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Equipe de recherche ASCLEPIOS

Publications de l'équipe ASCLEPIOS

2019

Article dans une revue

titre
Explainable cardiac pathology classification on cine MRI with motion characterization by semi-supervised learning of apparent flow
auteur
Qiao Zheng, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.media.2019.06.001⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01975880/file/1811.03433.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Deep Learning based Metal Artifacts Reduction in post-operative Cochlear Implant CT Imaging
auteur
Zihao Wang, Clair Vandersteen, Thomas Demarcy, Dan Gnansia, Charles Raffaelli, Nicolas Guevara, Hervé Delingette
article
The 22nd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2019, Shenzhen, China
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https://hal.inria.fr/hal-02196557/file/paper2371.pdf BibTex
titre
Incremental prognostic value of changes in 3D right ventricular function in pulmonary hypertension
auteur
Pamela Moceri, Nicolas Duchateau, Delphine Baudouy, Céline Sanfiorenzo, Fabien Squara, Emile Ferrari, Maxime Sermesant
article
Journées Européennes de la Société Française de Cardiologie, 2019, Paris, France
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2018

Article dans une revue

titre
Algorithms for left atrial wall segmentation and thickness – Evaluation on an open-source CT and MRI image database
auteur
Rashed Karim, Lauren-Emma Blake, Jiro Inoue, Qian Tao, Shuman Jia, R. James Housden, Pranav Bhagirath, Jean-Luc Duval, Marta Varela, Jonathan Behar, Loïc Cadour, Rob van der Geest, Hubert Cochet, Maria Drangova, Maxime Sermesant, Reza Razavi, Oleg Aslanidi, Ronak Rajani, Kawal Rhode
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2018, 50, pp.36 - 53. ⟨10.1016/j.media.2018.08.004⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01926935/file/1-s2.0-S1361841518306431-main.pdf BibTex
titre
Motor cortex neurovascular coupling: inputs from ultra–high-frequency ultrasound imaging in humans
auteur
Fabien Almairac, Denys Fontaine, Thomas Demarcy, Hervé Delingette, Stephanie Beuil, Charles Raffaelli
article
Journal of Neurosurgery, American Association of Neurological Surgeons, 2018, pp.1-7. ⟨10.3171/2018.5.jns18754⟩
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titre
A magnetic resonance multi-atlas for the neonatal rabbit brain
auteur
Sebastiano Ferraris, Johannes van der Merwe, Lennart van der Veeken, Ferran Prados, Juan Eugenio Iglesias, Marco Lorenzi, Andrew Melbourne, Marc Modat, Willy Gsell, Jan Deprest, Tom Vercauteren
article
NeuroImage, Elsevier, 2018, 179, pp.187 - 198. ⟨10.1016/j.neuroimage.2018.06.029⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01843151/file/hal-01843151.pdf BibTex
titre
Curved Optimal Delaunay Triangulation
auteur
Leman Feng, Pierre Alliez, Laurent Busé, Hervé Delingette, Mathieu Desbrun
article
ACM Transactions on Graphics, Association for Computing Machinery, 2018, Proceedings of SIGGRAPH 2018, 37 (4), pp.16. ⟨10.1145/3197517.3201358⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01826055/file/CODT-preprint-final.pdf BibTex
titre
Genetic study of multimodal imaging Alzheimer’s disease progression score implicates novel loci
auteur
Marzia A Scelzi, Raiyan R Khan, Marco Lorenzi, Christopher Leigh, Michael D Greicius, Jonathan M. Schott, Sébastien Ourselin, Andre Altmann
article
Brain - A Journal of Neurology , Oxford University Press (OUP), 2018, 141 (7), pp.2167 - 2180. ⟨10.1093/brain/awy141⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01843380/file/awy141.pdf BibTex
titre
Barycentric Subspace Analysis on Manifolds
auteur
Xavier Pennec
article
Annals of Statistics, Institute of Mathematical Statistics, 2018, 46 (6A), pp.2711-2746. ⟨https://projecteuclid.org/euclid.aos/1536307231⟩. ⟨10.1214/17-AOS1636⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01343881/file/AOS1636-WithSupplements.pdf BibTex
titre
Deep Learning Techniques for Automatic MRI Cardiac Multi-structures Segmentation and Diagnosis: Is the Problem Solved?
auteur
Olivier Bernard, Alain Lalande, Clement Zotti, Frederic Cervenansky, Xin Yang, Pheng-Ann Heng, Irem Cetin, Karim Lekadir, Oscar Camara, Miguel Angel Gonzalez Ballester, Gerard Sanroma, Sandy Napel, Steffen Petersen, Georgios Tziritas, Elias Grinias, Mahendra Khened, Varghese Alex Kollerathu, Ganapathy Krishnamurthi, Marc-Michel Rohé, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Fabian Isensee, Paul Jager, Klaus Maier-Hein, Peter Full, Ivo Wolf, Sandy Engelhardt, Chrisitan Baumgartner, Lisa Koch, Jelmer Wolterink, Ivana Isgum, Yeonggul Jang, Yoonmi Hong, Jay Patravali, Shubham Jain, Olivier Humbert, Pierre-Marc Jodoin
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 37 (11), pp.2514-2525. ⟨10.1109/TMI.2018.2837502⟩
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BibTex
titre
Low-Dimensional Representation of Cardiac Motion Using Barycentric Subspaces: a New Group-Wise Paradigm for Estimation, Analysis, and Reconstruction
auteur
Marc-Michel Rohé, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2018, 45, pp.1-12. ⟨10.1016/j.media.2017.12.008⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01677685/file/barycentric_article.pdf BibTex
titre
Model-based Feature Augmentation for Cardiac Ablation Target Learning from Images
auteur
Rocio Cabrera Lozoya, Benjamin Berte, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, pp.1. ⟨10.1109/TBME.2018.2818300⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01744142/file/TBME2818300.pdf BibTex
titre
Cardiac Motion Evolution Model for Analysis of Functional Changes Using Tensor Decomposition and Cross-Sectional Data
auteur
Kristin Mcleod, Kristin Tøndel, Lilian Calvet, M Sermesant, Xavier Pennec
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, In press, 65 (12), pp.2769 - 2780. ⟨10.1109/TBME.2018.2816519⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01736454/file/TBME2816519.pdf BibTex
titre
Statistical shape modeling of the left ventricle: myocardial infarct classification challenge
auteur
Avan Suinesiaputra, Pierre Ablin, Xènia Albà, Martino Alessandrini, Jack Allen, Wenjia Bai, Serkan Çimen, Peter Claes, Brett Cowan, Jan d'Hooge, Nicolas Duchateau, Jan Ehrhardt, Alejandro Frangi, Ali Gooya, Vicente Grau, Karim Lekadir, Allen Lu, Anirban Mukhopadhyay, Ilkay Oksuz, Nripesh Parajuli, Xavier Pennec, Marco Pereañez, Catarina Pinto, Paolo Piras, Marc-Michel Rohé, Daniel Rueckert, Dennis Säring, Maxime Sermesant, Kaleem Siddiqi, Mahdi Tabassian, Luciano Teresi, Sotirios Tsaftaris, Matthias Wilms, Alistair Young, Xingyu Zhang, Pau Medrano-Gracia
article
IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 22 (3), pp.503-515. ⟨10.1109/JBHI.2017.2652449⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01533805/file/jSuinesiaputra_JBHI_2017_FINAL.pdf BibTex
titre
Realistic Vendor-Specific Synthetic Ultrasound Data for Quality Assurance of 2-D Speckle Tracking Echocardiography: Simulation Pipeline and Open Access Database
auteur
Martino Alessandrini, Bidisha Chakraborty, Brecht Heyde, Olivier Bernard, Mathieu de Craene, Maxime Sermesant, Jan d'Hooge
article
IEEE Transactions on Ultrasonics, Ferroelectrics and Frequency Control, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 65 (3), pp.411-422. ⟨10.1109/TUFFC.2017.2786300⟩
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BibTex
titre
Transfer Learning from Simulations on a Reference Anatomy for ECGI in Personalised Cardiac Resynchronization Therapy
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Hervé Delingette, Thomas Jackson, Jessica Webb, Lauren Fovargue, Jack Lee, Christopher Rinaldi, Reza Razavi, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
TRANSACTIONS ON BIOMEDICAL ENGINEERING, In press, 20, ⟨10.1109/TBME.2018.2839713⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01796483/file/FINAL_VERSION_CORR.pdf BibTex
titre
Topologically constrained template estimation via Morse-Smale complexes controls its statistical consistency
auteur
Nina Miolane, Susan Holmes, Xavier Pennec
article
SIAM Journal on Applied Algebra and Geometry, SIAM, 2018, 2 (2), pp.348-375. ⟨10.1137/17M1129222⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01655366/file/siaga_article.pdf BibTex
titre
Three-dimensional right-ventricular regional deformation and survival in pulmonary hypertension
auteur
Pamela Moceri, Nicolas Duchateau, Delphine Baudouy, Elie-Dan Schouver, Sylvie Leroy, Fabien Squara, Emile Ferrari, Maxime Sermesant
article
European Heart Journal - Cardiovascular Imaging, Oxford UP, 2018, 19, pp.450-458. ⟨10.1093/ehjci/jex163⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01533793/file/jMoceri_EHJCI_2017_FINAL.pdf BibTex
titre
Susceptibility of brain atrophy to TRIB3 in Alzheimer’s disease, evidence from functional prioritization in imaging genetics
auteur
Marco Lorenzi, Andre Altmann, Boris Gutman, Selina Wray, Charles Arber, Derrek Hibar, Neda Jahanshad, Jonathan Schott, Daniel Alexander, Paul Thompson, Sébastien Ourselin
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2018, 115 (12), pp.3162-3167. ⟨10.1073/pnas.1706100115⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01756811/file/Brain_genes-UCL_USC-review_V3.pdf BibTex
titre
Model-based generation of large databases of cardiac images: synthesis of pathological cine MR sequences from real healthy cases
auteur
Nicolas Duchateau, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 37, pp.755-766. ⟨10.1109/TMI.2017.2714343⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01533788/file/jDuchateau_TMI_2017_FINAL.pdf BibTex
titre
A Framework for the Generation of Realistic Synthetic Cardiac Ultrasound and Magnetic Resonance Imaging Sequences from the same Virtual Patients
auteur
Yitian Zhou, Sophie Giffard-Roisin, Mathieu de Craene, Sorina Camarasu-Pop, Jan d'Hooge, Martino Alessandrini, Denis Friboulet, Maxime Sermesant, Olivier Bernard
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 37 (3), pp.741-754. ⟨10.1109/TMI.2017.2708159⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01533366/file/TMI2708159.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Statistical analysis of PET radiomic features and metabolomic data: prediction of triple-negative breast cancer
auteur
Fanny Orlhac, Olivier Humbert, Thierry Pourcher, Lun Jing, Jean-Marie Guigonis, Jacques Darcourt, Nicholas Ayache, Charles Bouveyron
article
SNMMI Annual Meeting, Jun 2018, Philadelphia, United States. pp.1755
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01759330/file/Abstract_SNM_Radio_Metabo.pdf BibTex

Thèse

titre
From normal right ventricle to pathology : shape and function analysis with different loading conditions using imaging and modelling
auteur
Pamela Moceri
article
Other. Université Côte d'Azur, 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4003⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01781331/file/2018AZUR4003.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Clustering multivariate functional data in group-specific functional subspaces
auteur
Amandine Schmutz, Julien Jacques, Charles Bouveyron, Laurence Cheze, Pauline Martin
article
2018
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https://hal.inria.fr/hal-01652467/file/article-funHDDC.pdf BibTex

2017

Article dans une revue

titre
Probabilistic disease progression modeling to characterize diagnostic uncertainty: application to staging and prediction in Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, Maurizio Filippone, Giovanni Frisoni, Daniel Alexander, Sébastien Ourselin
article
NeuroImage, Elsevier, 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01617750/file/time_series_journal.pdf BibTex
titre
Multifidelity-CMA: a multifidelity approach for efficient personalisation of 3D cardiac electromechanical models
auteur
Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Alan Garny, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
Biomechanics and Modeling in Mechanobiology, Springer Verlag, 2017, pp.1-16. ⟨10.1007/s10237-017-0960-0⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01656008/file/BMMB_Paper___Multifidelity_CMA___Camera_Ready.pdf BibTex
titre
Non-Invasive Personalisation of a Cardiac Electrophysiology Model from Body Surface Potential Mapping
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Thomas Jackson, Lauren Fovargue, Jack Lee, Hervé Delingette, Reza Razavi, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 64 (9), pp.2206 - 2218. ⟨http://ieeexplore.ieee.org/document/7745951/⟩. ⟨10.1109/TBME.2016.2629849⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01397393/file/TBME_acceptedversion.pdf BibTex
titre
Template estimation in computational anatomy: Fréchet means in top and quotient spaces are not consistent
auteur
Loïc Devilliers, Stéphanie Allassonnière, Alain Trouvé, Xavier Pennec
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2017, 10 (3), pp.1139-1169. ⟨10.1137/16M1083931⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01352707/file/InconsistencySIIMSDevilliers.pdf BibTex
titre
Inconsistency of template estimation by minimizing of the variance/pre-variance in the quotient space
auteur
Loïc Devilliers, Stéphanie Allassonnière, Alain Trouvé, Xavier Pennec
article
Entropy, MDPI, 2017, 19 (6), pp.28. ⟨10.3390/e19060288⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01543616/file/entropyHal.pdf BibTex
titre
ECG imaging of ventricular tachycardia: evaluation against simultaneous non-contact mapping and CMR-derived grey zone
auteur
Walther Schulze, Zhong Chen, Jatin Relan, Danila Potyagaylo, Martin W. Krueger, Rashed Karim, Manav Sohal, Anoop Shetty, Yingliang Ma, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Julian Bostock, Reza Razavi, Kawal S. Rhode, Christopher A. Rinaldi
article
Medical and Biological Engineering and Computing, Springer Verlag, 2017, 55 (6), pp.979 - 990. ⟨10.1007/s11517-016-1566-x⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01598299/file/10.1007-s11517-016-1566-x.pdf BibTex
titre
Statistical shape modelling to aid surgical planning: associations between surgical parameters and head shapes following spring-assisted cranioplasty
auteur
Naiara Rodriguez-Florez, Jan L. Bruse, Alessandro Borghi, Herman Vercruysse, Juling Ong, Greg James, Xavier Pennec, David J. Dunaway, Owase Jeelani, Silvia Schievano
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2017, pp.1-11. ⟨10.1007/s11548-017-1614-5⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01540631/file/Rodriguez-Florez_et_al-2017-International_Journal_of_Computer_Assisted_Radiology_and_Surgery.pdf BibTex
titre
Les maths de l’espace-temps qui décrivent et dépassent le cerveau
auteur
Nina Miolane
article
Interstices, INRIA, 2017, ⟨https://interstices.info/jcms/p_93071/les-maths-de-l-espace-temps-qui-decrivent-et-depassent-le-cerveau⟩
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BibTex
titre
Detecting clinically meaningful shape clusters in medical image data: metrics analysis for hierarchical clustering applied to healthy and pathological aortic arches
auteur
Jan L. Bruse, Maria A. Zuluaga, Abbas Khushnood, Kristin Mcleod, Hopewell N. Ntsinjana, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, pp.1 - 13. ⟨10.1109/TBME.2017.2655364⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01421202/file/07857751.pdf BibTex
titre
Simulating Longitudinal Brain MRIs with known Volume Changes and Realistic Variations in Image Intensity
auteur
Bishesh Khanal, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2017, 11 (Article 132), pp.18. ⟨10.3389/fnins.2017.00132⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01348959/file/fnins-11-00132.pdf BibTex
titre
Sparse Bayesian registration of medical images for self-tuning of parameters and spatially adaptive parametrization of displacements
auteur
Loïc Le Folgoc, Hervé Delingette, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 36, pp.79 - 97. ⟨10.1016/j.media.2016.09.008⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01149544/file/lefolgoc2016MedIA-accepted-HAL-version.pdf BibTex
titre
How successful is successful? Aortic arch shape after successful aortic coarctation repair correlates with left ventricular function
auteur
Jan L. Bruse, Abbas Khushnood, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Tain-Yen Hsia, Silvia Schievano
article
Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, Elsevier, 2017, 153 (2), pp.418 - 427. ⟨10.1016/j.jtcvs.2016.09.018⟩
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BibTex
titre
Looks Do Matter! Aortic Arch Shape After Hypoplastic Left Heart Syndrome Palliation Correlates With Cavopulmonary Outcomes
auteur
Jan Bruse, Elena Cervi, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano, Tain-Yen Hsia
article
The Annals of Thoracic Surgery, 2017, 103 (2), pp.645 - 654. ⟨10.1016/j.athoracsur.2016.06.041⟩
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BibTex
titre
Finiteness of fundamental groups
auteur
Zhiyu Tian, Chenyang Xu
article
Compositio Mathematica, Foundation Compositio Mathematica, 2017, 153 (02), pp.257-273
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BibTex
titre
A Bayesian Framework for Joint Morphometry of Surface and Curve meshes in Multi-Object Complexes
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 35, pp.458-474. ⟨10.1016/j.media.2016.08.011⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01359423/file/Articolo_Bayesian_LAST.pdf BibTex
titre
Template Shape Estimation: Correcting an Asymptotic Bias
auteur
Nina Miolane, Susan Holmes, Xavier Pennec
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2017, 10 (2), pp.808 - 844. ⟨10.1137/16M1084493⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01350508/file/siims_article_black.pdf BibTex
titre
Characterization of myocardial motion patterns by unsupervised multiple kernel learning
auteur
Sergio Sanchez-Martinez, Nicolas Duchateau, Tamas Erdei, Alan Fraser, Bart Bijnens, Gemma Piella
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 35, pp.70-82. ⟨10.1016/j.media.2016.06.007⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01331550/file/jsanchezmartinez_media_2016_finalok.pdf BibTex
titre
Quantitative analysis of electro-anatomical maps: application to an experimental model of LBBB/CRT
auteur
David Soto-Iglesias, Nicolas Duchateau, Constantine Butakoff, David Andreu, Juan Fernández-Armenta, Bart Bijnens, Antonio Berruezo, Marta Sitges, Oscar Camara
article
IEEE Journal of Translational Engineering in Health and Medicine, IEEE, 2017, 5, pp.1900215. ⟨10.1109/JTEHM.2016.2634006⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01398828/file/jSoto_JTEHM_2017_FINAL.pdf BibTex
titre
Automated analysis of human cochlea shape variability from segmented μCT images
auteur
Thomas Demarcy, Clair Vandersteen, Nicolas Guevara, Charles Raffaelli, Dan Gnansia, Nicholas Ayache, Hervé Delingette
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, Elsevier, 2017, 59 (July 2017), pp.1 - 12. ⟨http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0895611117300332⟩. ⟨10.1016/j.compmedimag.2017.04.002⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01528489/file/DemarcyCMIG_1503.pdf BibTex
titre
Selection bias in the reported performances of AD classification pipelines
auteur
Alex F. Mendelson, Maria A. Zuluaga, Marco Lorenzi, Brian F. Hutton, Sébastien Ourselin
article
Neuroimage-Clinical, Elsevier, 2017, 14, pp.400 - 416. ⟨10.1016/j.nicl.2016.12.018⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01843390/file/1-s2.0-S221315821630256X-main.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Sample-limited L p Barycentric Subspace Analysis on Constant Curvature Spaces
auteur
Xavier Pennec
article
Geometric Sciences of Information (GSI 2017), Nov 2017, Paris, France. pp.20-28, ⟨10.1007/978-3-319-68445-1_3⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01574895/file/62-Pennec.pdf BibTex
titre
Robust non-rigid registration through agent-based action learning
auteur
Julian Krebs, Tommaso Mansi, Hervé Delingette, Li Zhang, Florin Ghesu, Shun Miao, Andreas Maier, Nicholas Ayache, Rui Liao, Ali Kamen
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions (MICCAI), Sep 2017, Quebec, Canada. pp.344-352, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_40⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01569447/file/miccai17-2.pdf BibTex
titre
Longitudinal Analysis using Personalised 3D Cardiac Models with Population-Based Priors: Application to Paediatric Cardiomyopathies
auteur
Roch Molléro, Hervé Delingette, Manasi Datar, Tobias Heimann, Jakob Hauser, Dilveer Panesar, Alexander Jones, Andrew Taylor, Marcus Kelm, Titus Kuehne, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2017, Québec City, Canada. pp.350-358, ⟨10.1007/978-3-319-66185-8_40⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01569735/file/paper729.pdf BibTex
titre
Automatic Multi-Atlas Segmentation of Myocardium with SVF-Net
auteur
Marc-Michel Rohé, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM) workshop, Sep 2017, Québec, Canada
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https://hal.inria.fr/hal-01575297/file/stacom_seg_v2.pdf BibTex
titre
SVF-Net: Learning Deformable Image Registration Using Shape Matching
auteur
Marc-Michel Rohé, Manasi Datar, Tobias Heimann, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
MICCAI 2017 - the 20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Québec, Canada. pp.266-274, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_31⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01557417/file/paper_324.pdf BibTex
titre
A Vertex Clustering Model for Disease Progression: Application to Cortical Thickness Images
auteur
Răzvan Valentin Marinescu, Arman Esaghi, Marco Lorenzi, Alexandra L. Young, Neil P. Oxtoby, Sara Garbarino, Timothy J. Shakespeare, Sebastian Crutch, Daniel Alexander
article
International Conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI), Jul 2017, Boone, United States
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BibTex
titre
Inconsistency of Template Estimation with the Fréchet mean in Quotient Space
auteur
Loïc Devilliers, Xavier Pennec, Stéphanie Allassonnière
article
Information Processing in Medical Imaging 2017, Martin Styner; Marc Niethammer; Dinggang Shen; Stephen Aylward; Ipek Oguz; Hongtu Zhu, Jun 2017, Boone, United States. pp.12, ⟨10.1007/978-3-319-59050-9_2⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01481074/file/IPMIversionHAL.pdf BibTex
titre
VT Scan: Towards an Efficient Pipeline from Computed Tomography Images to Ventricular Tachycardia Ablation
auteur
Nicolas Cedilnik, Josselin Duchateau, Rémi Dubois, Pierre Jaïs, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
article
Functional Imaging and Modelling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.271-279, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_26⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01498672/file/vtscan.pdf BibTex
titre
Prediction of Post-Ablation Outcome in Atrial Fibrillation Using Shape Parameterization and Partial Least Squares Regression
auteur
Shuman Jia, Claudia Camaioni, Marc-Michel Rohé, Pierre Jaïs, Xavier Pennec, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
article
FIMH 2017 - International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.314 - 321, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_30⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01574831/file/FIMH_ShapePLS-1.pdf BibTex
titre
Sparse Bayesian Non-linear Regression for Multiple Onsets Estimation in Non-invasive Cardiac Electrophysiology
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Hervé Delingette, Thomas Jackson, Lauren Fovargue, Jack Lee, Aldo Rinaldi, Nicholas Ayache, Reza Razavi, Maxime Sermesant
article
Functional imaging and modelling of the heart 2017, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.230-238, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_22⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01498602/file/FIMH_2017_cameraready.pdf BibTex
titre
Improving Understanding of Long-Term Cardiac Functional Remodelling via Cross-Sectional Analysis of Polyaffine Motion Parameters
auteur
Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
FIMH 2017 - 9th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.51 - 59, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01574837/file/MeanMotionEvolutionFIMH-1.pdf BibTex
titre
Longitudinal Parameter Estimation in 3D Electromechanical Models: Application to Cardiovascular Changes in Digestion
auteur
Roch Molléro, Jakob Hauser, Xavier Pennec, Manasi Datar, Hervé Delingette, Alexander Jones, Nicholas Ayache, Tobias Heimann, Maxime Sermesant
article
FIMH 2017 - 9th international conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.432-440, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_41⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01522598/file/FIMH_2017_Camera_Ready.pdf BibTex
titre
Smoothed Particle Hydrodynamics for Electrophysiological Modeling: An Alternative to Finite Element Methods
auteur
Eric Lluch, Rubén Doste, Sophie Giffard-Roisin, Alexandre This, Maxime Sermesant, Oscar Camara, Mathieu de Craene, Hernán Morales
article
FIMH 2017 - 9th International Conference on Functional Imaging and Modelling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.333-343, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_32⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01533371/file/paperFIMH.pdf BibTex
titre
A Rule-Based Method to Model Myocardial Fiber Orientation for Simulating Ventricular Outflow Tract Arrhythmias
auteur
Rubén Doste, David Soto-Iglesias, Gabriel Bernardino, Rafael Sebastian, Sophie Giffard-Roisin, Rocío Cabrera-Lozoya, Maxime Sermesant, Antonio Berruezo, Damián Sánchez-Quintana, Oscar Camara
article
Functional imaging and modelling of the heart 2017, Jun 2017, Toronto, Canada. ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_33⟩
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titre
Three-dimensional speckle tracking of the right ventricle : implications on survival
auteur
Pamela Moceri, Nicolas Duchateau, Delphine Baudouy, Elie-Dan Schouver, P Bouvier, S Leroy, P Cerboni, P Gibelin, Maxime Sermesant, Emile Ferrari
article
Journées Européennes de la Société Française de Cardiologie, 2017, Paris, France
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Chapitre d'ouvrage

titre
Non linear Biomechanical Model of the Liver
auteur
Stéphanie Marchesseau, Simon Chatelin, Hervé Delingette
article
Yohan Payan; Jacques Ohayon. Biomechanics of Living Organs, Elsevier, pp.602, 2017, 9780128040096. ⟨https://www.elsevier.com/books/biomechanics-of-living-organs/payan/978-0-12-804009-6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01536406/file/LiverHyperElasticity.pdf BibTex

Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Graphs in Biomedical Image Analysis, Computational Anatomy and Imaging Genetics
auteur
Jorge Cardoso, Tal Arbel, Enzo Ferrante, Xavier Pennec, Dalca Adrian V., Sarah Parisot, Sarang Joshi, Nematollah Batmanghelich, Aristeidis Sotiras, Mads Nielsen, Mert Sabuncu, Fletcher Tom, Li Shen, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
article
Jorge Cardoso; Tal Arbel; Mert Sabuncu; Fletcher Tom; Li Shen; Stanley Durrleman; Stefan Sommer; Enzo Ferrante; Xavier Pennec; Dalca Adrian V.; Sarah Parisot; Sarang Joshi; Nematollah Batmanghelich; Aristeidis Sotiras; Mads Nielsen. France. 10551, 2017, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-319-67675-3⟩
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titre
Statistical Atlases and Computational Models of the Heart. ACDC and MMWHS Challenges
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Pierre-Marc Jodoin, Alain Lalande, Xiahai Zhuang, Guang Yang, Alistair Young, Olivier Bernard
article
France. Springer, pp.260, 2017, 978-3-319-75540-3
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Brevet

titre
Méthode de segmentation d’une image tridimensionnelle pour la génération d’un modèle de paroi du myocarde pour la détection d’au moins une zone de circulation électrique singulière
auteur
Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Maxime Sermesant
article
France, N° de brevet: FR1754107. 2017
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Thèse

titre
Robust personalisation of 3D electromechanical cardiac models. Application to heterogeneous and longitudinal clinical databases
auteur
Roch Molléro
article
Signal and Image processing. Université Côte d'Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4106⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01737200/file/2017AZUR4106.pdf BibTex
titre
Non-invasive Personalisation of Cardiac Electrophysiological Models from Surface Electrograms
auteur
Sophie Giffard-Roisin
article
Medical Imaging. Université côte d'azur, 2017. English
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https://hal.inria.fr/tel-01658489/file/Thesis_english.pdf BibTex
titre
Non-invasive personalisation of cardiac electrophysiological models from surface electrograms
auteur
Sophie Giffard-Roisin
article
Other. Université Côte d'Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4092⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01771476/file/2017AZUR4092.pdf BibTex
titre
Segmentation and study of anatomical variability of the cochlea from medical images
auteur
Thomas Demarcy
article
Other. Université Côte d'Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4052⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01609910/file/2017AZUR4052.pdf BibTex
titre
Reduced representation of segmentation and tracking in cardiac images for group-wise longitudinal analysis
auteur
Marc-Michel Rohé
article
Human health and pathology. Université Côte d'Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4051⟩
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https://hal.inria.fr/tel-01575292/file/2017AZUR4051.pdf BibTex

