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Il y a 3 Résultats avec le mot clé : "ADN"

Dominique Lavenier, responsable de l'équipe-projet Inria Symbiose

Logiciel - Bioinformatique

Un logiciel qui accélère le mapping génétique

Jean-Michel Prima - 27/09/2011

Développé par Symbiose, une équipe de recherche du centre Rennes - Bretagne Atlantique, GASSST permet de traiter rapidement l'information produite par les séquenceurs de dernière génération. L'outil vient d'intégrer la suite logicielle de GenomeQuest, une société américaine de bio-informatique. Rencontre avec Dominique Lavenier, chercheur à l'origine de ce nouvel outil au service des biologistes.

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Bioinformatique - Logiciel

Koriplast

Jean-Michel Prima - 1/03/2012

PME bretonne de bio-informatique, Korilog édite des outils qui aident les biologistes à analyser les séquences d'ADN et de protéines. Elle débute avec l'équipe de recherche Genscale une collaboration visant à développer une solution pour gérer la pléthore d'informations issues du séquençage de nouvelle génération. Rencontre avec son fondateur, Patrick Durand.

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Expédition Tara Océan ©S.Bollet / Fondation Tara Expeditions

Interdisciplinarité

Des outils innovants pour la metagénomique comparative

Jean-Michel Prima (*) - 6/02/2019

En analysant la distribution génomique du plancton dans des échantillons d'eau de mer, on pourrait à la fois mieux connaître cette biomasse et déterminer l'impact que le changement climatique aura sur elle.
Mais un problème se pose : dans ces échantillons, la flore microbienne est séquencée sans que l'on puisse séparer les individus. C'est comme si les morceaux de multiples puzzles avaient été mélangés dans une seule boîte. La comparaison de toutes ces pièces les unes avec les autres se heurte à la complexité des données et au manque de logiciels capables de les traiter. Financé par l'Agence nationale de la recherche et coordonné par l'équipe de recherche Inria GenScale, le projet HydroGen vient de donner naissance à deux outils pour aider les  biologistes à faire parler les données.

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