MAMBA team publications

2019

Journal articles

titre

Early stage prion assembly involves two subpopulations with different quaternary structures and a secondary templating pathway

auteur

Angélique Igel-Egalon, Florent Laferrière, Mohammed Moudjou, Jan Bohl, Mathieu Mezache, Tina Knäpple, Laetitia Herzog, Fabienne Reine, Christelle Jas-Duval, Marie Doumic, Human Rezaei, Vincent Beringue

article

Communications Biology, Nature Publishing Group, 2019, 2 (1), ⟨10.1038/s42003-019-0608-y⟩

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titre

Mathematical Models of Gene Expression

auteur

Philippe Robert

article

Probability Surveys, Institute of Mathematical Statistics (IMS), 2019, 16, pp.56

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titre

On the Asymptotic Distribution of Nucleation Times of Polymerization Processes

auteur

Philippe Robert, Wen Sun

article

SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2019, 79 (5), pp.27. ⟨10.1137/19M1237508⟩

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titre

A cohort longitudinal study identifies morphology and hemodynamics predictors of abdominal aortic aneurysm growth

auteur

Florian Joly, Gilles Soulez, Simon Lessard, Claude Kauffmann, Irene Vignon-Clementel

article

Annals of Biomedical Engineering, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s10439-019-02375-1⟩

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titre

A Stochastic Analysis of a Network with Two Levels of Service

auteur

Vianney Boeuf, Philippe Robert

article

Queueing Systems, Springer Verlag, In press, 92 (3-4), pp.30. ⟨10.1007/s11134-019-09617-y⟩

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titre

Cyclic asymptotic behaviour of a population reproducing by fission into two equal parts

auteur

Etienne Bernard, Marie Doumic, Pierre Gabriel

article

Kinetic and Related Models , AIMS, 2019, 12 (3), pp.551-571. ⟨10.3934/krm.2019022⟩

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titre

Adaptive dynamics of hematopoietic stem cells and their supporting stroma: A model and mathematical analysis

auteur

Thanh Nam Nguyen, Jean Clairambault, Thierry Jaffredo, Benoît Perthame, Delphine Salort

article

Mathematical Biosciences and Engineering, AIMS Press, 2019, 16 (05), pp.4818-4845. ⟨10.3934/mbe.2019243.⟩

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titre

A survey of adaptive cell population dynamics models of emergence of drug resistance in cancer, and open questions about evolution and cancer

auteur

Jean Clairambault, Camille Pouchol

article

BIOMATH, Biomath Forum, 2019, BIOMATH 2019, 8 (1), pp.23. ⟨10.11145/j.biomath.2019.05.147⟩

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titre

Extra-cellular matrix rigidity may dictate the fate of injury outcome

auteur

Diane Peurichard, Marielle Ousset, Jenny Paupert, Benjamin Aymard, Anne Lorsignol, Louis Casteilla, Pierre Degond

article

Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2019, 469, pp.127-136. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.02.017⟩

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titre

Bidirectional sliding of two parallel microtubules generated by multiple identical motors

auteur

Jun Allard, Marie Doumic, Alex Mogilner, Dietmar Oelz

article

Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2019, ⟨10.1007/s00285-019-01369-w⟩

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titre

Analysis of Large Urn Models with Local Mean-Field Interactions

auteur

Wen Sun, Philippe Robert

article

Electronic Journal of Probability, Institute of Mathematical Statistics (IMS), In press, 24 (45), pp.33

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titre

Quantitative cell-based model predicts mechanical stress response of growing tumor spheroids over various growth conditions and cell lines

auteur

Paul van Liedekerke, Johannes Neitsch, Tim Johann, Kévin Alessandri, Pierre Nassoy, Dirk Drasdo

article

PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2019, 15 (3), pp.e1006273. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006273⟩

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titre

Steady distribution of the incremental model for bacteria proliferation

auteur

Pierre Gabriel, Hugo Martin

article

Networks and Heterogeneous Media, AIMS-American Institute of Mathematical Sciences, 2019, Special issue on mathematical methods in systems biology, 14 (1), pp.149-171. ⟨10.3934/nhm.2019008⟩

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titre

Energy and implicit discretization of the Fokker-Planck and Keller-Segel type equations

auteur

Luís Almeida, Federica Bubba, Benoît Perthame, Camille Pouchol

article

Networks and Heterogeneous Media, AIMS-American Institute of Mathematical Sciences, 2019, 14 (1), ⟨10.3934/nhm.2019002⟩

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titre

The Flux Limited Keller-Segel System; Properties and Derivation from Kinetic Equations

auteur

Benoît Perthame, Nicolas Vauchelet, Zhian Wang

article

Revista Matemática Iberoamericana, European Mathematical Society, In press

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titre

Oscillatory regimes in a mosquito population model with larval feedback on egg hatching

auteur

Martin Strugarek, Laetitia Dufour, Nicolas Vauchelet, Luís Almeida, Benoît Perthame, Daniel Villela

article

Journal of Biological Dynamics, Taylor & Francis Open, 2019, 13 (1), pp.269-300. ⟨10.1080/17513758.2019.1593524⟩

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titre

Implementation of Control Strategies for Sterile Insect Techniques

auteur

Pierre-Alexandre Bliman, Daiver Cardona-Salgado, Yves Dumont, Olga Vasilieva

article

Mathematical Biosciences, Elsevier, 2019, 314, pp.43-60. ⟨10.1016/j.mbs.2019.06.002⟩

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titre

An evolutionary perspective on cancer, with applications to anticancer drug resistance modelling and perspectives in therapeutic control

auteur

Jean Clairambault

article

Journal of Mathematical Study, Global Science Press, In press, pp.1 - 21

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titre

Sparse control of Hegselmann-Krause models: Black hole and declustering

auteur

Benedetto Piccoli, Nastassia Pouradier Duteil, Emmanuel Trélat

article

SIAM Journal on Control and Optimization, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2019, 57 (4), pp.2628--2659. ⟨10.1137/18M1168911⟩

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titre

Phase portrait control for 1D monostable and bistable reaction-diffusion equations

auteur

Camille Pouchol, Emmanuel Trélat, Enrique Zuazua

article

Nonlinearity, IOP Publishing, 2019, 32 (3), pp.884--909. ⟨10.1088/1361-6544/aaf07e⟩

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titre

A Scaling Analysis of a Star Network with Logarithmic Weights

auteur

Philippe Robert, Amandine Véber

article

Stochastic Processes and their Applications, Elsevier, 2019, ⟨10.1016/j.spa.2018.06.002⟩

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titre

Optimal releases for population replacement strategies, application to Wolbachia

auteur

Luís Almeida, Yannick Privat, Martin Strugarek, Nicolas Vauchelet

article

SIAM Journal on Mathematical Analysis, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2019, 51 (4), pp.3170--3194. ⟨10.1137/18M1189841⟩

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Conference papers

titre

Feedback Control Principles for Biological Control of Dengue Vectors

auteur

Pierre-Alexandre Bliman

article

European Control Conference ECC19, Jun 2019, Naples, Italy. pp.6

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Habilitation à diriger des recherches

titre

Quantitative modeling of cell and tissue mechanics with agent-based models

auteur

Paul van Liedekerke

article

Biological Physics [physics.bio-ph]. Inria Paris, Sobonne Université, 2019

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Theses

titre

Étude de données et analyse de modèles intégro-différentiels en biologie cellulaire

auteur

Hugo Martin

article

Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Sorbonne Université - Laboratoire Jacques-Louis Lions, 2019. Français

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Preprints, Working Papers, ...

titre

Testing for high frequency features in a noisy signal

auteur

Mathieu Mezache, Marc Hoffmann, Human Rezaei, Marie Doumic

article

2019

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titre

A Positivity-Preserving Finite Element Scheme for the Relaxed Cahn-Hilliard Equation with Single-Well Potential and Degenerate Mobility

auteur

Federica Bubba, Alexandre Poulain

article

2019

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titre

Periodic asymptotic dynamics of the measure solutions to an equal mitosis equation

auteur

Pierre Gabriel, Hugo Martin

article

2019

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titre

Reaction-diffusion systems with initial data of low regularity

auteur

El-Haj Laamri, Benoît Perthame

article

2019

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titre

Multiple asymptotics of kinetic equations with internal states

auteur

Benoît Perthame, Weiran Sun, Min Tang, Shugo Yasuda

article

2019

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titre

Estimating the division rate from indirect measurements of single cells

auteur

Marie Doumic, Adélaïde Olivier, Lydia Robert

article

2019

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titre

A survey of adaptive cell population dynamics models of emergence of drug resistance in cancer, and open questions about evolution and cancer

auteur

Jean Clairambault, Camille Pouchol

article

2019

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titre

Social Dynamics Models with Time-Varying Influence

auteur

Sean Mcquade, Benedetto Piccoli, Nastassia Pouradier Duteil

article

2019

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titre

Monge-Kantorovich distance for PDEs: the coupling method

auteur

Nicolas Fournier, Benoît Perthame

article

2019

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titre

Modelling adhesion-independent cell migration

auteur

Gaspard Jankowiak, Diane Peurichard, Anne Reversat, Christian Schmeiser, Michael Sixt

article

2019

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titre

Control strategies on mosquitos population for the fight against arboviruses

auteur

Luís Almeida, Michel Duprez, Yannick Privat, Nicolas Vauchelet

article

2019

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titre

Quantitative agent-based modeling reveals mechanical stress response of growing tumor spheroids is predictable over various growth conditions and cell lines

auteur

Paul Liedekerke, Johannes Neitsch, Tim Johann, Kévin Alessandri, Pierre Nassoy, Dirk Drasdo

article

2019

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titre

Hele-Shaw limit for a system of two reaction-(cross-)diffusion equations for living tissues

auteur

Federica Bubba, Benoît Perthame, Camille Pouchol, Markus Schmidtchen

article

2019

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titre

Implicit and Semi-implicit Numerical Schemes for the Gradient Flow of the Formation of Biological Transport Networks

auteur

Di Fang, Shi Jin, Peter Markowich, Benoît Perthame

article

2019

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2018

Journal articles

titre

Relative Entropy Method for Measure Solutions of the Growth-Fragmentation Equation

auteur

Tomasz Dębiec, Marie Doumic, Piotr Gwiazda, Emil Wiedemann

article

SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2018, 50 (6), pp.5811-5824

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titre

Estimating the division rate and kernel in the fragmentation equation

auteur

Marie Doumic, Miguel Escobedo, Magali Tournus

article

Annales de l'Institut Henri Poincaré (C) Non Linear Analysis, Elsevier, 2018, 35 (7), pp.1847-1884. ⟨10.1016/j.anihpc.2018.03.004⟩

