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COMORE Research team

COMORE team publications

2014

Journal articles

titre
Experimental and theoretical study of the mechanism of formation of astrochemically important C2n+1N− anions via ion/molecule reactions
auteur
Ján Žabka, Ibrahima Ndiaye, Christian Alcaraz, Claire Romanzin, Miroslav Polášek
article
International Journal of Mass Spectrometry, Elsevier, 2014, 367, pp.1-9. ⟨10.1016/j.ijms.2014.04.008⟩
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2012

Journal articles

titre
Predictions of Carbon Fixation during a Bloom of Emiliania huxleyi as a Function of the Regulating Inorganic Species
auteur
Olivier Bernard, Antoine Sciandra, Sophie Rabouille
article
SNE Simulation Notes Europe, ArgeSIM, 2012, 22 (3-4), pp.967 - 981. ⟨10.11128/sne.22.tn.10141⟩
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2010

Journal articles

titre
Modeling continuous cultures of microalgae colimited by nitrogen and phosphorus
auteur
Gaël Bougaran, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2010, 265 (3), pp.443. ⟨10.1016/j.jtbi.2010.04.018⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00608413/file/PEER_stage2_10.1016%252Fj.jtbi.2010.04.018.pdf BibTex
titre
À propos de l’écologie comportementale
auteur
Pierre Bernhard, Joanna Jongwane
article
Interstices, INRIA, 2010
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titre
Deterministic minimax impulse control
auteur
Naïma El Farouq, Guy Barles, Pierre Bernhard
article
Applied Mathematics and Optimization, Springer Verlag (Germany), 2010, 61, pp.353--378. ⟨10.1007/s00245-009-9090-0⟩
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titre
Constrained Hybrid Neural Modelling of Biotechnological Processes
auteur
Asma Karama, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
article
International Journal of Chemical Reactor Engineering, De Gruyter, 2010, 8, pp.A21. ⟨10.2202/1542-6580.2117⟩
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titre
Oscillations induced by different timescales in signal modules regulated by slowly evolving protein-protein interactions
auteur
Ibrahima Ndiaye, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
article
IET Systems Biology, Institution of Engineering and Technology, 2010, 4(4), pp.263-276. ⟨10.1049/iet-syb.2009.0020.⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00847299/file/ndiaye-chaves-gouze-IETsysBio.pdf https://hal.inria.fr/hal-00847299/file/ndiaye-chaves-gouze-IETsysBio-supplementary.pdf BibTex
titre
Comparing Boolean and piecewise affine differential models for genetic networks
auteur
Madalena Chaves, Laurent Tournier, Jean-Luc Gouzé
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2010, 58 (2-3), pp.217-232. ⟨10.1007/s10441-010-9097-6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00847281/file/chaves-tournier-gouze-AB2010.pdf https://hal.inria.fr/hal-00847281/file/chaves-tournier-gouze-AB2010-SI.pdf BibTex
titre
Interval observer-based estimator of specific growth rate in bioreactors
auteur
Francis Mairet, Marcello Moisan, Olivier Bernard
article
Journal Européen des Systèmes Automatisés (JESA), Lavoisier, 2010, 44 (4-5), pp.493-507. ⟨10.3166/jesa.44.493-507⟩
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titre
Influence of Intrapredatory Interferences on Impulsive Biological Control Efficiency
auteur
Sapna Nundloll, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2010, 72 (8), pp.2113-2138. ⟨10.1007/s11538-010-9531-6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00847302/file/nundloll_BMB2010.pdf BibTex
titre
Two models of interfering predators in impulsive biological control
auteur
Sapna Nundloll, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
Journal of Biological Dynamics, Taylor & Francis Open, 2010, 4 (1), pp.102-114. ⟨10.1080/17513750902968779⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00847301/file/Nund_jbd.pdf BibTex
titre
Continuum equilibria and global optimization for routing in dense static ad hoc networks
auteur
Eitan Altman, Pierre Bernhard, Merouane Debbah, Alonso Silva
article
Computer Networks, Elsevier, 2010, 54 (6), pp.1005--1018. ⟨10.1016/j.comnet.2009.10.019⟩
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titre
Dynamical study and robustness for a nonlinear wastewater treatment model
auteur
Mustapha Serhani, Jean-Luc Gouzé, Nadia Raissi
article
Nonlinear Analysis: Real World Applications, Elsevier, 2010, 12, pp.487-500. ⟨10.1016/j.nonrwa.2010.06.034⟩
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titre
Asymptotically Stable Interval Observers for Planar Systems with Complex Poles
auteur
Frédéric Mazenc, Olivier Bernard
article
IEEE Transactions on Automatic Control, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, 55, pp.523-527
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BibTex
titre
Limit cycles in piecewise-affine gene network models with multiple interaction loops
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
International Journal of Systems Science, Taylor & Francis, 2010, 41 (1), pp.119-130. ⟨10.1080/00207720903144552⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00831782/file/RR-6875.pdf BibTex

