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Equipe de recherche XPOP

Publications de l'équipe XPOP

2019

Article dans une revue

titre
f-SAEM: A fast Stochastic Approximation of the EM algorithm for nonlinear mixed effects models
auteur
Belhal Karimi, Marc Lavielle, Éric Moulines
article
Computational Statistics and Data Analysis, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.csda.2019.07.001⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01958248/file/fsaem.pdf BibTex
titre
Quantification of gemcitabine intravenous drugs by direct measurement in chemotherapy plastic bags using a handheld Raman spectrometer
auteur
Laetitia Lê, Marion Berge, Ali Tfayli, Arlette Baillet-Guffroy, Patrice Prognon, Antoine Dowek, Eric Caudron
article
Talanta, Elsevier, 2019, 196, pp.376-380. ⟨10.1016/j.talanta.2018.11.062⟩
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BibTex
titre
Density estimation for RWRE
auteur
Antoine Havet, Matthieu Lerasle, Éric Moulines
article
Mathematical Methods of Statistics, Allerton Press, Springer (link), 2019, ⟨10.3103/S1066530719010022⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01815990/file/RWREdensity.pdf BibTex
titre
Inheritance and variability of kinetic gene expression parameters in microbial cells: modeling and inference from lineage tree data
auteur
Aline Marguet, Marc Lavielle, Eugenio Cinquemani
article
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2019, 35 (14), pp.i586-i595. ⟨10.1093/bioinformatics/btz378⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02317115/file/btz378.pdf BibTex
titre
A mathematical model to predict BNP levels in hemodialysis patients
auteur
Maxime Touzot, Pascal Seris, Catherine Maheas, Jill Vanmassenhove, Anne-Lyse Langlois, Kamal Moubakir, Sophie Laplanche, Thierry Petitclerc, Christophe Ridel, Marc Lavielle
article
Nephrology, Wiley, 2019, ⟨10.1111/nep.13586⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02127228/file/BNP%20modelling%20Nephrology%20Revision%20Marked.pdf BibTex
titre
Imputation of mixed data with multilevel singular value decomposition
auteur
François Husson, Julie Josse, Balasubramanian Narasimhan, Geneviève Robin
article
Journal of Computational and Graphical Statistics, Taylor & Francis, In press, ⟨10.1080/10618600.2019.1585261⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01781291/file/distcomp_imputation_JCGS.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
On the Global Convergence of (Fast) Incremental Expectation Maximization Methods
auteur
Belhal Karimi, Hoi-To Wai, Éric Moulines, Marc Lavielle
article
Advances in Neural Information Processing Systems (NeurIPS) 2019, Dec 2019, Vancouver, Canada
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https://hal.inria.fr/hal-02334656/file/fiem.pdf BibTex
titre
Imputation multiple pour données mixtes par analyse factorielle
auteur
Vincent Audigier, François Husson, Julie Josse, Matthieu Resche-Rigon
article
51es Journées de Statistique de la Société Française de Statistique, Société Française de Statistique, Jun 2019, Vandœuvre-lès-Nancy, France
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https://hal-agrocampus-ouest.archives-ouvertes.fr/hal-02355840/file/Husson-com_JDS_2019.pdf BibTex
titre
Efficient Metropolis-Hastings sampling for nonlinear mixed effects models
auteur
Belhal Karimi, Marc Lavielle
article
Proceedings of BAYSM, Jul 2018, Warwick, United Kingdom
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https://hal.inria.fr/hal-01958247/file/main.pdf BibTex
titre
Non-asymptotic Analysis of Biased Stochastic Approximation Scheme
auteur
Belhal Karimi, Blazej Miasojedow, Éric Moulines, Hoi-To Wai
article
32nd Conference on Learning Theory (COLT 2019), Jun 2019, Phoenix, United States. pp.1 - 33
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https://hal.inria.fr/hal-02127750/file/colt_Revised.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
On the Convergence Properties of the Mini-Batch EM and MCEM Algorithms
auteur
Belhal Karimi, Marc Lavielle, Éric Moulines
article
2019
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https://hal.inria.fr/hal-02334485/file/main.pdf BibTex
titre
On the consistency of supervised learning with missing values
auteur
Julie Josse, Nicolas Prost, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02024202/file/main.pdf BibTex
titre
Imputation and low-rank estimation with Missing Non At Random data
auteur
Aude Sportisse, Claire Boyer, Julie Josse
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01964720/file/LowRankMNAR_Sportisse.pdf BibTex

