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ARAMIS Research team

ARAMIS team publications

2019

Journal articles

titre
Interpretable and reliable artificial intelligence systems for brain diseases
auteur
Olivier Colliot
article
ERCIM News, ERCIM, 2019, 118
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https://hal.inria.fr/hal-02178901/file/ERCIM_postprint.pdf BibTex
titre
How many patients are eligible for disease-modifying treatment in Alzheimer’s disease? A French national observational study over 5 years
auteur
Stéphane Epelbaum, Claire Paquet, Jacques Hugon, Julien Dumurgier, David Wallon, Didier Hannequin, Thérèse Jonveaux, Annick Besozzi, Stéphane Pouponneau, Caroline Hommet, Frédéric Blanc, Laetitia Berly, Adrien Julian, Marc Paccalin, Florence Pasquier, Julie Bellet, Claire Boutoleau-Bretonnière, Thiphaine Charriau, Olivier Rouaud, Olivier Madec, Aurélie Mouton, Renaud David, Samir Bekadar, Roxane Fabre, Emmanuelle Liegey, Walter Deberdt, Philippe Robert, Bruno Dubois
article
BMJ Open, BMJ Publishing Group, 2019, 9 (6), pp.e029663. ⟨10.1136/bmjopen-2019-029663⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02165245/file/Epelbaum%20et%20al%202019%20How%20many%20patients%20are%20eligible%20for%20disease-modifying%20treatment%20in%20Alzheimer%E2%80%99s%20disease%20BMJOpen.pdf BibTex
titre
EEG evidence of compensatory mechanisms in preclinical Alzheimer’s disease
auteur
Sinead Gaubert, Federico Raimondo, Marion Houot, Marie-Constance Corsi, Jacobo Diego Sitt, Bertrand Hermann, Delphine Oudiette, Geoffroy Gagliardi, Marie-Odile Habert, Bruno Dubois, Fabrizio de Vico Fallani, Hovagim Bakardjian, Stéphane Epelbaum
article
Brain - A Journal of Neurology , Oxford University Press (OUP), 2019, ⟨10.1093/brain/awz150⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02164586/file/Preprint%20V2.pdf BibTex
titre
Presymptomatic spinal cord pathology in c9orf72 mutation carriers: a longitudinal neuroimaging study
auteur
Giorgia Querin, Peter Bede, Mohamed Mounir El Mendili, Menghan Li, Mélanie Pélégrini-Issac, Daisy Rinaldi, Martin Catala, Dario Saracino, François Salachas, Agnès Camuzat, Veronique Marchand-Pauvert, Julien Cohen-Adad, Olivier Colliot, Isabelle Le Ber, Pierre-François Pradat
article
Annals of Neurology, Wiley, 2019, 86 (2), pp.158-167. ⟨10.1002/ana.25520⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02265301/file/querin19_AnnNeurol_postprint.pdf BibTex
titre
Neurite density is reduced in the presymptomatic phase of C9orf72 disease
auteur
Junhao Wen, Hui Zhang, Daniel Alexander, Stanley Durrleman, Alexandre Routier, Daisy Rinaldi, Marion Houot, Philippe Couratier, Didier Hannequin, Florence Pasquier, Jiaying Zhang, Olivier Colliot, Isabelle Le Ber, Anne Bertrand
article
Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry, BMJ Publishing Group, 2019, J Neurol Neurosurg Psychiatry, 90 (4), pp.387-94. ⟨10.1136/jnnp-2018-318994⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01907482/file/WEN_NODDI-R1_manuscript_2018_10_27_postprint.pdf BibTex
titre
Tribute to Anne Bertrand (1978–2018): Neuroradiologist, scientist, teacher and friend
auteur
Didier Dormont, Noam Ben-Eliezer, Ninon Burgos, Olivier Colliot, Fabrizio de Vico Fallani, Marc Dhenain, Stanley Durrleman, Stéphane Epelbaum, Marie-Odile Habert, Isabelle Le Ber, Jean-François Méder, Yves Menu, Catherine Oppenheim, Youssef Wadghiri
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, Elsevier Masson, 2019, 46 (2), pp.155-159. ⟨10.1016/j.neurad.2019.01.001⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02265305/file/hommage_Anne_postprint.pdf BibTex
titre
Spatiotemporal analysis for detection of pre-symptomatic shape changes in neurodegenerative diseases: Initial application to the GENFI cohort
auteur
Claire Cury, Stanley Durrleman, David Cash, Marco Lorenzi, Jennifer Nicholas, Martina Bocchetta, John van Swieten, Barbara Borroni, Daniela Galimberti, Mario Masellis, Maria Carmela Tartaglia, James Rowe, Caroline Graff, Fabrizio Tagliavini, Giovanni Frisoni, Robert Laforce, Elizabeth Finger, Alexandre de Mendonça, Sandro Sorbi, Sébastien Ourselin, Jonathan Rohrer, Marc Modat, Christin Andersson, Silvana Archetti, Andrea Arighi, Luisa Benussi, Sandra Black, Maura Cosseddu, Marie Fallstrm, Carlos Ferreira, Chiara Fenoglio, Nick Fox, Morris Freedman, Giorgio Fumagalli, Stefano Gazzina, Robert Ghidoni, Marina Grisoli, Vesna Jelic, Lize Jiskoot, Ron Keren, Gemma Lombardi, Carolina Maruta, Lieke Meeter, Rick van Minkelen, Benedetta Nacmias, Linn Ijerstedt, Alessandro Padovani, Jessica Panman, Michela Pievani, Cristina Polito, Enrico Premi, Sara Prioni, Rosa Rademakers, Veronica Redaelli, Ekaterina Rogaeva, Giacomina Rossi, Martin Rossor, Elio Scarpini, David Tang-Wai, Hakan Thonberg, Pietro Tiraboschi, Ana Verdelho, Jason Warren
article
NeuroImage, Elsevier, 2019, 188, pp.282-290. ⟨10.1016/j.neuroimage.2018.11.063⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01958916/file/Spatio_temporal_analysis_GENFI_lastSub_black.pdf BibTex
titre
Fluid-attenuated inversion recovery MRI synthesis from multisequence MRI using three-dimensional fully convolutional networks for multiple sclerosis
auteur
Wen Wei, Emilie Poirion, Benedetta Bodini, Stanley Durrleman, Olivier Colliot, Bruno Stankoff, Nicholas Ayache
article
Journal of Medical Imaging, SPIE Digital Library, 2019, 6 (01), ⟨10.1117/1.JMI.6.1.014005⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02042526/file/article.pdf BibTex
titre
Relations between C9orf72 expansion size in blood, age at onset, age at collection and transmission across generations in patients and presymptomatic carriers
auteur
Clémence Fournier, Mathieu Barbier, Agnès Camuzat, Vincent Anquetil, Serena Lattante, Fabienne Clot, Cécile Cazeneuve, Mario Sabatelli, Sylvie Forlani, Ludmila Jornea, Eric Leguern, Alexis Brice, Sophie Auriacombe, Serge Belliard, Frédéric Blanc, Claire Bouteleau-Bretonnière, Mathieu Ceccaldi, Mira Didic, Charles Duyckaerts, Frédérique Etcharry-Bouix, Véronique Golfier, Lucette Lacomblez, Bernard-François Michel, Catherine Thomas-Antérion, Jérémie Pariente, François Sellal, Martine Vercelletto, Eve Benchetrit, Hugo Bertin, Anne Bertrand, Anne Bissery, Stéphanie Bombois, Marie-Paule Boncoeur, Pascaline Cassagnaud, Mathieu Chastan, Yaohua Chen, Marie Chupin, Olivier Colliot, Philippe Couratier, Xavier Delbeucq, Vincent Deramecourt, Christine Delmaire, Emmanuel Gérardin, Claude Hossein-Foucher, Bruno Dubois, Marie Habert, Didier Hannequin, Géraldine Lautrette, Thibaud Lebouvier, Isabelle Le Ber, Stéphane Lehéricy, Benjamin Le Toullec, Richard Lévy, Martine Martineau, Anne Mackowiak, Jacques Monteil, Florence Pasquier, Grégory Petyt, François Pradat, Assi-Hervé Oya, Daisy Rinaldi, Adeline Rollin-Sillaire, François Salachas, Sabrina Sayah, David Wallon
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2019, 74, pp.234.e1-234.e8. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2018.09.010⟩
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BibTex
titre
Reduction of recruitment costs in preclinical AD trials. Validation of automatic pre-screening algorithm for brain amyloidosis
auteur
Manon Ansart, Stéphane Epelbaum, Geoffroy Gagliardi, Olivier Colliot, Didier Dormont, Bruno Dubois, Harald Hampel, Stanley Durrleman
article
Statistical Methods in Medical Research, SAGE Publications, 2019, pp.096228021882303. ⟨10.1177/0962280218823036⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01964942/file/SMM_Hal%20%283%29.pdf BibTex
titre
Disrupted core-periphery structure of multimodal brain networks in Alzheimer’s disease
auteur
Jérémy Guillon, Mario Chavez, Federico Battiston, Yohan Attal, Valentina Corte, Michel Thiebaut de Schotten, Bruno Dubois, Denis Schwartz, Olivier Colliot, Fabrizio de Vico Fallani
article
Network Neuroscience, MIT Press, 2019, 3 (2), pp.635-652. ⟨10.1162/netn_a_00087⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02265308/file/guillon2019_published_open_access.pdf BibTex
titre
Predicting PET-derived Demyelination from Multimodal MRI using Sketcher-Refiner Adversarial Training for Multiple Sclerosis
auteur
Wen Wei, Emilie Poirion, Benedetta Bodini, Stanley Durrleman, Nicholas Ayache, Bruno Stankoff, Olivier Colliot
article
Medical Image Analysis, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.media.2019.101546⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02276634/file/medima-hal_version.pdf BibTex
titre
Activity-induced MEMRI cannot detect functional brain anomalies in the APPxPS1-Ki mouse model of Alzheimer’s disease
auteur
Alexandre Androuin, Yah-Se Abada, Myriam Ly, Mathieu Santin, Alexandra Petiet, Stephane Epelbaum, Anne Bertrand, Benoît Delatour
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9, pp.1140. ⟨10.1038/s41598-018-37980-y⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02017552/file/s41598-018-37980-y.pdf BibTex
titre
Quality Assessment of Single-Channel EEG for Wearable Devices
auteur
Fanny Grosselin, Xavier Navarro-Sune, Alessia Vozzi, Katerina Pandremmenou, Fabrizio de Vico Fallani, Yohan Attal, Mario Chavez
article
Sensors, MDPI, 2019, 19 (3), pp.601. ⟨10.3390/s19030601⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02017731/file/sensors-19-00601-v3.pdf BibTex
titre
Multi-omics signature of brain amyloid deposition in asymptomatic individuals at-risk for Alzheimer's disease: The INSIGHT-preAD study
auteur
Laura Xicota, Farid Ichou, François-Xavier Lejeune, Benoit Colsch, Arthur Tenenhaus, Inka Leroy, Gaelle Fontaine, Marie Lhomme, Hugo Bertin, Marie-Odile Habert, Stéphane Epelbaum, Bruno Dubois, Fanny Mochel, Marie-Claude Potier
article
EBioMedicine, Elsevier, 2019, 47, pp.518-528. ⟨10.1016/j.ebiom.2019.08.051⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02305609/file/1-s2.0-S2352396419305730-main.pdf BibTex

Conference papers

titre
Looking for cortical patterns of successful motor imagery-based BCI learning
auteur
Marie-Constance Corsi, M Chavez, D. Schwartz, N George, L. Hugueville, A. Kahn, S. Dupont, D. Bassett, Fabrizio de Vico Fallani
article
8th Graz Brain-Computer Interface Conference 2019, Sep 2019, Graz, Austria
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02123582/file/GBCIC2019_PaperSubmission_CORSI.pdf BibTex
titre
Prediction of future cognitive scores and dementia onset in Mild Cognitive Impairment patients
auteur
Manon Ansart, Ninon Burgos, Olivier Colliot, Didier Dormont, Stanley Durrleman
article
OHBM 2019 - Organization for Human Brain Mapping Conference, Jun 2019, Rome, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02098427/file/Ansart_et_al_2019.pdf BibTex
titre
Hierarchical modeling of Alzheimer's disease progression from a large longitudinal MRI data set
auteur
Alexandre Bône, Benoît Martin, Maxime Louis, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Roma, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02090275/file/OHBM_2019.pdf BibTex
titre
Predicting progression to Alzheimer’s disease from clinical and imaging data: a reproducible study
auteur
Jorge Samper-Gonzalez, Ninon Burgos, Simona Bottani, Marie-Odile Habert, Theodoros Evgeniou, Stephane Epelbaum, Olivier Colliot
article
OHBM 2019 - Organization for Human Brain Mapping Annual Meeting 2019, Jun 2019, Rome, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02142315/file/OHBM%20Jorge%20.pdf BibTex
titre
Deciphering the progression of PET alterations using surface-based spatiotemporal modeling
auteur
Igor Koval, Arnaud Marcoux, Ninon Burgos, Stéphanie Allassonnière, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
OHBM 2019 - Annual meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02134909/file/HAL_abstract_OHBM_2019_pdf.pdf BibTex
titre
New advances in the Clinica software platform for clinical neuroimaging studies
auteur
Alexandre Routier, Arnaud Marcoux, Mauricio Diaz Melo, Jérémy Guillon, Jorge Samper-Gonzlez, Junhao Wen, Simona Bottani, Alexis Guyot, Elina Thibeau--Sutre​, Marc Teichmann, Marie-Odile Habert, Stanley Durrleman, Ninon Burgos, Olivier Colliot
article
OHBM 2019 - Annual Meeting on Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Roma, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02132147/file/OHBM2019_Clinica%20%281%29.pdf BibTex
titre
How serious is data leakage in deep learning studies on Alzheimer's disease classification?
auteur
Junhao Wen​, Elina Thibeau--Sutre​, Jorge Samper-González​, Alexandre Routier, Simona Bottani​, Didier Dormont​, Stanley Durrleman, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
2019 OHBM Annual meeting - Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02105133/file/OHBM2019%20DL_data_leakage.pdf BibTex
titre
Looking for neurophysiological correlates of brain-computer interface learning
auteur
Marie-Constance Corsi, Mario Chavez, Denis Schwartz, Nathalie George, Laurent Hugueville, Ari Kahn, Sophie Dupont, Danielle Bassett, Fabrizio de Vico Fallani
article
OHBM 2019 - Annual Meeting on Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02157179/file/OHBM_Abstract_CORSI.pdf BibTex
titre
Beware of feature selection bias! Example on Alzheimer's disease classification from diffusion MRI
auteur
Junhao Wen​, Jorge Samper-González​, Alexandre Routier, Simona Bottani​, Stanley Durrleman​, Ninon Burgos, Olivier Colliot
article
2019 OHBM Annual Meeting - Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy
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https://hal.inria.fr/hal-02105134/file/OHBM2019-Feature%20Slection%20Bias.pdf BibTex
titre
Learning low-dimensional representations of shape data sets with diffeomorphic autoencoders
auteur
Alexandre Bône, Maxime Louis, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
IPMI 2019 : Information Processing in Medical Imaging, Jun 2019, Hong-Kong, China
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https://hal.inria.fr/hal-01963736/file/IPMI_2019.pdf BibTex
titre
Target controllability in genetic networks of macrophage activation
auteur
Giulia Bassignana, Jennifer Fransson, Olivier Colliot, Violetta Zujovic, Fabrizio de Vico Fallani
article
Netsci 2019, May 2019, Burlington, United States
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BibTex
titre
Learning disease progression models with longitudinal data and missing values
auteur
Raphael Couronne, Marie Vidailhet, Jean-Christophe Corvol, Stéphane Lehéricy, Stanley Durrleman
article
ISBI 2019 - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02091571/file/learning_disease_progression_missing_values.pdf BibTex
titre
Motor abnormalities progression in prodromal PD
auteur
Raphael Couronne, Marie Vidailhet, Graziella Mangone, Stéphane Lehéricy, Stanley Durrleman
article
AD/PD 2019 - 14th International Conference on Alzheimer's and Parkinson's Diseases and related neurological disorders, Mar 2019, Lisbon, Portugal
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BibTex
titre
Reproducible evaluation of methods for predicting progression to Alzheimer's disease from clinical and neuroimaging data
auteur
Jorge Samper-Gonzalez, Ninon Burgos, Simona Bottani, Marie-Odile Habert, Theodoros Evgeniou, Stephane Epelbaum, Olivier Colliot
article
SPIE Medical Imaging 2019, Feb 2019, San Diego, United States
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https://hal.inria.fr/hal-02025880/file/2019_Samper_SPIE_FullPaper%281%29.pdf BibTex