Conference papers

titre
Time-varying interval observers for linear systems with additive disturbances
auteur
Frédéric Mazenc, Olivier Bernard
article
8th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS 2010), Sep 2010, Bologne, Italy
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titre
Hurdles and challenges to extrapolate microalgal TAG production from lab to field: towards reliable numerical predictions
auteur
Olivier Bernard
article
8th European Workshop on Biotechnology of microalgae, 2010, Nuthetal, Germany
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titre
ESS versus cooperative behavior in a consumer-resource model
auteur
Andrei R. Akhmetzhanov, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Pierre Bernhard
article
Workshop on Game Theory for Finance, Social and Biological Sciences, 2010, Warwick, United Kingdom
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titre
ESS versus cooperative behaviour in a consumer-resource model
auteur
Anderi R. Akhmetzhanov, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Pierre Bernhard
article
Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics, 2010, Bordeaux, France
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BibTex
titre
Modelling neutral lipid productivity in photobioreactors under nitrogen deprivency
auteur
Francis Mairet, Olivier Bernard, Pierre Masci, Thomas Lacour, Antoine Sciandra
article
8th European Workshop on Biotechnology of microalgae, 2010, Nuthetal, Germany
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BibTex
titre
A Continuous size-structured model applied to zooplankton comunity
auteur
Jonathan Rault, Eric Benoît, Pieter Vandromme
article
Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics, 2010, Bordeaux, France
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BibTex
titre
Optimal foraging in Leslie-Gower predator-prey models with alternative food
auteur
Mickaël Teixeira-Alves, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics, 2010, Bordeaux, France
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BibTex
titre
Modelling lipid production in microalgae
auteur
Francis Mairet, Olivier Bernard, Pierre Masci, Thomas Lacour, Antoine Sciandra
article
DYnamics and COntrol of Process Systems - DYCOPS-2010, 2010, Leuven, Belgium
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BibTex
titre
Coupling biological and radiative models to describe microalgal growth in a photobioreactor
auteur
Francis Mairet, Mariana Titica, Olivier Bernard, Jeremy Pruvost
article
11th IFAC Symposium on Computer Applications in Biotechnology - CAB, 2010, Leuven, Belgium. pp.168-173, ⟨10.3182/20100707-3-BE-2012.0007⟩
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titre
Microalgal biomass surface productivity optimization based on a photobioreactor model
auteur
Pierre Masci, Frédéric Grognard, Olivier Bernard
article
11th IFAC Symposium on Computer Applications in Biotechnology - CAB, 2010, Leuven, Belgium. pp.180-185, ⟨10.3182/20100707-3-BE-2012.0014⟩
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titre
Cell cycle modelling for microalgae grown under light/dark cycles
auteur
Christophe Mocquet, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
article
11th IFAC Symposium on Computer Applications in Biotechnology - CAB, 2010, Leuven, Belgium. pp.174-179, ⟨10.3182/20100707-3-BE-2012.0072⟩
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titre
Unicité et stabilité globale de l'équilibre de modèles métaboliques réversibles
auteur
Ibrahima Ndiaye, Jean-Luc Gouzé
article
Conférence Internationale Francophone d'Automatique CIFA 2010, 2010, Nancy, France
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titre
Join forces or cheat: evolutionary analysis of a consumer-resource system
auteur
Andrei Akhmetzhanov, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Pierre Bernhard
article
14th International Symposium on Dynamic Games and Applications, 2010, Banff, Alberta, Canada
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titre
ESS for life history of cooperating consumers facing cheating mutants
auteur
Pierre Bernhard, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Andrei Akhmetzhanov
article
14th International Symposium on Dynamic Games and Applications, 2010, Banff, Alberta, Canada
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titre
Qualitative control of genetic networks: the bistable switch example
auteur
Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
article
8th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS 2010), 2010, Bologna, Italy. pp.338-343, ⟨10.3182/20100901-3-IT-2016.00166⟩
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titre
Hurdles and challenges for modelling and control of microalgae for CO2 mitigation and biofuel production
auteur
Olivier Bernard
article
9th International Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, 2010, Leuven, Belgium
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titre
Option pricing with zero lower bound of impulse cost
auteur
Naïma El Farouq, Pierre Bernhard
article
14th International Symposium on Dynamic Games and Applications, Banff, Canada, 2010, Banff, Alberta, Canada
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BibTex
titre
A Robust Control Approach to Option Pricing: the Uniqueness Theorem
auteur
Pierre Bernhard, Naïma El Farouq
article
EPSRC Symposium Workshop on game theory for finance, social and biological sciences, 2010, Warwick, United Kingdom
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titre
Optimization of a photobioreactor biomass production using natural light
auteur
Frédéric Grognard, Andrei Akhmetzhanov, Pierre Masci, Olivier Bernard
article
49th IEEE Conference on Decision and Control, 2010, Atlanta, GA, United States. pp.4691-4696, ⟨10.1109/CDC.2010.5717185⟩
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BibTex
titre
Qualitative control of periodic solutions in piecewise affine models of genetic networks
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
Proc. IFAC Nonlinear Control Systems Symposium (NOLCOS 10), Bologna, Italy, Sep. 2010., 2010, Bologna, Italy. ⟨10.3182/20100901-3-IT-2016.00145⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00831789/file/control-cycles-nolcos10-revised.pdf BibTex
titre
Transition probabilities for piecewise affine models of genetic networks
auteur
Madalena Chaves, Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
Proc. Int. Symp. Mathematical Theory of Networks and Systems (MTNS 10), Budapest, Hungary, Jul. 2010., 2010, Budapest, Hungary
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https://hal.inria.fr/hal-00831793/file/ChavesFarcotGouze-MTNS10.pdf BibTex
titre
Un cadre théorique pour étudier les interactions plantes-champignons pathogènes foliaires
auteur
Virginie Ravigné, Audrey Andanson, Bénédicte Fabre, Pascal Frey, Elisabeth Fournier, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Didier Tharreau, Fabien Halkett
article
Premier Colloque National d'Ecologie Scientifique, 2010, Montpellier, France
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Book sections