2016

Article dans une revue

titre
Comprehensive Pre-Clinical Evaluation of a Multi-physics Model of Liver Tumor Radiofrequency Ablation
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Hervé Delingette, Saikiran Rapaka, Tiziano Passerini, Viorel Mihalef, Marie-Pierre Jolly, Raoul Pop, Michele Diana, Luc Soler, Ali Kamen, Dorin Comaniciu, Nicholas Ayache
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2016, ⟨10.1007/s11548-016-1517-x⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01423321/file/IJCARS_Audigier_2016.pdf BibTex
titre
Sampling Image Segmentations for Uncertainty Quantification
auteur
Matthieu Lê, Jan Unkelbach, Nicholas Ayache, Hervé Delingette
article
Medical Image Analysis, 2016, 34, pp.42-51. ⟨10.1016/j.media.2016.04.005⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01304646/file/mle_preprint.pdf BibTex
titre
Quantifying Registration Uncertainty with Sparse Bayesian Modelling
auteur
Loïc Le Folgoc, Hervé Delingette, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, PP (99), ⟨10.1109/TMI.2016.2623608⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01378844/file/lefolgoc2016quantifying-HAL-manuscript.pdf BibTex
titre
20th anniversary of the medical image analysis journal (MedIA)
auteur
Nicholas Ayache, James Duncan
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2016, 33, pp.1-3. ⟨10.1016/j.media.2016.07.004⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01353697/file/Edito_Ayache.pdf BibTex
titre
Inter-Operative Biopsy Site Relocalization in Endoluminal Surgery
auteur
Anant S. Vemuri, Stéphane Nicolau, Adrien Sportes, Jacques Marescaux, Luc Soler, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, 63 (9), pp.1862-1873. ⟨10.1109/TBME.2015.2503981⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01230752/file/TBEDraft_postCorrections_compressed.pdf BibTex
titre
Impact of New Technologies and Approaches for Post–Myocardial Infarction Ventricular Tachycardia Ablation During Long-Term Follow-Up
auteur
Seigo Yamashita, Hubert Cochet, Frédéric Sacher, Saagar Mahida, Benjamin Berte, Darren Hooks, Jean-Marc Sellal, Nora Al Jefairi, Antonio Frontera, Yuki Komatsu, Han Lim, Sana Amraoui, Arnaud Denis, Nicolas Derval, Maxime Sermesant, François Laurent, Mélèze Hocini, Michel Haissaguerre, Michel Montaudon, Pierre Jais
article
Circulation. Arrhythmia and electrophysiology, Lippincott Williams & Wilkins, 2016, 9 (7), ⟨10.1161/CIRCEP.116.003901⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01353372/file/CIRCEP.116.003901.pdf BibTex
titre
Extended Modality Propagation: Image Synthesis of Pathological Cases
auteur
Nicolas Cordier, Hervé Delingette, Matthieu Lê, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, PP (99), ⟨10.1109/TMI.2016.2589760⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01343233/file/Cordier-TMI-2016-preprint.pdf BibTex
titre
A biophysical model of brain deformation to simulate and analyze longitudinal MRIs of patients with Alzheimer's disease
auteur
Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, 134, pp.35-52. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.03.061⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01305755/file/Khanal_2016_NeuroImage_acceptedVersionPreprint.pdf BibTex
titre
Longitudinal Analysis of Image Time Series with Diffeomorphic Deformations: A Computational Framework Based on Stationary Velocity Fields
auteur
Mehdi Hadj-Hamou, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2016, 10 (236), pp.18. ⟨10.3389/fnins.2016.00236⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01329989/file/fnins-10-00236.pdf BibTex
titre
Optimal electrode diameter in relation to volume of the cochlea
auteur
Dan Gnansia, Thomas Demarcy, Clair Vandersteen, Charles Raffaelli, Nicolas Guevara, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
European Annals of Otorhinolaryngology, Head and Neck Diseases, Elsevier Masson, 2016, 133, Supplement 1, pp.S66-S67. ⟨10.1016/j.anorl.2016.04.013⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01326507/file/ANORL.pdf BibTex
titre
Temporal epilepsy lesions may be detected by the voxel-based quantitative analysis of brain FDG-PET images using an original block-matching normalization software
auteur
Antoine Verger, Yalcin Yagdigul, Axel van Der Gucht, Sylvain Poussier, Eric Guedj, Louis Maillard, Grégoire Malandain, Gabriela Hossu, Renaud Fay, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie
article
Annals of Nuclear Medicine, Springer Verlag, 2016, 30 (4), pp.272-278. ⟨10.1007/s12149-016-1060-4⟩
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BibTex
titre
A statistical shape modelling framework to extract 3D shape biomarkers from medical imaging data: assessing arch morphology of repaired coarctation of the aorta
auteur
Jan L. Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Hopewell N. Ntsinjana, Claudio Capelli, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
article
BMC Medical Imaging, BioMed Central, 2016, 16 (1), ⟨10.1186/s12880-016-0142-z⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01335147/file/art3A10_1186_s12880-016-0142.pdf BibTex
titre
MRI Based Bayesian Personalization of a Tumor Growth Model
auteur
Matthieu Lê, Hervé Delingette, Jayashree Kalpathy-Cramer, Elizabeth Gerstner, Tracy Batchelor, Jan Unkelbach, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, 35 (10), pp.2329-2339. ⟨10.1109/TMI.2016.2561098⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01324849/file/preprint.pdf BibTex
titre
Longitudinal reproducibility of default-mode network connectivity in healthy elderly participants: A multicentric resting-state fMRI study
auteur
Jorge Jovicich, Ludovico Minati, Moira Marizzoni, Rocco Marchitelli, Roser Sala-Llonch, David Bartrés-Faz, Jennifer Arnold, Jens Benninghoff, Ute Fiedler, Luca Roccatagliata, Agnese Picco, Flavio Nobili, Oliver Blin, Stéphanie Bombois, Renaud Lopes, Regis Bordet, Julien Sein, Jean-Philippe Ranjeva, Mira Didic, Helene Gros-Dagnac, Pierre Payoux, Giada Zoccatelli, Franco Alessandrini, Alberto Beltramello, Nuria Bargallo, Antonio Ferretti, Massimo Caulo, Marco Aiello, Carlo Cavaliere, Andrea Soricelli, Lucilla Parnetti, Roberto Tarducci, Piero Floridi, Magda Tsolaki, Manos Constantinidis, Antonios Drevelegas, Paolo Maria Rossini, Camillo Marra, Peter Schoenknecht, Tilman Hensch, Karl-Titus Hoffmann, Joost P. Kuijer, Pieter Jelle Visser, Frederik Barkhof, Giovanni B. Frisoni
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, 124, pp.442--454. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.07.010⟩
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BibTex
titre
Image-based Biophysical Simulation of Intracardiac Abnormal Ventricular Electrograms
auteur
Rocío Cabrera-Lozoya, Benjamin Berte, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, PP (99), ⟨10.1109/TBME.2016.2562918⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01313615/file/HALfile.pdf BibTex
titre
Interactive Training System for Interventional Electrocardiology Procedures
auteur
Hugo Talbot, Federico Spadoni, Christian Duriez, Maxime Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2016, 8789, pp.11-19. ⟨10.1007/978-3-319-12057-7_2⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01338346/file/Talbot_H.pdf BibTex
titre
Biophysical modelling predicts ventricular tachycardia inducibility and circuit morphology: A combined clinical validation and computer modelling approach
auteur
Zhong Chen, Rocío Cabrera-Lozoya, Jatin Relan, Manav Sohal, Anoop Shetty, Rashed Karim, Hervé Delingette, Jaswinder Gill, Kawal Rhode, Nicholas Ayache, Peter Taggart, Christopher Aldo Rinaldi, Maxime Sermesant, Reza Razavi
article
Journal of Cardiovascular Electrophysiology, Wiley, 2016, 27 (7), pp.851-860. ⟨10.1111/jce.12991⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01301426/file/Biophysical%20modelling%20to%20predict%20VT%20Manuscript%20JCE%20Revised%20%2010042016.pdf BibTex
titre
Multiphysics and multiscale modelling, data-model fusion and integration of organ physiology in the clinic: ventricular cardiac mechanics
auteur
Radomir Chabiniok, Vicky Wang, Myrianthi Hadjicharalambous, Liya Asner, Jack Lee, Maxime Sermesant, Ellen Kuhl, Alistair Young, Philippe Moireau, Martyn Nash, Dominique Chapelle, David Nordsletten
article
Interface Focus, Royal Society publishing, 2016, 6 (2), ⟨10.1098/rsfs.2015.0083⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01277684/file/20150083.full.pdf BibTex
titre
Parsimonious Approximation of Streamline Trajectories in White Matter Fiber Bundles
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Fabrizio de Vico Fallani, Mario Chavez, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, PP (99), ⟨10.1109/TMI.2016.2591080⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01346067/file/Prototype_Paper_Final_PrePrint.pdf BibTex
titre
Personalized Radiotherapy Planning Based on a Computational Tumor Growth Model
auteur
Matthieu Lê, Hervé Delingette, Jayashree Kalpathy-Cramer, Elizabeth Gerstner, Tracy Batchelor, Jan Unkelbach, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, pp.11. ⟨10.1109/TMI.2016.2626443⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01403847/file/FINAL%20VERSION.pdf BibTex
titre
Infarct localization from myocardial deformation: Prediction and uncertainty quantification by regression from a low-dimensional space
auteur
Nicolas Duchateau, Mathieu de Craene, Pascal Allain, Eric Saloux, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, 35 (10), pp.2340-2352. ⟨10.1109/TMI.2016.2562181⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01314767/file/jDuchateau_TMI_2016_FINALok1.pdf BibTex
titre
Detailed Evaluation of Five 3D Speckle Tracking Algorithms Using Synthetic Echocardiographic Recordings
auteur
Martino Alessandrini, Brecht Heyde, Sandro Queirós, Szymon Cygan, Maria Zontak, Oudom Somphone, Olivier Bernard, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Daniel Barbosa, Mathieu de Craene, Matthew O'Donnell, Jan d'Hooge
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, 35 (8), pp.1915-1926. ⟨10.1109/TMI.2016.2537848⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01373083/file/main.pdf BibTex
titre
Medical Imaging Informatics: Towards a Personalized Computational Patient
auteur
Nicholas Ayache
article
IMIA Yearbook of Medical Informatics, Schattauer, 2016, 25 (Suppl. 1), pp.S8-S9. ⟨http://www.schattauer.de/de/magazine/uebersicht/zeitschriften-a-z/imia-yearbook/imia-yearbook-first/issue/special/manuscript/25863/show.html⟩. ⟨10.15265/IYS-2016-s002⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01320985/file/Ayache-IMIA-Yearbook-2016-v6-preprint.pdf BibTex
titre
Automatic model generation framework for computational simulation of cochlear implantation
auteur
Nerea Mangado, Mario Ceresa, Nicolas Duchateau, Hans Martin Kjer, Sergio Vera, Hector Dejea Velardo, Pavel Mistrik, Rasmus R. Paulsen, Jens Fagertun, Jérôme Noailly, Gemma Piella, Miguel Ángel González Ballester
article
Annals of Biomedical Engineering, Springer Verlag, 2016, 44 (8), pp.2453-2463. ⟨10.1007/s10439-015-1541-y⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01314765/file/jMangado_ABE_2016_FINALok.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Machine-learning based diagnosis of heart failure with preserved ejection fraction: how much do we agree with the guidelines?
auteur
Sergio Sanchez-Martinez, Nicolas Duchateau, Tamas Erdei, Gabor Kunszt, Anna Degiovanni, Erberto Carluccio, Alan Fraser, Gemma Piella, Bart Bijnens
article
EuroEcho-Imaging, Dec 2016, Leipzig, Germany
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BibTex
titre
Generation of Realistic 4D Synthetic CSPAMM Tagged MR Sequences for Benchmarking Cardiac Motion Tracking Algorithms
auteur
Yitian Zhou, Mathieu de Craene, Oudom Somphone, Maxime Sermesant, Olivier Bernard
article
International Workshop on Simulation and Synthesis in Medical Imaging, Oct 2016, Athens, Greece. pp.108-117, ⟨10.1007/978-3-319-46630-9_11⟩
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BibTex
titre
A Multiscale Cardiac Model for Fast Personalisation and Exploitation
auteur
Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.174-182, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_21⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01360908/file/paper_725.pdf BibTex
titre
STACOM-SLAWT Challenge: Left Atrial Wall Segmentation and Thickness Measurement Using Region Growing and Marker-Controlled Geodesic Active Contour
auteur
Shuman Jia, Loïc Cadour, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
article
7th International Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM) Workshop, Held in Conjunction with MICCAI 2016, Oct 2016, Athens, Greece. pp.211-219
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https://hal.inria.fr/hal-01373238/file/STACOM2016_021_final_v1.pdf BibTex
titre
Barycentric Subspace Analysis: a new Symmetric Group-wise Paradigm for Cardiac Motion Tracking
auteur
Marc-Michel Rohé, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
MICCAI 2016 - the 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2016, Athens, Greece. pp.300-307, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_35⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01373706/file/paper929.pdf BibTex
titre
Estimation of Purkinje Activation from ECG: an Intermittent Left Bundle Branch Block Study
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Lauren Fovargue, Jessica Webb, Roch Molléro, Jack Lee, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Reza Razavi, Maxime Sermesant
article
7th International Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM) Workshop, Held in Conjunction with MICCAI 2016, Oct 2016, Athens, Greece
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https://hal.inria.fr/hal-01372924/file/Stacom_sophie_ECG.pdf BibTex
titre
Phase-Based Registration of Cardiac Tagged MR Images by Incorporating Anatomical Constraints
auteur
Yitian Zhou, Mathieu de Craene, Maxime Sermesant, Olivier Bernard
article
International Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart, Oct 2016, Athens, Greece. pp.39-47, ⟨10.1007/978-3-319-52718-5_5⟩
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BibTex
titre
Uncertainty Quantification of Cochlear Implant Insertion from CT Images
auteur
Thomas Demarcy, Clair Vandersteen, Charles Raffaelli, Dan Gnansia, Nicolas Guevara, Nicholas Ayache, Hervé Delingette
article
5th International Workshop on Clinical Image-Based Procedures - CLIP 2016, Held in Conjunction with MICCAI 2016, Oct 2016, Athens, Greece. pp.27-35, ⟨10.1007/978-3-319-46472-5_4⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01393323/file/demarcymiccai.pdf BibTex
titre
Estimation de la position post-implantation cochléaire de l’électrode à partir d’images tomodensitométriques cliniques
auteur
Thomas Demarcy, Clair Vandersteen, Dan Gnansia, Charles Raffaelli, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Nicolas Guevara
article
123ème Congrès de la Société Française d'Oto-Rhino-Laryngologie et de Chirurgie de la Face et du Cou, Congrès de la Société Française d'Oto-Rhino-Laryngologie et de Chirurgie de la Face et du Cou, Oct 2016, Paris, France
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titre
Segmentation and registration coupling from short-axis Cine MRI: application to infarct diagnosis
auteur
Stephanie Marchesseau, Nicolas Duchateau, Hervé Delingette
article
7th International Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM) Workshop, Held in Conjunction with MICCAI 2016, Oct 2016, Athens, Greece. pp.48-56
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https://hal.inria.fr/hal-01352460/file/cMarchesseau_STACOM_2016.pdf BibTex
titre
Spatio-Temporal Shape Analysis of Cross-Sectional Data for Detection of Early Changes in Neurodegenerative Disease
auteur
Claire Cury, Marc Lorenzi, David Cash, Jennifer Nicholas, Alexandre Routier, Jonathan Rohrer, Sebastien Ourselin, Stanley Durrleman, Marc Modat
article
SeSAMI 2016 - First International Workshop Spectral and Shape Analysis in Medical Imaging, Sep 2016, Athens, Greece. pp.63 - 75, ⟨10.1007/978-3-319-51237-2_6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01440061/file/Cury_SSAMI_16.pdf BibTex
titre
Three-dimensional speckle tracking of the right ventricle: implications on survival in pulmonary hypertension
auteur
Pamela Moceri, Nicolas Duchateau, Delphine Baudouy, Sylvie Leroy, Priscille Bouvier, Elie Dan Schouver, Maxime Sermesant, Emile Ferrari
article
European Society of Cardiology (ESC) Congress, Aug 2016, Rome, Italy. pp.994
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titre
Highly Reduced Model of the Cardiac Function for Fast Simulation
auteur
Marc-Michel Rohé, Roch Molléro, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
IEEE - IVMSP Workshop 2016, Jul 2016, Bordeaux, France. pp.5, ⟨10.1109/IVMSPW.2016.7528214⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01373715/file/IVMSP.pdf BibTex
titre
Discovering clusters in pathologic cardiac morphology: MR-based hierarchical 3D shape clustering of surgically repaired aortic arches
auteur
Jan Bruse, Kristin Mcleod, Elena Cervi, Giovanni Biglino, T.-Y Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano
article
Computer Assisted Radiology, 30th International Congress and Exhibition, Jun 2016, Heidelberg, Germany
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titre
Infarct localization from myocardial deformation: Prediction and uncertainty quantification by regression from a low-dimensional space
auteur
Nicolas Duchateau, Mathieu de Craene, Pascal Allain, Eric Saloux, Maxime Sermesant
article
GRIC - Journées Francophones de Radiologie, 2016, Paris, France
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Chapitre d'ouvrage

titre
Learning pathological deviations from a normal pattern of myocardial motion: Added value for CRT studies?
auteur
Nicolas Duchateau, Gemma Piella, Alejandro Frangi, Mathieu de Craene
article
Guorong Wu; Dinggang Shen; Mert Sabuncu. Machine learning and medical imaging, 1st Edition, Elsevier, pp.365-382, 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01352464/file/bDuchateau_BookChapter_2016%C2%AD.pdf BibTex

HDR

titre
When Cardiac Biophysics Meets Groupwise Statistics: Complementary Modelling Approaches for Patient-Specific Medicine
auteur
Maxime Sermesant
article
Signal and Image processing. Université de Nice - Sophia Antipolis, 2016
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Autre publication

titre
Le patient numérique personnalisé : une révolution
auteur
Nicholas Ayache
article
2016
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Brevet

titre
Anatomical site relocalisation using dual data synchronisation
auteur
Stephane Nicolau, Anant S. Vemuri, Luc Soler, Jacques Marescaux
article
United States, Patent n° : 20160022125. 2016
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Poster

titre
Towards a unified bayesian geometric framework for template estimation in Computational Anatomy
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec, Susan Holmes
article
International Society of Bayesian Analysis: World Meeting, Jun 2016, Cagliari, Italy. ⟨https://bayesian.org/content/isba-2016-world-meeting⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01396716/file/MiolanePosterISBAv2.pdf BibTex

Thèse

titre
Geometric statistics for computational anatomy
auteur
Nina Miolane
article
Human health and pathology. Université Côte d'Azur, 2016. English. ⟨NNT : 2016AZUR4146⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01411886/file/2016AZUR4146.pdf BibTex
titre
Beyond volumetry in longitudinal deformation-based morphometry : application to sexual dimorphism during adolescence
auteur
Mehdi Hadj-Hamou
article
Other. Université Côte d'Azur, 2016. English. ⟨NNT : 2016AZUR4141⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01416569/file/2016AZUR4141.pdf BibTex
titre
Modeling and simulation of realistic longitudinal structural brain MRIs with atrophy in Alzheimer’s disease
auteur
Bishesh Khanal
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2016. English. ⟨NNT : 2016NICE4046⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01384678/file/2016NICE4046.pdf BibTex
titre
Brain tumor growth modeling : application to radiotherapy
auteur
Matthieu Lê
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2016. English. ⟨NNT : 2016NICE4034⟩
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titre
Inter-operative biopsy site relocalization in gastroscopy : application to oesophagus
auteur
Anant Suraj Vemuri
article
Other [cs.OH]. Université Nice Sophia Antipolis, 2016. English. ⟨NNT : 2016NICE4018⟩
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2015

Article dans une revue

titre
A patch-based approach for the segmentation of pathologies: Application to glioma labelling
auteur
Nicolas Cordier, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 35 (4), pp.11. ⟨10.1109/TMI.2015.2508150⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01241480/file/Cordier-TMI-2015-preprint.pdf BibTex
titre
Assessing atrophy measurement techniques in dementia: Results from the MIRIAD atrophy challenge
auteur
David M. Cash, Chris Frost, Leonardo O. Iheme, Devrim Ünay, Melek Kandemir, Jurgen Fripp, Olivier Salvado, Pierrick Bourgeat, Martin Reuter, Bruce Fischl, Marco Lorenzi, Giovanni B. Frisoni, Xavier Pennec, Ronald K. Pierson, Jeffrey L. Gunter, Matthew L. Senjem, Clifford R. Jack, Nicolas Guizard, Vladimir S. Fonov, D. Louis Collins, Marc Modat, M. Jorge Cardoso, Kelvin K. Leung, Hongzhi Wang, Sandhitsu R. Das, Paul A. Yushkevich, Ian B. Malone, Nick C. Fox, Jonathan M. Schott, Sebastien Ourselin
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, 123, pp.149-164. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.07.087⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01203573/file/NIMG_Challenge_Final.pdf BibTex
titre
A generative probabilistic model and discriminative extensions for brain lesion segmentation – with application to tumor and stroke
auteur
Bjoern H Menze, Koen van Leemput, Danial Lashkari, Tammy Riklin-Raviv, Ezequiel Geremia, Esther Alberts, Philipp Gruber, Susanne Wegener, Marc-André Weber, Gabor Szekely, Nicholas Ayache, Polina Golland
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015
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titre
Fine-tuned convolutional neural nets for cardiac MRI acquisition plane recognition
auteur
Jan Margeta, Antonio Criminisi, Rocio Cabrera Lozoya, Daniel C. Lee, Nicholas Ayache
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering: Imaging & Visualization, Taylor & Francis, 2015, ⟨10.1080/21681163.2015.1061448⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01162880/file/author_version.pdf BibTex
titre
Benchmark for Algorithms Segmenting the Left Atrium From 3D CT and MRI Datasets
auteur
Catalina Tobon-Gomez, Arjan Geers, Jochen Peters, Jürgen Weese, Karen Pinto, Rashed Karim, Mohammed Ammar, Abdelaziz Daoudi, Jan Margeta, Zulma Sandoval, Birgit Stender, Yefeng Zheng, Maria Zuluaga, Julian Betancur, Nicholas Ayache, Mohammed Amine Chikh, Jean-Louis Dillenseger, Michael Kelm, Saïd Mahmoudi, Sébastien Ourselin, Alexander Schlaefer, Tobias Schaeffter, Reza Razavi, Kawal Rhode
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 34 (7), pp.1460--1473. ⟨10.1109/TMI.2015.2398818⟩
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BibTex
titre
Spatio-Temporal Tensor Decomposition of a Polyaffine Motion Model for a Better Analysis of Pathological Left Ventricular Dynamics
auteur
Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Philipp Beerbaum, Xavier Pennec
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 34 (7), pp.1562--1675. ⟨10.1109/TMI.2015.2405579⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01205342/file/McLeod_PolyaffineHeartMeanMotion.pdf BibTex
titre
Regional flux analysis for discovering and quantifying anatomical changes: An application to the brain morphometry in Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, 115, pp.224-234. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.04.051⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01145728/file/Paper_flux_2nd_version.pdf BibTex
titre
Automated Quantification of Right Ventricular Fat at Contrast-enhanced Cardiac Multidetector CT in Arrhythmogenic Right Ventricular Cardiomyopathy
auteur
Hubert Cochet, Arnaud Denis, Yuki Komatsu, Amir S. Jadidi, Tassadit Aït Ali, Frédéric Sacher, Nicolas Derval, Jatin Relan, Maxime Sermesant, Olivier Corneloup, Mélèze Hocini, Michel Haïssaguerre, François Laurent, Michel Montaudon, Pierre Jaïs
article
Radiology, Radiological Society of North America, 2015, 275 (3), pp.683-91. ⟨10.1148/radiol.14141140⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01244219/file/radiol.pdf BibTex
titre
Computing Bi-Invariant Pseudo-Metrics on Lie Groups for Consistent Statistics
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec
article
Entropy, MDPI, 2015, 17 (4), pp.1850-1881. ⟨10.3390/e17041850⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01133922/file/entropy-17-01850.pdf BibTex
titre
Velocity-based cardiac contractility personalization from images using derivative-free optimization
auteur
Ken C.L. Wong, Maxime Sermesant, Kawal Rhode, Matthew Ginks, C. Aldo Rinaldi, Reza Razavi, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Journal of mechanical behavior of biomedical materials, Elsevier, 2015, 43, pp.35-52. ⟨10.1016/j.jmbbm.2014.12.002⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01095725/file/ActiveSubplex_final.pdf BibTex
titre
Expert-validated CSF segmentation of MNI atlas enhances accuracy of virtual glioma growth patterns
auteur
A Amelot, E Stretton, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, S Froelich, E Mandonnet
article
Journal of Neuro-Oncology, Springer Verlag, 2015, 121 (2), pp.381-387. ⟨10.1007/s11060-014-1645-5⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01081410/file/BrainMask_Aymeric_figuresBack6%281%29.pdf BibTex
titre
Disentangling normal aging from Alzheimer's disease in structural magnetic resonance images
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni, Nicholas Ayache
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2015, 36, pp.S42-S52. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2014.07.046⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01061017/file/Lorenzi-LongProjection-NBOA-Third.pdf BibTex
titre
Impact of the surgical experience on cochleostomy location: a comparative temporal bone study between endaural and posterior tympanotomy approaches for cochlear implantation
auteur
Clair Vandersteen, Thomas Demarcy, Coralie Roger, Eric Fontas, Charles Raffaelli, Nicholas Ayache, Hervé Delingette, Nicolas Guevara
article
European Archives of Oto-Rhino-Laryngology, Springer Verlag, 2015, pp.1-7. ⟨10.1007/s00405-015-3792-5⟩
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titre
A Pipeline for the Generation of Realistic 3D Synthetic Echocardiographic Sequences: Methodology and Open-access Database.
auteur
Martino Alessandrini, Mathieu de Craene, Olivier Bernard, Sophie Giffard-Roisin, Pascal Allain, Juergen Weese, Eric Saloux, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Jan d'Hooge
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 34 (7), pp.1436-1451. ⟨10.1109/TMI.2015.2396632⟩
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BibTex
titre
Efficient Lattice Boltzmann Solver for Patient-Specific Radiofrequency Ablation of Hepatic Tumors
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Hervé Delingette, Saikiran Rapaka, Viorel Mihalef, Daniel Carnegie, Emad Boctor, Michael Choti, Ali Kamen, Nicholas Ayache, Dorin Comaniciu
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 34 (issue 7 ), p 1576-1589. ⟨10.1109/TMI.2015.2406575⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01146319/file/2013-journal-paper.pdf BibTex
titre
A tree-topology preserving pairing for 3D/2D registration
auteur
Thomas Benseghir, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2015, 10 (6), pp.913-923. ⟨10.1007/s11548-015-1207-0⟩
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Communication dans un congrès

titre
Biased estimators on Quotient spaces
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec
article
Geometric Science of Information. Second International Conference, GSI 2015., Oct 2015, Palaiseau, France. pp.130-139, ⟨10.1007/978-3-319-25040-3_15⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01203805/file/Miolane_Pennec_GSI2015.pdf BibTex
titre
Barycentric Subspaces and Affine Spans in Manifolds
auteur
Xavier Pennec
article
Geometric Science of Information GSI'2015, Second International Conference, Oct 2015, Palaiseau, France. pp.12-21, ⟨10.1007/978-3-319-25040-3_2⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01164463/file/Pennec_AffineSpan_GSI2015.pdf BibTex
titre
Brain Transfer for the Analysis of Cortical Data
auteur
Herve Lombaert, Michael Arcaro, Sabine Kastner, Nicholas Ayache
article
Society for Neuroscience (SfN), Oct 2015, Chicago, United States
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BibTex
titre
A Non-parametric Statistical Shape Model for Assessment of the Surgically Repaired Aortic Arch in Coarctation of the Aorta: How Normal is Abnormal?
auteur
Jan Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Hopewell Ntsinjana, Claudio Capelli, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano
article
Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM 2015), Oct 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-28712-6_3⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01205515/file/Bruse_STACOM2015_04.pdf BibTex
titre
A survey of mathematical structures for extending 2D neurogeometry to 3D image processing
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec
article
MICCAI Workshop on Medical Computer Vision: Algorithms for Big Data (MICCAI-MCV 2015), Oct 2015, Munich, Germany
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https://hal.inria.fr/hal-01203518/file/Miolane_Pennec_MCV2015.pdf BibTex
titre
Estimating the Template in the Total Space with the Fréchet Mean on Quotient Spaces may have a Bias: a Case Study on Vector Spaces Quotiented by the Group of Translations
auteur
Stéphanie Allassonnière, Loïc Devilliers, Xavier Pennec
article
Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.131-142
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https://hal.inria.fr/hal-01203816/file/MFCA15_4_1.pdf BibTex
titre
A framework for creating population specific multimodal brain atlas using clinical T1 and diffusion tensor images
auteur
Vikash Gupta, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
MICCAI 2015 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.99-108, ⟨10.1007/978-3-319-28588-7_9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01261115/file/Gupta_CDMRI_2015.pdf BibTex
titre
Barycentric Subspaces Analysis on Spheres
auteur
Xavier Pennec
article
Mathematical Foundation sof Computational Anatomy (MFCA'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.71-82
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https://hal.inria.fr/hal-01203815/file/MFCA15_2_3.pdf BibTex
titre
Descriptive and Intuitive Population-Based Cardiac Motion Analysis via Sparsity Constrained Tensor Decomposition
auteur
Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Philipp Beerbaum, Xavier Pennec
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2015), Oct 2015, Munich, Germany. pp.419-426, ⟨10.1007/978-3-319-24574-4_50⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01205535/file/McLeod_CardiacMotionAnalysis_MICCAI2015.pdf BibTex
titre
Simulating Patient Specific Multiple Time-point MRIs From a Biophysical Model of Brain Deformation in Alzheimer's Disease
auteur
Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
Workshop on Computational Biomechanics for Medicine - X, Oct 2015, Munich, France. pp.167--176, ⟨10.1007/978-3-319-28329-6_15⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01217080/file/khanal2015_CBM.pdf BibTex
titre
Spectral Forests: Learning of Surface Data, Application to Cortical Parcellation
auteur
Herve Lombaert, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computingand Computer Assisted Intervention (MICCAI 2015), Oct 2015, Munich, Germany. pp.547-555, ⟨10.1007/978-3-319-24553-9_67⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01203568/file/MICCAI-SpectralForests.pdf BibTex
titre
Automatic View-Point Selection for Inter-Operative Endoscopic Surveillance
auteur
Anant S. Vemuri, Stéphane Nicolau, Jacques Marescaux, Luc Soler, Nicholas Ayache
article
Medical Content-based Retrieval for Clinical Decision Support, Tanveer Syeda-Mahmood; Hayit Greenspan; Anant Madabhushi, Oct 2015, Munich, Germany. pp.1-8
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https://hal.inria.fr/hal-01203463/file/anant_MCBR_2015_compressed.pdf BibTex
titre
Motion-Aware Mosaicing for Confocal Laser Endomicroscopy
auteur
Jessie Mahé, Nicolas Linard, Marzieh Kohandani Tafreshi, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Francois Lacombe, Remi Cuingnet
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2015, Oct 2015, Munich, Germany. pp.447-454, ⟨10.1007/978-3-319-24553-9_55⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01208437/file/miccai2015_VideoMosaicing_cameraready.pdf BibTex
titre
Challenges to Validate Multi-physics Model of Liver Tumor Radiofrequency Ablation from Pre-clinical Data
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Hervé Delingette, Saikiran Rapaka, Tiziano Passerini, Viorel Mihalef, Raoul Pop, Michele Diana, Luc Soler, Ali Kamen, Dorin Comaniciu, Nicholas Ayache
article
Computational Biomechanics for Medicine X, Oct 2015, Munich, Germany. pp.29-40
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https://hal.inria.fr/hal-01184543/file/CBMX_2015_CHLOE_AUDIGIER-v2.pdf BibTex
titre
Myocardial Infarct Localization using Neighborhood Approximation Forests
auteur
Héloïse Bleton, Jan Margeta, Herve Lombaert, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM 2015), Oct 2015, Munich, Germany
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https://hal.inria.fr/hal-01203579/file/MICCAI-STACOM-Myocardial-Infarction-NAF.pdf BibTex
titre
Bayesian Personalization of Brain Tumor Growth Model
auteur
Matthieu Lê, Hervé Delingette, Jayashree Kalpathy-Cramer, Elizabeth Gerstner, Tracy Batchelor, Jan Unkelbach, Nicholas Ayache
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2015, Oct 2015, Munich, Germany. pp.424-432, ⟨10.1007/978-3-319-24571-3_51⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01155075/file/paper295.pdf BibTex
titre
GPSSI: Gaussian Process for Sampling Segmentations of Images
auteur
Matthieu Lê, Jan Unkelbach, Nicholas Ayache, Hervé Delingette
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2015, Oct 2015, Munich, Germany. pp.38-46, ⟨10.1007/978-3-319-24574-4_5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01155078/file/paper435.pdf BibTex
titre
Prediction of infarct localization from myocardial deformation
auteur
Nicolas Duchateau, Maxime Sermesant
article
Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM 2015), Oct 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-28712-6_6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01208019/file/cDuchateau_STACOM_2015b-ok.pdf BibTex
titre
Haptic Rendering of Hyperelastic Models with Friction
auteur
Hadrien Courtecuisse, Yinoussa Adagolodjo, Hervé Delingette, Christian Duriez
article
2015 IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems (IROS), Sep 2015, Hamburg, Germany. pp.591-596, ⟨10.1109/IROS.2015.7353432⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01184113/file/IROS15_1122_FI.pdf BibTex
titre
The role of the image phase in cardiac strain imaging
auteur
Martino Alessandrini, Adrian Basarab, Mathieu de Craene, Maxime Sermesant, Hervé Liebgott, Olivier Bernard, Jan d'Hooge
article
EUSIPCO 2015 - 23rd European Signal Processing Conference, Aug 2015, Nice, France. pp.2796-2800, ⟨10.1109/EUSIPCO.2015.7362894⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01265886/file/alessandrini_14906.pdf BibTex
titre
Brain Transfer: Spectral Analysis of Cortical Surfaces and Functional Maps
auteur
Herve Lombaert, Michael Arcaro, Nicholas Ayache
article
Information Processing in Medical Imaging (IPMI 2015), Jul 2015, Scotland, United Kingdom. pp.474-487, ⟨10.1007/978-3-319-19992-4_37⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01203570/file/IPMI-BrainTransfer.pdf BibTex
titre
Joint Morphometry of Fiber Tracts and Gray Matter structures using Double Diffeomorphisms
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Alexandre Routier, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
IPMI - Information Processing in Medical Imaging, Jun 2015, Isle of Skye, United Kingdom. pp.275-287, ⟨10.1007/978-3-319-19992-4_21⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01142628/file/19.pdf BibTex
titre
Propagation of Myocardial Fibre Architecture Uncertainty on Electromechanical Model Parameter Estimation: A Case Study
auteur
Roch Molléro, Dominik Neumann, Marc-Michel Rohé, Manasi Datar, Herve Lombaert, Nicholas Ayache, Dorin Comaniciu, Olivier Ecabert, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Tommaso Mansi
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart, LNCS., Jun 2015, Maastricht, Netherlands. pp. 448-456, ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_51⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01241896/file/FIMH2015_UncertaintyPropagation_camera_ready.pdf BibTex
titre
Quantitative analysis of lead position vs. correction of electrical dyssynchrony in an experimental model of LBBB/CRT
auteur
David Soto-Iglesias, Nicolas Duchateau, Constantine Butakoff, David Andreu, Juan Fernández-Armenta, Bart Bijnens, Antonio Berruezo, Marta Sitges, Oscar Camara
article
FIMH: Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2015, Maastricht, Netherlands. pp.74-82, ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01208006/file/cSoto_FIMH_2015_FINALok.pdf BibTex
titre
Personalization of Cardiac Electrophysiology Model using the Unscented Kalman Filtering
auteur
Hugo Talbot, Stephane Cotin, Reza Razavi, Christopher Rinaldi, Hervé Delingette
article
Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS 2015), Jun 2015, Barcelona, Spain
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https://hal.inria.fr/hal-01195719/file/CARS2015-HTalbot.pdf BibTex
titre
Surgery Training, Planning and Guidance Using the SOFA Framework
auteur
Hugo Talbot, Nazim Haouchine, Igor Peterlik, Jeremie Dequidt, Christian Duriez, Hervé Delingette, Stephane Cotin
article
Eurographics, May 2015, Zurich, Switzerland
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https://hal.inria.fr/hal-01160297/file/Sofa-EG2015.pdf BibTex
titre
Virtual cochlear electrode insertion via parallel transport frame
auteur
Nicolas Duchateau, Nerea Mangado, Mario Ceresa, Pavel Mistrik, Sergio Vera, Miguel Angel Gonzalez Ballester
article
Biomedical Imaging (ISBI), 2015 IEEE 12th International Symposium on, Apr 2015, New York, France. pp.1398 - 1401, ⟨10.1109/ISBI.2015.7164137⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01207989/file/cDuchateau_ISBI_2015_FINALok.pdf BibTex
titre
Generation of ultra-realistic synthetic echocardiographic sequences to facilitate standardization of deformation imaging
auteur
Martino Alessandrini, Brecht Heyde, Sophie Giffard-Roisin, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Pascal Allain, Olivier Bernard, Mathieu de Craene, Jan d'Hooge
article
International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro (ISBI 2015), Apr 2015, New York, United States. pp.756-759, ⟨10.1109/ISBI.2015.7163982⟩
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BibTex
titre
Unified analysis of shape and structural connectivity of neural pathways
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Alexandre Routier, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
Organisation for Human Brain Mapping, 2015, Honolulu, Hawaii, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01187461/file/OHBM2015_Gori.pdf BibTex
titre
Combination of Polyaffine Transformations and Supervised Learning for the Automatic Diagnosis of LV Infarct
auteur
Marc-Michel Rohé, Nicolas Duchateau, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM 2015), 2015, Munich, Germany
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https://hal.inria.fr/hal-01206710/file/STACOM_2015_final.pdf BibTex
titre
Patient-specific virtual insertion of electrode array for electrical simulation of cochlear implants
auteur
Nerea Mangado, Nicolas Duchateau, Mario Ceresa, Hans Martin Kjer, Sergio Vera, Pavel Mistrik, Javier Herrero, Miguel Angel Gonzalez Ballester
article
Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS), 2015, Barcelona, Spain. pp.S102-S103, ⟨10.1007/s11548-015-1213-2⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01213345/file/cMangado_CARS_2015-02ok.pdf BibTex
titre
Automatic generation of a computational model for monopolar stimulation of cochlear implants
auteur
Nerea Mangado, Mario Ceresa, Nicolas Duchateau, Hector Dejea, Hans Martin Kjer, Rasmus Paulsen, Sergio Vera, Pavel Mistrik, Javier Herrero, Miguel Angel Gonzalez Ballester
article
Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS), 2015, Barcelona, Spain. pp.S67-S68, ⟨10.1007/s11548-015-1213-2⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01213341/file/cMangado_CARS_2015-01ok.pdf BibTex
titre
Characterization of myocardial motion by multiple kernel learning: application to heart failure with preserved ejection fraction
auteur
Sergio Sanchez-Martinez, Nicolas Duchateau, Bart Bijnens, Tamás Erdei, Alan Fraser, Gemma Piella
article
8th International Conference, FIMH 2015, Maastricht, The Netherlands, June 25-27, 2015. Proceedings, 2015, Maastricht, Netherlands. pp.65-73, ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_8⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01208016/file/cSanchez_FIMH_2015_FINALok.pdf BibTex
titre
Quantifying the contribution of stress echocardiography to the diagnosis of heart failure with preserved ejection fraction
auteur
Sergio Sanchez-Martinez, Nicolas Duchateau, Tamás Erdei, Alan Fraser, Gemma Piella, Bart Bijnens
article
EuroEcho-Imaging, 2015, Seville, Spain. pp.ii234, ⟨10.1093/ehjci/jev271⟩
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titre
Can machine learning help to identify heart failure with preserved ejection fraction?
auteur
Sergio Sanchez-Martinez, Nicolas Duchateau, Tamás Erdei, Alan Fraser, Gemma Piella, Bart Bijnens
article
EuroEcho-Imaging, 2015, Seville, Spain. pp.ii38-9, ⟨10.1093/ehjci/jev263⟩
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titre
3D regional right ventricular function in pulmonary hypertension
auteur
Nicolas Duchateau, Maxime Sermesant, Pierre Gibelin, Emile Ferrari, Pamela Moceri
article
EuroEcho-Imaging, 2015, Seville, Spain. pp.ii69, ⟨10.1093/ehjci/jev251⟩
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BibTex
titre
Statistical significance of 3D motion and deformation indexes for the analysis of LAD infarction
auteur
Nicolas Duchateau, Mathieu de Craene, Damien Legallois, Fabien Labombarda, Arnaud Pellissier, Maxime Sermesant, Eric Saloux
article
EuroEcho-Imaging, 2015, Seville, Spain. pp.ii81, ⟨10.1093/ehjci/jev278⟩
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Chapitre d'ouvrage

titre
Statistical Computing on Non-Linear Spaces for Computational Anatomy
auteur
Xavier Pennec, Pierre Fillard
article
Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Handbook of Biomedical Imaging: Methodologies and Clinical Research, Springer, pp.147-168, 2015, 978-0-387-09748-0. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7_8⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616201/file/ComputationalAnatomy.pdf BibTex
titre
Building Patient-Specific Physical and Physiological Computational Models from Medical Images
auteur
Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Handbook of Biomedical Imaging: Methodologies and Clinical Research, Springer US, pp.169-182, 2015, 978-0-387-09748-0. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7_9⟩
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Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015)
auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Thomas P. Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads and Fletcher, Thomas P. and Durrleman, Stanley and Sommer, Stefan Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015), Oct 2015, Munich, Germany. pp.173, 2015, ⟨http://www-sop.inria.fr/asclepios/events/MFCA15/⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01203812/file/MFCA15_Proceedings.pdf BibTex
titre
Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data
auteur
Stanley Durrleman, Thomas P. Fletcher, Guido Gerig, Marc Niethammer, Xavier Pennec
article
Durrleman, Stanley; Fletcher, Thomas P.; Gerig, Guido; Niethammer, Marc ; Pennec, Xavier STIA 2014 - Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Sep 2014, Cambridge, United States. , 8682, Springer International Publishing, pp.89, 2015, Lecture notes in computer science, 978-3-319-14904-2. ⟨10.1007/978-3-319-14905-9⟩. ⟨http://www.sci.utah.edu/stia2014-home.html⟩
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titre
Statistical Atlases and Computational Models of the Heart - Imaging and Modelling Challenges
auteur
Oscar Camara, Tommaso Mansi, Mihaela Pop, Kawal Rhode, Maxime Sermesant, Alistair Young
article
Oscar Camara; Tommaso Mansi; Mihaela Pop; Kawal Rhode; Maxime Sermesant; Alistair Young Statistical Atlases and Computational Models of the Heart, Sep 2014, Boston, United States. 8896, Springer, pp.296, 2015, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-319-14678-2⟩. ⟨http://capwebprd01.its.auckland.ac.nz/web/stacom2014⟩
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Ouvrage (y compris édition critique et traduction)

titre
Des images médicales au patient numérique
auteur
Nicholas Ayache
article
Collège de France / Fayard, pp.80, 2015, Leçons inaugurales du Collège de France, 978-2-213-68638-7. ⟨http://www.fayard.fr/des-images-medicales-au-patient-numerique-9782213686387⟩
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BibTex
titre
Handbook of Biomedical Imaging: Methodologies and Clinical Research
auteur
Nikos Paragios, Jim Duncan, Nicholas Ayache
article
Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Springer, pp.590, 2015, 978-0-387-09748-0. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7⟩
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Brevet

titre
System and method for personalized computation of tissue ablation extent based on medical images
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Saikiran Rapaka, Ali Kamen, Viorel Mihalef, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Dorin Comaniciu
article
United States, Patent n° : US 2015/0242588 A1. 2015
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titre
Magnetic resonance imaging tool to detect clinical difference in brain anatomy
auteur
Natasha Lepore, Fernando Ypes-Calderon, Yalin Wang, Paul Thompson, Xavier Pennec, Marvin D. Nelson, Caroline Brun, Wayne Tang
article
United States, Patent n° : WO/2015/017582, International Application PCT/US2014/048973. 2015
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Rapport

titre
From extraction of physiological features with dynamic µ-SPECT imaging to modelling of iodide biodistribution in stomach
auteur
Marine Breuilly, Kaouthar Chatti, Jacques Darcourt, Philippe Franken, Julien Guglielmi, Grégoire Malandain, Thierry Pourcher
article
[Research Report] Inria Sophia Antipolis. 2015
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https://hal.inria.fr/hal-01186222/file/BREUILLY_RR_201508.pdf BibTex