2018

Article dans une revue

titre
The Tamed Unadjusted Langevin Algorithm
auteur
Nicolas Brosse, Alain Durmus, Éric Moulines, Sotirios Sabanis
article
Stochastic Processes and their Applications, Elsevier, 2018, ⟨10.1016/j.spa.2018.10.002⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01648667/file/main.pdf BibTex
titre
Discriminative and Quantitative Analysis of Antineoplastic Taxane Drugs Using a Handheld Raman Spectrometer
auteur
Laetitia Lê, Ali Tfayli, Patrice Prognon, Eric Caudron
article
BioMed Research International , Hindawi Publishing Corporation, 2018, 2018, pp.1-7
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BibTex
titre
Optimization of classification and regression analysis of four monoclonal antibodies from Raman spectra using collaborative machine learning approach
auteur
Laetitia Minh Mai Lê, Balázs Kégl, Alexandre Gramfort, Camille Marini, David Nguyen, Mehdi Cherti, Sana Tfaili, Ali Tfayli, Arlette Baillet-Guffroy, Patrice Prognon, Pierre Chaminade, Eric Caudron
article
Talanta, Elsevier, 2018, 184, pp.260-265
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BibTex
titre
Normalizing constants of log-concave densities
auteur
Nicolas Brosse, Alain Durmus, Éric Moulines
article
Electronic journal of statistics , Shaker Heights, OH : Institute of Mathematical Statistics, 2018, 12 (1), pp.851-889. ⟨10.1214/18-EJS1411⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01648666/file/main.pdf BibTex
titre
Une nouvelle représentation de la polysomnographie par technique de machine learning non supervisée
auteur
G. Solelhac, M. Brigham, C. Marini, P. Bouchequet, M. Chennaoui, E. Le Pennec, D. Leger
article
Médecine du Sommeil, 2018, 15 (1), pp.49. ⟨10.1016/j.msom.2018.01.132⟩
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BibTex
titre
Development and performance of npde for the evaluation of time-to-event models
auteur
Marc Cerou, Marc Lavielle, Karl Brendel, Marylore Chenel, Emmanuelle Comets
article
Pharmaceutical Research, American Association of Pharmaceutical Scientists, 2018, 35 (2), pp.30. ⟨10.1007/s11095-017-2291-3⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01695500/file/CEROU_2017_npde_for_TTE_pharmRes.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01695500/file/document BibTex
titre
Rapid discrimination and quantification analysis of five antineoplastic drugs in aqueous solutions using Raman spectroscopy
auteur
Laetitia Minh Mai Lê, Marion Berge, Ali Tfayli, Jiangyan Zhou, Patrice Prognon, Arlette Baillet-Guffroy, Eric Caudron
article
European Journal of Pharmaceutical Sciences, Elsevier, 2018, 111, pp.158-166
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BibTex
titre
Adaptive estimation in the nonparametric random coefficients binary choice model by needlet thresholding
auteur
Eric Gautier, Erwan Le Pennec
article
Electronic journal of statistics , Shaker Heights, OH : Institute of Mathematical Statistics, 2018, 12 (1), pp.277-320. ⟨10.1214/17-EJS1383⟩
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BibTex
titre
Pharmacometrics Models with Hidden Markovian Dynamics
auteur
Marc Lavielle
article
Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics, Springer Verlag, 2018, 45 (1), pp.91--105. ⟨10.1007/s10928-017-9541-1⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01665722/file/markov2.pdf BibTex
