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NUMED Research team

NUMED team publications

2019

Journal articles

titre
Chemotactic waves of bacteria at the mesoscale
auteur
Vincent Calvez
article
Journal of the European Mathematical Society, European Mathematical Society, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01340375/file/Calvez-Chemotactic-Waves-preprint-HAL-2016-07-01.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Emergence of homogamy in a two-loci stochastic population model
auteur
Camille Coron, Manon Costa, Fabien Laroche, Hélène Leman, Charline Smadi
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02043536/file/Homogamy_v0.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Population parametrization of costly black box models using iterations between SAEM algorithm and kriging
auteur
Emmanuel Grenier, Celine Helbert, Violaine Louvet, Adeline Samson, Paul Vigneaux
article
Computational and Applied Mathematics, Springer Verlag, 2018, 37 (1), pp.161-173. ⟨10.1007/s40314-016-0337-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01224004/file/GHLSV16hal.pdf BibTex
titre
Large time monotonicity of solutions of reaction-diffusion equations in $R^N$
auteur
Emmanuel Grenier, François Hamel
article
Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, Elsevier, 2018, 112, pp.89-117. ⟨10.1016/j.matpur.2017.09.015⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01324533/file/grenier-hamel.pdf BibTex
titre
Traveling Wave and Aggregation in a Flux-Limited Keller-Segel Model
auteur
Vincent Calvez, Benoît Perthame, Shugo Yasuda
article
Kinetic and Related Models , AIMS, 2018, 11 (4), pp.891-909. ⟨10.3934/krm.2018035⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01591490/file/manuscript_krm.pdf BibTex
titre
Usefulness of Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus (KSHV) DNA Viral Load in Whole Blood for Diagnosis and Monitoring of KSHV-Associated Diseases
auteur
Aude Jary, Valentin Leducq, Romain Palich, Adélie Gothland, Diane Descamps, Véronique Joly, Sidonie Lambert-Niclot, Corinne Amiel, Ana Canestri, Audrey Mirand, Elyanne Gault, Astrid Vabret, Marc-Antoine Valantin, Christine Katlama, Vincent Calvez, Nicolas Dupin, Jean-Philippe Spano, Anne-Geneviève Marcelin
article
Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2018, 56 (6), pp.1-4. ⟨10.1128/JCM.00569-18⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01984174/file/JCM_Jary%202018.pdf BibTex

Theses

titre
Analyse mathématique et numérique d'écoulements de fluides à seuil
auteur
Arthur Marly
article
Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université de Lyon, 2018. Français. ⟨NNT : 2018LYSEN034⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02145210/file/MARLY_Arthur_2018LYSEN034_These.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Analysis of temozolomide resistance in low-grade gliomas using a mechanistic mathematical model
auteur
Edouard Ollier, Pauline Mazzocco, Damien Ricard, Gentian Kaloshi, Ahmed Idbaih, Agusti Alentorn, Dimitri Psimaras, Jérôme Honnorat, Jean-Yves Delattre, Emmanuel Grenier, François Ducray, Adeline Samson
article
Fundamental and Clinical Pharmacology, Wiley, 2017, 31 (3), pp.347-358. ⟨10.1111/fcp.12259⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01623733/file/ollier2016.pdf BibTex
titre
Mathematical model for transport of DNA plasmids from the external medium up to the nucleus by electroporation
auteur
Michael Leguèbe, Maria Notarangelo, Monika Twarogowska, Roberto Natalini, Clair Poignard
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2017, 285, pp.1-13. ⟨10.1016/j.mbs.2016.11.015⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01412380/file/Revision1.pdf BibTex
titre
Effects of initial telomere length distribution on senescence onset and heterogeneity
auteur
Sarah Eugene, Thibault Bourgeron, Zhou Xu
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2017, 413, pp.8
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https://arxiv.org/pdf/1606.06842 BibTex
titre
Augmented Lagrangian simulations study of yield-stress fluid flows in expansion-contraction and comparisons with physical experiments
auteur
Arthur Marly, Paul Vigneaux
article
Journal of Non-Newtonian Fluid Mechanics, Elsevier, 2017, 239, pp.35 - 52. ⟨10.1016/j.jnnfm.2016.12.004⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01432028/file/MVjnnfm17Hal.pdf BibTex
titre
Blow-up phenomena for gradient flows of discrete homogeneous functionals
auteur
Vincent Calvez, Thomas Gallouët
article
Applied Mathematics and Optimization, Springer Verlag (Germany), 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01286518/file/PBU_1D_SurCritiqueHAL.pdf BibTex
titre
Multicomponent and Longitudinal Imaging Seen as a Communication Channel—An Application to Stroke
auteur
Mathilde Giacalone, Carole Frindel, Emmanuel Grenier, David Rousseau
article
Entropy, MDPI, 2017, 19 (5), ⟨10.3390/e19050187⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01517001/file/entropy-19-00187.pdf BibTex
titre
Robustness of spatio-temporal regularization in perfusion MRI deconvolution: An application to acute ischemic stroke
auteur
Mathilde Giacalone, Carole Frindel, Marc Robini, Frédéric Cervenansky, Emmanuel Grenier, David Rousseau
article
Magnetic Resonance in Medicine, Wiley, 2017, 78 (5), pp.1981-1990 ⟨10.1002/mrm.26573⟩
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Conference papers

titre
Simulations of Bingham fluids in expansion-contraction geometries: comparison with physical experiments
auteur
Arthur Marly, Paul Vigneaux
article
7th Viscoplastic Fluids Workshop: From Theory to Applications (VPF7), Oct 2017, Rotorua, New Zealand
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titre
2D numerical simulations of Bingham equations (integrated or not)
auteur
Paul Vigneaux
article
5me Ecole du GdR CNRS EGRIN, May 2017, Cargèse, France
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Existence of recombination-selection equilibria for sexual populations
auteur
Thibault Bourgeron, Vincent Calvez, Jimmy Garnier, Thomas Lepoutre
article
2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01489695/file/BCGL.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Quantitative convergence towards a self similar profile in an age-structured renewal equation for subdiffusion
auteur
Hugues Berry, Thomas Lepoutre, Álvaro Mateos González
article
Acta Applicandae Mathematicae, Springer Verlag, 2016, pp.15-45
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https://hal.inria.fr/hal-01136667/file/Berry-Lepoutre-Mateos.pdf BibTex