Thèse

titre
Multi-atlas patch-based segmentation and synthesis of brain tumor MR images
auteur
Nicolas Cordier
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : 2015NICE4111⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01237853/file/2015NICE4111.pdf BibTex
titre
Statistical learning for image-based personalization of cardiac models
auteur
Loïc Le Folgoc
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : 2015NICE4098⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01316449/file/2015NICE4098.pdf BibTex
titre
Computational modeling of radiofrequency ablation for the planning and guidance of abdominal tumor treatment
auteur
Chloé Audigier
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : 2015NICE4071⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01256010/file/2015NICE4071.pdf BibTex
titre
Radiofrequency ablation planning for cardiac arrhythmia treatment using modeling and machine learning approaches
auteur
Rocío Cabrera Lozoya
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : 2015NICE4059⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01206478/file/2015NICE4059.pdf BibTex
titre
Topology Preserving Vascular Registration: Application to Percutaneous Coronary Intervention
auteur
Thomas Benseghir
article
Signal and Image processing. Université de Nice-Sophia Antipolis, 2015. English
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https://hal.inria.fr/tel-01235141/file/ThesisManuscript_ThomasBenseghir.pdf BibTex
titre
Diffusion tensor imaging of the brain : towards quantitative clinical tools
auteur
Vikash Gupta
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : 2015NICE4007⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01159964/file/2015NICE4007.pdf BibTex

2014

Article dans une revue

titre
The Multimodal Brain Tumor Image Segmentation Benchmark (BRATS)
auteur
Bjoern Menze, Andras Jakab, Stefan Bauer, Jayashree Kalpathy-Cramer, Keyvan Farahani, Justin Kirby, Yuliya Burren, Nicole Porz, Johannes Slotboom, Roland Wiest, Levente Lanczi, Elisabeth Gerstner, Marc-Andre Weber, Tal Arbel, Brian Avants, Nicholas Ayache, Patricia Buendia, Louis Collins, Nicolas Cordier, Jason Corso, Antonio Criminisi, Tilak Das, Hervé Delingette, Cagatay Demiralp, Christopher Durst, Michel Dojat, Senan Doyle, Joana Festa, Florence Forbes, Ezequiel Geremia, Ben Glocker, Polina Golland, Xiaotao Guo, Andac Hamamci, Khan Iftekharuddin, Raj Jena, Nigel John, Ender Konukoglu, Danial Lashkari, Jose Antonio Mariz, Raphael Meier, Sergio Pereira, Doina Precup, S. J. Price, Tammy Riklin-Raviv, Syed Reza, Michael Ryan, Lawrence Schwartz, Hoo-Chang Shin, Jamie Shotton, Carlos Silva, Nuno Sousa, Nagesh Subbanna, Gabor Szekely, Thomas Taylor, Owen Thomas, Nicholas Tustison, Gozde Unal, Flor Vasseur, Max Wintermark, Dong Hye Ye, Liang Zhao, Binsheng Zhao, Darko Zikic, Marcel Prastawa, Mauricio Reyes, Koen van Leemput
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, 34 (10), pp.1993-2024. ⟨10.1109/TMI.2014.2377694⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00935640/file/menze_brats.pdf BibTex
titre
Spatio-Temporal Video Segmentation with Shape Growth or Shrinkage Constraint
auteur
Yuliya Tarabalka, Guillaume Charpiat, Ludovic Brucker, Bjoern Menze
article
IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, 23 (9), pp.3829-3840
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https://hal.inria.fr/hal-01052543/file/2014_IEEETIP_Tarabalka.pdf BibTex
titre
Touchless User Interface for Intraoperative Image Control: Almost There
auteur
Antoine Iannessi, Pierre Yves Marcy, Olivier Clatz, Nicholas Ayache, Pierre Fillard
article
Radiographics, Radiological Society of North America (RSNA), 2014, 34 (4), ⟨10.1148/rg.344135158⟩
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BibTex
titre
Improved Myocardial Motion Estimation Combining Tissue Doppler and B-Mode Echocardiographic Images
auteur
Antonio Porras, Martino Alessandrini, Mathieu de Craene, Nicolas Duchateau, Marta Sitges, Bart Bijnens, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Jan d'Hooge, Alejandro Frangi, Gemma Piella
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, 33 (11), pp.2098 - 2106. ⟨10.1109/TMI.2014.2331392⟩
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BibTex
titre
Spectral Log-Demons: Diffeomorphic Image Registration with Very Large Deformations
auteur
Herve Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2014, 107 (3), pp.254-271. ⟨10.1007/s11263-013-0681-5⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00979616/file/SpectralDemons-IJCV2013.pdf BibTex
titre
Cardiac Electrophysiological Activation Pattern Estimation from Images using a Patient-Specific Database of Synthetic Image Sequences
auteur
Adityo Prakosa, Maxime Sermesant, Pascal Allain, Nicolas Villain, Christopher Aldo Rinaldi, Kawal Rhode, Reza Razavi, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, 61 (2), pp. 235 - 245. ⟨http://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=6600804⟩. ⟨10.1109/TBME.2013.2281619⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00858891/file/Journal_2_Adityo_Revision_Final_6.pdf BibTex
titre
A Collaborative Resource to Build Consensus for Automated Left Ventricular Segmentation of Cardiac MR Images
auteur
Avan Suinesiaputra, Brett Cowan, Ahmed O. Al-Agamy, Mustafa A. Alattar, Nicholas Ayache, Ahmed S. Fahmy, Ayman M. Khalifa, Pau Medrano-Gracia, Marie-Pierre Jolly, Alan H. Kadish, Daniel C. Lee, Jan Margeta, Simon K. Warfield, Alistair Young
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2014, 18 (1), pp.50-62. ⟨10.1016/j.media.2013.09.001⟩
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BibTex
titre
Group-wise Construction of Reduced Models for Understanding and Characterization of Pulmonary Blood Flows from Medical Images
auteur
Romain Guibert, Kristin Mcleod, Alfonso Caiazzo, Tommaso Mansi, Miguel Angel Fernández, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Irene Vignon-Clementel, Younes Boudjemline, Jean-Frédéric Gerbeau
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2014, 18 (1), pp.63-82. ⟨10.1016/j.media.2013.09.003⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00874545/file/MEDIA_Guibert_McLeod_2013.pdf BibTex
titre
Relationship Between MDCT-Imaged Myocardial Fat and Ventricular Tachycardia Substrate in Arrhythmogenic Right Ventricular Cardiomyopathy
auteur
Y. Komatsu, A. Jadidi, F. Sacher, A. Denis, M. Daly, N. Derval, A. Shah, H. Lehrmann, C.-I. Park, R. Weber, T. Arentz, G. Pache, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, J. Relan, M. Montaudon, F. Laurent, M. Hocini, M. Haissaguerre, P. Jais, Hubert Cochet
article
Journal of the American Heart Association, Wiley-Blackwell, 2014, 3 (4), pp.10. ⟨10.1161/JAHA.114.000935⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01095772/file/vkIwAd-J%20Am%20Heart%20Assoc-2014-Komatsu-.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Video Synchronization: An Approach to Biopsy Site Re-localization
auteur
Anant S. Vemuri, Adrien Sportes, Stéphane Nicolau, Jacques Marescaux, Nicholas Ayache, Luc Soler
article
Proceedings of Surgetica'2014 : Computer-Assisted Medical Interventions: scientific problems, tools and clinical applications, Jocelyne TROCCAZ, Dec 2014, Chambéry, France
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https://hal.inria.fr/hal-01089196/file/Anant_Vemuri_IHU.pdf BibTex
titre
Analyse biométrique de l'anneau pelvien en 3 dimensions - à propos de 100 scanners
auteur
Hugo Darmanté, Benoit Bugnas, Regis Bernard De Dompsure, Laurent Barresi, Nina Miolane, Xavier Pennec, Fernand de Peretti, Nicolas Bronsard
article
89e Réunion annuelle de la SOFCOT, Nov 2014, Paris, France. ⟨10.1016/j.rcot.2014.09.076⟩
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BibTex
titre
Interactive Training System for Interventional Electrocardiology Procedures
auteur
H Talbot, F Spadoni, Christian Duriez, M Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
6th International Symposium on Biomedical Simulation - ISBMS 2014, Oct 2014, Strabsourg, France. pp.11 - 19, ⟨10.1007/978-3-319-12057-7_2⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01078209/file/HugoTalbot-ISBMS2014.pdf BibTex
titre
Statistics on Lie groups : a need to go beyond the pseudo-Riemannian framework
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec
article
MaxEnt 2014, Sep 2014, Amboise, France. pp.59--66
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https://hal.inria.fr/hal-01091515/file/69_paper.pdf BibTex
titre
Evaluation of Personalised Canine Electromechanical Models
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Stéphanie Marchesseau, Loic Le Folgoc, Hervé Delingette, Maxime Sermesant
article
Proceedings of the 5th international STACOM workshop (Boston, September 18, 2014), Pop M., Sep 2014, Boston, United States. pp.74-82, ⟨10.1007/978-3-319-14678-2_8⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01087841/file/miccaiPaper.pdf BibTex
titre
A Prototype Representation to Approximate White Matter Bundles with Weighted Currents
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Fabrizio de Vico Fallani, Mario Chavez, Sophie Lecomte, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
MICCAI 2014 - 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01010702/file/paper466_MICCAI2014.pdf BibTex
titre
Sparse Bayesian Registration
auteur
Loic Le Folgoc, Hervé Delingette, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
MICCAI - 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. pp.235-242, ⟨10.1007/978-3-319-10404-1_30⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01006605/file/paper945.pdf BibTex
titre
Laplacian Forests: Semantic Image Segmentation by Guided Bagging
auteur
Herve Lombaert, Darko Zikic, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
MICCAI 2014 - 17th International Conference Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. ⟨10.1007/978-3-319-10470-6_62⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01009672/file/MICCAI-LaplacianForest.pdf BibTex
titre
Multimodal Analysis of Vasogenic Edema in Glioblastoma Patients for Radiotherapy Planning
auteur
Matthieu Lê, Hervé Delingette, Jayashree Kalpathy-Cramer, Elisabeth Gerstner, Helen A. Shih, Tracy Batchelor, Jan Unkelbach, Nicholas Ayache
article
Workshop Image-Guided Adaptive Radiation Therapy, Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01093397/file/mle_IGART_camera_ready.pdf BibTex
titre
A Biophysical Model of Shape Changes due to Atrophy in the Brain with Alzheimer's Disease
auteur
Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
MICCAI 2014 - 17th International Conference Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. pp.41-48, ⟨10.1007/978-3-319-10470-6_6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01006478/file/Khanal2014_MiccaiFinalSubmitted.pdf BibTex
titre
Parameter Estimation For Personalization of Liver Tumor Radiofrequency Ablation
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Hervé Delingette, Saikiran Rapaka, Viorel Mihalef, Daniel Carnegie, Emad Boctor, Michael Choti, Ali Kamen, Dorin Comaniciu, Nicholas Ayache
article
MICCAI Workshop on Abdominal Imaging -- Computational and Clinical Applications, Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01067709/file/paper.pdf BibTex
titre
Elastic registration vs. block matching for quantification of cardiac function with 3D ultrasound: Initial results of a direct comparison in silico based on a new evaluation pipeline
auteur
Martino Alessandrini, Brecht Heyde, Szymon Cygan, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Olivier Bernard, De Craene, Jan d'Hooge
article
IEEE International Ultrasonics Symposium, Sep 2014, Chicago, United States. pp.608 - 611, ⟨10.1109/ULTSYM.2014.0149⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01095790/file/radD71C8.pdf BibTex
titre
Confidence-based Training for Clinical Data Uncertainty in Image-based Prediction of Cardiac Ablation Targets
auteur
Rocio Cabrera Lozoya, Jan Margeta, Loic Le Folgoc, Yuki Komatsu, Berte Benjamin, Jatin Relan, Hubert Cochet, Michel Haissaguerre, Pierre Jais, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
bigMCV Workshop MICCAI 2014, Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01069085/file/RCL_miccai2014.pdf BibTex
titre
Semi-automated Query Construction for Content-based Endomicroscopy Video Retrieval
auteur
Marzieh Kohandani Tafreshi, Nicolas Linard, Barbara André, Nicholas Ayache, Tom Vercauteren
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01010673/file/paper-841.pdf BibTex
titre
Regional flux analysis of longitudinal atrophy in Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, (adni) For The Alzheimer'S Disease Neuroimaging Initiative
article
Alzheimer's Association International Conference, Jul 2014, Copenhagen, Denmark
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titre
Recognizing cardiac magnetic resonance acquisition planes
auteur
Jan Margeta, Antonio Criminisi, Daniel C. Lee, Nicholas Ayache
article
MIUA - Medical Image Understanding and Analysis Conference - 2014, Reyes-Aldasoro, Constantino Carlos and Slabaugh, Gregory, Jul 2014, London, United Kingdom
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https://hal.inria.fr/hal-01009952/file/view_recognition.pdf BibTex
titre
Smart Atlas for Supporting the Interpretation of needle-based Confocal Laser Endomicroscopy (nCLE) of Pancreatic Cysts: First Classification Results of a Computer-Aided Diagnosis Software based on Image Recognition
auteur
Marzieh Kohandani Tafreshi, Bertrand Napoléon, Anne-Isabelle Lemaistre, Marc Giovannini, Virendra Joshi, Julien Dauguet, Nicholas Ayache, Barbara André
article
Digestive Disease Week (DDW 2014), May 2014, Chicago, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01010701/file/DDW-ASGE-Abstract-PancreaticCysts.pdf BibTex
titre
Smart Atlas for Supporting the Interpretation of probe-based Confocal Laser Endomicroscopy (pCLE) of Gastric Lesions: First Classification Results of a Computer-Aided Diagnosis Software based on Image Recognition
auteur
Marzieh Kohandani Tafreshi, Yan-Qing Li, Rapat Pittayanon, Douglas Pleskow, Virendra Joshi, Philip Chiu, Julien Dauguet, Nicholas Ayache, Barbara André
article
Digestive Disease Week (DDW 2014), May 2014, Chicago, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01010762/file/DDW-ASGE-Abstract-GastricLesions.pdf BibTex
titre
Smart Atlas for Supporting the Interpretation of probe-based Confocal Laser Endomicroscopy (pCLE) of Biliary Strictures: First Classification Results of a Computer-Aided Diagnosis Software based on Image Recognition
auteur
Marzieh Kohandani Tafreshi, Virendra Joshi, Alexander Meining, Charles Lightdale, Marc Giovannini, Julien Dauguet, Nicholas Ayache, Barbara André
article
Digestive Disease Week (DDW 2014), May 2014, Chicago, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01010765/file/DDW-ASGE-Abstract-BiliaryStrictures.pdf BibTex
titre
Generation of ultra-realistic synthetic echocardiographic sequences
auteur
Mathieu de Craene, Martino Alessandrini, Pascal Allain, Stephanie Marchesseau, I Waechter-Stehle, J Weese, E Saloux, H. G. Morales, R Cuingnet, Hervé Delingette, M Sermesant, Olivier Bernard, J D 'Hooge
article
Biomedical Imaging (ISBI), 2014 IEEE 11th International Symposium on, Apr 2014, Beijing, China. pp.73 - 76, ⟨10.1109/ISBI.2014.6867812⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01095133/file/IsbiSyrus.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Discrete Ladders for Parallel Transport in Transformation Groups with an Affine Connection Structure
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
article
Frank Nielsen. Geometric Theory of Information, Springer, pp.243-271, 2014, Signals and Communication Technology, ⟨10.1007/978-3-319-05317-2_9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00933229/file/GSI-BookChapter.pdf BibTex
titre
Image Based Modelling
auteur
A. Frangi, Denis Friboulet, Nicholas Ayache, H. Delingette, T. Glatard, C. Hoogendoorn, L. Humbert, K. Lekadir, I. Larrabide, Y. Martelli, F. Peyrin, X. Planes, Maxime Sermesant, M.C. Villa-Uriol, T. Whitmarsh, D. Atkinson
article
Peter Coveney; Vanessa Diaz; Peter Hunter; Marco Viceconti. Computational Biomedicine, Oxford University Press, pp.59 - 82, 2014, 978-0-19-965818-3
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Brevet

titre
System and method for interactive patient specific simulation of radiofrequency ablation therapy
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Viorel Mihalef, Ali Kamen, Dorin Comaniciu, Puneet Sharma, Saikiran Rapaka
article
United States, Patent n° : PCT/US2014/017886. 2014
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titre
System and method for patient specific modeling of liver tumor ablation
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Viorel Mihalef, Ali Kamen, Dorin Comaniciu, Puneet Sharma, Saikiran Rapaka, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
United States, Patent n° : US 2014/0136174 A1. 2014
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Poster

titre
Teaching tool for advanced visualization of temporal bone structures by fusion of μCT and CT scan images
auteur
Clair Vandersteen, Thomas Demarcy, Hervé Delingette, Charles Raffaelli, Jonathan Laudanski, Thierry Pourcher, Jacques Darcourt, Philippe Franken, Dan Gnansia, Nicholas Ayache, Nicolas Guevara
article
8th International Symposium on Objective Measures in Auditory Implants, Oct 2014, Toronto, Canada. ⟨http://www.objectivemeasures.org/⟩. ⟨10.13140/2.1.1517.6007⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01108877/file/OMAI2014_Demarcy.pdf BibTex
titre
A Statistical Shape Atlas of the Surgically Reconstructed Aortic Arch in Patients With Hypoplastic Left Heart Syndrome
auteur
Jan Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Tain-Yen Hsia, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
article
7th World Congress of Biomechanics, Boston 2014, Jul 2014, Boston, United States. 2014, ⟨https://esbiomech.org/newsletter/esbiomech-newsletter-autumn-2013/7th-world-congress-of-biomechanics-from-july-6-11-2014-boston-usa/⟩
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titre
Développement d’un système de relocalisation endoscopique de sites de biopsie dans le suivi de l’endobrachyoesophage : Résultats préliminaires d’un prototype de synchronisation video
auteur
A Sportes, Anant S. Vemuri, Stéphane Nicolau, J Huppertz, L Soler, M Delvaux
article
Société Nationale Française de Gastro-Entérologie, 2014, Paris, France. 2014
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https://hal.inria.fr/hal-01308609/file/POSTER-Snfge2014.pdf BibTex
titre
Development Of A Prototype Of Video Synchronisation For Relocalization Of Biopsy Sites During Endoscopic Evaluation Of Barrett's Oesophagus: Preliminary Experimental And Clinical Study
auteur
Adrien Sportes, Anant Vemuri, Stéphane Nicolau, Jerome Huppertz, Luc Soler, Michel Delvaux
article
United European Gastroenterology (UEG) Week, 2014, Vienna, Austria. 2014
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https://hal.inria.fr/hal-01310072/file/UEGWeek%202014%20E-posterM2.pdf BibTex

Document associé à des manifestations scientifiques

titre
Technical Appendix on Sparse Bayesian Regression
auteur
Loic Le Folgoc, Hervé Delingette, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
MICCAI - 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01002861/file/appendix.pdf BibTex

Rapport

titre
Math in the Cabin - Shape Analysis Workshop in Bad Gastein
auteur
Martin Bauer, Martins Bruveris, Philipp Harms, Boris Khesin, Stephen Marsland, Peter Michor, Klas Modin, Olaf Müller, Xavier Pennec, Stefan Sommer, François-Xavier Vialard
article
[Research Report] Brunel University London; University of Vienna. 2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01076953/file/report.pdf BibTex

Thèse

titre
Simulation of patient-specific glioma models for therapy planning
auteur
Erin Stretton
article
Modeling and Simulation. Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2014. English. ⟨NNT : 2014ENMP0064⟩
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/tel-01144425/file/2014ENMP0064.pdf BibTex
titre
Interactive Patient-Specific Simulation of Cardiac Electrophysiology
auteur
Hugo Talbot
article
Computer Science [cs]. Université des Sciences et Technologies de Lille, 2014. English
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https://hal.inria.fr/tel-01097201/file/Thesis.pdf BibTex

2013

Article dans une revue

titre
Whole-body anatomy localization via classification and regression forests
auteur
Bjoern Menze, Georg Langs, Zhuowen Tu, Antonio Criminisi
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2013, 17 (8), pp.1282. ⟨10.1016/j.media.2013.09.005⟩
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BibTex
titre
Radiotherapy planning for glioblastoma based on a tumor growth model: improving target volume delineation
auteur
Jan Unkelbach, Bjoern Menze, Ender Konukoglu, Florian Dittmann, Matthieu Le, Nicholas Ayache, Helen Shi
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2013, ⟨10.1088/0031-9155/59/3/747⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00917869/file/Unkelbach-Physics-v2.pdf BibTex
titre
Radiotherapy planning for glioblastoma based on a tumor growth model: implications for spatial dose redistribution
auteur
Jan Unkelbach, Bjoern Menze, Ender Konukoglu, Florian Dittmann, Nicholas Ayache, Helen Shi
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00917846/file/unkelbach_13_dose.pdf BibTex
titre
Geodesics, Parallel Transport & One-parameter Subgroups for Diffeomorphic Image Registration
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2013, International Journal of Computer Vision, 105 (2), pp.111-127. ⟨10.1007/s11263-012-0598-4⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813835/file/Lorenzi-IJCV2012.pdf BibTex
titre
Efficient Parallel Transport of Deformations in Time Series of Images: from Schild's to Pole Ladder
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2013, 50 (1-2), pp.5-17. ⟨10.1007/s10851-013-0470-3⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00870489/file/Lorenzi-PoleLadder2013.pdf BibTex
titre
GPU & CPU implementation of Young - Van Vliet's Recursive Gaussian Smoothing Filter
auteur
Irina Vidal-Migallón, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Julien Dauguet, Tom Vercauteren
article
Insight Journal (ITK), 2013, pp.16
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00855958/file/IJ_896_3_InsightJournal_YVV.pdf BibTex
titre
Personalization of a Cardiac Electromechanical Model using Reduced Order Unscented Kalman Filtering from Regional Volumes
auteur
Stéphanie Marchesseau, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Rocio Cabrera Lozoya, Catalina Tobon-Gomez, Philippe Moireau, Rosa Maria Figueras I Ventura, Karim Lekadir, Alfredo Hernandez, Mireille Garreau, Erwan Donal, Christophe Leclercq, Simon G. Duckett, Kawal Rhode, Christopher Aldo Rinaldi, Alejandro F. Frangi, Reza Razavi, Dominique Chapelle, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2013, 17 (7), pp.816-829. ⟨10.1016/j.media.2013.04.012⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00819806/file/Finalmanuscript.pdf BibTex
titre
Toward a Comprehensive Framework for the Spatiotemporal Statistical Analysis of Longitudinal Shape Data
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, José Braga, Guido Gerig, Nicholas Ayache
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2013, 103 (1), pp.22-59. ⟨10.1007/s11263-012-0592-x⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813825/file/Durrleman_IJCV_2012_Longitudinal.pdf BibTex
titre
Towards an Interactive Electromechanical Model of the Heart
auteur
Hugo Talbot, Stéphanie Marchesseau, Christian Duriez, Maxime Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
Interface Focus, Royal Society publishing, 2013, The Virtual Physiological Human: Integrative Approaches to Computational Biomedicine, 3 (2), pp.4. ⟨http://rsfs.royalsocietypublishing.org/content/3/2/20120091.full.pdf+html⟩. ⟨10.1098/rsfs.2012.0091⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00797354/file/Interface_Focus-2013-Talbot.pdf BibTex
titre
Amplitude-based data selection for optimal retrospective reconstruction in micro-SPECT
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Julien Guglielmi, Robert Marsault, Thierry Pourcher, Philippe Franken, Jacques Darcourt
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2013, 58 (8), pp.2657-2674. ⟨10.1088/0031-9155/58/8/2657⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00799381/file/BREUILLY_PMB_2013.pdf BibTex
titre
Computational modelling of the right ventricle in repaired tetralogy of Fallot: can it provide insight into patient treatment?
auteur
Benedetta Leonardi, Andrew Taylor, Tommaso Mansi, Ingmar Voigt, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Younes Boudjemline, Giacomo Pongiglione
article
European Heart Journal - Cardiovascular Imaging, Oxford UP, 2013, 14 (4), pp.381-6. ⟨10.1093/ehjci/jes239⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813831/file/EHJCI-2013.pdf BibTex
titre
Integration of Merged Delayed-Enhanced Magnetic Resonance Imaging and Multi-Detector Computed Tomography for the Guidance of Ventricular Tachycardia Ablation: A Pilot Study
auteur
Hubert Cochet, Y. Komatsu, F. Sacher, A. Jadidi, D. Scherr, M. Riffaud, N. Derval, A. Shah, L. Roten, P. Pascale, Jatin Relan, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, M. Montaudon, F. Laurent, M. Hocini, M. Haïssaguerre, Pierre Jaïs
article
Journal of Cardiovascular Electrophysiology, Wiley, 2013, 24 (4), pp.419-426. ⟨10.1111/jce.12052⟩
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BibTex
titre
Higher-order momentum distributions and locally affine LDDMM registration
auteur
Stefan Sommer, Mads Nielsen, Sune Darkner, Xavier Pennec
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2013, 6 (1), pp.341-367. ⟨10.1137/110859002⟩
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https://arxiv.org/pdf/1112.3166 BibTex
titre
Generation of Synthetic but Visually Realistic Time Series of Cardiac Images Combining a Biophysical Model and Clinical Images
auteur
A. Prakosa, Maxime Sermesant, H. Delingette, S. Marchesseau, E. Saloux, Pascal Allain, N. Villain, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 32 (1), pp.99-109. ⟨10.1109/TMI.2012.2220375⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813861/file/PrakosaTMI2012.pdf BibTex
titre
Guest Editorial Special Issue on Medical Imaging and Image Computing in Computational Physiology
auteur
Alejandro F. Frangi, D. Rod Hose, Peter J. Hunter, Nicholas Ayache, Dana Brooks
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 32 (1), pp.1-7. ⟨10.1109/TMI.2012.2234320⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01355239/file/IEEE_TMI_MIinCP_v7.pdf BibTex
titre
Personalized Cardiac Modeling and Simulations in euHeart
auteur
Jürgen Weese, Nicholas Ayache, Nicolas Smith
article
Medical and Biological Engineering and Computing, Springer Verlag, 2013, ⟨10.1007/s11517-013-1103-0⟩
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BibTex
titre
In vivo human cardiac fibre architecture estimation using shape-based diffusion tensor processing
auteur
Nicolas Toussaint, Christian T. Stoeck, Tobias Schaeffter, Sebastian Kozerke, Maxime Sermesant, Philip G. Batchelor
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2013
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BibTex
titre
Spatial Correlation of Action Potential Duration and Diastolic Dysfunction in Transgenic and Drug-induced LQT2 Rabbits
auteur
Katja Odening, Bernd Jung, Corinna Lang, Rocio Cabrera Lozoya, David Ziupa, Marius Menza, Jatin Relan, Gerlind Franke, Stefanie Perez Feliz, Gideon Koren, Manfred Zehender, Christoph Bode, Michael Brunner, Maxime Sermesant, Daniela Föll
article
Heart Rhythm, Elsevier, 2013, 10 (10), pp.1533-1541. ⟨10.1016/j.hrthm.2013.07.038⟩
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BibTex
titre
Understanding the mechanisms amenable to CRT response: from pre-operative multimodal image data to patient-specific computational models
auteur
Catalina Tobon-Gomez, Nicolas Duchateau, Rafael Sebastian, Stéphanie Marchesseau, Oscar Camara, Erwan Donal, Mathieu de Craene, Ali Pashaei, Jatin Relan, Martin Steghofer, Pablo Lamata, Hervé Delingette, Simon G. Duckett, Mireille Garreau, Alfredo Hernandez, Kawal Rhode, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, Christophe Leclercq, Reza Razavi, Nicolas Smith, Alejandro F. Frangi
article
Medical and Biological Engineering and Computing, Springer Verlag, 2013, pp.1--16. ⟨10.1007/s11517-013-1044-7⟩
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BibTex
titre
Benchmarking framework for myocardial tracking and deformation algorithms: an open access database
auteur
Catalina Tobon-Gomez, Mathieu de Craene, Kristin Mcleod, Lennart Tautz, Wenzhe Shi, Anja Hennemuth, Adityo Prakosa, Hengui Wang, Gerald Carr-White, Sergio Kapetanakis, Albert Lutz, Vernon Rasche, Tobias Schaeffter, Constantin Butakoff, Oskar Friman, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Xiahai Zhuang, Sébastien Ourselin, Hans Otto Peitgen, Xavier Pennec, Reza Razavi, Daniel Rueckert, Alejandro F. Frangi, Kawal Rhode
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2013, 17 (6), pp.632-648. ⟨10.1016/j.media.2013.03.008⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00855928/file/tobon-gomez12a_v2.0.pdf BibTex
titre
Regional myocardial wall thinning at multidetector computed tomography correlates to arrhythmogenic substrate in postinfarction ventricular tachycardia: assessment of structural and electrical substrate
auteur
Yuki Komatsu, Hubert Cochet, Amir Jadidi, Frédéric Sacher, Ashok Shah, Nicolas Derval, Daniel Scherr, Patrizio Pascale, Laurent Roten, Arnaud Denis, Khaled Ramoul, Shinsuke Miyazaki, Matthew Daly, Matthieu Riffaud, Maxime Sermesant, Jatin Relan, Nicholas Ayache, Steven Kim, Michel Montaudon, François Laurent, Mélèze Hocini, Michel Haïssaguerre, Pierre Jaïs
article
Circulation Arrhythmia and Electrophysiology, American Heart Association, 2013, 6 (2), pp.342-350. ⟨10.1161/CIRCEP.112.000191⟩
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BibTex
titre
Preliminary Specificity Study of the Bestel-Clément-Sorine Electromechanical Model of the Heart using Parameter Calibration from Medical Images
auteur
Stéphanie Marchesseau, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Michel Sorine, Kawal Rhode, Simon G. Duckett, Christopher Aldo Rinaldi, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
Journal of mechanical behavior of biomedical materials, Elsevier, 2013, 20, pp.259-271. ⟨10.1016/j.jmbbm.2012.11.021⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813849/file/mbioMarchesseau2012.pdf BibTex
titre
Sparse Multi-Scale Diffeomorphic Registration: the Kernel Bundle Framework
auteur
Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2013, 46 (3), pp.292-308. ⟨10.1007/s10851-012-0409-0⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813868/file/Sommer_JMIV2013.pdf BibTex
titre
Inverse relationship between fractionated electrograms and atrial fibrosis in persistent atrial fibrillation: combined magnetic resonance imaging and high-density mapping
auteur
Amir Jadidi, Hubert Cochet, Ashok Shah, Steven Kim, Edward Duncan, Shinsuke Miyazaki, Maxime Sermesant, Heiko Lehrmann, Matthieu Lederlin, Nick Linton, Andrei Forclaz, Isabelle Nault, Lena Rivard, Matthew Wright, Xingpeng Liu, Daniel Scherr, Stephen Wilton, Laurent Roten, Patrizio Pascale, Nicolas Derval, Frédéric Sacher, Sebastian Knecht, Cornelius Keyl, Mélèze Hocini, Michel Montaudon, François Laurent, Michel Haïssaguerre, Pierre Jaïs
article
Journal of the American College of Cardiology, Elsevier, 2013, 62 (9), pp.802-812. ⟨10.1016/j.jacc.2013.03.081⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00855926/file/93795_1_merged_1363700367.pdf BibTex
titre
3D strain assessment in ultrasound (straus): A synthetic comparison of five tracking methodologies
auteur
Mathieu de Craene, Stéphanie Marchesseau, Brecht Heyde, Hang Gao, M. Alessandrini, Olivier Bernard, Gemma Piella, Antonio Porras, Lennart Tautz, Anja Hennemuth, Adityo Prakosa, Hervé Liebgott, Oudom Somphone, Pascal Allain, S. Makram Ebeid, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Jan d'Hooge, Eric Saloux
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 32 (9), pp.1632 - 1646. ⟨10.1109/TMI.2013.2261823⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00840039/file/TMI-2013-0246.pdf BibTex
titre
LCC-Demons: a robust and accurate symmetric diffeomorphic registration algorithm
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Giovanni Frisoni, Xavier Pennec
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 81 (1), pp.470-483. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.04.114⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00819895/file/Lorenzi-LCC2012.pdf BibTex
titre
Regional Appearance Modeling based on the Clustering of Intensity Profiles
auteur
François Chung, Hervé Delingette
article
Computer Vision and Image Understanding, Elsevier, 2013, 117 (6), pp.705-717. ⟨10.1016/j.cviu.2013.01.011⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813880/file/Chung-CVIU-2013.pdf BibTex
titre
Tumor Growth Parameters Estimation and Source Localization From a Unique Time Point: Application to Low-grade Gliomas
auteur
Islem Rekik, Stéphanie Allassonnière, Olivier Clatz, Ezequiel Geremia, Erin Stretton, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Computer Vision and Image Understanding, Elsevier, 2013, 117 (3), pp.238--249. ⟨10.1016/j.cviu.2012.11.001⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813881/file/Rekik-CVIU-2013.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Decision forests for segmentation of left atrium from 3D MRI
auteur
Jan Margeta, Kristin Mcleod, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
4th International Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart, Sep 2013, Nagoya, Japan
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BibTex
titre
Improving DTI Resolution from a Single Clinical Acquisition: A Statistical Approach using Spatial Prior
auteur
Vikash Gupta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2013 (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.477-484, ⟨10.1007/978-3-642-40760-4_60⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00845927/file/paper504.pdf BibTex
titre
Sparse Scale-Space Decomposition of Volume Changes in Deformations Fields
auteur
Marco Lorenzi, Bjoern Menze, Marc Niethammer, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
Medical Image Computing and Computer Aided Intervention (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.328-335, ⟨10.1007/978-3-642-40763-5_41⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00845758/file/Submission562.pdf BibTex
titre
Bayesian Atlas Estimation for the Variability Analysis of Shape Complexes
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Yulia Worbe, Linda Marrakchi-Kacem, Sophie Lecomte, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
MICCAI 2013 : Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.267-274, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_34⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01188791/file/MICCAI2013_GORI.pdf BibTex
titre
Inter-Operative Trajectory Registration for Endoluminal Video Synchronization: Application to Biopsy Site Re-localization
auteur
Anant S. Vemuri, Stéphane Nicolau, Nicholas Ayache, Jacques Marescaux, Luc Soler
article
International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.372-379, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_47⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00841712/file/anant_miccai13.pdf BibTex
titre
Patch-based Segmentation of Brain Tissues
auteur
Nicolas Cordier, Bjoern Menze, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
MICCAI Challenge on Multimodal Brain Tumor Segmentation, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.6 - 17
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https://hal.inria.fr/hal-00917084/file/Cordier-MICCAI-2013-Challenge.pdf BibTex
titre
Use of Diffusion Tensor Images in Glioma Growth Modeling for Radiotherapy Target Delineation
auteur
Florian Dittmann, Bjoern Menze, Ender Konukoglu, Jan Unkelbach
article
Multimodal Brain Image Analysis, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.63-73, ⟨10.1007/978-3-319-02126-3_7⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00912667/file/MBIA-Florian-13.pdf BibTex
titre
Lattice Boltzmann Method For Fast Patient-Specific Simulation of Liver Tumor Ablation from CT Images
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Hervé Delingette, Saikiran Rapaka, Viorel Mihalef, Puneet Sharma, Ali Kamen, Daniel Carnegie, Emad Boctor, Michael Choti, Dorin Comaniciu, Nicholas Ayache
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.323-330, ⟨10.1007/978-3-642-40760-4_41⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00804147/file/paper.pdf BibTex
titre
Enforcing Monotonous Shape Growth or Shrinkage in Video Segmentation
auteur
Yuliya Tarabalka, Guillaume Charpiat, Ludovic Brucker, Bjoern Menze
article
BMVC - British Machine Vision Conference, Sep 2013, Bristol, United Kingdom
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https://hal.inria.fr/hal-00856634/file/2013_BMVC_TarabalkaEtAl.pdf BibTex
titre
Iterative Closest Curve: a Framework for Curvilinear Structure Registration Application to 2D/3D Coronary Arteries Registration
auteur
Thomas Benseghir, Grégoire Malandain, Régis Vaillant
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.179-186, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_23⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00833196/file/paper974.pdf BibTex
titre
Parallel Transport with Pole Ladder: Application to Deformations of time Series of Images
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
article
GSI2013 - Geometric Science of Information, Aug 2013, Paris, France. pp.68-75, ⟨10.1007/978-3-642-40020-9_6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00819898/file/0069_MarcoLorenzi.pdf BibTex
titre
Random Spatial Structure of Geometric Deformations and Bayesian Nonparametrics
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Susan Holmes
article
GSI - Geometric Science of Information - 2013, Aug 2013, Paris, France. pp.120-127, ⟨10.1007/978-3-642-40020-9_12⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00847185/file/BayesianNonparametricsGeometricDeformationsSeiler2013.pdf BibTex
titre
Bi-invariant means on Lie groups with Cartan-Schouten connections
auteur
Xavier Pennec
article
Geometric Science of Information (GSI 2013), Aug 2013, Paris, France. pp.59-67, ⟨10.1007/978-3-642-40020-9_5⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00846373/file/GSI13_CartanConnections.pdf BibTex
titre
Conversion to MCI in healthy individuals with abnormal CSF Ab42 levels is associated with specific longitudinal morphological changes
auteur
Marco Lorenzi, Martina Bochetta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni Frisoni
article
Alzheimer's Association International Conference 2013, Jul 2013, Boston, United States. pp.P596, ⟨10.1016/j.jalz.2013.05.1189⟩
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BibTex
titre
Multinomial Probabilistic Fiber Representation for Connectivity Driven Clustering
auteur
Birkan Tunç, Alex Smith, Demian Wasserman, Xavier Pennec, William M. Wells, Ragini Verma, Kilian M. Pohl
article
IPMI 2013 - Information Processing in Medical Imaging, Jun 2013, Asilomar, United States. pp.730-741, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_61⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00846431/file/tunc-ipmi-2013.pdf BibTex
titre
Regional Analysis of Left Ventricle Function using a Cardiac-Specific Polyaffine Motion Model
auteur
Kristin Mcleod, Christof Seiler, Nicolas Toussaint, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart 2013 (FIMH), Jun 2013, London, United Kingdom. pp.483-490, ⟨10.1007/978-3-642-38899-6_57⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00840042/file/PolyAffineHeartRegionalAnalysis.pdf BibTex
titre
Image-based motion detection in 4D images and application to respiratory motion suppression
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Julien Guglielmi, Thierry Pourcher, Philippe Franken, Jacques Darcourt
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.792-795, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556597⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00799368/file/Breuilly_ISBI_13.pdf BibTex
titre
Fast Myocardial Motion and Strain Estimation in 3D Cardiac Ultrasound with Sparse Demons
auteur
Oudom Somphone, Mathieu de Craene, Roberto Ardon, Benoit Mory, Pascal Allain, Hang Gao, Jan d'Hooge, Stéphanie Marchesseau, Maxime Sermesant, Eric Saloux
article
International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2013, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1182-1185, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556691⟩
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BibTex
titre
Spatio-Temporal Dimension Reduction of Cardiac Motion for Group-Wise Analysis and Statistical Testing
auteur
Kristin Mcleod, Christof Seiler, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2013, 2013, Nagoya, Japan. pp.501-508, ⟨10.1007/978-3-642-40763-5_62⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00840041/file/MICCAI_mcleod_2013.pdf BibTex
titre
Towards joint morphometry of white matter tracts and gray matter surfaces
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Yulia Worbe, Linda Marrakchi-Kacem, Sophie Lecomte, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
Human Brain Mapping, 2013, Seattle, United States
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https://hal.inria.fr/hal-00816138/file/HBM_2013.pdf BibTex
titre
Spatially Adaptive Random Forest
auteur
Ezequiel Geremia, Bjoern Menze, Nicholas Ayache
article
2013 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2013, San Francisco, CA, United States. pp.1332-35, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556781⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00840035/file/Geremia_ISBI_2013.pdf BibTex
titre
Importance of patient DTI's to accurately model glioma growth using the reaction diffusion equation
auteur
Erin Stretton, Ezequiel Geremia, Bjoern Menze, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
2013 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2013, San Francisco, CA, United States. pp.1130-32
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https://hal.inria.fr/hal-00840036/file/Stretton_ISBI_2013.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Statistical Shape Analysis of Surfaces in Medical Images Applied to the Tetralogy of Fallot Heart
auteur
Kristin Mcleod, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Giacomo Pongiglione, Xavier Pennec
article
Frederic Cazals and Pierre Kornprobst. Modeling in Computational Biology and Biomedicine, Springer, pp.165-191, 2013, Lectures Notes in Mathematical and Computational Biology, 978-3-642-31207-6. ⟨10.1007/978-3-642-31208-3_5⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813850/file/McLeod_Pennec_CBB.pdf BibTex
titre
Classification Forests for Semantic Segmentation of Brain Lesions in Multi-channel MRI
auteur
Ezequiel Geremia, Darko Zikic, Olivier Clatz, Bjoern Menze, Ben Glocker, Ender Konukoglu, Jamie Shotton, O. M. Thomas, S. J. Price, Tilak Das, Raj Jena, Nicholas Ayache, Antonio Criminisi
article
Criminisi, Antonio and Shotton, J. Decision Forests for Computer Vision and Medical Image Analysis, Springer London, pp.245-260, 2013, Advances in Computer Vision and Pattern Recognition, 978-1-4471-4928-6. ⟨10.1007/978-1-4471-4929-3_17⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00931809/file/bookDecisionForests_Chapter.pdf BibTex

Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Proceedings of the MICCAI Challenge on Multimodal Brain Tumor Image Segmentation (BRATS) 2013
auteur
Bjoern Menze, Mauricio Reyes, Andras Jakab, Elisabeth Gerstner, Justin Kirby, Keyvan Farahani
article
Bjoern Menze and Mauricio Reyes and Andras Jakab and Elisabeth Gerstner and Justin Kirby and Keyvan Farahani. MICCAI Challenge on Multimodal Brain Tumor Image Segmentation (BRATS), Sep 2013, Nagoya, Japan. MICCAI, pp.57, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00912934/file/proc_brats_2013.pdf BibTex
titre
Proceedings of the Fourth International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Biological Shape Variability Modeling (MFCA 2013), Nagoya, Japan
auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Thomas Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads and Fletcher, Tom P. and Durrleman, Stanley and Sommer, Stefan. Inria, pp.132, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00873631/file/MFCA2013_Proceedings.pdf BibTex

Mémoire d'étudiant

titre
Defining a mean on Lie group
auteur
Nina Miolane
article
Medical Imaging. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00938320/file/MiolaneMasterThesis.pdf BibTex

Autre publication

titre
Mathematical Methods for Medical Imaging
auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen
article
2013, ⟨10.1007/s11263-013-0650-z⟩
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BibTex
titre
Editorial for the MEDIA special issue on MICCAI 2012
auteur
Hervé Delingette, Polina Golland, Kensaku Mori
article
2013, pp.711
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https://hal.inria.fr/hal-00848523/file/Editorial_for_the_MEDIA_Special_Issue_on_MICCAI_2012-final.pdf BibTex

Ouvrage (y compris édition critique et traduction)

titre
Medical Computer Vision: Recognition techniques and applications in medical imaging. Proceedings of the MICCAI 2012 Workshop on Medical Computer Vision (MCV 2012)
auteur
Bjoern Menze, Georg Langs, Le Lu, Albert Montillo, Zhuowen Tu, Antonio Criminisi
article
Springer, 7766, pp.294, 2013, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-642-36619-2. ⟨10.1007/978-3-642-36620-8⟩
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BibTex

Rapport

titre
Deliverable D10.4.2
auteur
Hugo Talbot, Federico Spadoni, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, Hervé Delingette
article
[Research Report] 2013, pp.22
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https://hal.inria.fr/hal-00918211/file/euHeart_Deliverable_10-4-2.pdf BibTex

Thèse

titre
Small animal 4D SPECT imaging : assessment of respiratory motion and iodide biodistribution
auteur
Marine Breuilly
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. English. ⟨NNT : 2013NICE4100⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00908962/file/2013NICE4100.pdf BibTex
titre
Reduced-order statistical models of cardiac growth, motion and blood flow : application to the tetralogy of Fallot heart
auteur
Kristin Mcleod
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. English. ⟨NNT : 2013NICE4091⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00942556/file/2013NICE4091.pdf BibTex
titre
Spatial random forests for brain lesions segmentation in MRIs and model-based tumor cell extrapolation
auteur
Ezequiel Geremia
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. English. ⟨NNT : 2013NICE4007⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00838795/file/2013NICE4007.pdf BibTex
titre
Simulation de modèles personnalisés du coeur pour la prédiction de thérapies cardiaques
auteur
Stephanie Marchesseau
article
Mathématiques générales [math.GM]. Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2013. Français. ⟨NNT : 2012ENMP0082⟩
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00820082/file/2012ENMP0082.pdf BibTex
titre
Analysis and simulation of multimodal cardiac images to study the heart function
auteur
Adityo Prakosa
article
Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. English. ⟨NNT : 2013NICE4003⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00837857/file/2013NICE4003.pdf BibTex

2012

Article dans une revue

titre
Human Atlas of the Cardiac Fiber Architecture: Study on a Healthy Population
auteur
H. Lombaert, J.-M. Peyrat, P. Croisille, S. Rapacchi, L. Fanton, F. Cheriet, P. Clarysse, I. Magnin, H. Delingette, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2012, 31 (7), pp.1436-1447. ⟨10.1109/TMI.2012.2192743⟩
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BibTex
titre
Personalization of Cardiac Motion and Contractility from Images using Variational Data Assimilation
auteur
Hervé Delingette, Florence Billet, Ken C.L. Wong, Maxime Sermesant, Kawal Rhode, Matt Ginks, C. Aldo Rinaldi, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2012, 59 (1), pp.20-24. ⟨10.1109/TBME.2011.2160347⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616183/file/Delingette-TBME-2011_1_.pdf BibTex
titre
Patient-Specific Electromechanical Models of the Heart for Prediction of the Acute Effects of Pacing in CRT: a First Validation
auteur
Maxime Sermesant, Radomir Chabiniok, Phani Chinchapatnam, Tommaso Mansi, Florence Billet, Philippe Moireau, Jean-Marc Peyrat, Ken C.L. Wong, Jatin Relan, Kawal Rhode, Matt Ginks, Pier Lambiase, Hervé Delingette, Michel Sorine, C. Aldo Rinaldi, Dominique Chapelle, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16 (1), pp.201-215. ⟨10.1016/j.media.2011.07.003⟩
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BibTex
titre
Comparison of the endocranial ontogenies between chimpanzees and bonobos via temporal regression and spatiotemporal registration.
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
article
Journal of Human Evolution, Elsevier, 2012, 62 (1), pp.74-88. ⟨10.1016/j.jhevol.2011.10.004⟩
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BibTex
titre
Construction of 3D MR image-based computer models of pathologic hearts, augmented with histology and optical fluorescence imaging to characterize action potential propagation
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Garry Liu, Jatin Relan, Tommaso Mansi, Alan Soong, Jean-Marc Peyrat, Michael Truong, P. Fefer, Elliot R. Mcveigh, Hervé Delingette, A.J. Dick, Nicholas Ayache, G.A Wright
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16 (2), pp.505-523
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https://hal.inria.fr/hal-00813859/file/MPop_MedIA2012preprint.pdf BibTex
titre
Capturing the Multiscale Anatomical Shape Variability with Polyaffine Transformation Trees
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16 (7), pp.1371-1384. ⟨10.1016/j.media.2012.05.011⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813866/file/SeilerPolyaffineTransformationTreesMedIA2012.pdf BibTex
titre
Software for Automated Classification of probe-based Confocal Laser Endomicroscopy Videos of Colorectal Polyps
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna M. Buchner, Murli Krishna, Nicholas Ayache, Michael B. Wallace
article
World Journal of Gastroenterology, Baishideng Publishing Group Co. Limited, 2012, pp.5560-5569
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https://hal.inria.fr/hal-00813813/file/ANDRE-WGJ-2012-Submitted.pdf BibTex
titre
Radiotherapy and radiology: joint efforts for modern radiation planning and practice
auteur
Juliette Thariat, Pierre-Yves Marcy, A. Lacout, Liliane Ramus, T. Girinsky, Y. Pointreau, Grégoire Malandain
article
Diagnostic and Interventional Imaging, Elsevier, 2012, 93 (5), pp.342-350. ⟨10.1016/j.diii.2012.02.004⟩
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BibTex
titre
Fast Parameter Calibration of a Cardiac Electromechanical Model from Medical Images based on the Unscented Transform
auteur
Stéphanie Marchesseau, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache
article
Biomechanics and Modeling in Mechanobiology, Springer Verlag, 2012, pp.1-17. ⟨10.1007/s10237-012-0446-z⟩
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BibTex
titre
Structural brain features of borderline personality and bipolar disorders
auteur
Roberta Rossi, Michela Pievani, Marco Lorenzi, Marina Boccardi, Rossella Beneduce, Stefano Bignotti, Genoveffa Borsci, Maria Cotelli, Panteleimon Giannakopoulos, Laura R. Magni, Luciana Rillosi, Sandra Rosini, Giuseppe Rossi, Giovanni B. Frisoni
article
Psychiatry Research: Neuroimaging, Elsevier, 2012, 12, pp.83-91
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BibTex
titre
Using spatial prior knowledge in the spectral fitting of MRS images
auteur
B. Michael Kelm, Frederik O. Kaster, A. Henning, Marc-André Weber, P. Bachert, P. Boesiger, Fred A. Hamprecht, Bjoern H. Menze
article
NMR in Biomedicine, Wiley, 2012, 25 (1), pp.1-13. ⟨10.1002/nbm.1704⟩
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BibTex

Communication dans un congrès

titre
Disentangling the normal aging from the pathological Alzheimer's disease progression on structural MR images
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni
article
5th Clinical Trials in Alzheimer's Disease (CTAD'12), Oct 2012, Monte Carlo, Monaco
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BibTex
titre
Fast Anatomical Structure Localization Using Top-down Image Patch Regression
auteur
René Donner, Bjoern Menze, Horst Bischof, Georg Langs
article
MICCAI Workshop on Medical Computer Vision (MCV), Oct 2012, Nice, France. pp.133-141, ⟨10.1007/978-3-642-36620-8_14⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00912929/file/donner_12_fast.pdf BibTex
titre
Oblique Random Forests for 3-D Vessel Detection Using Steerable Filters and Orthogonal Subspace Filtering
auteur
Matthias Schneider, Sven Hirsch, Gabor Szekely, Bruno Weber, Bjoern Menze
article
MICCAI Workshop on Medical Computer Vision (MCV), Oct 2012, Nice, France. pp.142-154, ⟨10.1007/978-3-642-36620-8_15⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00912932/file/Schneider2013.pdf BibTex
titre
Towards Real-Time Computation of Cardiac Electrophysiology for Training Simulator
auteur
Hugo Talbot, Christian Duriez, Hadrien Courtecuisse, Jatin Relan, Maxime Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
Statistical Atlases and Computational Models of the Heart - STACOM 2012 in the 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France
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https://hal.inria.fr/hal-00750835/file/SimulationOfCardiacAblation-STACOM2012.pdf BibTex
titre
Current-based 4D shape analysis for the mechanical personalization of heart models
auteur
Loic Le Folgoc, Hervé Delingette, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
MCV - MICCAI Workshop on Medical Computer Vision - 2012, Menze, Bjoern and Langs, Georg and Montillo, Albert and Tu, Zhuowen and Criminisi, Antonio, Oct 2012, Nice, France. pp.283-292, ⟨10.1007/978-3-642-36620-8_28⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00746740/file/LL_MCV2012.pdf BibTex
titre
Strain-Based Regional Nonlinear Cardiac Material Properties Estimation From Medical Images
auteur
Ken C. L. Wong, Jatin Relan, Linwei Wang, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Pengcheng Shi
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2012 (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. pp.617-624, ⟨10.1007/978-3-642-33415-3_76⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813874/file/KenMICCAI2012.pdf BibTex
titre
Topology preserving atlas construction from shape data without correspondence using sparse parameters.
auteur
Stanley Durrleman, Marcel Prastawa, Julie R Korenberg, Sarang Joshi, Alain Trouvé, Guido Gerig
article
MICCAI - Medical Image Computing And Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.223-230, ⟨10.1007/978-3-642-33454-2_28⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00818415/file/paper824.pdf BibTex
titre
Analysis of longitudinal shape variability via subject specific growth modeling.
auteur
James Fishbaugh, Marcel Prastawa, Stanley Durrleman, Joseph Piven, Guido Gerig
article
MICCAI - Medical Image Computing And Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.731-738, ⟨10.1007/978-3-642-33415-3_90⟩
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BibTex
titre
Interactive Electromechanical Model of the Heart for Patient-Specific Therapy Planning and Training using SOFA
auteur
Hugo Talbot, Stéphanie Marchesseau, Christian Duriez, Hadrien Courtecuisse, Jatin Relan, Maxime Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
VPH 2012, Sep 2012, Londres, United Kingdom
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https://hal.inria.fr/hal-00751537/file/VPH2012.pdf BibTex
titre
Differentiating pathological brain atrophy from normal aging: a promising diagnostic tool for Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni
article
2nd Virtual Physiological Human European Conference (VPH2012), Sep 2012, London, United Kingdom
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BibTex
titre
Which Reorientation Framework for the Atlas-Based Comparison of Motion from Cardiac Image Sequences?
auteur
Nicolas Duchateau, Mathieu de Craene, Xavier Pennec, Beatriz Merino, Marta Sitges, Bart Bijnens
article
STIA 2012 (Spatio-Temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Sep 2012, Nice, France. pp.25-37, ⟨10.1007/978-3-642-33555-6_3⟩
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BibTex
titre
Towards higher resolution analysis of Clinical Brain Diffusion Images
auteur
Vikash Gupta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
1st International Symposium on Deep Brain Connectomics, Sep 2012, Clermon-Ferrand, France
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BibTex
titre
Modeling the longitudinal atrophy in healthy subject at risk for Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni B. Frisoni
article
Alzheimer's Association International Conference 2012, Jul 2012, Vancouver, Canada. pp.P340, ⟨10.1016/j.jalz.2012.05.937⟩
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BibTex
titre
Spatio-temporal model of atrophy progression in healthy subjects at risk for Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni B. Frisoni
article
Alzheimer's Association International Conference 2012, Jul 2012, Vancouver, Canada. pp.P340-P341, ⟨10.1016/j.jalz.2012.05.938⟩
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BibTex
titre
Longitudinal Growth Modeling of Discrete-Time Functions with Application to DTI Tract Evolution in Early Neurodevelopment
auteur
Anuja Sharma, Stanley Durrleman, John Gilmore, Guido Gerig
article
ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelone, Spain. pp.1397-1399, ⟨10.1109/ISBI.2012.6235829⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00818411/file/Sharma_ISBI2012.pdf BibTex
titre
Dynamic Patient-specific Modeling of Ischemic Stroke Lesion Evolution: From Presentation to Final Damage using Diffusion, Perfusion and T2 MR imaging
auteur
Islem Rekik, Stéphanie Allassonniere, Carpenter Trevor, Joanna Wardlaw, Stanley Durrleman
article
XXI European Stroke Conference, May 2012, Lisbon, Portugal
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titre
4D spatio-temporal perfusion-diffusion evolution scenarios estimation in acute-subacute ischemic stroke
auteur
Islem Rekik, Stéphanie Allassonniere, Stanley Durrleman, Carpenter Trevor, Joanna Wardlaw
article
ISMRM - International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2012, Melbourne, Australia
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titre
Prise en compte du mouvement respiratoire du petit animal pour la reconstruction 3D TEMP synchronisée : application aux métastases péritonéales
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe Franken
article
50ème Colloque de Médecine Nucléaire de Langue Française, Apr 2012, Montpellier, France. pp.188-189, ⟨10.1016/j.mednuc.2012.02.108⟩
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titre
A framework for longitudinal data analysis via shape regression
auteur
James Fishbaugh, Stanley Durrleman, Joseph Piven, Guido Gerig
article
SPIE - Medical Imaging 2012: Image Processing, Feb 2012, San Diego, United States. ⟨10.1117/12.911721⟩
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titre
Simulated breath-hold reconstruction in micro-SPECT: application to peritoneal metastases expressing NIS as reporter gene
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe Franken
article
MIBO - second Molecular Imaging in Biology and Oncology workshop - 2012, Jan 2012, Nice, France
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titre
Sparsity and Scale: Compact Representations of Deformation for Diffeomorphic Registration
auteur
Stefan Sommer, Mads Nielsen, Xavier Pennec
article
IEEE Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis (MMBIA 2012), Jan 2012, Breckenridge, Colorado, United States. ⟨10.1109/MMBIA.2012.6164753⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00641357/file/Sommer.mmbia12.pdf BibTex
titre
A Near-Incompressible Poly-Affine Motion Model for Cardiac Function Analysis
auteur
Kristin Mcleod, Christof Seiler, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function + a Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge (STACOM+CESC'12), 2012, Nice, France. pp.288-297, ⟨10.1007/978-3-642-36961-2_33⟩
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titre
Probabilistic Flux Analysis of Cerebral Longitudinal Atrophy
auteur
Marco Lorenzi, Giovanni B. Frisoni, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
MICCAI workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders (NIBAD'12), 2012, Nice, France. pp.256-265
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https://hal.inria.fr/hal-00813846/file/Asclepios-Lorenzi-FluxAnalysis-atrophy-Challenge.pdf BibTex
titre
Predicting the Location of Glioma Recurrence After a Resection Surgery
auteur
Erin Stretton, Emmanuel Mandonnet, Ezequiel Geremia, Bjoern H. Menze, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Proceedings of 2nd International MICCAI Workshop on Spatiotemporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data (STIA'12), 2012, Nice, France. ⟨10.1007/978-3-642-33555-6_10⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813870/file/Miccai2012_Workshop_ErinStretton-Submit-1.pdf BibTex
titre
Evaluation of iLogDemons Algorithm for Cardiac Motion Tracking in Synthetic Ultrasound Sequence
auteur
Adityo Prakosa, Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Imaging and Modelling Challenge (STACOM12), 2012, Nice, France. pp.178-187, ⟨10.1007/978-3-642-36961-2_21⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813860/file/PrakosaSTACOM12_1_.pdf BibTex
titre
Simultaneous Multiscale Polyaffine Registration by Incorporating Deformation Statistics
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2012, Nice, France. pp.130--137, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_17⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813867/file/SeilerMultiscaleGroupwisePolyaffineRegistrationMICCAI2012.pdf BibTex
titre
Spatial Decision Forests for Glioma Segmentation in Multi-Channel MR Images
auteur
Ezequiel Geremia, Bjoern H. Menze, Nicholas Ayache
article
MICCAI Challenge on Multimodal Brain Tumor Segmentation, 2012, Nice, France
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BibTex
titre
Population-Based Design of Mandibular Plates Based on Bone Quality and Morphology
auteur
H. Bou-Sleiman, Christof Seiler, T. Iizuka, L. Nolte, Mauricio Reyes
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2012 (MICCAI), 2012, Nice, France. pp.66--73, ⟨10.1007/978-3-642-33415-3_9⟩
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titre
Groupwise Spectral Log-Demons Framework for Atlas Construction
auteur
Hervé Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Jean-Marc Peyrat, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
article
Medical Computer Vision (MCV'12) MICCAI workshop, 2012, Nice, France. pp.11-19, ⟨10.1007/978-3-642-36620-8_2⟩
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titre
Spectral Demons - Image Registration via Global Spectral Correspondence
auteur
Hervé Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
article
Computer Vision - ECCV 2012, 2012, Florence, Italy. pp.30-44, ⟨10.1007/978-3-642-33709-3_3⟩
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titre
Disentangling the normal aging from the pathological Alzheimer's disease progression on cross-sectional structural MR images
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni Frisoni
article
MICCAI workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders (NIBAD'12), 2012, Nice, France. pp.145-154
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https://hal.inria.fr/hal-00813836/file/Lorenzi-LongProjection-NIBAD12.pdf BibTex
titre
Regional flux analysis of longitudinal atrophy in Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2012 (MICCAI), 2012, Nice, France. pp.739--746, ⟨10.1007/978-3-642-33415-3_91⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813837/file/Lorenzi-MICCAI2012.pdf BibTex
titre
Brain tumor cell density estimation from multi-modal MR images based on a synthetic tumor growth model
auteur
Ezequiel Geremia, Bjoern H. Menze, Marcel Prastawa, Marc-André Weber, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
MICCAI Workshop on Medical Computer Vision, 2012, Nice, France. ⟨10.1007/978-3-642-36620-8_27⟩
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titre
Cardiac Mechanical Parameter Calibration based on the Unscented Transform
auteur
Stéphanie Marchesseau, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Kawal Rhode, S.G. Duckett, C. Aldo Rinaldi, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2012 (MICCAI), 2012, Nice, France. pp.41-48, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_6⟩
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titre
Computational and physical phantom setups for the second cardiac motion analysis challenge (cMAC2)
auteur
Mathieu de Craene, Pascal Allain, Hang Gao, Adityo Prakosa, Stéphanie Marchesseau, Oudom Somphone, Loic Hilpert, Alain Manrique, Hervé Delingette, Sherif Makram-Ebeid, Nicolas Villain, Jan d'Hooge, Maxime Sermesant, Eric Saloux
article
MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Imaging and Modelling Challenge (STACOM12), 2012, Nice, France. pp.125--133, ⟨10.1007/978-3-642-36961-2_15⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00840040/file/preprintCMAC2.pdf BibTex
titre
Glioblastoma growth modeling for radiotherapy target delineation.
auteur
J. Unkelbach, Bjoern H. Menze, A. Motamedi, F. Dittmann, Ender Konukoglu, Nicholas Ayache, H. Shih
article
Image-Guidance and Multimodal Dose Planning in Radiation Therapy, INRIA, 2012, Nice, France. pp.9-16
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Chapitre d'ouvrage

titre
SOFA: A Multi-Model Framework for Interactive Physical Simulation
auteur
François Faure, Christian Duriez, Hervé Delingette, Jérémie Allard, Benjamin Gilles, Stéphanie Marchesseau, Hugo Talbot, Hadrien Courtecuisse, Guillaume Bousquet, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
Yohan Payan. Soft Tissue Biomechanical Modeling for Computer Assisted Surgery, 11, Springer, pp.283-321, 2012, Studies in Mechanobiology, Tissue Engineering and Biomaterials, 978-3-642-29013-8. ⟨10.1007/8415_2012_125⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00681539/file/main.pdf BibTex
titre
Exponential Barycenters of the Canonical Cartan Connection and Invariant Means on Lie Groups
auteur
Xavier Pennec, Vincent Arsigny
article
Frederic Barbaresco and Amit Mishra and Frank Nielsen. Matrix Information Geometry, Springer, pp.123-168, 2012, 978-3-642-30231-2 (Print) / 978-3-642-30232-9 (Online). 〈10.1007/978-3-642-30232-9_7〉
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https://hal.inria.fr/hal-00699361/file/Bi-Invar-Means.pdf BibTex
titre
EP Challenge - STACOM'11: Forward Approaches to Computational Electrophysiology Using MRI-Based Models and In-Vivo CARTO Mapping in Swine Hearts
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Tommaso Mansi, Eugene Crystal, Sudip Ghate, Jatin Relan, Charles Pierre, Yves Coudière, Jennifer Barry, Ilan Lashevsky, Beiping Qiang, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache, Grahama. Wright
article
Camara, Oscar and Konukoglu, Ender and Pop, Mihaela and Rhode, Kawal and Sermesant, Maxime and Young, Alistair. LNCS, 7085, Springer Berlin Heidelberg, pp.1-13, 2012, STACOM 2011 : Statistical Atlases and Computational Models of the Heart. Imaging and Modelling Challenges, 978-3-642-28325-3. ⟨10.1007/978-3-642-28326-0_1⟩
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Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Proceedings of the MICCAI Challenge on Multimodal Brain Tumor Image Segmentation (BRATS) 2012
auteur
Bjoern Menze, Andras Jakab, Stefan Bauer, Mauricio Reyes, Marcel Prastawa, Koen van Leemput
article
Bjoern Menze and Andras Jakab and Mauricio Reyes and Stefan Bauer and Marcel Prastawa and Koen Van Leemput. MICCAI Challenge on Multimodal Brain Tumor Image Segmentation (BRATS), Oct 2012, Nice, France. MICCAI, pp.77, 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00912935/file/BRATS.pdf BibTex
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2012 - Part I
auteur
Nicholas Ayache, Hervé Delingette, Polina Golland, Kensaku Mori
article
Ayache, Nicholas and Delingette, Hervé and Golland, Polina and Mori, Kensaku. 7510, Springer, pp.746, 2012, LNCS, 978-3-642-33415-3. ⟨10.1007/978-3-642-33415-3⟩
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titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2012 - Part II
auteur
Nicholas Ayache, Hervé Delingette, Polina Golland, Kensaku Mori
article
Ayache, Nicholas and Delingette, Hervé and Golland, Polina and Mori, Kensaku. 7511, Springer, pp.674, 2012, LNCS, 978-3-642-33417-7. ⟨10.1007/978-3-642-33418-4⟩
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titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2012 - Part III
auteur
Nicholas Ayache, Hervé Delingette, Polina Golland, Kensaku Mori
article
Ayache, Nicholas and Delingette, Hervé and Golland, Polina and Mori, Kensaku. 7512, Springer, pp.646, 2012, LNCS, 978-3-642-33453-5. ⟨10.1007/978-3-642-33454-2⟩
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titre
Proceedings of Second International Workshop on Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data
auteur
Stanley Durrleman, Fletcher Tom, Guido Gerig, Marc Niethammer
article
S. Durrleman and T. Fletcher and G. Gerig and M. Niethammer. France. 7570, Springer, pp.163, 2012, Lecture Notes in Computer Science (LNCS), 978-3-642-33554-9. ⟨10.1007/978-3-642-33555-6⟩
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Autre publication

titre
Proceedings of the MICCAI 2012 Workshops, Challenges and Tutorials
auteur
Xavier Pennec
article
2012
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BibTex
titre
Cardiac Interventional Guidance using Multimodal Data Processing and Visualisation: medInria as an Interoperability Platform
auteur
Florian Vichot, Hubert Cochet, Benoit Bleuzé, Nicolas Toussaint, Pierre Jaïs, Maxime Sermesant
article
2012
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https://hal.inria.fr/hal-00813873/file/article.pdf BibTex
titre
Comparison of a Classification Software based on Image Retrieval with the Off-Line Diagnosis of Expert Endoscopists for probe-based Confocal Laser Endomicroscopy (pCLE) of Colorectal Polyps
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna M. Buchner, Murli Krishna, Nicholas Ayache, Michael B. Wallace
article
2012
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https://hal.inria.fr/hal-00813812/file/ANDRE-DDW12-Abs1-classification.pdf BibTex
titre
Image-based Semantic Learning Software for Automatic Detection of Discriminative Criteria used for probe-based Confocal Laser Endomicroscopy (pCLE) Diagnosis of Colorectal Polyps
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna M. Buchner, Michael B. Wallace, Nicholas Ayache
article
2012
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https://hal.inria.fr/hal-00813816/file/ANDRE-DDW12-Abs2-semantic6.pdf BibTex