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titre

Long-time asymptotics for polymerization models

auteur

Juan Calvo, Marie Doumic, Benoît Perthame

article

Communications in Mathematical Physics, Springer Verlag, 2018, 363 (1), pp.111-137. ⟨10.1007/s00220-018-3218-5⟩

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titre

Bile Microinfarcts in Cholestasis Are Initiated by Rupture of the Apical Hepatocyte Membrane and Cause Shunting of Bile to Sinusoidal Blood

auteur

Ahmed Ghallab, Ute Hofmann, Selahaddin Sezgin, Nachiket Vartak, Reham Hassan, Ayham Zaza, Patricio Godoy, Kai Markus Schneider, Georgia Guenther, Yasser Ahmed, Aya Abbas, Verena Keitel, Lars Kuepfer, Steven Dooley, Frank Lammert, Christian Trautwein, Michael Spiteller, Dirk Drasdo, Alan Hofmann, Peter L.M. Jansen, Jan Hengstler, Raymond Reif

article

Hepatology, Wiley-Blackwell, 2018

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titre

Stabilization of periodic orbits of discrete-time dynamical systems using the Prediction-Based Control: New control law and practical aspects

auteur

T.P. Chagas, Pierre-Alexandre Bliman, K.H. Kienitz

article

Journal of The Franklin Institute, Elsevier, 2018, 355 (12), pp.4771-4793. ⟨10.1016/j.jfranklin.2018.04.040⟩

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titre

Control in dormancy or eradication of cancer stem cells: Mathematical modeling and stability issues

auteur

Walid Djema, Catherine Bonnet, Frédéric Mazenc, Jean Clairambault, Emilia Fridman, Pierre Hirsch, François Delhommeau

article

Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2018, 449, pp.103 - 123. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.03.038⟩

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titre

Dynamics of concentration in a population model structured by age and a phenotypical trait

auteur

Samuel Nordmann, Benoît Perthame, Cécile Taing

article

Acta Applicandae Mathematicae, Springer Verlag, 2018, 155 (1), ⟨10.1007/s10440-017-0151-0⟩

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titre

The fractional diffusion limit of a kinetic model with biochemical pathway

auteur

Benoît Perthame, Weiran Sun, Min Tang

article

Zeitschrift für Angewandte Mathematik und Physik, Springer Verlag, 2018, 69:67, ⟨10.1007/s00033-018-0964-3⟩

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titre

Model Prediction and Validation of an Order Mechanism Controlling the Spatiotemporal Phenotype of Early Hepatocellular Carcinoma

auteur

Stefan Hoehme, François Bertaux, William Weens, Bettina Grasl-Kraupp, Jan Hengstler, Dirk Drasdo

article

Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2018, 80 (5), pp.1134-1171

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titre

Career plans and wage structures: a mean field game approach

auteur

Benoît Perthame, Edouard Ribes, Delphine Salort

article

Mathematics in Engineering, AIMS, 2018, 1 (1), pp.47-63. ⟨10.3934/Mine.2018.1.47⟩

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titre

A Large Scale Analysis of Unreliable Stochastic Networks

auteur

Reza Aghajani, Philippe Robert, Wen Sun

article

Annals of Applied Probability, Institute of Mathematical Statistics (IMS), In press, 28 (2), pp.36. ⟨10.1214/17-AAP1318⟩

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titre

Approximate Prediction-Based Control Method for Nonlinear Oscillatory Systems with Applications to Chaotic Systems

auteur

Thiago Chagas, Pierre-Alexandre Bliman, Karl Kienitz

article

Journal of Control Science and Engineering, Hindawi Publishing Corporation, 2018, 2018, pp.1-29. ⟨10.1155/2018/3298286⟩

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titre

Analysis of a system describing proliferative-quiescent cell dynamics

auteur

Jean Clairambault, Benoît Perthame, Andrada Quillas Maran

article

Chinese Annals of Mathematics - Series B, Springer Verlag, 2018, pp.1-13

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titre

Global stability with selection in integro-differential Lotka-Volterra systems modelling trait-structured populations

auteur

Camille Pouchol, Emmanuel Trélat

article

Journal of Biological Dynamics, Taylor & Francis Open, 2018, 12 (1), pp.872--893

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titre

Quantitative analysis of hepatic macro- and microvascular alterations during cirrhogenesis in the rat

auteur

Geert Peeters, Charlotte Debbaut, Adrian Friebel, Pieter Cornillie, Winnok de Vos, Kasper Favere, Ingrid Vander Elst, Tim Vandecasteele, Tim Johann, Luc van Hoorebeke, Diethard Monbaliu, Dirk Drasdo, Stefan Hoehme, Wim Laleman, Patrick Segers

article

Journal of Anatomy, Wiley, In press, ⟨10.1111/joa.12760⟩

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titre

A Functional Central Limit Theorem for the Becker-Döring model

auteur

Wen Sun

article

Journal of Statistical Physics, Springer Verlag, 2018, 171 (1), pp.145-165. ⟨10.04059⟩

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titre

Stiff-response-induced instability for chemotactic bacteria and flux-limited Keller-Segel equation

auteur

Benoît Perthame, Shugo Yasuda

article

Nonlinearity, IOP Publishing, 2018, 31 (9), ⟨10.1088/1361-6544/aac760⟩

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titre

Traveling Wave and Aggregation in a Flux-Limited Keller-Segel Model

auteur

Vincent Calvez, Benoît Perthame, Shugo Yasuda

article

Kinetic and Related Models , AIMS, 2018, 11 (4), pp.891-909. ⟨10.3934/krm.2018035⟩

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titre

Asymptotic analysis and optimal control of an integro-differential system modelling healthy and cancer cells exposed to chemotherapy

auteur

Camille Pouchol, Jean Clairambault, Alexander Lorz, Emmanuel Trélat

article

Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, Elsevier, 2018, 116, pp.268--308. ⟨10.1016/j.matpur.2017.10.007⟩

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titre

Super-linear propagation for a general, local cane toads model

auteur

Christopher Henderson, Benoît Perthame, Panagiotis Souganidis

article

Interfaces and Free Boundaries, European Mathematical Society, 2018, 20 (4), pp.483-509. ⟨10.4171/IFB/409⟩

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Conference papers

titre

Stability Analysis of a Nonlinear System with Infinite Distributed Delays Describing Cell Dynamics

auteur

Walid Djema, Frédéric Mazenc, Catherine Bonnet, Jean Clairambault, Emilia Fridman

article

IEEE American Control Conference (ACC 2018), Jun 2018, Milwaukee, United States. ⟨10.23919/acc.2018.8430869 ⟩

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titre

Introducing Cell-Plasticity Mechanisms into a Class of Cell Population Dynamical Systems

auteur

Walid Djema, Catherine Bonnet, Frédéric Mazenc, Jean Clairambault

article

IEEE American Control Conference (ACC 2018), Jun 2018, Milwaukee, United States. ⟨10.23919/acc.2018.8430758 ⟩

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titre

A class of nonlinear adaptive observers for SIR epidemic model

auteur

Pierre-Alexandre Bliman, Denis Efimov, Rosane Ushirobira

article

ECC 2018 - European Control Conference, Jun 2018, Limassol, Cyprus. pp.6

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titre

Interval observer for uncertain time-varying SIR-SI epidemiological model of vector-borne disease

auteur

Maria Soledad Aronna, Pierre-Alexandre Bliman

article

ECC 2018 - European Control Conference, Jun 2018, Limassol, Cyprus. pp.1-6

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Book sections

titre

Why Is Evolution Important in Cancer and What Mathematics Should Be Used to Treat Cancer? Focus on Drug Resistance

auteur

Luís Almeida, Rebecca Chisholm, Jean Clairambault, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Camille Pouchol, Emmanuel Trélat

article

Trends in Biomathematics: Modeling, Optimization and Computational Problems: Selected works from the BIOMAT Consortium Lectures, Moscow 2017, Springer International Publishing, pp.107-120, 2018

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titre

Agent-Based Lattice Models of Multicellular Systems

auteur

Paul van Liedekerke, Andreas Buttenschön, Dirk Drasdo

article

Numerical Methods and Advanced Simulation in Biomechanics and Biological Processes, Elsevier, pp.223-238, 2018, ⟨10.1016/B978-0-12-811718-7.00012-5⟩