titre
Impact of the interruption of a large heart failure regional disease management program on hospital admission rate: a population-based study
auteur
François Alla, Nelly Agrinier, Marc Lavielle, Patrick Rossignol, Damien Gonthier, Jean-Marc Boivin, Faiez Zannad
article
European Journal of Heart Failure, Oxford University Press (OUP), In press, 20 (6), pp.1066-1068. ⟨10.1002/ejhf.1193⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01727632/file/lettre_icalor.pdf BibTex
titre
Impact of the interruption of a large heart failure regional disease management program on hospital admission rate: a population-based study
auteur
François Alla, Nelly Agrinier, Marc Lavielle, Patrick Rossignol, Damien Gonthier, Jean-Marc Boivin, Faiez Zannad
article
European Journal of Heart Failure, Oxford University Press (OUP), 2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02127209/file/lettre_icalor.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Dealing with missing data in model-based clustering through a MNAR model
auteur
Christophe Biernacki, Gilles Celeux, Julie Josse, Fabien Laporte
article
CMStatistics 2018 - 11th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2018, Pise, Italy
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BibTex
titre
Low-rank Interaction with Sparse Additive Effects Model for Large Data Frames
auteur
Geneviève Robin, Hoi-To Wai, Julie Josse, Olga Klopp, Éric Moulines
article
32nd Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2018), Dec 2018, Montréal, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01959188/file/LORIS_2018_supplementary.pdf BibTex
titre
The promises and pitfalls of Stochastic Gradient Langevin Dynamics
auteur
Nicolas Brosse, Alain Durmus, Éric Moulines
article
NeurIPS 2018 (Advances in Neural Information Processing Systems 2018), Dec 2018, Montreal, France
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https://hal.inria.fr/hal-01934291/file/main.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
PAC-Bayesian Aggregation of Affine Estimators
auteur
L. Montuelle, E. Le Pennec
article
Nonparametric Statistics, pp.133-144, 2018
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BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Logistic Regression with Missing Covariates -- Parameter Estimation, Model Selection and Prediction
auteur
Wei Jiang, Julie Josse, Marc Lavielle
article
2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01958835/file/JCGS-renvoyer.pdf BibTex
titre
Diffusion approximations and control variates for MCMC
auteur
Nicolas Brosse, Alain Durmus, Sean Meyn, Éric Moulines
article
2018
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https://hal.inria.fr/hal-01934316/file/main.pdf BibTex
titre
PAC-Bayesian aggregation of affine estimators
auteur
Lucie Montuelle, Erwan Le Pennec
article
2018
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https://hal.inria.fr/hal-01070805/file/ArticlePAC_HAL.pdf BibTex
titre
Incomplete graphical model inference via latent tree aggregation
auteur
Geneviève Robin, Christophe Ambroise, Stephane Robin
article
2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01686841/file/Robin2018_latent_tree.pdf BibTex