Poster

titre
Joint T1 and brain fiber diffeomorphic registration using the demons
auteur
Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Bertrand Thirion, Pierre Fillard
article
Organization for the Human Brain Mapping, Jun 2012, Beijing, China
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https://hal.inria.fr/hal-00828387/file/ohbm2012.pdf BibTex

Rapport

titre
Evaluation of RFA planning based on biophysical models
auteur
Martin W. Krueger, Jatin Relan, Zhong Chen, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, Gunnar Seemann, Olaf Dössel, Nick Linton, C. Aldo Rinaldi, Reza Razavi, Kawal Rhode, Hervé Delingette
article
[Contract] 2012, pp.48
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Thèse

titre
Deformation-based morphometry of the brain for the development of surrogate markers in Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi
article
Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00844577/file/PhDThesis_1_.pdf BibTex
titre
Trees on Geometrical Deformations to Model the Statistical Variability of Organs in Medical Images
auteur
Christof Seiler
article
Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis; Universität Bern, 2012. English
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00844610/file/Seiler_PhDThesis.pdf BibTex
titre
Curvilinear Analysis and Approximation of Cardiac DTI In-Vivo
auteur
Nicolas Toussaint
article
Medical Imaging. King's College London, 2012. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00846248/file/PhDThesis-NicolasToussaint.pdf BibTex
titre
Personalised Electrophysiological Models of Ventricular Tachycardia for Radio Frequency Ablation Therapy Planning
auteur
Jatin Relan
article
Other. Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2012. English. ⟨NNT : 2012ENMP0042⟩
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00794165/file/2012ENMP0042.pdf BibTex

2011

Article dans une revue

titre
Evaluation of registration methods on thoracic CT: the EMPIRE10 challenge.
auteur
Keelin Murphy, Bram van Ginneken, Joseph Reinhardt, Sven Kabus, Kai Ding, Xiang Deng, Kunlin Cao, Kaifang Du, Gary Christensen, Vincent Garcia, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Ben Glocker, Nikolaos Paragios, Nassir Navab, Vladlena Gorbunova, Jon Sporring, Marleen de Bruijne, Xiao Han, Mattias Heinrich, Julia Schnabel, Mark Jenkinson, Cristian Lorenz, Marc Modat, Jamie Mcclelland, Sébastien Ourselin, Sacha Muenzing, Max Viergever, Dante de Nigris, Louis Collins, Tal Arbel, Marta Peroni, Rui Li, Gregory Sharp, Alexander Schmidt-Richberg, Jan Ehrhardt, René Werner, Dirk Smeets, Dirk Loeckx, Gang Song, Nicholas Tustison, Brian Avants, James Gee, Marius Staring, Stefan Klein, Berend Stoel, Martin Urschler, Manuel Werlberger, Jef Vandemeulebroucke, Simon Rit, David Sarrut, Josien Pluim
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 30 (11), pp.1901-20. ⟨10.1109/TMI.2011.2158349⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00607794/file/05782992.pdf BibTex
titre
Le cœur numérique
auteur
Hervé Delingette, Maxime Sermesant
article
Interstices, INRIA, 2011, ⟨https://interstices.info/jcms/i_61191/le-coeur-numerique⟩
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BibTex
titre
Registration, atlas estimation and variability analysis of white matter fiber bundles modeled as currents.
auteur
Stanley Durrleman, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, 55 (3), pp.1073-90. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.11.056⟩
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BibTex
titre
A nonconservative Lagrangian framework for statistical fluid registration-SAFIRA.
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, James C. Gee, Paul Thompson
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 30 (2), pp.184-202. ⟨10.1109/TMI.2010.2067451⟩
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BibTex
titre
Vers un patient numérique personnalisé pour le diagnostic et la thérapie guidés par l'image [Towards a personalized digital patient for diagnosis and therapy guided by image].
auteur
Nicholas Ayache, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
article
médecine/sciences, EDP Sciences, 2011, 27 (2), pp.208-13. ⟨10.1051/medsci/2011272208⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616192/file/Asclepios-Medecine-sciences2011.pdf BibTex
titre
Personalization of a Cardiac Electrophysiology Model using Optical Mapping and MRI for Prediction of Changes with Pacing
auteur
Jatin Relan, Mihaela Pop, Hervé Delingette, Graham Wright, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 58 (12), pp.3339 - 3349. ⟨10.1109/TBME.2011.2107513⟩
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BibTex
titre
Correspondence Between Simple 3-D MRI-Based Computer Models and In-Vivo EP Measurements in Swine With Chronic Infarctions
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Tommasi Mansi, Eugene Crystal, Sudip Ghate, Jean-Marc Peyrat, Ilan Lashevsky, Beiping Qiang, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache, Graham A. Wright
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 58 (12), pp.3483-3486. ⟨10.1109/TBME.2011.2168395⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813802/file/Mihaela_IeeeTBMEpreprint.pdf BibTex
titre
A Smart Atlas for Endomicroscopy using Automated Video Retrieval
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna M. Buchner, Michael B. Wallace, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2011, 15 (4), pp.460--476. ⟨10.1016/j.media.2011.02.003⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616190/file/ANDRE-MEDIA.pdf BibTex
titre
euHeart: Personalized and integrated cardiac care using patient-specific cardiovascular modelling
auteur
Nic Smith, A. de Vecchi, M. Mccormick, D. Nordsletten, Oscar Camara, Alejandro Frangi, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Jatin Relan, Nicholas Ayache, M.W. Krueger, W. Schulze, Rod Hose, I. Valverde, P. Beerbaum, C. Staicu, M. Siebes, J. Spaan, Peter Hunter, Jürgen Weese, H. Lehmann, Dominique Chapelle, Reza Razavi
article
Interface Focus, Royal Society publishing, 2011, 1 (3), pp.349--364. ⟨10.1098/rsfs.2010.0048⟩
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BibTex
titre
Coupled Personalization of Cardiac Electrophysiology Models for Prediction of Ischaemic Ventricular Tachycardia
auteur
Jatin Relan, Phani Chinchapatnam, Maxime Sermesant, Kawal Rhode, Matt Ginks, Hervé Delingette, Aldo C. Rinaldi, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
Interface Focus, Royal Society publishing, 2011, 1 (3), pp.396--407. ⟨10.1098/rsfs.2010.0041⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616188/file/RSFS-2010-0041_Manuscript_1_.pdf BibTex
titre
DENTALMAPS: Automatic Dental Delineation for Radiotherapy Planning in Head and Neck Cancer
auteur
Juliette Thariat, Liliane Ramus, Philippe Maingon, Guillaume Odin, Vincent Grégoire, Vincent Darcourt, Pierre-Yves Marcy, Nicolas Guevara, Marie-Helene Orlanducci, Serge Marcie, Gilles Poissonnet, Alex Bozec, Olivier Dassonville, François Demard, Laurent Castillo, José Santini, Grégoire Malandain
article
International Journal of Radiation Oncology - Biology - Physics, Elsevier, 2011, 82 (5), pp.1858-1865
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BibTex
titre
A Multi-Front Eikonal Model of Cardiac Electrophysiology for Interactive Simulation of Radio-Frequency Ablation
auteur
Erik Pernod, Maxime Sermesant, Ender Konukoglu, Jatin Relan, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Computers and Graphics, Elsevier, 2011, 35, pp.431--440
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00616180/file/CG-VCBM-2011.pdf BibTex
titre
Effect of memantine on resting state default mode network activity in Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, Alberto Beltramello, Nicola Mercuri, Elisa Canu, Giada Zoccatelli, Francesca Pizzini, Franco Alessandrini, Maria Cotelli, Sandra Rosini, Daniela Costardi, Carlo Caltagirone, Giovanni Frisoni
article
Drugs and Aging, Adis, 2011, 28 (3), pp.205-217
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BibTex
titre
Modeling and Registration for Electrophysiology Procedures Based on Three-Dimensional Imaging
auteur
Kawal Rhode, Maxime Sermesant
article
Current Cardiovascular Imaging Reports, Springer, 2011, 4 (2), pp.116-126. ⟨10.1007/s12410-011-9067-7⟩
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BibTex
titre
Efficient Probabilistic Model Personalization Integrating Uncertainty on Data and Parameters: Application to Eikonal-Diffusion Models in Cardiac Electrophysiology
auteur
Ender Konukoglu, Jatin Relan, Ulas Cilingir, Bjoern H. Menze, Phani Chinchapatnam, Amir Jadidi, Hubert Cochet, Meleze Hocini, Hervé Delingette, Pierre Jaïs, Michel Haïssaguerre, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2011, 107 (1), pp.134-146. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2011.07.002⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00616198/file/KonukogluPBMB2011_1_.pdf BibTex
titre
Inter-Model Consistency and Complementarity: Learning from ex-vivo Imaging and Electrophysiological Data towards an Integrated Understanding of Cardiac Physiology
auteur
Oscar Camara, Maxime Sermesant, P. Lamata, L. Wang, Mihaela Pop, Jatin Relan, Mathieu de Craene, Hervé Delingette, Hong Liu, S. Niederer, A. Pashaei, G. Plank, D. Romero, R. Sebastian, Ken C.L. Wong, H. Zhang, Nicholas Ayache, Alejandro Frangi, P. Shi, Nic Smith, Graham Wright
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2011, Experimental and Computational Model Interactions in Bio-Research: State of the Art, 107 (1), pp.122-133. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2011.07.007⟩
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BibTex
titre
Le coeur numérique personnalisé
auteur
Nicholas Ayache, Hervé Delingette, Maxime Sermesant
article
Bulletin de l'Académie Nationale de Médecine, Elsevier Masson, 2011, 195 (8)
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00813793/file/Ayache-et-al-Academie-Medecine-24Oct2011.pdf BibTex
titre
A Statistical Model for Quantification and Prediction of Cardiac Remodelling: Application to Tetralogy of Fallot
auteur
Tommaso Mansi, Ingmar Voigt, Benedetta Leonardi, Xavier Pennec, Stanley Durrleman, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Andrew Taylor, Younes Boudjemline, Giacomo Pongiglione, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 30 (9), pp.1605 - 1616. ⟨10.1109/TMI.2011.2135375⟩
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titre
Subject-specific knee joint model: Design of an experiment to validate a multi-body finite element model
auteur
C. Öhman, D.M. Espino, Tobias Heimann, M. Baleani, Hervé Delingette, Marco Viceconti
article
Visual Computer, Springer Verlag, 2011, 27, pp.153--159. ⟨10.1007/s00371-010-0537-8⟩
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titre
Comparison of statistical models performance in case of segmentation using a small amount of training datasets
auteur
François Chung, Jérôme Schmid, Nadia Magnenat-Thalmann, Hervé Delingette
article
Visual Computer, Springer Verlag, 2011, 27 (2), pp.141-151. ⟨10.1007/s00371-010-0536-9⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616199/file/comparison_of_statistical_models_performance_in_case_of_segmentation_using_a_small_amount_of_training_datasets.pdf BibTex
titre
iLogDemons: A Demons-Based Registration Algorithm for Tracking Incompressible Elastic Biological Tissues
auteur
Tommaso Mansi, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2011, 92 (1), pp.92-111. ⟨10.1007/s11263-010-0405-z⟩
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titre
Detecting stable distributed patterns of brain activation using Gini contrast
auteur
Georg Langs, Bjoern H. Menze, Danial Lashkari, Polina Golland
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, 56, pp.497-507. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.07.074⟩
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titre
Spatial Decision Forests for MS Lesion Segmentation in Multi-Channel Magnetic Resonance Images
auteur
Ezequiel Geremia, Olivier Clatz, Bjoern H. Menze, Ender Konukoglu, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, 57 (2), pp.378-390. ⟨10.1016/j.neuroimage.2011.03.080⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616194/file/Geremia-MS-NeuroImage-2011.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Myocardial Scar Modeling from Delayed Enhancement MRI: Usefulness for the Guidance of Ventricular Tachycardia Mapping and Ablation
auteur
Hubert Cochet, A. S. Jadidi, O. Corneloup, M. Lederlin, Jatin Relan, M. Montaudon, Maxime Sermesant, Pierre Jaïs, F. Laurent
article
Radiological Society of North America, RSNA'11, Nov 2011, Chicago, United States
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titre
An Incompressible Log-Domain Demons Algorithm for Tracking Heart Tissue
auteur
Kristin Mcleod, Adityo Prakosa, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function (STACOM11), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.55-67, ⟨10.1007/978-3-642-28326-0_6⟩
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titre
Layered spatio-temporal forests for left ventricle segmentation from 4D cardiac MRI data
auteur
Jan Margeta, Ezequiel Geremia, Antonio Criminisi, Nicholas Ayache
article
STACOM Workshop at MICCAI 2011, Oscar Camara and Ender Konukoglu and Mihaela Pop and Kawal Rhode and Maxime Sermesant and Alistair Young, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.109-119, ⟨10.1007/978-3-642-28326-0_11⟩
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titre
Mapping the effects of Ab142 levels on the longitudinal changes in healthy aging: hierarchical modeling based on stationary velocity filds.
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Giovanni Frisoni, Xavier Pennec
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.663-670, ⟨10.1007/978-3-642-23629-7_81⟩
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titre
Joint T1 and Brain Fiber Diffeomorphic Registration Using the Demons
auteur
Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Pierre Fillard
article
Multimodal Brain Image Analysis First International Workshop, MBIA 2011, Held in Conjunction with MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.10-18, ⟨10.1007/978-3-642-24446-9_2⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00627971/file/Joint_T1_and_Brain_Fiber_Diffeomorphic_Registration_Using_the_Demons_.pdf BibTex
titre
Geodesics, Parallel Transport & One-parameter Subgroups for Diffeomorphic Image Registration
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
article
Proceedings of the Third International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.64-74
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https://hal.inria.fr/inria-00623919/file/MFCA11_2_3.pdf BibTex
titre
Schilds Ladder for the parallel transport of deformations in time series of images
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. pp.463--474, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_38⟩
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titre
A Generative Approach for Image-Based Modeling of Tumor Growth
auteur
Bjoern H. Menze, Koen van Leemput, Antti Honkela, Ender Konukoglu, Marc-André Weber, Nicholas Ayache, Polina Golland
article
IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. pp.735-747, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_60⟩
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titre
A Multi-scale Kernel Bundle for LDDMM: Towards Sparse Deformation Description Across Space and Scales
auteur
Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
article
IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. pp.624--635, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_51⟩
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titre
Monitoring the brain's longitudinal changes in clinical trials for Alzheimers disease: a robust and reliable non-rigid registration framework
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Giovanni Frisoni
article
Alzheimer's Association 2011 International Conference on Alzheimer's Disease (AAICAD), Jul 2011, Paris, France. pp.S376, ⟨10.1016/j.jalz.2011.05.1082⟩
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titre
A federated system for sharing and reuse of images and image processing tools in neuroimaging
auteur
Bernard Gibaud, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Franck Michel, Bacem Wali, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Pascal Girard, Alban Gaignard, Diane Lingrand, Johan Montagnat, Javier Rojas Balderrama, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, David Godard, Gilles Kassel, Mélanie Pélégrini-Issac
article
Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS'11), Jun 2011, Berlin, Germany
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titre
NeuroLOG: A framework for the sharing and reuse of distributed tools and data in neuroimaging
auteur
Michel Dojat, Mélanie Pélégrini-Issac, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Alban Gaignard, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Franck Michel, Johan Montagnat, Xavier Pennec, Javier Balderrama, Bacem Wali
article
Organization for Human Brain Mapping (HBM'11), Jun 2011, Quebec, Canada
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titre
Kernel Bundle EPDiff: Evolution Equations for Multi-Scale Diffeomorphic Image Registration
auteur
Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
article
Scale Space and Variational Methods in Computer Vision, May 2011, Ein-Gedi, Israel. pp.677-688, ⟨10.1007/978-3-642-24785-9_57⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00644965/file/Sommer.SSVM11.pdf BibTex
titre
A 3D MRI-Based Cardiac Computer Model to Study Arrhythmia and Its In-vivo Experimental Validation
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Jean-Marc Peyrat, Eugene Crystal, Sudip Ghate, Tommaso Mansi, Ilan Lashevsky, Beiping Qiang, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache, Graham Wright
article
FIMH 2011- Sixth International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart., May 2011, New-York, United States. pp.195-205, ⟨10.1007/978-3-642-21028-0_25⟩
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titre
Statistical Analysis of the Human Cardiac Fiber Architecture from DT-MRI
auteur
Hervé Lombaert, Jean-Marc Peyrat, Pierre Croisille, Stanislas Rapacchi, Laurent Fanton, Patrick Clarysse, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
FIMH - Sixth International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart - 2011, May 2011, New York City, NY, United States. pp.171--179, ⟨10.1007/978-3-642-21028-0_22⟩
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titre
De l'imagerie médicale à la modélisation numérique personnalisée du corps humain
auteur
Hervé Delingette
article
10e colloque national en calcul des structures, May 2011, Giens, France. pp.Clé USB
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00623148/file/ar_2QLW20Q3.pdf BibTex
titre
Human Statistical Atlas of Cardiac Fiber Architecture from DT-MRI
auteur
Hervé Lombaert, Jean-Marc Peyrat, Stanislas Rapacchi, Laurent Fanton, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Pierre Croisille
article
Proceedings of International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM) 2011, May 2011, Montréal, Québec, Canada. pp.280
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titre
Ventricular Scar At Cardiac CT Correlates To Critical Isthmuses Of Ventricular Tachycardia Circuits And Sites Of Slow Conduction During Sinus Rhythm - Evidence For Clinical Use Of CT Integration Into 3D Mapping Systems
auteur
Hubert Cochet, Amir S. Jadidi, Frédéric Sacher, Nicolas Derval, Maxime Sermesant, Jatin Relan, Steven J. Kim, Pierre Bordachar, Philippe Ritter, Meleze Hocini, Michel Montaudon, François Laurent, Nicholas Ayache, Michel Haïssaguerre, Pierre Jais
article
Heart Rhythm Society '11, May 2011, San Francisco, CA, United States
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titre
Ventricular Scar imaging at MRI Correlates to Critical Isthmuses of Ventricular Tachycardia Circuits and Sites of Slow Conduction during Sinus Rhythm - Utility of integrating MR-data into 3D Mapping Systems
auteur
Amir S. Jadidi, Hubert Cochet, Frédéric Sacher, Steven J. Kim, Maxime Sermesant, Jatin Relan, Nicolas Derval, Shinsuke Miyazaki, Ashok Shah, Daniel Scherr, Steven B. Wilton, Patrizio Pascale, Laurent Roten, Michala Pederson, Sebastien Knecht, Pierre Bordachar, Philippe Ritter, Meleze Hocini, Michel Montaudon, François Laurent, Nicholas Ayache, Michel Haïssaguerre, Pierre Jais
article
Heart Rhythm Society '11, May 2011, San Francisco, CA, United States
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titre
Which parallel transport for the statistical analysis of longitudinal deformations?
auteur
Xavier Pennec, Marco Lorenzi
article
Colloque GRETSI '11, 2011, Bordeaux, France
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titre
Variability of the Human Cardiac Laminar Structure
auteur
Herve Lombaert, Jean-Marc Peyrat, Laurent Fanton, Farida Cheriet, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Patrick Clarysse, Isabelle Magnin, Pierre Croisille
article
Proceedings of STACOM Workshop at MICCAI 2011, 2011, Toronto, Canada
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titre
Statistical Atlas of Human Cardiac Fibers: Comparison with Abnormal Hearts
auteur
Herve Lombaert, Jean-Marc Peyrat, Laurent Fanton, Farida Cheriet, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Patrick Clarysse, Isabelle Magnin, Pierre Croisille
article
Proceedings of STACOM Workshop at MICCAI 2011, 2011, Toronto, Canada
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titre
Personalisation of a 3D Ventricular Electrophysiological Model, Using Endocardial and Epicardial Contact Mapping and MRI
auteur
J. Relan, Maxime Sermesant, H. Delingette, Nicholas Ayache
article
Statistical Atlases and Computational Models of the Heart. Imaging and Modelling Challenges - Second International Workshop, STACOM 2011, Held in Conjunction with MICCAI 2011, 2011, Toronto, Canada. pp.14-22, ⟨10.1007/978-3-642-28326-0_2⟩
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titre
Content-Based Retrieval in Endomicroscopy: Toward an Efficient Smart Atlas for Clinical Diagnosis
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the MICCAI Workshop - Medical Content-based Retrieval for Clinical Decision (MCBR-CDS'11), 2011, Toronto, Canada. pp.12-23
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https://hal.inria.fr/hal-00813791/file/ANDRE-MCBRCDS11.pdf BibTex
titre
Mesh-based vs. Image-based Statistical Model of Appearance of the Human Femur: A Preliminary Comparison Study for the Creation of Finite Element Meshes
auteur
S. Bonaretti, Christof Seiler, C. Boichon, P. Büchler, Mauricio Reyes
article
Mesh Processing in Medical Image Analysis Workshop MICCAI, 2011, Toronto, Canada
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BibTex
titre
Complexity of cerebral atrophy evaluation in relapsing-remitting multiple sclerosis context
auteur
Jean-Christophe Souplet, M. Cohen, C. Lebrun, N. Ayache, G. Malandain
article
2011 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2011, Chicago, United States. pp.317-320, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872413⟩
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BibTex
titre
Retrieval evaluation and distance learning from perceived similarity between endomicroscopy videos
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna Buchner, Michael Wallace, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2011, 2011, Toronto, Canada. pp.297-304, ⟨10.1007/978-3-642-23626-6_37⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00598301/file/Barbara_ANDRE_MICCAI11_CameraReadyFinal.pdf https://hal.inria.fr/inria-00598301/file/Barbara_ANDRE_MICCAI11_SupplementaryMaterial.pdf BibTex
titre
Geometry-Aware Multiscale Image Registration Via OBBTree-Based Polyaffine Log-Demons
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes Aguirre
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2011, 2011, Toronto, Canada. pp.631-638, ⟨10.1007/978-3-642-23629-7_77⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616215/file/SeilerOBBTreeMultiscalePolyLogDemonsMICCAI2011.pdf BibTex
titre
Femur Specific Polyaffine Model to Regularize the Log-Domain Demons Registration
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Lucas Ritacco, Mauricio Reyes Aguirre
article
Proceedings of SPIE Medical Imaging '11, 2011, Lake Buena Vista, Floride, United States. Paper 7962-15, ⟨10.1117/12.878316⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616216/file/SeilerFemurPolyaffineLogDemonsSPIE2011.pdf BibTex
titre
Synthetic Echocardiographic Image Sequences for Cardiac Inverse Electro-Kinematic Learning
auteur
Adityo Prakosa, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Eric Saloux, Pascal Allain, Pascal Cathier, Patrick Etyngier, Nicolas Villain, Nicholas Ayache
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), 2011, Toronto, Canada, Canada. pp.500-507, ⟨10.1007/978-3-642-23623-5_63⟩
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Chapitre d'ouvrage

titre
Model-based segmentation
auteur
Tobias Heimann, Hervé Delingette
article
Deserno, Thomas Martin. Biomedical Image Processing, Springer, pp.279-303, 2011, 978-3-642-15815-5. ⟨10.1007/978-3-642-15816-2_11⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616063/file/Delingette-RABIPA-2010_1_.pdf BibTex
titre
A Generative Approach for Image-Based Modeling of Tumor Growth
auteur
Bjoern H. Menze, Koen van Leemput, Ender Konukoglu, Marc-André Weber, Nicholas Ayache, Polina Golland
article
Székely, Gábor and Hahn, Horst K. Information Processing in Medical Imaging, 22, Springer, Heidelberg/Germany, pp.735-747, 2011, LNCS
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https://hal.inria.fr/hal-00813801/file/menze_11_generative.pdf BibTex
titre
Image-based modeling of tumor growth in patients with glioma.
auteur
B H Menze, Erin Stretton, Ender Konukoglu, Nicholas Ayache
article
Garbe, C S and Rannacher, R and Platt, U and Wagner, T. Optimal control in image processing, Springer, Heidelberg/Germany, 2011
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https://hal.inria.fr/hal-00825866/file/menze_11_image-based.pdf BibTex

Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Proceedings of the Third International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads. HAL, pp.200, 2011
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https://hal.inria.fr/hal-00813806/file/MFCA11_Proceedings.pdf BibTex

Autre publication

titre
Toward a structured training system for probe-based Confocal Laser Endomicroscopy (pCLE) on Barrett's Esophagus: a video retrieval approach to estimate diagnosis difficulty
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna M. Buchner, Muhammad Waseem Shahid, Michael B. Wallace, Nicholas Ayache
article
2011
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https://hal.inria.fr/hal-00825867/file/ANDRE_DDW11_Abstract.pdf BibTex

Rapport

titre
Learning Semantic and Visual Similarity for Endomicroscopy Video Retrieval
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna Buchner, Michael Wallace, Nicholas Ayache
article
[Research Report] RR-7722, INRIA. 2011
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https://hal.inria.fr/inria-00618057/file/RR-7722.pdf BibTex
titre
Deliverable D10.4.1
auteur
Hugo Talbot, Federico Spadoni, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, Hervé Delingette
article
[Research Report] 2011, pp.25
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https://hal.inria.fr/hal-00918216/file/euHeart_Deliverable_10-4-1.pdf BibTex
titre
Planning of RadioFrequency Ablation for patients with Ventricular Tachycardia
auteur
J. Relan, H. Delingette, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, M. W. Krueger, W. Schulze, G. Seemann, O. Dössel
article
[Contract] 2011, pp.71
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BibTex
titre
Planning of Radiofrequency Ablation for patients with Atrial Fibrillation
auteur
M. W. Krueger, W. Schulze, G. Seemann, O. Dössel, J. Relan, H. Delingette, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache
article
[Contract] 2011
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BibTex
titre
Model Personalization for AF and VT simulations
auteur
M. W. Krueger, J. Relan, H. Delingette, W. Schulze, G. Seemann, O. Dössel
article
[Contract] 2011, pp.71
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Thèse

titre
Smart atlas for endomicroscopy diagnosis support: a clinical application of content-based image retrieval
auteur
Barbara André
article
Medical Imaging. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2011. English. ⟨NNT : 2011ENMP0032⟩
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00640899/file/Barbara-Andre-Thesis-Manuscript-Final.pdf BibTex
titre
Conception et utilisation d'atlas anatomiques pour la segmentation automatique : application à la radiothérapie des cancers ORL
auteur
Liliane Ramus
article
Imagerie médicale. Université Nice Sophia Antipolis, 2011. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00845098/file/These_Liliane_Ramus_1_.pdf BibTex
titre
Modélisation de l'apparence de régions pour la segmentation d'images basée modèle
auteur
François Chung
article
Medical Imaging. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2011. English. ⟨NNT : 2011ENMP0004⟩
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00575796/file/Phd-Thesis_Francois-Chung.pdf BibTex

2010

Article dans une revue

titre
Combined diffusion imaging and MR spectroscopy in the diagnosis of human prion diseases.
auteur
Damien Galanaud, Stéphane Haïk, Marius George Linguraru, Jean-Philippe Ranjeva, Baptiste Faucheux, Elsa Kaphan, Nicholas Ayache, Jacques Chiras, Patrick Cozzone, Didier Dormont, Jean-Philippe Brandel
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2010, 31 (7), pp.1311-8. ⟨10.3174/ajnr.A2069⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616097/file/Galanaud-et-al-AJNR2010-1.pdf BibTex
titre
Les mathématiques cachées de la médecine
auteur
Grégoire Malandain
article
Interstices, INRIA, 2010, ⟨https://interstices.info/jcms/i_53813/les-mathematiques-cachees-de-la-medecine⟩
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BibTex
titre
Le coeur numérique
auteur
Hervé Delingette, Maxime Sermesant
article
Doc Sciences, Édition du CRDP de l'académie de Versailles, 2010, 13, pp.26-33
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BibTex
titre
Sharing and reusing cardiovascular anatomical models over the Web: a step towards the implementation of the virtual physiological human project
auteur
Daniele Gianni, S. Mckeever, T. Yu, R. Britten, Hervé Delingette, Alejandro Frangi, Peter Hunter, Nic Smith
article
Philos Transact of the Royal Society A Mathematical Physical Engineering Sciences, Royal Society Publisher, 2010, 368, pp.3039--3056. ⟨10.1098/rsta.2010.0025⟩
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BibTex
titre
Extrapolating Glioma Invasion Margin in Brain Magnetic Resonance Images: Suggesting New Irradiation Margins
auteur
Ender Konukoglu, Olivier Clatz, Pierre-Yves Bondiau, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2010, 14 (2), pp.111-125. ⟨http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1361841509001443⟩. ⟨10.1016/j.media.2009.11.005⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616107/file/MEDIA2009_konukoglu_extrapolation.pdf BibTex
titre
Outils de contourage, utilisation et construction d'atlas anatomiques : exemples des cancers de la tete et du cou
auteur
Liliane Ramus, Juliette Thariat, Pierre-Yves Marcy, Yoann Pointreau, Guillaume Bera, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
article
Cancer Radiothérapie, Elsevier Masson, 2010, 14 (3), pp.206-12
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BibTex
titre
Fast porous visco-hyperelastic soft tissue model for surgery simulation: Application to liver surgery
auteur
Stéphanie Marchesseau, T. Heimann, S. Chatelin, R. Willinger, Hervé Delingette
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2010, 103 (2-3), pp.185-196. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2010.09.005⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00593223/file/PBMB-Marchesseau-2010.pdf BibTex
titre
[Longitudinal study of health related quality of life in multiple sclerosis: correlation with MRI parameters]
auteur
M. Cohen, C. Lebrun, D Aufauvre, S. Chanalet, C Filleau-Bertogliatti, W Camu, P Thomas, Grégoire Malandain, P Clavelou
article
Revue Neurologique, Elsevier Masson, 2010, 166 (11), pp.894-900
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BibTex
titre
Spherical Demons: Fast Diffeomorphic Landmark-Free Surface Registration
auteur
Boon Thye Thomas Yeo, Mert Sabuncu, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Bruce Fischl, Polina Golland
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, 29 (3), pp.650--668. ⟨10.1109/TMI.2009.2030797⟩
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BibTex
titre
Image Guided Personalization of Reaction-Diffusion Type Tumor Growth Models Using Modified Anisotropic Eikonal Equations
auteur
Ender Konukoglu, Olivier Clatz, Bjoern H. Menze, Marc-André Weber, Bram Stieltjes, Emmanuel Mandonnet, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, 29 (1), pp.77-95. ⟨10.1109/TMI.2009.2026413⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616100/file/TMI2009_konukoglu_InverseProblem.pdf BibTex
titre
Registration of 4D Cardiac CT Sequences Under Trajectory Constraints With Multichannel Diffeomorphic Demons
auteur
Jean-Marc Peyrat, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Chenyang Xu, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, 29 (7), pp.1351-1368. ⟨10.1109/TMI.2009.2038908⟩
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BibTex
titre
Imaging plant growth in 4D : robust tissue reconstruction and lineaging at cell resolution.
auteur
R. Fernandez, Pradeep Das, V. Mirabet, E. Moscardi, Jan Traas, J.-L. Verdeil, Grégoire Malandain, Christophe Godin
article
Nature Methods, Nature Publishing Group, 2010, pp.547-553
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titre
A New Metric for Detecting Change in Slowly Evolving Brain Tumors: Validation in Meningioma Patients
auteur
Kilian M. Pohl, Ender Konukoglu, Sébastien Novellas, Nicholas Ayache, Andriy Fedorov, Ion-Florin Talos, Alexandra Golby, William M. Wells, Ron Kikinis, Peter Black
article
Neurosurgery, Lippincott, Williams & Wilkins, 2010, 68(1 Suppl Operative), pp.225-33. ⟨10.1227/NEU.0b013e31820783d5⟩
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Communication dans un congrès

