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Equipe de recherche MORPHEME

Publications de l'équipe MORPHEME

2019

Article dans une revue

titre
Nanometric axial resolution of fibronectin assembly units achieved with an efficient reconstruction approach for multi-angle-TIRF microscopy
auteur
Emmanuel Soubies, Agata Radwanska, Dominique Grall, Laure Blanc-Féraud, Ellen Van Obberghen-Schilling, Sébastien Schaub
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-018-36119-3⟩
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Communication dans un congrès

titre
New methods for L_2-L_0 minimization and their applications to 2D Single-Molecule Localization Microscopy
auteur
Arne Bechensteen, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2019, Apr 2019, Venice, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02107577/file/ISBI_19_HAL.pdf BibTex
titre
Improving 3D MA-TIRF Reconstruction with Deconvolution and Background Estimation
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Sébastien Schaub, Ellen Van Obberghen-Schilling
article
ISBI 2019 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02017862/file/Soubies_ISBI-2019.pdf BibTex

2018

Article dans une revue

titre
A stochastic framework to model axon interactions within growing neuronal populations
auteur
Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2018, 14 (12), pp.e1006627
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titre
In Toto Imaging and Reconstruction of Post-Implantation Mouse Development at the Single-Cell Level
auteur
Katie Mcdole, Léo Guignard, Fernando Amat, Andrew Berger, Grégoire Malandain, Loïc Royer, Srinivas Turaga, Kristin Branson, Philipp Keller
article
Cell, Elsevier, 2018, 175 (3), pp.859 - 876.e33. ⟨10.1016/j.cell.2018.09.031⟩
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titre
New objective measurements of semen wave motion are associated with fertility in sheep
auteur
Ingrid David, Philippa L. Kohnke, Jérôme Fehrenbach, Ana Rita Lopes Simoes, Eric Debreuve, Xavier Descombes, Franck Plouraboué, Pierre Degond, Xavier Druart
article
Reproduction, Fertility and Development, CSIRO Publishing, 2018, 30 (6), pp.889-896. ⟨10.1071/RD17472⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01808988/file/david_%2020121.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Single molecule localization by $\ell_2-\ell_0$ constrained optimization
auteur
Arne Bechensteen, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
iTWIST 2018, Nov 2018, Marseille, France
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https://arxiv.org/pdf/1812.05971 BibTex
titre
Detection of Brain Strokes Using Microwave Tomography
auteur
Vanna Lisa Coli, Pierre-Henri Tournier, Victorita Dolean, Ibtissam El Kanfoud, Christian Pichot, Claire Migliaccio, Laure Blanc-Féraud
article
International Symposium on Antennas and Propagation and USNC-URSI Radio Science Meeting, Jul 2018, Boston, United States. pp.223-224, ⟨10.1109/APUSNCURSINRSM.2018.8609404⟩
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titre
Classification of the fibronectin variants with curvelets
auteur
Anca-Ioana Grapa, Raphael Meunier, Laure Blanc-Féraud, Georgios Efthymiou, Sébastien Schaub, Agata Radwanska, Ellen Van Obberghen-Schilling, Xavier Descombes
article
ISBI 2018 - IEEE 15th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, DC, United States. pp. 930-933, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363723⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01868726/file/GrapaAncaISBI2018FinalVersion.pdf BibTex
titre
SPADE: A Small Particle Detection Method Using A Dictionary Of Shapes Within The Marked Point Process Framework
auteur
Nicolas Cedilnik, Eric Debreuve, Fabienne de Graeve, Florence Besse, Xavier Descombes
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) 2018, Apr 2018, Washington, DC, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01867805/file/spade_isbi2018.pdf BibTex
titre
Intensity-based matching and registration for 3D correlative microscopy with large discrepancies
auteur
Bertha Mayela Toledo Acosta, Xavier Heiligenstein, Grégoire Malandain, Patrick Bouthemy
article
ISBI 2018 - IEEE 15th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, United States. pp.493-496, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363623⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01930740/file/isbi2018vf.pdf BibTex

Poster

titre
An image based high throughput screen to identify regulators of Imp containing RNP granules
auteur
Fabienne de Graeve, Somia Rahmoun, Djampa Kozlowski, Nicolas Cedilnik, Eric Debreuve, Xavier Descombes, Florence Besse
article
32nd French Drosophila Meeting, Oct 2018, Hyères, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01900773/file/poster_DE_GRAEVE_2018.pdf BibTex
titre
SPADE: A Small Particle Detection Method Using A Dictionary Of Shapes Within The Marked Point Process Framework
auteur
Nicolas Cedilnik, Eric Debreuve, Fabienne de Graeve, Florence Besse, Xavier Descombes
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) 2018, Apr 2018, Washington, DC, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01867816/file/spade_isbi2018_poster.pdf BibTex

Thèse

titre
Modelling and characterizing axon growth from in vivo data
auteur
Agustina Razetti
article
Signal and Image processing. Université Côte d'Azur, 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4016⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01868324/file/2018AZUR4016.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Contact-dependent cell-cell communications drive morphological invariance during ascidian embryogenesis
auteur
Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Bruno Leggio, Emmanuel Faure, Julien Laussu, Lars Hufnagel, Grégoire Malandain, Christophe Godin, Patrick Lemaire
article
2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01938126/file/238741.1.full.pdf BibTex