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titre

Agent-Based Lattice Models of Multicellular Systems

auteur

Dirk Drasdo, A. Buttenschön, Paul van Liedekerke

article

Numerical Methods and Advanced Simulation in Biomechanics and Biological Processes, Elsevier, pp.223-238, 2018, ⟨10.1016/B978-0-12-811718-7.00012-5⟩

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Directions of work or proceedings

titre

Explicit Solution and Fine Asymptotics for a Critical Growth-Fragmentation Equation

auteur

Marie Doumic, Bruce van Brunt

article

ESAIM: Proceedings and Surveys, 62, pp.30-42, 2018, ⟨10.1051/proc/201862030⟩

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Habilitation à diriger des recherches

titre

Étude mathématique de modèles cinétiques, fluides et paraboliques issus de la biologie

auteur

Ayman Moussa

article

Mathématiques [math]. Sorbonne Université - Laboratoire Jacques-Louis Lions, 2018

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Master thesis

titre

Modélisation du métabolisme énergétique tumoral glycolytique vs. respiratoire oxydatif

auteur

Loïs Naudin

article

Mathématiques [math]. 2018

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Theses

titre

New Network / IT Command: Virtualized Function Performance for a Programmable Infrastructure

auteur

Veronica Karina Quintuna Rodriguez

article

Networking and Internet Architecture [cs.NI]. Sorbonne Université, 2018. English

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titre

Mathematical modeling of population dynamics, applications to vector control of Aedes spp. (Diptera:Culicidae)

auteur

Martin Strugarek

article

Analysis of PDEs [math.AP]. Sorbonne Université UPMC, 2018. English

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titre

Analysis, control and optimisation of PDEs, application to the biology and therapy of cancer

auteur

Camille Pouchol

article

Mathematics [math]. Sorbonne Université, 2018. English

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titre

A study of interacting stochastic networks :large scale, long time behavior and fluctuations

auteur

Wen Sun

article

Probability [math.PR]. Université Pierre et Marie Curie, 2018. English

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titre

Dynamique de concentration dans des équations aux dérivées partielles non locales issues de la biologie

auteur

Cécile Taing

article

Mathématiques [math]. Sorbonne Université, UPMC University of Paris 6, Laboratoire Jacques-Louis Lions, 2018. Français

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Preprints, Working Papers, ...

titre

The Division of Amyloid Fibrils

auteur

David Béal, Magali Tournus, Ricardo Marchante, Tracey Purton, David Smith, Mick Tuite, Marie Doumic, Wei-Feng Xue

article

2018

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titre

A quantitative high resolution computational mechanics cell model for growing and regenerating tissues

auteur

Paul Liedekerke, Johannes Neitsch, Tim Johann, Enrico Warmt, Ismael Gonzàlez-Valverde, Stefan Hoehme, Steffen Grosser, Josef Kaes, Dirk Drasdo

article

2018

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titre

Derivation of an integrate&fire equation for neural networks from a voltage-conductance kinetic model

auteur

Benoît Perthame, Delphine Salort

article

2018

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titre

The Equilibrium States of Large Networks of Erlang Queues

auteur

Davit Martirosyan, Philippe Robert

article

2018

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titre

A chemotaxis-based explanation of spheroid formation in 3D cultures of breast cancer cells

auteur

Federica Bubba, Camille Pouchol, Nathalie Ferrand, Guillaume Vidal, Luís Almeida, Benoıt Perthame, Michèle Sabbah

article

2018

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titre

A bi-monomeric, nonlinear Becker-Döring-type system to capture oscillatory aggregation kinetics in prion dynamics

auteur

Marie Doumic, Klemens Fellner, Mathieu Mezache, Human Rezaei

article

2018

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titre

On the use of the sterile insect technique or the incompatible insect technique to reduce or eliminate mosquito populations

auteur

Martin Strugarek, Herve Bossin, Yves Dumont

article

2018

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titre

Sharp seasonal threshold property for cooperative population dynamics with concave nonlinearities

auteur

Martin Strugarek, Hongjun Ji

article

2018

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titre

Multiplicative ergodic theorem for a non-irreducible random dynamical system

auteur

Davit Martirosyan, Vahagn Nersesyan

article

2018

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titre

On the stability of the state 1 in the non-local Fisher-KPP equation in bounded domains

auteur

Camille Pouchol

article

2018

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titre

Combination of direct methods and homotopy in numerical optimal control: application to the optimization of chemotherapy in cancer

auteur

Antoine Olivier, Camille Pouchol

article

2018

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2017

Journal articles

titre

Hybrid coupling of a one-dimensional Energy-Transport Schrödinger system

auteur

Clément Jourdana, Paola Pietra, Nicolas Vauchelet

article

Monatshefte für Mathematik, Springer Verlag, 2017, 184 (4), pp.563-596. ⟨10.1007/s00605-016-1008-8⟩

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titre

Corrigendum

auteur

Geert Peeters, Charlotte Debbaut, Wim Laleman, Adrian Friebel, Diethard Monbaliu, Ingrid Vander Elst, Detrez Jan R., Tim Vandecasteele, Tim Johann, Thomas de Schryver, Luc van Hoorebeke, Kasper Favere, Verbeke Jonas, Dirk Drasdo, Stefan Hoehme, Patrick Segers, Pieter Cornillie, Vos Winnok H. De

article

Journal of Anatomy, Wiley, 2017, 231 (5), pp.786-786. ⟨10.1111/joa.12723⟩

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titre

Adverse outcome pathways: opportunities, limitations and open questions

auteur

Marcel Leist, Ahmed Ghallab, Rabea Graepel, Rosemarie Marchan, Reham Hassan, Susanne Hougaard Bennekou, Alice Limonciel, Mathieu Vinken, Stefan Schildknecht, Tanja Waldmann, Erik Danen, Ben van Ravenzwaay, Hennicke Kamp, Iain Gardner, Patricio Godoy, Frédéric Bois, Albert Braeuning, Raymond Reif, Franz Oesch, Dirk Drasdo, Stefan Höhme, Michael Schwarz, Thomas Hartung, Thomas Braunbeck, Joost Beltman, Harry Vrieling, Ferran Sanz, Anna Forsby, Domenico Gadaleta, Ciarán Fisher, Jens Kelm, David Fluri, Gerhard Ecker, Barbara Zdrazil, Andrea Terron, Paul Jennings, Bart van der Burg, Steven Dooley, Annemarie Meijer, Egon Willighagen, Marvin Martens, Chris Evelo, Enrico Mombelli, Olivier Taboureau, Albert Mantovani, Barry Hardy, Bjorn Koch, Sylvia Escher, Chris van Thriel, Cristina Cadenas, D. Kroese, Bob van de Water, Jan Hengstler

article

Archives of Toxicology, Springer Verlag, 2017, 91 (11), pp.3477-3505. ⟨10.1007/s00204-017-2045-3⟩

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titre

Ensuring successful introduction of Wolbachia in natural populations of Aedes aegypti by means of feedback control

auteur

Pierre-Alexandre Bliman, M. Soledad Aronna, Flávio C. Coelho, Moacyr A. H. B. da Silva

article

Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2017, ⟨10.1007/s00285-017-1174-x⟩

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titre

Synchronising and non-synchronising dynamics for a two-species aggregation model

auteur

Casimir Emako, Jie Liao, Nicolas Vauchelet

article

Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2017, 22 (6), pp.2121 - 2146. ⟨10.3934/dcdsb.2017088⟩

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titre

Integrating Biological and Mathematical Models to Explain and Overcome Drug Resistance in Cancer, Part 1: Biological Facts and Studies in Drug Resistance

auteur

Aaron Goldman, Mohammad Kohandel, Jean Clairambault

article

Current Stem Cell Reports, Springer, 2017, ⟨10.1007/s40778-017-0097-1⟩

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titre

Integrating Biological and Mathematical Models to Explain and Overcome Drug Resistance in Cancer, Part 2: From Theoretical Biology to Mathematical Models

auteur

Aaron Goldman, Mohammad Kohandel, Jean Clairambault

article

Current Stem Cell Reports, Springer, 2017, ⟨10.1007/s40778-017-0098-0⟩

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titre

The mechanism of monomer transfer between two structurally distinct PrP oligomers

auteur

Aurora Armiento, Philippe Moireau, Davy Martin, Nad’a Lepejova, Marie Doumic, Human Rezaei

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (7), ⟨10.1371/journal.pone.0180538⟩

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titre

Analysis of a Stochastic Model of Replication in Large Distributed Storage Systems

auteur

Wen Sun, Véronique Simon, Sébastien Monnet, Philippe Robert, Pierre Sens

article

Proceedings of the ACM on Measurement and Analysis of Computing Systems , ACM, 2017, 1 (1), pp.1 - 21. ⟨10.1145/3084462⟩

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titre

How does variability in cells aging and growth rates influence the malthus parameter?

auteur

Adélaïde Olivier

article

Kinetic and Related Models , AIMS, 2017, 10 (2), pp.481-512. ⟨10.3934/krm.2017019⟩

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titre

Analytical examples of diffusive waves generated by a traveling wave

auteur

Harold Moundoyi, Ayman Moussa, Benoît Perthame, Benoît Sarels

article

Applicable Analysis, Taylor & Francis, 2017, ⟨10.1080/00036811.2017.1314463⟩

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titre

Toward an integrated workforce planning framework using structured equations

auteur

Marie Doumic, Benoît Perthame, Edouard Ribes, Delphine Salort, Nathan Toubiana

article

European Journal of Operational Research, Elsevier, 2017, 262, ⟨10.1016/j.ejor.2017.03.076⟩