Conference papers

titre
SAEM methods for statistical PDE parameters estimation and application to biology
auteur
Paul Vigneaux
article
CIMPA School "Mathematical models in biology and medicine", Dec 2016, Moka, Mauritius
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BibTex
titre
Numerical schemes for viscoplastic avalanches. A shallow - Bingham flow model
auteur
Paul Vigneaux
article
SIMAI 2016, SIMAI, Politecnico di Milano, Sep 2016, Milano, Italy
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Theses

titre
Modélisation de données pharmacologiques précliniques et cliniques d'efficacité des médicaments anti-angiogéniques en cancérologie
auteur
Aziz Ouerdani
article
Modélisation et simulation. Université Grenoble Alpes, 2016. Français. ⟨NNT : 2016GREAM018⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01496174/file/OUERDANI_2016_archivage.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Numerical schemes for kinetic equation with diffusion limit and anomalous time scale
auteur
Helene Hivert
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01389100/file/Hivert.pdf BibTex
titre
Large deviations for velocity-jump processes and non-local Hamilton-Jacobi equations
auteur
Emeric Bouin, Vincent Calvez, Emmanuel Grenier, Grégoire Nadin
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01344939/file/WKBGaussien_2016-07-12.pdf BibTex
titre
Super-linear spreading in local bistable cane toads equations
auteur
Emeric Bouin, Christopher Henderson
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01293988/file/bistable.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
A SAEM Algorithm for Fused Lasso Penalized NonLinear Mixed Effect Models: Application to Group Comparison in Pharmacokinetics
auteur
Edouard Ollier, Adeline Samson, Xavier Delavenne, Vivian Viallon
article
Computational Statistics and Data Analysis, Elsevier, 2015, 95, pp.207-221. ⟨http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167947315002613⟩. ⟨10.1016/j.csda.2015.10.006⟩
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BibTex
titre
The asymmetry of telomere replication contributes to replicative senescence heterogeneity
auteur
Thibault Bourgeron, Zhou Xu, Marie Doumic, Maria Teresa Teixeira
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2015, 5, pp.15326. ⟨10.1038/srep15326⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01272075/file/srep15326.pdf BibTex
titre
Propagation in a kinetic reaction-transport equation: travelling waves and accelerating fronts
auteur
Emeric Bouin, Vincent Calvez, Grégoire Nadin
article
Archives of rational mechanics and analysis, Springer-Verlag, 2015, 217 (2), pp.571-617
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00849405/file/Bouin-Calvez-Nadin-Front-Propagation-Kinetic-Equation-2013-revision.pdf BibTex
titre
Prediction of Response to Temozolomide in Low-Grade Glioma Patients Based on Tumor Size Dynamics and Genetic Characteristics
auteur
P Mazzocco, Célia Barthélémy, G Kaloshi, Marc Lavielle, D Ricard, A Idbaih, D Psimaras, M-A Renard, A Alentorn, J Honnorat, J-Y Delattre, F Ducray, B Ribba
article
CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol, 2015, 4 (12), pp.728-737. ⟨10.1002/psp4.54⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01252076/file/CPT_Mazzocco%20%281%29.pdf BibTex
titre
Confinement by biased velocity jumps: aggregation of Escherichia coli
auteur
Vincent Calvez, Gaël Raoul, Christian Schmeiser
article
Kinetic and Related Models , AIMS, 2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00971302/file/Calvez-Raoul-Schmeiser-HAL.pdf BibTex
titre
Particle approximation of the one dimensional Keller-Segel equation, stability and rigidity of the blow-up.
auteur
Vincent Calvez, Thomas Gallouët
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series A, American Institute of Mathematical Sciences, 2015
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https://hal.inria.fr/hal-00968347/file/KellerSegel_1D_SurCritique_soumis.pdf BibTex
titre
A Hamilton-Jacobi approach for a model of population structured by space and trait
auteur
Emeric Bouin, Sepideh Mirrahimi
article
Communications in Mathematical Sciences, International Press, 2015, 13 (6), pp.1431-1452
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00849406/file/HJEBSM10HAL.pdf BibTex

Conference papers

titre
Simulations numériques en IRM de perfusion cérébrale: bruit log-ricien ou bruit gaussien ?
auteur
Mathilde Giacalone, Carole Frindel, Marc C. Robini, Emmanuel Grenier, David Rousseau
article
XXVème colloque Gretsi 2015, Sep 2015, Lyon, France
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BibTex
titre
Small scale fluid dynamics, interfaces and numerics
auteur
Paul Vigneaux
article
CEMRACS 2015, SMAI, Jul 2015, CIRM - Marseille, France
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BibTex

Poster communications

titre
Clustering Absorption Profiles of Rivaroxaban Using Between Subject Model Mixture
auteur
Edouard Ollier, Isabelle Gouin-Thibault, Marie-Anne Loriot, Patrick Mismetti, Silvy Laporte, Xavier Delavenne
article
PAGE Meetin 2015, Jun 2015, Hersonissos, Greece. ⟨http://www.page-meeting.org/default.asp?abstract=3316⟩
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Theses

titre
Applications de la modélisation mathématique à l'optimisation des traitements chimiothérapiques des gliomes de bas-grade
auteur
Pauline Mazzocco
article
Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université Grenoble Alpes, 2015. Français. ⟨NNT : 2015GREAM022⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01235541/file/MAZZOCCO_2015_diffusion.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
The Use of Model-Based Tumor-Size Metrics to Predict Survival
auteur
Benjamin Ribba, Nick Holford, France Mentré
article
Clinical Pharmacology and Therapeutics, American Society for Clinical Pharmacology and Therapeutics, 2014, 96 (2), pp.133 - 135. ⟨10.1038/clpt.2014.111⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01084276/file/CPT_Ribba_14.pdf BibTex
titre
Parameter estimation in non-linear mixed effects models with SAEM algorithm: extension from ODE to PDE.
auteur
Emmanuel Grenier, Violaine Louvet, Paul Vigneaux
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, EDP Sciences, 2014, 48 (5), pp.1303-1329. ⟨10.1051/m2an/2013140⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00936373/file/GLV_EDPMLX14.pdf BibTex
titre
Hyperbolic traveling waves driven by growth
auteur
Emeric Bouin, Vincent Calvez, Grégoire Nadin
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, World Scientific Publishing, 2014, 24 (6), http://www.worldscientific.com/doi/abs/10.1142/S0218202513500802. ⟨10.1142/S0218202513500802⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00632597/file/telegraphe_revisedGregoireEmericGregoire2.pdf BibTex
titre
Enabling multiscale modeling in systems medicine: From reactions in cells to organ physiology
auteur
Olaf Wolkenhauer, Charles Auffray, Olivier Brass, Jean Clairambault, Andreas Deutsch, Dirk Drasdo, Francesco Gervasio, Luigi Preziosi, Philip Maini, Anna Marciniak-Czochra, Christina Kossow, Lars Kuepfer, Katja Rateitschak, Ignacio Ramis-Conde, Benjamin Ribba, Andreas Schuppert, Rod Smallwood, Georgios Stamatakos, Felix Winter, Helen Byrne
article
Genome Medicine, BioMed Central, 2014, Genome Medicine, 6 (21), pp.3. ⟨http://genomemedicine.com⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01109002/file/WolkenhauerGenomeMedicine2014.pdf BibTex
titre
Efficient numerical schemes for viscoplastic avalanches. Part 1: the 1D case
auteur
Enrique D. Fernandez-Nieto, J.M. Gallardo, Paul Vigneaux
article
Journal of Computational Physics, Elsevier, 2014, 264, pp.55-90. ⟨10.1016/j.jcp.2014.01.026⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01011373/file/FGVjcp14hal.pdf BibTex

