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MOSAIC Research team

MOSAIC team publications

2019

Conference papers

titre
Approximation of trees by self-nested trees
auteur
Romain Azaïs, Jean-Baptiste Durand, Christophe Godin
article
ALENEX 2019 - Algorithm Engineering and Experiments, Jan 2019, San Diego, United States. pp.1-24, 2019, <10.10860>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01294013/file/paper.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
The “computable egg”: Myth or useful concept?
auteur
Kilian Biasuz, Bruno Leggio, Emmanuel Faure, Patrick Lemaire
article
Current Opinion in Systems Biology, Elsevier, 2018, 11, pp.91-97. <10.1016/j.coisb.2018.09.003>
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titre
Regulation of plant cell wall stiffness by mechanical stress: a mesoscale physical model
auteur
Hadrien Oliveri, Jan Traas, Christophe Godin, Olivier Ali
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2018, pp.1-29. <10.1007/s00285-018-1286-y>
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https://hal.inria.fr/hal-01691110/file/oliveri_et_al2018_regulation.pdf BibTex
titre
Transcriptional induction of cell wall remodelling genes is coupled to microtubule-driven growth isotropy at the shoot apex in Arabidopsis
auteur
Alessia Armezzani, Ursula Abad, Olivier Ali, Amélie Andres Robin, Laetitia Vachez, Antoine Larrieu, Ewa Mellerowicz, Ludivine Taconnat, Virginie Battu, Thomas Stanislas, Mengying Liu, Teva Vernoux, Jan Traas, Massimiliano Sassi
article
Development (Cambridge, England), Company of Biologists, 2018, 145 (11), <10.1242/dev.162255>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01894645/file/CA51A8F3-17C5-40B9-8066-171241C3A773.pdf BibTex
titre
Bark and Leaf Fusion Systems to Improve Automatic Tree Species Recognition
auteur
Sarah Bertrand, Rihab Ben Ameur, Guillaume Cerutti, Didier Coquin, Lionel Valet, Laure Tougne
article
Ecological Informatics, Elsevier, 2018, <10.1016/j.ecoinf.2018.05.007>
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titre
An Image Analysis Pipeline to Quantify Emerging Cracks in Materials or Adhesion Defects in Living Tissues
auteur
Stéphane Verger, Guillaume Cerutti, Olivier Hamant
article
Bio-protocol , Bio-protocol LCC, 2018, 8 (19)
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https://hal.inria.fr/hal-01940178/file/Bio-protocol3036.pdf BibTex
titre
Estimation of the average number of continuous crossings for non-stationary non-diffusion processes
auteur
Romain Azaïs, Alexandre Genadot
article
Journal of Statistical Planning and Inference, Elsevier, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01499914/file/crossings.pdf BibTex

Conference papers

titre
Detection and modeling of the propagation regimes in fatigue crack propagation
auteur
Florine Greciet, Romain Azaïs, Anne Gégout-Petit
article
ENBIS 2018 - 18th Annual Conference of the European Network for Business and Industrial Statistics, Sep 2018, Nancy, France
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Book sections

titre
Rupture Detection in Fatigue Crack Propagation
auteur
Romain Azaïs, Anne Gégout-Petit, Florine Greciet
article
Statistical Inference for Piecewise-deterministic Markov Processes, Wiley, pp.173-207, 2018, <10.1002/9781119507338.ch6>
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titre
Level Crossings and Absorption of an Insurance Model
auteur
Romain Azaïs, Alexandre Genadot
article
Romain Azais; Florian Bouguet. Statistical Inference for Piecewise-deterministic Markov Processes, Wiley, pp.65-105, 2018, 978-1-786-30302-8. <10.1002/9781119507338.ch3>
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Directions of work or proceedings

titre
Statistical Inference for Piecewise-deterministic Markov Processes
auteur
Romain Azaïs, Florian Bouguet
article
France. Wiley, pp.i-xxxiv 1-260, 2018, 9781119544036. <10.1002/9781119507338>
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Poster communications

titre
Stress-based regulation of multicellular plant growth: a finite element modeling approach applied to planar leaf morphogenesis
auteur
Hadrien Oliveri, Feng Zhao, Olivier Ali, Jan Traas, Christophe Godin
article
ICSB 2018 - 19th International Conference on Systems Biology, Oct 2018, Lyon, France
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https://hal.inria.fr/hal-01897027/file/Poster%20ICSB.pdf BibTex
titre
A parametric active 4D model for the automatic construction of developmental atlases from confocal images of shoot apical meristems
auteur
Guillaume Cerutti, Carlos Galvan-Ampudia, Jonathan Legrand, Teva Vernoux, Christophe Godin
article
IAMPS - International Workshop on Image Analysis Methods for the Plant Sciences 2018, Jan 2018, Nottingham, United Kingdom. 2018
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https://hal.inria.fr/hal-01692584/file/IAMPS_Poster.pdf BibTex
titre
Visualization of Leaf Botanical Features Extracted from AlexNet Convolutional Layers
auteur
Sarah Bertrand, Guillaume Cerutti, Laure Tougne
article
IAMPS - International Workshop on Image Analysis Methods for the Plant Sciences 2018, Jan 2018, Nottingham, United Kingdom
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01691924/file/Visualization_of_Leaf_Botanical_Features_Extracted_from_AlexNet_Convolutional_Layers.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
From spatio-temporal morphogenetic gradients to rhythmic patterning at the shoot apex
auteur
Carlos Galvan-Ampudia, Guillaume Cerutti, Jonathan Legrand, Romain Azaïs, Geraldine Brunoud, Steven Moussu, Christian Wenzl, Jan Lohmann, Christophe Godin, Teva Vernoux
article
2018
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https://hal.inria.fr/hal-01937928/file/469718.full.pdf BibTex
titre
MorphoNet: An interactive online morphological browser to explore complex multi-scale data
auteur
Bruno Leggio, Julien Laussu, Axel Carlier, Christophe Godin, Patrick Lemaire, Emmanuel Faure
article
2018
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titre
Contact-dependent cell-cell communications drive morphological invariance during ascidian embryogenesis
auteur
Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Bruno Leggio, Emmanuel Faure, Julien Laussu, Lars Hufnagel, Grégoire Malandain, Christophe Godin, Patrick Lemaire
article
2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01938126/file/238741.1.full.pdf BibTex
titre
Inference for conditioned Galton-Watson trees from their Harris path
auteur
Romain Azaïs, Alexandre Genadot, Benoît Henry
article
2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01360650/file/main.pdf BibTex

2017

Conference papers

titre
Segmentation Algorithm on Smartphone Dual Camera: Application to Plant Organs in the Wild
auteur
Sarah Bertrand, Guillaume Cerutti, Laure Tougne
article
10th International Conference on Machine Vision, Nov 2017, Vienna, Austria
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