Poster communications

titre
Predicting Impulse Control Disorders in Parkinson's Disease: A Challenging Task
auteur
Johann Faouzi, Samir Bekadar, Olivier Colliot, Jean-Christophe Corvol
article
International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders, Sep 2019, Nice, France
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https://hal.inria.fr/hal-02315533/file/MDS19%20-%20Poster%20Johann%20%28final%20version%29.pdf BibTex
titre
Conciliation of process description and molecular interaction networks using logical properties of ontology
auteur
Vincent Henry, Giulia Bassignana, Violetta Zujovic, Fabrizio de Vico Fallani, Olivier Dameron, Ivan Moszer, Olivier Colliot
article
Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Jul 2019, Nantes, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02301702/file/JOBIM2019_paper_166.pdf BibTex
titre
On the genetic bases of incomplete hippocampal inversion: a genome-wide association study
auteur
Claire Cury, Marzia A Scelzi, Roberto Toro, Vincent Frouin, Eric Artiges, Andreas Heinz, Henrik Walter, Hervé Lemaître, Jean-Luc Martinot, Jean-Baptiste Poline, Michael N. Smolka, Gunter Schumann, Andre Altmann, Olivier Colliot
article
OHBM 2019 - Annual Meeting on Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-02074616/file/cury-claire-empenn-poster2.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Auto-encoding meshes of any topology with the current-splatting and exponentiation layers
auteur
Alexandre Bône, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
2019
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https://hal.inria.fr/hal-02087586/file/GMDL.pdf BibTex
titre
Learning the spatiotemporal variability in longitudinal shape data sets
auteur
Alexandre Bône, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
2019
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https://hal.inria.fr/hal-02091549/file/IJCV.pdf BibTex
titre
Clinica: an open source software platform for reproducible clinical neuroscience studies
auteur
Alexandre Routier, Ninon Burgos, Jérémy Guillon, Jorge Samper-González, Junhao Wen, Simona Bottani, Arnaud Marcoux, Michael Bacci, Sabrina Fontanella, Thomas Jacquemont, Adam Wild, Pietro Gori, Alexis Guyot, Pascal Lu, Mauricio Díaz, Elina Thibeau--Sutre, Tristan Moreau, Marc Teichmann, Marie-Odile Habert, Stanley Durrleman, Olivier Colliot
article
2019
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https://hal.inria.fr/hal-02308126/file/Routier_Clinica_PrePrint.pdf BibTex
titre
Learning the clustering of longitudinal shape data sets into a mixture of independent or branching trajectories
auteur
Vianney Debavelaere, Stanley Durrleman, Stéphanie Allassonnière
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02283747/file/IJCV_VD.pdf BibTex
titre
Clustering of longitudinal shape data sets using mixture of separate or branching trajectories
auteur
Vianney Debavelaere, Alexandre Bône, Stanley Durrleman, Stéphanie Allassonnière
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02103355/file/Clustering_longitudinal.pdf BibTex
titre
Longitudinal autoencoder for multi-modal disease progression modelling
auteur
Raphael Couronne, Maxime Louis, Stanley Durrleman
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02090886/file/longitudinal_multimodal_autoencoder.pdf BibTex
titre
Riemannian geometry learning for disease progression modelling
auteur
Maxime Louis, Raphael Couronne, Igor Koval, Benjamin Charlier, Stanley Durrleman
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02079820/file/IPMI2019_camera_ready%281%29.pdf BibTex
titre
Simulation of virtual cohorts increases predictive accuracy of cognitive decline in MCI subjects
auteur
Igor Koval, Stéphanie Allassonnière, Stanley Durrleman
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02089881/file/miccai.pdf BibTex
titre
Statistical shape analysis of large datasets based on diffeomorphic iterative centroids
auteur
Claire Cury, Joan Alexis Glaunès, Roberto Toro, Marie Chupin, Gunter Schumann, Vincent Frouin, Jean Baptiste Poline, Olivier Colliot
article
2019
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https://hal.inria.fr/hal-01832191/file/363861.full.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
An Automated Pipeline for the Analysis of PET Data on the Cortical Surface
auteur
Arnaud Marcoux, Ninon Burgos, Anne Bertrand, Marc Teichmann, Alexandre Routier, Junhao Wen, Jorge Samper-Gonzalez, Simona Bottani, Stanley Durrleman, Marie-Odile Habert, Olivier Colliot
article
Frontiers in Neuroinformatics, Frontiers, 2018, 12, ⟨10.3389/fninf.2018.00094⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01950933/file/Marcoux_Colliot_An_automated_pipeline_for_the_analysis_of_PET_data_on_the_cortical_surface.pdf BibTex
titre
Multi-modal brain fingerprinting: a manifold approximation based framework
auteur
Kuldeep Kumar, Laurent Chauvin, Matthew Toews, Olivier Colliot, Christian Desrosiers
article
NeuroImage, Elsevier, 2018, 183, pp.212 - 226. ⟨10.1016/j.neuroimage.2018.08.006⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01910367/file/Manuscript_MultiModal_Brain_Fingerprint_updated.pdf BibTex
titre
Reproducible evaluation of classification methods in Alzheimer's disease: Framework and application to MRI and PET data
auteur
Jorge Samper-Gonzalez, Ninon Burgos, Simona Bottani, Sabrina Fontanella, Pascal Lu, Arnaud Marcoux, Alexandre Routier, Jérémy Guillon, Michael Bacci, Junhao Wen, Anne Bertrand, Hugo Bertin, Marie-Odile Habert, Stanley Durrleman, Theodoros Evgeniou, Olivier Colliot
article
NeuroImage, Elsevier, 2018, 183, pp.504-521. ⟨10.1016/j.neuroimage.2018.08.042⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01858384/file/AD_ML_manuscript_postprint.pdf BibTex
titre
Role of inter-hemispheric connections in functional brain networks
auteur
J. Martinez, J. Buldú, D. Papo, Fabrizio de Vico Fallani, M. Chavez
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8 (1), pp.10246. ⟨10.1038/s41598-018-28467-x⟩
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BibTex
titre
Statistical Shape Analysis of Large Datasets Based on Diffeomorphic Iterative Centroids
auteur
Claire Cury, Joan Glaunès, Roberto Toro, Marie Chupin, Gunter Schumann, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Olivier Colliot
article
Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2018, 12, pp.803. ⟨10.3389/fnins.2018.00803⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01920263/file/fnins-12-00803.pdf BibTex
titre
Specificities of arterial spin labeling (ASL) abnormalities in acute seizure
auteur
Mathieu Schertz, Mathieu Benzakoun, Nadya Pyatigorskaya, Samia Belkacem, Melika Sahli-Amor, Vincent Navarro, Clément Cholet, Delphine Leclercq, Didier Dormont, Bruno Law-Ye
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, Elsevier Masson, 2018, ⟨10.1016/j.neurad.2018.11.003⟩
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BibTex
titre
Critical brain regions related to post-stroke aphasia severity identified by early diffusion imaging are not the same when predicting short- and long-term outcome
auteur
Chiara Zavanone, Yves Samson, Celine Arbizu, Sophie Dupont, Didier Dormont, Charlotte Rosso
article
Brain and Language, Elsevier, 2018, 186, pp.1-7. ⟨10.1016/j.bandl.2018.08.005⟩
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BibTex
titre
Structural, Microstructural, and Metabolic Alterations in Primary Progressive Aphasia Variants
auteur
Alexandre Routier, Marie-Odile Habert, Anne Bertrand, Aurélie Kas, Martina Sundqvist, Justine Mertz, Pierre-Maxime David, Hugo Bertin, Serge Belliard, Florence Pasquier, Karim Bennys, Olivier Martinaud, Frédérique Etcharry-Bouyx, Olivier Moreaud, Olivier Godefroy, Jérémie Pariente, Michèle Puel, Philippe Couratier, Claire Boutoleau-Bretonnière, Bernard Laurent, Raphaëlla Migliaccio, Bruno Dubois, Olivier Colliot, Marc Teichmann
article
Frontiers in Neurology, Frontiers, 2018, 9, ⟨10.3389/fneur.2018.00766⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01897015/file/2018_Routier_fneur-09-00766.pdf BibTex
titre
Multiplex core–periphery organization of the human connectome
auteur
Federico Battiston, Jérémy Guillon, Mario Chavez, Vito Latora, Fabrizio de Vico Fallani
article
Journal of the Royal Society Interface, the Royal Society, 2018, 15 (146), ⟨10.1098/rsif.2018.0514⟩
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BibTex
titre
Reduced acquisition time PET pharmacokinetic modelling using simultaneous ASL–MRI: proof of concept
auteur
Catherine Scott, Jieqing Jiao, Andrew Melbourne, Ninon Burgos, David Cash, Enrico de Vita, Pawel Markiewicz, Antoinette O'Connor, David Thomas, Philip Sj Weston, Jonathan Schott, Brian Hutton, Sébastien Ourselin
article
Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism, Nature Publishing Group, 2018, ⟨10.1177/0271678X18797343⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01871983/file/Scott_Reduced.pdf BibTex
titre
Malignant transformation of epidermoid cyst with diffuse leptomeningeal carcinomatosis on skull base and trigeminal perineural spread
auteur
Neesmah Badat, Clément Cholet, Genevièvet Hervé, Nadya Pyatigorskaya, Stéphanie Trunet, Didier Dormont, Bruno Law-Ye
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, Elsevier Masson, 2018, 45 (5), pp.337-340. ⟨10.1016/j.neurad.2018.07.002⟩
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BibTex
titre
Double diffeomorphism: combining morphometry and structural connectivity analysis
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Kacem, Yulia Worbe, Alexandre Routier, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 37 (9), pp.2033-2043. ⟨10.1109/TMI.2018.2813062⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01709847/file/Double_Diffeo_paper_Review2_Clean%20modified.pdf BibTex
titre
Comparative study of algorithms for synthetic CT generation from MRI: Consequences for MRI-guided radiation planning in the pelvic region
auteur
Hossein Arabi, Jason Dowling, Ninon Burgos, Xiao Han, Peter Greer, Nikolaos Koutsouvelis, Habib Zaidi
article
Medical Physics, American Association of Physicists in Medicine, 2018, ⟨10.1002/mp.13187⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01890646/file/Arabi_2018_MedPhys.pdf BibTex
titre
MR angiography of reversible cerebral vasoconstriction syndrome
auteur
Bruno Law-Ye, Didier Dormont, C. Cholet
article
Diagnostic and Interventional Imaging, Elsevier, 2018, 99 (9), pp.525-526. ⟨10.1016/j.diii.2018.07.001⟩
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BibTex
titre
Multimorbidity Is Associated with Preclinical Alzheimer’s Disease Neuroimaging Biomarkers
auteur
Aline Mendes, Sophie Tézenas Du Montcel, Marcel Levy, Anne Bertrand, Marie-Odile Habert, Hugo Bertin, Bruno Dubois, Stéphane Epelbaum
article
Dementia and Geriatric Cognitive Disorders, Karger, 2018, 45 (5-6), pp.272-281. ⟨10.1159/000489007⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01958870/file/Multimorbidity%20submitted.pdf BibTex
titre
Some new proposals for the classification of inherited myopathies
auteur
Alexandre Routier, Marie-Odile Habert, Anne Bertrand, Aurélie Kas, Martina Sundqvist, Justine Mertz, Pierre-Maxime David, Hugo Bertin, Serge Belliard, Florence Pasquier, Karim Bennys, Martina Martinaud, Frédérique Etcharry-Bouyx, Olivier Moreaud, Olivier Godefroy, Jérémie Pariente, Michèle Puel, Claire Boutoleau-Bretonnière, Bernard Laurent, Raphaëlla Migliaccio, Bruno Dubois, Marc Teichmann, Olivier Colliot, Stéphane Mathis, Meriem Tazir, Guilhem Sole, Laurent Magy, Gwendal Le Masson, Philippe Couratier, Karima Ghorab, Fanny Duval, Idoia Lacoste, Cyril Goizet, Jean-Michel Vallat
article
Journal of the Neurological Sciences, Elsevier, 2018, 391, pp.118-119
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BibTex
titre
Green Compressive Sampling Reconstruction in IoT Networks
auteur
Stefania Colonnese, Mauro Biagi, Tiziana Cattai, Roberto Cusani, Fabrizio de Vico Fallani, Gaetano Scarano
article
Sensors, MDPI, 2018, 18 (8), pp.2735. ⟨10.3390/s18082735⟩
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titre
COGEVIS: A New Scale to Evaluate Cognition in Patients with Visual Deficiency
auteur
Claire Meyniel, Dalila Samri, Farah Stefano, Joel Crevoisier, Florence Bonté, Raffaella Migliaccio, Laure Delaby, Anne Bertrand, Marie Odile Habert, Bruno Dubois, Bahram Bodaghi, Stéphane Epelbaum
article
Behavioural Neurology, IOS Press, 2018, 2018, pp.1-7. ⟨10.1155/2018/4295184⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01958688/file/EPELBAUM_St%C3%A9phane1.pdf BibTex
titre
Revolution of Alzheimer Precision Neurology. Passageway of Systems Biology and Neurophysiology
auteur
Harald Hampel, Nicola Toschi, Claudio Babiloni, Filippo Baldacci, Keith Black, Arun Bokde, René Bun, Francesco Cacciola, Enrica Cavedo, Patrizia Chiesa, Olivier Colliot, Cristina-Maria Coman, Bruno Dubois, Andrea Duggento, Stanley Durrleman, Maria-Teresa Ferretti, Nathalie George, Rémy Genthon, Marie-Odile Habert, Karl Herholz, Yosef Koronyo, Maya Koronyo-Hamaoui, Foudil Lamari, Todd Langevin, Stéphane Lehéricy, Jean Lorenceau, Christian Néri, Robert Nisticò, Francis Nyasse, Craig Ritchie, Simone Rossi, Emiliano Santarnecchi, Olaf Sporns, Steven Verdooner, Andrea Vergallo, Nicolas Villain, Erfan Younesi, Francesco Garaci, Simone Lista, Arun L.W. Bokde
article
Journal of Alzheimer's Disease, IOS Press, 2018, 64 (s1), pp.S47 - S105. ⟨10.3233/jad-179932⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01910402/file/nihms958679.pdf BibTex
titre
Spatiotemporal Propagation of the Cortical Atrophy: Population and Individual Patterns
auteur
Igor Koval, Jean-Baptiste Schiratti, Alexandre Routier, Michael Bacci, Olivier Colliot, Stéphanie Allassonnière, Stanley Durrleman
article
Frontiers in Neurology, Frontiers, 2018, 9, pp.235. ⟨10.3389/fneur.2018.00235⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01910400/file/koval_frontiers_publishedOpenAccess.pdf BibTex
titre
Integrating EEG and MEG Signals to Improve Motor Imagery Classification in Brain–Computer Interface
auteur
Marie-Constance Corsi, Mario Chavez, Denis Schwartz, Laurent Hugueville, Ankit Khambhati, Danielle Bassett, Fabrizio de Vico Fallani
article
International Journal of Neural Systems, World Scientific Publishing, 2018, ⟨10.1142/S0129065718500144⟩
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https://arxiv.org/pdf/1711.07258v2 BibTex
titre
Cognitive and neuroimaging features and brain β-amyloidosis in individuals at risk of Alzheimer's disease (INSIGHT-preAD): a longitudinal observational study
auteur
Bruno Dubois, Stéphane Epelbaum, Francis Nyasse, Hovagim Bakardjian, Geoffroy Gagliardi, Olga Uspenskaya, Marion Houot, Simone Lista, Federica Cacciamani, Marie-Claude Potier, Anne Bertrand, Foudil Lamari, Habib Benali, Jean-François Mangin, Olivier Colliot, Rémy Genthon, Marie-Odile Habert, Harald Hampel
article
Lancet Neurology, Elsevier, 2018, 17 (4), pp.335 - 346. ⟨10.1016/S1474-4422(18)30029-2⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01777834/file/INSIGHT-preAD%20%20B.DUBOIS.pdf BibTex
titre
Progressive white-matter demyelination in delayed CO poisoning encephalopathy
auteur
Bruno Law-Ye, Pauline Dodet, Bertrand Hermann, Stephanie Trunet, Didier Dormont, Nadya Pyatigorskaya, Delphine Leclercq
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, Elsevier Masson, 2018, 45 (1), pp.59-62. ⟨10.1016/j.neurad.2017.09.008⟩
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BibTex
titre
Early cognitive, structural and microstructural changes in c9orf72 presymptomatic carriers before 40 years of age
auteur
Anne Bertrand, Junhao Wen, Daisy Rinaldi, Marion Houot, Sabrina Sayah, Agnès Camuzat, Clémence Fournier, Sabrina Fontanella, Alexandre Routier, Philippe Couratier, Florence Pasquier, Marie-Odile Habert, Didier Hannequin, Olivier Martinaud, Paola Caroppo, Richard Levy, Bruno Dubois, Alexis Brice, Stanley Durrleman, Olivier Colliot, Isabelle Le Ber, Prevdemals Study
article
JAMA neurology, American Medical Association (imprimé) / 2018, 75 (2), pp.236-245. ⟨10.1001/jamaneurol.2017.4266⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01654000/file/2017-10-19%20Bertrand.pdf BibTex
titre
The endocranial shape of Australopithecus africanus : surface analysis of the endocasts of Sts 5 and Sts 60
auteur
Amélie Beaudet, Jean Dumoncel, Frikkie de Beer, Stanley Durrleman, Emmanuel Gilissen, Anna Oettlé, Gérard Subsol, John Francis Thackeray, José Braga
article
Journal of Anatomy, Wiley, 2018, 232 (2), pp.296-303. ⟨10.1111/joa.12745⟩
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BibTex
titre
The structure of the mental lexicon: what primary progressive aphasias reveal
auteur
Clara Sanches, Alexandre Routier, Olivier Colliot, Marc Teichmann
article
Neuropsychologia, Elsevier, 2018, 109, pp.107-115. ⟨10.1016/j.neuropsychologia.2017.12.018⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01672932/file/sanches17_lexicon_neuropsychologia_postprint.pdf BibTex
titre
A clinical and neurophysiological motor signature of Unverricht–Lundborg disease
auteur
E. Hainque, A. Blancher, V. Mesnage, S. Rivaud-Pechoux, A. Bertrand, S. Dupont, V. Navarro, E. Roze, I. Gourfinkel-An, E. Apartis
article
Revue Neurologique, Elsevier Masson, 2018, ⟨10.1016/j.neurol.2017.06.005⟩
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BibTex
titre
Increased 18F-FDG Uptake in Lhermitte-Duclos Disease With Cowden Syndrome Revealed by PET-MRI
auteur
Eve Piekarski, Nadya Pyatigorskaya, Didier Dormont, Damien Galanaud, Aurélie Kas
article
Clinical Nuclear Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2018, 43 (10), pp.1. ⟨10.1097/RLU.0000000000002248⟩
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BibTex
titre
Neural correlates of episodic memory in the Memento cohort
auteur
Stéphane Epelbaum, Vincent Bouteloup, Jean Mangin, Valentina La Corte, Raffaela Migliaccio, Hugo Bertin, Marie O. Habert, Clara Fischer, Chabha Azouani, Ludovic Fillon, Marie Chupin, Bruno Vellas, Florence Pasquier, Jean Dartigues, Frédéric Blanc, Audrey Gabelle, Mathieu Ceccaldi, Pierre Krolak-Salmon, Jacques Hugon, Olivier Hanon, Olivier Rouaud, Renaud David, Geneviève Chêne, Bruno Dubois, Carole Dufouil
article
Alzheimer's & Dementia: Translational Research & Clinical Interventions, 2018, 4, pp.224-233. ⟨10.1016/j.trci.2018.03.010⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01958834/file/EPELBAUM_St%C3%A9phane2.pdf BibTex
titre
Geometric and dosimetric evaluations of atlas-based segmentation methods of MR images in the head and neck region
auteur
Jennifer Petra Kieselmann, Cornelis Philippus Kamerling, Ninon Burgos, Martin J. Menten, Clifton David Fuller, Simeon Nill, M. Jorge Cardoso, Uwe Oelfke
article
Physics in Medicine and Biology, IOP Publishing, 2018, 63 (14), ⟨10.1088/1361-6560/aacb65⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01827187/file/Kieselmann_2018_Phys._Med._Biol.pdf BibTex
titre
A Fanning Scheme for the Parallel Transport Along Geodesics on Riemannian Manifolds
auteur
Maxime Louis, Benjamin Charlier, Paul Jusselin, Susovan Pal, Stanley Durrleman
article
SIAM Journal on Numerical Analysis, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2018, 56 (4), pp.2563-2584. ⟨10.1137/17M1130617⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01560787/file/JacobisFan.pdf BibTex