Conference papers

titre
Non-linear eigenvalue problems arising from growth maximization of positive linear dynamical systems
auteur
Vincent Calvez, Pierre Gabriel, Stéphane Gaubert
article
IEEE 53rd Annual Conference on Decision and Control (CDC 2014), Dec 2014, Los Angeles, United States. pp.1600--1607
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00974749/file/calvez-gabriel-gaubert-2014-HAL.pdf BibTex
titre
Numerical schemes for viscoplastic avalanches
auteur
Paul Vigneaux
article
2me Ecole du GdR CNRS EGRIN, Jun 2014, Domaine de Chalès, France
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BibTex

Book sections

titre
Some Remarks on Avalanches Modelling: An Introduction to Shallow Flows Models
auteur
Enrique D. Fernandez-Nieto, Paul Vigneaux
article
Parés, Carlos; Vazquez Cendon, Carlos; Coquel, Frederic. Advances in Numerical Simulation in Physics and Engineering - Lecture Notes of the XV 'Jacques-Louis Lions' Spanish-French School, 3, Springer, pp.51-106, 2014, SEMA SIMAI Springer Series, 978-3-319-02838-5. ⟨10.1007/978-3-319-02839-2_2⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01066445/file/hfjll2014.pdf BibTex

Theses

titre
Propagation de fronts structurés en biologie - Modélisation et analyse mathématique
auteur
Emeric Bouin
article
Mathématiques générales [math.GM]. Ecole normale supérieure de lyon - ENS LYON, 2014. Français. ⟨NNT : 2014ENSL0960⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01127095/file/2014ENSL0960.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Ongoing and prolonged response in adult low-grade gliomas treated with radiotherapy.
auteur
F. Ducray, G. Kaloshi, C. Houillier, A. Idbaih, Benjamin Ribba, D. Psimaras, Y. Marie, B. Boisselier, A. Alentorn, L. Dainese, S. Navarro, K. Mokhtari, M. Sanson, K. Hoang-Xuan, Jean-Yves Delattre
article
Journal of Neuro-Oncology, Springer Verlag, 2013, 115 (2), pp.261-5. ⟨10.1007/s11060-013-1224-1⟩
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BibTex
titre
National sentinel surveillance of transmitted drug resistance in antiretroviral-naive chronically HIV-infected patients in France over a decade: 2001-2011.
auteur
Diane Descamps, Lambert Assoumou, Marie-Laure Chaix, Antoine Chaillon, Sophie Pakianather, Alexis de Rougemont, Alexandre Storto, Georges dos Santos, Anne Krivine, Constance Delaugerre, Brigitte Montes, Jacques Izopet, Charlotte Charpentier, Marc Wirden, Anne Maillard, Laurence Morand-Joubert, Coralie Pallier, Jean-Christophe Plantier, Jérôme Guinard, Catherine Tamalet, Jacqueline Cottalorda, Anne-Geneviève Marcelin, Delphine Desbois, Cecile Henquell, Vincent Calvez, Françoise Brun-Vézinet, Bernard Masquelier, Dominique Costagliola
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2013, 68, pp.2626-31. ⟨10.1093/jac/dkt238⟩
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BibTex
titre
Modeling tumor response after combined administration of different immune-stimulatory agents.
auteur
Zinnia P Parra-Guillen, Pedro Berraondo, Benjamin Ribba, Iñaki F Trocóniz
article
Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics, American Society for Pharmacology and Experimental Therapeutics, 2013, 346 (3), pp.432-442. ⟨10.1124/jpet.113.206961⟩
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BibTex
titre
Simulation of human ischemic stroke in realistic 3D geometry
auteur
Thierry Dumont, Max Duarte, Stéphane Descombes, Marie-Aimée Dronne, Marc Massot, Violaine Louvet
article
Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, Elsevier, 2013, 18 (6), pp.1539-1557. ⟨10.1016/j.cnsns.2012.10.002⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00546223/file/article_avc_2012_hal.pdf BibTex
titre
A mathematical model for mechanotransduction at the early steps of suture formation
auteur
Roman Hossein Khonsari, Julien Olivier, Paul Vigneaux, Sophie Sanchez, Paul Tafforeau, P. E. Ahlberg, F. Di Rocco, Didier Bresch, P. Corre, A. Ohazama, P. T. Sharpe, Vincent Calvez
article
Proceedings of the Royal Society of London. Series B, Containing papers of a Biological character. Royal Society (Great Britain), Royal Society, The, 2013, 280 (1759), pp.20122670. ⟨10.1098/rspb.2012.2670⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00709484/file/sutures_HALL.pdf BibTex
titre
Mathematical Model Approach to Describe Tumour Response in Mice After Vaccine Administration and its Applicability to Immune-Stimulatory Cytokine-Based Strategies.
auteur
Zinnia P Parra-Guillen, Pedro Berraondo, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba, Iñaki F Troconiz
article
AAPS Journal, American Association of Pharmaceutical Scientists, 2013, 15 (3), pp.797-807. ⟨10.1208/s12248-013-9483-5⟩
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BibTex
titre
Theoretical investigation of the efficacy of antiangiogenic drugs combined to chemotherapy in xenografted mice.
auteur
Floriane Lignet, Sébastien Benzekry, Shelby Wilson, Frédérique Billy, Olivier Saut, Michel Tod, Benoit You, A. Adda Berkane, S. Kassour, M. X. Wei, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2013, 320, pp.86-99. ⟨10.1016/j.jtbi.2012.12.013⟩
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BibTex
titre
A structural model of the VEGF signalling pathway: Emergence of robustness and redundancy properties.
auteur
Floriane Lignet, Vincent Calvez, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba
article
Math Biosci Eng, American Institute of Mathematical Sciences, 2013, 10 (1), pp.167-84. ⟨10.3934/mbe.2013.10.167⟩
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BibTex
titre
Theme A: Modeling and simulation in biomedical research. Results and future works
auteur
Alfredo Hernandez, Catherine K Marque, Marie Beurton-Aimar, Benjamin Ribba
article
IRBM, Elsevier Masson, 2013, 34 (1), pp.3-5. ⟨10.1016/j.irbm.2012.12.019⟩
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BibTex
titre
HIV-1 dynamics and coreceptor usage in Maraviroc-treated patients with ongoing replication.
auteur
P Recordon-Pinson, S Raymond, P Bellecave, a G Marcelin, C Soulie, D Descamps, V Calvez, P R Harrigan, H Fleury, J Izopet, B Masquelier
article
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology, 2013, 57 (2), pp.930-935. ⟨10.1128/AAC.02159-12⟩
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Conference papers

