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Equipe de recherche MONC

Publications de l'équipe MONC

2017

Article dans une revue

titre
A framework for continuous target tracking during MR-guided high intensity focused ultrasound thermal ablations in the abdomen
auteur
Cornel Zachiu, Baudouin Denis de Senneville, Ivan D. Dmitriev, Chrit T. W. Moonen, Mario Ries
article
Journal of Therapeutic Ultrasound, BioMed Central, 2017, 5 (1), 〈10.1186/s40349-017-0106-y〉
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titre
Precision of manual two-dimensional segmentations of lung and liver metastases and its impact on tumour response assessment using RECIST 1.1
auteur
F. Cornelis, M. Martin, Olivier Saut, X. Buy, M. Kind, J. Palussiere, T. Colin
article
European Radiology Experimental, 2017, 1 (1), 〈10.1186/s41747-017-0015-4〉
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https://hal.inria.fr/hal-01634849/file/s41747-017-0015-4.pdf BibTex
titre
Revisiting bevacizumab + cytotoxics scheduling using mathematical modeling: proof of concept study in experimental non-small cell lung carcinoma
auteur
Diane-Charlotte Imbs, Raouf El Cheikh, Arnaud Boyer, Joseph Ciccolini, Celine Mascaux, Bruno Lacarelle, Fabrice Barlesi, Dominique Barbolosi, Sébastien Benzekry
article
CPT: Pharmacometrics and Systems Pharmacology, Wiley, A Paraître
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https://hal.inria.fr/hal-01624423/file/beva_lung.pdf BibTex
titre
Real-time non-rigid target tracking for ultrasound-guided clinical interventions
auteur
Cornel Zachiu, Mario Ries, Pascal Ramaekers, Jean-Luc Guey, Chrit T. W. Moonen, Baudouin Denis de Senneville
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2017, 62 (20), pp.8154 - 8177. 〈10.1088/1361-6560/aa8c66〉
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titre
Tumor growth model of ductal carcinoma: from in situ phase to stroma invasion
auteur
Olivier Gallinato, Thierry Colin, Olivier Saut, Clair Poignard
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2017, 429, pp.253 - 266. 〈10.1016/j.jtbi.2017.06.022〉
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https://hal.inria.fr/hal-01598837/file/paperBreastHidden.pdf BibTex
titre
Superconvergent second order Cartesian method for solving free boundary problem for invadopodia formation
auteur
Olivier Gallinato, Clair Poignard
article
Journal of Computational Physics, Elsevier, 2017, 339, pp.412 - 431. 〈10.1016/j.jcp.2017.03.010〉
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https://hal.inria.fr/hal-01483484/file/subm_paperJCP.pdf BibTex
titre
A novel adaptive needle insertion sequencing for robotic, single needle MR-guided high-dose-rate prostate brachytherapy
auteur
Maxence Borot de Battisti, Baudouin Denis de Senneville, Gilion Hautvast, D Binnekamp, Jan Lagendijk, M Maenhout, M Moerland
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2017
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titre
An Adaptive Non-Local-Means Filter for Real-Time MR-Thermometry
auteur
Cornel Zachiu, Mario Ries, Chrit Moonen, Baudouin Denis de Senneville
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017
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titre
A Voronoi Interface approach to cell aggregate electropermeabilization
auteur
Arthur Guittet, Clair Poignard, Frederic Gibou
article
Journal of Computational Physics, Elsevier, 2017, 332, pp.143 - 159. 〈10.1016/j.jcp.2016.11.048〉
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https://hal.inria.fr/hal-01483521/file/Revision_JCP_11_21_2016.pdf BibTex
titre
Mathematical model for transport of DNA plasmids from the external medium up to the nucleus by electroporation
auteur
Michael Leguèbe, Maria Notarangelo, Monika Twarogowska, Roberto Natalini, Clair Poignard
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2017, 285, pp.1-13. 〈10.1016/j.mbs.2016.11.015〉
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https://hal.inria.fr/hal-01412380/file/Revision1.pdf BibTex
titre
Feasibility of real-time MR thermal dose mapping for predicting radiofrequency ablation outcome in the myocardium in vivo
auteur
Solenne Toupin, Pierre Bour, Matthieu Lepetit-Coiffe, Valery Ozenne, Baudouin Denis de Senneville, Rainer Schneider, Alexis Vaussy, Arnaud Chaumeil, Hubert Cochet, Frédéric Sacher, Pierre Jais, Bruno Quesson
article
Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance, BioMed Central, 2017, 19 (1), pp.14
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titre
Combination of principal component analysis and optical-flow motion compensation for improved cardiac MR thermometry
auteur
Solenne Toupin, Baudouin Denis de Senneville, Valery Ozenne, Pierre Bour, Matthieu Lepetit-Coiffe, M Boissenin, Pierre Jais, Bruno Quesson
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2017, 62 (4), pp.1208-1224
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titre
Etude de l'effet séquence bevacizumab/pemetrexed/cisplatine chez la souris porteuse de cancer du poumon non à petites cellules