2017

Article dans une revue

titre
Simple mechanical cues could explain adipose tissue morphology
auteur
Diane Peurichard, Fanny Delebecque, Anne Lorsignol, Corinne Barreau, Jacques Rouquette, Xavier Descombes, Louis Casteilla, Pierre Degond
article
Journal of theoretical biology, 2017, 429, pp.21. ⟨https://www.elsevier.com/locate/jtbi⟩
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BibTex
titre
A comparison of edge-preserving approaches for differential interference contrast microscopy
auteur
Simone Rebegoldi, Lola Bautista, Laure Blanc-Féraud, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
article
Inverse Problems, IOP Publishing, 2017, ⟨10.1088/1361-6420/aa790a⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01568695/file/paper.pdf BibTex
titre
Photometric Stereo with Only Two Images: A Theoretical Study and Numerical Resolution
auteur
Yvain Quéau, Roberto Mecca, Jean-Denis Durou, Xavier Descombes
article
Image and Vision Computing, Elsevier, 2017, pp.175--191. ⟨10.1016/j.imavis.2016.11.006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01334657/file/IVC_final_v1.pdf BibTex
titre
A Unified View of Exact Continuous Penalties for l2-l0 Minimization
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
SIAM Journal on Optimization, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2017, 27 (3), ⟨10.1137/16M1059333⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01267701/file/Soubies_UnifiedView2017.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Quelles relaxations continues pour le critère $l2-l0$ ?
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
Colloque Gretsi, Sep 2017, Juan-Les-Pins, France. pp.4
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https://hal.inria.fr/hal-01560319/file/GRETSI_2017.pdf BibTex
titre
Suivi temporel 3D de vaisseaux coronaires dans les projections rayons X
auteur
Emmanuelle Poulain, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
article
GRETSI, Sep 2017, Juan-Les-Pins, France
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https://hal.inria.fr/hal-01544989/file/poulain182.pdf BibTex
titre
Quantitative image based analysis of endocrine disruptor effects on mitochondria morphology-function in prostate cancer cells
auteur
Aurélie Charazac, Célia Decondé Le Butor, Kévin Giulietti, Jean-Marc A. Lobaccaro, Silvère Baron, Jérôme Gilleron, Patrick Fenichel, Xavier Descombes, Frédéric Bost, Clavel Stéphan, Nicolas Chevalier
article
International Congress of Translational Research in Human Nutrition, Jun 2017, Clermont-Ferrand, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01548783/file/2017.06.23-CHARAZAC.pdf BibTex
titre
3D Coronary vessel tracking in x-ray projections
auteur
Emmanuelle Poulain, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
article
International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH), Jun 2017, Toronto, Canada. pp.204-215, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_20⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01502128/file/camera.pdf BibTex
titre
Modelling collective axon growth from in vivo data reveals the importance of physical axon-axon interactions
auteur
Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes
article
Rencontre C@UCA 2017, Jun 2017, Fréjus, France
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BibTex
titre
Modeling collective axon growth from in vivo data reveals the importance of physical axon-axon interactions
auteur
Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes
article
Cell biology of the neuron: Polarity, plasticity and regeneration, EMBO, May 2017, Heraklion, Greece
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01483505/file/abstract_EMBO_Medioni_Razetti.pdf BibTex
titre
Coherent temporal extrapolation of labeled images
auteur
Grégoire Malandain, Gaël Michelin
article
ISBI 2017 - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia. pp.433 - 436, ⟨10.1109/ISBI.2017.7950554⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01574698/file/malandain_2017.pdf BibTex
titre
High density molecule localization for super-resolution microscopy using CEL0 based sparse approximation
auteur
Simon Gazagnes, Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud
article
ISBI 2017 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2017.7950460⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01443565/file/ISBI_Gazagnes2017.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
A Stochastic Framework for Neuronal Morphological Comparison: Application to the Study of imp Knockdown Effects in Drosophila Gamma Neurons
auteur
Agustina Razetti, Xavier Descombes, Caroline Medioni, Florence Besse
article
Ana Fred; Hugo Gamboa. Biomedical Engineering Systems and Technologies, 690, Springer, pp.145-166, 2017, CCIS, ⟨10.1007/978-3-319-54717-6_9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01502735/file/SpringerBook_RAZETTI_et_al.pdf BibTex

Poster

titre
Quantitative image based analysis of endocrine disruptor effects on mitochondria morphology-function in prostate cancer cells.
auteur
Aurélie Charazac, Célia Decondé Le Butor, Mamadou Gueye, Jérôme Gilleron, Kévin Giuletti, Maeva Gesson, Patrick Fénichel, Xavier Descombes, Frédéric Bost, Stéphan Clavel, Nicolas Chevalier
article
ECE 2017 - European Congress of Endocrinology, May 2017, Lisbonne, Portugal. pp.1, 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01548773/file/2017-ECE-CHARAZACetal..pdf BibTex
titre
Quantitative image based analysis of endocrine disruptor effects on mitochondria morphology‐function in prostate cancer cells.
auteur
Aurélie Charazac, Célia Decondé Le Butor, Mamadou Gueye, Jérôme Gilleron, Kévin Giuletti, Maeva Gesson, Patrick Fénichel, Xavier Descombes, Frédéric Bost, Stéphan Clavel, Nicolas Chevalier
article
Signalife, May 2017, Nice, France. pp.1
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01548770/file/Signalife2017-CHARAZAC.pdf BibTex

Thèse

titre
Phase estimation for Differential Interference Contrast microscopy
auteur
Lola Xiomara Bautista Rozo
article
Other. Université Côte d'Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4045⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01576339/file/2017AZUR4045.pdf BibTex

