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DRACULA Research team

DRACULA team publications

2019

Journal articles

titre
Drugs modulating stochastic gene expression affect the erythroid differentiation process
auteur
Anissa Guillemin, Ronan Duchesne, Fabien Crauste, Sandrine Gonin-Giraud, Olivier Gandrillon
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (11), pp.1-19. ⟨10.1371/journal.pone.0225166⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02375801/file/Guillemin-etal-PlosOne-2019.pdf BibTex
titre
Cell generation dynamics underlying naïve T cell homeostasis in adult humans
auteur
Jeff Mold, Pedro Réu, Axel Olin, Samuel Bernard, Jakob Michaelsson, Sanket Rane, Andrew Yates, Azadeh Khosravi, Mehran Salehpour, Göran Possnert, Petter Brodin, Jonas Frisén
article
PLoS Biology, Public Library of Science, 2019, 17 (10), pp.e3000383. ⟨10.1101/635995⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02160888/file/journal.pbio.3000383.pdf BibTex
titre
Erythroid differentiation displays a peak of energy consumption concomitant with glycolytic metabolism rearrangements
auteur
Angélique Richard, Elodie Vallin, Caroline Romestaing, Damien Roussel, Olivier Gandrillon, Sandrine Gonin-Giraud
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (9), pp.e0221472. ⟨10.1371/journal.pone.0221472⟩
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titre
Adipose lipid turnover and long-term changes in body weight
auteur
P. Arner, Samuel Bernard, Lena Appelsved, Keng-Yeh Fu, Daniel Andersson, Mehran Salehpour, Anders Thorell, Mikael Rydén, Kirsty Spalding
article
Nature Medicine, Nature Publishing Group, 2019, 25 (9), pp.1385-1389. ⟨10.1038/s41591-019-0565-5⟩
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titre
Existence of Pulses for the System of Competition of Species
auteur
Martine Marion, Vitaly Volpert
article
Journal of Dynamics and Differential Equations, Springer Verlag, 2019, 31 (3), pp.1653-1670. ⟨10.1007/s10884-017-9582-6⟩
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titre
Global continuation of monotone waves for bistable delayed equations with unimodal nonlinearities
auteur
Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert
article
Nonlinearity, IOP Publishing, 2019, 32 (7), pp.2593-2632. ⟨10.1088/1361-6544/ab0e23⟩
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titre
Stochastic Gene Expression with a Multistate Promoter: Breaking Down Exact Distributions
auteur
Ulysse Herbach
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2019, 79 (3), pp.1007-1029. ⟨10.1137/18M1181006⟩
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titre
Cortical waves and post‐stroke brain stimulation
auteur
Nikolai Bessonov, Anne Beuter, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, Wiley, 2019, 42 (11), pp.3912-3928. ⟨10.1002/mma.5620⟩
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titre
Spatial Lymphocyte Dynamics in Lymph Nodes Predicts the Cytotoxic T Cell Frequency Needed for HIV Infection Control
auteur
Dmitry Grebennikov, Anass Bouchnita, Vitaly Volpert, Nikolay Bessonov, Andreas Meyerhans, Gennady Bocharov
article
Frontiers in Immunology, Frontiers, 2019, 10, pp.1-15. ⟨10.3389/fimmu.2019.01213⟩
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titre
Calibration, Selection and Identifiability Analysis of a Mathematical Model of the in vitro Erythropoiesis in Normal and Perturbed Contexts
auteur
Ronan Duchesne, Anissa Guillemin, Fabien Crauste, Olivier Gandrillon
article
In Silico Biology, IOS Press, 2019, 13 (1-2), pp.55-69. ⟨10.3233/ISB-190471⟩
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titre
Mathematical Modeling Reveals That the Administration of EGF Can Promote the Elimination of Lymph Node Metastases by PD-1/PD-L1 Blockade
auteur
Mohamed Amine Benchaib, Anass Bouchnita, Vitaly Volpert, Abdelkader Makhoute
article
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Frontiers, 2019, 7, pp.1-18. ⟨10.3389/fbioe.2019.00104⟩
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titre
WASABI: a dynamic iterative framework for gene regulatory network inference
auteur
Arnaud Bonnaffoux, Ulysse Herbach, Angélique Richard, Anissa Guillemin, Sandrine Gonin-Giraud, Pierre-Alexis Gros, Olivier Gandrillon
article
BMC Bioinformatics, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.1-19. ⟨10.1186/s12859-019-2798-1⟩
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titre
A multiscale model of platelet-fibrin thrombus growth in the flow
auteur
Anass Bouchnita, Vitaly Volpert
article
Computers & Fluids, Elsevier, 2019, 184, pp.10-20. ⟨10.1016/j.compfluid.2019.03.021⟩
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BibTex
titre
Existence of waves for a reaction–diffusion–dispersion system
auteur
Moitri Sen, Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, Elsevier, 2019, 180, pp.52-66. ⟨10.1016/j.na.2018.09.011⟩
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titre
Estimate of the travelling wave speed for an integro-differential equation
auteur
Nikolay Bessonov, Anne Beuter, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert
article
Applied Mathematics Letters, Elsevier, 2019, 88, pp.103-110. ⟨10.1016/j.aml.2018.07.037⟩
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BibTex
titre
Dynamics of oligodendrocyte generation in multiple sclerosis
auteur
Maggie Yeung, Mehdi Djelloul, Embla Steiner, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, Göran Possnert, Lou Brundin, Jonas Frisén
article
Nature, Nature Publishing Group, 2019, pp.538-542. ⟨10.1038/s41586-018-0842-3⟩
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titre
Improved duality estimates: time discrete case and applications to a class of cross-diffusion systems
auteur
Thomas Lepoutre
article
Communications in Mathematical Sciences, International Press, 2019, 17 (2), pp.1-17
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https://hal.inria.fr/hal-01943576/file/cms_lepoutre_cross_hal.pdf BibTex
titre
Existence of pulses for a reaction-diffusion system of blood coagulation in flow
auteur
Nicolas Ratto, Martine Marion, Vitaly Volpert
article
Mathematical Biosciences and Engineering, AIMS Press, In press, 16 (5), pp.4196-4212. ⟨10.3934/mbe.2019209⟩
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BibTex
titre
Model-based assessment of the Role of Uneven Partitioning of Molecular Content on Heterogeneity and Regulation of Differentiation in CD8 T-cell Immune Responses
auteur
Simon Girel, Christophe Arpin, Jacqueline Marvel, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste
article
Frontiers in Immunology, Frontiers, In press, pp.1-41. ⟨10.3389/fimmu.2019.00230 ⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02008705/file/DeuxiemePreprintFrontiers.pdf BibTex
titre
Existence of Waves for a Bistable Reaction–Diffusion System with Delay
auteur
Nicolas Ratto, Martine Marion, Vitaly Volpert
article
Journal of Dynamics and Differential Equations, Springer Verlag, 2019, 16 (5), pp.4196-4212. ⟨10.1007/s10884-019-09751-4⟩
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BibTex
titre
Existence of pulses for a reaction-diffusion system of blood coagulation
auteur
Nicolas Ratto, Martine Marion, Vitaly Volpert
article
Topological Methods in Nonlinear Analysis, Juliusz Schauder University Centre for Nonlinear Studies, In press
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BibTex
titre
Stability analysis of an equation with two delays and application to the production of platelets
auteur
Loïs Boullu, Laurent Pujo-Menjouet, Jacques Bélair
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series S, American Institute of Mathematical Sciences, In press, pp.1-24. ⟨10.3934/dcdss.2020131⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02109546/file/DCDS-S_platelet_arxiv.pdf BibTex
titre
A model for megakaryopoiesis with state-dependent delay
auteur
Loïs Boullu, Laurent Pujo-Menjouet, Jianhong Wu
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, In press, 79 (4), pp.1218-1243. ⟨10.1137/18M1201020⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02123621/file/Platelet_Model_SIAM_HAL.pdf BibTex
titre
Non-linear analysis of a model for yeast cell communication
auteur
Vincent Calvez, Thomas Lepoutre, Nicolas Meunier, Nicolas Muller
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, EDP Sciences, In press, pp.1-32. ⟨10.1051/m2an/2019065⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02372511/file/CLMM_m2an.pdf BibTex
titre
Oscillations and asymptotic convergence for a delay differential equation modeling platelet production
auteur
Loïs Boullu, Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Laurent Pujo-Menjouet
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2019, 24 (6), pp.2417-2442. ⟨10.3934/dcdsb.2018259⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01835435/file/Boullu%20Adimy%20Crauste%20Pujo-Menjouet%20-%20arxiv%20%281%29.pdf BibTex

Book sections

titre
In Silico Methods for Studying T Cell Biology
auteur
Katherine Grzesik, Kevin Eng, Fabien Crauste, Sebastiano Battaglia
article
Int. Rev. Cell. Mol. Biol. 342, Elsevier, pp.265-304, 2019, ⟨10.1016/bs.ircmb.2018.07.005⟩
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2018