auteur
Arnaud Boyer, Joseph Ciccolini, Céline Mascaux, Diane-Charlotte Imbs, Raouf El Cheikh, Fabrice Barlesi, Sébastien Benzekry
article
Revue des Maladies Respiratoires, Elsevier Masson, 2017, 34, 〈10.1016/j.rmr.2016.10.110〉
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titre
Irreversible Electroporation: Disappearance of Observable Changes at Imaging Does Not Always Imply Complete Reversibility of the Underlying Causal Tissue Changes
auteur
Olivier Seror, Clair Poignard, Olivier Gallinato, Rafik Belkacem-Ourabia, Olivier Sutter
article
Radiology, Radiological Society of North America, 2017, 282, pp.301 - 302. 〈10.1148/radiol.2017161809〉
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https://hal.inria.fr/hal-01421863/file/Preprint.pdf BibTex
titre
Mathematical modeling of tumor-tumor distant interactions supports a systemic control of tumor growth
auteur
Sébastien Benzekry, Clare Lamont, Dominique Barbolosi, Lynn Hlatky, Philip Hahnfeldt
article
Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2017, 〈10.1158/0008-5472.CAN-17-0564〉
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https://hal.inria.fr/hal-01566947/file/benzekry_concomitant_resistance_all.pdf https://hal.inria.fr/hal-01566947/file/supplementary_figures_tables.pdf BibTex
titre
Dynamical modeling of tissue electroporation
auteur
Damien Voyer, Aude Silve, Lluis M. Mir, Riccardo Scorretti, Clair Poignard
article
Bioelectrochemistry, Elsevier, A Paraître, 119, pp.98 - 110. 〈10.1016/j.bioelechem.2017.08.007〉
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https://hal.inria.fr/hal-01598846/file/201708SourceBIOJEC7041.pdf BibTex
titre
Non-standard radiotherapy fractionations delay the time to malignant transformation of low-grade gliomas
auteur
Araceli Henares-Molina, Sébastien Benzekry, Pedro Lara, Marcial García-Rojo, Víctor Pérez-García, Alicia Martínez-González
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 〈10.1371/journal.pone.0178552.t001〉
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https://hal.inria.fr/hal-01532505/file/Henares-Molina_2017_PloSOne_Non-standard%20radiotherapy%20fractionations%20delay%20the%20time%20to%20malignant%20transformation%20of%20low-grade%20gliomas.pdf BibTex
titre
Respiratory motion model based on the noise covariance matrix of a receive array
auteur
A. Andreychenko, Baudouin Denis de Senneville, R. Navest, Rob Tijssen, Jan Lagendijk, C. Van den Berg
article
Magnetic Resonance in Medicine, Wiley, 2017
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titre
Model-driven optimization of antiangiogenics + cytotoxics combination: application to breast cancer mice treated with bevacizumab + paclitaxel doublet leads to reduced tumor growth and fewer metastasis
auteur
Severine Mollard, Joseph Ciccolini, Diane-Charlotte Imbs, Raouf El Cheikh, Dominique Barbolosi, Sébastien Benzekry
article
Oncotarget, Impact journals, 2017, 〈10.18632/oncotarget.15484〉
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https://hal.inria.fr/hal-01474679/file/Mollard_17_Oncotarget_Model%20driven%20optimization%20of%20antiangiogenics%20%2B%20cytotoxics%20combination%20application%20to%20breast%20cancer%20mice%20treated%20with%20bevacizumab%20%2B%20paclitaxel%20doublet%20leads%20to%20reduced%20tumor%20growth%20and%20fewer%20metastasis.pdf BibTex
titre
Fluid filling of the digestive tract for improved proton resonance frequency shift-based MR thermometry in the pancreas
auteur
Cyril Ferrer, Wilbert Bartels, M Van Stralen, Baudouin Denis de Senneville, Chrit Moonen, Clemens Bos
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, Wiley-Blackwell, 2017
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titre
Front shape similarity measure for shape-oriented sensitivity analysis and data assimilation for Eikonal equation
auteur
Mélanie Rochoux, Annabelle Collin, Cong Zhang, Arnaud Trouvé, Didier Lucor, Philippe Moireau
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, EDP Sciences, A Paraître, pp.1-22
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https://hal.inria.fr/hal-01625575/file/ESAIM17_review.pdf BibTex
titre
Effect of intra-fraction motion on the accumulated dose for free-breathing MR-guided stereotactic body radiation therapy of renal-cell carcinoma
auteur
Bjorn Stemkens, Markus Glitzner, C Kontaxis, Baudouin Denis de Senneville, F Prins, Sjoerd Crijns, L Kerkmeijer, Jan Lagendijk, C. Van den Berg, Rob Tijssen
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2017
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titre
Development of a fluid dynamic model for quantitative contrast-enhanced ultrasound imaging
auteur
Baudouin Denis de Senneville, Anthony Novell, Chloé Arthuis, Vanda Mendes, Paul-Armand Dujardin, Frédéric Patat, Ayache Bouakaz, Jean-Michel Escoffre, Franck Perrotin
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, 〈10.1109/TMI.2017.2743099〉
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Communication dans un congrès