titre
A Study of Non-neutral Networks with Usage-Based Prices
auteur
Eitan Altman, Pierre Bernhard, Stéphane Caron, George Kesidis, Julio Rojas-Mora, Sulan Wong
article
Stiller, Burkhard and Hossfeld, Tobias and Stamoulis, George D. Incentives, Overlays, and Economic Traffic Control, 6236, Springer, pp.76-84, 2010, Lecture Notes in Computer Sciences, ⟨10.1007/978-3-642-15485-0_8⟩
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BibTex
titre
Piecewise affine models of regulatory genetic networks: review and probabilistic interpretation
auteur
Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
article
Lévine, Jean and Müllhaupt, Philippe. Advances in the Theory of Control, Signals and Systems, with Physical Modelling, 407, Springer, pp.241-253, 2010, Lecture Notes in Control and Information Sciences, ⟨10.1007/978-3-642-16135-3_20⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00847287/file/GouzeChaves-LNCIS2010.pdf BibTex

Master thesis

titre
Etude d'un modèle de croissance tumorale
auteur
Raphaël Madeleine
article
Sciences de l'ingénieur [physics]. 2010
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BibTex
titre
Modélisation de la propagation de ravageurs dans des milieux fragmentés
auteur
Elodie Girard
article
Sciences de l'ingénieur [physics]. 2010
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BibTex
titre
Analyse mathématique et numérique de réseaux de régulation génétique
auteur
Mohammed Machat
article
Sciences de l'ingénieur [physics]. 2010
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BibTex
titre
Development of a model of photoadaption to predict CO2 flow and the accumulation of biolipides in fluctuating environment
auteur
Lorenzo Baldacchini
article
Engineering Sciences [physics]. 2010
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BibTex
titre
Evolution of a population of cancer cells in a tissue
auteur
Federica Spiriti
article
Sciences de l'ingénieur [physics]. 2010
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BibTex
titre
Mise au point d'un procédé de sélection des microalgues en vue d'optimiser des souches oléagineuses dans le cadre du projet Shamash
auteur
Nacer Bouhireb
article
Sciences de l'ingénieur [physics]. 2010
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BibTex
titre
Méthanisation de biomasse algale : le projet Symbiose
auteur
Aline Dannappe
article
Sciences de l'ingénieur [physics]. 2010
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BibTex
titre
Etude d'un modèle de croissance tumorale
auteur
Gaëlle Drouot, Cédric Adam
article
Sciences de l'ingénieur [physics]. 2010
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BibTex
titre
Modélisation de la propagation d'une mutation lors de l'expansion spatiale d'une population
auteur
Aurore Lebrun
article
Sciences de l'ingénieur [physics]. 2010
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BibTex

Other publications

titre
Optimization of a photobioreactor biomass production using natural light
auteur
Frédéric Grognard, Andrei Akhmetzhanov, Masci Pierre, Olivier Bernard
article
2010
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00516705/file/RR-7378.pdf BibTex

Reports

titre
Global Gene Regulation in Metabolic Networks
auteur
Diego Oyarzun, Madalena Chaves
article
[Research Report] RR-7468, INRIA. 2010, pp.15
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https://hal.inria.fr/inria-00541112/file/rr-7468.pdf BibTex
titre
A theoretical exploration of birhythmicity in the p53-Mdm2 network
auteur
Wassim Abou-Jaoude, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-7406, INRIA. 2010
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https://hal.inria.fr/inria-00523270/file/RR-7406.pdf BibTex
titre
Exact control of genetic networks in a qualitative framework: the bistable switch example
auteur
Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-7359, INRIA. 2010, pp.22
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00507040/file/RR-7359.pdf BibTex
titre
Join forces or cheat: evolutionary analysis of a consumer-resource system
auteur
Andrei Akhmetzhanov, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Pierre Bernhard
article
[Research Report] RR-7312, INRIA. 2010
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https://hal.inria.fr/inria-00491434/file/RR-7312.pdf BibTex
titre
ESS for life-history traits of cooperating consumers facing cheating mutants
auteur
Pierre Bernhard, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Andrei Akhmetzhanov
article
[Research Report] RR-7314, INRIA. 2010
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00491489/file/RR-7314.pdf BibTex
titre
A study of non-neutral networks
auteur
Eitan Altman, Pierre Bernhard, George Kesidis, Julio Rojas-Mora, Sulan Wong
article
[Research Report] 2010
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https://hal.inria.fr/inria-00481702/file/Net_Neutrality_ResearchReport.pdf BibTex