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titre

Positive effect of Mdm2 on p53 expression explains excitability of p53 in response to DNA damage

auteur

Jan Elias

article

Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2017, 418, pp.94-104. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.01.038⟩

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titre

On interfaces between cell populations with different mobilities

auteur

Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Benoît Perthame

article

Kinetic and Related Models , AIMS, 2017, 10 (1), pp.299-311

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titre

Balanced Growth Path Solutions of a Boltzmann Mean Field Game Model for Knowledge Growth

auteur

Martin Burger, Alexander Lorz, Marie-Therese Wolfram

article

Kinetic and Related Models , AIMS, 2017, ⟨10.3934/krm.2017005⟩

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titre

Dirac concentrations in a chemostat model of adaptive evolution

auteur

Alexander Lorz, Benoît Perthame, Cécile Taing

article

Chinese Annals of Mathematics - Series B, Springer Verlag, 2017

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titre

Modulating Portal Hemodynamics With Vascular Ring Allows Efficient Regeneration After Partial Hepatectomy in a Porcine Model.

auteur

Petru O. Bucur, Mohamed Bekheit, Chloe Audebert, Amnah Othman, Seddik Hammad, Mylène Sebagh, Marc Antoine Allard, Benoît Decante, Adrian Friebel, Dirk Drasdo, Elodie Miquelestorena-Standley, Jan G. Hengstler, Irene Vignon-Clementel, Eric Vibert

article

Annals of Surgery, Lippincott, Williams & Wilkins, 2017, ⟨10.1097/SLA.0000000000002146⟩

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titre

Effects of initial telomere length distribution on senescence onset and heterogeneity

auteur

Sarah Eugene, Thibault Bourgeron, Zhou Xu

article

Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2017, 413, pp.8

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titre

A numerical scheme for the early steps of nucleation-aggregation Models

auteur

H. T. Banks, Marie Doumic, Carola Kruse

article

Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2017, 74 (1-2), pp.259-287. ⟨10.1007/s00285-016-1026-0⟩

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titre

Distributed synaptic weights in a LIF neural network and learning rules

auteur

Benoît Perthame, Delphine Salort, Gilles Wainrib

article

Physica D: Nonlinear Phenomena, Elsevier, 2017, 353-354, pp.20-30. ⟨10.1016/j.physd.2017.05.005⟩

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titre

A Hele-Shaw Problem for Tumor Growth

auteur

Antoine Mellet, Benoît Perthame, Fernando Quirós

article

Journal of Functional Analysis, Elsevier, 2017, 273, pp.3061-3093

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titre

From Kinetic Theory of Multicellular Systems to Hyperbolic Tissue Equations: Asymptotic Limits and Computing

auteur

Nisrine Outada, Nicolas Vauchelet, Thami Akrid, Mohamed Khaladi

article

Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, World Scientific Publishing, 2017

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titre

Establishing Traveling Wave in Bistable Reaction-Diffusion System by Feedback

auteur

Pierre-Alexandre Bliman, Nicolas Vauchelet

article

IEEE Control Systems Letters, IEEE, 2017, 1 (1), pp.62-67. ⟨10.1109/LCSYS.2017.2703303 ⟩

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titre

Tumor cell load and heterogeneity estimation from diffusion-weighted MRI calibrated with histological data: an example from lung cancer

auteur

Yi Yin, Oliver Sedlaczek, Benedikt Müller, Arne Warth, Margarita González-Vallinas, Bernd Lahrmann, Niels Grabe, Hans-Ulrich Kauczor, Kai Breuhahn, Irene Vignon-Clementel, Dirk Drasdo

article

IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, ⟨10.1109/TMI.2017.2698525⟩

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titre

A cooperative conjugate gradient method for linear systems permitting efficient multi-thread implementation

auteur

Amit Bhaya, Pierre-Alexandre Bliman, Guilherme Niedu, Fernando Pazos

article

Computational and Applied Mathematics, Springer Verlag, 2017, pp.1-28. ⟨10.1007/s40314-016-0416-7⟩

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Conference papers

titre

Analysis of Blood Cell Production under Growth Factors Switching

auteur

W Djema, Hitay Ozbay, C. Bonnet, E Fridman, Frédéric Mazenc, J Clairambault

article

IFAC 2017 - 20th World Congress of the International Federation of Automatic Control, Jul 2017, Toulouse, France. pp.13312-13317, ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.1331⟩

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titre

Analysis of a Model of Dormancy in Cancer as a State of Coexistence Between Tumor and Healthy Stem Cells

auteur

W Djema, C. Bonnet, J Clairambault, Frédéric Mazenc, P Hirsch, F Delhommeau

article

IEEE American Control Conference (ACC) 2017, May 2017, Seattle, United States. pp.5135-5140, ⟨10.23919/ACC.2017.7963751⟩

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Book sections

titre

Interval Observers for SIR Epidemic Models Subject to Uncertain Seasonality

auteur

Pierre-Alexandre Bliman, Bettina D 'Avila Barros

article

Lecture Notes in Control and Information Sciences, 471, pp.9, 2017, ⟨10.1007/978-3-319-54211-9_3⟩

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titre

System modeling of receptor-induced apoptosis

auteur

François Bertaux, Dirk Drasdo, Gregory Batt

article

Olivier Micheau. TRAIL, Fas Ligand, TNF and TLR3 in Cancer, 2017, Resistance to Targeted Anti-Cancer Therapeutics, 978-3-319-56804-1

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Master thesis

titre

Conception et identification à partir de données biologiques d’un modèle dédié aux interactions entre cellules souches hématopoïétiques et stromales

auteur

Julie Favre

article

Cancer. 2017

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Documents associated with scientific events

titre

Why is evolution important in cancer and what mathematics should be used to treat cancer? focus on drug resistance

auteur

Luis Almeida, Rebecca Chisholm †, Jean Clairambault, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Camille Pouchol, Emmanuel Trélat

article

Conference Biomat 2017 - 17th International Symposium on Mathematical and Computational Biology, Oct 2017, Moscou, Russia

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Theses

titre

Inverse problems and data assimilation methods applied to protein polymerisation

auteur

Aurora Armiento

article

Optimization and Control [math.OC]. Université Paris 7 - Diderot, 2017. English

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Preprints, Working Papers, ...

titre

A model for cost efficient Workforce Organizational Dynamics and its optimization

auteur

Benoît Perthame, Edouard Ribes, Karim Touahri, Delphine Salort

article

2017

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titre

Strategic Workforce Planning and sales force : a demographic approach to productivity

auteur

Marie Doumic, Mathieu Mezache, Benoît Perthame, Edouard Ribes, Delphine Salort

article

2017

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titre

Trend to equilibrium for a reaction-diffusion system modelling reversible enzyme reaction

auteur

Jan Elias

article

2017

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titre

Hindrances to bistable front propagation: application to Wolbachia invasion

auteur

Grégoire Nadin, Martin Strugarek, Nicolas Vauchelet

article

2017

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Videos

titre

Simulation of the critical fragmentation equation with binary fission

auteur

Marie Doumic

article

2017

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2016

Journal articles

titre

Tracking the evolution of cancer cell populations through the mathematical lens of phenotype-structured equations

auteur

Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Jean Clairambault

article

Biology Direct, 2016, 11 (1), pp.43. ⟨10.1186/s13062-016-0143-4⟩

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titre

Tracking the evolution of cancer cell populations through the mathematical lens of phenotype-structured equations

auteur

Rebecca Chisholm, Tommaso Lorenzi, Jean Clairambault

article

Biology Direct, BioMed Central, 2016, 11 (1), pp.43. ⟨10.1186/s13062-016-0143-4⟩

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titre

Asymptotics of Stochastic Protein Assembly Models

auteur

Marie Doumic, Sarah Eugene, Philippe Robert

article

SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2016, 76 (6), pp.20. ⟨10.1137/16M1066920⟩

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titre

Behavioral modulation of the coexistence between Apis melifera and Varroa destructor : A defense against colony colapse disorder?

auteur

Joyce de Figueiró Santos, Flávio Codeço Coelho, Pierre-Alexandre Bliman

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2016

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titre

Time Asymptotics for a Critical Case in Fragmentation and Growth-Fragmentation Equations

auteur

Marie Doumic, Miguel Escobedo

article

Kinetic and Related Models , AIMS, 2016, 9 (2), pp.47. ⟨10.3934/krm.2016.9.251⟩

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titre

Notes on a PDE System for Biological Network Formation

auteur

Jan Haskovec, Peter Markowich, Benoît Perthame, Matthias Schlottbom

article

Nonlinear Analysis: Real World Applications, Elsevier, 2016, Nonlinear Partial Differential Equations, in honor of Juan Luis Vázquez for his 70th birthday, 138, pp.127-155. ⟨10.1016/j.na.2015.12.018⟩

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titre

Insights into the variability of nucleated amyloid polymerization by a minimalistic model of stochastic protein assembly

auteur

Sarah Eugene, Wei-Feng Xue, Philippe Robert, Marie Doumic

article

Journal of Chemical Physics, American Institute of Physics, 2016, 144 (17), pp.12. ⟨10.1063/1.4947472⟩