titre
Optimized radiotherapy protocols delay the malignant transformation of low-grade gliomas in-silico
auteur
Araceli Henares-Molina, Sébastien Benzekry, Pedro Lara, Marcial García-Rojo, Victor Pérez-García, Alicia Martínez-González
article
5th Quadrennial Meeting of the World Federation of Neuro-Oncology Societies, May 2017, Zurich, France. 19 (suppl_3), pp.iii12 - iii12, 〈10.1093/neuonc/nox036.040〉
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Chapitre d'ouvrage

titre
Different Approaches Used in Modeling of Cell Membrane Electroporation
auteur
Clair Poignard, Aude Silve, Lars Wegner
article
Handbook of Electroporation, Springer, pp.24, 2017, Handbook of Electroporation, 978-3-319-26779-1. 〈10.1007/978-3-319-26779-1_3-1〉. 〈https://link.springer.com/referencework/10.1007/978-3-319-26779-1〉
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https://hal.inria.fr/hal-01483487/file/ChapterCellMod.pdf BibTex

Document associé à des manifestations scientifiques

titre
Joint-state and parameters estimation using nudging and SEIK filters for HIV mechanistic models
auteur
Mélanie Prague, Rodolphe Thiébaut, Philippe Moireau, Annabelle Collin
article
Journée de la statistique francaise, Jun 2017, Avignon, France
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https://hal.inria.fr/hal-01579068/file/Abstract_PRAGUE_JDS2017_v2.pdf BibTex

Rapport

titre
A continuum mechanics model of enzyme-based tissue degradation in cancer therapies
auteur
Manon Deville, Roberto Natalini, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-9030, Inria Bordeaux Sud-Ouest; IMB - Institut de Mathématiques de Bordeaux; Université de Bordeaux; IAC - Istituto per le Applicazioni del Calcolo "M. Picone", Consiglio Nazionale delle Ricerche. 2017
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https://hal.inria.fr/hal-01469180/file/RR-9030.pdf BibTex