Theses

titre
Control and optimization of ecosystems in bioreactors for bioenergy production
auteur
Pierre Masci
article
Automatic. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00850420/file/These_Masci-Pierre.pdf BibTex
titre
Influence du statut azoté et du cycle lumineux diurne sur le métabolisme lipidique d'Isochrysis sp. (Haptophyceae)
auteur
Thomas Lacour
article
Environnement et Société. Aix-Marseille Université, 2010. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00852596/file/THESE_2010_LACOUR_THOMAS_1_.pdf BibTex
titre
Dos and Don'ts in Augmentative Biological Control: Insights from Mathematical Modelling
auteur
Sapna Nundloll
article
Automatic. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00850358/file/NUNDLOLL2010_Manuscript_tel.pdf BibTex
titre
Méthodes d'analyse de modèles de régulation cellulaire
auteur
Ibrahima Ndiaye
article
Mathématiques [math]. Université Nice Sophia Antipolis, 2010. Français
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00459987/file/these_version_finale.pdf BibTex

2009

Journal articles

titre
Global stability and optimisation of a general impulsive biological control model
auteur
Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2009, 221 (2), pp.91-100. ⟨10.1016/j.mbs.2009.07.002⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01090139/file/MaiGro09.pdf BibTex
titre
Uncovering operational interactions in genetic networks using asynchronous Boolean dynamics
auteur
L. Tournier, M. Chavesa
article
Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2009, 260 (2), pp.196. ⟨10.1016/j.jtbi.2009.06.006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00554625/file/PEER_stage2_10.1016%252Fj.jtbi.2009.06.006.pdf BibTex
titre
A simplified design for strict Lyapunov functions under Matrosov conditions
auteur
Frédéric Mazenc, Michael Malisoff, Olivier Bernard
article
IEEE Transactions on Automatic Control, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009, 54 (1), pp.177-183. ⟨10.1109/tac.2008.2008353⟩
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BibTex
titre
Periodic Solutions of Piecewise Affine Gene Network Models with Non Uniform Decay Rates: The Case of a Negative Feedback Loop
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2009, 57 (4), pp.429-455. ⟨10.1007/s10441-009-9086-9⟩
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BibTex

Conference papers

titre
Driving competition in a complex ecosystem: application to anaerobic digestion
auteur
Pierre Masci, Olivier Bernard, Frédéric Grognard, Eric Latrille, Jean-Baptiste Sorba, Jean-Philippe Steyer
article
European Control Conference, Aug 2009, Budapest, Hungary
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https://hal.inria.fr/hal-01091826/file/masci_ECC2009.pdf BibTex
titre
Competition between foraging predators and hiding preys as a nonzero-sum differential game
auteur
Andrei Akhmetzhanov, Pierre Bernhard, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
article
International Conference on Game Theory for Networks (GameNets 2009), May 2009, Istanbul, Turkey. pp.357 - 365, ⟨10.1109/GAMENETS.2009.5137421⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01091827/file/gamenets2009.pdf BibTex
titre
Interval Observers for Linear Systems with Delay
auteur
Frederic Mazenc, Silviu-Iulian Niculescu, Olivier Bernard
article
Joint 48th IEEE Conference on Decision and Control (CDC) / 28th Chinese Control Conference (CCC), Dec 2009, Shanghai, China. ⟨10.1109/CDC.2009.5399818⟩
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BibTex

Patents

titre
Bioréacteur et procédé pour la production de biogaz
auteur
Olivier Bernard, Jonathan Hess, Jean-Philippe Steyer, Eric Latrille
article
France, N° de brevet: FR 2925040 (A1) FR 2925040 (B1) EP 2231849 (A2) WO 2009101297 (A2). 2009, pp.1-34
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BibTex

Reports

titre
Comparison between Boolean and piecewise affine differential models for genetic networks
auteur
Madalena Chaves, Laurent Tournier, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-7070, INRIA. 2009, pp.23
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00426414/file/RR-7070.pdf BibTex
titre
Limit cycles in piecewise-affine gene network models with multiple interaction loops
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-6875, INRIA. 2009
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00367186/file/RR-6875.pdf BibTex

Theses

titre
Interférence entre les processus mitotiques et la prise d'azote chez Thalassiosira weissflogii. Implications en modélisation et sur les flux globaux.
auteur
Christophe Mocquet
article
Océan, Atmosphère. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2009. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00472581/file/MOCQUET_2010_these.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Qualitative control of periodic solutions in piecewise affine systems; application to genetic networks
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
2009
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https://hal.inria.fr/inria-00437928/file/RR-7130.pdf BibTex