titre
Personalisation of a 3D Macroscopic Cardiac Electrophysiology Model for Simulation of Induced Ischemic Ventricular Tachycardia
auteur
Jatin Relan, Maxime Sermesant, Phani Chinchapatnam, Hervé Delingette, Kawal Rhode, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
VPH Conference (VPH2010), Sep 2010, Brussels, Belgium
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titre
Mapping longitudinal changes in the brain affected by Alzheimer's disease
auteur
Marco Lorenzi, G. Frisoni, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
VPH European Conference, Sep 2010, Brussels, Belgium
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titre
A Log-Euclidean Statistical Analysis of DTI Brain Deformations
auteur
Andrew Sweet, Xavier Pennec
article
MICCAI 2010 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2010, Beijing, China
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https://hal.inria.fr/hal-01525407/file/cdmri2010.pdf BibTex
titre
Cardiac motion estimation using a proactive deformable model: evaluation and sensitivity analysis
auteur
Ken C.L. Wong, Florence Billet, Tommaso Mansi, Radomir Chabiniok, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
STACOM - Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function; and CESC'10 -Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge, held in Conjunction with MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. pp.154-163, ⟨10.1007/978-3-642-15835-3_16⟩
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titre
Atlas-Based Reduced Models of Blood Flows for Fast Patient-Specific Simulations
auteur
Kristin Mcleod, Alfonso Caiazzo, Miguel Angel Fernández, Tommaso Mansi, Irene Vignon-Clementel, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Younes Boudjemline, Jean-Frédéric Gerbeau
article
STACOM, Sep 2010, Beijin, China. pp.95-104, ⟨10.1007/978-3-642-15835-3_10⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00517994/file/2010_miccai_lncs.pdf BibTex
titre
Design and use of patient-specific atlases for radiotherapy planning of the head and neck region
auteur
Liliane Ramus, Souha Aouadi, Yoann Pointreau, Guillaume Bera, Yungan Tao, Anne Beaudré, Vincent Grégoire, Grégoire Malandain
article
ESTRO - 29th European Society for Therapeutic Radiology and Oncology, Sep 2010, Barcelona, Spain
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titre
Construction of patient specific atlases from locally most similar anatomical pieces.
auteur
Liliane Ramus, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
article
Med Image Comput Comput Assist Interv (MICCAI), Sep 2010, China. pp.155-162
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00550024/file/RamusMiccai2010.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-00550024/file/inserm-00550024_edited.pdf BibTex
titre
Log-Domain Diffeomorphic Registration of Diffusion Tensor Images
auteur
Andrew Sweet, Xavier Pennec
article
WBIR 2010 - International Workshop on Biomedical Image Registration , Jul 2010, Lübeck, Germany. pp.198-209, ⟨10.1007/978-3-642-14366-3_18⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616163/file/wbir2010.pdf BibTex
titre
Statistical Analysis of the Anatomy: From Digital Patient to Digital Population
auteur
Kristin Mcleod, Tommaso Mansi, Stanley Durrleman, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
article
First VPH Conference (VPH2010), Jul 2010, Brussels, Belgium
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BibTex
titre
Measuring the inter-species variability of endocast growth using shape regression and spatiotemporal registration
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
article
Abstracts of the 79-th annual meeting of the American Assoc. of Physical Anthropologists (AAPA), April 2010, Albuquerque, Jul 2010, Albuquerque, United States. pp.78-79
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titre
Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.
auteur
Franck Michel, Alban Gaignard, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Mélanie Pélégrini-Issac, Xavier Pennec, Javier Rojas Balderrama, Bacem Wali
article
HealthGrid'10, Jun 2010, Paris, France. pp.112-123, ⟨10.3233/978-1-60750-583-9-112⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00512799/file/neurolog_healthgrid_2010.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-00512799/file/inserm-00512799_edited.pdf BibTex
titre
Biophysical Modelling To Predict Acute Hemodynamic Response To Cardiac Resynchronization Therapy In Human
auteur
Aldo C. Rinaldi, P.D. Lambiase, Maxime Sermesant, Phani Chinchapatnam, Kawal Rhode, Simon B. Duckett, Anoop Shetty, Radomir Chabiniok, Tommaso Mansi, Florence Billet, Jean-Marc Peyrat, Hervé Delingette, Philippe Moireau, Michel Sorine, Dominique Chapelle, Nicholas Ayache, Matthew Ginks, Reza Razavi
article
Heart Rhythm 2010 : 31st Annual Scientific Sessions, May 2010, Denver, United States
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titre
Measuring the inter-subject variability of endocast growth using shape regression and spatiotemporal registration
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
article
79th Annual Meeting of the American Association of Physical Anthropologists, Apr 2010, Albuquerque, United States
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BibTex
titre
Combined Statistical Model of Bone Shape and Mechanical Properties for Bone and Implant Modeling
auteur
S. Bonaretti, M. Kistler, Christof Seiler, Mauricio Reyes, P. Büchler
article
CMBBE, Feb 2010, Valencia, Spain
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BibTex
titre
A New Combined Surface and Volume Registration
auteur
Natasha Lepore, Anand Joshi, Richard Leahy, Caroline Brun, Yi-Yu Chou, Xavier Pennec, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greg de Zubicaray, Margaret Wright, Kathie Mcmahon, Aw Toga, Paul Thompson
article
Medical Imaging 2010, Feb 2010, San Diego, United States. pp.76231E-76231E-9, ⟨10.1117/12.844434⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813772/file/LeporeSPIE2010.pdf BibTex
titre
Three-dimensional Prolate Spheroidal Extrapolation for Sparse DTI of the In-vivo Heart
auteur
Nicolas Toussaint, Christian T. Stoeck, Maxime Sermesant, Sebastian Kozerke, Philip G. Batchelor
article
Book of Abstracts, International Society in Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM'10), 2010, Stockholm, United Kingdom
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titre
Estimation of Reaction, Diffusion and Restitution Parameters for a 3D Myocardial Model Using Optical Mapping and MRI
auteur
Jatin Relan, Mihaela Pop, Hervé Delingette, Graham Wright, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function (STACOM) and a Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge (CESC'10), 2010, Beijing, China. pp.270-280, ⟨10.1007/978-3-642-15835-3_28⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616151/file/relan_STACOM_MICCAI_2010.pdf BibTex
titre
Multi-atlas based segmentation: Application to the head and neck region for radiotherapy planning
auteur
Liliane Ramus, Grégoire Malandain
article
MICCAI Workshop Medical Image Analysis for the Clinic - A Grand Challenge, 2010, Beijing, China, China
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BibTex
titre
Atlas to Image-with-Tumor Registration based on Demons and Deformation Inpainting
auteur
Hans Lamecker, Xavier Pennec
article
MICCAI Workshop on Computational Imaging Biomarkers for Tumors - From Qualitative to Quantitative (CIBT'2010), 2010, Beijing, China
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https://hal.inria.fr/inria-00616156/file/IJ_759_1_demons.pdf BibTex
titre
Parametric regression of 3D medical images through the exploration of non-parametric regression models
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes Aguirre
article
Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.452--455, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490313⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616168/file/Seiler.ISBI2010.pdf BibTex
titre
Comparative validation of graphical models for learning tumor segmentations from noisy manual annotations
auteur
Frederik O. Kaster, Bjoern H. Menze, Marc-André Weber, Fred A. Hamprecht
article
MICCAI Workshop on Medical Computer Vision (MICCAI-MCV'10), 2010, Beijing, China. pp.74-85, ⟨10.1007/978-3-642-18421-5_8⟩
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titre
Statistically assisted fluid image registration algorithm - SAFIRA
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Paul Thompson
article
Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.364--367, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490335⟩
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BibTex
titre
A 3D Statistical Fluid Registration Algorithm
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, James C. Gee, Paul Thompson
article
Workshop on Machine Learning in Medical Imaging (MLMI'2010), 2010, Beijing, China
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BibTex
titre
An image retrieval approach to setup difficulty levels in training systems for endomicroscopy diagnosis
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna M. Buchner, Muhammad Waseem Shahid, Michael B. Wallace, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'10), 2010, Beijing, China, United States. pp.480--487, ⟨10.1007/978-3-642-15745-5_59⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616153/file/ANDRE-MICCAI10.pdf BibTex
titre
Endomicroscopic video retrieval using mosaicing and visual words
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna M. Buchner, Michael B. Wallace, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, no address, United States. pp.1419--1422, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490265⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616164/file/ANDRE-ISBI10.pdf BibTex
titre
Coupled Personalisation of Electrophysiology Models for Simulation of Induced Ischemic Ventricular Tachycardia
auteur
Jatin Relan, Phani Chinchapatnam, Maxime Sermesant, Kawal Rhode, Hervé Delingette, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'10), 2010, Beijing, China, United Kingdom. pp.420-428, ⟨10.1007/978-3-642-15745-5_52⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616158/file/relan_MICCAI_2010.pdf BibTex
titre
In-vivo Human 3D Cardiac Fibre Architecture: Reconstruction Using Curvilinear Interpolation of Diffusion Tensor Images
auteur
Nicolas Toussaint, Maxime Sermesant, Christian T. Stoeck, Sebastian Kozerke, Philip G. Batchelor
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'10), 2010, Beijing, China, United Kingdom. pp.418-425, ⟨10.1007/978-3-642-15705-9_51⟩
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BibTex
titre
A Robust and Efficient Block Matching Framework for Non Linear Registration of Thoracic CT Images
auteur
Vincent Garcia, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
article
Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China. pp.1-10
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https://hal.inria.fr/inria-00616148/file/Garcia_2010_EMPIRE10_2.pdf BibTex
titre
Diffeomorphic demons and the EMPIRE10 challenge
auteur
Vincent Garcia, Tom Vercauteren, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache
article
Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China
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https://hal.inria.fr/inria-00616149/file/Garcia_2010_EMPIRE10_1.pdf BibTex
titre
LogDemons Revisited: Consistent Regularisation and Incompressibility Constraint for Soft Tissue Tracking in Medical Images
auteur
Tommaso Mansi, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Proc. of Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'10), part II, 2010, Beijing, China, China. pp.652-659, ⟨10.1007/978-3-642-15745-5_80⟩
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BibTex
titre
Lung CT registration combining intensity, curves and surfaces
auteur
V. Gorbunova, Stanley Durrleman, Pechin Lo, Xavier Pennec, M. de Bruijne
article
Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.340--343, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490341⟩
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titre
Interactive real time simulation of cardiac radio-frequency ablation
auteur
Erik Pernod, Maxime Sermesant, Jatin Relan, Hervé Delingette
article
Proc. of Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine (2010) (VCBM'2010), 2010, Leipzig, Germany
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https://hal.inria.fr/inria-00616160/file/ErikPernodVCBM2010.pdf BibTex
titre
Assessing Selection Methods in the Context of Multi-atlas Based Segmentation
auteur
Liliane Ramus, Grégoire Malandain
article
Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, The Netherlands, Netherlands
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BibTex
titre
A generative model for brain tumor segmentation in multi-modal images
auteur
Bjoern H. Menze, Koen van Leemput, Danial Lashkari, Marc-André Weber, Nicholas Ayache, Polina Golland
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'10), 2010, Beijing, China. pp.151-159, ⟨10.1007/978-3-642-15745-5_19⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813776/file/menze_10_generative.pdf BibTex
titre
Multiplicative Jacobian energy decomposition method for fast porous visco-hyperelastic soft tissue model
auteur
Stéphanie Marchesseau, T. Heimann, S. Chatelin, R. Willinger, Hervé Delingette
article
MICCAI'10 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2010, Beijing, China. pp.235-242, ⟨10.1007/978-3-642-15705-9_29⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00593207/file/MICCAI.pdf BibTex
titre
[In-silico models for the simulation and prediction of the cardiac function].
auteur
Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Younes Boudjemline
article
Congrès de la Société Francaise de Pédiatrie et de l'Association des Pédiatres de Langue Française (APLF), 2010, Paris, France. pp.611-2, ⟨10.1016/S0929-693X(10)70022-1⟩
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BibTex
titre
Comparison of the endocast growth of chimpanzees and bonobos via temporal regression and spatiotemporal registration
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
article
Miccai Workshop on Spatio-Temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, 2010, Beijing, China, China
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https://hal.inria.fr/inria-00616154/file/Durrleman_Workshop4D.pdf BibTex
titre
Non-Invasive Activation Times Estimation using 3D Echocardiography
auteur
Adityo Prakosa, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Eric Saloux, Pascal Allain, Pascal Cathier, Patrick Etyngier, Nicolas Villain, Nicholas Ayache
article
Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function + a Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge (STACOM+CESC'10), 2010, Beijing, China
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Chapitre d'ouvrage

titre
Personalization of Reaction-Diffusion Tumor Growth Models in MR Images: Application to Brain Gliomas Characterization and Radiotherapy Planning
auteur
Ender Konukoglu, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Deisboeck, Thomas S. and Stamatakos, Georgios. Multiscale Cancer Modeling, CRC Press, 2010, Chapman & Hall/CRC Mathematical & Computational Biology
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https://hal.inria.fr/inria-00616111/file/nih-cvit-chapter.pdf BibTex
titre
Personalized Computational Models of the Heart for Cardiac Resynchronization Therapy
auteur
Maxime Sermesant, Reza Razavi
article
Kerckhoffs, Roy C.P. Patient-Specific Modeling of the Cardiovascular System, Springer New York, pp.167-182, 2010, 978-1-4419-6691-9. ⟨10.1007/978-1-4419-6691-9_10⟩
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Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Statistical Atlases and Computational Models of the Heart, First International Workshop, STACOM 2010, and Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge, CESC 2010
auteur
Oscar Camara, Mihaela Pop, Kawal Rhode, Maxime Sermesant, Nic Smith, Alistair Young
article
Camara, Oscar and Pop, Mihaela and Rhode, Kawal and Sermesant, Maxime and Smith, Nic and Young, Alistair A. France. 6364, Springer, pp.292, 2010, LNCS, 978-3-642-15834-6
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BibTex
titre
Medical Computer Vision: Recognition techniques and applications in medical imaging -- MICCAI-MCV 2010
auteur
Bjoern H. Menze, Georg Langs, Zhuowen Tu, Antonio Criminisi
article
Menze, Bjoern H. and Langs, Georg and Tu, Zhuowen and Criminisi, Antonio. 6533, Springer, pp.237, 2010, LNCS
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Autre publication

titre
Power Euclidean metrics for covariance matrices with application to diffusion tensor imaging
auteur
I. L. Dryden, Xavier Pennec, Jean-Marc Peyrat
article
2010
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https://arxiv.org/pdf/1009.3045 BibTex
titre
Horizontal Data Fusion for Integrative Modelling: the MedINRIA Fusion Toolbox
auteur
Benoît Bleuzé, Olivier Clatz, Pierre Fillard, Maxime Sermesant, Nicolas Toussaint, Julien Wintz
article
2010
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https://hal.inria.fr/hal-00813764/file/noe-abstract.pdf BibTex
titre
Longitudinal MRI assessment of quality of life and disability in early treated relapsing remitting multiple sclerosis
auteur
Mikael Cohen, Christine Lebrun, Dominique Aufauvre, Stéphane Chanalet, Christelle Filleau, William Camu, Pierre Thomas, Grégoire Malandain, Pierre Clavelou
article
2010
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BibTex
titre
Atlas de contourage automatique des dents pour l'optimisation des soins dentaires
auteur
Juliette Thariat, Liliane Ramus, Philippe Maingon, Vincent Grégoire, Vincent Darcourt, Serge Marcie, Grégoire Malandain
article
2010
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BibTex
titre
Endomicroscopic Video Retrieval Approach to Support Diagnostic Differentiation Between Neoplastic and Non-Neoplastic Colonic Polyps
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Anna M. Buchner, Michael B. Wallace, Nicholas Ayache
article
2010, ⟨10.1016/S0016-5085(10)62375-X⟩
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BibTex
titre
Construction of a dental atlas for automatic teeth segmentation to improve post-irradiation dental care management
auteur
Juliette Thariat, Liliane Ramus, Philippe Maingon, Vincent Grégoire, Serge Marcie, Grégoire Malandain
article
2010
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BibTex
titre
Enrichment through biomarkers in clinical trials of Alzheimer's drugs in patients with mild cognitive impairment
auteur
Marco Lorenzi, Michael Donohue, Donata Paternico, Cristina Scarpazza, Susanne Ostrowitzki, Olivier Blin, Elaine Irving, G. Frisoni
article
2010
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BibTex

Document associé à des manifestations scientifiques

titre
Definition of motionless phases for monitoring gated reconstruction of SPECT images in alive mice
auteur
Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe Franken
article
ICVSS - International Computer Vision Summer School, Jul 2010, Punta Sampieri, 97010 Scicli, Sicile, Italy. 2010
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https://hal.inria.fr/hal-00759962/file/BreuillyICVSS2010.pdf BibTex

Rapport

titre
Third generation disease models: Image analysis tools, pediatric heart diseases, inflammatory diseases and brain tumors
auteur
Xavier Pennec, Curzio Basso, Younes Boudjemline, Stanley Durrleman, Ender Konukoglu, Tommaso Mansi, Kristin Mcleod, Giacomo Pongiglione, Matteo Santoro, Maxime Sermesant, Bertrand Stos, Nicolas Toussaint, Gianluca Trocchio
article
[Technical Report] 2010
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BibTex
titre
Computational Models for AF and VT simulation
auteur
M. W. Krueger, J. Relan, H. Delingette, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, G. Seemann, O. Dössel
article
[Contract] 2010, pp.58
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Thèse

titre
Reconstruction tridimensionnelle et suivi de lignées cellulaires à partir d'images de microscopie laser : application à des tissus végétaux
auteur
Romain Fernandez
article
Traitement du signal et de l'image [eess.SP]. Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2010. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00845205/file/fernandez-phd-2010.pdf BibTex
titre
Image-based physiological and statistical models of the heart: application to tetralogy of Fallot
auteur
Tommaso Mansi
article
Human-Computer Interaction [cs.HC]. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2010. English. ⟨NNT : 2010ENMP0023⟩
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/tel-00530956/file/thesis.pdf BibTex
titre
Assimilation de données images pour la personnalisation d'un modèle électromécanique du coeur
auteur
Florence Billet
article
Traitement des images [eess.IV]. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00639921/file/Manuscrit-2-FlorenceBillet.pdf BibTex
titre
A probabilistic framework for point-based shape modeling in medical image analysis
auteur
Heike Hufnagel
article
Medical Imaging. universität Lübeck, 2010. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00844717/file/Hufnagel_PhD.pdf BibTex
titre
Statistical models of currents for measuring the variability of anatomical curves, surfaces and their evolution
auteur
Stanley Durrleman
article
Human-Computer Interaction [cs.HC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. English
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00631382/file/Durrleman_thesis.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
A probabilistic model to analyse workflow performance on production grids
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
2010
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00481713/file/glatard-montagnat-etal_2008b.pdf BibTex

2009

Article dans une revue

titre
DT-REFinD: diffusion tensor registration with exact finite-strain differential.
auteur
B T Thomas Yeo, Tom Vercauteren, Pierre Fillard, Jean-Marc Peyrat, Xavier Pennec, Polina Golland, Nicholas Ayache, Olivier Clatz
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009, 28 (12), pp.1914-28. ⟨10.1109/TMI.2009.2025654⟩
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titre
Mapping the regional influence of genetics on brain structure variability--a tensor-based morphometry study.
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Agatha Lee, Marina Barysheva, Sarah Madsen, Christina Avedissian, Yi-Yu Chou, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
article
NeuroImage, Elsevier, 2009, 48 (1), pp.37-49. ⟨10.1016/j.neuroimage.2009.05.022⟩
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BibTex
titre
Statistical models of sets of curves and surfaces based on currents.
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
Med Image Anal, Elsevier, 2009, 13 (5), pp.793-808. ⟨10.1016/j.media.2009.07.007⟩
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BibTex
titre
Evaluation of 14 nonlinear deformation algorithms applied to human brain MRI registration.
auteur
Arno Klein, Jesper Andersson, Babak Ardekani, John Ashburner, Brian Avants, Ming-Chang Chiang, Gary Christensen, D. Louis Collins, Pierre Hellier, Joo Hyun Song, Mark Jenkinson, Claude Lepage, Daniel Rueckert, Paul Thompson, Tom Vercauteren, Roger Woods, John Mann, Ramin Parsey
article
NeuroImage, Elsevier, 2009, 46 (3), pp.786-802. ⟨10.1016/j.neuroimage.2008.12.037⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00360790/file/Eval14NonlinearRegistration-Klein-NeuroImage09.pdf BibTex
titre
An augmented reality system for liver thermal ablation: design and evaluation on clinical cases.
auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, X. Buy, A. Gangi, Nicholas Ayache, Jacques Marescaux
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2009, 13 (3), pp.494-506. ⟨10.1016/j.media.2009.02.003⟩
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titre
Diffeomorphic demons: Efficient non-parametric image registration.
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
article
NeuroImage, Elsevier, 2009, 45 (1), Supplement 1, Pages S61-S72. ⟨10.1016/j.neuroimage.2008.10.040⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00349600/file/DiffeoDemons-NeuroImage08-Vercauteren.pdf BibTex
titre
Fusion of optical imaging and MRI for the evaluation and adjustment of macroscopic models of cardiac electrophysiology: A feasibility study
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Damien Lepiller, M.V. Truong, Elliot Mcveigh, Eugene Crystal, Alexander Dick, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Graham Wright
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2009, 13 (2), pp.370-80
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titre
A pre-clinical assessment of an atlas-based automatic segmentation tool for the head and neck
auteur
Richard Sims, Aurélie Isambert, Vincent Grégoire, François Bidault, Lydia Fresco, John Sage, John Mills, Jean Bourhis, Dimitri Lefkopoulos, Olivier Commowick, Mehdi Benkebil, Grégoire Malandain
article
Radiotherapy and Oncology, Elsevier, 2009, 93 (3), pp.474-8
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titre
A three-dimensional histological atlas of the human basal ganglia. II. Atlas deformation strategy and evaluation in deep brain stimulation for Parkinson disease.
auteur
Eric Bardinet, Manik Bhattacharjee, Didier Dormont, Bernard Pidoux, Grégoire Malandain, Michael Schupbach, Nicholas Ayache, Philippe Cornu, Yves Agid, Jérôme Yelnik
article
Journal of Neurosurgery, American Association of Neurological Surgeons, 2009, 110 (2), pp.208-19
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BibTex
titre
A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Linear Registration
auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2009, 33 (2), pp.222-238. ⟨10.1007/s10851-008-0135-9⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616084/file/Arsigny_JMIV_polyaffine_1_.pdf BibTex
titre
Revue des approches de segmentation des lésions de sclérose en plaques dans les séquences conventionnelles IRM
auteur
Jean-Christophe Souplet, Christine Lebrun, Stéphane Chanalet, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
article
Revue Neurologique, Elsevier Masson, 2009, 165 (1), pp.7--14
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BibTex
titre
Editorial: Special Issue on Medical Robotics
auteur
Jaydev Desai, Nicholas Ayache
article
The International Journal of Robotics Research, SAGE Publications, 2009, 28 (9), pp.1099-1100
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https://hal.inria.fr/inria-00616092/file/The_International_Journal_of_Robotics_Research-2009-Desai-1099-100.pdf BibTex
titre
Computation of a probabilistic statistical shape model in a maximum-a-posteriori framework.
auteur
Heike Hufnagel, Jan Ehrhardt, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Heinz Handels
article
IMIA Yearbook of Medical Informatics, Schattauer, 2009, 48 (4), pp.314-9. ⟨10.3414/ME9228⟩
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Communication dans un congrès

titre
Adaptive Tetrahedral Meshing for Personalized Cardiac Simulations
auteur
Hans Lamecker, Tommaso Mansi, Jatin Relan, Florence Billet, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, Hervé Delingette
article
CI2BM09 - MICCAI Workshop on Cardiovascular Interventional Imaging and Biophysical Modelling, Sep 2009, London, United Kingdom. pp.149-158
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https://hal.inria.fr/inria-00417371/file/4_7_paper108.pdf BibTex
titre
Volumetric Prediction of Cardiac Electrophysiology using a Heart Model Personalised to Surface Data
auteur
Jatin Relan, Maxime Sermesant, Mihaela Pop, Hervé Delingette, Michel Sorine, Graham Wright, Nicholas Ayache
article
CI2BM09 - MICCAI Workshop on Cardiovascular Interventional Imaging and Biophysical Modelling, Sep 2009, London, United Kingdom. 9 p
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https://hal.inria.fr/inria-00418471/file/1_5_paper118a4.pdf BibTex
titre
A statistical model of white matter fiber bundles based on currents.
auteur
Stanley Durrleman, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2009, Williamsburg, Va, United States. pp.114-25, ⟨10.1007/978-3-642-02498-6_10⟩
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BibTex
titre
Personalised Electromechanical Model of the Heart for the Prediction of the Acute Effects of Cardiac Resynchronisation Therapy
auteur
Maxime Sermesant, Florence Billet, Radomir Chabiniok, Tommaso Mansi, Phani Chinchapatnam, Philippe Moireau, Jean-Marc Peyrat, Kawal Rhode, Matt Ginks, Pier Lambiase, Simon Arridge, Hervé Delingette, Michel Sorine, C.A. Rinaldi, Dominique Chapelle, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart 2009 (FIMH'09), Jun 2009, Nice, France. pp.239-248, ⟨10.1007/978-3-642-01932-6_26⟩
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BibTex
titre
Using consensus measures for atlas construction
auteur
Liliane Ramus, Grégoire Malandain
article
Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, Boston, MA, United States
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BibTex
titre
Parameter Estimation of a 3D Cardiac Electrophysiology Model Including the Restitution Curve Using Optical and MR Data
auteur
Jatin Relan, Maxime Sermesant, Mihaela Pop, Hervé Delingette, Michel Sorine, Graham Wright, Nicholas Ayache
article
World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, 2009, Munich, Germany. pp.1716--1719, ⟨10.1007/978-3-642-03882-2_456⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616143/file/relan_WorldCongress09.pdf BibTex
titre
Characterization of Post-infarct Scars in a Porcine Model - a Combined Experimental and Theoretical Study
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Tommaso Mansi, Eugene Crystal, Jay Detsky, Yuesong Yang, Paul Fefer, Elliot Mcveigh, Alexander Dick, Nicholas Ayache, Graham Wright
article
Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2009 (FIMH'09), 2009, no address, France. pp.1-10
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BibTex
titre
Application of a Probabilistic Statistical Shape Model to Automatic Segmentation
auteur
Heike Hufnagel, Jan Ehrhardt, Xavier Pennec, Heinz Handels
article
World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, WC 2009, München, 2009, no address, Germany. pp.2181--2184, ⟨10.1007/978-3-642-03882-2_579⟩
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BibTex
titre
Spatiotemporal Atlas Estimation for Developmental Delay Detection in Longitudinal Datasets
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Guido Gerig, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part I, 2009, London, UK, United States. pp.297--304, ⟨10.1007/978-3-642-04268-3_37⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616113/file/MICCAI-1207.pdf BibTex
titre
Asymmetric Image-Template Registration
auteur
Mert Sabuncu, Boon Thye Thomas Yeo, Tom Vercauteren, Koen Van Leemput, Polina Golland
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part I, 2009, London, UK, United States. pp.565--573, ⟨10.1007/978-3-642-04268-370⟩
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BibTex
titre
Subject-Specific Ligament Models: Towards Real-Time Simulation of the Knee Joint
auteur
Tobias Heimann, François Chung, Hans Lamecker, Hervé Delingette
article
Computational Biomechanics for Medicine IV Workshop 2009, 2009, London, United Kingdom. pp.107-119, ⟨10.1007/978-1-4419-5874-7_12⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616129/file/Heimann-BiomechanicsWorkshop09.pdf BibTex
titre
Quantitative comparison of two cardiac electrophysiology models using personalisation to optical and MR data
auteur
Jatin Relan, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Mihaela Pop, Graham Wright, Nicholas Ayache
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'09), 2009, Boston, MA, United States. pp.1027-1030, ⟨10.1109/ISBI.2009.5193230⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616130/file/relan_ISBI.pdf BibTex
titre
Using Frankenstein's Creature Paradigm to Build a Patient Specific Atlas
auteur
Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Grégoire Malandain
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part II, 2009, London, UK, United States. pp.993--1000, ⟨10.1007/978-3-642-04271-3_120⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616133/file/CommowickMiccai2009.pdf BibTex
titre
Cardiac Motion Recovery and Boundary Conditions Estimation by Coupling an Electromechanical Model and Cine-MRI Data
auteur
Florence Billet, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart 2009 (FIMH'09), 2009, Nice, France. pp.376-385, ⟨10.1007/978-3-642-01932-6_41⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616137/file/fimh09-CardiacMotionRecovery.pdf BibTex
titre
Physically-Constrained Diffeomorphic Demons for the Estimation of 3D Myocardium Strain from Cine-MRI
auteur
Tommaso Mansi, Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Julie Blanc, Younes Boudjemline, Nicholas Ayache
article
Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2009 (FIMH'09), 2009, no address, France. pp.201-210
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BibTex
titre
Conditional Variability of Statistical Shape Models Based on Surrogate Variables
auteur
R. Blanc, Mauricio Reyes, Christof Seiler, G. Székely
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2009 (MICCAI), 2009, London, United Kingdom. pp.84-91
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BibTex
titre
A Lagrangian formulation for statistical fluid registration
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
article
Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, no address, United States. pp.975--978, ⟨10.1109/ISBI.2009.5193217⟩
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BibTex
titre
Introducing space and time in local feature-based endomicroscopic image retrieval
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Anna M. Buchner, Michael B. Wallace, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the MICCAI Workshop - Medical Content-based Retrieval for Clinical Decision (MCBR-CDS'09), 2009, London, United Kingdom. pp.18-30, ⟨10.1007/978-3-642-11769-5_2⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616139/file/ANDRE-MCBRCDS09.pdf BibTex
titre
Endomicroscopic image retrieval and classification using invariant visual features
auteur
Barbara André, Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Anna M. Buchner, Michael B. Wallace, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, Boston, MA, United States. pp.346--349, ⟨10.1109/ISBI.2009.5193055⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616140/file/ANDRE-ISBI09.pdf BibTex
titre
Error Assessment on myocardial fiber orientations from DTI measurements
auteur
Nicolas Toussaint, Stanley Durrleman, Maxime Sermesant, Sebastian Kozerke, Philip G. Batchelor
article
Book of Abstracts, European Society of Magnetic Resonance in Medicine (ESMRMB) 26th Annual Scientific Meeting, 2009, Antalya, Turkey, Turkey. pp.59, ⟨10.1007/s10334-009-0175-1⟩
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BibTex
titre
Joint segmentation via patient-specific latent anatomy model
auteur
Tammy Riklin-Raviv, Bjoern H. Menze, Koen Van Leemput, Bram Stieltjes, Marc-André Weber, Nicholas Ayache, William M. Wells, Polina Golland
article
MICCAI Workshop on Probabilistic Methods in Medical Image Analysis (PMMIA'09)), 2009, London, UK, United Kingdom
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BibTex
titre
A Statistical Model of Right Ventricle in Tetralogy of Fallot for Prediction of Remodelling and Therapy Planning
auteur
Tommaso Mansi, Stanley Durrleman, Boris Bernhardt, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Ingmar Voigt, Philipp Lurz, Andrew Taylor, Julie Blanc, Younes Boudjemline, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'09), 2009, London, UK, United Kingdom. pp.214-221, ⟨10.1007/978-3-642-04268-3_27⟩
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BibTex
titre
Multimodal Prior Appearance Models based on Regional Clustering of Intensity Profiles
auteur
François Chung, Hervé Delingette
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), 2009, London, United Kingdom. pp.1051--1058, ⟨10.1007/978-3-642-04271-3_127⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616132/file/multimodal_prior_appearance_models_based_on_regional_clustering_of_intensity_profiles.pdf BibTex
titre
Automatic Extraction of Mandibular Nerve and Bone from Cone-Beam CT Data
auteur
D. Kainmüller, Hans Lamecker, H. Seim, M. Zinser, S. Zachow
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2009, no address, Germany. pp.76-83
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BibTex
titre
Reconstruction 3D des structures anatomiques des membres inférieurs
auteur
François Chung, Jérôme Schmid, Olivier Clatz, Nadia Magnenat-Talmann, Hervé Delingette
article
ORASIS'09 - Congrès des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, 2009, Trégastel, France, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00404638/file/41.pdf BibTex
titre
Curve- and surface-based registration of lung CT images via currents
auteur
V. Gorbunova, Stanley Durrleman, Pechin Lo, Xavier Pennec, M. de Bruijne
article
Second International Workshop on Pulmonary Image Analysis, 2009, London United Kingdom, United Kingdom. pp.15--25
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00616136/file/Gorbunova_LungWorkshop.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Grid Analysis of Radiological Data
auteur
Cecile Germain-Renaud, Vincent Breton, Patrick Clarysse, Bertrand Delhay, Yann Gaudeau, Tristan Glatard, Emmanuel Jeannot, Yannick Legre, Johan Montagnat, Jean-Marie Moureaux, Angel Osorio, Xavier Pennec, Joel Schaerer, Romain Texier
article
Mario Cannataro (Ed.). Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine and Healthcare, IGI, pp.363-391, 2009, chapter 19, ⟨10.4018/978-1-60566-374-6.ch019⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683992/file/germain-breton-etal-2009.pdf BibTex
titre
Virtual Pulmonary Valve Replacement Interventions with a Personalised Cardiac Electromechanical Model
auteur
Tommaso Mansi, Barbara André, Michael Lynch, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Younes Boudjemline, Nicholas Ayache
article
Magnenat-Thalmann, Nadia and Zhang, Jian J. and Feng, David D. Recent Advances in the 3D Physiological Human, Springer, pp.201-210, 2009, 978-1-84882-564-2
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BibTex
titre
Asclepios: a Research Project-Team at INRIA for the Analysis and Simulation of Biomedical Images
auteur
Nicholas Ayache, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
article
Bertot, Y. and Huet, G. and Lévy, J.-J. and Plotkin, G. From semantics to computer science: essays in honor of Gilles Kahn, Cambridge University Press, pp.415-436, 2009, ⟨10.1017/CBO9780511770524.019⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616094/file/Colloquium-Gilles-Kahn-NA-2007-v5.pdf BibTex
titre
Musculoskeletal simulation model generation from MRI datasets and motion capture data
auteur
Jérôme Schmid, Anders Sandholm, François Chung, Daniel Thalmann, Hervé Delingette, Nadia Magnenat-Thalmann
article
Magnenat-Thalmann, Nadia and Zhang, Jian J. and Feng, David D. Recent Advances in the 3D Physiological Human, Springer, pp.3-19, 2009, 978-1-84882-564-2. ⟨10.1007/978-1-84882-565-9_1⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616096/file/musculoskeletal_simulation_model_generation_from_mri_datasets_and_motion_capture_data.pdf BibTex
titre
Hierarchical Markov Random Fields Applied to Model Soft Tissue Deformations on Graphics Hardware
auteur
Christof Seiler, P. Büchler, L.-P. Nolte, R. Paulsen, Mauricio Reyes
article
N. Magnenat-Thalmann, J. J. Zhang & Feng, D. D. Recent Advances in the 3D Physiological Human, Springer, pp.133-148, 2009
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BibTex

Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Functional Imaging and Modeling of the Heart - FIMH 2009
auteur
Nicholas Ayache, Hervé Delingette, Maxime Sermesant
article
Ayache, Nicholas and Delingette, Hervé and Sermesant, Maxime. 5528, Springer, 2009, LNCS
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BibTex

Autre publication

titre
An ITK Implementation of the Symmetric Log-Domain Diffeomorphic Demons Algorithm
auteur
Florence Dru, Tom Vercauteren
article
2009
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00813744/file/IJ_644_7_SymLogDemons-IJ-2009-05-05-DruAndVercauteren.pdf BibTex
titre
Automatic Landmark Propagation for Left and Right Symmetry Assessment of Tibia and Femur: A Computational Anatomy Based Approach
auteur
Christof Seiler, S. Weber, W. Schmidt, F. Fischer, N. Reimers, Mauricio Reyes
article
2009
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BibTex
titre
Personalisation of 3D Cardiac Electrophysiology Models for valid Predictions: A Step Towards Patient-Specific Ventricular Tachycardia Modelling
auteur
J. Relan, Maxime Sermesant, H. Delingette, M. Pop, M. Sorine, G.A. Wright, Nicholas Ayache
article
2009
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BibTex

Rapport

titre
Spatiotemporal Atlas Estimation for Developmental Delay Detection in Longitudinal Datasets
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Guido Gerig, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
[Research Report] RR-6952, INRIA. 2009, 17 p
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https://hal.inria.fr/inria-00408293/file/RR-6952.pdf BibTex