2016

Article dans une revue

titre
Free boundary problem for cell protrusion formations: theoretical and numerical aspects
auteur
Olivier Gallinato, Masahito Ohta, Clair Poignard, Takashi Suzuki
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2016, 〈10.1007/s00285-016-1080-7〉
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https://hal.inria.fr/hal-01412264/file/subm_paperJMB-v2-R1.pdf BibTex
titre
Analysis-suitable G1 multi-patch parametrizations for C1 isogeometric spaces
auteur
Annabelle Collin, Giancarlo Sangalli, Thomas Takacs
article
Computer Aided Geometric Design, Elsevier, 2016
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https://arxiv.org/pdf/1509.07619 BibTex
titre
Multi-scale Modeling in Clinical Oncology: Opportunities and Barriers to Success
auteur
Thomas E. Yankeelov, Gary An, Oliver Saut, Guy M. Genin, E. Georg Luebeck, Aleksander S. Popel, Benjamin Ribba, Paolo Vicini, Xiaobo Zhou, Jared A. Weis, Kaiming Ye
article
Annals of Biomedical Engineering, Springer Verlag, 2016, 44 (9)
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https://hal.inria.fr/hal-01396241/file/MSM_oncology_manuscript_revised_v4.pdf BibTex
titre
Mathematical modeling of cancer immunotherapy and its synergy with radiotherapy
auteur
R. Serre, Sébastien Benzekry, Laetitia Padovani, C. Meille, N. Andre, J. Ciccolini, F. Barlesi, X. Muracciole, D. Barbolosi
article
Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2016, 〈10.1158/0008-5472.CAN-15-3567〉
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BibTex
titre
Modeling Spontaneous Metastasis following Surgery: An In Vivo-In Silico Approach
auteur
Sébastien Benzekry, A. Tracz, M. Mastri, R. Corbelli, D. Barbolosi, J. M. L. Ebos
article
Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2016, 76 (3), pp.535 - 547. 〈10.1158/0008-5472.CAN-15-1389〉
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https://hal.inria.fr/hal-01222046/file/benzekryEbos_surgery_all_HAL.pdf BibTex
titre
Impact of external medium conductivity on cell membrane electropermeabilization by microsecond and nanosecond electric pulses
auteur
Aude Silve, Isabelle Leray, Clair Poignard, Lluis M. Mir
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, 〈10.1038/srep19957〉
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BibTex
titre
Computational Trials: Unraveling Motility Phenotypes, Progression Patterns, and Treatment Options for Glioblastoma Multiforme
auteur
Fabio Raman, Elizabeth Scribner, Olivier Saut, Cornelia Wenger, Thierry Colin, Hassan Fathallah-Shaykh
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (1), 〈10.1371/journal.pone.0146617〉
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https://hal.inria.fr/hal-01396271/file/journal.pone.0146617.PDF BibTex
titre
In Vivo Bioluminescence Tomography for Monitoring Breast Tumor Growth and Metastatic Spreading: Comparative Study and Mathematical Modeling
auteur
Séverine Mollard, Raphaelle Fanciullino, Sarah Giacometti, Cindy Serdjebi, Sebastien Benzekry, Joseph Ciccolini
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.10. 〈10.1038/srep36173〉
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https://hal.inria.fr/hal-01392861/file/Mollard_16_In%20vivo%20bioluminescence%20tomography%20for%20monitoring%20breast%20tumor%20growth%20and%20metastatic%20spreading-%20comparative%20study%20and%20mathematical%20modeling.pdf BibTex
titre
Les lois de la croissance tumorale
auteur
Sébastien Benzekry
article
Bibliothèque Tangente, Editions Pôle Paris, 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01418295/file/les_lois_de_la_croissance_tumorale_all.pdf BibTex
titre
Next generation metronomic chemotherapy - report from the Fifth Biennial International Metronomic and Anti-angiogenic Therapy Meeting, 6 - 8 May 2016, Mumbai
auteur
Pan Pantziarka, Lisa Hutchinson, Nicolas André, Sébastien Benzekry, Francesco Bertolini, Atanu Bhattacharjee, Shubhada Chiplunkar, Dan Duda, Vikram Gota, Sudeep Gupta, Amit Joshi, Sadhana Kannan, Robert Kerbel, Mark Kieran, Antonella Palazzo, Aparna Parikh, Eddy Pasquier, Vijay Patil, Kumar Prabhash, Yuval Shaked, Giselle Sholler, Jaroslav Sterba, David Waxman, Shripad Banavali
article
Ecancermedicalscience, 2016, 10, 〈10.3332/ecancer.2016.689〉
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https://hal.inria.fr/hal-01392473/file/Pantziarka_16_Next%20generation%20metronomic%20chemotherapy%E2%80%94report%20from%20the%20Fifth%20Biennial%20International%20Metronomic%20and%20Anti-angiogenic%20Therapy%20Meeting%206%E2%80%938%20May%202016%20Mumbai.pdf BibTex
titre
Spatial modelling of tumour drug resistance: the case of GIST liver metastases Mathematical Medicine and Biology Advance
auteur
Guillaume Lefebvre, François Cornelis, Patricio Cumsille, Thierry Colin, Clair Poignard, Olivier Saut
article
Mathematical Medicine and Biology, Oxford University Press (OUP), 2016, 00, pp.1 - 26. 〈10.1093/imammb/dqw002〉
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https://hal.inria.fr/hal-01380292/file/2016MMB-LCCCPS.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Asymptotic expansion for the magnetic potential in the eddy-current problem
auteur
Ronan Perrussel, Clair Poignard, Victor Péron, Ruth V. Sabariego, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl
article
10th International Symposium on Electric and Magnetic Fields (EMF 2016), Apr 2016, Lyon, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01393362/file/153.pdf BibTex
titre
Abstract 2099: Model-driven optimization of anti-angiogenics combined with chemotherapy: application to bevacizumab + pemetrexed/cisplatin doublet in NSCLC-bearing mice
auteur
Joseph Ciccolini, Sebastien Benzekry, Sarah Giacometti, Fabrice Barlesi, Dominique Barbolosi
article
107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research, 2016, New Orleans, France. 76 (14 Supplement), pp.20, 〈10.1158/1538-7445.AM2016-2099〉
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Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Dynamic Modeling of Electroporation for the Computation of the Electric Field Distribution Inside Biological Tissues during the Application of the Pulse Voltage
auteur
Lluis Mir, Clair Poignard, Riccardo Scorretti, A. Silve, Damien Voyer
article
1st World Congress on Electroporation and Pulsed Electric Fields in Biology, Medicine and Food & Environmental Technologies, Sep 2015, Portorož, Slovenia. 53 (Part IX), Springer, pp.211-214, 2016, IFMBE Proceedings: 1st World Congress on Electroporation and Pulsed Electric Fields in Biology, Medicine and Food & Environmental Technologies, 978-981-287-817-5. 〈10.1007/978-981-287-817-5_47〉
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BibTex