2008

Journal articles

titre
Projet Shamash : production de biocarburants lipidiques par des microalgues
auteur
Olivier Bernard, Christian Blonz, Bernard Hidoine
article
Interstices, INRIA, 2008
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BibTex
titre
The Effect of Partial Crop Harvest on Biological Pest Control
auteur
Sapna Nundloll, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
Rocky Mountain Journal of Mathematics, Rocky Mountain Mathematics Consortium, 2008, 38 (5), pp.1633-1661. ⟨10.1216/RMJ-2008-38-5-1633⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01090316/file/RMJM.pdf BibTex
titre
Modélisation : Des micro-algues numériques par Olivier Bernard et Antoine Sciandra. Entre complexité des modèles et fiabilité, entretien avec James Orr, propos recueillis par Dominique Chouchan.
auteur
Olivier Bernard, Antoine Sciandra, James Orr
article
Les Cahiers de l'INRIA - La Recherche, INRIA, 2008, L' eau
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https://hal.inria.fr/inria-00546786/file/inria-n421-juil-aout08.pdf BibTex
titre
Estimation of a Reduced Model of the BSM1 Activated Sludge Wastewater Treatment Plant
auteur
O. Barrou, A. Karama, E.K. Lakhal, Olivier Bernard, M.-N. Pons, J.P. Corriou
article
International Journal of Chemical Reactor Engineering, De Gruyter, 2008, 6, pp.Article A63
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BibTex
titre
Generic analysis of the response of calcifying microalgae to an elevation of pCO2 : qualitative vs quantitative analysis
auteur
Olivier Bernard, Antoine Sciandre
article
Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2008, 9, pp.57-84
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https://hal.inria.fr/hal-01277921/file/arima00905.pdf BibTex
titre
Two simple growth models in the chemostat
auteur
Jean-Luc Gouzé, Valérie Lemesle
article
Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2008, 9, pp.145-155
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01277831/file/arima00909.pdf BibTex
titre
A mathematical framework for the control of piecewise-affine models of gene networks
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
Automatica, Elsevier, 2008, 44 (9), pp.2326-2332. ⟨10.1016/j.automatica.2007.12.019⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00831803/file/cntrl-pwaff-revis.pdf BibTex

Conference papers

titre
Continuous Selection of the Fastest Growing Species in the Chemostat
auteur
Pierre Masci, Olivier Bernard, Frédéric Grognard
article
17th IFAC World Congress, Jul 2008, Seoul, South Korea. pp.9707-9712, ⟨10.3182/20080706-5-KR-1001.01642⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01091821/file/masci_ifac.pdf BibTex
titre
Global Stability in a General Impulsive Biological Control Model with Harvest
auteur
Sapna Nundloll, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
17th IFAC World Congress, Jul 2008, Seoul, South Korea. pp.15517-15522, ⟨10.3182/20080706-5-KR-1001.02624⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01091822/file/nundloll_ifac.pdf BibTex
titre
Lyapunov functions and robustness analysis under Matrosov conditions with an application to biological systems
auteur
Frédéric Mazenc, Michael Malisoff, Olivier Bernard
article
American Control Conference 2008 : ACC 2008, Jun 2008, Seattle, United States. pp.2933 - 2938
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BibTex

Reports

titre
Global stability and optimisation of a general impulsive biological control model
auteur
Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
[Research Report] RR-6637, INRIA. 2008, pp.28
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https://hal.inria.fr/inria-00320578/file/RR-6637.pdf BibTex
titre
Uncovering operational interactions in genetic networks using asynchronous boolean dynamics
auteur
Laurent Tournier, Madalena Chaves
article
[Research Report] RR-6703, INRIA. 2008
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https://hal.inria.fr/inria-00325914/file/RR-6703.pdf BibTex

2007

Journal articles

titre
Les jeux dynamiques, du combat aérien à l’écologie comportementale
auteur
Pierre Bernhard
article
Interstices, INRIA, 2007
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BibTex
titre
Polytopic Lyapunov functions for persistence analysis of competing species
auteur
Alain Rapaport, Frédéric Grognard, Frédéric Mazenc
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, American Institute of Mathematical Sciences, 2007, 8 (1), pp.73-93. ⟨10.3934/dcdsb.2007.8.73⟩
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https://hal.inria.fr/inria-00000873/file/polytopicdef.pdf BibTex

Conference papers

titre
Piecewise Constant Feedback Control of Piecewise Affine Gene Network Models
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
Hybrid Systems: Computation and Control, HSCC 2007, 2007, Pisa, Italy. pp.688-692
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00831825/file/xxx_hscc2007.pdf BibTex

Book sections

titre
Piecewise-Linear Models of Genetic Regulatory Networks: Theory and Example
auteur
Frédéric Grognard, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
article
Isabelle Queinnec, Sophie Tarbouriech, Germain Garcia, Silviu-Iulian Niculescu. Biology and Control Theory: Current Challenges, 357, Springer, pp.137 - 159, 2007, Lecture Notes in Control and Information Sciences, ⟨10.1007/978-3-540-71988-5_7⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01091662/file/toulouse_springer.pdf BibTex

Reports

titre
Qualitative stability patterns for Lotka-Volterra systems on rectangles
auteur
Laurent Tournier, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-6346, INRIA. 2007, pp.16
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00186247/file/RR-6346.pdf BibTex
titre
The Effects of Partial Crop Harvest on Biological Pest Control
auteur
Sapna Nundloll, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
[Research Report] RR-6284, INRIA. 2007, pp.27
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00171093/file/RR-6284.pdf BibTex
titre
Hierarchical analysis of piecewise affine models of gene regulatory networks
auteur
Laurent Tournier, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-6189, INRIA. 2007, pp.22
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https://hal.inria.fr/inria-00145357/file/RR-6189.pdf BibTex