Conference papers

titre
Converting Alzheimer's disease map into a heavyweight ontology: a formal network to integrate data
auteur
Vincent Henry, Ivan Moszer, Olivier Dameron, Marie-Claude Potier, Martin Hofmann-Apitius, Olivier Colliot
article
DILS 2018 - 13th International Conference on Data Integration in the Life Sciences, Nov 2018, Hannover, Germany. pp.1-9
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01917742/file/Henry_et_al_ORCID.pdf BibTex
titre
Deformetrica 4: an open-source software for statistical shape analysis
auteur
Alexandre Bône, Maxime Louis, Benoît Martin, Stanley Durrleman
article
ShapeMI @ MICCAI 2018 - Workshop on Shape in Medical Imaging, Sep 2018, Granada, Spain
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https://hal.inria.fr/hal-01874752/file/ShapeMI2018.pdf BibTex
titre
Learning Myelin Content in Multiple Sclerosis from Multimodal MRI through Adversarial Training
auteur
Wen Wei, Emilie Poirion, Benedetta Bodini, Stanley Durrleman, Nicholas Ayache, Bruno Stankoff, Olivier Colliot
article
MICCAI 2018 – 21st International Conference On Medical Image Computing & Computer Assisted Intervention, Sep 2018, Granada, Spain. ⟨10.1007/978-3-030-00931-1_59⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01810822/file/paper.pdf BibTex
titre
Identification of Driver Nodes in Genetic Networks Regulating Macrophage Activation
auteur
Giulia Bassignana, Jennifer Fransson, O. Colliot, Violetta Zujovic, Fabrizio de Vico Fallani
article
Conference on Complex Systems - CSS, Sep 2018, Thessaloniki, Greece
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01967797/file/CCS2018-Bassignana.pdf BibTex
titre
Integrating EEG and MEG information to enhance motor-imagery classification in brain-computer interface
auteur
Marie-Constance Corsi, Mario Chavez, Denis Schwartz, Laurent Hugueville, Ankit Khambhati, Danielle Bassett, Fabrizio de Vico Fallani
article
BIOMAG 2018 - 21st International Conference on Biomagnetism, Aug 2018, Philadelphia, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01966311/file/BIOMAG_poster.pdf BibTex
titre
Design of a decision support system for predicting the progression of Alzheimer’s disease
auteur
Manon Ansart, Igor Koval, Anne Bertrand, Didier Dormont, Stanley Durrleman
article
Alzheimer's Association International Conference, Jul 2018, Chicago, United States. pp.P433, ⟨10.1016/j.jalz.2018.06.371⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01988912/file/abstract_v4_hal.pdf BibTex
titre
Using diffusion MRI for classification and prediction of Alzheimer's Disease: a reproducible study
auteur
Junhao Wen, Jorge Samper-Gonzalez, Simona Bottani, Alexandre Routier, Ninon Burgos, Thomas Jacquemont, Sabrina Fontanella, Stanley Durrleman, Anne Bertrand, Olivier Colliot
article
AAIC 2018 - Alzheimer's Association International Conference, Jul 2018, Chicago, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01758167/file/Using%20diffusion%20MRI%20for%20classification%20and%20prediction%20of%20Alzheimer%E2%80%99s%20Disease%20a%20reproducible%20study.pdf BibTex
titre
Integrating ontological representation and reasoning into a disease map: application to Alzheimer's disease
auteur
Vincent J. Henry, Ivan Moszer, Olivier Dameron, Marie-Claude Potier, Martin Hofmann-Apitius, Olivier Colliot
article
DMCM 2018 - 3rd Disease Maps Community Meeting, Jun 2018, Paris, France. pp.1-2
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01873474/file/DiseaseMapMeeting_2018_VHenry.pdf BibTex
titre
Learning distributions of shape trajectories from longitudinal datasets: a hierarchical model on a manifold of diffeomorphisms
auteur
Alexandre Bône, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
CVPR 2018 - Computer Vision and Pattern Recognition 2018, Jun 2018, Salt Lake City, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01744538/file/%5BBo%CC%82ne%20et%20al.%202018%5D.pdf BibTex
titre
Comparison of DTI Features for the Classification of Alzheimer's Disease: A Reproducible Study
auteur
Junhao Wen, Jorge Samper-Gonzalez, Simona Bottani, Alexandre Routier, Ninon Burgos, Thomas Jacquemont, Sabrina Fontanella, Stanley Durrleman, Anne Bertrand, Olivier Colliot
article
OHBM 2018 - Organization for Human Brain Mapping Annual Meeting, Jun 2018, Singapour, Singapore
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https://hal.inria.fr/hal-01758206/file/Wen_DTI_Classification.pdf BibTex
titre
NODDI Highlights Promising New Markers In Presymptomatic C9orf72 Carriers
auteur
Junhao Wen, Hui Zhang, Daniel Alexander, Stanley Durrleman, Alexandre Routier, Daisy Rinaldi, Marion Houot, Jiaying Zhang, Olivier Colliot, Isabelle Le Ber, Anne Bertrand
article
OHBM 2018 - Organization for Human Brain Mapping Annual Meeting, Jun 2018, Singapour, Singapore
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https://hal.inria.fr/hal-01758137/file/Highlights%20Promising%20New%20Markers%20In%20Presymptomatic%20C9orf72%20Carriers.pdf BibTex
titre
A pipeline for the analysis of 18F-FDG PET data on the cortical surface and its evaluation on ADNI
auteur
Arnaud Marcoux, Ninon Burgos, Anne Bertrand, Alexandre Routier, Junhao Wen, Jorge Samper-Gonzalez, Simona Bottani, Stanley Durrleman, Marie-Odile Habert, Olivier Colliot
article
Annual meeting of the Organization for Human Brain Mapping - OHBM 2018, Jun 2018, Singapour, Singapore
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01757646/file/HAL_abstract_OHBM.pdf BibTex
titre
Reproducible evaluation of Alzheimer's Disease classification from MRI and PET data
auteur
Jorge Samper-Gonzalez, Simona Bottani, Ninon Burgos, Sabrina Fontanella, Pascal Lu, Arnaud Marcoux, Alexandre Routier, Jérémy Guillon, Michael Bacci, Junhao Wen, Anne Bertrand, Hugo Bertin, Marie-Odile Habert, Stanley Durrleman, Theodoros Evgeniou, Olivier Colliot
article
Annual meeting of the Organization for Human Brain Mapping - OHBM 2018, Jun 2018, Singapour, Singapore
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01761666/file/HAL_OHBM_ADM.pdf BibTex
titre
Clinica: an open source software platform for reproducible clinical neuroscience studies
auteur
Alexandre Routier, Jérémy Guillon, Ninon Burgos, Jorge Samper-Gonzalez, Junhao Wen, Sabrina Fontanella, Simona Bottani, Thomas Jacquemont, Arnaud Marcoux, Pietro Gori, Pascal Lu, Tristan Moreau, Michael Bacci, Stanley Durrleman, Olivier Colliot
article
Annual meeting of the Organization for Human Brain Mapping - OHBM 2018, Jun 2018, Singapore, Singapore
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01760658/file/OHBM2018_Clinica.pdf BibTex
titre
Structural, microstructural and metabolic alterations in Primary Progressive Aphasia variants
auteur
Alexandre Routier, Marie-Odile Habert, Anne Bertrand, Aurélie Kas, Pierre-Maxime David, Hugo Bertin, Olivier Godefroy, Frédérique Etcharry-Bouyx, Olivier Moreaud, Florence Pasquier, Philippe Couratier, Karim Bennys, Claire Boutoleau-Bretonnière, Olivier Martinaud, Bernard Laurent, Jérémie Pariente, Michèle Puel, Serge Belliard, Raphaëlla Migliaccio, Bruno Dubois, Olivier Colliot, Marc Teichmann
article
Annual meeting of the Organization for Human Brain Mapping - OHBM 2018, Jun 2018, Singapore, Singapore
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https://hal.inria.fr/hal-01764289/file/OHBM2018_CAPP.pdf BibTex
titre
FLAIR MR Image Synthesis By Using 3D Fully Convolutional Networks for Multiple Sclerosis
auteur
Wen Wei, Emilie Poirion, Benedetta Bodini, Stanley Durrleman, Olivier Colliot, Bruno Stankoff, Nicholas Ayache
article
ISMRM-ESMRMB 2018 - Joint Annual Meeting, Jun 2018, Paris, France. pp.1-6
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https://hal.inria.fr/hal-01723070/file/ismrm_2018_wen_final.pdf BibTex
titre
Three simple ideas for predicting progression to Alzheimer's disease
auteur
Jorge Samper-Gonzalez, Ninon Burgos, Simona Bottani, Marie-Odile Habert, Theodoros Evgeniou, Stephane Epelbaum, Olivier Colliot
article
8th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2018, Singapour, Singapore
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https://hal.inria.fr/hal-01891996/file/Poster%20PRNI%20Samper%20Gonzalez.pdf BibTex
titre
Identification of driver nodes in genetic networks regulating macrophage activation
auteur
Giulia Bassignana, Jennifer Fransson, Olivier Colliot, Violetta Zujovic, Fabrizio de Vico Fallani
article
International School and Conference on Network Science (Netsci) 2018, Jun 2018, Paris, France
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BibTex
titre
M/EEG integration to enhance motor-imagery-based brain-computer interface performances
auteur
Marie-Constance Corsi, Mario Chavez, Denis Schwartz, Laurent Hugueville, Ankit Khambhati, Danielle Bassett, Fabrizio de Vico Fallani
article
Seventh International BCI Society Meeting, May 2018, Asilomar, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01966314/file/Abstract_BCISociety_HAL.pdf BibTex

Documents associated with scientific events

titre
Temporal metrics for exponential random graph models of time-evolving networks
auteur
Catalina Obando Forero, Fabrizio de Vico Fallani
article
NetSci 2018 - International School and Conference in Complex Science, Jun 2018, Paris, France
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https://hal.inria.fr/hal-01967589/file/Abstract_NETSCI2018.pdf BibTex

Theses

titre
Imagerie cérébrale multimodale pour l'étude des aphasies primaires progressives
auteur
Alexandre Routier
article
Imagerie médicale. Sorbonne Université UPMC, 2018. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01992799/file/ROUTIER_Alexandre_2018-12-03.pdf BibTex
titre
Multilayer approach to brain connectivity in Alzheimer's disease
auteur
Jérémy Guillon
article
Neuroscience. Pierre and Marie Curie University, 2018. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01985286/file/PhD_Thesis_v2.0.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Spatiotemporal analysis for detection of pre-symptomatic shape changes in neurodegenerative diseases: applied to GENFI study
auteur
Claire Cury, Stanley Durrleman, David M. Cash, Marco Lorenzi, Jennifer Nicholas, Martina Bocchetta, John C. van Swieten, Barbara Borroni, Daniela Galimberti, Mario Masellis, Maria Carmela Tartaglia, James Rowe, Caroline Graff, Fabrizio Tagliavini, Giovanni B. Frisoni, Robert Jr. Laforce, Elizabeth Finger, Alexandre de Mendonça, Sandro Sorbi, Sébastien Ourselin, Jonathan D Rohrer, Marc Modat
article
2018
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BibTex
titre
Learning Riemannian geometry for mixed-effect models using deep generative networks.
auteur
Maxime Louis, Benjamin Charlier, Stanley Durrleman
article
2018
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https://hal.inria.fr/hal-01828949/file/nips_2018.pdf BibTex
titre
Simulating Alzheimer's disease progression with personalised digital brain models
auteur
Igor Koval, Alexandre Bône, Maxime Louis, Simona Bottani, Arnaud Marcoux, Jorge Samper-Gonzalez, Ninon Burgos, Benjamin Charlier, Anne Bertrand, Stéphane Epelbaum, Olivier Colliot, Stéphanie Allassonnière, Stanley Durrleman
article
2018
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2017

Journal articles

titre
Cognitive and imaging markers in non-demented subjects attending a memory clinic: study design and baseline findings of the MEMENTO cohort
auteur
Carole Dufouil, Bruno Dubois, Bruno Vellas, Florence Pasquier, Frédéric Blanc, Jacques Hugon, Olivier Hanon, Jean-François Dartigues, Sandrine Harston, Audrey Gabelle, Mathieu Ceccaldi, Olivier Beauchet, Pierre Krolak-Salmon, Renaud David, Olivier Rouaud, Olivier Godefroy, Catherine Belin, Isabelle Rouch, Nicolas Auguste, David Wallon, Athanase Benetos, Jérémie Pariente, Marc Paccalin, Olivier Moreaud, Caroline Hommet, François Sellal, Claire Boutoleau-Bretonnière, Isabelle Jalenques, Armelle Gentric, Pierre Vandel, Chabha Azouani, Ludovic Fillon, Clara Fischer, Helen Savarieau, Grégory Operto, Hugo Bertin, Marie Chupin, Vincent Bouteloup, Marie Habert, Jean-François Mangin, Geneviève Chêne
article
Alzheimer's Research and Therapy, BioMed Central, 2017, 9 (1), ⟨10.1186/s13195-017-0288-0⟩
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BibTex
titre
Association of Prognostic Factors and Immunosuppressive Treatment With Long-term Outcomes in Neurosarcoidosis
auteur
Bastien Joubert, Catherine Chapelon-Abric, Lucie Biard, David Saadoun, Sophie Demeret, Didier Dormont, Matthieu Resche-Rigon, Patrice Cacoub
article
JAMA neurology, American Medical Association (imprimé) / 2017, 74 (11), pp.1336. ⟨10.1001/jamaneurol.2017.2492⟩
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BibTex
titre
Reduced basal forebrain atrophy progression in a randomized Donepezil trial in prodromal Alzheimer's disease
auteur
Enrica Cavedo, Michel J Grothe, Olivier Colliot, Simone Lista, Marie Chupin, Didier Dormont, Marion Houot, Stephane Lehéricy, Stefan Teipel, Bruno Dubois, Harald Hampel
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.11706. ⟨10.1038/s41598-017-09780-3⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01589622/file/cavedo17_SciRep_openaccess.pdf BibTex
titre
Characterization of Skull Base Lesions Using Pseudo-Continuous Arterial Spin Labeling
auteur
N Geerts, N. Leclercq, N Tezenas Du Montcel, N Law-Ye, N Gerber, D. Bernardeschi, Damien Galanaud, Didier Dormont, N. Pyatigorskaya
article
Clinical Neuroradiology, Springer, 2017, ⟨10.1007/s00062-017-0623-7⟩
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BibTex
titre
Loss of brain inter-frequency hubs in Alzheimer's disease.
auteur
J. Guillon, Y. Attal, O. Colliot, V. La Corte, B. Dubois, D. Schwartz, M. Chavez, F de Vico Fallani
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.10879. ⟨10.1038/s41598-017-07846-w⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01578419/file/guillon17_SciRep_openaccess.pdf BibTex
titre
Structural magnetic resonance imaging in frontotemporal lobar dementia
auteur
Anne Bertrand, Sebastian Stroër, Isabelle Le Ber, Marc Teichmann, Didier Dormont
article
Gériatrie et Psychologie Neuropsychiatrie du Vieillissement, John Libbey Eurotext, 2017, 15 (3), ⟨10.1684/pnv.2017.0686⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01583008/file/2017-04-26.pdf BibTex
titre
Capecitabine-induced acute toxic leukoencephalopathy
auteur
M. Obadia, D. Leclercq, J. Wasserman, Damien Galanaud, M. Sahli-Amor, D. Psimaras, N. Pyatigorskaya, B. Law-Ye
article
NeuroToxicology, Elsevier, 2017, 62, pp.1-5. ⟨10.1016/j.neuro.2017.05.001⟩
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BibTex
titre
A New Fire Hazard for MR Imaging Systems: Blankets—Case Report
auteur
Anne Bertrand, Sandrine Brunel, Marie-Odile Habert, Marine Soret, Simone Jaffre, Nicolas Capeau, Laetitia Bourseul, Isabelle Dufour-Claude, Aurélie Kas, Didier Dormont
article
Radiology, Radiological Society of North America, 2017, 000, ⟨10.1148/radiol.2017162921⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01580514/file/2017%20Bertrand%20Radiology.pdf https://hal.inria.fr/hal-01580514/file/MS16-2921R1Edited%20AB.pdf BibTex
titre
Free and Cued Selective Reminding Test – accuracy for the differential diagnosis of Alzheimer's and neurodegenerative diseases: A large-scale biomarker-characterized monocenter cohort study (ClinAD)
auteur
Stéphane Epelbaum, Marc Teichmann, Dalila Samri, Marcel Nogueira, Harald Hampel, Foudil Lamari, Bruno Dubois, Agnès Michon
article
Alzheimer's and Dementia, Elsevier, 2017, 13 (8), pp.913 - 923. ⟨10.1016/j.jalz.2016.12.014⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01672862/file/Teichmann%20et%20al.%202017%20Free%20and%20Cued%20Selective%20Reminding%20Test%20%E2%80%93%20accuracy%20for%20the%20differential%20ALZ%20%26%20DEM.pdf BibTex
titre
Fiberprint: A subject fingerprint based on sparse code pooling for white matter fiber analysis
auteur
Kuldeep Kumar, Christian Desrosiers, Kaleem Siddiqi, Olivier Colliot, Matthew Toews
article
NeuroImage, Elsevier, 2017, 158, pp.242 - 259. ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.06.083⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01562449/file/kumar_fiberprint_NeuroImage2017_postprint.pdf BibTex
titre
Geodesic shape regression with multiple geometries and sparse parameters
auteur
James Fishbaugh, Stanley Durrleman, Marcel Prastawa, Guido Gerig
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 39, pp.1-17
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https://hal.inria.fr/hal-01566280/file/fishbaugh_article_reduced_size.pdf BibTex
titre
Low Cognitive Awareness, but Not Complaint, is a Good Marker of Preclinical Alzheimer's Disease.
auteur
Federica Cacciamani, Caroline Tandetnik, Geoffroy Gagliardi, Hugo Bertin, Marie Habert, Marie Hampel, Laurie Boukadida, Marie Révillon, Stéphane Epelbaum, Bruno Dubois
article
Journal of Alzheimer's disease : JAD, 2017, 59 (2), pp.753-762. ⟨10.3233/JAD-170399⟩
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BibTex
titre
Amyloidosis and neurodegeneration result in distinct structural connectivity patterns in mild cognitive impairment
auteur
Thomas Jacquemont, Fabrizio de Vico Fallani, Anne Bertrand, Stéphane Epelbaum, Alexandre Routier, Bruno Dubois, Harald Hampel, Stanley Durrleman, Olivier Colliot
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2017, ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2017.03.023⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01518785/file/jacquemont17_neurobiolaging_postprint.pdf BibTex
titre
A Precision Medicine Initiative for Alzheimer's disease: the road ahead to biomarker-guided integrative disease modeling.
auteur
Harald Hampel, Sid O’bryant, Stanley Durrleman, Erfan Younesi, Katrine Rojkova, Valentina Escott-Price, Jean-Christophe Corvol, Karl Broich, Bruno Dubois, Simone Lista
article
Climacteric, Taylor & Francis, 2017, 20 (2), pp.107-118
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https://hal.inria.fr/hal-01566281/file/HAMPEL%20et%20al.%20PRECISION%20MED_CLIMACTERIC_08%20Nov_FINAL%20SUBMITTED.pdf BibTex
titre
A statistical model for brain networks inferred from large-scale electrophysiological signals
auteur
Catalina Obando, Fabrizio de Vico Fallani
article
Journal of the Royal Society Interface, the Royal Society, 2017, 14 (128), ⟨10.1098/rsif.2016.0940⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01564939/file/Main.pdf BibTex
titre
A Topological Criterion for Filtering Information in Complex Brain Networks
auteur
Fabrizio de Vico Fallani, Vito Latora, Mario Chavez
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2017, 13 (1), pp.1-18. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005305⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01443254/file/journal.pcbi.1005305.pdf BibTex
titre
A Bayesian Framework for Joint Morphometry of Surface and Curve meshes in Multi-Object Complexes
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 35, pp.458-474. ⟨10.1016/j.media.2016.08.011⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01359423/file/Articolo_Bayesian_LAST.pdf BibTex
titre
A sub-Riemannian modular framework for diffeomorphism based analysis of shape ensembles
auteur
Barbara Gris, Stanley Durrleman, Alain Trouvé
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01321142/file/Gris_SubRiemModular2.pdf BibTex
titre
Analysis of anatomical variability using diffeomorphic iterative centroid in patients with Alzheimer's disease
auteur
Claire Cury, Joan Glaunès, Marie Chupin, Olivier Colliot
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering: Imaging & Visualization, Taylor & Francis, 2017, 5 (5), pp.350 - 358. ⟨10.1080/21681163.2015.1035403⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01135304/file/CMBBE_cury_sub.pdf BibTex
titre
Extensive white matter lesions after 2 years of fingolimod: progressive multifocal leukoencephalopathy or MS relapse?
auteur
Marine Boudot de la Motte, Céline Louapre, Anne Bertrand, Pauline Reach, Catherine Lubetzki, Caroline Papeix, Elisabeth Maillart
article
Multiple Sclerosis, SAGE Publications, 2017, 23 (4), pp.614 - 616. ⟨10.1177/1352458516682858⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01562641/file/2016-07-29%20Le%CC%81sions%20extensives%20fg%20.pdf BibTex
titre
Preclinical Alzheimer's disease: a systematic review of the cohorts underlying the concept
auteur
Stéphane Epelbaum, Rémy Genthon, Enrica Cavedo, Marie Habert, Foudil Lamari, Geoffroy Gagliardi, Simone Lista, Marc Teichmann, Hovagim Bakardjian, Harald Hampel, Bruno Dubois
article
Alzheimer's and Dementia, Elsevier, 2017, 13 (4), pp.454-467. ⟨10.1016/j.jalz.2016.12.003⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01672859/file/Epelbaum%20et%20al%202017%20for%20HAL.pdf BibTex
titre
MR imaging of adult acute infectious encephalitis
auteur
Anne Bertrand, Delphine Leclercq, Laurent Martinez-Almoyna, Nadine Girard, J.-P Stahl, T De-Broucker
article
Médecine et Maladies Infectieuses, Elsevier Masson, 2017, ⟨10.1016/j.medmal.2017.01.002⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01490868/file/2017-01-05%20final%20Enc.1-imagerie.pdf BibTex
titre
Predictive factors of long-term outcomes of surgery for mesial temporal lobe epilepsy associated with hippocampal sclerosis
auteur
Bertrand Mathon, Franck Bielle, Séverine Samson, Odile Plaisant, Sophie Dupont, Anne Bertrand, Richard Miles, Vi-Huong Nguyen-Michel, Virginie Lambrecq, Ana Laura Calderon-Garcidueñas, Charles Duyckaerts, Alexandre Carpentier, Michel Baulac, Philippe Cornu, Claude Adam, Stéphane Clemenceau, Vincent Navarro
article
Epilepsia, Wiley, 2017, 58 (8), pp.1473-1485 ⟨10.1111/epi.13831⟩
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BibTex
titre
Early life adversity is associated with a smaller hippocampus in male but not female depressed in-patients: a case–control study
auteur
Romain Colle, Tomoyuki Segawa, Marie Chupin, Minh Ngoc Thien Kim Tran Dong, Patrick Hardy, Bruno Falissard, Olivier Colliot, Denis Ducreux, Emmanuelle Corruble
article
BMC Psychiatry, BioMed Central, 2017, 17 (1), pp.71. ⟨10.1186/s12888-017-1233-2⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01474139/file/art_10.1186_s12888-017-1233-2.pdf BibTex