titre
Viscoplastic shallow models to simulate some complex avalanches
auteur
Paul Vigneaux
article
Mathematics of Planet Earth: Examples of Mathematics applied to Geophysics, Oct 2013, Institute of Mathematics of Seville, Spain
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BibTex
titre
Estimation of PDE's parameters via mixed effects models. Application to KPP equation.
auteur
Paul Vigneaux
article
CIMPA Research Summer School on "PDE methods in Biology and Medicine", Jun 2013, La Habana, Cuba
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BibTex
titre
Extending Monolix to use models with Partial Differential Equations
auteur
Paul Vigneaux
article
PAGE 2013. Annual Meeting of the Population Approach Group in Europe., Jun 2013, Glasgow, United Kingdom. pp.PAGE 22 (2013) Abstr 2666
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titre
Microfluidics, Nanofluidics: ounces of physics, modelling & numerical methods
auteur
Paul Vigneaux
article
13th CNRS Thematic School on Computational Fluid Dynamics, Jun 2013, Porquerolles, France
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BibTex
titre
On the growth of low grade gliomas - Sur la croissance des gliomes de bas grade
auteur
Paul Vigneaux
article
SMAI 2013 - Minisymposium "CANCER", May 2013, Seignosse, France
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BibTex
titre
Statistical Inference for Partial Differential Equations
auteur
Emmanuel Grenier, Marc Hoffmann, Tony Lelièvre, Violaine Louvet, Clémentine Prieur, Nabil Rachdi, Paul Vigneaux
article
SMAI 2013 - 6e Biennale Française des Mathématiques Appliquées et Industrielles, May 2013, Seignosse, France. pp.178-188, ⟨10.1051/proc/201445018⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01102782/file/proc144518.pdf BibTex

Reports

titre
2012 Activity Report of the Regional Research Programme on Hadrontherapy for the ETOILE Center
auteur
G. Alphonse, D. Ardail, E. Armandy, M. Bajard, J. Balosso, M.-H. Baron, P. Battiston-Montagne, G. Bertrand, M. Beuve, Marie-Claude Biston, G. Blanchard, O. Bouhadiba, B. Boutin, B. Cajavec-Bernard, F. Chandez, M.-A. Chanrion, L. Chollier, J. Constanzo, M. Cunha, Djamel Dabli, M. Dahoumane, D. Dauvergne, M. de Rydt, G. Dedes, S. Deng, F. Ducimetière, M. Fallavier, Y. Fayet, S. Ferrandon, P. Force, N. Freud, C. Gagnon, C. Ganne, M. Gautier, M. Gilormini, T. Glatard, Y. Hu, C. Insa, F. Jaillet, Baptiste Joly, J. Krimmer, Hamid Ladjal, D. Lambert, Loïc Lestand, J.M. Letang, J.-L. Ley, N. Magné, C. Malesys, F. Martin, H. Mathez, Voichita Maxim, C. Moncharmont, Gerard Montarou, J.-M. Moreau, L. Pequegnot, S. Patin, N. Pauna, M. Pinto, P. Pommier, D. Poncet, S. Pop-Camarasu, R. Prost, C. Ray, Isabelle Ray-Coquard, V. Reithinger, J. Remillieux, S. Ribba, M.-H. Richard, S. Rit, C. Rodriguez-Lafrasse, F. Roellinghoff, L. Royer, D. Sarrut, B. Shariat, E. Testa, P.-E. Vert, L. Vial, G. Vogin, F. Zara, Y. Zoccarato
article
[Research Report] Centre Etoile; Université Lyon 1 - Claude Bernard. 2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00840163/file/rapact-prrh-2012-eng.pdf BibTex
titre
Parameter estimation in non-linear mixed effects models with SAEM algorithm: extension from ODE to PDE
auteur
Emmanuel Grenier, Violaine Louvet, Paul Vigneaux
article
[Research Report] RR-8231, INRIA. 2013, pp.30
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https://hal.inria.fr/hal-00789135/file/RR-8231.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Travelling waves for the cane toads equation with bounded traits.
auteur
Emeric Bouin, Vincent Calvez
article
2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00863115/file/Toads-TW.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
A Tumor Growth Inhibition Model for Low-Grade Glioma Treated with Chemotherapy or Radiotherapy.
auteur
Benjamin Ribba, Gentian Kaloshi, Mathieu Peyre, Damien Ricard, Vincent Calvez, Michel Tod, Branka Cajavec-Bernard, Ahmed Idbaih, Dimitri Psimaras, Linda Dainese, Johan Pallud, Stéphanie Cartalat-Carel, Jean-Yves Delattre, Jérôme Honnorat, Emmanuel Grenier, François Ducray
article
Clinical Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2012, 18 (18), pp.5071-5080. ⟨10.1158/1078-0432.CCR-12-0084⟩
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BibTex
titre
Invasion fronts with variable motility: phenotype selection, spatial sorting and wave acceleration
auteur
Emeric Bouin, Vincent Calvez, Nicolas Meunier, Sepideh Mirrahimi, Benoît Perthame, Gael Raoul, Raphael Voituriez
article
Comptes rendus de l'Académie des sciences. Série I, Mathématique, Elsevier, 2012, 350 (15-16), pp.761-766. ⟨10.1016/j.crma.2012.09.010⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00716349/file/cane-toads-CRAS-v6.pdf BibTex
titre
A well-balanced finite volume-augmented Lagrangian method for an integrated Herschel-Bulkley model
auteur
C. Acary-Robert, Enrique D. Fernandez-Nieto, G. Narbona-Reina, Paul Vigneaux
article
Journal of Scientific Computing, Springer Verlag, 2012, 53 (3), pp.608-641. ⟨10.1007/s10915-012-9591-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00709491/file/AFNVswhb-hal.pdf BibTex
titre
New resolution strategy for multi-scale reaction waves using time operator splitting, space adaptive multiresolution and dedicated high order implicit/explicit time integrators
auteur
Max Duarte, Marc Massot, Stéphane Descombes, Christian Tenaud, Thierry Dumont, Violaine Louvet, Frédérique Laurent
article
SIAM Journal on Scientific Computing, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2012, 34 (1), pp.76-104. ⟨10.1137/100816869⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00457731/file/Duarte_SISC081686.pdf BibTex
titre
Self-similarity in a General Aggregation-Fragmentation Problem ; Application to Fitness Analysis
auteur
Vincent Calvez, Marie Doumic-Jauffret, Pierre Gabriel
article
Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, Elsevier, 2012, 98 (1), pp.1-27. ⟨10.1016/j.matpur.2012.01.004⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00539279/file/CDG.pdf BibTex
titre
Time-course analysis of main markers of primary infection in cats with the feline immunodeficiency virus.
auteur
Benjamin Ribba, H. El Garch, S. Brunet, Emmanuel Grenier, F. Castiglione, H. Poulet, P. Vanhems
article
Computational and Mathematical Methods in Medicine, Hindawi Publishing Corporation, 2012, 2012, pp.1-9. ⟨10.1155/2012/342602⟩
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BibTex