Theses

titre
Modélisation de la qualité du biogaz produit par un fermenteur méthanogène et stratégie de régulation en vue de sa valorisation
auteur
Jonathan Hess
article
Automatique / Robotique. Université Nice Sophia Antipolis, 2007. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00257347/file/These_JHess.pdf BibTex

2006

Journal articles

titre
Equilibria and stability analysis of a branched metabolic network with feedback inhibition
auteur
Frédéric Grognard, Yacine Chitour, Georges Bastin
article
Networks and Heterogeneous Media, AIMS-American Institute of Mathematical Sciences, 2006, 1 (1), pp.219-239. ⟨10.3934/nhm.2006.1.219⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01090325/file/nancy.pdf BibTex
titre
Stability analysis of a wastewater treatment plant with saturated control
auteur
Frédéric Grognard, Olivier Bernard
article
Water Science and Technology, IWA Publishing, 2006, 53 (1), pp.149-157. ⟨10.2166/wst.2006.017⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01090322/file/WST05grognard.pdf BibTex
titre
Geometric properties of a class of piecewise affine biological network models
auteur
Etienne Farcot
article
Journal of Mathematical Biology, Springer Verlag (Germany), 2006, 52 (3), pp.373-418. ⟨10.1007/s00285-005-0360-4⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00830063/file/DOIs00285-005-0360-4.pdf BibTex

Conference papers

titre
Etude d'un petit réseau métabolico-génétique par des techniques de systèmes monotones
auteur
Ibrahima Ndiaye, Jean-Luc Gouzé, Frédéric Grognard
article
Réseaux d'interactions : analyse, modélisation et simulation - RIAMS, Nov 2006, Lyon, France
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BibTex
titre
Symbolic numeric analysis of attractors in randomly generated piecewise affine models of gene networks
auteur
Etienne Farcot
article
International Conference on Symbolic and Algebraic Computation, 2006, Genoa, Italy. pp.79-86, ⟨10.1145/1145768.1145787⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00830070/file/fp068-farcot.pdf BibTex

Book sections

titre
STATE ESTIMATION FOR WASTEWATER TREATMENT PROCESSES
auteur
Olivier Bernard, Benoit Chachuat, Jean-Philippe Steyer
article
Philippe Quevauviller. Wastewater Quality Monitoring and Wastewater Quality Monitoring and Treatment, 6 (6), John Wiley & Sons Ltd, 2006, Wastewater Monitoring; Water Quality Measurements, 10: 0-471-49929-3
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00122496/file/Bernard_Chachuat_Steyer_060103.pdf BibTex
titre
Optimal Release Policy for Prophylactic Biological Control
auteur
Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
Christian Commault, Nicolas Marchand. Positive Systems: Proceedings of the second Multidisciplinary International Symposium on Positive Systems: Theory and Applications (POSTA 06), 341, Springe, 2006, ⟨10.1007/3-540-34774-7_12⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01091661/file/mailleret_grognard.pdf BibTex

Reports

titre
Periodic solutions of piecewise affine gene network models: the case of a negative feedback loop
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-6018, INRIA. 2006, pp.22
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https://hal.inria.fr/inria-00112195/file/RR-6018.pdf BibTex
titre
How to control a biological switch: a mathematical framework for the control of piecewise affine models of gene networks
auteur
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-5979, INRIA. 2006, pp.22
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00094853/file/RR-5979.pdf BibTex
titre
Feedback stabilization for a chemostat with delayed output
auteur
Gonzalo Robledo
article
[Research Report] RR-5844, INRIA. 2006, pp.30
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070182/file/RR-5844.pdf BibTex
titre
Optimal release policy for prophylactic biological control
auteur
Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
article
[Research Report] RR-5849, INRIA. 2006, pp.11
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070177/file/RR-5849.pdf BibTex
titre
Feedback control for competition models with different removal rates in the chemostat
auteur
Jean-Luc Gouzé, Gonzalo Robledo
article
[Research Report] RR-5555, INRIA. 2006, pp.26
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070451/file/RR-5555.pdf BibTex
titre
Global Stabilization of a Class of Partially Known Positive Systems
auteur
Jean-Luc Gouzé, Olivier Bernard, Ludovic Mailleret
article
[Research Report] RR-5952, INRIA. 2006, pp.24
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https://hal.inria.fr/inria-00086788/file/RR-5952.pdf BibTex

Theses

titre
Control of the chemostat: Some Results
auteur
Gonzalo Robledo
article
Mathematics [math]. Université Nice Sophia Antipolis, 2006. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00069800/file/tesis2.pdf BibTex

2005

Journal articles

titre
Probabilistic Observers for a Class of Uncertain Biological Processes
auteur
Benoit Chachuat, Olivier Bernard
article
International Journal of Robust and Nonlinear Control, Wiley, 2005, 16, pp.157-171
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https://hal.inria.fr/inria-00122551/file/ChachuatBernard_IJNRC.pdf BibTex
titre
On the estimation of the pseudo-stoichiometric matrix for macroscopic mass balance modelling of biotechnological processes
auteur
Olivier Bernard, Georges Bastin
article
Mathematical Biosciences, Elsevier, 2005, 193, pp.51-77
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00122545/file/BernardBastinMBS6448.pdf BibTex
titre
Identification of reaction networks for bioprocesses: determination of a partially unknown pseudo-stoichiometric matrix
auteur
Olivier Bernard, Georges Bastin
article
Bioprocess and biosystems engineering., Springer, 2005, 27, pp.293-302
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00122549/file/Bernard_Bastin_BBE2.pdf BibTex
titre
Can we assess the model complexity for a bioprocess ? Theory and example of the anaerobic digestion process
auteur
Olivier Bernard, Benoit Chachuat, Arnaud Hélias, Jorge Rodriguez
article
Water Science and Technology, IWA Publishing, 2005, 53, pp.85-92
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https://hal.inria.fr/inria-00122500/file/Bernard_et_al_WST06.pdf BibTex