Conference papers

titre
Parallel transport in shape analysis : a scalable numerical scheme
auteur
Maxime Louis, Alexandre Bône, Benjamin Charlier, Stanley Durrleman
article
Geometric Science of Information, Nov 2017, Paris, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01565478/file/84-Louis.pdf BibTex
titre
Selection of amyloid positive pre-symptomatic subjects using automatic analysis of neuropsychological and MRI data for cost effective inclusion procedures in clinical trials
auteur
Manon Ansart, Stéphane Epelbaum, Olivier Colliot, Didier Dormont, Bruno Dubois, Harald Hampel, Stanley Durrleman
article
Clinical Trials for Alzheimer's Disease, Nov 2017, Boston, United States. pp.295
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https://hal.inria.fr/hal-02098434/file/Ansart%20et%20al_hal.pdf BibTex
titre
Diagnosis of Alzheimer’s Disease Through Identification of Abnormality Patterns in FDG PET Data
auteur
Ninon Burgos, Jorge Samper-González, Anne Bertrand, Marie-Odile Habert, Sébastien Ourselin, Stanley Durrleman, M. Jorge Cardoso, Olivier Colliot
article
30th Annual Congress of the European Association of Nuclear Medicine (EANM), Oct 2017, Vienna, Austria. pp.253 - 254, ⟨10.1007/s00259-017-3822-1⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01632509/file/Burgos_EANM_2017_hal.pdf BibTex
titre
White Matter Fiber Segmentation Using Functional Varifolds
auteur
Kuldeep Kumar, Pietro Gori, Benjamin Charlier, Stanley Durrleman, Olivier Colliot, Christian Desrosiers
article
MFCA 2017 - 6th MICCAI workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Sep 2017, Québec, Canada. pp.92-100
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https://hal.inria.fr/hal-01589649/file/kumar_varifolds_MICCAI-MFCA_postprint.pdf BibTex
titre
Multilevel Modeling with Structured Penalties for Classification from Imaging Genetics data
auteur
Pascal Lu, Olivier Colliot
article
3rd MICCAI Workshop on Imaging Genetics (MICGen 2017), Sep 2017, Québec City, Canada. pp.230-240
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https://hal.inria.fr/hal-01578441/file/10.1007%3A978-3-319-67675-3%2021.pdf BibTex
titre
Prediction of amyloidosis from neuropsychological and MRI data for cost effective inclusion of pre-symptomatic subjects in clinical trials
auteur
Manon Ansart, Stéphane Epelbaum, Geoffroy Gagliardi, Olivier Colliot, Didier Dormont, Bruno Dubois, Harald Hampel, Stanley Durrleman
article
Multimodal Learning for Clinical Decision Support, Sep 2017, Quebec City, Canada
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https://hal.inria.fr/hal-01578422/file/Ansart_et_al.pdf BibTex
titre
Multi-modal analysis of genetically-related subjects using SIFT descriptors in brain MRI
auteur
Kuldeep Kumar, Laurent Chauvin, Mathew Toews, Olivier Colliot, Christian Desrosiers
article
Workshop on Computational Diffusion MRI, CDMRI 2017, MICCAI Workshop, Sep 2017, Quebec, Canada
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https://hal.inria.fr/hal-01589647/file/kumar_SIFT_MICCAI-CDMRI_postprint.pdf BibTex
titre
Prediction of the progression of subcortical brain structures in Alzheimer's disease from baseline
auteur
Alexandre Bône, Maxime Louis, Alexandre Routier, Jorge Samper, Michael Bacci, Benjamin Charlier, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
6th MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Sep 2017, Quebec City, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01563587/file/MFCA2017.pdf BibTex
titre
Individual Analysis of Molecular Brain Imaging Data Through Automatic Identification of Abnormality Patterns
auteur
Ninon Burgos, Jorge Samper-González, Anne Bertrand, Marie-Odile Habert, Sébastien Ourselin, Stanley Durrleman, M. Jorge Cardoso, Olivier Colliot
article
Computational Methods for Molecular Imaging - [MICCAI 2017 Satellite Workshop], Sep 2017, Quebec City, Canada
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https://hal.inria.fr/hal-01567343/file/paperBurgos.pdf BibTex
titre
Yet Another ADNI Machine Learning Paper? Paving The Way Towards Fully-reproducible Research on Classification of Alzheimer's Disease
auteur
Jorge Samper-Gonzalez, Ninon Burgos, Sabrina Fontanella, Hugo Bertin, Marie-Odile Habert, Stanley Durrleman, Theodoros Evgeniou, Olivier Colliot
article
Machine Learning in Medical Imaging 2017, Sep 2017, Quebec City, Canada. pp.8
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https://hal.inria.fr/hal-01578479/file/samper17_MLMI_postprint.pdf https://hal.inria.fr/hal-01578479/file/MLMI-2017-Paper_12.pdf BibTex
titre
Statistical learning of spatiotemporal patterns from longitudinal manifold-valued networks
auteur
Igor Koval, Jean-Baptiste Schiratti, Alexandre Routier, Michael Bacci, Olivier Colliot, Stéphanie Allassonnière, Stanley Durrleman
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Quebec City, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01540828/file/paper723.pdf BibTex
titre
Early Diagnosis of Alzheimer’s Disease Using Subject-Specific Models of FDG-PET Data
auteur
Ninon Burgos, Jorge Samper-González, M. Jorge Cardoso, Stanley Durrleman, Sébastien Ourselin, Olivier Colliot
article
AAIC 2017 - Alzheimer's Association International Conference, Jul 2017, London, United Kingdom. pp.1-2, ⟨10.1016/j.jalz.2017.06.1618⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01621383/file/Burgos_AAIC_2017.pdf BibTex
titre
Accuracy of MRI classification algorithms in a tertiary memory center clinical routine cohort
auteur
Alexandre Morin, Jorge Samper-Gonzales, Anne Bertrand, Enrica Cavedo, Simone Lista, Didier Dormont, Aline Mendes, Pierrick Coupé, Jamila Ahdidan, Marcel Levy, Agnès Michon, Dalila Samri, Marc Teichmann, Harald Hampel, Bruno Dubois, Stéphane Epelbaum, Olivier Colliot
article
AAIC 2017 - Alzheimer's Association International Conference, Jul 2017, London, United Kingdom. pp.P772-P774, ⟨10.1016/j.jalz.2017.06.1034⟩
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BibTex
titre
Étude quantitative des anomalies de signal flair de la substance blanche dans les pathologies neurodégénératives
auteur
Sébastian Ströer, Ludovic Fillon, Stéphane Epelbaum, Marc Teichmann, Agnès Michon, Lara Miggliaccio, Aline Mendes, Marie Chupin, Olivier Colliot, Jamila Ahdidan, Christian Christoffersen, Claus Pedersen, Didier Dormont, Anne Bertrand
article
SFNR 2017 - 44ème Congrès de la Société Française de Neuroradiologie, Mar 2017, Paris, France. pp.1, ⟨10.1016/j.neurad.2017.01.011⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01562645/file/stroer_SFNR.pdf BibTex

Directions of work or proceedings

titre
Graphs in Biomedical Image Analysis, Computational Anatomy and Imaging Genetics
auteur
Jorge Cardoso, Tal Arbel, Enzo Ferrante, Xavier Pennec, Dalca Adrian V., Sarah Parisot, Sarang Joshi, Nematollah Batmanghelich, Aristeidis Sotiras, Mads Nielsen, Mert Sabuncu, Fletcher Tom, Li Shen, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
article
Jorge Cardoso; Tal Arbel; Mert Sabuncu; Fletcher Tom; Li Shen; Stanley Durrleman; Stefan Sommer; Enzo Ferrante; Xavier Pennec; Dalca Adrian V.; Sarah Parisot; Sarang Joshi; Nematollah Batmanghelich; Aristeidis Sotiras; Mads Nielsen. France. 10551, 2017, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-319-67675-3⟩
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BibTex