Journal articles

titre
Solvability of Some Integro-Differential Equations with Anomalous Diffusion in Two Dimensions
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Journal of Mathematical Sciences, Springer Verlag (Germany), 2018, 235 (3), pp.243-255. ⟨10.1007/978-3-319-47512-7_9⟩
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BibTex
titre
The Origin of Species by Means of Mathematical Modelling
auteur
Nikolai Bessonov, Natalia Reinberg, Malay Banerjee, Vitaly Volpert
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2018, 66 (4), pp.333-344. ⟨10.1007/s10441-018-9328-9⟩
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BibTex
titre
Alzheimer's disease and prion: an in vitro mathematical model
auteur
Ionel S. Ciuperca, Matthieu Dumont, Abdelkader Lakmeche, Pauline Mazzocco, Laurent Pujo-Menjouet, Human Rezaei, Léon Matar Tine
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01708659/file/Alzheimer_in_DCDS.pdf BibTex
titre
A multiscale model of the CD8 T cell immune response structured by intracellular content
auteur
Loic Barbarroux, Philippe Michel, Mostafa Adimy, Fabien Crauste
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2018, 23 (9), pp.3969-4002. ⟨10.3934/dcdsb.2018120⟩
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BibTex
titre
Modeling thrombosis in silico: Frontiers, challenges, unresolved problems and milestones
auteur
Vladimir A. Belyaev, Joanne L. Dunster, Jon M. Gibbins, M.A. Panteleev, Vitaly Volpert
article
Physics of Life Reviews, Elsevier, 2018, 26-27, pp.57-95. ⟨10.1016/j.plrev.2018.02.005⟩
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BibTex
titre
Interplay between reaction and diffusion processes in governing the dynamics of virus infections
auteur
Gennady Bocharov, Andreas Meyerhans, Nikolay Bessonov, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2018, 457, pp.221-236. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.08.036⟩
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BibTex
titre
Modeling of post-stroke stimulation of cortical tissue
auteur
Anne Beuter, Anne Balossier, Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2018, 305, pp.146-159. ⟨10.1016/j.mbs.2018.08.014⟩
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BibTex
titre
Analysis and numerical simulation of a polymerization model with aggregation and Ostwald ripening for the growth phenomenon
auteur
Léon Matar Tine, Babacar Lèye
article
Acta Applicandae Mathematicae, Springer Verlag, 2018, pp.1-28. ⟨10.1007/s10440-018-0222-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01933553/file/paper_Leon.pdf BibTex
titre
On the Existence in the Sense of Sequences of Stationary Solutions for Some Systems of Non-Fredholm Integro-differential Equations
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Mediterranean Journal of Mathematics, Springer Verlag, 2018, 15 (5)
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BibTex
titre
Stability analysis of a steady state of a model describing Alzheimer’s disease and interactions with prion proteins
auteur
Mohammed Helal, Angélique Igel-Egalon, Abdelkader Lakmeche, Pauline Mazzocco, Angélique Perrillat-Mercerot, Laurent Pujo-Menjouet, Human Rezaei, Léon Matar Tine
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2018, pp.1-25. ⟨10.1007/s00285-018-1267-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01946610/file/modeleDiscretRevised.pdf BibTex
titre
Initiation of reaction–diffusion waves of blood coagulation
auteur
Tatiana Galochkina, Martine Marion, Vitaly Volpert
article
Physica D: Nonlinear Phenomena, Elsevier, 2018, 376-377, pp.160-170. ⟨10.1016/j.physd.2017.11.006⟩
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BibTex
titre
The pATM Immunofluorescence assay: a high-performance radiosensitivity assay to predict post radiotherapy overreactions.
auteur
Guillaume Vogin, Thierry Bastogne, Larry Bodgi, Julien Gillet-Daubin, Aurélien Canet, Sandrine Pereira, Nicolas Foray
article
International Journal of Radiation Oncology - Biology - Physics, Elsevier, 2018, 101 (3), pp.690-693. ⟨10.1016/j.ijrobp.2018.03.047⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01757771/file/Rouge_2018.pdf BibTex
titre
Existence and stability of periodic solutions of an impulsive differential equation and application to CD8 T-cell differentiation
auteur
Simon Girel, Fabien Crauste
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2018, 76 (7), pp.1765-1795. ⟨10.1007/s00285-018-1220-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01721728/file/ArticleJMBpp.pdf BibTex
titre
Numerical integration of an erythropoiesis model with explicit growth factor dynamics
auteur
O. Angulo, Fabien Crauste, J.C. López-Marcos
article
Journal of Computational and Applied Mathematics, Elsevier, 2018, 330, pp.770 - 782. ⟨10.1016/j.cam.2017.01.033⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01646786/file/Angulo-LopezMarcos-Crauste-JCAM-2017.pdf BibTex
titre
Traveling Waves for a Bistable Reaction-Diffusion Equation with Delay
auteur
Sergei Trofimchuk, Vitaly Volpert
article
SIAM Journal on Mathematical Analysis, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2018, 50 (1), pp.1175-1199. ⟨10.1137/17M1115587⟩
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BibTex
titre
Investigating the role of the experimental protocol in phenylhydrazine-induced anemia on mice recovery
auteur
O. Angulo, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2018, 437, pp.286 - 298. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.10.031⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01646792/file/Angulo-Gandrillon-Crauste-revised.pdf BibTex
titre
Generalizing a mathematical model of prion aggregation allows strain coexistence and co-stability by including a novel misfolded species
auteur
Paul Lemarre, Laurent Pujo-Menjouet, Suzanne Sindi
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), In press, ⟨10.1007/s00285-018-1280-4⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01858724/file/JMB_article_preprint.pdf BibTex
titre
A Novel Multiscale Mathematical Model for Building Bone Substitute Materials for Children
auteur
Abdennasser Chekroun, Laurent Pujo-Menjouet, Jean-Philippe Berteau
article
Materials, MDPI, 2018, 11 (6), pp.1-16. ⟨10.3390/ma11061045⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02159058/file/materials-11-01045.pdf BibTex
titre
Meningioma growth dynamics assessed by radiocarbon retrospective birth dating
auteur
Hagen Huttner, Olaf Bergmann, Mehran Salehpour, Raouf Cheikh, Makoto Nakamura, Angelo Tortora, Paula Heinke, Roland Coras, Elisabet Englund, Ilker Eyüpoglu, Joji Kuramatsu, Sebastian Roeder, Stephan Kloska, Iris Muehlen, Arnd Doerfler, Stefan Schwab, Goran Possnert, Samuel Bernard, Jonas Frisén
article
EBioMedicine, Elsevier, In press, 27, pp.176-181. ⟨10.1016/j.ebiom.2017.12.020⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01671339/file/huttner2017ebiomedicine.pdf BibTex
titre
Alzheimer's disease and prion: analysis of an in vitro mathematical model
auteur
Ionel Sorin Ciuperca, Matthieu Dumont, Abdelkader Lakmeche, Pauline Mazzocco, Laurent Pujo-Menjouet, Human Rezaei, Léon M Tine
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, In press
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BibTex

Books

titre
Mathematical Immunology of Virus Infections
auteur
Gennady Bocharov, Vitaly Volpert, Burkhard Ludewig, Andreas Meyerhans
article
Springer International Publishing, pp.XV, 245, 2018, 978-3-319-72316-7. ⟨10.1007/978-3-319-72317-4⟩
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BibTex

Theses

titre
Modélisation de la Réponse Immunitaire T-CD8 : Analyse Mathématique et Modèles Multiéchelles
auteur
Simon Girel
article
Systèmes dynamiques [math.DS]. Université de Lyon, 2018. Français
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01941850/file/ManuscritGirel.pdf BibTex
titre
Inférence de réseaux de régulation de gènes à partir de données dynamiques multi-échelles
auteur
Arnaud Bonnaffoux
article
Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université de Lyon, 2018. Français
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01920262/file/Manuscrit_these_Bonnaffoux.pdf BibTex
titre
Modélisation stochastique de l’expression des gènes et inférence de réseaux de régulation
auteur
Ulysse Herbach
article
Mathématiques [math]. Université de Lyon, 2018. Français. ⟨NNT : 2018LYSE1155⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01930398/file/Manuscrit.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Inferring gene regulatory networks from single-cell data: a mechanistic approach
auteur
Ulysse Herbach, Arnaud Bonnaffoux, Thibault Espinasse, Olivier Gandrillon
article
BMC Systems Biology, BioMed Central, 2017, 11 (1), pp.105. ⟨10.1186/s12918-017-0487-0⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01646910/file/ArticleModel.pdf BibTex
titre
Fast and binary assay for predicting radiosensitivity based on the nucleoshuttling of ATM protein: development, validation and performances
auteur
Sandrine Pereira, Larry Bodgi, Mirlande Duclos, Aurélien Canet, Mélanie L. Ferlazzo, Clément Devic, Adeline Granzotto, Sophie Deneuve, Guillaume Vogin, Nicolas Foray
article
International Journal of Radiation Oncology - Biology - Physics, Elsevier, 2017, ⟨10.1016/j.ijrobp.2017.10.029⟩
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BibTex
titre
Modelling the dynamics of virus infection and immune response in space and time
auteur
G Bocharov, A Meyerhans, N Bessonov, S Trofimchuk, V Volpert
article
International Journal of Parallel, Emergent and Distributed Systems, Taylor & Francis, 2017, ⟨10.1080/17445760.2017.1363203⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01578907/file/imm-sys3.pdf BibTex
titre
Entropic structure and duality for multiple species cross-diffusion systems
auteur
Thomas Lepoutre, Ayman Moussa
article
Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, Elsevier, 2017, 159, ⟨10.1016/j.na.2017.02.008⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01373172/file/LM_27_09_16.pdf BibTex
titre
The Lifespan and Turnover of Microglia in the Human Brain
auteur
Pedro Réu, Azadeh Khosravi, Samuel Bernard, Jeff E. Mold, Mehran Salehpour, Kanar Alkass, Shira Perl, John Tisdale, Göran Possnert, Henrik Druid, Jonas Frisén
article
Cell Reports , Elsevier Inc, 2017, 20 (4), pp.779 - 784. ⟨10.1016/j.celrep.2017.07.004⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01572438/file/1-s2.0-S2211124717309439-main.pdf BibTex
titre
Estimates and impact of lymphocyte division parameters from CFSE data using mathematical modelling.
auteur
Pauline Mazzocco, Samuel Bernard, Laurent Pujo-Menjouet
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (6), pp.e0179768
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01561667/file/pone.0179768.pdf BibTex
titre
Analysis of temozolomide resistance in low-grade gliomas using a mechanistic mathematical model
auteur
Edouard Ollier, Pauline Mazzocco, Damien Ricard, Gentian Kaloshi, Ahmed Idbaih, Agusti Alentorn, Dimitri Psimaras, Jérôme Honnorat, Jean-Yves Delattre, Emmanuel Grenier, François Ducray, Adeline Samson
article
Fundamental and Clinical Pharmacology, Wiley, 2017, 31 (3), pp.347-358. ⟨10.1111/fcp.12259⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01623733/file/ollier2016.pdf BibTex
titre
Impact of fat mass and distribution on lipid turnover in human adipose tissue
auteur
Kirsty Spalding, Samuel Bernard, Erik Näslund, Mehran Salehpour, Göran Possnert, Lena Appelsved, Keng-Yeh Fu, Kanar Alkass, Henrik Druid, Anders Thorell, Mikael Rydén, Peter Arner
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2017, 8, pp.15253. ⟨10.1038/ncomms15253⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01561605/file/ncomms15253.pdf BibTex
titre
Identification of Nascent Memory CD8 T Cells and Modeling of Their Ontogeny
auteur
Fabien Crauste, Julien Mafille, Lilia Boucinha, Sophia Djebali, Olivier Gandrillon, Jacqueline Marvel, Christophe Arpin
article
Cell Systems, 2017, 4 (3), pp.306-317. ⟨10.1016/j.cels.2017.01.014⟩
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BibTex
titre
A Hybrid Finite Volume Method for Advection Equations and Its Applications in Population Dynamics
auteur
Chang Yang, Léon Matar Tine
article
Numerical Methods for Partial Differential Equations, Wiley, 2017, 33 (4), pp.1114 - 1142. ⟨10.1002/num.22134⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01646859/file/paper-A_hybrid.pdf BibTex
titre
Long-term treatment effects in chronic myeloid leukemia
auteur
Apollos Besse, Thomas Lepoutre, Samuel Bernard
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2017, pp.1-26. ⟨10.1007/s00285-017-1098-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01447781/file/Manuscript_Besse_HAL.pdf BibTex
titre
Stability Analysis of a Model of Interaction Between the Immune System and Cancer Cells in Chronic Myelogenous Leukemia
auteur
Apollos Besse, Geoffrey D. Clapp, Samuel Bernard, Franck E. Nicolini, Doron Levy, Thomas Lepoutre
article
Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2017, pp.1-27. ⟨10.1007/s11538-017-0272-7⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01539364/file/besse-etal_HAL.pdf BibTex
titre
Solvability in the sense of sequences for some non Fredholm operators related to the superdiffusion
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Journal of Pseudo-Differential Operators and Applications, 2017, 160, pp.1-22. ⟨10.1007/s11868-017-0204-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01573772/file/seqr.pdf BibTex
titre
Conditions of microvessel occlusion for blood coagulation in flow
auteur
A Bouchnita, T Galochkina, P Kurbatova, Patrice Nony, V Volpert
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, John Wiley and Sons, 2017, CMBE15: SELECTED PAPERS FROM THE 4TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTATIONAL & MATHEMATICAL BIOMEDICAL ENGINEERING 2015, ⟨10.1002/cnm.2850⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01573775/file/IJNMBE-submitted.pdf BibTex
titre
Towards a Multiscale Model of Acute HIV Infection
auteur
Anass Bouchnita, Gennady Bocharov, Andreas Meyerhans, Vitaly Volpert
article
Computation, MDPI, 2017, 5 (1), pp.6. ⟨10.3390/computation5010006 ⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01570577/file/computation-05-00006.pdf BibTex
titre
A Hybrid Computation Model to Describe the Progression of Multiple Myeloma and Its Intra-Clonal Heterogeneity
auteur
Anass Bouchnita, Fatima Belmaati, Rajae Aboulaich, M Koury, Vitaly Volpert
article
Computation, MDPI, 2017, 5 (1), pp.16. ⟨10.3390/computation5010016⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01565940/file/myeloma-clone.pdf BibTex
titre
Interaction of human migration and wealth distribution
auteur
Vitaly Volpert, S Petrovskii, A Zincenko
article
Nonlinear Analysis: Hybrid Systems, Elsevier, 2017, 159, pp.408 - 423. ⟨10.1016/j.na.2017.02.024⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01565519/file/NLA-2017.pdf BibTex
titre
Delayed nonlocal reaction–diffusion model for hematopoietic stem cell dynamics with Dirichlet boundary conditions
auteur
Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Toshikazu Kuniya
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2017, 12 (6), pp.1 - 22. ⟨10.1051/mmnp/2017078⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01683636/file/mmnp170078s.pdf BibTex
titre
Existence of Pulses for the System of Competition of Species
auteur
Martine Marion, Vitaly Volpert
article
Journal of Dynamics and Differential Equations, Springer Verlag, 2017, 14, pp.1-18. ⟨10.1007/s10884-017-9582-6⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01573773/file/Marion%20Volpert%20Revised.pdf BibTex
titre
Traveling waves in a coupled reaction-diffusion and difference model of hematopoiesis
auteur
Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Bogdan Kazmierczak
article
Journal of Differential Equations, Elsevier, 2017, 262, pp.4085 - 4128. ⟨10.1016/j.jde.2016.12.009⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01573613/file/Adimy%20ChekrounKazmieJDERevision.pdf BibTex
titre
Existence of stationary solutions for some systems of integro-differential equations with superdiffusion
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Rocky Mountain Journal of Mathematics, Rocky Mountain Mathematics Consortium, 2017, 47 (3), pp.955-970. ⟨10.1216/RMJ-2017-47-3-955⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01564763/file/voug.pdf BibTex
titre
A multiscale modelling approach for the regulation of the cell cycle by the circadian clock
auteur
Raouf El Cheikh, Samuel Bernard, Nader El Khatib
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2017, 426, pp.117-125. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.05.021⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01561617/file/elcheikh2017JTB.pdf BibTex
titre
Reaction-diffusion waves of blood coagulation
auteur
Tatiana Galochkina, Anass Bouchnita, Polina Kurbatova, Vitaly Volpert
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2017, 288, pp.130 - 139. ⟨10.1016/j.mbs.2017.03.008⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01567320/file/elsarticle-template-num.pdf BibTex
titre
Mathematical model of T-cell lymphoblastic lymphoma: disease, treatment, cure or relapse of a virtual cohort of patients
auteur
Nathalie Eymard, Vitaly Volpert, Polina Kurbatova, Nikolai Bessonov, Kayode Ogungbenro, Leon Aarons, Perrine Janiaud, Patrice Nony, Agathe Bajard, Sylvie Chabaud, Yves Bertrand, Behrouz Kassaï, Catherine Cornu
article
Mathematical Medicine and Biology, Oxford University Press (OUP), 2017, ⟨10.1093/imammb/dqw019⟩
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Habilitation à diriger des recherches

