Equipe-projet

MOSAIC

Simulation et Analyse de la morphogenèse in siliCo
Simulation et Analyse de la morphogenèse in siliCo
En collaboration étroite avec nos partenaires biologistes, notre objectif est d'identifier des principes clés du développement des organismes vivants en construisant une nouvelle génération de modèles fondée sur des représentations mathématique et informatiques explicites des formes biologiques en développement. Pour cela nous développons une approche mixte dans laquelle des modèles conceptuels nous permettent d'identifier des principes d'auto-organisation du vivant et des modèles plus réalistes nous permettent de tester quantitativement nos hypothèses biologiques ou physiques in silico en comparant simulations et observations. Cette démarche s'inscrit dans une perspective actuelle d'extension de la biologie des systèmes à la biologie plus intégrée des systèmes en développement.

Alors que notre approche se concentre principalement sur le développement des plantes à différentes échelles, l'équipe Mosaic s'interesse également à des systèmes modèle animaux comme l'embryogenèse des ascidies (organisme marin proche des vertébrés). Nous pensons qu'une telle démarche croisée dans l'étude des animaux et végetaux, assez peu pratiquée, est susceptible de faire ressortir des abstractions ou des principes communs pertinents pour la compréhension de la morphogenèse du vivant, ainsi que des synergies entre les démarches de modélisation (comme en imagerie par exemple). Nous nous intéressons aux processus physiques et chimiques qui interagissent dans le milieu que constitue la forme et qui interagissent avec elle. Nous cherchons à intégrer des aspects mécanistes et stochastiques dans nos modèles pour rendre compte de la variabilité biologique observée dans les organismes en développement. Sur le long terme, notre ambition est de contribuer à développer une nouvelle vision de la morphogenèse en biologie, à l'origine d'une nouvelle physique de la matière vivante, et fondé sur une analyse plus mécaniste des liens entre gènes, forme et environnement.
Centre(s) inria
Grenoble - Rhône-Alpes
En partenariat avec
Ecole normale supérieure de Lyon,CNRS,INRAE

Membres de l'équipe-projet

Responsable de l'équipe

Boyer Sylvie

Assistant(e) de l'équipe

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