Poster communications

titre
Frontotemporal lobar degenerations, RNAopathy leading to proteinopathies
auteur
Vincent Anquetil, Anne Bertrand, Agnès Camuzat, Pierre de La Grange, Clémence Fournier, Valérie Buée-Scherrer, Vincent Deramecourt, Nicolas Sergeant, Mathieu Barbier, Luc Buée, Alexis Brice, Charles Duyckaerts, Isabelle Le Ber
article
AAIC 2017 - Alzheimer's Association International Conference, Jul 2017, Londres, United Kingdom. 13 (7), 2017, ⟨10.1016/j.jalz.2017.06.1982⟩
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BibTex
titre
A statistical model for brain networks inferred from large-scale electrophysiological signals
auteur
Catalina Obando Forero, Fabrizio de Vico Fallani
article
NetSci, Jun 2017, Indianapolis, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01564952/file/NetSci2017_Poster_Catalina.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Neuroimaging features in Posterior Reversible Encephalopathy Syndrome: A Pictorial Review
auteur
Morgan Ollivier, Anne Bertrand, Frédéric Clarençon, Sophie Gerber, Sandrine Deltour, Fanny Domont, Stéphanie Trunet, Didier Dormont, Delphine Leclercq
article
Journal of the Neurological Sciences, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.jns.2016.12.007⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01427526/file/PIIS0022510X16307900.pdf BibTex
titre
Reduced Regional Cortical Thickness Rate of Change in Donepezil-Treated Subjects With Suspected Prodromal Alzheimer’s Disease
auteur
Enrica Cavedo, Bruno Dubois, Olivier Colliot, Simone Lista, Bernard Croisile, Guy Louis Tisserand, Jacques Touchon, Alain Bonafe, Pierre J. Ousset, Olivier Rouaud, Fréderic Ricolfi, Alain Vighetto, Florence Pasquier, Samantha Galluzzi, Christine Delmaire, Mathieu Ceccaldi, Nadine Girard, Stéphane Lehericy, Françoise Duveau, Marie Chupin, Marie Sarazin, Didier Dormont, Harald Hampel
article
Journal of Clinical Psychiatry, Physicians Postgraduate Press, 2016, ⟨10.4088/JCP.15m10413 ⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01388951/file/cavedo16_the%20Journal%20of%20Clinical%20Psychiatry_postprint.pdf BibTex
titre
Efficacy of the MEK inhibitor cobimetinib for wild-type BRAF Erdheim-Chester disease.
auteur
Fleur Cohen Aubart, Jean Francois Emile, Philippe Maksud, Damien Galanaud, Philippe Cluzel, Neila Benameur, Olivier Aumaitre, Zahir Amoura, Julien Haroche
article
British Journal of Haematology, Wiley, 2016
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BibTex
titre
Pseudo-asymmetry of cerebral blood flow in arterial spin labeling caused by unilateral fetal-type circle of Willis: Technical limitation or a way to better understanding physiological variations of cerebral perfusion and improving arterial spin labeling acquisition?
auteur
Bruno Law-Ye, B Geerts, Damien Galanaud, Didier Dormont, Nadya Pyatigorskaya
article
Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism, Nature Publishing Group, 2016, 36 (9), pp.1641 - 1643. ⟨10.1177/0271678X16653614⟩
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BibTex
titre
Morphoarchitectural variation in South African fossil cercopithecoid endocasts
auteur
Amélie Beaudet, Jean Dumoncel, Frikkie de Beer, Benjamin Duployer, Stanley Durrleman, Emmanuel Gilissen, Jakobus Hoffman, Christophe Tenailleau, John Thackeray, José Braga
article
Journal of Human Evolution, Elsevier, 2016, 101, pp.65-78. ⟨10.1016/j.jhevol.2016.09.003⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01440065/file/Beaudet_JHE_2016.pdf BibTex
titre
Predictors of cognitive decline and treatment response in a clinical trial on suspected prodromal Alzheimer's disease
auteur
Stefan J Teipel, Enrica Cavedo, Michel J Grothe, Simone Lista, Samantha Galluzzi, Olivier Colliot, Marie Chupin, Hovagim Bakardjian, Didier Dormont, Bruno Dubois, Harald Hampel
article
Neuropharmacology, Elsevier, 2016, 108, pp.128-35
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BibTex
titre
Bee Venom for the Treatment of Parkinson Disease – A Randomized Controlled Clinical Trial
auteur
Andreas Hartmann, Julia Müllner, Niklaus Meier, Helke Hesekamp, Priscilla van Meerbeeck, Marie-Odile Habert, Aurélie Kas, Marie Tanguy, Merry Mazmanian, Hervé Oya, Nissen Abuaf, Hafida Gaouar, Sabrina Salhi, Fanny Charbonnier-Beaupel, Marie Fievet, Damien Galanaud, Sophie Arguillere, Emmanuel Roze, Bertrand Degos, David Grabli, Lucette Lacomblez, Cécile Hubsch, Marie Vidailhet, Anne-Marie Bonnet, Jean-Christophe Corvol, Michael Schüpbach
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (7)
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BibTex
titre
Smaller hippocampal volumes predict lower antidepressant response/remission rates in depressed patients: A meta-analysis
auteur
Romain Colle, Irène Dupong, Olivier Colliot, Eric Deflesselle, Patrick Hardy, Bruno Falissard, Denis Ducreux, Marie Chupin, Emmanuelle Corruble
article
World Journal of Biological Psychiatry, Taylor & Francis, 2016, pp.1-23. ⟨10.1080/15622975.2016.1208840⟩
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BibTex
titre
Interhemispheric Connectivity Characterizes Cortical Reorganization in Motor-Related Networks After Cerebellar Lesions.
auteur
Fabrizio de Vico Fallani, Silvia Clausi, Maria Leggio, Mario Chavez, Miguel Valencia, Anton Giulio Maglione, Fabio Babiloni, Febo Cincotti, Donatella Mattia, Marco Molinari
article
Cerebellum (London, England), 2016
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BibTex
titre
Robust imaging of hippocampal inner structure at 7T: in vivo acquisition protocol and methodological choices
auteur
Linda Marrakchi-Kacem, Alexandre Vignaud, Julien Sein, Johanne Germain, Thomas R Henry, Cyril Poupon, Lucie Hertz-Pannier, Stéphane Lehéricy, Olivier Colliot, Pierre-François van de Moortele, Marie Chupin
article
Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine, Springer Verlag, 2016
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https://hal.inria.fr/hal-01321870/file/marrakchi_2016_MAGMA_preprint.pdf BibTex
titre
Magnetic Resonance Imaging of Cerebral Aspergillosis: Imaging and Pathological Correlations
auteur
Guillaume Marzolf, Marcela Sabou, Béatrice Lannes, François Cotton, David Meyronet, Damien Galanaud, Jean-Philippe Cottier, Sylvie Grand, Hubert Desal, Julie Kreutz, Maleka Schenck, Nicolas Meyer, Francis Schneider, Jean-Louis Dietemann, Meriam Koob, Raoul Herbrecht, Stéphane Kremer, Heye Zhang
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (4)
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BibTex
titre
CATI: A Large Distributed Infrastructure for the Neuroimaging of Cohorts
auteur
Grégory Operto, Marie Chupin, Bénédicte Batrancourt, Marie-Odile Habert, Olivier Colliot, Habib Benali, Cyril Poupon, Catherine Champseix, Christine Delmaire, Sullivan Marie, Denis Rivière, Mélanie Pélégrini-Issac, Vincent Perlbarg, Régine Trebossen, Michel Bottlaender, Vincent Frouin, Antoine Grigis, Dimitri Papadopoulos Orfanos, Hugo Dary, Ludovic Fillon, Chabha Azouani, Ali Bouyahia, Clara Fischer, Lydie Edward, Mathilde Bouin, Urielle Thoprakarn, Jinpeng Li, Leila Makkaoui, Sylvain Poret, Carole Dufouil, Vincent Bouteloup, Gaël Chételat, Bruno Dubois, Stéphane Lehéricy, Jean-François Mangin, Yann Cointepas
article
Neuroinformatics, Springer, 2016, pp.1-12. ⟨10.1007/s12021-016-9295-8⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01303094/file/Operto_2016_CATI.pdf BibTex
titre
Early and protective microglial activation in Alzheimer's disease: a prospective study using 18F-DPA-714 PET imaging
auteur
Lorraine Hamelin, Julien Lagarde, Guillaume Dorothée, Claire Leroy, Mickael Labit, Robert A Comley, Leonardo Cruz de Souza, Helene Corne, Luce Dauphinot, Maxime Bertoux, Bruno Dubois, Philippe Gervais, Olivier Colliot, Marie Claude Potier, Michel Bottlaender, Marie Sarazin
article
Brain - A Journal of Neurology , Oxford University Press (OUP), 2016, 139 (Pt 4), pp.1252-64. ⟨10.1093/brain/aww017⟩
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BibTex
titre
White matter lesions in FTLD: distinct phenotypes characterize GRN and C9ORF72 mutations
auteur
Fatima Ameur, Olivier Colliot, Paola Caroppo, Sebastian Stroer, Didier Dormont, Alexis Brice, Carole Azuar, Bruno Dubois, Isabelle Le Ber, Anne Bertrand
article
Neurology: Genetics, American Academy of neurology, 2016, 2 (1), ⟨10.1212/NXG.0000000000000047⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01266596/file/ameur2016_white_FTLD_NeurologyGenetics_published_Open.pdf BibTex
titre
Brain lesions
auteur
Ariane Molka, Gaëlle Leroux, Anne Bertrand, Stéphane Jaureguiberry, David Saadoun, Dominique Mazier, Eric Caumes, Patrice Cacoub
article
La Revue De Médecine Interne, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.revmed.2016.04.010⟩
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titre
Functional and effective brain connectivity for discrimination between Alzheimer’s patients and healthy individuals: A study on resting state EEG rhythms
auteur
Katarzyna J. Blinowska, Franciszek Rakowski, Maciej Kaminski, Fabrizio de Vico Fallani, Claudio del Percio, Roberta Lizio, Claudio Babiloni
article
Clinical Neurophysiology, Elsevier, 2016, 128 (4), pp.667-680. ⟨10.1016/j.clinph.2016.10.002⟩
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titre
Vascular permeability in the RG2 glioma model can be mediated by macropinocytosis and be independent of the opening of the tight junction
auteur
Karin Pernet-Gallay, Pierre-Henri Jouneau, Anne Bertrand, Julie Delaroche, Régine Farion, Chantal Remy, Emmanuel L. Barbier
article
Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism, Nature Publishing Group, 2016
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titre
Neither the patient nor the physician could see anything: Atypical Bing-Neel syndrome
auteur
Jean-Louis Bacquet, Nicolas Weiss, Claire Meyniel, Caroline Algrin, Sylvain Choquet, Véronique Leblond, Damien Galanaud, Phuc Lehoang, Bahram Bodaghi, Valerie Touitou
article
American Journal of Hematology, Wiley, 2016, 91 (8), pp.858 - 859
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titre
Parsimonious Approximation of Streamline Trajectories in White Matter Fiber Bundles
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Fabrizio de Vico Fallani, Mario Chavez, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, PP (99), ⟨10.1109/TMI.2016.2591080⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01346067/file/Prototype_Paper_Final_PrePrint.pdf BibTex
titre
Hippocampal volume predicts antidepressant efficacy in depressed patients without incomplete hippocampal inversion
auteur
Romain Colle, Claire Cury, Marie Chupin, Eric Deflesselle, Patrick Hardy, Nasser Ghaidaa, Bruno Falissard, Denis Ducreux, Olivier Colliot, Emmanuelle Corruble
article
Neuroimage-Clinical, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.nicl.2016.04.009⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01310464/file/1-s2.0-S2213158216300729-main.pdf BibTex
titre
Improved cerebral microbleeds detection using their magnetic signature on T2*-phase-contrast: a comparison study in a clinical setting
auteur
Takoua Kaaouana, Anne Bertrand, Fatma Ouamer, Bruno Law-Ye, Nadya Pyatigorskaya, Ali Bouyahia, Nathalie Thiery, Carole Dufouil, Christine Delmaire, Didier Dormont, Ludovic de Rochefort, Marie Chupin
article
Neuroimage-Clinical, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.nicl.2016.08.005⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01406920/file/1-s2.0-S2213158216301413-main.pdf BibTex
titre
Riemannian geometry applied to detection of respiratory states from EEG signals: the basis for a brain-ventilator interface
auteur
Xavier Navarro-Sune, Anna Hudson, Fabrizio de Vico Fallani, Jacques Martinerie, Adrien Witon, Pierre Pouget, Mathieu Raux, Thomas Similowski, Mario Chavez
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, pp.14
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https://arxiv.org/pdf/1601.03022 BibTex
titre
Efficacy of Anti-TNFα in Severe and Refractory Neuro-Behcet Disease
auteur
Anne Desbois, Olga Addimanda, Anne Bertrand, Alban Deroux, Laurent Pérard, Raphael Depaz, Eric Hachulla, Marc Lambert, David Launay, Benjamin Subran, Felix Ackerman, Xavier Marie, Fleur Cohen, Isabelle Marie, Carlo Salvarini, Patrice Cacoub, David Saadoun
article
Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2016, 95 (23)
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titre
Predictors of Trigeminal Neuropathy After Radiosurgery for Vestibular Schwannomas
auteur
Suhan Senova, Mourad Aggad, Jean-Louis Golmard, Dominique Hasboun, Ioannis Lamproglou, Catherine Jenny, Philippe Cornu, Jean-Jacques Mazeron, Charles A. Valéry
article
International Journal of Radiation Oncology - Biology - Physics, Elsevier, 2016, 95 (2), pp.721 - 728
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titre
Direct current stimulation over the anterior temporal areas boosts semantic processing in primary progressive aphasia
auteur
Marc Teichmann, Constance Lesoil, Juliette Godard, Marine Vernet, Anne Bertrand, Richard Levy, Bruno Dubois, Laurie Lemoine, Dennis Q. Truong, Marom Bikson, Aurélie Kas, Antoni Valero-Cabré
article
Annals of Neurology, Wiley, 2016
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titre
Spinal Koebner phenomenon: Medullar sarcoidosis facing a discal hernia
auteur
Clothilde Isabel, Fleur Cohen Aubart, Pauline Dodet, Damien Galanaud, Zahir Amoura, Elisabeth Maillart
article
Joint Bone Spine, Elsevier Masson, 2016, ⟨10.1016/j.jbspin.2016.05.009⟩
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titre
Atypical ocular manifestation of primary varicella zoster virus infection as the first manifestation of AIDS
auteur
Ammr Alghamdi, Romain Palich, Ruxandra Calin, Claire Hussenet, Matthias Papo, David Boutolleau, Alexis Mathian, Damien Galanaud, Phuc Le Hoang, Eric Caumes, Christine Katlama, Bahram Bodaghi, Valerie Touitou, Valérie Pourcher-Martinez
article
AIDS, Lippincott, Williams & Wilkins, 2016, 30 (4), pp.674 - 676. ⟨10.1097/QAD.0000000000000981⟩
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titre
Normalisation of brain spectroscopy findings in Niemann–Pick disease type C patients treated with miglustat
auteur
Frédéric Sedel, Brigitte Chabrol, Bertrand Audoin, Elsa Kaphan, Christine Tranchant, Tomasz Burzykowski, Ayman Tourbah, Marie-Thérèse Vanier, Damien Galanaud
article
Journal of Neurology, Springer Verlag, 2016, 263 (5), pp.927 - 936. ⟨10.1007/s00415-016-8051-1⟩
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titre
Extensive and severe CNS demyelination associated with golimumab therapy
auteur
Elisabeth Maillart, Caroline Papeix, Charles Mellerio, Anne Bertrand, Catherine Lubetzki, Céline Louapre
article
Journal of Neurology, Springer Verlag, 2016, 263 (9), pp.1869 - 1871
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titre
Dural and osteolytic sarcomatoid relapse of a secondary gliosarcoma with tryptase immunoreactivity
auteur
Ana Laura Calderon-Garcidueñas, Ahmed Idbaih, Damien Galanaud, Charles Duyckaerts, Franck Bielle
article
Clinical Neuropathology, Dustri-Verlag, 2016, 35 (05), pp.154 - 158
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Conference papers

titre
Imagerie hybride TEP-IRM pour l'exploration des troubles cognitifs
auteur
Stéphanie Bourrelier, Marie-Odile Habert, Bruno Law-Ye, Morgan Ollivier, Nathanaelle Yeni, Pierre-Maxime David, Aurélie Kas, Didier Dormont, Anne Bertrand
article
Journées Françaises de Radiologie, Oct 2016, Paris, France
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titre
Spatio-Temporal Shape Analysis of Cross-Sectional Data for Detection of Early Changes in Neurodegenerative Disease
auteur
Claire Cury, Marc Lorenzi, David Cash, Jennifer Nicholas, Alexandre Routier, Jonathan Rohrer, Sebastien Ourselin, Stanley Durrleman, Marc Modat
article
SeSAMI 2016 - First International Workshop Spectral and Shape Analysis in Medical Imaging, Sep 2016, Athens, Greece. pp.63 - 75, ⟨10.1007/978-3-319-51237-2_6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01440061/file/Cury_SSAMI_16.pdf BibTex
titre
The INSIGHT cohort: baseline analysis of structural MR imaging in asymptomatic subjects at risk for Alzheimer's disease
auteur
Anne Bertrand, Stephane Epelbaum, Marie-Odile Habert, Harald Hampel, Hovagim Bakardjian, Marie Chupin, Chabha Azouani, Kelly Martineau, Ludovic Fillon, Clara Fischer, Olivier Colliot, Bruno Dubois
article
AAIC, Jul 2016, Toronto, Canada. ⟨10.1016/j.jalz.2016.06.612⟩
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titre
How to build an average model when samples are variably incomplete? Application to fossil data
auteur
Jean Dumoncel, Gérard Subsol, Stanley Durrleman, Jean Pierre Jessel, Amélie Beaudet, José Braga
article
CVPRW: Computer Vision and Pattern Recognition Workshops, Jun 2016, Las Vegas, United States. pp.541-548, ⟨10.1109/CVPRW.2016.74⟩
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https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-01381310/file/Dumoncel_How_to_Build_CVPR_2016_paper.pdf BibTex
titre
Imagerie hybride TEP/IRM dans le bilan des pathologies neurodégénératives : retour d’expérience
auteur
M. Habert, M. David, Anne Bertrand, G. Bera, N. Yeni, M. Bertaux, N. Pyatigorskaya, D. Dormont, A. Villanueva, A. Kas
article
2es Journées Francophones de Médecine Nucléaire, May 2016, Grenoble, France. pp.169 - 170, ⟨10.1016/j.mednuc.2016.03.003⟩
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BibTex
titre
Suspected non-alzheimer disease pathophysiology (SNAP) categorization in the insight cohort
auteur
Stephane Epelbaum, Anne Bertrand, Aline Mendes, Marc Levy, Geoffroy Gagliardi, Hugo Bertin, Marc Teichmann, Olivier Colliot, Marie-Odile Habert, Bruno Dubois
article
AAIC, 2016, Toronto, Canada. pp.P1073 - P1074, ⟨10.1016/j.jalz.2016.06.2246⟩
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Poster communications

titre
Graph Models of Brain Connectivity Networks
auteur
Catalina Obando Forero, Fabrizio de Vico Fallani
article
Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2016, Geneve, Switzerland
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Theses

