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Equipe de recherche BONSAI

Bioinformatics and Sequence Analysis

  • Responsable : Helene Touzet
  • Type : Équipe-projet
  • Centre(s) de recherche : Lille
  • Domaine : Santé, biologie et planète numériques
  • Thème : Biologie numérique
  • Partenaire(s) : CNRS,Université des sciences et technologies de Lille (Lille 1)
  • Collaborateur(s) : Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille (9189)

Présentation de l'équipe

La bio-informatique a connu un développement important ces vingt dernières années pour devenir un domaine de recherche riche et fécond. Cette evolution s'est accompagnée d'innovations en biologie moléculaire concernant les technologies de séquençage, le transcriptome, la protéomique, qui permettent d'accéder à une mine d'informations. Ces données constituent une opportunité inédite d'élucider le fonctionnement du génome et de la cellule. L'objectif principal de BONSAI est de développer des outils pour l'analyse des génomes et des séquences à grande échelle. Cela inclut la définition de modèles combinatoires et d'algorithmes efficaces, la mise en oeuvre dans des logiciels robustes et diffusés, la validation sur des données biologiques. La plupart de nos projets de recherche sont menés en collaboration avec des équipes de recherche de biologie.

Axes de recherche

High-throughput sequence analysis Noncoding RNAs Nonribosomal peptides Genome rearrangements

Mots-clés : Bioinformatique

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