titre
Structured differential equations and multiscale approaches for human cell population dynamics
auteur
Samuel Bernard
article
Dynamical Systems [math.DS]. Université Claude Bernard Lyon 1, 2017
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titre
Contributions en dynamique de populations
auteur
Thomas Lepoutre
article
Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université Claude Bernard (Lyon 1), 2017
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https://hal.inria.fr/tel-01524261/file/Habilitation_Lepoutre.pdf BibTex

Theses

titre
Spatial structure of lipopolysaccharides and its role in blood coagulation
auteur
Tatiana Galochkina
article
Mathematics [math]. Université Claude Bernard Lyon 1 - Institut Camille Jordan; Lomonosov Moscow State University, 2017. Russian
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01674579/file/thesis_main_fr.pdf BibTex
titre
Modélisation mathématique de la leucémie myéloide chronique
auteur
Apollos Besse
article
Modélisation et simulation. Université de Lyon, 2017. Français. ⟨NNT : 2017LYSE1105⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01561249/file/TH2017BESSEAPOLLOS.pdf BibTex
titre
Contributions à la modélisation multi-échelles de la réponse immunitaire T-CD8 : construction, analyse, simulation et calibration de modèles
auteur
Loïc Barbarroux
article
Autre. Université de Lyon, 2017. Français. ⟨NNT : 2017LYSEC026⟩
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Spatial Risk Measure for Max-Stable and Max-Mixture Processes
auteur
Manaf Ahmed, Véronique Maume-Deschamps, Pierre Ribereau, Céline Vial
article
2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01546570/file/Max-Mixture_version_du_24juin2017.pdf BibTex
titre
Two models for yeast cell communication
auteur
Vincent Calvez, Thomas Lepoutre, Nicolas Meunier, Nicolas Muller
article
2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01498673/file/Calvez_Lepoutre_Meunier_Muller_hal.pdf BibTex
titre
Existence of recombination-selection equilibria for sexual populations
auteur
Thibault Bourgeron, Vincent Calvez, Jimmy Garnier, Thomas Lepoutre
article
2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01489695/file/BCGL.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Single-Cell-Based Analysis Highlights a Surge in Cell-to-Cell Molecular Variability Preceding Irreversible Commitment in a Differentiation Process
auteur
Angélique Richard, Loïs Boullu, Ulysse Herbach, Arnaud Arnaud, Valérie Morin, Elodie Vallin, Anissa Guillemin, Nan Papili Gao, Rudiyanto Gunawan, Jérémie Cosette, Ophélie Arnaud, Jean-Jacques Kupiec, Thibault Espinasse, Sandrine Gonin-Giraud, Olivier Gandrillon, Sarah Teichmann
article
PLoS Biology, Public Library of Science, 2016, 14 (12), ⟨10.1371/journal.pbio.1002585⟩
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BibTex
titre
Multi-scale Modelling of Erythropoiesis and Hemoglobin Production
auteur
Anass Bouchnita, Alexandre Rocca, Eric Fanchon, Mark J. Koury, Jean-Marc Moulis, Vitaly Volpert
article
Journal of Inorganic and Organometallic Polymers and Materials, Springer Verlag (Germany), 2016, 26 (6), pp.1362 - 1379. ⟨10.1007/s10904-016-0437-0⟩
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BibTex
titre
Moving the Boundaries of Granulopoiesis Modelling
auteur
Samuel Bernard
article
Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2016, 78 (12), pp.2358 - 2363. ⟨10.1007/s11538-016-0215-8⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01391393/file/bernard2016BMB_postprint.pdf BibTex
titre
Age-structured model of hematopoiesis dynamics with growth factor-dependent coefficients
auteur
Mostafa Adimy, Youssef Bourfia, My Lhassan Hbid, Catherine Marquet
article
Electronic Journal of Differential Equations, Texas State University, Department of Mathematics, 2016, pp.140
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01344118/file/adimy.pdf BibTex
titre
Global asymptotic stability for an age-structured model of hematopoietic stem cell dynamics
auteur
Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Tarik-Mohamed Touaoula
article
Applicable Analysis, Taylor & Francis, 2016, pp.1 - 12. ⟨10.1080/00036811.2016.1139698⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01396691/file/AdimyChekrounTouaoula.pdf BibTex
titre
First passage times in homogeneous nucleation: Dependence on the total number of particles
auteur
Romain Yvinec, Samuel Bernard, Erwan Hingant, Laurent Pujo-Menjouet
article
Journal of Chemical Physics, American Institute of Physics, 2016, 144 (3), pp.1-17. ⟨10.1063/1.4940033⟩
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BibTex
titre
IL-2 sensitivity and exogenous IL-2 concentration gradient tune the productive contact duration of CD8+ T cell-APC: a multiscale modeling study
auteur
Xuefeng Gao, Christophe Arpin, Jacqueline Marvel, Sotiris Prokopiou, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste
article
BMC Systems Biology, BioMed Central, 2016, 10 (1), pp.77. ⟨10.1186/s12918-016-0323-y⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01354185/file/12918_2016_Article_323.pdf BibTex
titre
Bone marrow infiltration by multiple myeloma causes anemia by reversible disruption of erythropoiesis
auteur
Anass Bouchnita, Nathalie Eymard, Tamara Moyo, Mark Koury, Vitaly Volpert
article
American Journal of Hematology, Wiley, 2016, 91 (4), pp.371 - 378. ⟨10.1002/ajh.24291⟩
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BibTex
titre
Blood Cell Dynamics: Half of a Century of Modelling
auteur
Laurent Pujo-Menjouet
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2016, 11, pp.92 - 115. ⟨10.1051/mmnp/201611106⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01382783/file/mmnp2016111p92.pdf BibTex
titre
Mathematics of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics: Diversity of Topics, Models and Methods
auteur
Gennady Bocharov, Anas Bouchnita, Jean Clairambault, Vitaly Volpert
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01413795/file/PrefaceMMNPDec2016.pdf BibTex
titre
Methods of Blood Flow Modelling
auteur
Nikolay Bessonov, Adélia Sequeira, Sergey Simakov, Yuri Vassilevski, Vitaly Volpert
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2016, 11, pp.1 - 25. ⟨10.1051/mmnp/201611101⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01397437/file/Bessonov_2016_1.pdf BibTex
titre
Hybrid Modelling in Biology: a Classification Review
auteur
A Stéphanou, Vitaly Volpert
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2016, 11, pp.37 - 48. ⟨10.1051/mmnp/201611103⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01397430/file/Stephanou_2016_1.pdf BibTex
titre
Wound Healing and Scale Modelling in Zebrafish
auteur
F. Garaguel, Nikolai Bessonov, Jacques Demongeot, Danielle Dhouailly, Vitaly Volpert
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2016
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BibTex
titre
Existence of pulses for a monotone reaction-diffusion system
auteur
Martine Marion, Vitaly Volpert
article
Pure and Applied Functional Analysis, 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01396839/file/pulse-sys12.pdf BibTex
titre
Homogenization of a one-dimensional diffusion - discrete absorption equation with feedback
auteur
Grigory Panasenko, Vitaly Volpert
article
Applicable Analysis, Taylor & Francis, 2016, 95, pp.1507 - 1516. ⟨10.1080/00036811.2016.1179288⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01397565/file/ddanonlv4.pdf BibTex
titre
Existence of stationary solutions for some non-Fredholm integro-differential equations with superdiffusion
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Journal of Pseudo-Differential Operators and Applications, 2016, ⟨10.1007/s11868-016-0173-9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01397555/file/nfnlr.pdf BibTex
titre
Quantitative convergence towards a self similar profile in an age-structured renewal equation for subdiffusion
auteur
Hugues Berry, Thomas Lepoutre, Álvaro Mateos González
article
Acta Applicandae Mathematicae, Springer Verlag, 2016, pp.15-45
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https://hal.inria.fr/hal-01136667/file/Berry-Lepoutre-Mateos.pdf BibTex
titre
Mathematical models of radiation action on living cells: From the target theory to the modern approaches. A historical and critical review
auteur
Larry Bodgi, Aurélien Canet, Laurent Pujo-Menjouet, Annick Lesne, Jean-Marc Victor, Nicolas Foray
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2016, 394, pp.93 - 101. ⟨10.1016/j.jtbi.2016.01.018⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01382777/file/cell%20survival%20review%20%207%20juin%202015.pdf BibTex