Conference papers

titre
Viscoplastic Free-Surface Flows: The Herschel-Bulkley Case
auteur
Paul Vigneaux
article
Seventh International Conference on Computational Fluid Dynamics (ICCFD7), Big Island, Hawaii, July 9-13, 2012, Jul 2012, United States. pp.ICCFD7-3302
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BibTex
titre
Mathematical model of cancer growth controled by metronomic chemotherapies
auteur
Nicolas Andre, Dominique Barbolosi, Frédérique Billy, Guillemette Chapuisat, Florence Hubert, Emmanuel Grenier, Amandine Rovini
article
CANUM 2012, 41e Congrès National d'Analyse Numérique, May 2012, Superbesse, France. pp.77-94, ⟨10.1051/proc/201341004⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00751645/file/proceeding_angio_rev.pdf BibTex

Book sections

titre
A finite volume/duality method for Bingham viscoplastic flow
auteur
J.M. Gallardo, E. D. Fernández-Nieto, Paul Vigneaux
article
Elena Vázquez-Cendón ; Arturo Hidalgo ; Pilar Garcia Navarro ; Luis Cea. Numerical Methods for Hyperbolic Equations: Theory and Applications, CRC Press, pp.60, 2012, 9780415621502
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BibTex

Theses

titre
Approches mathématiques multi-niveaux pour l'étude de la croissance des tumeurs : Application à la morphogenèse du cancer du sein et ciblage thérapeutique de l'angiogenèse du cancer du côlon
auteur
Floriane Lignet
article
Mathématiques générales [math.GM]. Ecole normale supérieure de lyon - ENS LYON, 2012. Français. ⟨NNT : 2012ENSL0771⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00844807/file/LIGNET_Floriane_2012_These.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Numerical simulation on a cell polarisation model: the polar case
auteur
Vincent Calvez, Nicolas Meunier, Nicolas Muller, Raphael Voituriez
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00777055/file/hal_Germany.pdf BibTex
titre
Numerical simulation of the dynamics of molecular markers involved in cell polarisation
auteur
Vincent Calvez, Nicolas Meunier, Nicolas Muller, Raphael Voituriez
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00777040/file/hal_Porto.pdf BibTex
titre
Front acceleration by dynamic selection in Fisher population waves
auteur
Olivier Benichou, Vincent Calvez, Nicolas Meunier, Raphael Voituriez
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00716348/file/fkpp4PRE.pdf BibTex
titre
Optimal growth for linear processes with affine control
auteur
Vincent Calvez, Pierre Gabriel
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00681920/file/CG_Ergodicity.pdf BibTex
titre
A kinetic eikonal equation
auteur
Emeric Bouin, Vincent Calvez
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00668874/file/Kinetic_Eikonal_BC.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Simultaneous Inhibition of Estrogen Receptor and the HER2 Pathway in Breast Cancer: Effects of HER2 Abundance.
auteur
Anna Emde, Georg Mahlknecht, Kerstin Maslak, Benjamin Ribba, Michael Sela, Kurt Possinger, Yosef Yarden
article
Transl Oncol, SPI Publishing Services, 2011, 4 (5), pp.293-300
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BibTex
titre
Directional persistence of chemotactic bacteria in a traveling concentration wave
auteur
Jonathan Saragosti, Vincent Calvez, Nikolaos Bournaveas, Benoît Perthame, Axel Buguin, Pascal Silberzan
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2011, 108 (39), pp.16235-16240. ⟨10.1073/pnas.1101996108⟩
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BibTex
titre
Adaptive time splitting method for multi-scale evolutionary partial differential equations
auteur
Stéphane Descombes, Max Duarte, Thierry Dumont, Violaine Louvet, Marc Massot
article
Confluentes Mathematici, Institut Camille Jordan et Unité de Mathématiques Pures et Appliquées, 2011, 3, pp.1-31. ⟨10.1142/S1793744211000412⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00587036/file/AdaptiveSplitting_revised.pdf BibTex
titre
Combining epitope-distinct antibodies to HER2: cooperative inhibitory effects on invasive growth.
auteur
Anna Emde, Chaluvally-Raghavan Pradeep, Daniela Aleida Ferraro, Nir Ben-Chetrit, Michael Sela, Benjamin Ribba, Zvi Kam, Yosef Yarden
article
Oncogene, Nature Publishing Group, 2011, 30 (14), pp.1631-42. ⟨10.1038/onc.2010.547⟩
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BibTex
titre
L'Institut Courant de Sciences Mathématiques : 75 ans d'Excellence
auteur
Mary Louise Ball, Paul Vigneaux
article
Images des Mathématiques, CNRS, 2011, http://images.math.cnrs.fr/L-Institut-Courant-de-Sciences.html
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00643784/file/IdM-Ball-Vigneaux.pdf BibTex
titre
Computational analysis of the influence of the microenvironment on carcinogenesis.
auteur
David Basanta, Benjamin Ribba, Emmanuel Watkin, Benoit You, Andreas Deutsch
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2011, 229 (1), pp.22-9. ⟨10.1016/j.mbs.2010.10.005⟩
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BibTex

Conference papers

titre
Well-Balanced Finite Volume Schemes for Bingham Flows
auteur
Paul Vigneaux, Didier Bresch, Enrique D. Fernandez - Nieto, Ioan Ionescu
article
ICIAM 2011 - 7th International Congress on Industrial and Applied Mathematics, Jul 2011, Vancouver, Canada
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BibTex
titre
Stability condition for surface tension-driven flows and application to microfluidics
auteur
Paul Vigneaux
article
Mathematical Aspects of Fluid Problems, Apr 2011, Seville, Spain
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BibTex