2016

Article dans une revue

titre
Estimating the Intrinsic Dimension of Hyperspectral Images Using a Noise-Whitened Eigengap Approach
auteur
Abderrahim Halimi, Paul Honeine, Malika Kharouf, Cédric Richard, Jean-Yves Tourneret
article
IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, vol. 54 (n° 7), pp.3811-3821. ⟨10.1109/TGRS.2016.2528298⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01325467/file/Halimi_15873.pdf BibTex
titre
ERRATUM: A Continuous Exact l0 penalty (CEL0) for least squares regularized problem
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2016, 9 (1), pp.490-494. ⟨10.1137/15M1038384⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01267679/file/Erratum_SIIMS_CEL0_Soubies_BlancFeraud_Aubert.pdf BibTex
titre
Multiple objects detection in biological images using a marked point process framework
auteur
Xavier Descombes
article
Methods, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.ymeth.2016.09.009⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01383165/file/MPPBio.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Accelerated gradient-based methods for phase estimation in differential-interference-contrast microscopy
auteur
Simone Rebegoldi, Lola Bautista, Laure Blanc-Féraud, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
article
SIMAI 2016: Società Italiana di Matematica Aplicata e Industriale, Sep 2016, Milan, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-01426330/file/SIMAI2016_Abstract.pdf BibTex
titre
An efficient gradient-based method for differential-interference-contrast microscopy
auteur
Simone Rebegoldi, Lola Bautista, Marco Prato, Luca Zanni, Laure Blanc-Féraud, Arturo Plata
article
NUMTA 2016: Numerical Computations: Theory and Algorithms, Jun 2016, Calabria, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-01426337/file/NUMTA2016_Abstract.pdf BibTex
titre
Is the Vascular Network Discriminant Enough to Classify Renal Cell Carcinoma?
auteur
Alexis Zubiolo, Eric Debreuve, Damien Ambrosetti, Philippe Pognonec, Xavier Descombes
article
CBMI 2016 - International Workshop on Content-based Multimedia Indexing, Jun 2016, Bucarest, Romania. ⟨10.1109/CBMI.2016.7500255⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01344247/file/cbmi-2016-hal.pdf BibTex
titre
Some results on sparse L2-L0 reconstruction: Continuous Exact L0 penalties
auteur
Laure Blanc-Féraud, Emmanuel Soubies, Gilles Aubert
article
Workshop ATLAS on mathematical and algorithmimcal approaches for high dimensional problems in data sciences. , GdR MaDICS, May 2016, Grenoble, France
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BibTex
titre
Some results on sparse L2-L0 reconstruction: Continuous Exact L0 penalties
auteur
Laure Blanc-Féraud, Emmanuel Soubies, Gilles Aubert
article
NCMIP 2016 - New Computational Methods for Inverse Problem , ENS Cachan, Apr 2016, Cachan, France
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BibTex
titre
Phase Estimation in Differential-Interference-Contrast (DIC) Microscopy
auteur
Lola Bautista, Simone Rebegoldi, Laure Blanc-Féraud, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.136-139
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https://hal.inria.fr/hal-01255004/file/ISBI-2016-Version10.pdf BibTex
titre
A Framework for Multi-angle Tirf Microscope Calibration
auteur
Emmanuel Soubies, Sébastien Schaub, Agata Radwanska, Ellen Van Obberghen-Schilling, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2016.7493355⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01257736/file/main.pdf BibTex
titre
Spatio-temporal registration of 3D microscopy image sequences of Arabidopsis floral meristems
auteur
Gaël Michelin, Yassin Refahi, Raymond Wightman, Henrik Jönsson, Jan Traas, Christophe Godin, Grégoire Malandain
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic. ⟨10.1109/ISBI.2015.7163872⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01606687/file/michelin_2016_final.pdf BibTex
titre
Statistical Characterization, Modelling and Classification of Morphological Changes in imp Mutant Drosophila Gamma Neurons
auteur
Agustina Razetti, Xavier Descombes, Caroline Medioni, Florence Besse
article
BIOSTEC 2016 - The 9h International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Feb 2016, Rome, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-01290499/file/BIOINFORMATICS_2016_35_CR.pdf BibTex

Poster

titre
Optimization methods for phase estimation in differential-interference-contrast (DIC) microscopy
auteur
Simone Rebegoldi, Lola Bautista, Laure Blanc-Féraud, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
article
Workshop on Optimization Techniques for Inverse Problems III, Sep 2016, Modena, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-01426317/file/posterModena.pdf BibTex

Thèse

titre
Outils d'analyse d'images et recalage d'individus pour l'étude de la morphogenèse animale et végétale
auteur
Gaël Michelin
article
Autre. Université Côte d'Azur, 2016. Français. ⟨NNT : 2016AZUR4088⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01451608/file/2016AZUR4088.pdf BibTex
titre
Sur quelques problèmes de reconstruction en imagerie MA-TIRF et en optimisation parcimonieuse par relaxation continue exacte de critères pénalisés en norme-l0
auteur
Emmanuel Soubies
article
Autre. Université Côte d'Azur, 2016. Français. ⟨NNT : 2016AZUR4082⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01479054/file/2016AZUR4082.pdf BibTex