titre
Statistical models to learn the structural organisation of neural circuits from multimodal brain images - Application to Gilles de la Tourette syndrome
auteur
Pietro Gori
article
Medical Imaging. UPMC - Université Paris 6 Pierre et Marie Curie, 2016. English
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01352477/file/Thesis_PhD_Gori.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Incomplete Hippocampal Inversion: A Comprehensive MRI Study of Over 2000 Subjects
auteur
Claire Cury, Roberto Toro, Fanny Cohen, Clara Fischer, Amel Mhaya, Jorge Samper-González, Dominique Hasboun, Jean-François Mangin, Tobias Banaschewski, Arun L. W. Bokde, Uli Bromberg, Christian Buechel, Anna Cattrell, Patricia Conrod, Herta Flor, Juergen Gallinat, Hugh Garavan, Penny Gowland, Andreas Heinz, Bernd Ittermann, Hervé Lemaitre, Jean-Luc Martinot, Frauke Nees, Marie-Laure Paillère Martinot, Dimitri P. Orfanos, Tomas Paus, Luise Poustka, Michael N. Smolka, Henrik Walter, Robert Whelan, Vincent Frouin, Gunter Schumann, Joan A. Glaunès, Olivier Colliot
article
Frontiers in Neuroanatomy, Frontiers, 2015, 9, pp.160. ⟨10.3389/fnana.2015.00160⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01251239/file/cury_IHI_Frontiers_in_Neuroanatomy_published_Open_Access.pdf BibTex
titre
Safety profile of intracranial electrode implantation for video-EEG recordings in drug-resistant focal epilepsy.
auteur
Bertrand Mathon, Stéphane Clemenceau, Dominique Hasboun, Marie-Odile Habert, Hayat Belaid, Vi-Huong Nguyen-Michel, Virginie Lambrecq, Vincent Navarro, Sophie Dupont, Michel Baulac, Philippe Cornu, Claude Adam
article
Journal of Neurology, Springer Verlag, 2015, 262 (12), pp.2699-712. ⟨10.1007/s00415-015-7901-6⟩
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BibTex
titre
Extensive brain demyelinating lesions under natalizumab: The role of anti-natalizumab antibodies.
auteur
Rabab Debs, Elisabeth Maillart, Robert Fahed, Caroline Papeix, Charles Duyckaerts, Christine Stadelmann, Damien Galanaud, Catherine Lubetzki
article
Neurology, American Academy of Neurology, 2015, 85 (18), pp.1630-2
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BibTex
titre
Sulcal morphology as a new imaging marker for the diagnosis of early onset Alzheimer's disease
auteur
Lorraine Hamelin, Maxime Bertoux, Michel Bottlaender, Helene Corne, Julien Lagarde, Valérie Hahn, Jean-François Mangin, Bruno Dubois, Marie Chupin, Leonardo Cruz de Souza, Olivier Colliot, Marie Sarazin
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2015, 36 (11), pp.2932-9. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2015.04.019⟩
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BibTex
titre
Event-Related Potential, Time-frequency, and Functional Connectivity Facets of Local and Global Auditory Novelty Processing: An Intracranial Study in Humans.
auteur
Imen El Karoui, Jean-Remi King, Jacobo Sitt, Florent Meyniel, Simon van Gaal, Dominique Hasboun, Claude Adam, Vincent Navarro, Michel Baulac, Stanislas Dehaene, Laurent Cohen, Lionel Naccache
article
Cerebral Cortex, Oxford University Press (OUP), 2015, 25 (11), pp.4203-12. ⟨10.1093/cercor/bhu143⟩
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titre
Donepezil decreases annual rate of hippocampal atrophy in suspected prodromal Alzheimer's disease
auteur
Bruno Dubois, Marie Chupin, Harald Hampel, Simone Lista, Enrica Cavedo, Bernard Croisile, Guy Louis Tisserand, Jacques Touchon, Alain Bonafe, Pierre Jean Ousset, Amir Ait Ameur, Olivier Rouaud, Fréderic Ricolfi, Alain Vighetto, Florence Pasquier, Christine Delmaire, Mathieu Ceccaldi, Nadine Girard, Carole Dufouil, Stéphane Lehericy, Isabelle Tonelli, Françoise Duveau, Olivier Colliot, Line Garnero, Marie Sarazin, Didier Dormont
article
Alzheimer's and Dementia, Elsevier, 2015, 11 (9), pp.1041-1049. ⟨10.1016/j.jalz.2014.10.003⟩
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BibTex
titre
Partial epilepsy: A pictorial review of 3 TESLA magnetic resonance imaging features
auteur
Lucas Giansante Abud, Lionel Thivard, Thiago Giansante Abud, Guilherme Seizem Nakiri, Antonio Carlos Dos Santos, Didier Dormont
article
Clinics (São Paulo, Brazil), 2015, 70 (9), pp.654-61. ⟨10.6061/clinics/2015(09)10⟩
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titre
Lateral Temporal Lobe: An Early Imaging Marker of the Presymptomatic GRN Disease?
auteur
Paola Caroppo, Marie-Odile Habert, Stanley Durrleman, Aurélie Funkiewiez, Vincent Perlbarg, Valérie Hahn, Hugo Bertin, Malo Gaubert, Alexandre Routier, Didier Hannequin, Vincent Deramecourt, Florence Pasquier, Sophie Rivaud-Pechoux, Martine Vercelletto, Geoffrey Edouart, Romain Valabregue, Pascal Lejeune, Mira Didic, Jean-Christophe Corvol, Habib Benali, Stéphane Lehéricy, Bruno Dubois, Olivier Colliot, Alexis Brice, Isabelle Le Ber
article
Journal of Alzheimer's Disease, IOS Press, 2015, 47 (3), pp.751-9. ⟨10.3233/JAD-150270⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01220380/file/caroppo2015_JAD_published.pdf BibTex
titre
Bayesian Mixed Effect Atlas Estimation with a Diffeomorphic Deformation Model
auteur
Stéphanie Allassonnière, S Durrleman, E Kuhn
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2015, 8 (3), pp.29. ⟨10.1137/140971762⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01246570/file/SIIMS.pdf BibTex
titre
An algebraic topological method for multimodal brain networks comparisons
auteur
Tiago Simas, Mario Chavez, Pablo R. Rodriguez, Albert Diaz-Guilera
article
Frontiers in Psychology, Frontiers, 2015, 6, pp.904. ⟨10.3389/fpsyg.2015.00904⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01263828/file/fpsyg-06-00904.pdf BibTex
titre
A diagnostic flow chart for POLG-related diseases based on signs sensitivity and specificity.
auteur
Maya Tchikviladzé, Mylène Gilleron, Thierry Maisonobe, Damien Galanaud, Pascal Laforêt, Alexandra Durr, Bruno Eymard, Fanny Mochel, Hélène Ogier, Anthony Béhin, Tanya Stojkovic, Bertrand Degos, Isabelle Gourfinkel-An, Frederic Sedel, Mathieu Anheim, Alexis Elbaz, Karine Viala, Marie Vidailhet, Alexis Brice, Claude Jardel, Anne Lombès
article
Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry, BMJ Publishing Group, 2015, 86 (6), pp.646-54. ⟨10.1136/jnnp-2013-306799⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01067950/file/RevisedManuscript_Lombes_et_al.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01067950/file/Figures_Lombes_et_al.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01067950/file/Tables_e-1_et_2.pdf BibTex
titre
Probable Creutzfeldt-Jakob Disease Mimicking a Perioperative Stroke in an Elderly Adult.
auteur
Emmanuelle Magny, Catherine Sagot, Judith Cohen-Bittan, Solène Makdessi, Anne Bertrand, Marc Verny, Jacques Boddaert
article
Journal of the American Geriatrics Society, Wiley, 2015, 63 (6), pp.1268-9. ⟨10.1111/jgs.13452⟩
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BibTex
titre
Standardized evaluation of algorithms for computer-aided diagnosis of dementia based on structural MRI: the CADDementia challenge.
auteur
Esther E Bron, Marion Smits, Wiesje M van der Flier, Hugo Vrenken, Frederik Barkhof, Philip Scheltens, Janne M Papma, Rebecca M E Steketee, Carolina Méndez Orellana, Rozanna Meijboom, Madalena Pinto, Joana R Meireles, Carolina Garrett, António J Bastos-Leite, Ahmed Abdulkadir, Olaf Ronneberger, Nicola Amoroso, Roberto Bellotti, David Cárdenas-Peña, Andrés M Álvarez-Meza, Chester V Dolph, Khan M Iftekharuddin, Simon F Eskildsen, Pierrick Coupé, Vladimir S Fonov, Katja Franke, Christian Gaser, Christian Ledig, Ricardo Guerrero, Tong Tong, Katherine R Gray, Elaheh Moradi, Jussi Tohka, Alexandre Routier, Stanley Durrleman, Alessia Sarica, Giuseppe Di Fatta, Francesco Sensi, Andrea Chincarini, Garry M Smith, Zhivko V Stoyanov, Lauge Sørensen, Mads Nielsen, Sabina Tangaro, Paolo Inglese, Christian Wachinger, Martin Reuter, John C van Swieten, Wiro J Niessen, Stefan Klein
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, 111, pp.562-79. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.01.048⟩
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BibTex
titre
Successful endovascular treatment of three fusiform cerebral aneurysms with the Pipeline Embolization Device in a patient with dilating HIV vasculopathy.
auteur
Bruno Law-Ye, Didier Dormont, Jacques Chiras, Robert-Yves Carlier, Frédéric Clarençon
article
Journal of neurointerventional surgery, 2015, ⟨10.1136/neurintsurg-2015-011730⟩
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BibTex
titre
Lucid Dreaming in Narcolepsy
auteur
Pauline Dodet, Mario Chavez, Smaranda Leu-Semenescu, Jean-Louis Golmard, Isabelle Arnulf
article
SLEEP, American Academy of Sleep Medicine, 2015, 38 (3), pp.487-497. ⟨10.5665/sleep.4516⟩
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BibTex
titre
3D multimodal MRI brain glioma tumor and edema segmentation: a graph cut distribution matching approach.
auteur
Ines Njeh, Lamia Sallemi, Ismail Ben Ayed, Khalil Chtourou, Stéphane Lehéricy, Damien Galanaud, Ahmed Ben Hamida
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, Elsevier, 2015, 40 (4), pp.108-19. ⟨10.1016/j.compmedimag.2014.10.009⟩
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BibTex
titre
Depressed suicide attempters have smaller hippocampus than depressed patients without suicide attempts
auteur
Romain Colle, Marie Chupin, Claire Cury, Christophe Vandendrie, Florence Gressier, Patrick Hardy, Bruno Falissard, Olivier Colliot, Denis Ducreux, Emmanuelle Corruble
article
Journal of Psychiatric Research, Elsevier, 2015, 61, pp.6. ⟨10.1016/j.jpsychires.2014.12.010⟩
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BibTex
titre
[Contribution of arterial spin labeling to the diagnosis of sudden and transient neurological deficit].
auteur
Marion Yger, Nicolas Villain, Samia Belkacem, Anne Bertrand, Charlotte Rosso, Sophie Crozier, Yves Samson, Didier Dormont
article
Revue Neurologique, Elsevier Masson, 2015, 171 (2), pp.161-5. ⟨10.1016/j.neurol.2014.10.014⟩
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BibTex
titre
2D harmonic filtering of MR phase images in multicenter clinical setting: Toward a magnetic signature of cerebral microbleeds
auteur
Takoua Kaaouana, Ludovic de Rochefort, Thomas Samaille, Nathalie Thiery, Carole Dufouil, Christine Delmaire, Didier Dormont, Marie Chupin
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, 104, pp.14. ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.08.024⟩
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BibTex
titre
Age-associated evolution of plasmatic amyloid in mouse lemur primates: relationship with intracellular amyloid deposition
auteur
Maggie Roy, Cécile Cardoso, Olène Dorieux, Carole Malgorn, Stéphane Epelbaum, Fanny Petit, Audrey Kraska, Emmanuel Brouillet, Benoit Delatour, Martine Perret, Fabienne Aujard, Marc Dhenain
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2015, 36 (1), pp.149-156. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2014.07.017⟩
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BibTex
titre
Biomedical image segmentation using geometric deformable models and metaheuristics
auteur
Pablo Mesejo, Andrea Valsecchi, Linda Marrakchi-Kacem, Stefano Cagnoni, Sergio Damas
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, Elsevier, 2015, 43, pp.167-178. ⟨10.1016/j.compmedimag.2013.12.005⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01221316/file/CMIG.pdf BibTex
titre
OFSEP, a nationwide cohort of people with multiple sclerosis: Consensus minimal MRI protocol
auteur
Roxana Amélie, René Anxionnat, Jean-Paul Armspach, Bertrand Audoin, Christian Barillot, Isabelle Berry, Fabrice Bonneville, Claire Boutet, Giovanni Castelnovo, Frédéric Cervenansky, Mikael Cohen, Olivier Commowick, François Cotton, Jérôme de Seze, Vincent Dousset, Françoise Durand-Dubief, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferre, Damien Galanaud, Tristan Glattard, Sylvie Grand, Justine Guillaumont, Rémy Guillevin, Charles Guttmann, Salem Hannoun, Fabrice Heitz, Alexandre Krainik, Stéphane Kremer, Pierre Labauge, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Dominique Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Bruno Stankoff, Thomas Tourdias, Ayman Tourbah, Sandra Vukusic
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, Elsevier Masson, 2015, 42 (3), pp.133 - 140. ⟨10.1016/j.neurad.2014.12.001⟩
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BibTex
titre
Diffuse Cerebral Microbleeds after Extracorporeal Membrane Oxygenation Support
auteur
Loïc Le Guennec, Anne Bertrand, Charles Laurent, Hadrien Roze, Jean Chastre, Alain Combes, Charles-Edouard Luyt
article
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, American Thoracic Society, 2015, 191 (5), pp.594 - 596. ⟨10.1164/rccm.201411-2118LE⟩
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BibTex
titre
An Unusual Case of Hemiballism-Hemichorea Associated with Nonketotic Hyperglycemia in Association with a Centrum Semiovale Stroke
auteur
Giulia Lancellotti, Catherine Sagot, Anne Forest, Sandrine Greffard, Anne Bertrand, Marc Verny
article
Journal of the American Geriatrics Society, Wiley, 2015, 63 (8), pp.1720 - 1721. ⟨10.1111/jgs.13577⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01406697/file/lancelotti%202015.pdf BibTex
titre
Open-Angle Glaucoma and Paraoptic Cyst: First Description of a Series of 11 Patients
auteur
Anne Bertrand, Catherine Vignal, F Lafitte, P Koskas, O Bergès, F Héran
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2015, 36, pp.779 - 782. ⟨10.3174/ajnr.A4194⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01406948/file/779.full.pdf BibTex
titre
Transient reduction in venous susceptibility during posterior reversible encephalopathy syndrome
auteur
Morgan Ollivier, Emmanuelle Wanono, Delphine Leclercq, Fanny Domont, Stéphanie Trunet, Didier Dormont, Anne Bertrand
article
Journal of the Neurological Sciences, Elsevier, 2015, 358 (1-2), pp.505-506. ⟨10.1016/j.jns.2015.09.359⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01251489/file/2015-09-01%20Article%20PRES%20clean.pdf BibTex

Conference papers

titre
Learning spatiotemporal trajectories from manifold-valued longitudinal data
auteur
Jean-Baptiste Schiratti, Stéphanie Allassonniere, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
Neural Information Processing Systems, Dec 2015, Montréal, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01163373/file/nips2015_final_SD.pdf BibTex
titre
A sub-Riemannian modular approach for diffeomorphic deformations
auteur
Barbara Gris, Stanley Durrleman, Alain Trouvé
article
2nd conference on Geometric Science of Information, Oct 2015, Paris-Saclay, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01191540/file/%2382-Barbara_Gris.pdf BibTex
titre
Mixed-effects model for the spatiotemporal analysis of longitudinal manifold-valued data
auteur
Jean-Baptiste Schiratti, Stéphanie Allassonnière, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
5th MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2015, Munich, Germany
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01245905/file/PapierMFCA.pdf BibTex
titre
Innovation-based sparse estimation of functional connectivity from multivariate autoregressive models
auteur
François Deloche, Fabrizio de Vico Fallani, Stéphanie Allassonniere
article
SPIE, Wavelets and Sparsity XVI, Aug 2015, San Diego, United States. ⟨10.1117/12.2189640⟩
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titre
Joint Morphometry of Fiber Tracts and Gray Matter structures using Double Diffeomorphisms
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Alexandre Routier, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
IPMI - Information Processing in Medical Imaging, Jun 2015, Isle of Skye, United Kingdom. pp.275-287, ⟨10.1007/978-3-319-19992-4_21⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01142628/file/19.pdf BibTex
titre
A mixed-effects model with time reparametrization for longitudinal univariate manifold-valued data
auteur
Jean-Baptiste Schiratti, Stéphanie Allassonniere, Alexandre Routier, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
IPMI - Information Processing in Medical Imaging , Sebastien Ourselin, Daniel C. Alexander, Carl-Fredrik Westin, M. Jorge Cardoso, Jun 2015, Sleat, Isle of Skye, United Kingdom. pp.564-575
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01163213/file/133.pdf BibTex
titre
Assessment of an iconic-geometric nonlinear registration method for deep brain stimulation (DBS) planning
auteur
Ana B. Graciano Fouquier, Eric Bardinet, Marie-Laure Welter, Carine Karachi, Jérôme Yelnik, Sara Fernandez Vidal, Stanley Durrleman
article
Organization for Human Brain Mapping (OHBM) 2015, Jun 2015, Honolulu, Hawaii, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01187468/file/3005_GracianoFouquier_0611_043746.pdf BibTex
titre
A modular multi-scale model to build atlases of shapes with large deformations
auteur
Barbara Gris, Stanley Durrleman, Alain Trouvé
article
Organization for Human Brain Mapping 2015, Jun 2015, Honolulu, United States. pp.1
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titre
Multi-template approaches for segmenting the hippocampus: the case of the SACHA software
auteur
Ludovic Fillon, Olivier Colliot, Dominique Hasboun, Bruno Dubois, Didier Dormont, Louis Lemieux, Marie Chupin
article
Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2015, Honolulu, United States. pp.5
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01188794/file/Abstract%20HBM_2015_20150115_final.pdf BibTex
titre
Characterization of Incomplete Hippocampal Inversions in a large dataset of young healthy subjects
auteur
Claire Cury, Roberto Toro, Fanny Cohen, Amel Mhaya, Dominique Hasboun, Gunter Schumann, Vincent Frouin, Joan Alexis Glaunès, Olivier Colliot
article
Human Brain Mapping - 2015, Jun 2015, Honolulu, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01212219/file/aramis_poster_HBM_IHI_2.pdf BibTex
titre
Statistical shape analysis of large datasets using diffeomorphic iterative centroids
auteur
Claire Cury, Joan Glaunés, Roberto Toro, Gunter Schumann, Vincent Frouin, Olivier Colliot
article
Human Brain Mapping - 2015, Jun 2015, Honolulu, United States
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BibTex
titre
Deformetrica: a software for statistical analysis of anatomical shapes
auteur
Alexandre Routier, Marcel Prastawa, Benjamin Charlier, Cédric Doucet, Joan Alexis Glaunès, Stanley Durrleman
article
21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, OHBM 2015, Jun 2015, Honolulu, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01187469/file/2015_ohbm_deformetrica.pdf BibTex
titre
Combined Laplacian-equivolumic model for studying cortical lamination with ultra high field MRI (7 T)
auteur
Yann Leprince, Fabrice Poupon, Thierry Delzescaux, Dominique Hasboun, Cyril Poupon, Denis Rivière
article
2015 IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), IEEE, Apr 2015, New York, United States. pp.580-583, ⟨10.1109/ISBI.2015.7163940⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01119475/file/isbi.pdf BibTex
titre
Mise au point d'une antenne IRM 11.7T pour l'imagerie directe de coupes histologiques
auteur
Anne Bertrand, Dung Hoang, Alexandra Petiet, Benoit Delatour, Charles Duyckaerts, Véronique Sazdovitch, Youssef Z. Wadghiri
article
SFNR, Apr 2015, Paris, France
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titre
Steady state visual evoked potentials-based patient interface under breathing constraints
auteur
Xavier Navarro, Sebastien Campion, Fabrizio de Vico Fallani, Pierre Pouget, Thomas Similowski, Mathieu Raux, Mario Chavez
article
Neural Engineering (NER), 2015 7th International IEEE/EMBS Conference, 2015, montpellier, France. ⟨10.1109/NER.2015.7146579⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01207793/file/ssevp_ventilation_final_revised.pdf BibTex
titre
Segmentation of hippocampal inner structure using 7T in-vivo MRI: a robust anatomical protocol
auteur
Marie Chupin, Johanne Germain, Linda Marrakchi-Kacem, Emilie Gerardin, Claire Boutet, Claire Cury, Alexandre Vignaud, Lucie Hertz-Pannier, Stéphane Lehéricy, Stéphane Epelbaum, Dominique Hasboun, Olivier Colliot
article
Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, OHBM 2015, 2015, Honolulu, United States
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titre
Imaging of hippocampal inner structure at 7T: robust in-vivo acquisition protocol
auteur
Linda Marrakchi-Kacem, Alexandre Vignaud, Julien Sein, Johanne Germain, Stéphane Epelbaum, Thomas R Henry, Poupon Cyril, Lucie Hertz-Pannier, Stéphane Lehéricy, Olivier Colliot, Pierre-François van de Moortele, Marie Chupin
article
Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, OHBM 2015, 2015, Honolulu, United States
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titre
Measuring the thickness of the hippocampal pyramidal layer using in vivo 7T MRI
auteur
Emilie Gérardin, Joan Alexis Glaunès, Marie Chupin, Ana B. Graciano Fouquier, Kevin Roussel, Stanley Durrleman, Thomas R Henry, Pierre-François van de Moortele, Alain Trouvé, Olivier Colliot
article
Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, OHBM 2015, 2015, Honolulu, United States
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BibTex
titre
Unified analysis of shape and structural connectivity of neural pathways
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Alexandre Routier, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
Organisation for Human Brain Mapping, 2015, Honolulu, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01187461/file/OHBM2015_Gori.pdf BibTex