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titre

Traveling Pulses for a Two-Species Chemotaxis Model

auteur

Casimir Emako, Charlène Gayrard, Axel Buguin, Luís Neves de Almeida, Nicolas Vauchelet

article

PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2016, 12 (4), pp.e1004843. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004843⟩

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titre

Estimation from Moments Measurements for Amyloid Depolymerisation

auteur

Aurora Armiento, Marie Doumic, Philippe Moireau, Human Rezaei

article

Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.jtbi.2016.02.037⟩

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titre

Derivation of the bacterial run-and-tumble kinetic equation from a model with biochemical pathway

auteur

Benoît Perthame, Min Tang, Nicolas Vauchelet

article

Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2016

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titre

Epidemiological data accessibility in Brazil: Current challenges for an adequate response to emergencies

auteur

Flávio Codeço Coelho, Cláudia Torres Codeço, Oswaldo Gonçalves Cruz, Sabrina Camargo, Pierre-Alexandre Bliman

article

The Lancet Infectious Diseases, New York, NY : Elsevier Science ; The Lancet Pub. Group, 2001-, 2016, 16, pp.524 - 525. ⟨10.1016/S1473-3099(16)30007-X⟩

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titre

Equivalence between duality and gradient flow solutions for one-dimensional aggregation equations

auteur

Francois James, Nicolas Vauchelet

article

Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series A, American Institute of Mathematical Sciences, 2016, 36 (3), pp.1355-1382

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titre

Uncertainty propagation; intrusive kinetic formulations of scalar conservation laws

auteur

Bruno Després, Benoît Perthame

article

SIAM/ASA Journal on Uncertainty Quantification, ASA, American Statistical Association, 2016, 4 (1), pp.980-1013

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titre

Mathematics of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics: Diversity of Topics, Models and Methods

auteur

Gennady Bocharov, Anas Bouchnita, Jean Clairambault, Vitaly Volpert

article

Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2016

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titre

Physiologically structured cell population dynamic models with applications to combined drug delivery optimisation in oncology

auteur

Jean Clairambault, Olivier Fercoq

article

Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2016, pp.22. ⟨10.1051/mmnp/201611604⟩

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titre

Rare mutations limit of a steady state dispersal evolution model

auteur

Benoît Perthame, Panagiotis E. Souganidis

article

Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2016, 11 (4), ⟨10.1051/mmnp/201611411⟩

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titre

Hydrodynamic singular regimes in 1+1 kinetic models and spectral numerical methods

auteur

Laurent Gosse, Nicolas Vauchelet

article

Journal of Mathematical Analysis and Applications, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.jmaa.2016.07.059⟩

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titre

Free boundary problems for tumor growth: a viscosity solutions approach

auteur

Inwon Kim, Benoît Perthame, Panagiotis E. Souganidis

article

Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, Elsevier, 2016, 138, pp.207-228. ⟨10.1016/j.na.2016.01.019⟩

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titre

Cooperative concurrent asynchronous computation of the solution of symmetric linear systems

auteur

Amit Bhaya, Pierre-Alexandre Bliman, Fernando Pazos

article

Numerical Algorithms, Springer Verlag, 2016, ⟨10.1007/s11075-016-0213-9⟩

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titre

The Filippov characteristic flow for the aggregation equation with mildly singular potentials

auteur

José Antonio Carrillo, Francois James, Frédéric Lagoutière, Nicolas Vauchelet

article

Journal of Differential Equations, Elsevier, 2016, 260 (1), pp.304-338

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titre

Inferring Growth Control Mechanisms in Growing Multi-cellular Spheroids of NSCLC Cells from Spatial-Temporal Image Data

auteur

Nick Jagiella, Benedikt Müller, Margareta Müller, Irene E. Vignon-Clementel, Dirk Drasdo

article

PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2016, 12 (2), pp.e1004412. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004412⟩

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titre

On a Boltzmann mean field model for knowledge growth

auteur

Martin Burger, Alexander Lorz, Marie-Therese Wolfram

article

SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2016, ⟨10.1137/15M1018599⟩

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titre

Reduction to a single closed equation for 2 by 2 reaction-diffusion systems of Lotka-Volterra type

auteur

Martin Strugarek, Nicolas Vauchelet

article

SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2016, 76 (5), pp.2060-2080

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titre

Semi-discretization for Stochastic Scalar Conservation Laws with Multiple Rough Fluxes

auteur

Benjamin Gess, Benoît Perthame, Panagiotis E. Souganidis

article

SIAM Journal on Numerical Analysis, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2016, 54 (4), pp.2187-2209. ⟨10.1137/15M1053670⟩

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Conference papers

titre

Stability of a Delay System Coupled to a Differential-Difference System Describing the Coexistence of Ordinary and Mutated Hematopoietic Stem Cells

auteur

Walid Djema, Frédéric Mazenc, Catherine Bonnet, Jean Clairambault, P Hirsch, François Delhommeau

article

55th IEEE Conference on Decision and Control (CDC 2016), Dec 2016, Las Vegas, United States. ⟨10.1109/cdc.2016.7798328 ⟩

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titre

Quantitative Estimation of Tumor Cellularity Based on Histology Data

auteur

Yi Yin, Oliver Sedlaczek, Arne Warth, Margarita González-Vallinas, Kai Breuhahn, Irene Vignon-Clementel, Dirk Drasdo

article

IEEE Nuclear Science Symposuim & Medical Imaging Conference, Oct 2016, Oct 2016, Strasbourg, France

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titre

Tumor Microvasculature in Lung Cancer and Diffusion-Weighted MRI: Preliminary Results

auteur

Yi Yin, Oliver Sedlaczek, Johannes Lotz, Janine Olesch, Kai Breuhahn, Dirk Drasdo, Irene Vignon-Clementel

article

IEEE Nuclear Science Symposuim & Medical Imaging Conference, Oct 2016, Strasbourg, France

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titre

Interval observer for SIR epidemic model subject to uncertain seasonality

auteur

Pierre-Alexandre Bliman, Bettina D 'Avila Barros

article

Positive Systems - POSTA 2016, Sep 2016, Roma, Italy

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Book sections

titre

Creation of Three-dimensional Liver Tissue Models from Experimental Images for Systems Medicine

auteur

Stefan Hoehme, Adrian Friebel, Seddik Hammad, Dirk Drasdo, Jan G. Hengstler

article

Peggy Stock, Bruno Christ. Hepatocyte Transplantation, 1506, Springer, pp.319-362, 2016, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-6504-5 (Print) 978-1-4939-6506-9. ⟨10.1007/978-1-4939-6506-9_22⟩

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Master thesis

titre

Investigating cancer resistance in a Glioblastoma cell line with gene expression data

auteur

Hicham Janati

article

Statistics [stat]. 2016

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Poster communications

titre

Tumour growth and drug resistance: an evolutionary view with perspectives in therapeutics

auteur

Jean Clairambault, Luís Almeida, Rebecca Chisholm, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Benoît Perthame, Camille Pouchol, Emmanuel Trélat

article

ECMTB 2016 - European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jul 2016, Nottingham, United Kingdom. 2016

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Theses

titre

Mathematical Modeling in Cellular Dynamics: Applications to Cancer Research

auteur

Youssef Bourfia

article

Mathematics [math]. Université Paris 6 - Pierre et Marie Curie; Université Cadi Ayyad, 2016. English

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titre

Study of two-species chemotaxis models

auteur

Casimir Emako Kazianou

article

General Mathematics [math.GM]. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2016. English. ⟨NNT : 2016PA066045⟩

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Preprints, Working Papers, ...

titre

Quantitative modeling identifies robust predictable stress response of growing CT26 tumor spheroids under variable conditions

auteur

P van Liedekerke, J Neitsch, T Johann, K Alessandri, P Nassoy, Dirk Drasdo

article

2016

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titre

Asymptotic analysis and optimal control of an integro-differential system modelling healthy and cancer cells exposed to chemotherapy

auteur

Camille Pouchol, Jean Clairambault, Alexander Lorz, Emmanuel Trélat

article

2016

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titre

Model prediction and validation of an order mechanism controlling the spatio-temporal phenotype of early hepatocellular carcinoma

auteur

François Bertaux, Stefan Hoehme, William Weens, Bettina Grasl-Kraupp, Jan G. Hengstler, Dirk Drasdo

article

2016

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titre

Analysis and simulation of nonlinear and nonlocal transport equations

auteur

Frédéric Lagoutière, Nicolas Vauchelet

article

2016

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titre

Quantifying the Survival Uncertainty of Wolbachia-infected Mosquitoes in a Spatial Model *

auteur

Martin Strugarek, Nicolas Vauchelet, Jorge Zubelli

article

2016

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titre

Physiologically structured cell population dynamic models with applications to combined drug delivery optimisation in oncology

auteur

Jean Clairambault, Olivier Fercoq

article

2016

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titre

Well-balanced and asymptotic preserving schemes for kinetic models

auteur

Casimir Emako, Min Tang

article

2016

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Videos

titre

Simulation of the growth-fragmentation equation in a periodic case - Non-dissipative numerical scheme

auteur

Marie Doumic

article

2016

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2015

Journal articles

titre

Microscopic approach of a time elapsed neural model

auteur

Julien Chevallier, Maria J. Caceres, Marie Doumic, Patricia Reynaud-Bouret

article

Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, World Scientific Publishing, 2015, http://www.worldscientific.com/doi/10.1142/S021820251550058X. ⟨10.1142/S021820251550058X⟩