2017

Article dans une revue

titre
Blocking strategies and stability of particle Gibbs samplers
auteur
S Singh, S Lindsten, Eric Moulines
article
Biometrika, Oxford University Press (OUP), 2017, 104 (4), pp.953-969
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BibTex
titre
Optimal scaling of the random walk Metropolis algorithm under L p mean differentiability
auteur
Alain Durmus, Sylvain Le Corff, Eric Moulines, Gareth Roberts
article
Journal of Applied Probability, Applied Probability Trust, 2017, 54 (04), pp.1233-1260
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BibTex
titre
Particle rejuvenation of Rao-Blackwellized sequential Monte Carlo smoothers for conditionally linear and Gaussian models
auteur
Ngoc Minh Nguyen, Sylvain Le Corff, Éric Moulines
article
EURASIP Journal on Advances in Signal Processing, SpringerOpen, 2017, 2017:54, pp.1-15. ⟨10.1186/s13634-017-0489-5⟩
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BibTex
titre
Decentralized Frank–Wolfe Algorithm for Convex and Nonconvex Problems
auteur
Hoi-To Wai, Jean Lafond, Anna Scaglione, Éric Moulines
article
IEEE Transactions on Automatic Control, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, 62 (11), pp.5522 - 5537. ⟨10.1109/TAC.2017.2685559⟩
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BibTex
titre
Online EM for functional data
auteur
Florian Maire, Éric Moulines, Sidonie Lefebvre
article
Computational Statistics and Data Analysis, Elsevier, 2017, 111, pp.27 - 47. ⟨10.1016/j.csda.2017.01.006⟩
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BibTex
titre
Nonasymptotic convergence analysis for the unadjusted Langevin algorithm
auteur
Alain Durmus, Éric Moulines
article
Annals of Applied Probability, Institute of Mathematical Statistics (IMS), 2017, 27 (3), pp.1551 - 1587. ⟨10.1214/16-AAP1238⟩
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BibTex
titre
On perturbed proximal gradient algorithms
auteur
Yves Atchade, Gersende Fort, Éric Moulines
article
Journal of Machine Learning Research, Microtome Publishing, 2017
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BibTex
titre
Sampling from a log-concave distribution with compact support with proximal Langevin Monte Carlo
auteur
Nicolas Brosse, Alain Durmus, Éric Moulines, Marcelo Pereyra
article
Proceedings of Machine Learning Research, PMLR, 2017, 65, pp.319-342
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https://hal.inria.fr/hal-01648665/file/main.pdf BibTex
titre
Asymptotic properties of quasi-maximum likelihood estimators in observation-driven time series models
auteur
Randal Douc, Konstantinos Fokianos, Éric Moulines
article
Electronic journal of statistics , Shaker Heights, OH : Institute of Mathematical Statistics, 2017, 11 (2), pp.2707 - 2740. ⟨10.1214/17-EJS1299⟩
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BibTex

Communication dans un congrès

titre
Fast and privacy preserving distributed low-rank regression
auteur
Hoi-To Wai, Jean Lafond, Anna Scaglione, Éric Moulines
article
2017 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP), 2017, New Orleans, United States
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BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Adaptive estimation in the nonparametric random coefficients binary choice model by needlet thresholding
auteur
Eric Gautier, Erwan Le Pennec
article
2017
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https://hal.inria.fr/inria-00601274/file/inverse.pdf BibTex
titre
Low-rank model with covariates for count data analysis
auteur
Geneviève Robin, Julie Josse, Eric Moulines, Sylvain Sardy
article
2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01482773/file/main_arxiv.pdf BibTex
titre
Clustering and Model Selection via Penalized Likelihood for Different-sized Categorical Data Vectors
auteur
Esther Derman, Erwan Le Pennec
article
2017
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https://hal.inria.fr/hal-01583692/file/CategoricalVectorClustering.pdf BibTex