Directions of work or proceedings

titre
Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015)
auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Thomas P. Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads and Fletcher, Thomas P. and Durrleman, Stanley and Sommer, Stefan Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015), Oct 2015, Munich, Germany. pp.173, 2015, ⟨http://www-sop.inria.fr/asclepios/events/MFCA15/⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01203812/file/MFCA15_Proceedings.pdf BibTex
titre
Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data
auteur
Stanley Durrleman, Thomas P. Fletcher, Guido Gerig, Marc Niethammer, Xavier Pennec
article
Durrleman, Stanley; Fletcher, Thomas P.; Gerig, Guido; Niethammer, Marc ; Pennec, Xavier STIA 2014 - Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Sep 2014, Cambridge, United States. , 8682, Springer International Publishing, pp.89, 2015, Lecture notes in computer science, 978-3-319-14904-2. ⟨10.1007/978-3-319-14905-9⟩. ⟨http://www.sci.utah.edu/stia2014-home.html⟩
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Poster communications

titre
Convergent stochastic Expectation Maximization algorithm with efficient sampling in high dimension. Application to deformable template model estimation
auteur
Estelle Kuhn, Stéphanie Allassonnière, Stanley Durrleman
article
8th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics (CMStatistics 2015), Dec 2015, London, United Kingdom. 2015
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titre
Learning spatio-temporal trajectories from manifold-valued longitudinal data
auteur
Jean-Baptiste Schiratti, Stéphanie Allassonniere, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
Neural Information Processing Systems, Dec 2015, Montréal, Canada. Advances in Neural Information Processing Systems, ⟨https://nips.cc/Conferences/current⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01245909/file/Poster_NIPS.pdf BibTex
titre
Convergent stochastic Expectation Maximization algorithm with efficient sampling in high dimension. Application to deformable template model estimation
auteur
Estelle Kuhn, Stéphanie Allassonniere, Stanley Durrleman
article
30-th European Meeting of Statisticians -EMS, 2015, NA, Netherlands. 2015
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Theses

titre
Statistical shape analysis of the anatomical variability of the human hippocampus in large populations.
auteur
Claire Cury
article
Neurons and Cognition [q-bio.NC]. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2015. English. ⟨NNT : 2015PA066021⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01133165/file/2015PA066021.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Extensive white matter involvement in patients with frontotemporal lobar degeneration: think progranulin
auteur
Paola Caroppo, Isabelle Le Ber, Agnès Camuzat, Fabienne Clot, Lionel Naccache, Foudil Lamari, Anne de Septenville, Anne Bertrand, Serge Belliard, Didier Hannequin, Olivier Colliot, Alexis Brice
article
JAMA neurology, American Medical Association (imprimé) / 2014, 71 (12), pp.1562-6
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BibTex
titre
The road ahead to cure Alzheimer’s disease: development of biological markers and neuroimaging methods for prevention trials across all stages and target populations
auteur
Enrica Cavedo, Simone Lista, Zaven S Khachaturian, Paul S Aisen, Philippe Amouyel, Karl Herholz, Clifford Jack, Reisa Sperling, Jeffrey Cummings, Kaj Blennow, Sid O'Bryant, Giovanni Frisoni, Ara Khachaturian, Miia Kivipelto, William Klunk, Karl Broich, Sandrine Andrieu, Michel Thiebaut de Schotten, Jean-François Mangin, Adriana Lammertsma, Keith Johnson, Stefan J Teipel, Alexander Drzezga, Arun L. W. Bokde, Olivier Colliot, Hovagim Bakardjian, Henrik Zetterberg, Bruno Dubois, Bruno Vellas, Lon Schneider, Harald Hampel
article
Journal of Prevention of Alzheimer’s Disease, 2014, 1 (3), pp.181-202. ⟨10.14283/jpad.2014.32⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01098836/file/JPAD_PDF_postprint.pdf BibTex
titre
Occlusion of vertebral artery due to transverse canal osteochondroma
auteur
S Fadili, Frédéric Clarençon, François Bonneville, Julien Savatovsky, Sandrine Deltour, Didier Dormont
article
Clinical Neuroradiology, Springer, 2014, 24 (4), pp.395-7. ⟨10.1007/s00062-013-0259-1⟩
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BibTex
titre
Neuroanatomical basis of paroxysmal sympathetic hyperactivity: a diffusion tensor imaging analysis
auteur
Holly E Hinson, Louis Puybasset, Nicolas Weiss, Vincent Perlbarg, Habib Benali, Damien Galanaud, Mike Lasarev, Robert D Stevens
article
Brain Injury, Taylor & Francis, 2014, 29 (4), pp.455-61. ⟨10.3109/02699052.2014.995229⟩
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BibTex
titre
Axial Diffusivity of the Corona Radiata at 24 Hours Post-Stroke: A New Biomarker for Motor and Global Outcome.
auteur
Eric Moulton, Mélika Amor-Sahli, Vincent Perlbarg, Christine Pires, Sophie Crozier, Damien Galanaud, Romain Valabregue, Marion Yger, Flore Baronnet-Chauvet, Yves Samson, Didier Dormont, Charlotte Rosso
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 10 (11), pp.e0142910
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BibTex
titre
Hyperglycaemia, insulin therapy and critical penumbral regions for prognosis in acute stroke: further insights from the INSULINFARCT trial.
auteur
Charlotte Rosso, Christine Pires, Jean-Christophe Corvol, Flore Baronnet, Sophie Crozier, Anne Leger, Sandrine Deltour, Romain Valabregue, Mélika Amor-Sahli, Stéphane Lehéricy, Didier Dormont, Yves Samson
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 10 (3), pp.e0120230
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BibTex
titre
Clinical and MRI characterization of MS patients with a pure and severe cognitive onset.
auteur
Rana Assouad, Celine Louapre, Ayman Tourbah, Caroline Papeix, Damien Galanaud, Catherine Lubetzki, Bruno Stankoff
article
Clinical Neurology and Neurosurgery, Elsevier, 2014, 126, pp.55-63
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BibTex
titre
Structural connectivity differences in left and right temporal lobe epilepsy
auteur
Pierre Besson, Vera Dinkelacker, Romain Valabregue, Lionel Thivard, Xavier Leclerc, Michel Baulac, Daniela Sammler, Olivier Colliot, Stéphane Lehéricy, Séverine Samson, Sophie Dupont
article
NeuroImage, Elsevier, 2014, pp.135-44
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BibTex
titre
Dramatic response of a BRAF V600E-mutated primary CNS histiocytic sarcoma to vemurafenib.
auteur
Ahmed Idbaih, Karima Mokhtari, Jean-François Emile, Damien Galanaud, Hayat Belaid, Simon de Bernard, Neila Benameur, Vlad-Ciprian Barlog, Dimitri Psimaras, Jean Donadieu, Catherine Carpentier, Nadine Martin-Duverneuil, Julien Haroche, Loic Feuvret, Noel Zahr, Jean-Yves Delattre, Khê Hoang-Xuan
article
Neurology, American Academy of Neurology, 2014, 83 (16), pp.1478-80. ⟨10.1212/WNL.0000000000000880⟩
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BibTex
titre
Graph analysis of functional brain networks: practical issues in translational neuroscience
auteur
Fabrizio de Vico Fallani, Jonas Richiardi, Mario Chavez, Sophie Achard
article
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2014, 369 (1653), pp.20130521. ⟨10.1098/rstb.2013.0521⟩
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BibTex
titre
Marked efficacy of vemurafenib in suprasellar Erdheim-Chester disease.
auteur
Fleur Cohen-Aubart, Jean-François Emile, Philippe Maksud, Damien Galanaud, Ahmed Idbaih, Dorian Chauvet, Yaël Amar, Neila Benameur, Zahir Amoura, Julien Haroche
article
Neurology, American Academy of Neurology, 2014, 83 (14), pp.1294-6. ⟨10.1212/WNL.0000000000000832⟩
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BibTex
titre
Cerebral tumor or pseudotumor?
auteur
D Leclercq, S Trunet, Anne Bertrand, Damien Galanaud, S Lehéricy, Didier Dormont, A Drier
article
Diagnostic and Interventional Imaging, Elsevier, 2014, 95 (10), pp.906-16. ⟨10.1016/j.diii.2014.08.004⟩
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BibTex
titre
Brain networks disconnection in early multiple sclerosis cognitive deficits: an anatomofunctional study.
auteur
Céline Louapre, Vincent Perlbarg, Daniel García-Lorenzo, Marika Urbanski, Habib Benali, Rana Assouad, Damien Galanaud, Léorah Freeman, Benedetta Bodini, Caroline Papeix, Ayman Tourbah, Catherine Lubetzki, Stéphane Lehéricy, Bruno Stankoff
article
Human Brain Mapping, Wiley, 2014, 35 (9), pp.4706-17
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BibTex
titre
Hierarchy of Neural Organization in the Embryonic Spinal Cord: Granger-Causality Graph Analysis of Calcium Imaging Data
auteur
Fabrizio de Vico Fallani, Martina Corazzol, Jenna Sternberg, Claire Wyart, Mario Chavez
article
IEEE Transactions on Neural Systems and Rehabilitation Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, pp.10. ⟨10.1109/TNSRE.2014.2341632⟩
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BibTex
titre
Detection of volume loss in hippocampal layers in Alzheimer's disease using 7 T MRI: a feasibility study
auteur
Claire Boutet, Marie Chupin, Stéphane Lehéricy, Linda Marrakchi-Kacem, Stéphane Epelbaum, Cyril Poupon, Christopher Wiggins, Alexandre Vignaud, Dominique Hasboun, Bénédicte Defontaines, Olivier Hanon, Bruno Dubois, Marie Sarazin, Lucie Hertz-Pannier, Olivier Colliot
article
Neuroimage-Clinical, Elsevier, 2014, 5, pp.341-8
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https://hal.inria.fr/hal-01099185/file/claire_boutet_2014_neuroimage_Clinical_published.pdf BibTex
titre
Extensive basal ganglia edema caused by a traumatic carotid-cavernous fistula: a rare presentation related to a basal vein of Rosenthal anatomical variation
auteur
Isabelle Ract, Aurélie Drier, Delphine Leclercq, Nader Sourour, Joseph Gabrieli, Marion Yger, Aurélien Nouet, Didier Dormont, Jacques Chiras, Frédéric Clarençon
article
British Journal of Neurosurgery, Taylor & Francis, 2014, 121 (1), pp.63-6. ⟨10.3171/2014.1.JNS132016⟩
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BibTex
titre
Dynamic Granger-causal networks of electricity spot prices: A novel approach to market integration
auteur
Giorgio Castagneto-Gissey, Mario Chavez, Fabrizio de Vico Fallani
article
Energy Economics, Elsevier, 2014, 44, pp.422-432. ⟨10.1016/j.eneco.2014.05.008⟩
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BibTex
titre
Human brain distinctiveness based on EEG spectral coherence connectivity.
auteur
Daria La Rocca, Patrizio Campisi, Balazs Vegso, Peter Cserti, Gyorgy Kozmann, Fabio Babiloni, Fabrizio de Vico Fallani
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, to be published. ⟨10.1109/TBME.2014.2317881⟩
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BibTex
titre
Perspective on future role of biological markers in clinical therapy trials of Alzheimer's disease: a long-range point of view beyond 2020
auteur
Harald Hampel, Simone Lista, Stefan J Teipel, Francesco Garaci, Robert Nisticò, Kaj Blennow, Henrik Zetterberg, Lars Bertram, Charles Duyckaerts, Hovagim Bakardjian, Alexander Drzezga, Olivier Colliot, Stéphane Epelbaum, Karl Broich, Stéphane Lehéricy, Alexis Brice, Zaven S Khachaturian, Paul S Aisen, Bruno Dubois
article
Biochemical Pharmacology, Elsevier, 2014, pp.426-49
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BibTex
titre
Optimal target localization for subthalamic stimulation in patients with Parkinson disease
auteur
Marie-Laure Welter, Michael Schüpbach, Virginie Czernecki, Carine Karachi, Sara Fernandez-Vidal, Jean-Louis Golmard, Giulia Serra, Soledad Navarro, Arlette Welaratne, Andréas Hartmann, Valérie Mesnage, Fanny Pineau, Philippe Cornu, Bernard Pidoux, Yulia Worbe, Panayiotis Zikos, David Grabli, Damien Galanaud, Anne-Marie Bonnet, Hayat Belaid, Didier Dormont, Marie Vidailhet, Luc Mallet, Jean-Luc Houeto, Eric Bardinet, Jerome Yelnik, Yves Agid
article
Neurology, American Academy of Neurology, 2014, 82 (15), pp.1352-61. ⟨10.1212/WNL.0000000000000315⟩
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BibTex
titre
Wavelet analysis in ecology and epidemiology: impact of statistical tests.
auteur
Bernard Cazelles, Kévin Cazelles, Mario Chavez
article
Interface, Mitchell Publ., 2014, 11 (91), pp.20130585. ⟨10.1098/rsif.2013.0585⟩
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BibTex
titre
White matter changes in comatose survivors of anoxic ischemic encephalopathy and traumatic brain injury: comparative diffusion-tensor imaging study
auteur
Anke W van der Eerden, Omid Khalilzadeh, Vincent Perlbarg, Julien Dinkel, Paola Sanchez, Pieter E Vos, Charles-Edouard Luyt, Robert D Stevens, Nicolas Menjot de Champfleur, Christine Delmaire, Eleonore Tollard, Rajiv Gupta, Didier Dormont, Steven Laureys, Habib Benali, Audrey Vanhaudenhuyse, Damien Galanaud, Louis Puybasset
article
Radiology, Radiological Society of North America, 2014, 270 (2), pp.506-16. ⟨10.1148/radiol.13122720⟩
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BibTex
titre
Long-term functional outcome of cardiac arrest survivors.
auteur
Anne Peskine, F. Baronnet, E. Bayen, Damien Galanaud, Pascale Pradat-Diehl, C. E. Luyt
article
Resuscitation, Elsevier, 2014, to be published. ⟨10.1016/j.resuscitation.2013.12.034⟩
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BibTex
titre
Long-Term Outcome of Neuro-Behçet's Disease
auteur
Nicolas Noel, Remy Bernard, Bertrand Wechsler, Matthieu Resche-Rigon, Raphaël Depaz, Du Le Thi Huong Boutin, Jean Charles Piette, Aurélie Drier, Didier Dormont, Patrice Cacoub, David Saadoun
article
Arthritis and Rheumatism, Wiley, 2014, pp.1306-1314. ⟨10.1002/art.38351⟩
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BibTex
titre
Nonparametric resampling of random walks for spectral network clustering.
auteur
Fabrizio de Vico Fallani, Vincenzo Nicosia, Vito Latora, Mario Chavez
article
Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, American Physical Society, 2014, 89 (1), pp.012802. ⟨10.1103/PhysRevE.89.012802⟩
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BibTex
titre
High-level gait and balance disorders in the elderly: a midbrain disease?
auteur
Adèle Demain, G W Max Westby, Sara Fernandez-Vidal, Carine Karachi, Fabrice Bonneville, Manh Cuong Do, Christine Delmaire, Didier Dormont, Eric Bardinet, Yves Agid, Nathalie Chastan, Marie-Laure Welter
article
Journal of Neurology, Springer Verlag, 2014, 261 (1), pp.196-206. ⟨10.1007/s00415-013-7174-x⟩
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BibTex
titre
Long-term white matter changes after severe traumatic brain injury: a 5-year prospective cohort.
auteur
Julien Dinkel, Aurélie Drier, Omid Khalilzadeh, Vincent Perlbarg, Virginie Czernecki, Rajiv Gupta, F. Gomas, Paola Sanchez, Didier Dormont, Damien Galanaud, Robert D. Stevens, Louis Puybasset
article
American Journal of Neuroradiology, American Society of Neuroradiology, 2014, 35 (1), pp.23-9. ⟨10.3174/ajnr.A3616⟩
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BibTex
titre
Abnormal functional connectivity between motor cortex and pedunculopontine nucleus following chronic dopamine depletion.
auteur
Miguel Valencia, Mario Chavez, Julio Artieda, J Paul Bolam, Juan Mena-Segovia
article
Journal of Neurophysiology, American Physiological Society, 2014, 111 (2), pp.434-40. ⟨10.1152/jn.00555.2013⟩
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BibTex
titre
Morphometry of anatomical shape complexes with dense deformations and sparse parameters
auteur
Stanley Durrleman, Marcel Prastawa, Nicolas Charon, Julie R Korenberg, S. Joshi, Guido Gerig, Alain Trouvé
article
NeuroImage, Elsevier, 2014, ⟨10.1016/j.neuroimage.2014.06.043⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01015771/file/2013_Neuroimage_Durrleman_author_copy.pdf BibTex
titre
Connectivity between right inferior frontal gyrus and supplementary motor area predicts after-effects of right frontal cathodal tDCS on picture naming speed.
auteur
Charlotte Rosso, R Valabregue, C Arbizu, S Ferrieux, P Vargas, F Humbert, Y Attal, A Messé, C Zavanone, Sabine Meunier, L Cohen, C Delmaire, A Thielscher, D M Herz, H R Siebner, Yves Samson, S Lehéricy
article
Brain Stimulation, Elsevier, 2014, 7 (1), pp.122-9
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BibTex
titre
Intracranial markers of emotional valence processing and judgments in music.
auteur
Diana Omigie, Delphine Dellacherie, Dominique Hasboun, Sylvain Clément, Michel Baulac, Claude Adam, Séverine Samson
article
Cognitive Neuroscience, Taylor and Francis, 2014, pp.1--8. ⟨10.1080/17588928.2014.988131⟩
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BibTex
titre
An Intracranial EEG Study of the Neural Dynamics of Musical Valence Processing.
auteur
Diana Omigie, Delphine Dellacherie, Dominique Hasboun, Nathalie George, Sylvain Clement, Michel Baulac, Claude Adam, Séverine Samson
article
Cerebral Cortex, Oxford University Press (OUP), 2014, pp.1--10. ⟨10.1093/cercor/bhu118⟩
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BibTex
titre
Unusual primary cerebral localization of a CIC-DUX4 translocation tumor of the Ewing sarcoma family
auteur
Franck Bielle, Marc Zanello, Delphine Guillemot, Marian Gil‑delgado, Anne Bertrand, Anne‑laure Boch, Paul Fréneaux, Karima Mokhtari
article
Acta Neuropathologica, Springer Verlag, 2014, 128, pp.309 - 311. ⟨10.1007/s00401-014-1312-0⟩
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BibTex
titre
Late dural relapse of a resected and irradiated pineal parenchymal tumor of intermediate differentiation.
auteur
Franck Bielle, Soledad Navarro, Anne Bertrand, Philippe Cornu, Jean-Jacques Mazeron, Anne Jouvet, Chiara Villa
article
Clinical Neuropathology, Dustri-Verlag, 2014, 33 (6), pp.424-7
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Conference papers