Conference papers

titre
Polytopic Lyapunov functions for the stability analysis of persistence of competing species
auteur
Frédéric Grognard, Frédéric Mazenc, Alain Rapaport
article
44. IEEE Conference on Decision and Control and European Control Conference, Dec 2005, Seville, Spain. pp.3699-3704
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BibTex
titre
Positive control of Lotka-Volterra systems
auteur
Frédéric Grognard, Jean-Luc Gouzé
article
16th IFAC World Congress, Jul 2005, Prague, Czech Republic. ⟨10.3182/20050703-6-CZ-1902.00724⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01091732/file/lotkahal.pdf BibTex

Book sections

titre
Virtual constraints for the orbital stabilization of the Pendubot
auteur
Frédéric Grognard, Carlos Canudas de Wit
article
A. Alstolfi. Nonlinear and adaptive control: theory and applications for the users., IC Press, pp.115-145, 2005
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BibTex

2004

Journal articles

titre
A mechanistic modelling and data assimilation approach to estimate the carbon/chlorophyll and carbon/nitrogen ratios in a coupled hydrodynamical-biological model
auteur
Blaise Faugeras, Olivier Bernard, Antoine Sciandra, Marina Lévy
article
Nonlinear Processes in Geophysics, European Geosciences Union (EGU), 2004, 11 (4), pp.515-533. ⟨10.5194/npg-11-515-2004 ⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00331073/file/npg-11-515-2004.pdf BibTex
titre
Design of orbitally stable zero dynamics for a class of nonlinear systems
auteur
Frédéric Grognard, Carlos Canudas de Wit
article
Systems and Control Letters, Elsevier, 2004, 51 (2), pp.89-103. ⟨10.1016/S0167-6911(03)00209-3⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01091542/file/scl02def.pdf BibTex

Conference papers

titre
Stability analysis of a wastewater treatment plant with saturated control
auteur
Frédéric Grognard, Olivier Bernard
article
6th International Symposium on Systems Analysis and Integration Assessment (WATERMATEX 2004), Nov 2004, Beijing, China
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01091729/file/beijing.pdf BibTex
titre
Equilibria and stability analysis of a branched metabolic network with feedback inhibition
auteur
Frédéric Grognard, Yacine Chitour, Georges Bastin
article
9th International Symposium on Computer Applications in Biotechnology, Mar 2004, Nancy, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01091728/file/nancy.pdf BibTex
titre
Explicit formula for a general integral of motion for a class of mechanical systems subject to holonomic constraint
auteur
J.-W. Perram, Anton Shiriaev, Carlos Canudas de Wit, Frédéric Grognard
article
2nd IFAC Workshop on Lagrangian and Hamiltonian Methods for Nonlinear Control, Mar 2004, Sevilla, Spain. pp.99-104
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https://hal.inria.fr/hal-01091637/file/Full_integrals_IFAC_Sevilla04.pdf BibTex

Book sections

titre
Introduction : le réseau Plasmas froids et la Mission des Ressources et Compétences Technologiques du CNRS
auteur
Gérard Lelièvre, Françoise Massines, Elodie Girard
article
Massines, Françoise. Plasmas froids. Génération, caractérisation et technologies, ⟨PUSE-MRCT-CNRS⟩, pp.11-16, 2004, Intégrations [des savoirs et savoir-faire], 2862723398
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BibTex

Reports

titre
Robust control for an uncertain chemostat model
auteur
Jean-Luc Gouzé, Gonzalo Robledo
article
RR-5295, INRIA. 2004, pp.16
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070705/file/RR-5295.pdf BibTex
titre
Stratégie optimale d'un problème dans le cadre de la lutte biologique
auteur
M. Jerry, Jean-Luc Gouzé
article
RR-5253, INRIA. 2004, pp.25
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070745/file/RR-5253.pdf BibTex
titre
Piecewise-linear Models of Genetic Regulatory Networks: Equilibria and their Stability
auteur
Richard Casey, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
article
[Research Report] RR-5353, INRIA. 2004
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071250/file/RR-5353.pdf BibTex

Theses

titre
Stabilisation Globale de Systèmes Dynamiques Positifs Mal Connus. Applications en Biologie
auteur
Ludovic Mailleret
article
Ecologie, Environnement. Université Nice Sophia Antipolis, 2004. Français
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00006700/file/tel-000067001.pdf BibTex
titre
Modélisation structurée de la croissance cellulaire en chemostat: analyse et estimation
auteur
Valérie Lemesle
article
Mathématiques [math]. Université Nice Sophia Antipolis, 2004. Français
Accès au texte intégral et bibtex
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00006502/file/tel-00006502.pdf BibTex