Directions of work or proceedings

titre
Inverse problem for cell division rate in population dynamics
auteur
LÉon Matar Tine
article
EDP Sciences. Workshop on Mathematics for Life Sciences (WMLS 2014), France. Volume 4 (01003), pp.10, 2016, ITM Web of Conferences, ⟨10.1051/itmconf/20150401003⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01253536/file/itmconf-wmls2014_01003.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Étude de modèles mathématiques issus de la biologie du cycle cellulaire et de la dynamique des protéines
auteur
Laurent Pujo-Menjouet
article
Systèmes dynamiques [math.DS]. Université Claude Bernard Lyon 1 - Institut Camille Jordan, 2016
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https://hal.inria.fr/tel-01411371/file/Hdr-pujo-manuscript.pdf BibTex

Theses

titre
Contribution à l’analyse mathématique d’équations aux dérivées partielles structurées en âge et en espace modélisant une dynamique de population cellulaire
auteur
Abdennasser Chekroun
article
Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université de Lyon, 2016. Français. ⟨NNT : 2016LYSE1040⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01313670/file/TH2016CHEKROUNABDENNASSER.pdf BibTex
titre
Mathematical modeling of the hormonal regulation of food intake and body weight : applications to caloric restriction and leptin resistance
auteur
Marine Jacquier
article
Statistics [math.ST]. Université de Lyon, 2016. English. ⟨NNT : 2016LYSE1027⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01273347/file/TH2016JACQUIERMARINE.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Spatial risk measure for Gaussian processes
auteur
Manaf Ahmed, Véronique Maume-Deschamps, Pierre Ribereau, Céline Vial
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01421078/file/Gaussian_version20122016.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Discrete limit and monotonicity properties of the Floquet eigenvalue in an age structured cell division cycle model
auteur
Stéphane Gaubert, Thomas Lepoutre
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2015, 71 (6), ⟨10.1007/s00285-015-0874-3⟩
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https://arxiv.org/pdf/1301.2151 BibTex
titre
Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells
auteur
Ophélie Arnaud, Sam Meyer, Elodie Vallin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
article
BMC Molecular Biology, BioMed Central, 2015, 16 (20), ⟨10.1186/s12867-015-0048-2⟩
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BibTex
titre
Age-structured and delay differential-difference model of hematopoietic stem cell dynamics
auteur
Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Tarik-Mohamed Touaoula
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2015, 20 (9), pp.27. ⟨10.3934/dcdsb.2015.20.2765⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01249892/file/Adimy_DCDS_B.pdf BibTex
titre
Implication of the Autologous Immune System in BCR-ABL Transcript Variations in Chronic Myelogenous Leukemia Patients Treated with Imatinib.
auteur
Geoffrey D Clapp, Thomas Lepoutre, Raouf El Cheikh, Samuel Bernard, Jérémy Ruby, Hélène Labussière-Wallet, Franck E Nicolini, Doron Levy
article
Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2015, 75 (19), pp.4053-62. ⟨10.1158/0008-5472.CAN-15-0611⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01251396/file/Postprint_CLEBRLNL.pdf BibTex
titre
A new model for the estimation of time of death from vitreous potassium levels corrected for age and temperature
auteur
B. Zilg, Samuel Bernard, K. Alkass, S. Berg, H. Druid
article
Forensic Science International, Elsevier, 2015, 254, pp.158-166. ⟨10.1016/j.forsciint.2015.07.020⟩
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BibTex
titre
Transplanted Bone Marrow-Derived Cells Contribute to Human Adipogenesis
auteur
Mikael Rydén, Mehmet Uzunel, Joanna l. Hård, Erik Borgström, Jeff e. Mold, Erik Arner, Niklas Mejhert, Daniel p. Andersson, Yvonne Widlund, Moustapha Hassan, Christina v. Jones, Kirsty l. Spalding, Britt-Marie Svahn, Afshin Ahmadian, Jonas Frisén, Samuel Bernard, Jonas Mattsson, Peter Arner
article
Cell Metabolism, Elsevier, 2015, 22 (3), pp.408-417. ⟨10.1016/j.cmet.2015.06.011⟩
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BibTex
titre
A mathematical model of leptin resistance
auteur
Marine Jacquier, Hédi A. Soula, Fabien Crauste
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2015, 267, ⟨10.1016/j.mbs.2015.06.008⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01233483/file/model_leptin_resistance.pdf BibTex
titre
Optimal linear stability condition for scalar differential equations with distributed delay
auteur
Samuel Bernard, Fabien Crauste
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2015, 20 (7), ⟨10.3934/dcdsb.2015.20.1855⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00997528/file/manuscript-distributed-delay.pdf BibTex
titre
Predicting pathogen-specific CD8 T cell immune responses from a modeling approach.
auteur
Fabien Crauste, Emmanuelle Terry, I Le Mercier, Julien Mafille, S Djebali, Thibault Andrieu, Brigitte Mercier, Gaël Kaneko, C Arpin, Jacqueline Marvel, Olivier Gandrillon
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2015, 374, pp.66-82. ⟨10.1016/j.jtbi.2015.03.033⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00717406/file/Crauste-et-al-JTB-2015-final-version.pdf BibTex
titre
Dynamics of Cell Generation and Turnover in the Human Heart
auteur
Olaf Bergmann, Sofia Zdunek, Anastasia Felker, Mehran Salehpour, Kanar Alkass, Samuel Bernard, Staffan l. Sjostrom, Mirosława Szewczykowska, Teresa Jackowska, Cris Dos remedios, Torsten Malm, Michaela Andrä, Ramadan Jashari, Jens r. Nyengaard, Göran Possnert, Stefan Jovinge, Henrik Druid, Jonas Frisén
article
Cell, Elsevier, 2015, 161 (7), pp.1566-1575. ⟨10.1016/j.cell.2015.05.026⟩
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BibTex
titre
A delay differential-difference system of hematopoietic stem cell dynamics
auteur
Mostafa Adimy, Abdennasser Chekroun, Tarik-Mohamed Touaoula
article
Comptes Rendus Mathématique, Elsevier Masson, 2015, 353 (4), ⟨10.1016/j.crma.2015.01.018⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01249894/file/Adimy_CRAS.pdf BibTex
titre
Facile Synthesis and High Rate Capability of Silicon Carbonitride/Boron Nitride Composite with a Sheet-Like Morphology
auteur
Lamuel David, Samuel Bernard, Christel Gervais, Philippe Miele, Gurpreet Singh
article
Journal of Physical Chemistry C, American Chemical Society, 2015, 119 (5), pp.2783-2791. ⟨10.1021/jp508075x⟩
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BibTex
titre
Target morphology and cell memory: a model of regenerative pattern formation Cell Memory Can Regulate Morphogenesis and Regeneration
auteur
Nikolai Bessonov, Michael Levin, Nadya Morozova, Natalia Reinberg, Alen Tosenberger, Vitaly Volpert
article
Neural Regeneration Research, Publishing House of Neural Regeneration Research, 2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01238420/file/celmem.pdf BibTex
titre
How morphology of artificial organisms influences their evolution
auteur
Nikolai Bessonov, Natalia Reinberg, Vitaly Volpert
article
Ecological Complexity, Elsevier, 2015, ⟨10.1016/j.ecocom.2015.09.005⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237505/file/triangles2.pdf BibTex
titre
Modelling of platelet–fibrin clot formation in flow with a DPD–PDE method
auteur
Alen Tosenberger, Fazly Ataullakhanov, Nikolai Bessonov, Mikhail Panteleev, Alexei Tokarev, Vitaly Volpert
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2015, ⟨10.1007/s00285-015-0891-2⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237498/file/manuscript%2020140908.pdf BibTex
titre
Dynamical system model of decision making and propagation
auteur
Jacques Demongeot, Vitaly Volpert
article
Journal of Biological Systems, World Scientific Publishing, 2015, ⟨10.1142/S0218339015500187⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237695/file/decision-rev.pdf BibTex
titre
Pulses and waves for a bistable nonlocal reaction–diffusion equation
auteur
Vitaly Volpert
article
Applied Mathematics Letters, Elsevier, 2015, ⟨10.1016/j.aml.2014.12.011⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237160/file/aml.pdf BibTex
titre
Existence of stationary solutions for some nonlocal reaction-diffusion equations
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Dynamics of Partial Differential Equations, International Press, 2015, ⟨10.4310/DPDE.2015.v12.n1.a3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237921/file/heatnl-rev.pdf BibTex
titre
On a Model of Pattern Regeneration Based on Cell Memory
auteur
Nikolai Bessonov, Michael Levin, Nadya Morozova, Natalia Reinberg, Alen Tosenberger, Vitaly Volpert
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, ⟨10.1371/journal.pone.0118091⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237935/file/reg4.pdf BibTex
titre
On the entropic structure of reaction-cross diffusion systems
auteur
L Desvillettes, Th Lepoutre, Ayman Moussa, A Trescases
article
Communications in Partial Differential Equations, Taylor & Francis, 2015
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01078175/file/DLMT17%20%281%29.pdf BibTex
titre
Hybrid Modelling in Cell Biology
auteur
Angélique Stéphanou, Vitaly Volpert
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2015, 10 (1), pp.1-1
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BibTex
titre
Influence of Fibrinogen Deficiency on Clot Formation in Flow by Hybrid Model
auteur
Alen Tosenberger, Nikolai Bessonov, Vitaly Volpert
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2015, ⟨10.1051/mmnp/201510102⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237500/file/tosenberger-bessonov-volpert.pdf BibTex
titre
Acta Biotheoretica Mathematical and philosophical foundations of biological and biomedical science A Conceptual Model of Morphogenesis and Regeneration
auteur
Alen Tosenberger, Nikolai Bessonov, M Levin, Natalia Reinberg, Vitaly Volpert, Nadya Morozova
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2015, ⟨10.1007/s10441-015-9249-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237264/file/manuscript.pdf BibTex
titre
On pulse solutions of a reaction–diffusion system in population dynamics
auteur
Vitaly Volpert, Natalia Reinberg, Mohammed Benmir, Soumaya Boujena
article
Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, Elsevier, 2015, ⟨10.1016/j.na.2015.02.017⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237675/file/pulse-sys2-revised.pdf BibTex
titre
Travelling Waves of Cell Dierentiation
auteur
Mohammed Benmir, Nikolai Bessonov, Soumaya Boujena, Vitaly Volpert
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01238175/file/diff3%20%281%29.pdf BibTex
titre
On the existence of stationary solutions for some nonlinear heat equations
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Annales Academiae Scientiarum Fennicae Mathematica, Bookstore Tiedekirja, 2015, ⟨10.5186/aasfm.2015.4013⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01238488/file/heat%20%282%29.pdf BibTex
titre
Existence of Pulses for Local and Nonlocal Reaction-Diffusion Equations
auteur
Nathalie Eymard, Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Journal of Dynamics and Differential Equations, Springer Verlag, 2015, ⟨10.1007/s10884-015-9487-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237744/file/pulse3.pdf BibTex
titre
A Model of Miscible Liquids in Porous Media
auteur
Karam Allali, Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Electronic Journal of Differential Equations, Texas State University, Department of Mathematics, 2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237171/file/allali.pdf BibTex
titre
Prediction of Response to Temozolomide in Low-Grade Glioma Patients Based on Tumor Size Dynamics and Genetic Characteristics
auteur
P Mazzocco, Célia Barthélémy, G Kaloshi, Marc Lavielle, D Ricard, A Idbaih, D Psimaras, M-A Renard, A Alentorn, J Honnorat, J-Y Delattre, F Ducray, B Ribba
article
CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol, 2015, 4 (12), pp.728-737. ⟨10.1002/psp4.54⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01252076/file/CPT_Mazzocco%20%281%29.pdf BibTex
titre
Sequential pattern mining for discovering gene interactions and their contextual information from biomedical texts
auteur
Peggy Cellier, Thierry Charnois, Marc Plantevit, Christophe Rigotti, Bruno Crémilleux, Olivier Gandrillon, Jiri Klema, Jean-Luc Manguin
article
Journal of Biomedical Semantics, BioMed Central, 2015, 6, pp.1-27. ⟨10.1186/s13326-015-0023-3⟩
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BibTex
titre
Numerical simulations of heat explosion with convection in porous media
auteur
Karam Allali, Fouad Bikany, Ahmed Taik, Vitaly Volpert
article
Combustion Science and Technology, Taylor & Francis, 2015, ⟨10.1080/00102202.2014.948619⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01238489/file/ExplosionPorousMediaRevised_modifications.pdf BibTex