2016

Article dans une revue

titre
What do we mean by identiability in mixed effects models?
auteur
Marc Lavielle, Leon Aarons
article
Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics, Springer Verlag, 2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01365535/file/identifiabilityHAL.pdf BibTex
titre
Sequential design of computer experiments for the assessment of fetus exposure to electromagnetic fields
auteur
Marjorie Jala, Celine Levy Leduc, Éric Moulines, Emmanuelle Conil, Joe Wiart
article
Technometrics, Taylor & Francis, 2016, 58 (1), pp.30--42. ⟨10.1080/00401706.2014.979951⟩
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BibTex
titre
Enhanced Method for Diagnosing Pharmacometric Models: Random Sampling from Conditional Distributions
auteur
Marc Lavielle, Benjamin Ribba
article
Pharmaceutical Research / Pharmaceutical Research (Dordrecht), 2016, ⟨10.1007/s11095-016-2020-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01365532/file/paperHAL.pdf BibTex
titre
Fixed Rank Kriging for Cellular Coverage Analysis
auteur
Hajer Braham, Sana Jemaa, Gersende Fort, Éric Moulines, Berna Sayrac
article
IEEE Transactions on Vehicular Technology, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, pp.11. ⟨10.1109/TVT.2016.2599842⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01418961/file/BrahamJemaaMoulinesTVT2016.pdf BibTex
titre
Spatial Prediction Under Location Uncertainty in Cellular Networks
auteur
Hajer Braham, Sana Jemaa, Gersende Fort, Éric Moulines, Berna Sayrac
article
IEEE Transactions on Wireless Communications, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, 15, pp.7633 - 7643. ⟨10.1109/TWC.2016.2605676⟩
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BibTex
titre
A Shrinkage-Thresholding Metropolis Adjusted Langevin Algorithm for Bayesian Variable Selection
auteur
Amandine Schreck, Gersende Fort, Sylvain Le Corff, Éric Moulines
article
IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing, IEEE, 2016, 10, pp.366 - 375. ⟨10.1109/JSTSP.2015.2496546⟩
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BibTex
titre
Convergence of Markovian Stochastic Approximation with Discontinuous Dynamics
auteur
Gersende Fort, Éric Moulines, Amandine Schreck, Matti Vihola
article
SIAM Journal on Control and Optimization, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2016, 54 (2), pp.866-893. ⟨10.1137/140962723⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01418857/file/schreck_etal_2014_HAL.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Maximum likelihood estimation of a low-order building model
auteur
Tahar Nabil, Éric Moulines, François Roueff, Jean-Marc Jicquel, Alexandre Girard
article
EUSIPCO 2016: 2016 24th European Signal Processing Conference, Aug 2016, Budapest, Hungary. ⟨10.1109/EUSIPCO.2016.7760339⟩
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BibTex
titre
Nonparametric estimation of a shot-noise process
auteur
Paul Ilhe, François Roueff, Éric Moulines, Antoine Souloumiac
article
SSP 16 - Statistical Signal Processing Workshop, IEEE Signal Processing Society, Jun 2016, Palma de Mallorca, Spain. pp.7551709, ⟨10.1109/SSP.2016.7551709⟩
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BibTex
titre
On the LP-convergence of a Girsanov theorem based particle filter
auteur
Simo Särkkä, Éric Moulines
article
ICASSP 2016 - International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing , Mar 2016, Shangai, China. pp.3989 - 3993, ⟨10.1109/ICASSP.2016.7472426⟩
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BibTex
titre
D-FW: Communication efficient distributed algorithms for high-dimensional sparse optimization
auteur
Jean Lafond, Hoi-To Wai, Éric Moulines
article
International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing , Mar 2016, Shangai, China. pp.4144 - 4148, ⟨10.1109/ICASSP.2016.7472457⟩
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BibTex

HDR

titre
Contribution to missing values & principal component methods
auteur
Julie Josse
article
Statistics [stat]. Université Paris Sud - Orsay, 2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01573493/file/HDR_julie_thank.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
What do we mean by identifiability in mixed effects models?
auteur
Marc Lavielle, Leon Aarons
article
2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01251986/file/identifiability_R1.pdf BibTex

2015

Article dans une revue

titre
MatVPC: A User-Friendly MATLAB-Based Tool for the Simulation and Evaluation of Systems Pharmacology Models
auteur
Kostas Biliouris, Marc Lavielle, Mirjam Trame
article
CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol, 2015, ⟨10.1002/psp4.12011⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01252020/file/CPT_MatVPC.pdf BibTex
titre
Prediction of Response to Temozolomide in Low-Grade Glioma Patients Based on Tumor Size Dynamics and Genetic Characteristics
auteur
P Mazzocco, Célia Barthélémy, G Kaloshi, Marc Lavielle, D Ricard, A Idbaih, D Psimaras, M-A Renard, A Alentorn, J Honnorat, J-Y Delattre, F Ducray, B Ribba
article
CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol, 2015, 4 (12), pp.728-737. ⟨10.1002/psp4.54⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01252076/file/CPT_Mazzocco%20%281%29.pdf BibTex

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