Book sections

titre
New Resolution Strategy for Multi-scale Reaction Waves using Time Operator Splitting and Space Adaptive Multiresolution: Application to Human Ischemic Stroke
auteur
Max Duarte, Marc Massot, Stéphane Descombes, Christian Tenaud, Thierry Dumont, Violaine Louvet, Frédérique Laurent
article
E. Cancès, V. Louvet, M. Massot. Summer school on multiresolution and adaptive mesh refinement methods, EDP Sciences, pp.Vol. 34 277-290, 2011, ESAIM: Proceedings, ⟨10.1051/proc/201134006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00590812/file/Duarte_etal_ESAIM.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Analysis of a non local model for spontaneous cell polarisation
auteur
Vincent Calvez, Rhoda Hawkins, Nicolas Meunier, Raphael Voituriez
article
2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00594777/file/CHMV_version_HAL.pdf BibTex

2010

Journal articles

titre
A mathematical model of inflammation during ischemic stroke
auteur
Cristiana Di Russo, Jean-Baptiste Lagaert, Guillemette Chapuisat, Marie-Aimée Dronne
article
ESAIM: Proceedings, EDP Sciences, 2010, 30, pp.15-33. ⟨10.1051/proc/2010003⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00555286/file/proc103002.pdf BibTex
titre
A model of vascular tumour growth in mice combining longitudinal tumour size data with histological biomarkers.
auteur
Benjamin Ribba, Emmanuel Watkin, Michel Tod, Pascal Girard, Emmanuel Grenier, Benoît You, Enrico Giraudo, Gilles Freyer
article
European Journal of Cancer, Elsevier, 2010
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BibTex
titre
In silico study of the influence of intensity and duration of blood flow reduction on cell death through necrosis or apoptosis during acute ischemic stroke
auteur
Guillemette Chapuisat, Marie-Aimée Dronne, Emmanuel Grenier, Marc Hommel, Jean-Pierre Boissel
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2010, 58 (2-3), pp.171-190. ⟨10.1007/s10441-010-9100-2⟩
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BibTex
titre
Predictive values of hCG clearance for risk of methotrexate resistance in low-risk gestational trophoblastic neoplasias.
auteur
Benoit You, M. Pollet-Villard, L. Fronton, C. Labrousse, A.-M. Schott, T. Hajri, P. Girard, G. Freyer, Michel Tod, B. Tranchand, O. Colomban, Benjamin Ribba, D. Raudrant, J. Massardier, S. Chabaud, F. Golfier
article
Annals of Oncology, Oxford University Press (OUP), 2010, 21 (8), pp.1643-50. ⟨10.1093/annonc/mdq033⟩
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BibTex
titre
Mathematical description of bacterial traveling pulses
auteur
Jonathan Saragosti, Vincent Calvez, Nikolaos Bournaveas, Axel Buguin, Pascal Silberzan, Benoît Perthame
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2010, http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1000890. ⟨10.1371/journal.pcbi.1000890⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00440108/file/BacterialTW07_12_09_HAL.pdf BibTex
titre
Predictive value of modeled AUC(AFP-hCG), a dynamic kinetic parameter characterizing serum tumor marker decline in patients with nonseminomatous germ cell tumor.
auteur
Benoit You, Ludivine Fronton, Helen Boyle, Jean-Pierre Droz, Pascal Girard, Brigitte Tranchand, Benjamin Ribba, Michel Tod, Sylvie Chabaud, Henri Coquelin, Aude Fléchon
article
Urology, Elsevier, 2010, 76 (2), pp.423-9.e2. ⟨10.1016/j.urology.2010.02.049⟩
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BibTex
titre
A phenomenological model of the growth of the necrotic area in ischemic stroke
auteur
Emmanuel Grenier, Didier Bresch, Marie-Aimée Dronne, Marc Hommel, Jean-Pierre Boissel
article
Mathematical and Computer Modelling, Elsevier, 2010, 51 (9-10), pp.1011-1025. ⟨10.1016/j.mcm.2008.07.025⟩
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BibTex
titre
Volcan islandais Eyjafjöll : mais où vont les particules ?
auteur
Paul Vigneaux
article
Images des Mathématiques, CNRS, 2010, http://images.math.cnrs.fr/Volcan-islandais-Eyjafjoll-mais-ou.html
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00572394/file/idm-volcan.pdf BibTex
titre
Prion dynamics with size dependency-strain phenomena
auteur
Vincent Calvez, Natacha Lenuzza, Marie Doumic, Jean-Philippe Deslys, Franck Mouthon, Benoît Perthame
article
Journal of Biological Dynamics, Taylor & Francis Open, 2010, 4 (1), pp.28-42. ⟨10.1080/17513750902935208⟩
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BibTex
titre
Mathematical and numerical modeling of early atherosclerotic lesions
auteur
Vincent Calvez, Jean-Gabriel Houot, Nicolas Meunier, Annie Raoult, Gabriela Rusnakova
article
ESAIM: Proceedings, EDP Sciences, 2010, 30, pp.1-14
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00523348/file/proc10_01_prepubli.pdf BibTex
titre
Global weak solutions to a generic two-fluid model.
auteur
Emmanuel Grenier, Didier Bresch, Benoît Desjardins, Jean-Michel Ghidaglia
article
Archive for Rational Mechanics and Analysis, Springer Verlag, 2010, 196 (2), pp.599-629. ⟨10.1007/s00205-009-0261-6⟩
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Conference papers

titre
New Resolution Strategies for Multi-scale Reaction Waves: Optimal Time Operator Splitting and Space Adaptive Multiresolution
auteur
Max Duarte, Marc Massot, Frédérique Laurent, Stéphane Descombes, Christian Tenaud, Thierry Dumont, Violaine Louvet
article
XXXVI Latin American Conference on Informatics (CLEI 2010), Oct 2010, Asunción, Paraguay. Paper 6, 14 p
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BibTex
titre
A Method for Compressible Bingham-Type Systems Applied to Shallow Dense Avalanches Simulations. Keynote Lecture
auteur
Paul Vigneaux
article
9th World Congress on Computational Mechanics, WCCM 2010, Jul 2010, Sydney, Australia
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BibTex
titre
Augmented Lagrangian / well-balanced finite volume method for compressible viscoplastic flows
auteur
Paul Vigneaux, Didier Bresch, Enrique D. Fernandez-Nieto, Ioan Ionescu
article
Sixth International Conference on Computational Fluid Dynamics, ICCFD6, Jul 2010, St-Petersburg, Russia. pp.271-277
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BibTex
titre
Une méthode couplée Lagrangien Augmenté - Volumes-Finis appliquée aux avalanches de neige dense
auteur
Paul Vigneaux
article
CANUM 2010 - 40e Congrès National d'Analyse Numérique, May 2010, Bordeaux, France
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BibTex
titre
A coupled Augmented Lagrangian/Finite Volume method for a compressible Bingham system
auteur
Paul Vigneaux
article
Chinese-French Research Institute on Stress Tensor Effects on Fluid Mechanics, Jan 2010, Beijing, China
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BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Refined Asymptotics for the subcritical Keller-Segel system and Related Functional Inequalities
auteur
Vincent Calvez, José Antonio Carrillo
article
2010
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00503203/file/Refined1-2D-LogCase-HAL.pdf BibTex
titre
Blow-up, concentration phenomenon and global existence for the Keller-Segel model in high dimension
auteur
Vincent Calvez, Lucilla Corrias, Mohammed Abderrahman Ebde
article
2010
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00462450/file/CCE_08_03_10.pdf BibTex