Conference papers

titre
Preface to Session 70 " Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology
auteur
Loic Barbarroux, Jean Clairambault, Nick Cogan, Jan Elias, Shalla Hanson, Marek Kimmel, Tommaso Lorenzi
article
ICNAAM 2015 Session 70: "Mathematical models and methods to investigate heterogeneity in cell and cell population biology'', Organiser Session 70: Jean Clairambault, Sep 2015, Rhodes, Greece
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https://hal.inria.fr/hal-01249244/file/JC_Session70Preface_ICNAAM2015Rhodes.pdf BibTex
titre
Multi-scale modeling of the CD8 immune response
auteur
Loic Barbarroux, Philippe Michel, Mostafa Adimy, Fabien Crauste
article
INTERNATIONAL CONFERENCE OF NUMERICAL ANALYSIS AND APPLIED MATHEMATICS 2015 (ICNAAM 2015), Sep 2015, Rhodes, Greece. pp.320002, ⟨10.1063/1.4952106⟩
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Theses

titre
Multiscale modeling for the regulation of cell cycle by the circadian clock : applications to chronotherapy
auteur
Raouf El Cheikh
article
Dynamical Systems [math.DS]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2015. English. ⟨NNT : 2015LYO10082⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01254464/file/TH2015ElCheikhRaouf.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Dynamics of oligodendrocyte generation and myelination in the human brain.
auteur
Maggie S Y Yeung, Sofia Zdunek, Olaf Bergmann, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, Kanar Alkass, Shira Perl, John Tisdale, Göran Possnert, Lou Brundin, Henrik Druid, Jonas Frisén
article
Cell, Elsevier, 2014, 159, pp.766-774
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BibTex
titre
In Situ Controlled Growth of Titanium Nitride in Amorphous Silicon Nitride: A General Route Toward Bulk Nitride Nanocomposites with Very High Hardness
auteur
Mirna Chaker Bechelany, Vanessa Proust, Christel Gervais, Rudy Ghisleni, Samuel Bernard, Philippe Miele
article
Advanced Materials, Wiley-VCH Verlag, 2014, 26 (38), pp.6548-6553. ⟨10.1002/adma.201402356⟩
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BibTex
titre
Multiscale Modeling of the Early CD8 T-Cell Immune Response in Lymph Nodes: An Integrative Study
auteur
Sotiris Prokopiou, Loic Barbarroux, Samuel Bernard, Julien Mafille, Yann Leverrier, Christophe Arpin, Jacqueline Marvel, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste
article
Computation, MDPI, 2014, 2 (4), pp.159-181. ⟨10.3390/computation2040159⟩
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BibTex
titre
Modeling circadian clock-cell cycle interaction effects on cell population growth rates
auteur
Raouf El Cheikh, Samuel Bernard, Nader El Khatib
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2014, 363, pp.318-331. ⟨10.1016/j.jtbi.2014.08.008⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01055081/file/elcheikh2014JTB_postprint.pdf BibTex
titre
A Micellar On-Pathway Intermediate Step Explains the Kinetics of Prion Amyloid Formation
auteur
Erwan Hingant, Pascaline Fontes, Maria-Teresa Alvarez-Martinez, Jacques-Damien Arnaud, Jean-Pierre Liautard, Laurent Pujo-Menjouet
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2014, 10 (8), pp.e1003735. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003735⟩
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BibTex
titre
Finding maximal homogeneous clique sets
auteur
Pierre-Nicolas Mougel, Christophe Rigotti, Marc Plantevit, Olivier Gandrillon
article
Knowledge and Information Systems (KAIS), Springer, 2014, 39 (3), pp.1-30. ⟨10.1007/s10115-013-0625-y⟩
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BibTex
titre
The age and genomic integrity of neurons after cortical stroke in humans.
auteur
Hagen B Huttner, Olaf Bergmann, Mehran Salehpour, Attila Rácz, Jemal Tatarishvili, Emma Lindgren, Tamás Csonka, László Csiba, Tibor Hortobágyi, Gábor Méhes, Elisabet Englund, Beata Werne Solnestam, Sofia Zdunek, Christian Scharenberg, Lena Ström, Patrik Ståhl, Benjamin Sigurgeirsson, Andreas Dahl, Stefan Schwab, Göran Possnert, Samuel Bernard, Zaal Kokaia, Olle Lindvall, Joakim Lundeberg, Jonas Frisén
article
Nature Neuroscience, Nature Publishing Group, 2014, pp.801-3
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BibTex
titre
Neurogenesis in the Striatum of the Adult Human Brain.
auteur
Aurélie Ernst, Kanar Alkass, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, Shira Perl, John Tisdale, Göran Possnert, Henrik Druid, Jonas Frisén
article
Cell, Elsevier, 2014, 156 (5), pp.1072-1083. ⟨10.1016/j.cell.2014.01.044⟩
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BibTex
titre
Cell polarisation model : the 1D case
auteur
Thomas Lepoutre, Nicolas Meunier, Nicolas Muller
article
Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, Elsevier, 2014, 101 (2), pp.152--171. ⟨10.1016/j.matpur.2013.05.006⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00776613/file/hal_LMM.pdf BibTex
titre
Synchronisation and control of proliferation in cycling cell population models with age structure
auteur
Frédérique Billy, Jean Clairambault, Olivier Fercoq, Stéphane Gaubert, Thomas Lepoutre, Thomas Ouillon, Shoko Saito
article
Mathematics and Computers in Simulation, Elsevier, 2014, 96, pp.66-94. ⟨10.1016/j.matcom.2012.03.005⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00662885/file/BiCFerGLOuS.pdf BibTex
titre
Solvability Relations For Some Diffusion Equations With Convection Terms
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Discontinuity, Nonlinearity and Complexity, 2014, 3 (4), pp.457-465
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BibTex
titre
Alzheimer's disease: analysis of a mathematical model incorporating the role of prions
auteur
Mohamed Helal, Erwan Hingant, Laurent Pujo-Menjouet, Glenn F. Webb
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2014, 69 (5), pp.1207-1235. ⟨10.1007/s00285-013-0732-0⟩
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https://arxiv.org/pdf/1302.7013 BibTex
titre
The role of spatial organization of cells in erythropoiesis
auteur
Nathalie Eymard, Nikolai Bessonov, Olivier Gandrillon, Koury Mark, Vitaly Volpert
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2014, pp.1-29. ⟨10.1007/s00285-014-0758-y⟩
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BibTex
titre
Asymptotic behaviour of a mathematical model of hematopoietic stem cell dynamics
auteur
Mostafa Adimy, Oscar Angulo, Juan Carlos López-Marcos, Miguel Angel López-Marcos
article
International Journal of Computer Mathematics, Taylor & Francis, 2014, 91 (2), pp.11. ⟨10.1080/00207160.2013.778400⟩
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BibTex
titre
On the solvability in the sense of sequences for some non-Fredholm operators
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Dynamics of Partial Differential Equations, International Press, 2014, 11 (2), pp.109-124
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BibTex
titre
A predictive model of the dynamics of body weight and food intake in rats submitted to caloric restrictions.
auteur
Marine Jacquier, Fabien Crauste, Christophe Soulage, Hédi A Soula
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (6), pp.e100073. ⟨10.1371/journal.pone.0100073⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01017357/file/journal.pone.0100073.pdf BibTex
titre
Mathematics of Darwin’s Diagram
auteur
Nikolai Bessonov, Reinberg Natalia, Vitaly Volpert
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2014, 9 (3), pp.5-25. ⟨10.1051/mmnp/20149302⟩
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BibTex
titre
Entropy, Duality and Cross Diffusion
auteur
Laurent Desvillettes, Thomas Lepoutre, Ayman Moussa
article
SIAM Journal on Mathematical Analysis, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2014, Entropy, Duality, and Cross Diffusion, 46 (1)
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https://arxiv.org/pdf/1302.1028 BibTex
titre
Ergodic and weighted pseudo-almost periodic solutions for partial functional differential equations in fading memory spaces
auteur
Mostafa Adimy, Khalil Ezzinbi, Catherine Marquet
article
Journal of Applied Mathematics and Computing, Springer, 2014, 44 (1-2), pp.19. ⟨10.1007/s12190-013-0686-9⟩
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BibTex
titre
Branching and aggregation in self-reproducing systems
auteur
Vitaly Volpert
article
ESAIM: Proceedings, EDP Sciences, 2014, 47, pp.116-129. ⟨10.1051/proc/201447007⟩
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BibTex
titre
Solvability conditions for some non Fredholm operators in a layer in four dimensions
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Discontinuity, Nonlinearity and Complexity, 2014, 3 (1), pp.59-71
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BibTex
titre
Existence of stationary pulses for nonlocal reaction-diffusion equations
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Documenta Mathematica, Universität Bielefeld, 2014, 19, pp.1141-1153
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BibTex
titre
Properness and topological degree for nonlocal integro-differential systems
auteur
Narcisa Apreutesei, Vitaly Volpert
article
Topological Methods in Nonlinear Analysis, Juliusz Schauder University Centre for Nonlinear Studies, 2014, 43 (1), pp.215-229
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BibTex
titre
A methodological framework for drug development in rare diseases
auteur
Patrice Nony, Polina Kurbatova, Agathe Bajard, Salma Malik, Charlotte Castellan, Sylvie Chabaud, Vitaly Volpert, Nathalie Eymard, Behrouz Kassai, Catherine Cornu
article
Orphanet Journal of Rare Diseases, BioMed Central, 2014, 9 (164), pp.1-10. ⟨10.1186/s13023-014-0164-y⟩
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BibTex
titre
Functional differential equations with unbounded delay in extrapolation spaces
auteur
Mostafa Adimy, Mohamed Alia, Khalil Ezzinbi
article
Electronic Journal of Differential Equations, Texas State University, Department of Mathematics, 2014, 2014, pp.1 - 16
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https://hal.inria.fr/hal-01096950/file/adimy.pdf BibTex
titre
A Model for Genome Size Evolution
auteur
Stephan Fischer, Samuel Bernard, Guillaume Beslon, Carole Knibbe
article
Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2014, 76 (9), pp.2249 - 2291. ⟨10.1007/s11538-014-9997-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01090984/file/Fischer14.pdf BibTex
titre
A mathematical model of multistage hematopoietic cell lineages
auteur
Mostafa Adimy, Oscar Angulo, Catherine Marquet, Leila Sebaa
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2014, 19 (1), pp.26. ⟨10.3934/dcdsb.2014.19.1⟩
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BibTex

