Ouverture d'une Chaire de professeur junior en santé numérique

Le centre Inria de l’Université de Lille et ses partenaires créent une chaire de professeur junior en santé numérique, dont le projet scientifique est d’endotyper les MIC (Maladies inflammatoires chroniques).

Les maladies inflammatoires chroniques sont caractérisées par une importante hétérogénéité clinique qui complexifie la prise en charge des patients. Concept clé de la médecine personnalisée, un "endotype" est un sous-type de maladie, défini par un mécanisme moléculaire ou une réponse particulière à un traitement. Ce projet porté par le professeur Vincent Sobanski (Université et CHU de Lille, membre IUF Junior) vise à révéler des endotypes de MIC par une analyse multidimensionnelle intégrative de patients hautement phénotypés. Elle est basée sur leurs données cliniques et de suivi (informations de faible dimension) et sur des profils multiomiques générés spécifiquement pour ce projet (informations de haute dimension).

Retenu parmi les cinq lauréats nationaux de l’AMI "équipe-projet Inserm-Inria Santé numérique", ce projet constitue une avancée majeure vers une classification innovante car il intègre un très grand nombre de variables en prenant en compte la dimension temporelle et vise à concevoir des outils de validation séquentielle pour vérifier la pertinence d'une telle classification intégrative. Une originalité importante de ce projet est de travailler à rendre les endotypes intelligibles et exploitables en développant une interface humain-machine permettant aux acteurs (chercheurs, praticiens et même patients) de s'approprier cette nouvelle façon de classifier une maladie.

L’unité de recherche Inserm INFINITE U1286 a mis en place l’équipe ENDOMIC (Endotyper les maladies inflammatoires chroniques). Cette équipe a pour objectif d’analyser une cohorte clinico-biologique (FHU PRECISE, Service de Médecine interne du CHU de Lille) contenant 1.000 patients atteints de MIC hautement phénotypés et pour lesquels les sérums sont disponibles dans une biobanque à 0, 1, 2 et 3 ans. Cette cohorte est enrichie des données de soin issues de l’EDS du CHU de Lille (INCLUDE), des profils omiques et des images de tests diagnostiques de routine (100k images déjà standardisées). Toutes les autorisations éthiques et réglementaires sont déjà disponibles, l’équipe réalisant déjà des analyses non supervisées sur des données cliniques et multi-omiques.

Le profil recherché dans cette CPJ est un chercheur spécialiste en informatique, statistique et/ou intelligence artificielle, dont le parcours permettrait un recrutement en tant que directeur de recherche Inria d’ici 3 à 6 ans. Il viendra compléter une équipe comprenant un professeur des universités-praticien hospitalier en médecine interne, deux chercheurs postdoctorants (un chercheur en informatique, une chercheuse en immunologie), deux étudiants PhD (un médecin et une pharmacienne) et un ingénieur data-scientist.

Le candidat retenu participera aux enseignements liés à la santé de précision en y apportant son expertise spécifique (sciences des données, intelligence artificielle (IA), mathématiques, statistique). Ce programme gradué "santé de précision" est ouvert aux biologistes, médecins et pharmaciens, ainsi qu’aux (bio)informaticiens d’origine nationale et internationale, afin de former la prochaine génération de leaders de la recherche pour le monde universitaire, l’industrie et le monde des biotechnologies.