2009

Journal articles

titre
Exploration of beneficial and deleterious effects of inflammation in stroke: dynamics of inflammation cells.
auteur
Taïssia Lelekov-Boissard, Guillemette Chapuisat, Jean-Pierre Boissel, Emmanuel Grenier, Marie-Aimée Dronne
article
Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, Royal Society, The, 2009, 367 (1908), pp.4699-4716. ⟨10.1098/rsta.2009.0184⟩
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BibTex
titre
A pharmacologically based multiscale mathematical model of angiogenesis and its use in investigating the efficacy of a new cancer treatment strategy.
auteur
Frédérique Billy, Benjamin Ribba, Olivier Saut, Hélène Morre-Trouilhet, Thierry Colin, Didier Bresch, Jean-Pierre Boissel, Emmanuel Grenier, Jean-Pierre Flandrois
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2009, 260 (4), pp.545-62. ⟨10.1016/j.jtbi.2009.06.026⟩
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BibTex
titre
Les baïnes, du surf et des maths
auteur
Paul Vigneaux
article
Images des Mathématiques, CNRS, 2009, http://images.math.cnrs.fr/Les-baines-du-surf-et-des-maths.html
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BibTex
titre
Examples of the influence of the geometry on the propagation of progressive waves
auteur
Marie-Aimée Dronne, Stéphane Descombes, Emmanuel Grenier, Hervé Gilquin
article
Mathematical and Computer Modelling, Elsevier, 2009, 49 (11-12), pp.2138-2144. ⟨10.1016/j.mcm.2008.07.024⟩
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BibTex
titre
Chemotherapy may be delivered based on an integrated view of tumour dynamics.
auteur
Benjamin Ribba, Benoit You, Michel Tod, P. Girard, B. Tranchand, V. Trillet-Lenoir, G. Freyer
article
IET Systems Biology, Institution of Engineering and Technology, 2009, 3 (3), pp.180-90. ⟨10.1049/iet-syb.2008.0104⟩
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BibTex
titre
Size distribution dependence of prion aggregates infectivity
auteur
Vincent Calvez, Natacha Lenuzza, Dietmar Oelz, Jean-Philippe Deslys, Pascal Laurent, Franck Mouthon, Benoît Perthame
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2009, 217 (1), pp.88-99. ⟨10.1016/j.mbs.2008.10.007⟩
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BibTex
titre
Mathematical modelling of the atherosclerotic plaque formation
auteur
Vincent Calvez, Mohammed Abderrahman Ebde, Nicolas Meunier, Annie Raoult
article
ESAIM: Proceedings, EDP Sciences, 2009, 28, pp.1-12
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00523290/file/proceeding2009CaEbMeRa_prepubli.pdf BibTex
titre
A viscoelastic model for avascular tumor growth.
auteur
Didier Bresch, Thierry Colin, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba, Olivier Saut
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series A, American Institute of Mathematical Sciences, 2009, pp.101-108
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BibTex
titre
Existence of compactly upported solutions for a degenerate nonlinear parabolic equation with nonlipschitz source term
auteur
Didier Bresch, B. Bouffandeau, Benoît Desjardins, Emmanuel Grenier
article
Methods and Applications of Analysis, 2009, A paraitre
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BibTex
titre
Singular ordinary differential equations homogenenous of degree 0 near a codimension 2 set
auteur
Didier Bresch, Benoît Desjardins, Emmanuel Grenier
article
Proc AMS, 2009
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BibTex
titre
Existence of compactly supported solutions for a degenerate nonlinear parabolic equation with nonlipschitz source term
auteur
B. Bouffandeau, Benoit Desjardins, Emmanuel Grenier
article
Methods and Applications of Analysis, International Press, 2009, 16, pp.45-53
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Conference papers

titre
Simulations numériques en microfluidique. Applications en Chimie et Biologie
auteur
Paul Vigneaux
article
1res Journées du GdR CNRS CALCUL. Institut Henri Poincaré., Nov 2009, Paris, France
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BibTex
titre
A mathematical approach to model stroke pathophysiology
auteur
Marie-Aimée Dronne, Emmanuel Grenier, Thierry Dumont, Marc Hommel, Jean-Pierre Boissel
article
International Heart Forum, Sep 2009, Beijing, China
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BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
A one-dimensional Keller-Segel equation with a drift issued from the boundary
auteur
Vincent Calvez, Nicolas Meunier
article
2009
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00424649/file/Calvez.Meunier.Note.1D.KS.Boundary.SUBMITTED.pdf BibTex
titre
The one-dimensional Keller-Segel model with fractional diffusion of cells
auteur
Nikolaos Bournaveas, Vincent Calvez
article
2009
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00398629/file/Bournaveas.Calvez.Submitted.ChemoFracDiff.2009.pdf BibTex
titre
Singular ordinary differential equations homogeneous of degree 0 near a codimension 2 set
auteur
Didier Bresch, Benoit Desjardins, Emmanuel Grenier
article
2009
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00408619/file/BrDeGr.20090325.pdf BibTex