Poster

titre
The effects of the diffusive inclusions in the bidomain model: theoretical and numerical study. Application to the rat heart.
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard
article
2nd Scientific Workshop IHU-Liryc, Nov 2016, Bordeaux, France
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https://hal.inria.fr/hal-01418706/file/main.pdf BibTex
titre
Front observer for data assimilation of electroanatomical mapping data for a numerical atrial model
auteur
A Gérard, Annabelle Collin, J Bayer, A Frontera, Philippe Moireau, Yves Coudière
article
Liryc Workshop, Sep 2016, Bordeaux, France
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https://hal.inria.fr/hal-01400776/file/poster.pdf BibTex

Rapport

titre
Mathematical model for transport of DNA plasmids from the external medium up to the nucleus by electroporation
auteur
Michael Leguèbe, Maria G. Notarangelo, Monika Twarogowska, Roberto Natalini, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8939, Inria Bordeaux Sud-Ouest. 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01349522/file/RR-8939.pdf BibTex
titre
Free boundary problem for cell protrusion formations: theoretical and numerical aspects
auteur
Olivier Gallinato, Masahito Ohta, Clair Poignard, Takashi Suzuki
article
[Research Report] RR-8810, INRIA; Institut de Mathématiques de Bordeaux; Université de Bordeaux; Tokyo University of Science; Osaka University. 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01228013/file/RR-8810-rr.pdf BibTex
titre
Different Approaches used in Modeling of Cell Membrane Electroporation
auteur
Clair Poignard, A Silve, L Wegner
article
[Research Report] RR-8940, Inria Bordeaux Sud-Ouest. 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01349523/file/RR-8940.pdf BibTex
titre
Around a mathematical model of the concomitant tumor resistance phenomenon
auteur
Laura Lumale, Sébastien Benzekry
article
[Research Report] INRIA Bordeaux; Equipe MONC; INSA Toulouse. 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01420449/file/rapport_stage.pdf BibTex
titre
Mathematical modeling of tumor and metastatic growth when treated with sunitinib
auteur
Simon Evain, Sebastien Benzekry
article
[Research Report] Inria Bordeaux Sud-Ouest. 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01377994/file/Mathematical%20modeling%20of%20tumor%20and%20metastatic%20growth%20when%20treated%20with%20sunitinib%20EVAIN%20BENZEKRY.pdf BibTex