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titre

Nonparametric estimation of the division rate of an age dependent branching process

auteur

Marc Hoffmann, Adélaïde Olivier

article

Stochastic Processes and their Applications, Elsevier, 2015, ⟨10.1016/j.spa.2015.11.009⟩

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titre

Mathematical model reveals how regulating the three phases of T-cell response could counteract immune evasion

auteur

Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Matteo Melensi, Alexander Lorz, Marcello Delitala

article

Immunology, Wiley, 2015, 146 (2), pp.271-280. ⟨10.1111/imm.12500⟩

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titre

Model-guided identification of a therapeutic strategy to reduce hyperammonemia in liver diseases

auteur

Ahmed Ghallab, Geraldine Celliere, Sebastian Henkel, Dominik Driesch, Stefan Hoehme, Ute Hofmann, Sebastian Zellmer, Patricio Godoy, Agapios Sachinidis, Meinolf Blaszkewicz, Raymond Reif, Rosemarie Marchan, Lars Kuepfer, Dieter Häussinger, Dirk Drasdo, G Gebhardt, Jan G. Hengstler

article

Journal of Hepatology, Elsevier, 2015, 64 (4), pp.860-871. ⟨10.1016/j.jhep.2015.11.018⟩

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titre

Simulating tissue mechanics with Agent Based Models: concepts and perspectives

auteur

Paul van Liedekerke, Margriet Palm, N Jagiella, Dirk Drasdo

article

Computational Particle Mechanics, Springer Verlag, 2015, 2 (4), pp.401-444. ⟨10.1007/s40571-015-0082-3⟩

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titre

The asymmetry of telomere replication contributes to replicative senescence heterogeneity

auteur

Thibault Bourgeron, Zhou Xu, Marie Doumic, Maria Teresa Teixeira

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2015, 5, pp.15326. ⟨10.1038/srep15326⟩

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titre

Dynamics of time elapsed inhomogeneous neuron network model

auteur

Moon-Jin Kang, Benoît Perthame, Delphine Salort

article

Comptes Rendus Mathématique, Elsevier Masson, 2015, pp.1111-1115. ⟨10.1016/j.crma.2015.09.029⟩

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titre

Modelling and numerics for respiratory aerosols

auteur

Laurent Boudin, Céline Grandmont, Alexander Lorz, Ayman Moussa

article

Communications in Computational Physics, Global Science Press, 2015, 18 (3), pp.723-756. ⟨10.4208/cicp.180714.200415a⟩

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titre

Dissecting the dynamics of epigenetic changes in phenotype-structured populations exposed to fluctuating environments

auteur

Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Laurent Desvillettes, Barry D. Hughes

article

Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2015, 386, pp.166-176. ⟨10.1016/j.jtbi.2015.08.031⟩

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titre

Concomitant expression of far upstream element (FUSE) binding protein (FBP) interacting repressor (FIR) and its splice variants induce migration and invasion of non-small cell lung cancer (NSCLC) cells

auteur

Benedikt Müller, Michael Bovet, Yi Yin, Damian Stiche, Mona Malz, Margarita González-Vallinas, Alistair Middleton, Volker Ehemann, Jennifer Schmitt, Thomas Muley, Michael Meister, Esther Herpel, Stephan Singer, Arne Warth, Peter Schirmacher, Dirk Drasdo, Franziska Matthäus, Kai Breuhahn

article

Journal of Pathology, Wiley, 2015, 237 (3), pp.390-401. ⟨10.1002/path.4588⟩

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titre

Qualitative Properties of Solutions for the Noisy Integrate & Fire model in Computational Neuroscience

auteur

José Carrillo, Benoît Perthame, Delphine Salort, Didier Smets

article

Nonlinearity, IOP Publishing, 2015, 28 (9), pp.3365 ⟨10.1088/0951-7715/28/9/3365 ⟩

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titre

Gap geometry dictates epithelial closure efficiency

auteur

Andrea Ravasio, Ibrahim Cheddadi, Tianchi Chen, Telmo Pereira, Hui Ting Ong, Cristina Bertocchi, Agusti Brugues, Antonio Jacinto, Alexandre J. Kabla, Yusuke Toyama, Xavier Trepat, Nir Gov, Luís Neves de Almeida, Benoit Ladoux

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2015, 6, pp.NATURE COMMUNICATIONS | 6:7683 | DOI: 10.1038/ncomms8683 ⟨10.1038/ncomms8683⟩

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titre

Information Content in Data Sets for a Nucleated-Polymerization Model

auteur

H. T. Banks, Marie Doumic, Carola Kruse, Stephanie Prigent, H Rezaei

article

Journal of Biological Dynamics, Taylor & Francis Open, 2015, 9 (1), pp.26. ⟨10.1080/17513758.2015.1050465⟩

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titre

Existence and diffusive limit of a two-species kinetic model of chemotaxis

auteur

Luís Almeida, Casimir Emako, Nicolas Vauchelet

article

Kinetic and Related Models , AIMS, 2015, ⟨10.3934/krm.2015.8.359⟩

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titre

TiQuant: software for tissue analysis, quantification and surface reconstruction

auteur

Adrian Friebel, Johannes Neitsch, Tim Johann, Seddik Hammad, Dirk Drasdo, Stefan Hoehme

article

Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2015, 31 (19), pp.3234-3236. ⟨10.1093/bioinformatics/btv346⟩

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titre

Mathematical Analysis of a System for Biological Network Formation

auteur

Jan Haskovec, Peter Markowich, Benoît Perthame

article

Communications in Partial Differential Equations, Taylor & Francis, 2015, 40 (5), pp.918-956. ⟨10.1080/03605302.2014.968792⟩

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titre

Emergence of Drug Tolerance in Cancer Cell Populations: An Evolutionary Outcome of Selection, Nongenetic Instability, and Stress-Induced Adaptation

auteur

Rebecca H. Chisholm, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Annette K. Larsen, Luís Almeida, Alexandre Escargueil, Jean Clairambault

article

Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2015, 75 (6), pp.930-939. ⟨10.1158/0008-5472.CAN-14-2103⟩

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titre

Data Assimilation for hyperbolic conservation laws. A Luenberger observer approach based on a kinetic description

auteur

Anne-Céline Boulanger, Philippe Moireau, Benoît Perthame, Jacques Sainte-Marie

article

Communications in Mathematical Sciences, International Press, 2015, 13 (3), pp.587 - 622. ⟨10.4310/CMS.2015.v13.n3.a1⟩

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titre

Social information use and the evolution of unresponsiveness in collective systems

auteur

Colin J Torney, Tommaso Lorenzi, Iain D Couzin, Simon A Levin

article

Journal of the Royal Society Interface, the Royal Society, 2015, ⟨10.1098/rsif.2014.0893⟩

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titre

Unraveling liver complexity from molecular to organ level: Challenges and perspectives

auteur

Lorenza Alice d'Alessandro, Stefan Hoehme, Adriano Henney, Dirk Drasdo, Ursula Klingmüller

article

Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2015, 117 (1), pp.78-86. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2014.11.005⟩

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titre

Modeling the effects of space structure and combination therapies on phenotypic heterogeneity and drug resistance in solid tumors

auteur

Alexander Lorz, Tommaso Lorenzi, Jean Clairambault, Alexandre Escargueil, Benoît Perthame

article

Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2015, 77 (1), pp.1-22. ⟨10.1007/s11538-014-0046-4⟩

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titre

My Personal Journey In Mathematical Biology & Medicine

auteur

Jean Clairambault

article

Society of Mathematical Biology Newsletter, Society of Mathematical Biology, 2015, SMB Newsletter, 28 (1), pp.2

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titre

Competition and boundary formation in heterogeneous media: Application to neuronal differentiation

auteur

Benoît Perthame, Cristóbal Quiñinao, Jonathan Touboul

article

Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, World Scientific Publishing, 2015, 25 (13), pp.2477-2502. ⟨10.1142/S0218202515400151⟩

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titre

Asymptotic analysis of a selection model with space

auteur

Sepideh Mirrahimi, Benoît Perthame

article

Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, Elsevier, 2015, 104, pp.1108-1118

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titre

Statistical estimation of a growth-fragmentation model observed on a genealogical tree

auteur

Marie Doumic, Marc Hoffmann, Nathalie Krell, Lydia Robert

article

Bernoulli, Bernoulli Society for Mathematical Statistics and Probability, 2015, 21 (3), pp.1760-1799

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titre

Incompressible limit of mechanical model of tumor growth with viscosity

auteur

Benoît Perthame, Nicolas Vauchelet

article

Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series A, Mathematical and Physical Sciences (1934–1990), Royal Society, The, 2015, 373, pp.20140283. ⟨10.1098/rsta.2014.0283 ⟩

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titre

Transversal instability for the thermodiffusive reaction-diffusion system

auteur

Michal Kolwalczyk, Benoît Perthame, Nicolas Vauchelet

article

Chinese Annals of Mathematics - Series B, Springer Verlag, 2015, 36 (5), pp.871-882

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titre

Numerical methods for one-dimensional aggregation equations

auteur

Francois James, Nicolas Vauchelet

article

SIAM Journal on Numerical Analysis, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2015, 53 (2), pp.895-916. ⟨10.1137/140959997⟩

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titre

Mechanics of epithelial closure over non-adherent environments

auteur

Sri Ram Krishna Vedula, Grégoire Peyret, Ibrahim Cheddadi, Tianchi Chen, Agustí Brugués, Hiroaki Hirata, Horacio Lopez-Menendez, Yusuke Toyama, Luís Neves de Almeida, Xavier Trepat, Chwee Teck Lim, Benoit Ladoux