Conference papers

titre
Initiation of erythropoiesis by BFU-E cells
auteur
Anass Bouchnita, Nathalie Eymard, Mark Koury, Vitaly Volpert
article
Mathematical biology in life sciences, Sep 2014, Sidi bel Abbes, Algeria. ⟨10.1051/itmconf/20150401002⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01238490/file/bouchnita-eymard-koury-volpert.pdf BibTex

Book sections

titre
Théorie sur l’apparition de structures de Turing pour les biologistes ou éclaircissements sur deux intuitions ingénieuses
auteur
Laurent Pujo-Menjouet
article
Modéliser & simuler - Epistémologies et pratiques de la modélisation et de la simulation - Tome 2, 2, ⟨Éditions Matériologiques⟩, pp.525, 2014, Modélisations, simulations, systèmes complexes, 978-2-919694-72-3
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BibTex

Directions of work or proceedings

titre
A generalized finite difference method for the 2-D nonlinear shallow water equations
auteur
Mansour Dia Ben, Ababacar Diagne, Leon Matar Tine
article
CARI'14 Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées., Oct 2014, Saint-Louis, Senegal. 2014, CARI 2014 Proceedings
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BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Equations à Retard et Modèles de Dynamiques de Populations Cellulaires
auteur
Fabien Crauste
article
Mathématiques générales [math.GM]. Université Claude Bernard Lyon 1, 2014
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https://hal.inria.fr/tel-01092352/file/CRAUSTE-HDR-manuscript.pdf BibTex

Books

titre
Elliptic Partial Differential Equations Volume 2: Reaction-Diffusion Equations
auteur
Vitaly Volpert
article
Birkhauser, 2014, ISBN: 978-3-0348-0812-5
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BibTex

Theses

titre
Blood flow modelling and applications to blood coagulation and atherosclerosis
auteur
Alen Tosenberger
article
Mathematics [math]. Université Claude Bernard - Lyon 1 Institut Camille Jordan - CNRS UMR 5208, 2014. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01101607/file/TH2014_Tosenberger_Alen.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Adipocyte triglyceride turnover and lipolysis in lean and overweight subjects.
auteur
Mikael Rydén, Daniel P Andersson, Samuel Bernard, Kirsty Spalding, Peter Arner
article
Journal of Lipid Research, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2013, 54 (10), pp.2909-2913. ⟨10.1194/jlr.M040345⟩
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BibTex
titre
How to Build a Multiscale Model in Biology.
auteur
Samuel Bernard
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2013, 61 (3), pp.291-303. ⟨10.1007/s10441-013-9199-z⟩
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BibTex
titre
Steady state analysis for a relaxed cross diffusion model
auteur
Thomas Lepoutre, Salome Martinez
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series A, American Institute of Mathematical Sciences, 2013, 34 (2), pp.613-633. ⟨10.3934/dcds.2014.34.613⟩
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BibTex
titre
Solvability in the sense of sequence for some non-Fredholm elliptic problems
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Discontinuity, Nonlinearity and Complexity, 2013, in press
Accès au bibtex
BibTex
titre
Properness and topological degree for nonlocal integro-differential systems
auteur
Vitaly Volpert, Narcisa Apreutesei
article
Topological Methods in Nonlinear Analysis, Juliusz Schauder University Centre for Nonlinear Studies, 2013, in press
Accès au bibtex
BibTex
titre
Existence of Reaction-Diffusion Waves with Nonlinear Boundary Conditions
auteur
Vitaly Volpert, Narcisa Apreutesei, Alen Tosenberger
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2013, 8 (4), pp.2-17. ⟨10.1051/mmnp/20138302⟩
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BibTex
titre
Deformable cell model and its application to growth of plant meristem
auteur
Vitaly Volpert, Nikolai Bessonov, Victoria Mironova
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2013, 8 (3), pp.62-79. ⟨10.1051/mmnp/20138405⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Solvability in the sense of sequences to some non-Fredholm operators
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Electronic Journal of Differential Equations, Texas State University, Department of Mathematics, 2013, 2013 (160), pp.1-16
Accès au bibtex
BibTex
titre
Convergence of time dependent Turing structure to a stationary solution
auteur
Vitaly Volpert, A.G. Ramm
article
Acta Applicandae Mathematicae, Springer Verlag, 2013, 123 (1), pp.31-42. ⟨10.1007/s10440-012-9711-5⟩
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BibTex
titre
Reaction-diffusion waves with nonlinear boundary conditions
auteur
Narcisa Apreutesei, Vitaly Volpert
article
Networks and Heterogeneous Media, AIMS-American Institute of Mathematical Sciences, 2013, 8 (1), pp.23-35. ⟨10.3934/nhm.2013.8.23⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00846563/file/nonlinear-bc.pdf BibTex
titre
Dynamics of hippocampal neurogenesis in adult humans.
auteur
Kirsty L Spalding, Olaf Bergmann, Kanar Alkass, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, Hagen B Huttner, Emil Boström, Isabelle Westerlund, Céline Vial, Bruce A Buchholz, Göran Possnert, Deborah C Mash, Henrik Druid, Jonas Frisén
article
Cell, Elsevier, 2013, 153 (6), pp.1219-1227. ⟨10.1016/j.cell.2013.05.002⟩
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BibTex
titre
Applying ecological and evolutionary theory to cancer: a long and winding road
auteur
Frédéric Thomas, Daniel Fisher, Philippe Fort, Jean-Pierre Marie, Simon Daoust, Benjamin Roche, Christoph Grunau, Céline Cosseau, Guillaume Mitta, Stephen Baghdiguian, François Rousset, Patrice Lassus, Eric Assenat, Damien Grégoire, Dorothée Missé, Alexander Lorz, Frédérique Billy, William Vainchenker, François Delhommeau, Serge Koscielny, Raphael Itzykson, Ruoping Tang, Fanny Fava, Annabelle Ballesta, Thomas Lepoutre, Liliane Krasinska, Vjekoslav Dulic, Peggy Raynaud, Philippe Blache, Corinne Quittau-Prévostel, Emmanuel Vignal, Hélène Trauchessec, Benoît Perthame, Jean Clairambault, Vitaly Volpert, Eric Solary, Urszula Hibner, Michael E. Hochberg
article
Evolutionary Applications, Blackwell, 2013, 6 (1), pp.1-10. ⟨10.1111/eva.12021⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/halsde-00790602/file/Thomas-2013-EvolAppl-Applying.pdf BibTex
titre
Analysis of radiocarbon, stable isotopes and DNA in teeth to facilitate identification of unknown decedents.
auteur
Kanar Alkass, Hisako Saitoh, Bruce A Buchholz, Samuel Bernard, Gunilla Holmlund, David R Senn, Kirsty L Spalding, Henrik Druid
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (7), ⟨10.1371/journal.pone.0069597⟩
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BibTex