Thèse

titre
Modélisation de processus cancéreux et méthodes superconvergentes de résolution de problèmes d'interface sur grille cartésienne
auteur
Olivier Gallinato
article
Modélisation et simulation. Université de Bordeaux, 2016. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01419334/file/manthesis.pdf BibTex
titre
Identification of unknown model parameters and sensitivity analysis for abrasive waterjet milling process
auteur
Vladimir Groza
article
Analysis of PDEs [math.AP]. Universite Nice Sophia Antipolis, 2016. English
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01410323/file/These%20GROZA%20final.pdf BibTex
titre
A quantitative study of the metastatic process through mathematical modeling
auteur
Etienne Baratchart
article
Computation [stat.CO]. Université de Bordeaux, 2016. English. 〈NNT : 2016BORD0023〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01314117/file/BARATCHART_ETIENNE_2016.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
The Modified Bidomain Model with Periodic Diffusive Inclusions
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard
article
2016
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2015

Article dans une revue

titre
Cell membrane permeabilization by 12-ns electric pulses: Not a purely dielectric, but a charge-dependent phenomenon
auteur
Aude Silve, Isabelle Leray, Michael Leguèbe, Clair Poignard, Lluis M. Mir
article
Bioelectrochemistry, Elsevier, 2015, Volume 106, Part B, December 2015, Pages 369–378, 〈10.1016/j.bioelechem.2015.06.002〉
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BibTex
titre
TMOD−03 * Motility controls growth and progression patterns of glioblastoma multiforme
auteur
Olivier Saut, Thierry Colin, Hassan Fathallah, Elizabeth Scribner
article
Neuro-Oncology, Oxford University Press (OUP), 2015, 〈10.1093/neuonc/nov237.03〉
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BibTex
titre
Capturing the Driving Role of Tumor-Host Crosstalk in a Dynamical Model of Tumor Growth
auteur
Sebastien Benzekry, Afshin Beheshti, Philip Hahnfeldt, Lynn Hlatky
article
Bio-protocol , Bio-protocol LCC, 2015, 5 (21), 〈http://bio-protocol.org/e1644〉
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https://hal.inria.fr/hal-01222068/file/Capturing%20the%20Driving%20Role%20of%20Tumor-Host%20Crosstalk_Final.pdf BibTex
titre
Computational Modelling of Metastasis Development in Renal Cell Carcinoma
auteur
Etienne Baratchart, Sébastien Benzekry, Andreas Bikfalvi, Thierry Colin, Lindsay S. Cooley, Raphäel Pineau, Emeline J Ribot, Olivier Saut, Wilfried Souleyreau
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2015, 11 (11), 〈10.1371/journal.pcbi.1004626〉
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https://hal.inria.fr/hal-01164834/file/journal.pcbi.1004626.pdf BibTex
titre
Adaptive radiotherapy in routine: The radiation oncologist's point of view
auteur
Olivier Saut, Bénédicte Henriques de Figueiredo, Adeline Petit, Paul Sargos, Guy Kantor, Claudia Pouypoudat, Christina Zacharatou, Mikael Antoine
article
Cancer Radiothérapie, Elsevier Masson, 2015, 19 (6), 〈10.1016/j.canrad.2015.06.016〉
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BibTex
titre
A second-order Cartesian method for the simulation of electropermeabilization cell models
auteur
M. Leguèbe, Clair Poignard, L. Weynans
article
Journal of Computational Physics, Elsevier, 2015, 292, pp.26. 〈10.1016/j.jcp.2015.03.028〉
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titre
Migration and orientation of endothelial cells on micropatterned polymers: A simple model based on classical mechanics
auteur
Julie Joie, Yifeng Lei, Marie-Christine Durrieu, Thierry Colin, Clair Poignard, Olivier Saut
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2015, 20 (4), 〈10.3934/dcdsb.2015.20.1059〉
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titre
Host Age Is a Systemic Regulator of Gene Expression Impacting Cancer Progression
auteur
Afshin Beheshti, Sebastien Benzekry, J. Tyson Mcdonald, Lili Ma, Michael Peluso, Philip Hahnfeldt, Lynn Hlatky