Thèse

titre
Comparison of Cardiac Anatomy and Function: Statistics on Fibre Architecture from DT-MRI and Registration of 4D CT Images
auteur
Jean-Marc Peyrat
article
Computer Science [cs]. Université Nice Sophia Antipolis, 2009. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00633206/file/Peyrat_2009_PhDThesis.pdf BibTex
titre
Modeling Glioma Growth and Personalizing Growth Models in Medical Images
auteur
Ender Konukoglu
article
Human-Computer Interaction [cs.HC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2009. English. ⟨NNT : 2009NICE4000⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00633697/file/konukoglu_thesis.pdf BibTex
titre
Évaluation de l'atrophie et de la charge lésionnelle sur des séquences IRM de patients atteints de sclérose en plaques
auteur
Jean-Christophe Souplet
article
Informatique [cs]. Université Nice Sophia Antipolis, 2009. Français
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00635295/file/Souplet_PhDThesis-1.pdf BibTex

2008

Article dans une revue

titre
Workflow-based data parallel applications on the EGEE production grid infrastructure
auteur
Johan Montagnat, Tristan Glatard, Isabel Campos Plasencia, Francisco Castejon, Xavier Pennec, Giuliano Taffoni, Vladimir Voznesensky, Claudio Vuerli
article
Journal of Grid Computing, Springer Verlag, 2008, 6 (8), pp.369-383. ⟨10.1007/s10723-008-9108-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683983/file/montagnat-glatard-etal-2008.pdf BibTex
titre
Diffusion tensor imaging characteristics of the corpus callosum in mild, moderate, and severe traumatic brain injury.
auteur
D. R. Rutgers, P. Fillard, G. Paradot, M. Tadié, P. Lasjaunias, D. Ducreux
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2008, 29 (9), pp.1730-5. ⟨10.3174/ajnr.A1213⟩
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BibTex
titre
Inferring brain variability from diffeomorphic deformations of currents: an integrative approach.
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Paul Thompson, Nicholas Ayache
article
Med Image Anal, Elsevier, 2008, 12 (5), pp.626-37. ⟨10.1016/j.media.2008.06.010⟩
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BibTex
titre
Flexible and efficient workflow deployement of data-intensive applications on grids with MOTEUR
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Diane Lingrand, Xavier Pennec
article
International Journal of High Performance Computing Applications, SAGE Publications, 2008, 22 (3), pp.347-360. ⟨10.1177/1094342008096067⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00459130/file/glatard-montagnat-etal_2008.pdf BibTex
titre
Toward patient-specific myocardial models of the heart
auteur
Maxime Sermesant, Jean-Marc Peyrat, Phani Chinchapatnam, Florence Billet, Tommaso Mansi, Kawal Rhode, Hervé Delingette, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
Heart Failure Clinics, WB Saunders, 2008, Function Follows Form, 4 (3), pp.289-301. ⟨10.1016/j.hfc.2008.02.014⟩
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BibTex
titre
A Service-Oriented Architecture enabling dynamic services grouping for optimizing distributed workflows execution
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, David Emsellem, Diane Lingrand
article
Future Generation Computer Systems, Elsevier, 2008, 24 (7), pp.720--730. ⟨10.1016/j.future.2008.02.011⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00459808/file/glatard-montagnat-etal_2008a.pdf BibTex
titre
White matter abnormalities in mild traumatic brain injury: a diffusion tensor imaging study.
auteur
D. R. Rutgers, F. Toulgoat, J. Cazejust, P. Fillard, P. Lasjaunias, D. Ducreux
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2008, 29 (3), pp.514-9. ⟨10.3174/ajnr.A0856⟩
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BibTex
titre
Simulation : Le coeur numérique par Hervé Delingette et Miguel Fernandez. De l'ordinateur à la clinique, entretien avec Jérôme Garot, propos recueillis par Dominique Chouchan. Améliorer les performances des implants cardiaques par Alain Ripart
auteur
Hervé Delingette, Miguel Angel Fernández, Jérôme Garot, Alain Ripart
article
Les Cahiers de l'INRIA - La Recherche, INRIA, 2008, Newton les alchimistes et la science
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00547225/file/inria-n416-fev08.pdf BibTex
titre
Atlas-Based Delineation of Lymph Node Levels in Head and Neck Computed Tomography Images
auteur
Olivier Commowick, Vincent Grégoire, Grégoire Malandain
article
Radiotherapy Oncology, undefined or unknown publisher, 2008, 87 (2), pp.281-289
Accès au bibtex
BibTex
titre
Articulated Spine Models for 3D Reconstruction from Partial Radiographic Data
auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 55 (11), pp.2565--2574. ⟨10.1109/TBME.2008.2001125⟩
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BibTex
titre
Triangular Springs for Modeling Nonlinear Membranes
auteur
Hervé Delingette
article
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 14 (2)
Accès au bibtex
BibTex
titre
An efficient locally affine framework for the smooth registration of anatomical structures
auteur
Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Aurélie Isambert, Jimena Costa, Frédéric Dhermain, F. Bidault, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2008, 12 (4), pp.427-41. ⟨10.1016/j.media.2008.01.002⟩
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titre
Generation of a Statistical Shape Model with Probabilistic Point Correspondences and EM-ICP
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2008, 2 (5), pp.265--273. ⟨10.1007/s11548-007-0138-9⟩
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titre
In Vivo Detection of Thalamic Gliosis: A Pathoradiologic Demonstration in Familial Fatal Insomnia
auteur
Stéphane Haïk, Damien Galanaud, Marius George Linguraru, K. Peoc'H, N. Privat, Baptiste Faucheux, Nicholas Ayache, J.J. Hauw, Didier Dormont, Jean-Philippe Brandel
article
Archives of Neurology -Chigago-, American Medical Association, 2008, 65 (4), pp.545-549
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titre
Biocomputing: numerical simulation of glioblastoma growth using diffusion tensor imaging
auteur
Pierre-Yves Bondiau, Olivier Clatz, Maxime Sermesant, Pierre-Yves Marcy, Hervé Delingette, Marc Frenay, Nicholas Ayache
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2008, 53 (4), pp.879-93
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titre
Evaluation of an atlas-based automatic segmentation software for the delineation of brain organs at risk in a radiation therapy clinical context
auteur
Aurélie Isambert, Frédéric Dhermain, F. Bidault, Olivier Commowick, Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Dimitri Lefkopoulos
article
Radiotherapy and Oncology, Elsevier, 2008, 87 (1), pp.93-9. ⟨10.1016/j.radonc.2007.11.030⟩
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titre
A phantom study of the accuracy of CT, MR and PET image registrations with a block matching-based algorithm
auteur
Aurélie Isambert, Guillaume Bonniaud, F. Lavielle, Grégoire Malandain, Dimitri Lefkopoulos
article
Cancer Radiothérapie, Elsevier Masson, 2008, 12 (8), pp.800-8. ⟨10.1016/j.canrad.2008.04.009⟩
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titre
Principal Deformations Modes of Articulated Models for the Analysis of 3D Spine Deformities
auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
article
Electronic Letters on Computer Vision and Image Analysis, Computer Vision Center Press, 2008, 7 (4), pp.13--31. ⟨10.5565/rev/elcvia.165⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616067/file/Boisvert_ELCVIA08.pdf BibTex
titre
Geometric Variability of the Scoliotic Spine using Statistics on Articulated Shape Models
auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 27 (4), pp.557--568. ⟨10.1109/TMI.2007.911474⟩
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titre
Model-Based Imaging of Cardiac Apparent Conductivity and Local Conduction Velocity for Diagnosis and Planning of Therapy
auteur
Phani Chinchapatnam, Kawal Rhode, Matt Ginks, C.A. Rinaldi, Pier Lambiase, Reza Razavi, Simon Arridge, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 27 (11), pp.1631-1642
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titre
Compensation of geometric distortion effects on intraoperative magnetic resonance imaging for enhanced visualization in image-guided neurosurgery
auteur
Neculai Archip, Olivier Clatz, Stephen Whalen, Simon Dimaio, Peter Black, Alexandra Golby, Ferenc Jolesz, Simon K. Warfield
article
Neurosurgery, Lippincott, Williams & Wilkins, 2008, 62 (3 supl. 1), pp.209-15
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titre
Computational Modelling of the WHO Grade II Glioma Dynamics: Principles and Applications to Surgical Strategy
auteur
Emmanuel Mandonnet, Johan Pallud, Olivier Clatz, Hugues Duffau, Laurent Capelle
article
Neurosurgical Review, Springer Verlag, 2008, 31 (3), pp.263-9
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Communication dans un congrès

titre
Comparing algorithms for diffeomorphic registration: Stationary LDDMM and Diffeomorphic Demons
auteur
Monica Hernandez, Salvador Olmos, Xavier Pennec
article
2nd MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2008, New-York, United States. pp.24-35
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https://hal.inria.fr/inria-00629883/file/mfca08_1_3.pdf BibTex
titre
A Forward Model to Build Unbiased Atlases from Curves and Surfaces
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
2nd MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2008, New-York, United States. pp.68-79
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https://hal.inria.fr/inria-00632875/file/mfca08_3_1.pdf BibTex
titre
A framework for evaluating the impact of compression on registration algorithms without gold standard
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
International Conference on Image Processing, Oct 2008, San Diego, California, United States. IEEE, pp.2912-2915, 2008, 〈10.1109/ICIP.2008.4712404〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683112/file/icip_final.pdf BibTex
titre
NeuroLOG: Neuroscience Application Workflows Execution on the EGEE Grid
auteur
Javier Rojas Balderrama, Diane Lingrand, Erik Pernod, Jean-Christophe Souplet, Xavier Pennec, Johan Montagnat
article
EGEE conference, Sep 2008, Istanbul, Turkey
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00461625/file/egee08.pdf BibTex
titre
Sparse approximation of currents for statistics on curves and surfaces.
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
MICCAI - 11th International Conference on Medical Image Computing And Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. pp.390-398, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_47⟩
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titre
Multiple Sclerosis Brain MRI Segmentation Workflow deployment on the EGEE Grid
auteur
Erik Pernod, Jean-Christophe Souplet, Javier Rojas Balderrama, Diane Lingrand, Xavier Pennec
article
MICCAI-Grid Workshop, Sep 2008, New York, United States. pp.55--64
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00459138/file/pernod-souplet-etal_2008.pdf BibTex
titre
Detection of DTI white matter abnormalities in multiple sclerosis patients.
auteur
Olivier Commowick, Pierre Fillard, Olivier Clatz, Simon K Warfield
article
International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York City, United States. pp.975-82, ⟨10.1007/978-3-540-85988-8_116⟩
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titre
Spherical Demons: Fast Surface Registration
auteur
B.T. Thomas Yeo, Mert Sabuncu, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Bruce Fischl, Polina Golland
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States
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https://hal.inria.fr/inria-00287048/file/SphericalDemons-MICCAI08-Yeo.pdf BibTex
titre
Symmetric Log-Domain Diffeomorphic Registration: A Demons-based Approach
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. pp.754--761, ⟨10.1007/978-3-540-85988-8_90⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00280602/file/SymLogDemons-MICCAI08-Vercauteren.pdf BibTex
titre
Volumetric Differences in Brain Structure in Identical and Fraternal Twins Computed using Riemannian Tensor-Based Morphometry
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Katie L. Mcmahon, Greig I. de Zubicaray, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
article
13th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2008, Melbourne, Australia
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titre
Implementation of Turing machines with the Scufl data-flow language
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat
article
Workshop on Workflow Systems in e-Science, May 2008, Lyon, France. pp.1-10, 2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683113/file/wses08.pdf BibTex
titre
DTI Registration with Exact Finite-Strain Differential
auteur
B.T. Thomas Yeo, Tom Vercauteren, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Polina Golland, Nicholas Ayache, Olivier Clatz
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), May 2008, Paris, France. pp.700-703, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541092⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00272326/file/DTIDiffeomorphicDemons-ISBI08-Yeo.pdf BibTex
titre
Cardiac Electrophysiology Model Adjustment Using the Fusion of MR and Optical Imaging
auteur
Damien Lepiller, Maxime Sermesant, Mihaela Pop, Hervé Delingette, Graham Wright, Nicholas Ayache
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, no address, United States. pp.678-685
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titre
A Global Criterion for the Computation of Statistical Shape Model Parameters Based on Correspondence Probabilities
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
article
Bildverarbeitung für die Medizin 2008, 2008, no address, Germany. pp.277-282, ⟨10.1007/978-3-540-78640-5_56⟩
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titre
Biquadratic and Quadratic Springs for Modeling St Venant Kirchhoff Materials
auteur
Hervé Delingette
article
Fourth International Symposium on BioMedical Simulation (ISBMS'08), 2008, London, UK, United Kingdom. pp.40--48
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titre
An Integrated Platform for Dynamic Cardiac Simulation and Image Processing: Application to Personalised Tetralogy of Fallot Simulation
auteur
Nicolas Toussaint, Tommaso Mansi, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
Proc. Eurographics Workshop on Visual Computing for Biomedicine (VCBM), 2008, Delft, The Netherlands, Netherlands
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titre
Registration of 4D Time-Series of Cardiac Images with Multichannel Diffeomorphic Demons
auteur
Jean-Marc Peyrat, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Nicholas Ayache
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, New York, USA, United States. pp.972--979, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_117⟩
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titre
Comparison of Statistical Shape Models Built on Correspondence Probabilities and One-to-One Correspondences
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
article
Proc. SPIE Symposium on Medical Imaging '08, 2008, San Diego, USA, Germany. ⟨10.1117/12.771136⟩
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titre
A New Evaluation Of The Brain Parenchymal Fraction: Application In Multiple Sclerosis Longitudinal Studies
auteur
Jean-Christophe Souplet, Christine Lebrun, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
article
Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), 2008, Paris, France, France. pp.65-68
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titre
Versatile design of changing mesh topologies for surgery simulation
auteur
Barbara André, Hervé Delingette
article
Fourth International Symposium on BioMedical Simulation (ISBMS'08), 2008, London, UK, United Kingdom. pp.147--156
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BibTex
titre
Monitoring Slowly Evolving Tumors
auteur
Ender Konukoglu, William M. Wells, Sébastien Novellas, Nicholas Ayache, Ron Kikinis, Peter Black, K.M. Pohl
article
In Proceedings of the IEEE Internation Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), 2008, Paris, France, France
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titre
Cardiac Motion Recovery by Coupling an Electromechanical Model and Cine-MRI Data: First Steps
auteur
Florence Billet, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Proc. of the Workshop on Computational Biomechanics for Medicine III. (Workshop MICCAI-2008), 2008, no address, United States
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titre
Modélisation électromécanique du coeur et analyse d'images
auteur
Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Martin Huber, Andrew Taylor, Giacomo Pongiglione, Xavier Pennec, Younes Boudjemline
article
Congrés des Sociétés Françaises Médico-chirurgicales Pédiatriques, 2008, Paris, France. pp.1032, ⟨10.1016/S0929-693X(08)72422-9⟩
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titre
An Automatic Segmentation of T2-FLAIR Multiple Sclerosis Lesions
auteur
Jean-Christophe Souplet, Christine Lebrun, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
article
MICCAI-Multiple Sclerosis Lesion Segmentation Challenge Workshop, 2008, New York, NY, USA, United States
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https://hal.inria.fr/inria-00616119/file/Souplet_MSChallenge08.pdf BibTex
titre
A tensor-based morphometry study of genetic influences on brain structure using a new fluid registration method
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig de Zubicaray, Matthew Meredith, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, New York, USA, United States. pp.914--921, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_110⟩
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BibTex
titre
A new registration method based on Log-Euclidean Tensor metrics and its application to genetic studies
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Marina Barysheva, Arthur Toga, Paul Thompson
article
Proc. of the 2008 IEEE Int. Symp. on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), Paris, France, May 14-17, 2008, no address, France. pp.1115-1118, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541196⟩
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BibTex
titre
Real Time Autonomous Video Image Registration for Endomicroscopy: Fighting The Compromises
auteur
Tom Vercauteren, Alexander Meining, François Lacombe, Aymeric Perchant
article
Proc. SPIE BIOS - Three-Dimensional and Multidimensional Microscopy: Image Acquisition and Processing XV, 2008, San Jose, CA, USA, United States. pp.68610C, ⟨10.1117/12.763089⟩
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BibTex
titre
Best individual template selection from deformation tensor minimization
auteur
Natasha Leporé, Caroline Brun, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Xavier Pennec, Katie Mcmahon, Matthew Meredith, Greig de Zubicaray, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
article
Proc. of the 2008 IEEE Int. Symp. on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), Paris, France, May 14-17, 2008, no address, France. pp.460-463, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541032⟩
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Chapitre d'ouvrage

titre
Tumor Growth Modeling in Oncological Image Analysis
auteur
Ender Konukoglu, Xavier Pennec, Olivier Clatz, Nicholas Ayache
article
Bankman, I. Handbook of Medical Image Processing and Analysis - New edition, Academic Press, pp.297--307, 2008, 13: 978-0-12-373904-9. ⟨10.1016/B978-012373904-9.50027-1⟩
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BibTex
titre
Landmark-based registration using features identified through differential geometry
auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Jean-Philippe Thirion
article
Bankman, I. Handbook of Medical Image Processing and Analysis - New edition, Academic Press, pp.565--578, 2008, 13: 978-0-12-373904-9. ⟨10.1016/B978-012373904-9.50044-1⟩
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BibTex
titre
Processing of In Vivo Fibered Confocal Microscopy Video Sequences
auteur
Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Nicolas Savoire, Grégoire Malandain, Aymeric Perchant
article
Rittscher, Jens and Machiraju, Raghu and Wong, Stephen T.C. Microscopic Image Analysis for Life Science Applications, Artech House, pp.441--463, 2008
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BibTex
titre
Statistical computing on manifolds: from Riemannian geometry to computational anatomy
auteur
Xavier Pennec
article
Nielsen, Frank. Emerging Trends in Visual Computing, 5416, Springer, pp.347--386, 2008, LNCS, 978-3-642-00825-2. ⟨10.1007/978-3-642-00826-9_16⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00616104/file/Pennec_ETVC08.pdf BibTex

Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Proceedings of the Second International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'08) - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang. MICCAI, Inria, Hal, pp.188, 2008
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00846316/file/MFCA08_Proceedings.pdf BibTex

Poster

titre
Apport d’un algorithme de segmentation semi-automatique pour analyse des adenopathies mediastinales
auteur
S. Novellas, G. Malandain, J. Costa, Jean-Christophe Souplet, N. Ayache, P. Chevallier
article
JFR 2008, Oct 2008, Paris, France. pp.1267, 2008, ⟨10.1016/S0221-0363(08)75786-X⟩
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BibTex

Rapport

titre
Sparse Approximation of Currents for Statistics on Curves and Surfaces
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
[Research Report] RR-6571, INRIA. 2008, pp.15
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https://hal.inria.fr/inria-00286014/file/RR-6571.pdf BibTex

Thèse

titre
Modèles de la variabilité géométrique du rachis scoliotique
auteur
Jonathan Boisvert
article
Automatique / Robotique. Université Nice Sophia Antipolis, 2008. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00630221/file/PhD_Boisvert.pdf BibTex
titre
Segmentation of anatomical structures of the lower abdomen using 3D deformable models
auteur
Maria Jimena Costa
article
domain_stic. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2008. English. ⟨NNT : 2008ENMP⟩
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00003832/file/Thesecosta.pdf BibTex
titre
Riemannian processing of tensors for diffusion MRI and computational anatomy of the brain.
auteur
Pierre Fillard
article
Human-Computer Interaction [cs.HC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2008. English
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00265129/file/these.pdf BibTex
titre
Image registration and mosaicing for dynamic In vivo fibered confocal microscopy
auteur
Tom Vercauteren
article
Human-Computer Interaction [cs.HC]. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2008. English. ⟨NNT : 2008ENMP1521⟩
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/tel-00221481/file/PhDThesis-TomVercauteren.pdf BibTex

2007

Article dans une revue

titre
Clinical DT-MRI estimation, smoothing, and fiber tracking with log-Euclidean metrics.
auteur
Pierre Fillard, Xavier Pennec, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2007, 26 (11), pp.1472-82. ⟨10.1109/TMI.2007.899173⟩
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BibTex
titre
MR diffusion tensor imaging and fiber tracking in spinal cord arteriovenous malformations: a preliminary study.
auteur
A. Ozanne, T. Krings, D. Facon, P. Fillard, J. L. Dumas, H. Alvarez, D. Ducreux, P. Lasjaunias
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2007, 28 (7), pp.1271-9. ⟨10.3174/ajnr.A0541⟩
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BibTex
titre
Le cœur numérique - Le film
auteur
Dominique Chapelle, Philippe Moireau, Maxime Sermesant, Miguel Fernández, Hervé Delingette, Arghyro Paouri
article
Interstices, INRIA, 2007, ⟨https://interstices.info/jcms/c_23092/le-coeur-numerique-le-film⟩
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BibTex
titre
Diffusion tensor magnetic resonance imaging and fiber tracking in spinal cord lesions: current and future indications.
auteur
Denis Ducreux, Pierre Fillard, David Facon, Augustin Ozanne, Jean-François Lepeintre, Jerome Renoux, Marc Tadié, Pierre Lasjaunias
article
Neuroimaging Clinics of North America, WB Saunders, 2007, 17 (1), pp.137-47. ⟨10.1016/j.nic.2006.11.005⟩
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BibTex
titre
Measuring brain variability by extrapolating sparse tensor fields measured on sulcal lines.
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Kiralee M Hayashi, Paul M Thompson, Nicholas Ayache
article
NeuroImage, Elsevier, 2007, 34 (2), pp.639-50. ⟨10.1016/j.neuroimage.2006.09.027⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00502521/file/Fillard.Neuroimage.2006.pdf BibTex
titre
Model-based respiratory motion compensation for emission tomography image reconstruction
auteur
Mauricio Reyes Aguirre, Grégoire Malandain, Pierre Malick Koulibaly, Miguel Ángel González Ballester, Jacques Darcourt
article
Phys Med Biol, undefined or unknown publisher, 2007, 52 (12), pp.3579-600
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BibTex
titre
Dynamic Model of Communicating Hydrocephalus for Surgery Simulation
auteur
Olivier Clatz, Stéphane Litrico, Hervé Delingette, Philippe Paquis, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2007, 54 (4), pp.755-758. ⟨10.1109/TBME.2006.890146⟩
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BibTex
titre
Deformable Atlases for the Segmentation of Internal Brain Nuclei in Magnetic Resonance Imaging
auteur
Marius George Linguraru, Miguel Ángel González Ballester, Nicholas Ayache
article
International Journal of Computers, Communications and Control, Agora University of Oradea, 2007, 2 (1), pp.26--36
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BibTex
titre
High Resolution Miniprobe-based Confocal Microscopy in Combination with Video-mosaicing
auteur
Valentin Becker, Tom Vercauteren, Claus Hann von Weyern, Christian Prinz, Roland Schmid, Alexander Meining
article
Gastrointestinal Endoscopy, Elsevier, 2007, 66 (5), pp.1001--1007. ⟨10.1016/j.gie.2007.04.015⟩
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BibTex
titre
Geometric Means in a Novel Vector Space Structure on Symmetric Positive-Definite Matrices
auteur
Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2007, 29 (1), pp.328--347. ⟨10.1137/050637996⟩
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BibTex
titre
Segmentation Propagation from Deformable Atlases for Brain Mapping and Analysis
auteur
Marius George Linguraru, Tom Vercauteren, Mauricio Reyes Aguirre, Miguel Ángel González Ballester, Nicholas Ayache
article
Brain Researchearch Journal, 2007, 1 (4), pp.269--287
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BibTex
titre
A topologically faithful, tissue-guided, spatially varying meshing strategy for computing patient-specific head models for endoscopic pituitary surgery simulation
auteur
Michel Audette, Hervé Delingette, Alain H. Fuchs, O. Burgert, K. Chinzei
article
Computer Aided Surgery, Taylor & Francis, 2007, 12 (1), pp.43--52
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BibTex
titre
Glioma Dynamics and Computational Models: A Review of Segmentation, Registration, and In Silico Growth Algorithms and their Clinical Applications
auteur
Elsa Angelini, Olivier Clatz, Emmanuel Mandonnet, Ender Konukoglu, Laurent Capelle, Hugues Duffau
article
Current Medical Imaging Reviews, Bentham Science Publishers, 2007, 3 (4), pp.262-176
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BibTex
titre
Three-dimensional reconstruction of stained histological slices and 3D non-linear registration with in-vivo MRI for whole baboon brain
auteur
Julien Dauguet, Thierry Delzescaux, Françoise Condé, Jean-François Mangin, Nicholas Ayache, Philippe Hantraye, Vincent Frouin
article
Journal of Neuroscience Methods, Elsevier, 2007, 164 (1), pp.191-204
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BibTex
titre
A Computational Framework for the Statistical Analysis of Cardiac Diffusion Tensors: Application to a Small Database of Canine Hearts
auteur
Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Chenyang Xu, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2007, 26 (11), pp.1500-1514. ⟨10.1109/TMI.2007.907286⟩
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BibTex
titre
Learning Shape Correspondence for n-D curves
auteur
Alain Pitiot, Hervé Delingette, Paul Thompson
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2007, 71 (1), pp.71-88
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BibTex
titre
A three-dimensional, histological and deformable atlas of the human basal ganglia. I. Atlas construction based on immunohistochemical and MRI data
auteur
Jérôme Yelnik, Eric Bardinet, Didier Dormont, Grégoire Malandain, Sébastien Ourselin, Dominique Tandé, Carine Karachi, Nicholas Ayache, Philippe Cornu, Yves Agid
article
NeuroImage, Elsevier, 2007, 34 (2), pp.618-38
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titre
Non-rigid alignment of preoperative MRI, fMRI, and DT-MRI with intra-operative MRI for enhanced visualization and navigation in image-guided neurosurgery
auteur
Neculai Archip, Olivier Clatz, Stephen Whalen, Dan Kacher, Andriy Fedorov, Andriy Kot, Nikos Chrisochoides, Ferenc Jolesz, Alexandra Golby, Peter Black, Simon K. Warfield
article
NeuroImage, Elsevier, 2007, 35 (2), pp.609-24
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Communication dans un congrès

titre
Measuring brain variability via sulcal lines registration: a diffeomorphic approach.
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
article
International Conference on Medical Imaging and Computer Assisted Intervention, Oct 2007, Brisbane, Australia. pp.675-82, ⟨10.1007/978-3-540-75757-3_82⟩
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titre
Non-parametric Diffeomorphic Image Registration with the Demons Algorithm
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Oct 2007, Brisbane, Australia. pp.319-326, ⟨10.1007/978-3-540-75759-7_39⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00166123/file/DiffeoDemons-MICCAI07-Vercauteren.pdf BibTex
titre
SOFA: A modular yet efficient simulation framework
auteur
François Faure, Jérémie Allard, Stéphane Cotin, Paul Neumann, Pierre-Jean Bensoussan, Christian Duriez, Hervé Delingette, Laurent Grisoni
article
Surgetica 2007 - Computer-Aided Medical Interventions: tools and applications, Sep 2007, Chambéry, France. pp.101-108
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https://hal.inria.fr/inria-00319407/file/sofa-surgetica07.pdf BibTex
titre
Insight Into Efficient Image Registration Techniques and the Demons Algorithm
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Ezio Malis, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
article
Information Processing in Medical Imaging, Jul 2007, Kerkrade, Netherlands. pp.495-506, ⟨10.1007/978-3-540-73273-0_41⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00165534/file/InsightEffRegDemons-IPMI07-Vercauteren.pdf BibTex
titre
Merging overlapping orchestrations: an application to the Bronze Standard medical application
auteur
Clémentine Nemo, Tristan Glatard, Mireille Blay-Fornarino, Johan Montagnat
article
International Conference on Services Computing (SCC 2007), Jul 2007, Salt Lake City, Utah, United States. pp.364-371, 2007, 〈10.1109/SCC.2007.79 〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683168/file/scc07.pdf BibTex
titre
Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
Cluster Computing and the Grid, May 2007, Rio de Janeiro, Brazil. pp.100-107, 2007, 〈10.1109/CCGRID.2007.78〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683172/file/CCGRID07.pdf BibTex
titre
Region Tracking Algorithms on Laser Scanning Devices Applied to Cell Traffic Analysis
auteur
Aymeric Perchant, Tom Vercauteren, Fabien Oberrietter, Nicolas Savoire, Nicholas Ayache
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'07), Apr 2007, Arlington, United States. ⟨10.1109/ISBI.2007.356838⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00166610/file/RegionTrackingCellTraffic-ISBI07-Perchant.pdf BibTex
titre
SOFA - an Open Source Framework for Medical Simulation
auteur
Jérémie Allard, Stéphane Cotin, François Faure, Pierre-Jean Bensoussan, François Poyer, Christian Duriez, Hervé Delingette, Laurent Grisoni
article
MMVR 15 - Medicine Meets Virtual Reality, Feb 2007, Palm Beach, United States. pp.13-18
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https://hal.inria.fr/inria-00319416/file/MMVR07.pdf BibTex
titre
Diffeomorphic Demons Using ITK's Finite Difference Solver Hierarchy
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
article
Insight Journal -- ISC/NA-MIC Workshop on Open Science at MICCAI 2007, 2007, no address, Australia
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titre
Grid-Enabled Software Environment for Enhanced Dynamic Data-Driven Visualization and Navigation During Image-Guided Neurosurgery
auteur
Nikos Chrisochoides, Andriy Fedorov, Andriy Kot, Neculai Archip, Daniel Goldberg-Zimring, Dan Kacher, Stephen Whalen, Ron Kikinis, Ferenc Jolesz, Olivier Clatz, Simon K. Warfield, Peter Black, Alexandra Golby
article
Proc. 7th International Conference on Computational Science (ICCS), 2007, Beijing, China, China. pp.980-987, ⟨10.1007/978-3-540-72584-8⟩
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titre
Shape Analysis Using a Point-Based Statistical Shape Model Built on Correspondence Probabilities
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Heinz Handels, Nicholas Ayache
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.959-967, ⟨10.1007/978-3-540-75757-3_116⟩
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titre
Statistical Comparison of Cardiac Fibre Architectures
auteur
Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
article
Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2007 (FIMH'07), 2007, no address, United States. pp.413-423, ⟨10.1007/978-3-540-72907-5_42⟩
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titre
Evaluation Of Brain Image Nonrigid Registration Algorithms Based on Log-Euclidean MR-DTI Consistency Measures
auteur
Franciso Javier Sanchez Castro, Olivier Clatz, Julien Dauguet, Neculai Archip, Jean-Philippe Thiran, Simon K. Warfield
article
Proceedings of IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'07), 2007, Metro Washington DC, USA, United States. pp.45-48
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titre
Automatic Segmentation of the Bladder Using Deformable Models
auteur
Jimena Costa, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Proceedings of IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'07), 2007, Metro Washington DC, USA, United States. pp.904-907
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titre
Towards an Identification of Tumor Growth Parameters from Time Series of Images
auteur
Ender Konukoglu, Olivier Clatz, Pierre-Yves Bondiau, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.549-556, ⟨10.1007/978-3-540-75757-367⟩
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titre
vtkINRIA3D: A VTK Extension for Spatiotemporal Data Synchronization, Visualization and Management
auteur
Nicolas Toussaint, Maxime Sermesant, Pierre Fillard
article
Proc. of Workshop on Open Source and Open Data for MICCAI, 2007, Brisbane, Australia, Australia
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titre
Point-Based Statistical Shape Models with Probabilistic Correspondences and Affine EM-ICP
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Heinz Handels, Nicholas Ayache
article
Bildverarbeitung fuer die Medizin 2007, 2007, no address, Germany. pp.434-438, ⟨10.1007/978-3-540-71091-2_87⟩
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titre
Automatic Segmentation of Bladder and Prostate Using Coupled 3D Deformable Models
auteur
Jimena Costa, Hervé Delingette, Sébastien Novellas, Nicholas Ayache
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.252-260, ⟨10.1007/978-3-540-75757-331⟩
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titre
Statistical Shape Analysis via Principal Factor Analysis
auteur
Mauricio Reyes Aguirre, Marius George Linguraru, K. Marias, Nicholas Ayache, L.P. Nolte, Miguel Ángel González Ballester
article
Proceedings of IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2007, Metro Washington DC, USA, United States. pp.1216-1219
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titre
Anisotropic Wave Propagation and Apparent Conductivity Estimation in a Fast Electrophysiological Model: Application to XMR Interventional Imaging
auteur
Phani Chinchapatnam, Kawal Rhode, A. King, G. Gao, Y. Ma, Tobias Schaeffter, David Hawkes, Reza Razavi, Derek Hill, Simon Arridge, Maxime Sermesant
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.575-583, ⟨10.1007/978-3-540-75757-370⟩
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titre
Efficient Selection of the Most Similar Image in a Database for Critical Structures Segmentation
auteur
Olivier Commowick, Grégoire Malandain
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Part II, 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.203--210
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titre
A 3D Videoconferencing System with 2D Backwards Compatibility
auteur
J.L. Landabaso, Tommaso Mansi, C. Molina, K. Zangelin, P. Enfedaque, J. Canadas, L. Lizcano
article
Proc. 3DTV Conference 2007, 2007, no address, United States. pp.1--4, ⟨10.1109/3DTV.2007.4379446⟩
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titre
An experimental framework to validate 3D models of cardiac electrophysiology via optical imaging and MRI
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Desmond Chung, G. Liu, Elliot Mcveigh, Eugene Crystal, Graham Wright
article
Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2007 (FIMH'07), 2007, no address, United States. pp.100-109
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titre
A Recursive Anisotropic Fast Marching Approach to Reaction Diffusion Equation: Application to Tumor Growth Modeling
auteur
Ender Konukoglu, Maxime Sermesant, Olivier Clatz, Jean-Marc Peyrat, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the 20th International Conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI'07), 2007, no address, Netherlands. pp.686-699
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titre
An anisotropic multi-front fast marching method for real-time simulation of cardiac electrophysiology
auteur
Maxime Sermesant, Ender Konukoglu, Hervé Delingette, Yves Coudière, Phani Chinchapatnam, Kawal Rhode, Reza Razavi, Nicholas Ayache
article
Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2007 (FIMH'07), 2007, no address, United States. pp.160-169
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titre
Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
auteur
Pierre Fillard, Xavier Pennec, Paul Thompson, Nicholas Ayache
article
Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, Australia
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https://hal.inria.fr/inria-00616033/file/Fillard_CCA_SulcalLines_2007.pdf BibTex
titre
Mean Template for Tensor-Based Morphometry using Deformation Tensors
auteur
Natasha Leporé, Caroline Brun, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Oscar Lopez, Howard Aizenstein, James Becker, Arthur Toga, Paul Thompson
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.826-833, ⟨10.1007/978-3-540-75759-7_100⟩
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titre
MedINRIA: Medical Image Navigation and Research Tool by INRIA
auteur
Nicolas Toussaint, Jean-Christophe Souplet, Pierre Fillard
article
Proc. of MICCAI'07 Workshop on Interaction in medical image analysis and visualization, 2007, Brisbane, Australia, Australia
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https://hal.inria.fr/inria-00616047/file/Fillard.MICCAI07.InteractionWorkshop.pdf BibTex
titre
CardioSense3D: Patient-Specific Cardiac Simulation
auteur
Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Jean-Marc Peyrat, Nicholas Ayache, Kawal Rhode, Reza Razavi, Elliot Mcveigh, Dominique Chapelle, Jacques Sainte-Marie, Philippe Moireau, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau, K. Djabella, Q. Zhang, Michel Sorine
article
Proceedings of IEEE International Conference on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'07), 2007, Metro Washington DC, USA, United States. pp.628-631
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titre
Clinical Evaluation of a Respiratory Gated Guidance System for Liver Punctures
auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.77--85, ⟨10.1007/978-3-540-75759-7_10⟩
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titre
Comparison of Standard and Riemannian Fluid Registration for Tensor-Based Morphometry in HIV/AIDS
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Oscar Lopez, Howard Aizenstein, James Becker, Arthur Toga, Paul Thompson
article
Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, United States
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Chapitre d'ouvrage

titre
Applications de la géométrie discrète en imagerie médicale
auteur
Grégoire Malandain
article
Coeurjolly, David and Montanvert, Annick and Chassery, Jean-Marc. Géométrie discrète et images numériques, Hermès, pp.371--379, 2007, Traités IC2
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Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2007 - Part I
auteur
Nicholas Ayache, Sébastien Ourselin, Anthony Maeder
article
Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. 4791, Springer, 2007, LNCS, ⟨10.1007/978-3-540-75757-3⟩
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titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2007 - Part II
auteur
Nicholas Ayache, Sébastien Ourselin, Anthony Maeder
article
Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. 4792, Springer, 2007, LNCS, ⟨10.1007/978-3-540-75759-7⟩
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Brevet

titre
Robust Mosaicing Method with Correction of Motion Distorsions and Tissue Deformations for In Vivo Fibered Microscopy
auteur
Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
article
United States, Patent n° : US Patent US20090041314. 2007
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Rapport

titre
Notes on Convex Sets, Polytopes, Polyhedra Combinatorial Topology, Voronoi Diagrams and Delaunay Triangulations
auteur
Jean Gallier
article
[Research Report] RR-6379, INRIA. 2007, pp.191
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https://hal.inria.fr/inria-00193831/file/convex-RR.pdf BibTex
titre
Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
auteur
Pierre Fillard, Xavier Pennec, Paul Thompson, Nicholas Ayache
article
[Research Report] RR-6241, INRIA. 2007, pp.12
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https://hal.inria.fr/inria-00159699/file/RR-6241.pdf BibTex