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2015, 6, pp.Article number: 6111. ⟨10.1038/ncomms7111⟩

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Conference papers

titre

Global stabilizing feedback law for a problem of biological control of mosquito-borne diseases

auteur

Pierre-Alexandre Bliman, Maria Soledad Aronna, Flávio Coelho, Moacyr da Silva

article

54th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2015, Osaka, Japan

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titre

Emergence of cytotoxic resistance in cancer cell populations: single-cell mechanisms and population-level consequences

auteur

Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Alexander Lorz, Annette K Larsen, Luís Neves de Almeida, Alexandre Escargueil, Jean Clairambault

article

ICNAAM 2015 Session 70: "Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology", Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece

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titre

Phenotype heterogeneity in cancer cell populations

auteur

Luis Almeida, Rebecca H. Chisholm, Jean Clairambault, Alexandre Escargueil, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Emmanuel Trélat

article

ICNAAM 2015 Session 70: "Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology'', Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece

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titre

Diverse spatio-temporal dynamical patterns of p53 and cell fate decisions

auteur

Jean Clairambault, Jan Elias

article

ICNAAM 2015 Session 70: "Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology'', Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece. pp.4

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titre

Preface to Session 70 " Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology

auteur

Loic Barbarroux, Jean Clairambault, Nick Cogan, Jan Elias, Shalla Hanson, Marek Kimmel, Tommaso Lorenzi

article

ICNAAM 2015 Session 70: "Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology'', Organiser Session 70: Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece

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titre

Emergence of cytotoxic resistance in cancer cell populations

auteur

Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Alexander Lorz, Annette K Larsen, Luís Neves de Almeida, Alexandre Escargueil, Jean Clairambault

article

Workshop on Multiscale and Hybrid Modelling in Cell and Cell Population Biology, V. Volpert and J. Clairambault, Mar 2015, Paris, France. ⟨10.1051/itmconf/20150500009⟩

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Master thesis

titre

Modelling interactions between tumour cells and supporting adipocytes in breast cancer

auteur

Camille Pouchol

article

Mathematics [math]. 2015

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Books

titre

Parabolic equations in biology

auteur

Benoît Perthame

article

Springer. ⟨Springer⟩, 2015, Lecture Notes on Mathematical Modelling in the Life Sciences, 978-3-319-19499-8; 978-3-319-19500-1

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Poster communications

titre

Approximating the dynamics of the Hybrid Stochastic-Deterministic Apoptosis pathway

auteur

Sucheendra Palaniappan, François Bertaux, Matthieu Pichene, Eric Fabre, Gregory Batt, Blaise Genest

article

CMSB 2015, 2015, Nantes, France. CMSB 2015, 2015, CMSB 2015

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Theses

titre

Statistical analysis of growth-fragmentation models

auteur

Adelaïde Olivier

article

Statistics [math.ST]. Université Paris Dauphine - Paris IX, 2015. English. ⟨NNT : 2015PA090047⟩

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titre

Mathematical model of the role and temporal dynamics of protein p53 after drug-induced DNA damage

auteur

Jan Elias

article

Number Theory [math.NT]. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2015. English. ⟨NNT : 2015PA066253⟩

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Preprints, Working Papers, ...

titre

Effects of an advection term in nonlocal Lotka-Volterra equations

auteur

Tommaso Lorenzi, Rebecca H. Chisholm, Alexander Lorz

article

2015

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titre

Ensuring successful introduction of Wolbachia in natural populations of Aedes aegypti by means of feedback control

auteur

Pierre-Alexandre Bliman, Maria Soledad Aronna, Flávio Coelho, Moacyr da Silva

article

2015

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titre

Determining the distribution of calcium channels in the olfactory system

auteur

Thibault Bourgeron, Carlos Conca, Rodrigo Lecaros

article

2015

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titre

Behavioral modulation of the coexistence between Apis melifera and Varroa destructor : A defense against colony colapse disorder?

auteur

Joyce de Figueiró Santos, Flávio C. Coelho, Pierre-Alexandre Bliman

article

2015

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titre

Emergence of drug tolerance in cancer cell populations: an evolutionary outcome of selection, non-genetic instability and stress-induced adaptation

auteur

Rebecca H. Chisholm, Tommaso Lorenzi, Alexander Lorz, Annette K. Larsen, Luís Almeida, Alexandre Escargueil, Jean Clairambault

article

2015

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2014

Journal articles

titre

Integrated metabolic spatial-temporal model for the prediction of ammonia detoxification during liver damage and regeneration

auteur

Freimut Schliess, Stefan Hoehme, Sebastian Henkel, Ahmed Ghallab, Dominik Driesch, Jan Böttger, Reinhard Guthke, Michael Pfaff, Jan Hengstler, Rolf Gebhardt, Dieter Häussinger, Dirk Drasdo, Sebastian Zellmer

article

Hepatology, Wiley-Blackwell, 2014, 60 (6), pp.2040-2051. ⟨10.1002/hep.27136⟩

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titre

The virtual liver: state of the art and future perspectives

auteur

Dirk Drasdo, Johannes Bode, Uta Dahmen, Olaf Dirsch, Steven Dooley, Rolf Gebhardt, Ahmed Ghallab, Patricio Godoy, Dieter Häussinger, Seddik Hammad, Stefan Hoehme, Hermann-Georg Holzhütter, Ursula Klingmüller, Lars Kuepfer, Jens Timmer, Marino Zerial, Jan G. Hengstler

article

Archives of Toxicology, Springer Verlag, 2014, pp.2071-2075. ⟨10.1007/s00204-014-1384-6⟩

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titre

Scalar conservation laws with rough (stochastic) fluxes; the spatially dependent case

auteur

Pierre-Louis Lions, Benoît Perthame, Panagiotis E. Souganidis

article

Stochastic Partial Differential Equations : Analysis and Computations, 2014, 2 (4), pp.517-538. ⟨10.1007/s40072-014-0038-2⟩

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titre

Division in Escherichia coliis triggered by a size-sensing rather than a timing mechanism

auteur

Lydia Robert, Marc Hoffmann, Nathalie Krell, Stéphane Aymerich, Jérôme Robert, Marie Doumic

article

BMC Biology, BioMed Central, 2014, 12 (1), ⟨10.1186/1741-7007-12-17⟩

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titre

Derivation of a Hele-Shaw type system from a cell model with active motion

auteur

Benoît Perthame, Fernando Quirós, Min Tang, Nicolas Vauchelet

article

Interfaces and Free Boundaries, European Mathematical Society, 2014, 14 (4), pp.489-508. ⟨10.4171/IFB/327⟩

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titre

How predictive quantitative modeling of tissue organization can inform liver disease pathogenesis.

auteur

Dirk Drasdo, Stefan Hoehme, Jan G. Hengstler

article

Journal of Hepatology, Elsevier, 2014, 61 (4), pp.951-956. ⟨10.1016/j.jhep.2014.06.013⟩

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titre

Dynamics of p53 in single cells: physiologically based ODE and reaction-diffusion PDE models

auteur

Jan Elias, Luna Dimitrio, Jean Clairambault, Roberto Natalini

article

Physical Biology, Institute of Physics: Hybrid Open Access, 2014, pp.22. ⟨10.1088/1478-3975/11/4/045001⟩

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titre

Reaction-diffusion systems for spatio-temporal intracellular protein networks: a beginner's guide with two examples

auteur

Jan Elias, Jean Clairambault

article

Computational and Structural Biotechnology Journal, Elsevier, 2014, pp.11. ⟨10.1016/j.csbj.2014.05.007⟩

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titre

Size distribution of amyloid brils. Mathematical models and experimental data.

auteur

Stephanie Prigent, Hadjer Wafaa Haffaf, H. T. Banks, M. Hoffmann, Human Rezaei, Marie Doumic

article

International Journal of Pure and Applied Mathematics, Academic Publishing Ltd, 2014, 93 (6), pp.845-878. ⟨10.12732/ijpam.v93i6.10⟩

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titre

Modeling contact interactions between triangulated rounded bodies for the discrete element method

auteur

Bart Smeets, Tim Odenthal, Janos Keresztes, Simon Vanmaercke, Paul van Liedekerke, Engelbert Tijskens, Wouter Saeys, Hans van Oosterwyck, Herman Ramon

article

Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, Elsevier, 2014, 277, pp.219-238. ⟨10.1016/j.cma.2014.04.017⟩

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titre

Perspective on "New and Less New Opportunities For Mathematical Biology as Applied To Biological and Clinical Medicine

auteur

Jean Clairambault

article

Society of Mathematical Biology Newsletter, Society of Mathematical Biology, 2014, SMB Newsletter, 27 (2), pp.2

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titre

Protocols for staining of bile canalicular and sinusoidal networks of human, mouse and pig livers, three-dimensional reconstruction and quantification of tissue microarchitecture by image processing and analysis.

auteur

Seddik Hammad, Stefan Hoehme, Adrian Friebel, Iris von Recklinghausen, Amnah Othman, Brigitte Begher-Tibbe, Raymond Reif, Patricio Godoy, Tim Johann, Amruta Vartak, Klaus Golka, Petru O. Bucur, Eric Vibert, Rosemarie Marchan, Bruno Christ, Steven Dooley, Christoph Meyer, Iryna Ilkavets, Uta Dahmen, Olaf Dirsch, Jan Böttger, Rolf Gebhardt, Dirk Drasdo, Jan G. Hengstler

article

Archives of Toxicology, Springer Verlag, 2014, 88 (5), pp.1161-1183. ⟨10.1007/s00204-014-1243-5⟩