article
Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2015, 75 (6), pp.10. 〈10.1158/0008-5472.CAN-14-1053〉
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titre
Non-Linear Steady-State Electrical Current Modeling for the Electropermeabilization of Biological Tissue
auteur
Marie Breton, Francois Buret, Laurent Krähenbühl, Michael Leguèbe, Lluis M. Mir, Ronan Perrussel, Clair Poignard, Riccardo Scorretti, Damien Voyer
article
IEEE Transactions on Magnetics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 51 (3), pp.7402104. 〈10.1109/TMAG.2014.2351836〉
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titre
Design principles for cancer therapy guided by changes in complexity of protein-protein interaction networks
auteur
Sebastien Benzekry, Jack A Tuszynski, Edward Rietman, Giannoula Lakka Klement
article
Biology Direct, BioMed Central, 2015, pp.14. 〈10.1186/s13062-015-0058-5〉
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https://hal.inria.fr/hal-01158313/file/s13062-015-0058-5.pdf BibTex
titre
Improving efficacy of the combination between antiangiogenic and chemotherapy: Time for mathematical modeling support
auteur
Joseph Ciccolini, Sébastien Benzekry, Bruno Lacarelle, Dominique Barbolosi, Fabrice Barlési
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2015, pp.1. 〈10.1073/pnas.1506689112〉
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titre
Metronomic Reloaded: Theoretical Models Bringing Chemotherapy into the Era of Precision Medicine
auteur
Sébastien Benzekry, Eddy Pasquier, Dominique Barbolosi, Bruno Lacarelle, Fabrice Barlési, Nicolas André, Joseph Ciccolini
article
Seminars in Cancer Biology, Elsevier, 2015, pp.23. 〈10.1016/j.semcancer.2015.09.002〉
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https://hal.inria.fr/hal-01195547/file/BenzekryPasquierAndreCiccolini_SCB_15_Metronomic%20reloaded%20theoretical%20models%20bringing%20chemotherapy%20into%20the%20era%20of%20precision%20medicine_hal.pdf BibTex
titre
Patient specific simulation of tumor growth, response to the treatment and relapse of a lung metastasis: a clinical case
auteur
Thierry Colin, François Cornelis, Julien Jouganous, Jean Palussière, Olivier Saut
article
Journal of Computational Surgery, Springer, 2015, pp.18. 〈10.1186/s40244-014-0014-1〉
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https://hal.inria.fr/hal-01102586/file/article.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Microscopic Modelling of the Non-Linear Gap Junction Channels
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
2015 Computing in Cardiology Conference (CinC), Sep 2015, Nice, France
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https://hal.inria.fr/hal-01418702/file/paper.pdf BibTex
titre
Efficient delta-parametrization of 2D Surface-Impedance solutions
auteur
Laurent Krähenbühl, Patrick Dular, Victor Péron, Ronan Perrussel, Ruth V. Sabariego, Clair Poignard
article
Compumag, Jun 2015, Montréal, Canada. pp.442, 2015, Proceedings of the 20th International Conference on the Computation of Electromagnetic Fields
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01174983/file/PC4%20Kr%C3%A4henb%C3%BChl-Efficient%20delta-parametrization%20of%202D%20Surface-Impedance%20solutions.pdf BibTex
titre
Impédances de surface en 2D : comparaison de méthodes de paramétrisation en δ
auteur
Laurent Krähenbühl, P Dular, V Péron, R Perrussel, R Sabariego, Clair Poignard
article
M. Féliachi. Numélec, Jun 2015, Nantes, France. 2015, Actes de la 8ème Conférence Européenne sur les Méthodes Numériques en Electromagnétisme
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199546/file/Numelec2015_66.pdf BibTex
titre
On the growth and dissemination laws in a mathematical model of metastatic growth
auteur
Sébastien Benzekry, John Ebos
article
Workshop on Multiscale and Hybrid Modelling in Cell and Cell Population Biology, Mar 2015, Paris, France. 〈10.1051/itmconf/20150500007〉
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https://hal.inria.fr/hal-01222088/file/benzekry_ebos.pdf BibTex