Thèse

titre
Création et utilisation d'atlas anatomiques numériques pour la radiothérapie
auteur
Olivier Commowick
article
Interface homme-machine [cs.HC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2007. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00133432/file/These.pdf BibTex

2006

Article dans une revue

titre
[Functional MRI in brain tumours]
auteur
D. Ducreux, F. Dhermain, Pierre Fillard
article
Cancer Radiothérapie, Elsevier Masson, 2006, 10 (6-7), pp.330-3. ⟨10.1016/j.canrad.2006.07.015⟩
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BibTex
titre
Blockwise processing applied to brain microvascular network study
auteur
Céline Fouard, Grégoire Malandain, Steffen Prohaska, Malte Westerhoff
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2006, 25 (10), pp.1319 - 1328. ⟨10.1109/TMI.2006.880670⟩
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BibTex
titre
MR diffusion tensor imaging and fiber tracking in inflammatory diseases of the spinal cord.
auteur
J. Renoux, D. Facon, P. Fillard, I. Huynh, P. Lasjaunias, D. Ducreux
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2006, 27 (9), pp.1947-51
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BibTex
titre
Log-Euclidean metrics for fast and simple calculus on diffusion tensors.
auteur
Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Magnetic Resonance in Medicine, Wiley, 2006, 56 (2), pp.411-21. ⟨10.1002/mrm.20965⟩
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BibTex
titre
[Diffusion tensor imaging and tractography of central pontine myelinolysis]
auteur
M. Liberatore, C. Denier, P. Fillard, M. C. Petit-Lacour, F. Benoudiba, P. Lasjaunias, D. Ducreux
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, Elsevier Masson, 2006, 33 (3), pp.189-93
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BibTex
titre
A Novel Three-Dimensional Computer-Assisted Method for a Quantitative Study of Microvascular Networks of the Human Cerebral Cortex
auteur
Francis Cassot, Frédéric Lauwers, Céline Fouard, Steffen Prohaska, Valérie Lawers-Cances
article
Microcirculation, Wiley, 2006, 13 (1), pp.1--18. ⟨10.1080/10739680500383407⟩
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BibTex
titre
MR diffusion tensor imaging and fiber tracking in 5 spinal cord astrocytomas.
auteur
D. Ducreux, J.-F. Lepeintre, P. Fillard, C. Loureiro, M. Tadié, P. Lasjaunias
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2006, 27 (1), pp.214-6
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BibTex
titre
Building Maps of Local Apparent Conductivity of the Epicardium with a 2D Electrophysiological Model of the Heart
auteur
Valérie Moreau-Villéger, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Hiroshi Ashikaga, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2006, 53 (8), pp.1457-1466. ⟨10.1109/TBME.2006.877794⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00614992/file/moreauIEEETBME05.pdf BibTex
titre
Robust Mosaicing with Correction of Motion Distortions and Tissue Deformation for In Vivo Fibered Microscopy
auteur
Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2006, 10 (5), pp.673--692. ⟨10.1016/j.media.2006.06.006⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00163961/file/Mosaicing-Vercauteren-MedIA-elsart.pdf BibTex
titre
Cardiac function estimation from MRI using a heart model and data assimilation: Advances and difficulties
auteur
Maxime Sermesant, Philippe Moireau, Oscar Camara, Jacques Sainte-Marie, Rado Andriantsimiavona, Robert Cimrman, Derek Hill, Dominique Chapelle, Reza Razavi
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2006, 10 (4), pp.642--656
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BibTex
titre
La simulation de Chirurgie Hépatique
auteur
Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Pour la science, Pour la science, 2006, 52 (52), pp.106-109
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BibTex
titre
Modèles Biomathématiques de Croissance Des Gliomes : Recherche en Informatique et Perspectives en Neuro-oncologie
auteur
Olivier Clatz, Emmanuel Mandonnet, Stéphane Chanalet, Christine Lebrun, Ender Konukoglu, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Pierre-Yves Bondiau
article
Neurologies, Expressions Santé, 2006, 9 (93), pp.665-667
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BibTex
titre
Realistic numerical modelling of human head tissues exposure to electromagnetic waves from cellular phones
auteur
Serge Piperno, Gilles Scarella, Olivier Clatz, Stéphane Lanteri, G. Beaume, S. Oudot, J.-P. Pons, Pascal Joly, J. Wiart
article
Comptes rendus de l’Académie des sciences. Série IV, Physique, astrophysique, Elsevier, 2006, 7 (5), pp.501-508
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BibTex
titre
Computational Models for Image Guided, Robot-Assisted and Simulated Medical Interventions
auteur
Hervé Delingette, Xavier Pennec, Luc Soler, Jacques Marescaux, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the IEEE, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2006, 94 (9), pp.1678- 1688. ⟨10.1109/JPROC.2006.880718⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00615001/file/IEEE-proceedings-Robotics.pdf BibTex
titre
Intrinsic Statistics on Riemannian Manifolds: Basic Tools for Geometric Measurements
auteur
Xavier Pennec
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2006, 25 (1), pp.127-154. ⟨10.1007/s10851-006-6228-4⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00614994/file/Pennec.JMIV06.pdf BibTex
titre
Early detection of cognitive impairment in relapsing-remitting multiple sclerosis: functional-anatomical correlations and longitudinal follow-up
auteur
Caroline Bensa, Christelle Bertogliati, Stéphane Chanalet, Grégoire Malandain, P. Bedoucha, Christine Lebrun
article
Revue Neurologique, Elsevier Masson, 2006, 162 (12), pp.1221
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BibTex
titre
An Electromechanical Model of the Heart for Image Analysis and Simulation
auteur
Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2006, 25 (5), pp.612-625
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00614991/file/TMI2006Sermesant.pdf BibTex
titre
Reconstruction of Coronary Arteries from a Single Rotational X-Ray Projection Sequence
auteur
Christophe Blondel, Grégoire Malandain, Régis Vaillant, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2006, 25 (5), pp.653--663. ⟨10.1109/TMI.2006.873224⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00614993/file/blondel-tmi-2006.pdf BibTex
titre
A Riemannian Framework for Tensor Computing
auteur
Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2006, 66 (1), pp.41--66. ⟨10.1007/s11263-005-3222-z⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00614990/file/Pennec.IJCV05.pdf BibTex
titre
Segmentation of focal cortical dysplasia lesions on MRI using level set evolution
auteur
Olivier Colliot, Tommaso Mansi, N. Bernasconi, V. Naessens, D. Klironomos, A. Bernasconi
article
NeuroImage, Elsevier, 2006, 32 (4), pp.1621-1630. ⟨10.1016/j.neuroimage.2006.04.225⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00614998/file/colliot_neuroimage2006_ls_fcd_preprint.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Left-Invariant Riemannian Elasticity: a distance on shape diffeomorphisms ?
auteur
Xavier Pennec
article
1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.1-13
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00634098/file/Pennec_MFCA06.pdf BibTex
titre
Performance evaluation of grid-enabled registration algorithms using bronze-standards
auteur
Tristan Glatard, Xavier Pennec, Johan Montagnat
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI 2006), Oct 2006, Copenhagen, Denmark. Springer, 4191, pp.152-160, 2006, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/11866763_19〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683176/file/MICCAI06.pdf BibTex
titre
Efficient services composition for grid-enabled data-intensive applications
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
High Performance and Distributed Computing, Jun 2006, Paris, France. pp.333-334, 2006, 〈10.1109/HPDC.2006.1652170〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683201/file/HPDC06.pdf BibTex
titre
Medical image registration algorithms assessment: Bronze Standard application enactment on grids using the MOTEUR workflow engine
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
HealthGrid conference (HealthGrid'06), Valencia, Spain, June 7-9, Jun 2006, Valencia, Spain. pp.93-103, 2006
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683188/file/HealthGrid06b.pdf BibTex
titre
An experimental comparison of Grid5000 clusters and the EGEE grid
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
Experimental Grid testbeds for the assessment of large-scale distributed applications and tools, Jun 2006, Paris, France. pp.1-10, 2006
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683199/file/EXPGRID06.pdf BibTex
titre
Data composition patterns in service-based workflows
auteur
Johan Montagnat, Tristan Glatard, Diane Lingrand
article
Workshop on Workflows in Support of Large-Scale Science (WORKS'06), Jun 2006, Paris, France. pp.1-10
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683193/file/WORKS06.pdf BibTex
titre
Generic web service wrapper for efficient embedding of legacy codes in service-based workflows
auteur
Tristan Glatard, David Emsellem, Johan Montagnat
article
Grid-Enabling Legacy Applications and Supporting End Users Workshop, Jun 2006, Paris, France. pp.1-10
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683196/file/GELA06.pdf BibTex
titre
Probabilistic and dynamic optimization of job partitioning on a grid infrastructure
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
Parallel, Distributed and network-based Processing, Feb 2006, Montbéliard-Sochaux, France. pp.231-238, 2006, 〈10.1109/PDP.2006.61〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683203/file/PDP06.pdf BibTex
titre
Health-e-Child: An Integrated Biomedical Platform for Grid-Based Pediatrics
auteur
J. Freund, D. Comaniciu, Y. Ioannis, P. Liu, Richard Mcclatchey, E. Moley-Fletcher, Xavier Pennec, Giacomo Pongiglione, X.S. Zhou
article
Proc of Health-Grid 2006, 2006, Valancia, Spain, Spain. pp.259-270
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titre
Extrapolating Tumor Invasion Margins for Physiologically Determined Radiotherapy Regions
auteur
Ender Konukoglu, Olivier Clatz, Pierre-Yves Bondiau, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, no address, Denmark. pp.338--346
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titre
Assessment of Brace Local Action on Vertebrae Relative Poses
auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle
article
Research into Spinal Deformities, 2006, no address, United States. pp.372--378
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titre
Toward Real-Time, Image Guided Neurosurgery Using Distributed and Grid Computing
auteur
Nikos Chrisochoides, Andriy Fedorov, Andriy Kot, Neculai Archip, Peter Black, Olivier Clatz, Alexandra Golby, Ron Kikinis, Simon K. Warfield
article
SuperComputing06, 2006, Tampa, Florida, USA, United States
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titre
Principal Spine Shape Deformation Modes Using Riemannian Geometry and Articulated Models
auteur
Jonathan Boisvert, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Farida Cheriet, Nicholas Ayache
article
Proc of the IV Conference on Articulated Motion and Deformable Objects, Andratx, Mallorca, Spain, 11-14 July, 2006, no address, Spain. pp.346--355, ⟨10.1007/11789239_36⟩
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titre
A Log-Euclidean Framework for Statistics on Diffeomorphisms
auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, Copenhaguen, Denmark. pp.924--931, ⟨10.1007/11866565_113⟩
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titre
A Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Rigid or Affine Registration
auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the Third International Workshop on Biomedical Image Registration (WBIR'06), 2006, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.120-127, ⟨10.1007/11784012_15⟩
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titre
Unstructured mesh solvers for the simulation of electromagnetic wave propagation and induced temperature elevation in living tissues
auteur
Olivier Clatz, Stéphane Lanteri, Serge Piperno
article
7th International Symposium on Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 2006, no address, French Southern Territories
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titre
Towards a Statistical Atlas of Cardiac Fiber Structure
auteur
Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
article
Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, no address, Denmark. pp.297--304, ⟨10.1007/11866565_37⟩
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titre
A topologically faithful, tissue-guided, spatially varying meshing strategy for computing patient-specific head models for endoscopic pituitary surgery simulation
auteur
Michel Audette, Hervé Delingette, Alain H. Fuchs, O. Burgert, K. Chinzei
article
Studies in health technology and informatics, Medicine Meets Virtual Reality (MMVR), 2006, no address, United States. pp.22--27
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titre
Evaluation of Atlas Construction Strategies in the Context of Radiotherapy Planning
auteur
Olivier Commowick, Grégoire Malandain
article
Proceedings of the SA2PM Workshop (From Statistical Atlases to Personalized Models), 2006, Copenhagen, Denmark
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titre
An interactive Intensity- and Feature-Based Non-Rigid Registration Framework for 3D Medical Images
auteur
Antoine Azar, Chenyang Xu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.824--827, ⟨10.1109/ISBI.2006.1625045⟩
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titre
3D Anatomic Variability Assesment of the Scoliotic Spine Using Statistics on Lie Groups
auteur
Jonathan Boisvert, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle, Farida Cheriet
article
Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.750--753, ⟨10.1109/ISBI.2006.1625025⟩
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titre
An Efficient Locally Affine Framework for the Registration of Anatomical Structures
auteur
Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Jimena Costa, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
article
Proceedings of the Third IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.478-481
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titre
Stereo Reconstruction of the Epicardium for Optical Fluorescence Imaging
auteur
Desmond Chung, Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Graham Wright
article
MICCAI Workshop on Biophotonics Imaging for Diagnostics and Treatment, 2006, no address, French Southern Territories. pp.33-40
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titre
Processing and Mosaicing of Fibered Confocal Images
auteur
Nicholas Ayache, Tom Vercauteren, Grégoire Malandain, Fabien Oberrietter, Nicolas Savoire, Aymeric Perchant
article
MICCAI Workshop on Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB'06), 2006, no address, Denmark
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titre
Clinical DT-MRI estimation, smoothing and fiber tracking with log-Euclidean metrics
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.786-789, ⟨10.1109/ISBI.2006.1625034⟩
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titre
Aid of Computer Modelling to Identify Ventricular Reentries due to Infarct Scars
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Alexander Dick, John Graham, Yves Coudière, Graham Wright
article
15th World Congress in Cardiac Electrophysiology and Cardiac Techniques (Cardiostim'06), 2006, no address, French Southern Territories
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BibTex
titre
A theoretical model of ventricular reentry and its radiofrequency ablation therapy
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Yves Coudière, J. Graham, M. Bronskill, Alexander Dick, Graham Wright
article
3rd IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: Macro to Nano (ISBI'06), 2006, no address, United States. pp.33-36
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BibTex
titre
Assessment of Radio-frequency Ablation of Ventricular Arrhythmias Via Magnetic Resonance Imaging and Computer Modelling
auteur
Mihaela Pop, Maxime Sermesant, Alexander Dick, John Graham, Yves Coudière, Graham Wright
article
15th World Congress in Cardiac Electrophysiology and Cardiac Techniques (Cardiostim'06), 2006, no address, French Southern Territories
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BibTex
titre
Improved segmentation of focal cortical dysplasia lesions on MRI using expansion towards cortical boundaries
auteur
Olivier Colliot, Tommaso Mansi, P. Besson, N. Bernasconi, A. Bernasconi
article
3rd IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: Nano to Macro (ISBI), 2006, Arlington, VA, USA, United States. pp.323-326
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BibTex
titre
A novel framework for the 3D analysis of spine deformation modes.
auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle
article
Research into Spinal Deformities, 2006, no address, United States. pp.176-81
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Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Proceedings of the MICCAI Workshop - From Statistical Atlases to Personalized Models: Understanding Complex Diseases in Populations and Individuals
auteur
Hervé Delingette, Alejandro Frangi
article
Delingette, Hervé and Frangi, Alejandro. undefined or unknown publisher, 2006
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BibTex
titre
Proceedings of the First International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'06) - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang. MICCAI - Inria, pp.187, 2006
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https://hal.inria.fr/inria-00614989/file/MFCA06.pdf BibTex

HDR

titre
Statistical Computing on Manifolds for Computational Anatomy
auteur
Xavier Pennec
article
Computer Science [cs]. Université Nice Sophia Antipolis, 2006
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00633163/file/Pennec_HDR.pdf BibTex

Brevet

titre
Dispositif perfectionné de traitement ou de production d'images de tenseurs
auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
article
France, Patent n° : International application number PCT/FR2006/000774. 2006
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BibTex
titre
Device for processing raw images or tensor images
auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
article
United States, Patent n° : US patent US 2008/0170802. 2006
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Rapport

titre
Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
2006, pp.23
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00691828/file/RR-06.35-T.GLATARD.pdf BibTex
titre
Dynamic Model of Communicating Hydrocephalus for Surgery Simulation
auteur
Olivier Clatz, Stéphane Litrico, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
[Research Report] RR-5934, INRIA. 2006, pp.20
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https://hal.inria.fr/inria-00080553/file/RR-5934.pdf BibTex
titre
Towards a Statistical Atlas of Cardiac Fiber Architecture
auteur
Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
article
[Research Report] RR-5906, INRIA. 2006
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https://hal.inria.fr/inria-00071359/file/RR-5906.pdf BibTex
titre
Measuring Brain Variability by Extrapolating Sparse Tensor Fields Measured on Sulcal Lines
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Kiralee M. Hayashi, Paul M. Thompson, Nicholas Ayache
article
[Research Report] RR-5887, INRIA. 2006
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https://hal.inria.fr/inria-00071381/file/RR-5887.pdf BibTex
titre
A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Affine Registration
auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
[Research Report] RR-5865, INRIA. 2006, pp.46
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https://hal.inria.fr/inria-00070161/file/RR-5865.pdf BibTex

Thèse

titre
Processing Data in Lie Groups : An Algebraic Approach. Application to Non-Linear Registration and Diffusion Tensor MRI
auteur
Vincent Arsigny
article
Human-Computer Interaction [cs.HC]. Ecole Polytechnique X, 2006. English
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https://pastel.archives-ouvertes.fr/tel-00121162/file/arsigny_phd.pdf BibTex

2005

Article dans une revue

titre
Recaler pour mieux soigner
auteur
Xavier Pennec
article
Pour la science, Pour la science, 2005, pp.126--131
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BibTex
titre
Simulation de chirurgie hépatique
auteur
Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Interstices, INRIA, 2005, ⟨https://interstices.info/jcms/c_12239/simulation-de-chirurgie-hepatique⟩
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BibTex
titre
Brain MR diffusion tensor imaging and fibre tracking to differentiate between two diffuse axonal injuries.
auteur
D. Ducreux, I. Huynh, P. Fillard, J. Renoux, M. C. Petit-Lacour, K. Marsot-Dupuch, P. Lasjaunias
article
Neuroradiology, Springer Verlag, 2005, 47 (8), pp.604-8. ⟨10.1007/s00234-005-1389-1⟩
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BibTex
titre
Removing Tetrahedra from manifold tetrahedralisation : application to real-time surgical simulation
auteur
Clément Forest, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2005, 9 (2), pp.113--122. ⟨10.1016/j.media.2004.11.003⟩
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BibTex
titre
Polyrigid and Polyaffine Transformations: a Novel Geometrical Tool to Deal with Non-Rigid Deformations - Application to the registration of histological slices
auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2005, 9 (6), pp.507-523. ⟨10.1016/j.media.2005.04.001⟩
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BibTex
titre
Simulation of Cardiac Pathologies using an Electromechanical Biventricular Model and XMR Interventional Imaging
auteur
Maxime Sermesant, Kawal Rhode, G. Sanchez-Ortiz, Oscar Camara, Rado Andriantsimiavona, S. Hegde, Daniel Rueckert, Pier Lambiase, C. Bucknall, E. Rosenthal, Hervé Delingette, Derek Hill, Nicholas Ayache, Reza Razavi
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2005, 9 (5), pp.467--480
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BibTex
titre
La tomographie en mouvement
auteur
Grégoire Malandain, Mauricio Reyes Aguirre
article
Pour la science, Pour la science, 2005, 338, pp.132--137
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BibTex
titre
Grid-enabling medical image analysis
auteur
Cécile Germain-Renaud, Vincent Breton, Patrick Clarysse, Yann Gaudeau, Tristan Glatard, Emmanuel Jeannot, Yannick Legre, Charles Loomis, Isabelle Magnin, Johan Montagnat, Jean-Marie Moureaux, Angel Osorio, Xavier Pennec, Romain Texier
article
International Journal of Clinical Monitoring and Computing, Springer Verlag, 2005, 19 (4-5), pp.339-349. ⟨10.1007/s10877-005-0679-9⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00174284/file/AGIRJCMCALL.PDF BibTex
titre
Atlas-based automatic segmentation of MR images: validation study on the brainstem in radiotherapy context
auteur
Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Stéphane Chanalet, Pierre-Yves Marcy, Jean-Louis Habrand, François Fauchon, Philippe Paquis, Adel Courdi, Olivier Commowick, Isabelle Rutten, Nicholas Ayache
article
International Journal of Radiation Oncology - Biology - Physics, Elsevier, 2005, 61 (1), pp.289-98. ⟨10.1016/j.ijrobp.2004.08.055⟩
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BibTex
titre
An augmented reality system to guide radio-frequency tumor ablation
auteur
Stéphane Nicolau, Alain Garcia, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
article
Computer Animation and Virtual Worlds, Wiley, 2005, 16 (1), pp.1--10. ⟨10.1002/cav.52⟩
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BibTex
titre
MR diffusion tensor imaging and fiber tracking in spinal cord compression.
auteur
David Facon, Augustin Ozanne, Pierre Fillard, Jean-François Lepeintre, Caroline Tournoux-Facon, Denis Ducreux
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2005, 26 (6), pp.1587-94
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BibTex
titre
A system for real-time XMR guided cardiovascular intervention
auteur
Kawal Rhode, Maxime Sermesant, D. Brogan, S. Hegde, J. Hipwell, Pier Lambiase, E. Rosenthal, C. Bucknall, S. Qureshi, J. Gill, Reza Razavi, Derek Hill
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2005, 24 (11), pp.1428-1440
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BibTex
titre
Robust Non-Rigid Registration to Capture Brain Shift from Intra-Operative MRI
auteur
Olivier Clatz, Hervé Delingette, Ion-Florin Talos, Alexandra Golby, Ron Kikinis, Ferenc Jolesz, Nicholas Ayache, Simon K. Warfield
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2005, 24 (11), pp.1417-1427
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BibTex
titre
Realistic Simulation of the 3D Growth of Brain Tumors in MR Images Coupling Diffusion with Mass Effect
auteur
Olivier Clatz, Maxime Sermesant, Pierre-Yves Bondiau, Hervé Delingette, Simon K. Warfield, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2005, 24 (10), pp.1334-1346
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BibTex
titre
Measurement of total pulmonary arterial compliance using invasive pressure monitoring and MR flow quantification during MR-guided cardiac catheterization
auteur
V. Muthurangu, D. Atkinson, Maxime Sermesant, M.E. Miquel, S. Hegde, R. Johnson, Rado Andriantsimiavona, Andrew Taylor, E. Baker, R. Tulloh, Derek Hill, Reza Razavi
article
AJP - Heart and Circulatory Physiology, American Physiological Society, 2005, 289 (3), pp.1301-1306. ⟨10.1152/ajpheart.00957.2004⟩
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BibTex
titre
Hepatic Surgery Simulation
auteur
Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Communications- ACM, Association for Computing Machinery, 2005, 48 (2), pp.31--36. ⟨10.1145/1042091.1042116⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00615659/file/HDNAC.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Riemannian elasticity: a statistical regularization framework for non-linear registration.
auteur
Xavier Pennec, R. Stefanescu, V. Arsigny, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
article
International Conference on Medical Image computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.943-50, ⟨10.1007/11566489_116⟩
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BibTex
titre
Fast and simple calculus on tensors in the log-Euclidean framework.
auteur
Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
International Conference on Medical Image computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.115-22, ⟨10.1007/11566465_15⟩
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BibTex
titre
Mosaicing of Confocal Microscopic In Vivo Soft Tissue Video Sequences
auteur
Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, United States. pp.753-760, ⟨10.1007/11566465_93⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00166791/file/miccai05_mosaicing_vercauteren.pdf BibTex
titre
Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.
auteur
Olivier Commowick, Radu Stefanescu, Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.927-34, ⟨10.1007/11566489_114⟩
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BibTex
titre
Extrapolation of sparse tensor fields: application to the modeling of brain variability.
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Paul M. Thompson, Nicholas Ayache
article
International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2005, Glenwood Springs, CO, United States. pp.27-38, ⟨10.1007/11505730_3⟩
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BibTex
titre
Non-Linear 2D and 3D Registration Using Block-Matching and B-Splines
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Hans Handels, Nicholas Ayache
article
Bildverarbeitung fuer die Medizin 2005, Deutsches Krebsforschungszentrum, 2005, Heidelberg, Germany, Germany. pp.325-329, ⟨10.1007/3-540-26431-0_67⟩
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BibTex
titre
Modélisation macroscopique de la croissance des tumeurs cérébrales
auteur
Olivier Clatz, Pierre-Yves Bondiau, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Congrès Français de Mécanique (CFM), 2005, Troyes, France
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BibTex
titre
On the Adequacy of Principal Factor Analysis for the Study of Shape Variability
auteur
Miguel Ángel González Ballester, Marius George Linguraru, Mauricio Reyes Aguirre, Nicholas Ayache
article
SPIE Medical Imaging '05, 2005, no address, United States. pp.1392--1399
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BibTex
titre
A topologically faithful, tissue-guided, spatially varying meshing strategy for computing patient-specific head models for endoscopic pituitary surgery simulation
auteur
Michel Audette, Hervé Delingette, Alain H. Fuchs, O. Burgert, K. Chinzei
article
Computer Vision for Biomedical Image Applications (CVBIA), 2005, Beijing, China, China. pp.178-188
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BibTex
titre
Integrating Tactile and Force Feedback with Finite Element Models
auteur
Christopher Wagner, Olivier Clatz, Ross Feller, Douglas Perrin, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Robert Howe
article
International Conference on Robotics and Automation (ICRA'05), 2005, Barcelona, Spain
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BibTex
titre
Hybrid Formulation of the Model-Based Non-Rigid Registration Problem to Improve Accuracy and Robustness
auteur
Olivier Clatz, Hervé Delingette, Ion-Florin Talos, Alexandra Golby, Nicholas Ayache, Ron Kikinis, Ferenc Jolesz, Simon K. Warfield
article
Proceedings of MICCAI'05, 2005, no address, United States. pp.295--302, ⟨10.1007/1156648937⟩
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BibTex
titre
Segmentation of Focal Cortical Dysplasia Lesions Using a Feature-Based Level Set
auteur
Olivier Colliot, Tommaso Mansi, N. Bernasconi, V. Naessens, D. Klironomos, A. Bernasconi
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'05), 2005, Palm Springs (CA), USA, United States. pp.375-382, ⟨10.1007/1156646547⟩
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BibTex
titre
A Fast-Marching Approach to Cardiac Electrophysiology Simulation for XMR Interventional Imaging
auteur
Maxime Sermesant, Yves Coudière, Valérie Moreau-Villéger, Kawal Rhode, Derek Hill, Reza Razavi
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'05), 2005, Palm Springs, California, United States. pp.607--615, ⟨10.1007/1156648975⟩
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BibTex
titre
Respiratory Motion Correction in Emission Tomography Imaging
auteur
Mauricio Reyes Aguirre, Grégoire Malandain, Jacques Darcourt, Pierre Malick Koulibaly
article
Fully Three-Dimensional Image Reconstruction Meeting in Radiology and Nuclear Medicine, 2005, Salt Lake City, Utah, USA, United States
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BibTex
titre
Respiratory Motion Correction in Emission Tomography Image Reconstruction
auteur
Mauricio Reyes Aguirre, Grégoire Malandain, Pierre Malick Koulibaly, Miguel Ángel González Ballester, Jacques Darcourt
article
Proceedings of MICCAI'05, Part II, 2005, Palm Springs, California, United States. pp.369--376, ⟨10.1007/1156648946⟩
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BibTex
titre
A Riemannian Framework for the Processing of Tensor-Valued Images
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
article
Deep Structure, Singularities, and Computer Vision (DSSCV), 2005, no address, Netherlands. pp.112--123, ⟨10.1007/11577812_10⟩
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BibTex
titre
A complete Augmented Reality Guidance System for Liver Punctures: First Clinical Evaluation
auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
article
Proceedings of the 8th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Part I, 2005, Palm Springs, CA, USA, October 26-29, United States. pp.539--547, ⟨10.1007/11566465_67⟩
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BibTex
titre
A level set driven by MR features of focal cortical dysplasia for lesion segmentation
auteur
Olivier Colliot, Tommaso Mansi, N. Bernasconi, V. Naessens, D. Klironomos, A. Bernasconi
article
Medical Image Understanding and Analysis (MIUA), 2005, no address, United States. pp.239-242
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BibTex
titre
Estimating Local Apparent Conductivity with a 2-D Electrophysiological Model of the Heart
auteur
Valérie Moreau-Villéger, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Hiroshi Ashikaga, Owen Faris, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
article
Proc. of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2005 (FIMH'O5), 2005, no address, Spain. pp.256-266, ⟨10.1007/1149462126⟩
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BibTex
titre
Computer-Assisted Interventions on liver: Feasibility of the anchor needle technique for real-time targeting of lesions with respiratory motion
auteur
Ivan Bricault, Simon Dimaio, Olivier Clatz, Sonia Pujol, Kirby Vosburgh, Ron Kikinis
article
Surgetica, 2005, Chambéry, France
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titre
Early diagnosis of human TSE by multimodality MRI: Spectroscopic detection of thalamic gliosis in a patient with FFI and normal FLAIR and diffusion-weighted imaging
auteur
Stéphane Haïk, Damien Galanaud, Baptiste Faucheux, N. Privat, I. Laffont-Proust, Marius George Linguraru, Nicholas Ayache, J.J. Hauw, Didier Dormont, Jean-Philippe Brandel
article
Proceedings of Prions 2005: Between Fundamentals and Society's Needs, German TSE research platform, 2005, Düsseldorf, Germany. pp.176
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Retrospective cross-evaluation of an histological and deformable 3D atlas of the basal ganglia on series of Parkinsonian patients treated by deep brain stimulation (DBS)
auteur
Eric Bardinet, Didier Dormont, Grégoire Malandain, Manik Bhattacharjee, Bernard Pidoux, Christian Saleh, Philippe Cornu, Nicholas Ayache, Yves Agid, Jérôme Yelnik
article
Proceedings of MICCAI'05, 2005, Palm Springs, California, United States. pp.385--393, ⟨10.1007/1156648948⟩
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Realistic numerical modeling of human head tissues exposure to electromagnetic waves from mobiles phones
auteur
Gilles Scarella, Olivier Clatz, Stéphane Lanteri, Grégory Beaume, Steve Oudot, Jean-Philippe Pons, Serge Piperno, Patrick Joly, Joe Wiart
article
Seventh International Conference on Mathematical and Numerical Aspects of Wave Propagation, 2005, Brown University, Rhode Island, United States
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titre
Liver registration for the follow-up of hepatic tumors
auteur
Arnaud Charnoz, Vincent Agnus, Grégoire Malandain, Clément Forest, Mohamed Tajine, Luc Soler
article
Proceedings of MICCAI'05, 2005, Palm Springs, California, United States. pp.155--162, ⟨10.1007/1156648920⟩
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titre
Tree Matching Applied to Vascular System
auteur
Arnaud Charnoz, Vincent Agnus, Grégoire Malandain, Luc Soler, Mohamed Tajine
article
Graph-Based Representations in Pattern Recognition, 2005, no address, France. pp.183--192, ⟨10.1007/b107037⟩
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Chapitre d'ouvrage

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Non-Rigid MR/US Registration for Tracking Brain Deformations
auteur
Xavier Pennec, Alexis Roche, Pascal Cathier, Nicholas Ayache
article
Blum, R.S. and Liu, Zh. Multi-Sensor Image Fusion and Its Applications, 26, CRC Press - Taylor and Francis, pp.107--143, 2005, Signal Processing and Communications
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titre
Automated Image Segmentation: Issues and Applications
auteur
Alain Pitiot, Hervé Delingette, Paul Thompson
article
Leondes, Cornelius T. Medical Imaging Systems Technology, 3, World Scientific, 2005
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Autre publication

titre
An optimized workflow enactor for data-intensive grid applications
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
article
I3S laboratory Research Report (I3S/RR-2005-32-FR), Sophia Antipolis, France. 2005, pp.17
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00691833/file/RR-05.32-T.GLATARD.pdf BibTex

Thèse

titre
Méthodes variationnelles et séquentielles pour l'étude de la contraction cardiaque
auteur
Valérie Moreau-Villéger
article
Interface homme-machine [cs.HC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2005. Français. ⟨NNT : 2005NICE4086⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00634169/file/moreauThese2005.pdf BibTex

2004

Article dans une revue

titre
Le traitement numérique des images médicales
auteur
Nicholas Ayache
article
Interstices, INRIA, 2004, ⟨https://interstices.info/jcms/c_6522/le-traitement-numerique-des-images-medicales⟩
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Communication dans un congrès

titre
An Augmented Reality and Virtuality Interface for a Puncture Guidance System: Design and Validation on an Abdominal Phantom
auteur
Stéphane Nicolau, Jérôme Schmid, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
article
MIAR - Medical Imaging and Augmented Reality - 2004, Aug 2004, Beijing, China. pp.302--310, ⟨10.1007/b99698⟩
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