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titre

Enabling multiscale modeling in systems medicine: From reactions in cells to organ physiology

auteur

Olaf Wolkenhauer, Charles Auffray, Olivier Brass, Jean Clairambault, Andreas Deutsch, Dirk Drasdo, Francesco Gervasio, Luigi Preziosi, Philip Maini, Anna Marciniak-Czochra, Christina Kossow, Lars Kuepfer, Katja Rateitschak, Ignacio Ramis-Conde, Benjamin Ribba, Andreas Schuppert, Rod Smallwood, Georgios Stamatakos, Felix Winter, Helen Byrne

article

Genome Medicine, BioMed Central, 2014, Genome Medicine, 6 (21), pp.3

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titre

Long-term analysis of phenotypically structured models

auteur

Alexander Lorz, Benoît Perthame

article

Proceedings of the Royal Society of London. Series A, Mathematical and physical sciences, Royal Society, The, 2014, 470 (2167), pp.1-10. ⟨10.1098/rspa.2014.0089⟩

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titre

Estimating Dose Painting Effects in Radiotherapy: A Mathematical Model

auteur

Juan Carlos Lopez Alfonso, Nick Jagiella, Luis Núñez, Miguel Herrero, Dirk Drasdo

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (2), pp.22. ⟨10.1371/journal.pone.0089380⟩

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titre

Synchronisation and control of proliferation in cycling cell population models with age structure

auteur

Frédérique Billy, Jean Clairambault, Olivier Fercoq, Stéphane Gaubert, Thomas Lepoutre, Thomas Ouillon, Shoko Saito

article

Mathematics and Computers in Simulation, Elsevier, 2014, 96, pp.66-94. ⟨10.1016/j.matcom.2012.03.005⟩

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titre

Estimating the Division Rate of the Self-Similar Growth-Fragmentation Equation

auteur

Thibault Bourgeron, Marie Doumic, Miguel Escobedo

article

Inverse Problems, IOP Publishing, 2014, 30 (2), pp.025007, 28

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titre

The Hele-Shaw asymptotics for mechanical models of tumor growth

auteur

Benoît Perthame, Fernando Quirós, Juan-Luis Vázquez

article

Archive for Rational Mechanics and Analysis, Springer Verlag, 2014, 212, pp.93-127. ⟨10.1007/s00205-013-0704-y⟩

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titre

Bernoulli variational problem and beyond

auteur

Alexander Lorz, Peter Markowich, Benoît Perthame

article

Archive for Rational Mechanics and Analysis, Springer Verlag, 2014, 212, pp.415-443. ⟨10.1007/s00205-013-0707-8⟩

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titre

Traveling wave solution of the Hele-Shaw model of tumor growth with nutrient

auteur

Benoît Perthame, Min Tang, Nicolas Vauchelet

article

Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, World Scientific Publishing, 2014, 24 (13), pp.2601-2626

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titre

A simple derivation of BV bounds for inhomogeneous relaxation systems

auteur

Benoît Perthame, Nicolas Seguin, Magali Tournus

article

Communications in Mathematical Sciences, International Press, 2014, 13 (2), pp.577-586

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titre

Division in Escherichia coli is triggered by a size-sensing rather than a timing mechanism

auteur

Lydia Robert, Marc Hoffmann, Nathalie Krell, Stéphane Aymerich, Jérôme Robert, Marie Doumic

article

BMC Biology, BioMed Central, 2014, 12 (1), pp.17. ⟨10.1186/1741-7007-12-17⟩

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titre

Modeling Dynamics of Cell-to-Cell Variability in TRAIL-Induced Apoptosis Explains Fractional Killing and Predicts Reversible Resistance

auteur

François Bertaux, Szymon Stoma, Dirk Drasdo, Gregory Batt

article

PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2014, 10 (10), pp.14. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003893.s016⟩

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titre

Beyond blow-up in excitatory integrate and fire neuronal networks: refractory period and spontaneous activity

auteur

Maria J. Caceres, Benoît Perthame

article

Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2014, 350, pp.81-89. ⟨10.1016/j.jtbi.2014.02.005⟩

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titre

Adaptation and Fatigue Model for Neuron Networks and Large Time Asymptotics in a Nonlinear Fragmentation Equation

auteur

Khashayar Pakdaman, Benoît Perthame, Delphine Salort

article

Journal of Mathematical Neuroscience, BioMed Central, 2014, 4 (1), pp.14. ⟨10.1186/2190-8567-4-14 ⟩

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Conference papers

titre

Stability analysis of PDE’s modelling cell dynamics in Acute Myeloid Leukemia

auteur

Jose Luis Avila Alonso, Catherine Bonnet, Emilia Fridman, Frédéric Mazenc, Jean Clairambault

article

53rd IEEE Annual Conference on Decision and Control (CDC 2014), Dec 2014, Los Angeles, United States. ⟨10.1109/cdc.2014.7039860⟩

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titre

A coupled model for healthy and cancer cells dynamics in Acute Myeloid Leukemia

auteur

José Luis Avila Alonso, Catherine Bonnet, Hitay Ozbay, Jean Clairambault, Silviu-Iulian Niculescu

article

19th IFAC World Congress on International Federation of Automatic Control (IFAC 2014), Aug 2014, Groningen, South Africa. ⟨10.3182/20140824-6-za-1003.02574⟩

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titre

Some mathematical aspects of tumor growth and therapy

auteur

Benoît Perthame

article

ICM 2014 - International Congress of Mathematicians, Aug 2014, Seoul, South Korea

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titre

A discrete-maturity Interconnected Model of Healthy and Cancer Cell Dynamics in Acute Myeloid Leukemia

auteur

José Luis Avila Alonso, Catherine Bonnet, Hitay Ozbay, Jean Clairambault, Silviu-Iulian Niculescu

article

Mathematical Theory of Networks and Systems, Jul 2014, Groningen, Netherlands

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titre

A Discrete-Maturity Interconnected Model of Healthy and Cancer Cell Dynamics in Acute Myeloid Leukemia

auteur

Catherine Bonnet, Jose Luis Avila Alonso, Hitay Ozbay, Jean Clairambault, Silviu-Iulian Niculescu, Pierre Hirsch

article

The 10th AIMS Conference on Dynamical Systems,Differential Equations and Applications, Jul 2014, Madrid, Spain

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Book sections

titre

Analysis of a New Model of Cell Population Dynamics in Acute Myeloid Leukemia

auteur

José Luis Avila Alonso, Catherine Bonnet, Jean Clairambault, Hitay Ozbay, Silviu-Iulian Niculescu, Faten Merhi, Annabelle Ballesta, Ruoping Tang, Jean-Pierre Marie

article

Tomáš Vyhlídal and Jean-François Lafay and Rifat Sipahi. Delay Systems : From Theory to Numerics and Applications, 1, Springer, pp.315-328, 2014, Advances in Delays and Dynamics, 978-3-319-01695-5. ⟨10.1007/978-3-319-01695-5_23⟩

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Habilitation à diriger des recherches

titre

Contributions mathématiques à l'étude de modèles décrivant le mouvement de particules confinées et de micro-organismes

auteur

Nicolas Vauchelet

article

Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université Pierre et Marie Curie, 2014

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Other publications

titre

Modelling and analysis of protein aggregation - completing pathways in prion (PrP) polymerisation

auteur

Stephanie Prigent, Hadjer Wafaa Haffaf

article

2014

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Theses

titre

Analyse de l'agrégation des protéines dans les maladies neurodégénératives amyloïdes : application aux maladies à prion

auteur

Hadjer Wafaa Haffaf

article

Analyse numérique [math.NA]. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2014. Français. ⟨NNT : 2014PA066263⟩

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2013

Journal articles

titre

Wave-like solutions for nonlocal reaction-diffusion equations: a toy model

auteur

Grégoire Nadin, Luca Rossi, Leonid Ryzhik, Benoît Perthame

article

Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2013, 8 (3), pp.33-41. ⟨10.1051/mmnp/20127102⟩

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titre

The p53 protein and its molecular network: modelling a missing link between DNA damage and cell fate

auteur

Jan Elias, Luna Dimitrio, Jean Clairambault, Roberto Natalini

article

Biochimica et Biophysica Acta Proteins and Proteomics, Elsevier, 2013, ⟨10.1016/j.bbapap.2013.09.019⟩

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Conference papers

titre

Modelling and analysis of protein aggregation - Competing pathways in prion (PrP) polymerisation

auteur

Hadjer Wafaa Haffaf, Stephanie Prigent

article

Congrès SMAI 2013, May 2013, Seignosse le Penon, France. ⟨10.1051/proc/201445019⟩

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2012

Journal articles

titre

Regularization in Keller-Segel type systems and the De Giorgi method

auteur

Benoît Perthame, Alexis Vasseur

article

Communications in Mathematical Sciences, International Press, 2012, 10 (2), pp.463 - 476. ⟨10.4310/CMS.2012.v10.n2.a2⟩

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2009

Journal articles

titre

Scaling limit of a discrete prion dynamics model

auteur

Marie Doumic, Thierry Goudon, Thomas Lepoutre

article

Communications in Mathematical Sciences, International Press, 2009, 7 (4), ⟨10.4310/CMS.2009.v7.n4.a3⟩

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