2015

Article dans une revue

titre
Age-related changes in FDG brain uptake are more accurately assessed when applying an adaptive template to the SPM method of voxel-based quantitative analysis
auteur
Axel Van Der Gucht, Antoine Verger, Eric Guedj, Grégoire Malandain, Gabriela Hossu, Yalcin Yagdigul, Véronique Roch, Sylvain Poussier, Louis Maillard, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie
article
Annals of Nuclear Medicine, Springer Verlag, 2015, 29 (10), pp.921-928. ⟨10.1007/s12149-015-1022-2⟩
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BibTex
titre
A Continuous Exact l0 penalty (CEL0) for least squares regularized problem
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2015, 8 (3), pp. 1607-1639 (33 p.). ⟨10.1137/151003714⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01102492/file/Soubies_Blanc-Feraud_Aubert_CEL0.pdf BibTex
titre
From Curves to Trees: A Tree-like Shapes Distance Using the Elastic Shape Analysis Framework
auteur
Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse
article
Neuroinformatics, Springer, 2015, 13 (2), pp.175-191. ⟨10.1007/s12021-014-9255-0⟩
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BibTex
titre
A tree-topology preserving pairing for 3D/2D registration
auteur
Thomas Benseghir, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2015, 10 (6), pp.913-923. ⟨10.1007/s11548-015-1207-0⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01183573/file/Article.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
L0-Optimization for Channel and DOA Sparse Estimation
auteur
Adilson Chinatto, Emmanuel Soubies, Cynthia Junqueira, Joâo M. T. Romano, Pascal Larzabal, Jean-Pierre Barbot, Laure Blanc-Féraud
article
International Workshop on Computational Advances in Multi-Sensor Adaptive Processing (CAMSAP), Dec 2015, Cancun, Mexico. pp.305-308, ⟨10.1109/CAMSAP.2015.7383797⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01212042/file/Camsap2015_Chinatto.pdf BibTex
titre
Geometric Analysis of Axonal Tree Structures
auteur
Alan Duncan, Eric Klassen, Xavier Descombes, Srivastava Anuj
article
DIFF-CV 2015 - Proceedings of the 1st International Workshop on DIFFerential Geometry in Computer Vision for Analysis of Shapes, Images and Trajectories, Oct 2015, Swansea, United Kingdom
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BibTex
titre
A framework for creating population specific multimodal brain atlas using clinical T1 and diffusion tensor images
auteur
Vikash Gupta, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
MICCAI 2015 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.99-108, ⟨10.1007/978-3-319-28588-7_9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01261115/file/Gupta_CDMRI_2015.pdf BibTex
titre
Gradient-Based Phase Estimation in Differential Interference Contrast (DIC) Microscopy
auteur
Lola Bautista, Laure Blanc-Féraud, Simone Rebegoldi, Marco Prato, Luca Zanni, Arturo Plata
article
Assemblée générale ; interférences d'ondes, GdR Ondes, Sep 2015, lyon, France
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BibTex
titre
Comment retrouver une constellation dans la galaxie ?
auteur
Alexis Zubiolo, Kawssar Harb, Michèle Studer, Eric Debreuve, Xavier Descombes
article
Colloque Gretsi, Sep 2015, Lyon, France. pp.4
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https://hal.inria.fr/hal-01176960/file/zubiolo2015gretsi.pdf BibTex
titre
Seuillage CEL0 pour la minimisation l2- l0 : comparaisons avec IHT
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
Colloque Gretsi, Sep 2015, Lyon, France. pp.4
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https://hal.inria.fr/hal-01169557/file/GRETSI15_Soubies_Blanc-Feraud_Aubert.pdf BibTex
titre
Morphological Analysis and Feature Extraction of Neurons from Mouse Cortices Multiscale 3D Microscopic Images
auteur
Alexis Zubiolo, Kawssar Harb, Michèle Studer, Eric Debreuve, Xavier Descombes
article
37th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC 2015), IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS), Aug 2015, Milan, Italy. ⟨10.1109/EMBC.2015.7320118⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01176966/file/zubiolo2015embc.pdf BibTex
titre
CEL0: a continuous alternative to l0 penalty
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations (SPARS), Jul 2015, Cambridge, United Kingdom
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https://hal.inria.fr/hal-01167192/file/Soubies_Blanc_Feraud_Aubert_SPARS_15.pdf BibTex
titre
Que peut-on apprendre d'une scène vue par une webcam à partir d'images prises au cours d'une journée ensoleillée ?
auteur
Yvain Queau, Jean-Denis Durou, Xavier Descombes
article
Journées francophones des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, Jun 2015, Amiens, France. pp.8
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01161843/file/orasis_2015.pdf BibTex
titre
Detection and Tracking of Golgi Outposts in Microscopy Data
auteur
Huei-Fang Yang, Chu-Song Chen, Xavier Descombes
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, New York, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01113626/file/isbi15.pdf BibTex
titre
Cells Detection Using Segmentation Competition
auteur
Emmanuelle Poulain, Sylvain Prigent, Emmanuel Soubies, Xavier Descombes
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, United States. ⟨10.1109/ISBI.2015.7164090⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01113167/file/Poulain_ISBI15.pdf BibTex
titre
Motion compensation in two-photon microscopy temporal series
auteur
Caroline Medioni, Florence Besse, Xavier Descombes, Grégoire Malandain
article
International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, Brooklyn, United States. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2015.7164182⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01311755/file/isbi2015-medioni.pdf BibTex
titre
Quantitative comparison of micro-vasculatures
auteur
Manon Linder, Cecile Duplaa, Thierry Couffinhal, Grégoire Malandain
article
ISBI 2015 - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01145908/file/isbi2015-linder.pdf BibTex
titre
Cell Pairings for Ascidian Embryo Registration
auteur
Gaël Michelin, Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Patrick Lemaire, Christophe Godin, Grégoire Malandain
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, New York, United States. ⟨10.1109/ISBI.2015.7163872⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01113166/file/michelin_2015_final_version.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Graph Cut Based Segmentation of Predefined Shapes: Applications to Biological Imaging
auteur
Emmanuel Soubies, Pierre Weiss, Xavier Descombes
article
Pattern Recognition Applications and Methods., 318, Springer-Verlag, pp.153-170, 2015, Advances in Intelligent Systems and Computing, 978-3-319-12610-4. ⟨10.1007/978-3-319-12610-4_10⟩
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BibTex

Rapport

titre
From extraction of physiological features with dynamic µ-SPECT imaging to modelling of iodide biodistribution in stomach
auteur
Marine Breuilly, Kaouthar Chatti, Jacques Darcourt, Philippe Franken, Julien Guglielmi, Grégoire Malandain, Thierry Pourcher
article
[Research Report] Inria Sophia Antipolis. 2015
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https://hal.inria.fr/hal-01186222/file/BREUILLY_RR_201508.pdf BibTex
titre
Assessing skin lesion evolution from multispectral image sequences
auteur
Sylvain Prigent, Xavier Descombes, Didier Zugaj, Laurent Petit, Anne-Sophie Dugaret, Philippe Martel, Josiane Zerubia
article
[Research Report] RR-8745, Inria Sophia Antipolis; INRIA. 2015
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https://hal.inria.fr/hal-01164502/file/RR-8745.pdf BibTex

Thèse

titre
Extraction de caractéristiques et apprentissage statistique pour l'imagerie biomédicale cellulaire et tissulaire
auteur
Alexis Zubiolo
article
Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. Français. ⟨NNT : 2015NICE4117⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01290131/file/2015NICE4117.pdf BibTex

2014

Article dans une revue

titre
Assessing the ability of the 2D Fisher-KPP equation to model cell-sheet wound closure
auteur
Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2014, 252, pp.45-59
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https://hal.inria.fr/hal-00923588/file/MBS-D-13-00210R.pdf BibTex
titre
Space Variant Blind Image Restoration
auteur
Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2014, 7, pp.2196 - 2225. ⟨10.1137/130945776⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01096491/file/94577.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Sparse reconstruction from Multiple-Angle Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Sébastien Schaub, Gilles Aubert
article
ICIP - International Conference on Image Processing, Oct 2014, Paris, France. pp.2844 - 2848, ⟨10.1109/ICIP.2014.7025575 ⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01037895/file/main.pdf BibTex
titre
Discrete Stochastic Model for the Generation of Axonal Trees
auteur
Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse, Eugene Pechersky
article
EMBC 2014, Aug 2014, Chicago, United States
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BibTex
titre
A 3D model with shape prior information for biological structures reconstruction using Multiple-Angle Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy
auteur
Emmanuel Soubies, Laure Blanc-Féraud, Sébastien Schaub, Gilles Aubert
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. pp.608 - 611, ⟨10.1109/ISBI.2014.6867944⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00914998/file/Soubies_ISBI_2014.pdf BibTex
titre
Axonal Tree Classification Using an Elastic Shape Analysis Based Distance
auteur
Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. ⟨10.1109/ISBI.2014.6868004⟩
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BibTex
titre
Embryo Cell Membranes Reconstruction by Tensor Voting
auteur
Gaël Michelin, Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Grégoire Malandain
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. ⟨10.1109/ISBI.2014.6868105 ⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00915000/file/michelin-isbi-2014.pdf BibTex
titre
Spatio-temporal registration of embryo images
auteur
Léo Guignard, Christophe Godin, Ulla-Maj Fiuza, Lars Hufnagel, Patrick Lemaire, Grégoire Malandain
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Pekin, China
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https://hal.inria.fr/hal-00919142/file/Article_Leo.pdf BibTex
titre
Head Tracking and Flagellum Tracing for Sperm Motility Analysis
auteur
Huei-Fang Yang, Xavier Descombes, Sylvain Prigent, Grégoire Malandain, Xavier Druart, Franck Plouraboué
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. ⟨10.1109/ISBI.2014.6867871⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00909868/file/isbi14.pdf BibTex
titre
A Recursive Approach For Multiclass Support Vector Machine: Application to Automatic Classification of Endomicroscopic Videos
auteur
Alexis Zubiolo, Barbara André, Eric Debreuve, Grégoire Malandain
article
VISAPP - International Conference on Computer Vision Theory and Applications, Jan 2014, Lisbon, Portugal
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https://hal.inria.fr/hal-00905382/file/Example.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Markov Models and MCMC Algorithms in Image Processing
auteur
Xavier Descombes
article
Rama Chelappa. Academic Press Library in Signal Processing, 4, Elsevier Ltd, 2014, Image, Video Processing and Analysis, Hardware, Audio, Acoustic and Speech 978-0-12-396501-1
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BibTex