Mémoire d'étudiant

titre
Etude de sensibilité de modèles de croissance tumorale sous contrôle angiogénique
auteur
Maxime Prod'Homme
article
Mathématiques [math]. 2015
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https://hal.inria.fr/hal-01215779/file/rapport.pdf BibTex

Poster

titre
Microscopic Modelling of the Non-Linear Gap Junction Channels
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
2015 Computing in Cardiology Conference, Sep 2015, Nice, France
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https://hal.inria.fr/hal-01418665/file/main.pdf BibTex
titre
Effects of non-linear GJ channels on the AP propagation : a modelling insight
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
33RD ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN SECTION OF THE ISHR , Jul 2015, Bordeaux, France
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https://hal.inria.fr/hal-01418687/file/ISHR2015-AD.pdf BibTex
titre
Modelling cardiac electrophysiology with structural heterogeneities and dynamical gap junctions
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard, Thomas Desplantez
article
2015 SIAM Conference on Computational Science and Engineering, Mar 2015, Salt Lake City, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01418697/file/main.pdf BibTex

Rapport

titre
Superconvergent Cartesian Methods for Poisson type Equations in 2D–domains
auteur
Olivier Gallinato, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8809, INRIA; Institut de Mathématiques de Bordeaux; Université de Bordeaux. 2015, pp.33
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https://hal.inria.fr/hal-01228046/file/RR-8809-rr.pdf BibTex
titre
Mathematical study and asymptotic analysis of a model for tumor drug resistance
auteur
Thierry Colin, Thomas Michel, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8784, Inria Bordeaux Sud-Ouest. 2015, 32 p
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https://hal.inria.fr/hal-01211770/file/ColinMichelPoignard-HAL.pdf BibTex
titre
On the asymptotic expansion of the magnetic potential in eddy current problem: a practical use of asymptotics for numerical purposes
auteur
Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8749, INRIA Bordeaux; INRIA. 2015
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https://hal.inria.fr/hal-01174009/file/RR-8749.pdf BibTex

Thèse

titre
Imagerie oncologique et modélisation mathématique : développement, optimisation et perspectives
auteur
Francois Cornelis
article
Analyse numérique [math.NA]. Université de Bordeaux, 2015. Français. 〈NNT : 2015BORD0121〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01270590/file/CORNELIS_FRANCOIS_2015.pdf BibTex
titre
Modélisation et simulation de la croissance de métastases pulmonaires
auteur
Julien Jouganous
article
Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université de Bordeaux, 2015. Français
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https://hal.inria.fr/tel-01245553/file/These.pdf BibTex

2014

Article dans une revue

titre
Spatial Modeling of Tumor Drug Resistance: the case of GIST Liver Metastases
auteur
Guillaume Lefebvre, François Cornelis, Patricio Cumsille, Thierry Colin, Clair Poignard, Olivier Saut
article
MATHEMATICAL MEDICINE AND BIOLOGY-A JOURNAL OF THE IMA, 2014, pp.26. 〈10.1093/imammb/dqw002〉
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https://hal.inria.fr/hal-01089452/file/RR-8642.pdf BibTex
titre
Classical'' Electropermeabilization Modeling at the Cell Scale
auteur
Otared Kavian, Michael Leguèbe, Clair Poignard, Lisl Weynans
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2014, 68 (1-2), pp.30. 〈http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00285-012-0629-3〉. 〈10.1007/s00285-012-0629-3〉
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https://hal.inria.fr/hal-00712683/file/RR-8005.pdf BibTex

Mémoire d'étudiant

titre
An experimentally-based modeling study of the effect of anti-angiogenic therapies on primary tumor kinetics for data analysis of clinically relevant animal models of metastasis
auteur
Aristoteles Camillo
article
Cancer. 2014
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https://hal.inria.fr/hal-01087741/file/Rapport_stage_M2.pdf BibTex

2011

Article dans une revue

titre
Dry Coating of Talc Particles: Effect of Material and Process Modifications on Their Wettability and Dispersibility
auteur
Guillaume Lefebvre, Laurence Galet, Alain Chamayou
article
AIChE Journal, Wiley, 2011, 57 (1), pp.79-86. 〈10.1002/aic.12239〉
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