Book sections

titre
Modele multi-echelle de la dynamique cellulaire
auteur
Vitaly Volpert, Nikolai Bessonov, Alen Tosenberger, Nathalie Eymard
article
Le vivant discret et continu, Editions Materiologiques, in press, 2013
Accès au bibtex
BibTex
titre
Pattern Formation in Hybrid Models of Cell Population
auteur
Vitaly Volpert, N. Bessonov, Polina Kurbatova
article
Pattern Formation in Morphogenesis, Springer-Verlag, pp.107-119, 2013, Springer Proceedings in Mathematics, 978-3-642-20164-6. ⟨10.1007/978-3-642-20164-6_10⟩
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BibTex
titre
Emergence and Propagation of Patterns in Nonlocal Reaction-Diffusion Equations Arising in the Theory of Speciation.
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Dispersal, Individual Movement and Spatial Ecology, Springer-Verlag, pp.331-353, 2013, Lecture Notes in Mathematics, 978-3-642-35497-7. ⟨10.1007/978-3-642-35497-7_12⟩
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BibTex
titre
Mathematical modeling in chronobiology
auteur
Grigory Bordyugov, Pål O Westermark, Ana Korencic, Samuel Bernard, Hanspeter Herzel
article
Achim Kramer and Martha Merrow. Circadian clocks, Springer, pp.335--357, 2013, ⟨10.1007/978-3-642-25950-0_14⟩
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BibTex
titre
Modélisation multi-échelles en biologie
auteur
Samuel Bernard
article
Nicolas Glade and Angélique Stéphanou. Le vivant discret et continu, Éditions Matériologiques, pp.65-89, 2013, Science & Philosophie, 978-2-919694-23-5
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Numerical Simulations of Heat ExplosionWith Convection In Porous Media
auteur
Karam Allali, Fouad Bikany, Ahmed Taik, Vitaly Volpert
article
2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00859414/file/porous.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Adipocyte triglyceride turnover is independently associated with atherogenic dyslipidemia.
auteur
Keith Frayn, Samuel Bernard, Kirsty Spalding, Peter Arner
article
Journal of the American Heart Association, Wiley-Blackwell, 2012, 1 (6), pp.e003467. ⟨10.1161/JAHA.112.003467⟩
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titre
On the existence of stationary solutions for some systems of non-Fredholm integro-differential equations.
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Discontinuity, Nonlinearity and Complexity, 2012, 1 (2), pp.197-209
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titre
Reaction-Diffusion Model of Atherosclerosis Development.
auteur
N. El Khatib, Stéphane Génieys, Bogdan Kazmierczak, Vitaly Volpert
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2012, 65 (2), pp.349-374. ⟨10.1007/s00285-011-0461-1⟩
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titre
Solvability conditions for some linear and nonlinear non-Fredholm elliptic problems.
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Analysis and mathematical physics, 2012, 2, pp.473-496. ⟨10.1007/s13324-012-0046-1⟩
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titre
Existence of travelling waves for a class of integro-differential equations from population dynamics
auteur
Vitaly Volpert, Narcisa Apreutesei
article
International Electronic Journal of Pure and Applied Mathematics, 2012, 5 (2), pp.53-67
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titre
Solvability Conditions for a Linearized Cahn-Hilliard Equation of Sixth Order.
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2012, 7 (2), pp.146--154. ⟨10.1051/mmnp/20127212⟩
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titre
Modelling of thrombus growth and growth stop in flow by the method of dissipative particle dynamics.
auteur
Alen Tosenberger, Fazly Ataullakhanov, N. Bessonov, Mikhail A. Panteleev, Alexey Tokarev, Vitaly Volpert
article
Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling, De Gruyter, 2012, 27 (5), pp.507-522. ⟨10.1515/rnam-2012-0029⟩
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titre
Mathematical modelling of erythropoiesis in vivo with multiple erythroblastic islands.
auteur
Nikolai Bessonov, Nathalie Eymard, Polina Kurbatova, Vitaly Volpert
article
Applied Mathematics Letters, Elsevier, 2012, 25 (9), pp.1217-1221. ⟨10.1016/j.aml.2012.02.053⟩
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titre
On the solvability conditions for the diffusion equation with convection terms.
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
Communications on Pure and Applied Mathematics, Wiley, 2012, 11 (1), pp.365--373
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titre
Propagation of Turing patterns in a plankton model.
auteur
R. Upadhyay, Vitaly Volpert, N. K. Thakur
article
Journal of Biological Dynamics, Taylor & Francis Open, 2012, 6 (2), pp.524-538. ⟨10.1080/17513758.2012.655327⟩
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titre
Né pour sentir [Born to smell].
auteur
Samuel Bernard
article
médecine/sciences, EDP Sciences, 2012, 28 (11), pp.937-9. ⟨10.1051/medsci/20122811012⟩
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titre
Mathematical model of the primary CD8 T cell immune response: stability analysis of a nonlinear age-structured system.
auteur
Emmanuelle Terry, Jacqueline Marvel, Christophe Arpin, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2012, 65, pp.263-291. ⟨10.1007/s00285-011-0459-8⟩
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titre
Asymptotic behavior for a class of the renewal nonlinear equation with diffusion
auteur
Philippe Michel, Tarik Touaoula
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, Wiley, 2012, 36 (3), pp.323-335. ⟨10.1002/mma.2591⟩
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titre
The age of olfactory bulb neurons in humans.
auteur
Olaf Bergmann, Jakob Liebl, Samuel Bernard, Kanar Alkass, Maggie S Y Yeung, Peter Steier, Walter Kutschera, Lars Johnson, Mikael Landén, Henrik Druid, Kirsty L Spalding, Jonas Frisén
article
Neuron, Elsevier, 2012, 74 (4), pp.634-639. ⟨10.1016/j.neuron.2012.03.030⟩
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BibTex
titre
Fragmentation and monomer lengthening of rod-like polymers, a relevant model for prion proliferation
auteur
Ionel Ciuperca, Erwan Hingant, Liviu Palade, Laurent Pujo-Menjouet
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2012, 17 (3), pp.775-799. ⟨10.3934/dcdsb.2012.17.775⟩
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titre
Modeling erythroblastic islands: using a hybrid model to assess the function of central macrophage.
auteur
S. Fischer, P. Kurbatova, N. Bessonov, Olivier Gandrillon, Vitaly Volpert, Fabien Crauste
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2012, 298, pp.92-106. ⟨10.1016/j.jtbi.2012.01.002⟩
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titre
Asymptotic-numerical analysis of the diffusion- discrete absorption equation
auteur
Polina Kurbatova, Grigory Panasenko, Vitaly Volpert
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, Wiley, 2012, 35 (4), pp.438-444. ⟨10.1002/mma.1572⟩
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titre
Continuous Mathematical Model of Platelet Thrombus Formation in Blood Flow.
auteur
Alexey Tokarev, G. Sirakov, G. Panasenko, Vitaly Volpert, E. Schnol, A. Butylin, Fazly Ataullakhanov
article
Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling, De Gruyter, 2012, 27 (2), pp.192-212. ⟨10.1515/rnam-2012-0011⟩
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titre
On the stability of hematopoietic model with feedback control
auteur
Mostafa Adimy, Catherine Marquet
article
Comptes Rendus Mathématique, Elsevier Masson, 2012, 350 (3-4), pp.173-176. ⟨10.1016/j.crma.2012.01.014⟩
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titre
Cardiomyocyte renewal in humans.
auteur
Olaf Bergmann, Sofia Zdunek, Jonas Frisén, Samuel Bernard, Henrik Druid, Stefan Jovinge
article
Circulation Research, American Heart Association, 2012, 110 (1), e17-8; author reply e19-21. ⟨10.1161/CIRCRESAHA.111.259598⟩
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titre
Center manifolds for some partial functional differential equations with infinite delay in fading memory spaces
auteur
Mostafa Adimy, Khalil Ezzinbi, Catherine Marquet
article
Journal of Concrete and Applicable Mathematics, Eudoxus Press, 2012, 10 (3-4), pp.168-185
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titre
Modeling Biological Rhythms in Cell Populations
auteur
Raouf El Cheikh, Thomas Lepoutre, Samuel Bernard
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2012, 7 (6), pp.107--125. ⟨10.1051/mmnp/20127606⟩
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titre
Delay Differential Equations and Autonomous Oscillations in Hematopoietic Stem Cell Dynamics Modeling
auteur
Mostafa Adimy, Fabien Crauste
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2012, 7 (6), pp.1-22. ⟨10.1051/mmnp/20127601⟩
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BibTex
titre
Global well-posedness of a conservative relaxed cross diffusion system.
auteur
Thomas Lepoutre, Michel Pierre, Guillaume Rolland
article
SIAM Journal on Mathematical Analysis, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2012, 44 (3), pp.1674-1693. ⟨10.1137/110848839⟩
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titre
Study of the intermediate pyrolysis steps and mechanism identification of polymer-derived SiBCN ceramics
auteur
Laura Gottardo, Samuel Bernard, Christel Gervais, Markus Weinmann, Philippe Miele
article
Journal of Materials Chemistry, Royal Society of Chemistry, 2012, 22 (34), pp.17923-17933. ⟨10.1039/c2jm32737f⟩
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Conference papers

titre
Finding Collections of Protein Modules in Protein-Protein Interaction Networks
auteur
Pierre-Nicolas Mougel, Christophe Rigotti, Olivier Gandrillon
article
Bioinformatics and Computational Biology (BICoB), 2012, Las Vegas, United States. pp.216-222
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BibTex
titre
Finding Collections of k-Clique Percolated Components in Attributed Graphs
auteur
Pierre-Nicolas Mougel, Christophe Rigotti, Olivier Gandrillon
article
Pacific-Asia Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (PAKDD), 2012, Kuala Lumpur, Malaysia. pp.181--192
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Theses

titre
Modélisation probabiliste en biologie moléculaire et cellulaire
auteur
Romain Yvinec
article
Probabilités [math.PR]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2012. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00749633/file/masterv3.pdf BibTex
titre
Contributions à la modélisation mathématique et numérique de problèmes issus de la biologie - Applications aux Prions et à la maladie d'Alzheimer
auteur
Erwan Hingant
article
Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2012. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00763444/file/these.pdf BibTex
titre
Contributions à la théorie des modèles positive.
auteur
Mohammed Belkasmi
article
Logique [math.LO]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2012. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00733592/file/Contributions_A_la_thA_orie_des_modA_les_positive_.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
The role of platelets in blood coagulation during thrombus formation in flow
auteur
Alen Tosenberger, Fazly Ataullakhanov, Nikolai Bessonov, Mikhail A. Panteleev, Alexey Tokarev, Vitaly Volpert
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00729046/file/hal_20120910.pdf BibTex
titre
Adiabatic reduction of a model of stochastic gene expression with jump Markoc process
auteur
Romain Yvinec, Changjing Zhuge, Jinzhi Lei, Michael C. Mackey
article
2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00674572/file/JLMCMRYCZ_12_Adiabaticreductionbursting.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Particle Dynamics Methods of Blood Flow Simulations,
auteur
Alen Tosenberger, Vsevolod Salnikov, Nikolai Bessonov, Evgeniya Babushkina, Vitaly Volpert
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2011, 6 (5), pp.320-332. ⟨10.1051/mmnp/20116512⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00653688/file/mmnp-tosenberger.pdf BibTex
titre
Properness and Topological Degree for Nonlocal Reaction-Diffusion Operators
auteur
Narcisa Apreutesei, Vitaly Volpert
article
Abstract and Applied Analysis, Hindawi Publishing Corporation, 2011, pp.ID 629692
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00653656/file/int-dif-prop_3_revised.pdf BibTex
titre
On the existence of stationary solutions for some non-Fredholm integro-differential equations
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Documenta Mathematica, Universität Bielefeld, 2011, 16, pp.561-580
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00653648/file/nfnl-revised.pdf BibTex
titre
Spectrum of some integro-differential operators and stability of travelling waves
auteur
Arnaud Ducrot, Martine Marion, Vitaly Volpert
article
Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, Elsevier, 2011, 74 (13), pp.4455-4473. ⟨10.1016/j.na.2011.04.009⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00653653/file/int-spectrum15.pdf BibTex
titre
Solvability conditions for some non-Fredholm operators
auteur
Vitali Vougalter, Vitaly Volpert
article
Proceedings of the Edinburgh Mathematical Society, Cambridge University Press (CUP), 2011, 54 (1), pp.249-271. ⟨10.1017/S0013091509000236⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00653658/file/fredholm.pdf BibTex
titre
Computational Algorithm for Some Problems with Variable Geometrical Structure
auteur
Nikolai Bessonov, Vitaly Volpert
article
Lecture Notes in Computer Science, Springer, 2011, 6260/2011, pp.87-102. ⟨10.1007/978-3-642-16236-7_6⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00653652/file/algorithm.pdf BibTex
titre
Dynamics of human adipose lipid turnover in health and metabolic disease.
auteur
Peter Arner, Samuel Bernard, Mehran Salehpour, Göran Possnert, Jakob Liebl, Peter Steier, Bruce A Buchholz, Mats Eriksson, Erik Arner, Hans Hauner, Thomas Skurk, Mikael Rydén, Keith N Frayn, Kirsty L Spalding
article
Nature, Nature Publishing Group, 2011, 478 (7367), pp.110-3. ⟨10.1038/nature10426⟩
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BibTex
titre
Dynamics of polymerization shed light on the mechanisms that lead to multiple amyloid structures of the prion protein.
auteur
Maria-Teresa Alvarez-Martinez, Pascaline Fontes, Viviana Zomosa-Signoret, Jacques-Damien Arnaud, Erwan Hingant, Laurent Pujo-Menjouet, Jean-Pierre Liautard
article
BBA - Biochimica et Biophysica Acta, Elsevier, 2011, 1814 (10), pp.1305-17. ⟨10.1016/j.bbapap.2011.05.016⟩
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BibTex
titre
Cholesterol synthesis-related enzyme oxidosqualene cyclase is required to maintain self-renewal in primary erythroid progenitors.
auteur
C. Mejia-Pous, F. Damiola, Olivier Gandrillon
article
Cell Proliferation, Wiley, 2011, 44 (5), pp.441-52. ⟨10.1111/j.1365-2184.2011.00771.x⟩
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BibTex
titre
Regulation of mammalian cell cycle progression in the regenerating liver.
auteur
Anuradha Chauhan, Stephan Lorenzen, Hanspeter Herzel, Samuel Bernard
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2011, 283 (1), pp.103-12. ⟨10.1016/j.jtbi.2011.05.026⟩
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BibTex
titre
A review on local asymptotic stability analysis for mathematical models of hematopoiesis with delay and delay-dependent coefficients
auteur
Fabien Crauste
article
Annals of the Tiberiu Popoviciu Seminar of functional equations, approximation and convexity, 2011, 9, pp.121-143
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https://hal.inria.fr/hal-00750271/file/ATPS-2011-Crauste-Fabien.pdf BibTex
titre
Les complexités : point de vue d'un institut des systèmes complexes
auteur
Eric Bertin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon, Sebastian Grauwin, Pablo Jensen, Nicolas Schabanel
article
Hermès, La Revue- Cognition, communication, politique, CNRS-Editions, 2011, pp.145-150
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BibTex
titre
Identification of cardiomyocyte nuclei and assessment of ploidy for the analysis of cell turnover.
auteur
Olaf Bergmann, Sofia Zdunek, Kanar Alkass, Henrik Druid, Samuel Bernard, Jonas Frisén
article
Experimental Cell Research, Elsevier, 2011, 317 (2), pp.188-94. ⟨10.1016/j.yexcr.2010.08.017⟩
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BibTex
titre
Modelling of Plant Growth with Apical or Basal Meristem
auteur
Nikolai Bessonov, Fabien Crauste, Vitaly Volpert
article
Math. Model. Nat. Phenom., 2011, 6 (2), pp.107-132. ⟨10.1051/mmnp/20116204⟩
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BibTex
titre
Application of Hybrid Models to Blood Cell Production in the Bone Marrow
auteur
Nikolai Bessonov, Fabien Crauste, Stephan Fisher, Polina Kurbatova, Vitaly Volpert
article
Math. Model. Nat. Phenom., 2011, 6 (7), pp.2-12. ⟨10.1051/mmnp/20116701⟩
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BibTex
titre
Extrapolation Spaces and Partial Neutral Functional Differential Equations with infinite delay
auteur
Mostafa Adimy, Khalil Ezzinbi, Mohamed Alia
article
Differential and integral equations, Khayyam Publishing, 2011
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BibTex
titre
HYBRID MODEL OF ERYTHROPOIESIS AND LEUKEMIA TREATMENT WITH CYTOSINE ARABINOSIDE
auteur
Polina Kurbatova, Samuel Bernard, Nikolai Bessonov, Fabien Crauste, Ivan Demin, Charles Dumontet, Stephan Fischer, Vitaly Volpert
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2011, 71 (6), pp.2246-2268. ⟨10.1137/100815517⟩
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Conference papers