Thèse

titre
Axonal morphology analysis : from image processing to modelling
auteur
Alejandro Ricardo Mottini d'Oliveira
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. English. ⟨NNT : 2014NICE4066⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01074620/file/2014NICE4066.pdf BibTex

2013

Article dans une revue

titre
Amplitude-based data selection for optimal retrospective reconstruction in micro-SPECT
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Julien Guglielmi, Robert Marsault, Thierry Pourcher, Philippe Franken, Jacques Darcourt
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2013, 58 (8), pp.2657-2674. ⟨10.1088/0031-9155/58/8/2657⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00799381/file/BREUILLY_PMB_2013.pdf BibTex
titre
Analysis of a new variational model to restore point-like and curve-like singularities in imaging
auteur
Gilles Aubert, Laure Blanc-Féraud, Daniele Graziani
article
Applied Mathematics and Optimization, 2013, 67, pp.73-96
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https://hal.inria.fr/inria-00522098/file/amorevised.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Mechanical properties of the plasma membrane of micropatterned cells incubated with mono or polyunsaturated fatty acids
auteur
Hélène Barelli, M. Pinot, Thierry Ferreira, Grégoire Malandain, Xavier Descombes, Bruno Goud, Bruno Antonny
article
American Society for Cell Biology (ASCB) Annual Meeting, Dec 2013, New Orleans, United States
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BibTex
titre
Multi-scale analysis of skin hyper-pigmentation evolution
auteur
Sylvain Prigent, Xavier Descombes, Didier Zugaj, Laurent Petit, Josiane Zerubia
article
ICIP - International Conf. on Image Processing, Sep 2013, Melbourne, Australia
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https://hal.inria.fr/hal-00841460/file/icip2013.pdf BibTex
titre
Tree-like Shapes Distance Using the Elastic Shape Analysis Framework
auteur
Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse
article
BMVC - British Machine Vision Conference, Sep 2013, Bristol, United Kingdom
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BibTex
titre
Optimisation jointe de la chaîne codage/débruitage pour les images satellite
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
article
GRETSI, Sep 2013, Brest, France
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https://hal.inria.fr/hal-00920794/file/GRETSI13.pdf BibTex
titre
Restauration aveugle d'image 3D de microscopie de fluorescence avec prise en compte des aberrations sphériques et contrainte de phase
auteur
Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Engler Gilbert
article
Colloque Gretsi, Sep 2013, Brest, France
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https://hal.inria.fr/hal-00920194/file/gretsi_resume_SB_LBF_13-V2.pdf BibTex
titre
Iterative Closest Curve: a Framework for Curvilinear Structure Registration Application to 2D/3D Coronary Arteries Registration
auteur
Thomas Benseghir, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.179-186, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_23⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00833196/file/paper974.pdf BibTex
titre
Modeling cell sheet wound closure
auteur
Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain
article
Applied Mathematics, Modeling and Computational Science (AMMCS), Wilfrid Laurier University with AIMS and SIAM, Aug 2013, Waterloo, Ontario, Canada
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BibTex
titre
Blind restoration of confocal microscopy images in presence of a depth-variant blur and Poisson noise
auteur
Laure Blanc-Féraud, Saima Ben Hadj, Gilles Aubert
article
Journées thématiques, GdR Microscopie foncitonnelle du vivant, Jul 2013, Paris, France
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BibTex
titre
ML estimation of wavelet regularization hyperparameters in inverse problems
auteur
Roberto Cavicchioli, Caroline Chaux, Laure Blanc-Féraud, Luca Zanni
article
ICASSP - International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing, May 2013, Vancouver, Canada. pp.1553-1557
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BibTex
titre
Blind restoration of confocal microscopy images in presence of a depth-variant blur and Poisson noise
auteur
Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert, Engler Gilbert
article
ICASSP - International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2013, Vancouver, Canada
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BibTex
titre
Depth-variant blind restoration with pupil-phase constraints for 3D confocal microscopy
auteur
Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Engler Gilbert
article
3rd International Workshop on New Computational Methods for Inverse Problems, May 2013, Paris, France
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https://hal.inria.fr/hal-00920193/file/NCMIP_SBH_LBF_GE_13.pdf BibTex
titre
Automatic dendrite spines detection from X-ray tomography volumes
auteur
Xavier Descombes, Grégoire Malandain, Caroline Fonta, Lazlo Negyessy, Rajmund Mosko
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San fancisco, United States. ⟨10.1109/ISBI.2013.6556505⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00793573/file/Spine.pdf BibTex
titre
Blind depth-variant blur removal in confocal microscopy
auteur
Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert, Gilbert Engler, Elie Maalouf, Bruno Colicchio, Alain Dieterlen
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. ⟨10.1109/ISBI.2013.6556438⟩
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BibTex
titre
Image-based motion detection in 4D images and application to respiratory motion suppression
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Julien Guglielmi, Thierry Pourcher, Philippe Franken, Jacques Darcourt
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.792-795, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556597⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00799368/file/Breuilly_ISBI_13.pdf BibTex
titre
A 3D segmentation algorithm for ellipsoidal shapes. Application to nuclei extraction.
auteur
Emmanuel Soubiès, Pierre Weiss, Xavier Descombes
article
ICPRAM - International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods, Feb 2013, Barcelona, Spain. pp.97-105
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00733187/file/Article_Soubies_ICPRAM_2012.pdf BibTex
titre
An efficient optimizer for simple point process models
auteur
Ahmed Gamal Eldin, Guillaume Charpiat, Xavier Descombes, Josiane Zerubia
article
SPIE, Computational Imaging XI, Feb 2013, Burlingame, California, United States. ⟨10.1117/12.2009238⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00801448/file/article.pdf BibTex
titre
Optimisation joint pour le codage/débruitage d'images bruitées
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiébaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
article
GRETSI, 2013, Brest, France
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BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Deconvolution and denoising for computational microscopy
auteur
Praveen Pankajakshan, Gilbert Engler, Laure Blanc-Féraud, Josiane Zerubia
article
F. Cazals, P. kornprobst. Modeling in Computational Biology and Biomedecine. A Multidisciplinary Endeavor, XXVI, Springer, pp.117-164, 2013
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BibTex

Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
3rd international Workshop on New Computational Methods for Inverse Problems (NCMIP 2013)
auteur
Laure Blanc-Féraud, Pierre-Yves Joubert
article
Blanc-Féraud,Laure and Joubert,Pierre-Yves. France. 464, IOP Publishing, 2013, Journal of Physics: Conference Series
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BibTex

Rapport

titre
On the optimization of the satellite imaging chain
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
article
[Research Report] I3S. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00773606/file/GRS2012.pdf BibTex
titre
Joint coding-denoising optimization of noisy images
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
article
[Research Report] I3S. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00773604/file/IP2012.pdf BibTex

Thèse

titre
Restauration d'images 3D de microscopie de fluorescence en présence d'aberrations optiques
auteur
SaÏma Ben Hadj
article
Autre. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. Français. ⟨NNT : 2013NICE4015⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00847334/file/2013NICE4015.pdf BibTex

2012

Article dans une revue

titre
Voxel-based quantitative analysis of brain images from F-18 Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography with a Block-Matching algorithm for spatial normalization
auteur
Christophe Person, Valérie Louis-Dorr, Sylvain Poussier, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Louis Maillard, Didier Wolf, Nicolas Gilet, Véronique Roch, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie
article
Clinical Nuclear Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2012, 37 (3), pp.268-273. ⟨10.1097/RLU.0b013e3182443b2d⟩
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BibTex
titre
Building Development Monitoring in Multitemporal Remotely Sensed Image Pairs with Stochastic Birth-Death Dynamics
auteur
Csaba Benedek, Xavier Descombes, Josiane Zerubia
article
IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2012, 34 (1), pp.33-50. ⟨10.1109/TPAMI.2011.94⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00730552/file/pami_BCS_accepted.pdf BibTex
titre
Sparse Poisson Noisy Image Deblurring
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud
article
IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2012, 21 (4), pp.1834-1846
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00634896/file/IP2010.pdf BibTex
titre
Double Annealing Regimes in the Multiple Birth-and-Death Stochastic Algorithms
auteur
Elena Zhizhina, Xavier Descombes
article
Markov Processes and Related Fields, Polymath, 2012, 18, pp.441-456
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BibTex

Communication dans un congrès

titre
Tracking Growing Axons by Particle Filtering in 3D+t Fluorescent Two-Photon Microscopy Images
auteur
Huei-Fang Yang, Xavier Descombes, Charles Kervrann, Caroline Medioni, Florence Besse
article
ACCV - Asian Conference on Computer Vision, Nov 2012, Daejeon, South Korea
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https://hal.inria.fr/hal-00740966/file/accv12.pdf BibTex
titre
A satellite imaging chain based on the Compressed Sensing technique
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
article
On-Board Payload Data Compression Workshop, Oct 2012, Barcelone, Spain
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https://hal.inria.fr/hal-00748523/file/2655947_carlavan.pdf BibTex
titre
Global rate-distortion optimization of satellite imaging chains
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud, Marc Antonini, Carole Thiebaut, Christophe Latry, Yves Bobichon
article
On-Board Payload Data Compression Workshop, Oct 2012, Barcelone, Spain
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00748522/file/2655866_carlavan.pdf BibTex
titre
ML estimation of hyperparameters in inverse problems with wavelet regularisation
auteur
Laure Blanc-Féraud
article
Workshop Optimization Techniques for Inverse Problems II, Sep 2012, Modena, France
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BibTex
titre
Modeling Cell-Sheets Wound Closure
auteur
Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain
article
3rd International Conference of the Moroccan Society of Applied Mathematics (SM2A), Sep 2012, Marrakesh, Morocco
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00923616/file/HABBAL_SM2A_abstract.pdf BibTex
titre
Depth variant image restoration in 3D fluorescence microscopy: two approaches under Gaussian and Poissonian noise conditions
auteur
Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Elie Maalouf, Bruno Colicchio, Alain Dieterlen
article
ISBI 2012 - 9th International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain. pp.1671-1674, ⟨10.1109/ISBI.2012.6235899⟩
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BibTex
titre
Axon extraction from fluorescent confocal microscopy images
auteur
Alejandro Mottini, Xavier Descombes, Florence Besse
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain. IEEE, 2012, <10.1109/ISBI.2012.6235660>
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BibTex
titre
Vascular network segmentation: an unsupervised approach
auteur
Xavier Descombes, Franck Plouraboué, A. El Boustani, Caroline Fonta, Geraldine Le Duc, Raphaël Serduc, Timm Weitkamp
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain. &#x27E8;10.1109/ISBI.2012.6235788&#x27E9;
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BibTex
titre
Prise en compte du mouvement respiratoire du petit animal pour la reconstruction 3D TEMP synchronisée : application aux métastases péritonéales
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe Franken
article
50ème Colloque de Médecine Nucléaire de Langue Française, Apr 2012, Montpellier, France. pp.188-189, &#x27E8;10.1016/j.mednuc.2012.02.108&#x27E9;
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BibTex
titre
Modeling and removing depth variant blur in 3D fluorescence microscopy
auteur
Laure Blanc-Féraud, Saima Ben Hadj
article
IEEE ICIP - International conference on Image Processing, Mar 2012, Kyoto, Japan
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BibTex
titre
Modeling and removing depth-variant blur from 3D fluorescence microscopy
auteur
Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud
article
ICASSP - International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing, Mar 2012, Kyoto, Japan. 2012
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BibTex
titre
Simulated breath-hold reconstruction in micro-SPECT: application to peritoneal metastases expressing NIS as reporter gene
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe Franken
article
MIBO - second Molecular Imaging in Biology and Oncology workshop - 2012, Jan 2012, Nice, France
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BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Interacting Adaptive Filters for Multiple Objects Detection
auteur
Xavier Descombes
article
Luc Florack and Remco Duits and Geurt Jongbloed and Marie-Colette van Lieshout and Laurie Davies. Mathematical Methods for Signal and Image Analysis and Representation, 41, Springer, pp.221-239, 2012, Computational Imaging and Vision, 978-1-4471-2352-1. <10.1007/978-1-4471-2353-8_13>
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BibTex

Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
2nd international Workshop on New Computational Methods for Inverse Problems
auteur
Laure Blanc-Féraud, Pierre-Yves Joubert
article
Blanc-Feraud, Laure and Joubert, Pierre-Yves. France. 386, IOP Publishing, pp.70, 2012, Journal of Physics: Conference Series
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BibTex

Autre publication

titre
A relaxation result for an inhomogeneous functional preserving point-like and curve-like singularities in image processing
auteur
Gilles Aubert, Daniele Graziani
article
2012
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https://hal.inria.fr/inria-00536206/file/augrazIJM.pdf BibTex

Rapport

titre
Skin lesion evaluation from multispectral images
auteur
Sylvain Prigent, Xavier Descombes, Didier Zugaj, Laurent Petit, Anne-Sophie Dugaret, Philippe Martel, Josiane Zerubia
article
[Research Report] RR-8136, INRIA. 2012, pp.23
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00757039/file/RR-8136.pdf BibTex
titre
Space Variant Blind Image Restoration
auteur
Saima Ben Hadj, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
[Research Report] RR-8073, INRIA. 2012, pp.49
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00735135/file/RR-8073.pdf BibTex
titre
Wavelet-based hyperparameter estimation for solving inverse problems
auteur
Caroline Chaux, Laure Blanc-Féraud
article
[Research Report] INRIA; I3S. 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00668807/file/RR_LBF_CC.pdf BibTex
titre
Classification of skin hyper-pigmentation lesions with multi-spectral images
auteur
Sylvain Prigent, Xavier Descombes, Didier Zugaj, Laurent Petit, Anne-Sophie Dugaret, Philippe Martel, Josiane Zerubia
article
[Research Report] RR-8105, INRIA. 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00745367/file/RR-8105.pdf BibTex

Thèse

titre
Apport de l'imagerie multi et hyperspectrale pour l'évaluation de la pigmentation de la peau
auteur
Sylvain Prigent
article
Traitement du signal et de l'image [eess.SP]. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. Français
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00764831/file/These.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
ADMM algorithm for demosaicking deblurring denoising
auteur
Daniele Graziani, Laure Blanc-Féraud, Gilles Aubert
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00874610/file/admcolorpaper-5.pdf BibTex

2011

Article dans une revue

titre
Trends in Bio Imaging and Signal Processing
auteur
Jean-Christophe Olivo-Marin, Laure Blanc-Féraud, Michael Unser, Andrew Laine, Boudewijn Lelieveldt
article
IEEE Signal Processing Magazine, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 28 (6), pp.200-191. &#x27E8;10.1109/MSP.2011.942317&#x27E9;
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titre
A Marked Point Process Model Including Strong Prior Shape Information Applied to Multiple Object Extraction From Images.
auteur
Maria Kulikova, Ian Jermyn, Xavier Descombes, Elena Zhizhina, Josiane Zerubia
article
International Journal of Computer Vision and Image Processing, 2011, 1 (2), pp.1-12. &#x27E8;10.4018/ijcvip.2011040101&#x27E9;
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titre
Regularized inversion of a distributed point source model for the reconstruction of defects in eddy current imagin
auteur
S. Bausson, Vincent Thomas, Pierre-Yves Joubert, Laure Blanc-Féraud, Jérôme Darbon, Gilles Aubert
article
The International Journal for Computation and Mathematics in Electrical Engineering, Emerald, 2011, 30 (6)
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Communication dans un congrès

titre
Analyse par micro-tomographie RX des réseaux vasculaires normaux et tumoraux
auteur
Franck Plouraboué, Laurent Risser, Xavier Descombes, A. El Boustani, Caroline Fonta, Géraldine Le Duc, Raphaël Serduc, Timm Weitkamp
article
7èmes Journées du Cancéropôle Grand Sud-Ouest, Oct 2011, Bordeaux, France
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titre
Regularizing parameter estimation for Poisson noisy image restoration.
auteur
Laure Blanc-Féraud, Mikael Carlavan
article
Optimisation et traitement des images, GdR MOA et GdR MSPC, Jun 2011, La Londe les Maures, France
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titre
Regularizing parameter estimation for Poisson noisy image restoration
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud
article
International ICST Workshop on New Computational Methods for Inverse Problems, May 2011, Paris, France
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https://hal.inria.fr/inria-00590906/file/NCMIP11.pdf BibTex
titre
Brain tumor vascular network segmentation from micro-tomography
auteur
Xavier Descombes, Franck Plouraboue, Habdelhakim Boustani, Caroline Fonta, Geraldine Leduc, Raphael Serduc, Timm Weitkamp
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, 2011, Chicago, United States. pp.1113 - 1116, &#x27E8;10.1109/ISBI.2011.5872596&#x27E9;
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titre
Two constrained formulations for deblurring poisson noisy images
auteur
Mikael Carlavan, Laure Blanc-Féraud
article
IEEE International Conference on Image Processing, 2011, Brussels, Belgium
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https://hal.inria.fr/inria-00591035/file/ICIP2011.pdf BibTex

Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Stochastic geometry for image analysis
auteur
Xavier Descombes
article
Xavier Descombes. France. Wiley-ISTE, pp.384, 2011, 978-1-84821-240-4
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Ouvrage (y compris édition critique et traduction)

titre
Applications de la géometrie stochastique à l'analyse d'images
auteur
Florent Chatelain, Xavier Descombes, Florent Lafarge, Christian Lantuéjoul, Clement Mallet, Robert Minlos, Michel Schmitt, Marc Sigelle, Radu Stoica, Elena Zhizhina
article
Xavier Descombes. Hermes Science-Lavoisier, pp.250, 2011, 978-2-7462-2145-1
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2010

Document associé à des manifestations scientifiques

titre
Definition of motionless phases for monitoring gated reconstruction of SPECT images in alive mice
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe Franken
article
ICVSS - International Computer Vision Summer School, Jul 2010, Punta Sampieri, 97010 Scicli, Sicile, Italy. 2010
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https://hal.inria.fr/hal-00759962/file/BreuillyICVSS2010.pdf BibTex