2003

Conference papers

titre
Computation of time-optimal switchings for linear systems with complex poles
auteur
Frédéric Grognard, Rodolphe Sepulchre
article
European Control Conference (ECC03), Sep 2003, Cambridge, United Kingdom
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01091712/file/articleECC3.pdf BibTex

Book sections

titre
Stability Analysis of a Metabolic Model with Sequential Feedback Inhibition
auteur
Yacine Chitour, Frédéric Grognard, Georges Bastin
article
Luca Benvenuti, Alberto De Santis, Lorenzo Farina. Positive Systems: Proceedings of the First Multidisciplinary International Symposium on Positive Systems: Theory and Applications (POSTA 2003), 294, Springer Berlin Heidelberg, pp.143-150, 2003, ⟨10.1007/978-3-540-44928-7_20⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01091656/file/chitour.pdf BibTex

Reports

titre
Feedback control for nonmonotone competition models in the chemostat
auteur
Gonzalo Robledo, Jean-Luc Gouzé
article
RR-5033, INRIA. 2003
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071551/file/RR-5033.pdf BibTex
titre
On the estimation of the pseudo-stoichiometric matrix for mass balance modeling of biotechnological processes
auteur
Olivier Bernard, Georges Bastin
article
RR-4977, INRIA. 2003
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071601/file/RR-4977.pdf BibTex
titre
Experiment Selection for the Discrimination of Semi-Quantitative Models of Dynamical Systems
auteur
Ivayla Vatcheva, Olivier Bernard, Hidde de Jong, Nicolaas Mars
article
RR-4940, INRIA. 2003
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071639/file/RR-4940.pdf BibTex
titre
Closed loop observers bundle for uncertain biotechnological models
auteur
Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
article
RR-4905, INRIA. 2003
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071676/file/RR-4905.pdf BibTex
titre
Estimation des paramètres de modèles pour la digestion anaérobie
auteur
Ricardo Martinez
article
[Rapport de recherche] RT-0284, INRIA. 2003, pp.44
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00069894/file/RT-0284.pdf BibTex

2002

Conference papers

titre
Design of orbitally stable zero dynamics for a class of nonlinear systems
auteur
Frédéric Grognard, Carlos Canudas de Wit
article
41st IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2002, Las Vegas, United States. ⟨10.1109/CDC.2002.1184875⟩
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BibTex
titre
QUALITATIVE BEHAVIOUR OF A PHYTOPLANKTON GROWTH MODEL IN A PHOTOBIOREACTOR
auteur
Lionel Pawlowski, Olivier Bernard, Emilie Lefloc'H, Antoine Sciandra
article
15th IFAC World Congress, Jul 2002, Barcelone, Spain. pp.437 - 442, ⟨10.3182/20020721-6-ES-1901.01382⟩
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BibTex

Reports

titre
Averaging in Hamiltonian systems with slowly varying parameters
auteur
Tewfik Sari
article
RR-4374, INRIA. 2002
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072214/file/RR-4374.pdf BibTex
titre
Qualitative Simulation of Genetic Regulatory Networks Using Piecewise-Linear Models
auteur
Hidde De Jong, Jean-Luc Gouzé, Céline Hernandez, Tewfik Sari, Michel Page, Johannes Geiselmann
article
[Research Report] RR-4407, INRIA. 2002
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072181/file/RR-4407.pdf BibTex

2001

Journal articles

titre
A non-linear software sensor to monitor the internal nitrogen quota of phytoplanktonic cells
auteur
Olivier Bernard, Antoine Sciandra, Gauthier Sallet
article
Oceanologica Acta, Elsevier, 2001, 24 (5), pp.435 - 442. ⟨10.1016/S0399-1784(01)01155-0⟩
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BibTex

Reports

titre
A Class of Piecewise Linear Differential Equations Arising in Biological Models
auteur
Jean-Luc Gouzé, Tewfik Sari
article
RR-4207, INRIA. 2001
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https://hal.inria.fr/inria-00072415/file/RR-4207.pdf BibTex

2000

Reports

titre
The peaking Phenomenon and Singular Perturbations : An Extension of Tikhonov's Theorem
auteur
Claude Lobry, Tewfik Sari
article
RR-4051, INRIA. 2000
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072586/file/RR-4051.pdf BibTex
titre
Practical and Polytopic Observers for Nonlinear Uncertain Systems
auteur
Alain Rapaport, Jean-Luc Gouzé
article
RR-4079, INRIA. 2000
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072554/file/RR-4079.pdf BibTex
titre
A Discrete, Size-Structured Model of Phytoplankton Growth in The Chemostat
auteur
Julien Arino, Jean-Luc Gouzé, Antoine Sciandra
article
[Research Report] RR-3963, INRIA. 2000, pp.23
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072684/file/RR-3963.pdf BibTex

1998

Reports

titre
Global Qualitative Behavior of a Class of Nonlinear Biological Systems; Application to the Qualitative Validation of Phytoplankton Growth Models
auteur
Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
article
RR-3334, INRIA. 1998
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00073355/file/RR-3334.pdf BibTex