titre
Extraction sous Contraintes d'Ensembles de Cliques Homogènes
auteur
Pierre-Nicolas Mougel, Marc Plantevit, Christophe Rigotti, Olivier Gandrillon, Jean-François Boulicaut
article
11eme Conference Francophone sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances (EGC'11), 2011, Brest, France. pp.1-12
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BibTex

Book sections

titre
Multi-Agent Systems and Blood Cell Formation
auteur
Nikolai Bessonov, Ivan Demin, Polina Kurbatova, Laurent Pujo-Menjouet, Vitaly Volpert
article
InTech. Multi-Agent Systems - Modeling, Interactions, Simulations and Case Studies, InTech, pp.502, 2011, Robotics, 978-953-307-176-3. ⟨10.5772/1936⟩
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Books

titre
Elliptic Partial Differential Equations. Volume I. Fredholm theory of elliptic problems in unbounded domains
auteur
Vitaly Volpert
article
birkhauser, pp.655, 2011
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BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
On the bursting of gene products
auteur
Romain Yvinec, Alexandre F. Ramos
article
2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00651588/file/RY-13-12-11.pdf BibTex
titre
Positive model theory and amalgamations
auteur
Mohammed Belkasmi
article
2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00746275/file/article3ndjfl.pdf BibTex
titre
A numerical scheme for rod-like polymers with fragmentation and monomers lengthening
auteur
Erwan Hingant
article
2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00653394/file/article.pdf BibTex

2010

Journal articles

titre
Novel genes differentially expressed between posterior and median silk gland identified by SAGE-aided transcriptome analysis.
auteur
Corinne Royer, Jérôme Briolay, Annie Garel, Patrick Brouilly, Shun-Ichi Sasanuma, Motoe Sasanuma, Michihiko Shimomura, Céline Keime, Olivier Gandrillon, Yongping Huang, Gérard Chavancy, Kazuei Mita, Pierre Couble
article
Insect Biochemistry and Molecular Biology, Elsevier, 2010, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.ibmb.2010.11.003⟩
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BibTex
titre
Identification of human, rat and chicken ribosomal proteins by a combination of two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis and mass spectrometry.
auteur
Anh Thu Nguyen-Lefebvre, Sandrine Gonin-Giraud, Alexander Scherl, Patrizia Arboit, Laure Granger, Jean-Charles Sanchez, Jean-Jacques Diaz, Olivier Gandrillon, Jean-Jacques Madjar
article
Journal of Proteomics, Elsevier, 2010, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.jprot.2010.10.007⟩
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BibTex
titre
On the solvability conditions for some non-Fredholm operators
auteur
Vitaly Volpert, Vitali Vougalter
article
International Journal of Pure and Applied Mathematics, Academic Publishing Ltd, 2010, 60 (2), pp.169-191
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BibTex
titre
Existence of Waves for a Nonlocal Reaction-Diffusion Equation.
auteur
Vitaly Volpert, I. Demin
article
Math. Model. Nat. Phenom., 2010, pp.5 (2010), No. 5, 80-101
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BibTex
titre
Linear stability analysis of reaction front propagation in liquids with vibrations
auteur
Vitaly Volpert, K. Allali, F. Bikany, A. Taik
article
international electronic journal of pure and applied mathematics (IEJPAM), 2010, 1 (2), pp.196-215
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BibTex
titre
Spatial structures and generalized travelling waves for an integro-differential equation
auteur
Vitaly Volpert, Narcisa Apreutesei, Nikolai Bessonov, Vitali Vougalter
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2010, 13 (3), pp.537-557. ⟨10.3934/dcdsb.2010.13.537⟩
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BibTex
titre
Mathematical study of feedback control roles and relevance in stress erythropoiesis.
auteur
Fabien Crauste, Ivan Demin, Olivier Gandrillon, Vitaly Volpert
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2010, 263 (3), pp.303-16. ⟨10.1016/j.jtbi.2009.12.026⟩
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BibTex
titre
Adipocyte turnover: relevance to human adipose tissue morphology.
auteur
Erik Arner, Pål O Westermark, Kirsty L Spalding, Tom Britton, Mikael Rydén, Jonas Frisén, Samuel Bernard, Peter Arner
article
Diabetes, American Diabetes Association, 2010, 59 (1), pp.105-9. ⟨10.2337/db09-0942⟩
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BibTex
titre
Boundedness and Lyapunov Function for a Nonlinear System of Hematopoietic Stem Cell Dynamics
auteur
Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Abderrahim El Abdllaoui
article
Comptes Rendus Mathématique, Elsevier Masson, 2010, 348 (7-8), pp.373-377. ⟨10.1016/j.crma.2010.02.018⟩
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BibTex
titre
A mathematical model for the interpretation of nuclear bomb test derived 14C incorporation in biological systems
auteur
Samuel Bernard, Jonas Frisén, Kirsty Spalding
article
Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms, Elsevier, 2010, 268 (7-8), pp.1295-1298. ⟨10.1016/j.nimb.2009.10.156⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00544517/file/bernardNIMB.pdf BibTex
titre
Asymptotic behavior and stability switch for a mature-immature model of cell differentiation
auteur
Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Catherine Marquet
article
Nonlinear Analysis: Real World Applications, Elsevier, 2010, 11 (4), pp.2913-2929. ⟨10.1016/j.nonrwa.2009.11.001⟩
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BibTex
titre
A multi-scale model of erythropoiesis
auteur
Ivan Demin, Fabien Crauste, Olivier Gandrillon, Vitaly Volpert
article
Journal of Biological Dynamics, Taylor & Francis Open, 2010, 4 (1), pp.59-70. ⟨10.1080/17513750902777642⟩
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BibTex
titre
Tumor growth rate determines the timing of optimal chronomodulated treatment schedules
auteur
Samuel Bernard, Branka Cajavec Bernard, Francis Lévi, Hanspeter Herzel
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2010, 6 (3), pp.e1000712. ⟨10.1371/journal.pcbi.1000712⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00470302/file/bernard2010PLoSComputBiol.pdf BibTex
titre
Stability and Hopf bifurcation for a cell population model with state-dependent delay
auteur
Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Hassan Hbid, Redouane Qesmi
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2010, 70 (5), pp.1611-1633. ⟨10.1137/080742713⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00542655/file/AdimyCrausteHbidQesmiSIAP2010.pdf BibTex

Book sections

titre
Stability and Hopf bifurcation for a first-order linear delay differential equation with distributed delay
auteur
Fabien Crauste
article
Complex Time Delay Systems (Ed. F. Atay), Springer, pp.320, 2010, ⟨10.1007/978-3-642-02329-3_8⟩
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Molecular distributions in gene regulatory dynamics
auteur
Michael C. Mackey, Marta Tyran-Kamińska, Romain Yvinec
article
2010
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00651585/file/MCMMTRY_10_MolecularDistributions.pdf BibTex

2009

Journal articles

titre
Non-Newtonian effects in a fluid-structure interaction model for atherosclerosis
auteur
Nader El Khatib, Stéphane Génieys, Abdelmalek Zine, Vitaly Volpert
article
Journal of Applied Mechanics and Technical Physics, Springer Verlag, 2009, 50 (1), pp.55-64
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titre
Scaling limit of a discrete prion dynamics model
auteur
Marie Doumic, Thierry Goudon, Thomas Lepoutre
article
Communications in Mathematical Sciences, International Press, 2009, 7 (4), ⟨10.4310/CMS.2009.v7.n4.a3⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00403914/file/Scaling_limit_2009_07_05.pdf BibTex
titre
Dynamics of erythroid progenitors and erythroleukemia
auteur
Nikolai Bessonov, Fabien Crauste, Ivan Demin, Vitaly Volpert
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2009, Cancer modelling (Part 2), 4 (3), pp.210-232. ⟨10.1051/mmnp/20094309⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00542660/file/BessonovCrausteDeminVolpertMMNP2009.pdf BibTex
titre
Mathematical model of hematopoiesis dynamics with growth factor-dependent apoptosis and proliferation regulation
auteur
Fabien Crauste, Mostafa Adimy
article
Mathematical and Computer Modelling, Elsevier, 2009, 49, pp.2128-2137. ⟨10.1016/j.mcm.2008.07.014⟩
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2008

Journal articles

titre
Discrete maturity-structured model of cell differentiation with applications to acute myelogenous leukemia
auteur
Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Abderrahim El Abdllaoui
article
Journal of Biological Systems, World Scientific Publishing, 2008, 16 (3), pp.395-424. ⟨10.1142/S0218339008002599⟩
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titre
Numerical integration of a mathematical model of hematopoietic stem cell dynamics
auteur
Mostafa Adimy, Oscar Angulo, Fabien Crauste, Juan Carlos Lopez-Marcos
article
Computer and mathematics with applications, Elsevier, 2008, 56, pp.594-606. ⟨10.1016/j.camwa.2008.01.003⟩
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titre
Modélisation de la dynamique de l'hématopoïèse normale et pathologique
auteur
Mostafa Adimy, Samuel Bernard, Jean Clairambault, Fabien Crauste, Stéphane Génieys, Laurent Pujo-Menjouet
article
Hématologie, John Libbey Eurotext, 2008, 14 (5), pp.339-350. ⟨10.1684/hma.2008.0282⟩
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2006

Journal articles

titre
Asymptotic Behavior of a Discrete Maturity Structured System of Hematopoietic Stem Cells Dynamics with Several Delays
auteur
Mostafa Adimy, Fabien Crauste, Abderrahim El Abdllaoui
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, EDP Sciences, 2006, 1 (2), pp.1-22. ⟨10.1051/mmnp:2008001⟩
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