Sites Inria

English version

Equipe de recherche MODEMIC

Modélisation et Optimisation des Dynamiques des Ecosystèmes MICrobiens

  • Responsable : Alain Rapaport
  • Centre(s) de recherche : CRI Sophia Antipolis - Méditerranée
  • Domaine : Santé, biologie et planète numériques
  • Thème : Modélisation et commande pour le vivant
  • Partenaire(s) : INRA
  • Collaborateur(s) : Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie

Présentation de l'équipe

Les activités de recherche de l'équipe MODEMIC portent sur la modélisation et la simulation d'écosystèmes microbiens, naturels ou reconstitués, présentant plusieurs échelles temporelles, spatiales ou taxomomiques. Ses objectifs sont
  • une meilleure compréhension de l'écologie microbienne, notamment sur les plans de la diversité, des fonctions (dégradation, fermentation, séquestration) et des enjeux pour la préservation de l'environnement (qualité des ressources en eau, fertilités des sols,...)
  • l'aide à la décision pour la conduite et l'amélioration des bio-procédés (dépollution, chimie verte,...)
Les applications sont menées grâce à des collaborations rapprochées avec des biologistes, microbiologistes et agronomes.

Axes de recherche

  • Modélisation et simulation d'écosystèmes microbiens:
    • approche macroscopique
    • approche microscopique
    • mariage des deux approches
  • Interprétation et analyse d'observations expérimentales:
    • détermination des structures des communautés
    • caractérisation des interactions
    • observation des structures spatiales
  • Commande et optimisation de bioprocédés:
    • identification, capteurs logiciels et filtrage
    • stabilisation de bioprocédés
    • commande optimale de bioréacteurs
    • conception optimale

Logiciels

Relations industrielles et internationales

  • UMR Centro de Modelamiento Matematico, Santiago, Chili
  • Departamento de Ingeniera Matematica, Universidad de Chile, Santiago, Chili
  • Departamento de Matematica, Universidad Tecnica Federico Santa Maria, Valparaiso, Chili
  • Departamento de Ingenieria Informatica, Universidad de Santiago, Chili
  • Instituto de Matematica y Ciencias Afines, Universidad Nacional de Ingenieria - Lima, Pérou
  • Centre for systems engineering and applied mechanics, Université catholique de Louvain-la-Neuve, Belgique
  • Automatic Control Laboratory, Université de Mons, Belgique
  • Departamento de Matematica Aplicada, Universidad Complutense de Madrid, Espagne
  • NRC Biotechnology Research Institute, Montréal, Canada
  • Probability and Statistics Group, School of Mathematics, University of Manchester, Royaume-Uni
  • Community and Conservation Ecology group, University of Groningen, Pays-Bas
  • Department of Biology, McGill University, Montréal, Canada
  • School of Biology, Georgia Institute of Technology, Atlanta, USA
  • Laboratoire de Modélisation Mathématique et Numérique dans les Sciences de l'Ingénieur, Ecole Nationale d'Ingénieurs de Tunis, Université Tunis El-Manar, Tunisie
  • Laboratoire d'Automatique, Université de Tlemcen, Algérie
  • Laboratorio di Ingegneria Ambientale, Politecnico de Milano, Italie
  • Centre de Biotechnologie de Sfax, Tunisie
  • Grupo de Ingenieria Ambiental y Bioprocesos, Universidade de Santiago de Compostela, Espagne
  • Escuela de Ingenieria Bioquimica, Pontifica Universidad Catholica de Valparaiso, Chili

Mots-clés : Modélisation Écologie microbienne Diversité Structuration spatiale Préservation de l'environnement Systèmes dynamiques Automatique Optimisation Modèles individus-centrés Dynamiques spatio-tem

Suivez Inria tout au long de son 50e anniversaire et au-delà !