2009

Communication dans un congrès

titre
Estimation d'hyperparamètres pour la résolution de problèmes inverses à l'aide d'ondelettes
auteur
Caroline Chaux, Laure Blanc-Féraud
article
GRETSI 2009, Sep 2009, Dijon, France, France. 10pp
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2008

Article dans une revue

titre
Gap Filling of 3-D Microvascular Networks by Tensor Voting
auteur
Laurent Risser, Franck Plouraboué, Xavier Descombes
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 27 (5), pp.674-687. &#x27E8;10.1109/TMI.2007.913248&#x27E9;
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Communication dans un congrès

titre
Building reconstruction from a single DEM
auteur
Florent Lafarge, Xavier Descombes, Josiane Zerubia, Marc Pierrot-Deseilligny
article
Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), Jun 2008, Anchorage, United States
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https://hal.inria.fr/hal-00781733/file/2008_lafarge_cvpr08.pdf BibTex

2000

Article dans une revue

titre
Regularized bi-conjugate gradient algorithm for tomographic reconstruction of buried objects
auteur
Cédric Dourthe, Christian Pichot, Jean-Yves Dauvignac, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
IEICE Transactions on Electronics, Institute of Electronics, Information and Communication Engineers, 2000, E83-C (12), pp.1858-1863. &#x27E8;https://www.researchgate.net/publication/234076505_Regularized_Bi-Conjugate_Gradient_Algorithm_for_Tomographic_Reconstruction_of_Buried_Objects&#x27E9;
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Communication dans un congrès

titre
A boundary-oriented inverse scattering method based on contour deformations by means of PDE-Driven level sets for radar imaging
auteur
R. Ferraye, Jean-Yves Dauvignac, Christian Pichot, Michel Barlaud, Laure Blanc-Féraud, Jean-Paul Zolesio
article
European Microwave Conference (EuMW 2000) - Workshop on Microwave Imaging Methods and Techniques, Oct 2000, Paris, France. pp.11-18
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1999

Article dans une revue

titre
Image reconstruction from the 1997 Ipswich data using conjugate-gradient
auteur
P. Lobel, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud, A.K. Louis
article
IEEE Antennas and Propagation Magazine, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 1999, 41 (1), pp.48-51. &#x27E8;10.1109/74.755026&#x27E9;
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1998

Chapitre d'ouvrage

titre
Edge-preserving regularization for quantitative reconstruction algorithms in microwave imaging
auteur
P. Lobel, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
A. Ramm (Ed.). Tomagraphy and Image Processing, Plenum Press, pp.113-124, 1998, 0-306-45828-4
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1997

Article dans une revue

titre
Conjugate-gradient algorithm with edge- preserving regularization for image reconstruction from Ipswich data for mytery objects
auteur
P. Lobel, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
IEEE Transactions on Magnetics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 1997, 39 (2), pp.12-14. &#x27E8;10.1109/74.584492&#x27E9;
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titre
A new regularization scheme for inverse scattering
auteur
P. Lobel, Laure Blanc-Féraud, Christian Pichot, Michel Barlaud
article
Inverse Problems, IOP Publishing, 1997, 13 (2), pp.403-410. &#x27E8;10.1088/0266-5611/13/2/013&#x27E9;
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titre
Microwave imaging : reconstruction from experimental data using conjugate gradient and enhancement by edge-preserving regularization
auteur
P. Lobel, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
International Journal of Imaging Systems and Technology, Wiley, 1997, 8 (4), pp.337-342. &#x27E8;10.1002/(SICI)1098-1098(1997)8:4<337::AID-IMA1>3.0.CO;2-B&#x27E9;
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titre
Microwave inverse scattering : Quantitative reconstruction of complex permittivity for different applications
auteur
Christian Pichot, P. Lobel, Cédric Dourthe, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
IEICE Transactions on Electronics, Institute of Electronics, Information and Communication Engineers, 1997, E80-C (11), pp.1343-1348
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Communication dans un congrès

titre
Reconstructions from the 1997 Ipswich data using edge-ereserving regularized conjugate gradient algorithm
auteur
P. Lobel, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
IEEE Antennas and Propagation International Symposium (IEEE AP-S 1997) / URSI North American Radio Science Meeting, Jul 1997, Montreal, Canada. pp.159
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titre
Iterative regularized algorithms for Quantitative imaging in microwave tomography : the conjugate gradient and the modified gradient
auteur
P. Lobel, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
Progress In Electromagnetic Research Symposium (PIERS 97), Jul 1997, Cambridge, United States. pp.729
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titre
Quantitative microwave reconstruction algorithms for buried or non-buried objects
auteur
Christian Pichot, P. Lobel, Cédric Dourthe, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
3rd International Workshop on Inverse Problems in Electromagnetics and Acoustics (PIEMA 97), Jun 1997, Clermont-Ferrand, France. pp.1-13
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1996

Article dans une revue

titre
Conjugate gradient method for solving inverse scattering with experimental data
auteur
P. Lobel, R.E. Kleinman, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
IEEE Antennas and Propagation Magazine, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 1996, 38 (3), pp.48-51. &#x27E8;10.1109/MAP.1996.511954&#x27E9;
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Communication dans un congrès

titre
Regularized inversion algorithms for microwave imaging
auteur
P. Lobel, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
XXVe General Assembly of URSI (URSI 1996), Aug 1996, Lille, France. pp.74
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titre
Conjugate gradient algorithm with edge- preserving regularization for image reconstruction from experimental data
auteur
P. Lobel, Christian Pichot, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
IEEE Antennas and Propagation International Symposium (IEEE AP-S 1996), Jul 1996, Baltimore, United States. pp.644-647
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titre
Conjugate gradient algorithm with edge- preserving regularization for microwave inverse scattering
auteur
P. Lobel, Laure Blanc-Féraud, Christian Pichot, Michel Barlaud
article
Progress In Electromagnetic Research Symposium (PIERS 96), Jul 1996, Innsbruck, Austria. pp.355
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titre
Inversion algorithms for Microwave Imaging using different modalities and for various applications
auteur
Christian Pichot, P. Lobel, Cédric Dourthe, Laure Blanc-Féraud, Michel Barlaud
article
1st EMSL User Workshop, Apr 1996, Ispra, Italy. Abstracts.in European Commission, EUR Report no.17326EN, 1997
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