2008

Journal articles

titre
Etoposide pharmacokinetics and survival in patients with small cell lung cancer: a multicentre study.
auteur
Benoit You, Brigitte Tranchand, Pascal Girard, Claire Falandry, Benjamin Ribba, Sylvie Chabaud, Pierre-Jean Souquet, Isabelle Court-Fortune, Véronique Trillet-Lenoir, Cécile Fournel, Michel Tod, Gilles Freyer
article
Lung Cancer, Elsevier, 2008, 62 (2), pp.261-72. ⟨10.1016/j.lungcan.2008.03.008⟩
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BibTex
titre
Advantages of prostate-specific antigen (PSA) clearance model over simple PSA half-life computation to describe PSA decrease after prostate adenomectomy.
auteur
Benoit You, Paul Perrin, Gilles Freyer, Alain Ruffion, Brigitte Tranchand, Emilie Hénin, Philippe Paparel, Benjamin Ribba, Marian Devonec, Claire Falandry, Cécile Fournel, Michel Tod, Pascal Girard
article
Clinical Biochemistry, Elsevier, 2008, 41 (10-11), pp.785-95. ⟨10.1016/j.clinbiochem.2008.04.001⟩
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BibTex
titre
On stability condition for bifluid flows with surface tension : application to microfluidics
auteur
Cedric Galusinski, Paul Vigneaux
article
Journal of Computational Physics, Elsevier, 2008, 227 (12), pp.6140-6164. ⟨10.1016/j.jcp.2008.02.023⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00274569/file/galvi-jcp08.pdf BibTex
titre
[Pharmacology of anticancer drugs in the elderly: tools for dose-adjustment].
auteur
Brigitte Tranchand, Claire Falandry, Benoît You, Pascale Girard, Benjamin Ribba, Michael Tod, Gilles Freyer
article
Bulletin du Cancer, John Libbey Eurotext, 2008, 95 FMC Onco, pp.F21-7. ⟨10.1684/bdc.2007.0541⟩
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titre
A modelling approach to explore some hypotheses of the failure of neuroprotective trials in ischemic stroke patients.
auteur
Marie-Aimée Dronne, Emmanuel Grenier, Guillemette Chapuisat, Marc Hommel, Jean-Pierre Boissel
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2008, 97 (1), pp.60-78. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2007.10.001⟩
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titre
A numerical study of the blocking of migraine by Rolando sulcus.
auteur
Emmanuel Grenier, Marie-Aimée Dronne, Stéphane Descombes, Hervé Gilquin, Agnès Jaillard, Marc Hommel, Jean-Pierre Boissel
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2008, 97 (1), pp.54-9. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2007.10.002⟩
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titre
Modelling methodology in physiopathology.
auteur
Jean-Pierre Boissel, Benjamin Ribba, Emmanuel Grenier, Guillemette Chapuisat, Marie-Aimée Dronne
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2008, 97 (1), pp.28-39. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2007.10.005⟩
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titre
A global phenomenological model of ischemic stroke with stress on spreading depressions.
auteur
Guillemette Chapuisat, Marie-Aimée Dronne, Emmanuel Grenier, Marc Hommel, Hervé Gilquin, Jean-Pierre Boissel
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2008, 97 (1), pp.4-27. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2007.10.004⟩
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titre
Modèle mathématique multi-échelle de l'angiogenèse tumorale et application à l'analyse de l'efficacité de traitements anti-angiogéniques.
auteur
Thierry Colin, Frédérique Billy, Olivier Saut, Hélène Morre-Trouilhet, Didier Bresch, Benjamin Ribba, Emmanuel Grenier
article
Bulletin du Cancer, John Libbey Eurotext, 2008, 95 (65), pp.1
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Book sections

titre
Simulations of 3D Dynamics of Microdroplets: A Comparison of Rectangular and Cylindrical Channels
auteur
Charles-Henri Bruneau, Thierry Colin, Cedric Galusinski, Sandra Tancogne, Paul Vigneaux
article
K. Kunisch, G. Of, O. Steinbach. Numerical Mathematics and Advanced Applications. Proceedings of ENUMATH 2007, the 7th European Conference on Numerical Mathematics and Advanced Applications, Graz, Austria, September 2007, xxx (xxx), Springer Berlin Heidelberg, pp.449-456, 2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00291512/file/bcgtv-enum08.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Critical mass phenomenon for a chemotaxis kinetic model with spherically symmetric initial data
auteur
Nikolaos Bournaveas, Vincent Calvez
article
2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00349928/file/KineticBU_BournaveasCalvez_HAL.pdf BibTex

2007

Journal articles

titre
Role of astrocytes in grey matter during stroke: a modelling approach.
auteur
Marie-Aimée Dronne, Emmanuel Grenier, Thierry Dumont, Marc Hommel, Jean-Pierre Boissel
article
Brain Research, Elsevier, 2007, 1138, pp.231-42. ⟨10.1016/j.brainres.2006.12.062⟩
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2006

Journal articles

titre
A multiscale mathematical model of cancer, and its use in analyzing irradiation therapies.
auteur
Benjamin Ribba, Thierry Colin, Santiago Schnell
article
Theoretical Biology and Medical Modelling, BioMed Central, 2006, 3, pp.7. ⟨10.1186/1742-4682-3-7⟩
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titre
A multiscale mathematical model of avascular tumor growth to investigate the therapeutic benefit of anti-invasive agents
auteur
Benjamin Ribba, Olivier Saut, Thierry Colin, Didier Bresch, Emmanuel Grenier, Jean-Pierre Boissel
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2006, 243 (4), pp.532-541. ⟨10.1016/j.jtbi.2006.07.013⟩
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titre
A multiscale mathematical model of avascular tumor growth to investigate the therapeutic benefit of anti-invasive agent
auteur
Didier Bresch, Thierry Colin, Olivier Saut, Benjamin Ribba, Emmanuel Grenier, Jean-Pierre Boissel
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2006, 243 (4), pp.532-541
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Conference papers

titre
QxDB: An open-ended, generic database for quantitative physiology
auteur
S. Randall Thomas, Benjamin Ribba, Philippe Tracqui
article
Federation of American Societies for Experimental Biology 2006, 2006, San Francisco, United States. pp.Elec. Proc
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Reports

titre
An age-and-cyclin-structured cell population model with proliferation and quiescence for healthy and tumoral tissues
auteur
Fadia Bekkal Brikci, Jean Clairambault, Benjamin Ribba, Benoît Perthame
article
[Research Report] RR-5941, INRIA. 2006
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https://hal.inria.fr/inria-00081301/file/RRBCPR_last.pdf BibTex

2005

Journal articles

titre
A mathematical model of Doxorubicin treatment efficacy for non-Hodgkin's lymphoma: investigation of the current protocol through theoretical modelling results.
auteur
Benjamin Ribba, K. Marron, Z. Agur, T. Alarcón, P. K. Maini
article
Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2005, 67 (1), pp.79-99. ⟨10.1016/j.bulm.2004.06.007⟩
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titre
Modélisation numérique et simulation : nouvelles applications en pharmacologie [New approaches in pharmacology: numerical modelling and simulation]
auteur
Jean-Pierre Boissel, Michel Cucherat, Patrice Nony, Marie-Aimée Dronne, Behrouz Kassaï, Sylvie Chabaud
article
Thérapie, EDP Sciences, 2005, 60 (1), pp.1-15
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2004

Journal articles

titre
Mathematical modelling of an ischemic stroke: an integrative approach.
auteur
Marie-Aimée Dronne, Jean-Pierre Boissel, Emmanuel Grenier, Hervé Gilquin, Michel Cucherat, Marc Hommel, Emmanuel Barbier, Giampiero Bricca
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2004, 52 (4), pp.255-72. ⟨10.1023/B:ACBI.0000046597.53669.ff⟩
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