titre
Genetic Frontotemporal Dementia with TDP-43 Inclusions:Distinct Radiological Phenotypes between Patients with PGRN and C9ORF72 Mutations
auteur
Anne Bertrand, Fatima Ameur, Paola Caroppo, Didier Dormont, Alexis Brice, Isabelle Le Ber, Olivier Colliot
article
RSNA, Nov 2014, Chicago, United States
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BibTex
titre
Multimodal neuroimaging study in presymptomatic GRN mutations carriers
auteur
Paola Caroppo, Marie-Odile Habert, Stanley Durrleman, Hugo Bertin, Alexandre Routier, Vincent Perlbarg, Didier Hannequin, Basile Pinsart, Romain Valabrègue, Vincent Deramecourt, Florence Pasquier, Sophie Rivaud-Pechoux, Martine Vercelletto, Ali Bouyahia, Geoffrey Edouart, A. Guignebert, Habib Benali, Stéphane Lehericy, Olivier Colliot, Alexis Brice, Isabelle Le Ber
article
9th International Conference on Frontotemporal Dementias (ICFTD), Oct 2014, Vancouver, Canada
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titre
Iconic-Geometric Nonlinear Registration of a Basal Ganglia Atlas for Deep Brain Stimulation Planning
auteur
Ana B. Graciano Fouquier, Stanley Durrleman, Jérôme Yelnik, Sara Fernández-Vidal, Eric Bardinet
article
2nd International MICCAI Workshop on Deep Brain Stimulation Methodological Challenges (DBSMC), Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01108191/file/dbs_miccai_cameraready.pdf BibTex
titre
A Prototype Representation to Approximate White Matter Bundles with Weighted Currents
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Linda Marrakchi-Kacem, Yulia Worbe, Fabrizio de Vico Fallani, Mario Chavez, Sophie Lecomte, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
MICCAI 2014 - 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01010702/file/paper466_MICCAI2014.pdf BibTex
titre
Evaluation of morphometric descriptors of deep brain structures for the automatic classification of patients with Alzheimer’s disease, mild cognitive impairment and elderly controls
auteur
Alexandre Routier, Pietro Gori, Ana B. Graciano Fouquier, Sophie Lecomte, Olivier Colliot, Stanley Durrleman
article
MICCAI Workshop, Sep 2014, Cambridge, United States. pp.8
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https://hal.inria.fr/hal-01099081/file/Routier_et_al.pdf BibTex
titre
Diffeomorphic Shape Trajectories for Improved Longitudinal Segmentation and Statistics
auteur
Prasanna Muralidharan, James Fishbaugh, Hans J. Johnson, Stanley Durrleman, Jane S. Paulsen, Guido Gerig, Thomas P. Fletcher
article
17th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2014, Sep 2014, Boston, United States. pp.49 - 56, ⟨10.1007/978-3-319-10443-0_7⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01108237/file/2014_MICCAI_Muralidharan.pdf BibTex
titre
Incidence and characterization of supratentorial FLAIR hyperintenstities in patients with sporadic and genetic frontotemporal dementia
auteur
Anne Bertrand, Fatima Ameur, Paola Caroppo, Didier Dormont, Alexis Brice, Isabelle Le Ber, Olivier Colliot
article
AAIC 2014 - Alzheimer’s Association International Conference, Jul 2014, Copenhagen, Denmark
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titre
Fast Template-based Shape Analysis using Diffeomorphic Iterative Centroid
auteur
Claire Cury, Joan Alexis Glaunès, Marie Chupin, Olivier Colliot
article
MIUA 2014 - Medical Image Understanding and Analysis 2014, Jul 2014, Egham, United Kingdom. pp.39-44
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https://hal.inria.fr/hal-01050590/file/miua2014_sub22.pdf BibTex
titre
Automatic evolutionary medical image segmentation using deformable models
auteur
Andrea Valsecchi, Pablo Mesejo, Linda Marrakchi-Kacem, Stefano Cagnoni, Sergio Damas
article
16th IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC’14), Jul 2014, Beijing, China. pp.97-104, ⟨10.1109/CEC.2014.6900466⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01221343/file/paperFinal.pdf BibTex
titre
Outils statistiques pour l'analyse de formes dans des bases de données longitudinales : Applications à la neuro-anatomie normale et pathologique
auteur
Stanley Durrleman
article
Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France. 6 p
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00988878/file/Durrleman_RFIA_temporel.pdf BibTex
titre
Slab registration as a first step towards hippocampus subparts high resolution imaging at 7T
auteur
Linda Marrakchi-Kacem, Alexandre Vignaud, Johanne Germain, Julien Sein, Thomas R Henry, Poupon Cyril, Lucie Hertz-Pannier, Stephane Lehericy, Olivier Colliot, Pierre-François van de Moortele, Marie Chupin
article
ISMRM 2014 - Annual Meeting of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2014, Milan, Italy
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BibTex
titre
Geodesic regression of image and shape data for improved modeling of 4D trajectories
auteur
James Fishbaugh, Marcel Prastawa, Guido Gerig, Stanley Durrleman
article
ISBI 2014 - 11th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijin, China. pp.385 - 388, ⟨10.1109/ISBI.2014.6867889⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01108243/file/2014_ISBI_Fishbaugh_isbi2014.pdf BibTex
titre
Improved accuracy of the diagnosis of early Alzheimer’s disease using combined measures of hippocampal volume and sulcal morphology
auteur
Lorraine Hamelin, Leonardo Cruz de Souza, Fabian Corlier, Hélène Corne, Marie Chupin, Bruno Dubois, Michel Bottlaender, Olivier Colliot, Marie Sarazin
article
AAN 2014 - Annual Meeting of the American Academy of Neurology, Apr 2014, Philadelphia, United States
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BibTex
titre
Landmark-free 3D method for comparison of fossil hominins and hominids based on endocranium and EDJ shapes
auteur
Jean Dumoncel, Stanley Durrleman, José Braga, Jean-Pierre Jessel, Gérard Subsol
article
AAPA: American Association of Physical Anthropologists, Apr 2014, Calgary, Canada
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Book sections

titre
Shape Analysis for Brain Structures: A Review
auteur
Bernard Ng, Matthew Toews, Stanley Durrleman, Yonggang Shi
article
Li, Shuo and Tavares, João Manuel R. S. Shape Analysis in Medical Image Analysis, 14, Springer, 2014, Lecture Notes in Computational Vision and Biomechanics, 978-3-319-03813-1
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titre
Biomarqueurs IRM de la maladie d’Alzheimer : apport du traitement des images
auteur
Olivier Colliot
article
Tillement Jean-Paul; Hauw Jean-Jacques; Papadopoulos Vassilios. Vieillissement et démences : un défi médical, scientifique et socio-économique, Lavoisier, pp.25-37, 2014, Rapports de l’Académie Nationale de Médecine
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https://hal.inria.fr/hal-01098841/file/ANM-Final.pdf BibTex
titre
Diffeomorphic Iterative Centroid Methods for Template Estimation on Large Datasets
auteur
Claire Cury, Joan Alexis Glaunès, Olivier Colliot
article
Frank Nielsen. Geometric Theory of Information, Chapter 10, Springer, pp.273-299, 2014, ⟨10.1007/978-3-319-05317-2_10⟩
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Theses

titre
Etude des atteintes de la substance blanche liées aux performances motrices et de langage des patients après un accident vasculaire cérébral
auteur
Patricia Vargas
article
Sciences agricoles. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2014. Français. ⟨NNT : 2014PA066031⟩
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2013

Journal articles

titre
The cerebral cost of breathing: an FMRI case-study in congenital central hypoventilation syndrome.
auteur
Mike Sharman, Cécile Gallea, Katia Lehongre, Damien Galanaud, Nathalie Nicolas, Thomas Similowski, Laurent Cohen, Christian Straus, Lionel Naccache
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 9 (9), pp.e107850. ⟨10.1371/journal.pone.0107850⟩
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titre
Manifestations neurologiques de la maladie de Behçet [Neurological manifestations of Behçet's disease]
auteur
N. Noel, Aurélie Drier, B. Wechsler, J.-C. Piette, R. de Paz, Didier Dormont, P. Cacoub, D. Saadoun
article
La Revue De Médecine Interne, Elsevier, 2013, 35 (2), pp.112-120. ⟨10.1016/j.revmed.2013.10.332⟩
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titre
Deciphering logopenic primary progressive aphasia: a clinical, imaging and biomarker investigation.
auteur
Marc Teichmann, Aurélie Kas, Claire Boutet, Sophie Ferrieux, Marie Nogues, Dalila Samri, Christina Rogan, Didier Dormont, Bruno Dubois, Raffaella Migliaccio
article
Brain - A Journal of Neurology , Oxford University Press (OUP), 2013, 136 (11), pp.3474-3488. ⟨10.1093/brain/awt266⟩
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titre
Teaching neuroimages: Burkitt dural lymphoma mimicking a subacute subdural hematoma.
auteur
Bertrand Mathon, Aurélien Nouet, Chiara Villa, Karima Mokhtari, Hussa Alshehhi, Matthieu Faillot, Didier Dormont, Philippe Cornu, Delphine Leclercq
article
Neurology, American Academy of Neurology, 2013, 81 (17), pp.e128-9. ⟨10.1212/WNL.0b013e3182a956d0⟩
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titre
Imaging findings of intraventricular and ependymal lesions.
auteur
L. Vandesteen, Aurélie Drier, Damien Galanaud, F. Clarençon, Delphine Leclercq, C. Karachi, Didier Dormont
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, Elsevier Masson, 2013, 40 (4), pp.229-44. ⟨10.1016/j.neurad.2013.06.004⟩
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titre
Imaging of the optic chiasm and retrochiasmal visual pathways
auteur
Nicolas Menjot de Champfleur, S. Menjot de Champfleur, Damien Galanaud, N. Leboucq, A. Bonafé
article
Diagnostic and Interventional Imaging, Elsevier, 2013, 94 (10), pp.957-971. ⟨10.1016/j.diii.2013.06.012⟩
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titre
Magnetic resonance imaging for diagnosis of early Alzheimer's disease
auteur
Olivier Colliot, Lorraine Hamelin, Marie Sarazin
article
Revue Neurologique, Elsevier Masson, 2013, 169 (10), pp.724-8. ⟨10.1016/j.neurol.2013.07.013⟩
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titre
MEG Evidence for Dynamic Amygdala Modulations by Gaze and Facial Emotions
auteur
Thibaud Dumas, Stéphanie Dubal, Yohan Attal, Marie Chupin, Roland Jouvent, Shasha Morel, Nathalie George
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (9), pp.e74145. ⟨10.1371/journal.pone.0074145⟩
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titre
The clinical and anatomical heterogeneity of environmental dependency phenomena
auteur
Julien Lagarde, Romain Valabrègue, Jean-Christophe Corvol, Isabelle Le Ber, Olivier Colliot, Marie Vidailhet, Richard Levy
article
Journal of Neurology, Springer Verlag, 2013, 260 (9), pp.2262-70. ⟨10.1007/s00415-013-6976-1⟩
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titre
Node accessibility in cortical networks during motor tasks.
auteur
Mario Chavez, Fabrizio de Vico Fallani, Miguel Valencia, Julio Artieda, Donatella Mattia, Vito Latora, Fabio Babiloni
article
Neuroinformatics, Springer, 2013, 11 (3), pp.355-366. ⟨10.1007/s12021-013-9185-2⟩
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titre
Brain white matter oedema due to ClC-2 chloride channel deficiency: an observational analytical study.
auteur
Christel Depienne, Marianna Bugiani, Céline Dupuits, Damien Galanaud, Valérie Touitou, Nienke Postma, Carola van Berkel, Emiel Polder, Eleonore Tollard, Frédéric Darios, Alexis Brice, Christine E de Die-Smulders, Johannes S Vles, Adeline Vanderver, Graziella Uziel, Cengiz Yalcinkaya, Suzanna G Frints, Vera M Kalscheuer, Jan Klooster, Maarten Kamermans, Truus Em Abbink, Nicole I Wolf, Frédéric Sedel, Marjo S van der Knaap
article
Lancet Neurology, Elsevier, 2013, 12 (7), pp.659-668. ⟨10.1016/S1474-4422(13)70053-X⟩
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titre
Multiscale topological properties of functional brain networks during motor imagery after stroke
auteur
Fabrizio de Vico Fallani, Floriana Pichiorri, Giovanni Morone, Marco Molinari, Fabio Babiloni, Febo Cincotti, Donatella Mattia
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 83, pp.438-449. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.06.039⟩
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titre
Toward a Comprehensive Framework for the Spatiotemporal Statistical Analysis of Longitudinal Shape Data
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, José Braga, Guido Gerig, Nicholas Ayache
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2013, 103 (1), pp.22-59. ⟨10.1007/s11263-012-0592-x⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00813825/file/Durrleman_IJCV_2012_Longitudinal.pdf BibTex
titre
Remote synchronization reveals network symmetries and functional modules.
auteur
Vincenzo Nicosia, Miguel Valencia, Mario Chavez, Albert Díaz-Guilera, Vito Latora
article
Physical Review Letters, American Physical Society, 2013, 110 (17), pp.174102
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BibTex
titre
Network Redundancy Analysis of Effective Brain Networks; a Comparison of Healthy Controls and Patients with Major Depression
auteur
Lutz Leistritz, Thomas Weiss, Karl-Jürgen Bär, Fabrizio de Vico Fallani, Fabio Babiloni, Herbert Witte, Thomas Lehmann, Linda Chao
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (4), pp.1-10. ⟨10.1371/journal.pone.0060956⟩
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titre
Parkinson's disease patients show reduced cortical-subcortical sensorimotor connectivity
auteur
Michael Sharman, Romain Valabregue, Vincent Perlbarg, Linda Marrakchi-Kacem, Marie Vidailhet, Habib Benali, Alexis Brice, Stephane Lehéricy
article
Movement Disorders, Wiley, 2013, 28 (4), pp.447-454. ⟨10.1002/mds.25255⟩
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titre
Is Hippocampal Volume a Good Marker to Differentiate Alzheimer's Disease from Frontotemporal Dementia?
auteur
Leonardo Cruz de Souza, Marie Chupin, Maxime Bertoux, Stéphane Lehéricy, Bruno Dubois, Foudil Lamari, Isabelle Le Ber, Michel Bottlaender, Olivier Colliot, Marie Sarazin, Lorraine Hamelin
article
Journal of Alzheimer's Disease, IOS Press, 2013, 36 (1), pp.57-66. ⟨10.3233/JAD-122293⟩
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titre
Comparative performance evaluation of data-driven causality measures applied to brain networks
auteur
Angie Fasoula, Yohan Attal, Denis Schwartz
article
Journal of Neuroscience Methods, Elsevier, 2013, 215 (2), pp.170-189. ⟨10.1016/j.jneumeth.2013.02.021⟩
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BibTex
titre
Non-invasive, in vivo monitoring of neuronal transport impairment in a mouse model of tauopathy using MEMRI
auteur
Anne Bertrand, Umer Khan, Dung M. Hoang, Dmitry S. Novikov, Pavan Krishnamurthy, Hameetha B. Rajamohamed Sait, Benjamin W. Little, Einar M. Sigurdsson, Youssef Z. Wadghiri
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 64, pp.693 - 702. ⟨10.1016/j.neuroimage.2012.08.065⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01439335/file/neuroimage.pdf BibTex
titre
Assessment of Subcortical Source Localization Using Deep Brain Activity Imaging Model with Minimum Norm Operators: A MEG Study
auteur
Yohan Attal, Denis Schwartz
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (3), pp.e59856. ⟨10.1371/journal.pone.0059856⟩
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BibTex
titre
Subthalamic nucleus high-frequency stimulation restores altered electrophysiological properties of cortical neurons in parkinsonian rat.
auteur
Bertrand Degos, Jean-Michel Deniau, Mario Chavez, Nicolas Maurice
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (12), pp.e83608. ⟨10.1371/journal.pone.0083608⟩
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BibTex
titre
Micro-MRI Study of Cerebral Aging: Ex Vivo Detection of Hippocampal Subfield Reorganization, Microhemorrhages and Amyloid Plaques in Mouse Lemur Primates
auteur
Anne Bertrand, Adrien Pasquier, Alexandra Petiet, Christopher Wiggins, Audrey Kraska, Nelly Joseph-Mathurin, Fabienne Aujard, Nadine Mestre-Francé, Marc Dhenain
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8, ⟨10.1371/journal.pone.0056593.g002⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01407046/file/2013b%20Bertrand.pdf BibTex
titre
Spatiotemporal Dynamic Simulation of Acute Perfusion/Diffusion Ischemic Stroke Lesions Evolution: A Pilot Study Derived from Longitudinal MR Patient Data
auteur
Islem Rekik, Stéphanie Allassonnière, Stanley Durrleman, Trevor Carpenter, Joanna M Wardlaw
article
Computational and Mathematical Methods in Medicine, Hindawi Publishing Corporation, 2013, ⟨10.1155/2013/283593⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00935051/file/Rekik2013.pdf BibTex
titre
Spatial and Anatomical Regularization of SVM: A General Framework for Neuroimaging Data
auteur
Rémi Cuingnet, Joan Alexis Glaunès, Marie Chupin, Habib Benali, Olivier Colliot
article
IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 35 (3), pp.682 - 696. ⟨10.1109/TPAMI.2012.142⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00790079/file/cuingnet_ieee_tpami2013_postprint.pdf BibTex
titre
Sparse Adaptive Parameterization of Variability in Image Ensembles
auteur
Stanley Durrleman, Stéphanie Allassonnière, S. Joshi
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2013, 101 (1), pp.161-183. ⟨10.1007/s11263-012-0556-1⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00817565/file/Durrleman_IJCV.pdf BibTex

Conference papers

titre
Bayesian Atlas Estimation for the Variability Analysis of Shape Complexes
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Yulia Worbe, Linda Marrakchi-Kacem, Sophie Lecomte, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
MICCAI 2013 : Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.267-274, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_34⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01188791/file/MICCAI2013_GORI.pdf BibTex
titre
Geodesic image regression with a sparse parameterization of diffeomorphisms
auteur
James Fishbaugh, Marcel Prastawa, Guido Gerig, Stanley Durrleman
article
Geometric Science of Information, Aug 2013, Paris, France. pp.95-102
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BibTex
titre
Template Estimation for Large Database: A Diffeomorphic Iterative Centroid Method Using Currents
auteur
Claire Cury, Joan Alexis Glaunès, Olivier Colliot
article
GSI 2013 - First International Conference Geometric Science of Information, Aug 2013, Paris, France. pp.103-111, ⟨10.1007/978-3-642-40020-9_10⟩
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titre
Discriminating brain microbleeds using phase contrast MRI in a multicentre clinical setting
auteur
Takoua Kaaouana, Ludovic de Rochefort, Thomas Samaille, Nathalie Thierry, Geneviève Chêne, Christine Delmaire, Didier Dormont, Marie Chupin
article
2nd International Workshop on MRI Phase Contrast & Quantitative Susceptibility Mapping (QSM), Jul 2013, Ithaca NY, United States
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BibTex
titre
Geodesic Shape Regression in the Framework of Currents
auteur
James Fishbaugh, Marcel Prastawa, Guido Gerig, Stanley Durrleman
article
Information Processing in Medical Imaging, Jul 2013, Asilomar, United States. pp.718-729
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https://hal.inria.fr/hal-00935053/file/Fishbaugh_IPMI_2013.pdf BibTex
titre
Improving Efficiency of Data Assimilation Procedure for a Biomechanical Heart Model by Representing Surfaces as Currents
auteur
Alexandre Imperiale, Alexandre Routier, Stanley Durrleman, Philippe Moireau
article
FIMH - 7th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart - 2013, Jun 2013, London, United Kingdom. pp.342-351, ⟨10.1007/978-3-642-38899-6_41⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00841442/file/estimCurrentsFIMH13.pdf BibTex
titre
Evolutionary Medical Image Registration using Automatic Parameter Tuning
auteur
Andrea Valsecchi, Dubois-Lacoste Jérémie, Stützle Thomas, Sergio Damas, José Santamaria, Linda Marrakchi-Kacem
article
CEC-IEE- IEEE Congress On Evolutionary Computation, Jun 2013, Cancun, Mexico
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BibTex
titre
Genetic Algorithms for Voxel-based Medical Image Registration
auteur
Andrea Valsecchi, Sergio Damas, José Santamaria, Linda Marrakchi-Kacem
article
SSCI-IEEE Symposium Series on Computational Intelligence, Apr 2013, Singapore, Singapore
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BibTex
titre
Towards joint morphometry of white matter tracts and gray matter surfaces
auteur
Pietro Gori, Olivier Colliot, Yulia Worbe, Linda Marrakchi-Kacem, Sophie Lecomte, Cyril Poupon, Andreas Hartmann, Nicholas Ayache, Stanley Durrleman
article
Human Brain Mapping, 2013, Seattle, United States
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https://hal.inria.fr/hal-00816138/file/HBM_2013.pdf BibTex
titre
Deformetrics: describing and describing anatomical phenotypes with space deformations
auteur
Stanley Durrleman
article
Rank Prize Funds Symposium on Medical Imaging meets Computer Vision, 2013, Grasmere, United Kingdom
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BibTex

Directions of work or proceedings

titre
Proceedings of the Fourth International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Biological Shape Variability Modeling (MFCA 2013), Nagoya, Japan
auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Thomas Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads and Fletcher, Tom P. and Durrleman, Stanley and Sommer, Stefan. Inria, pp.132, 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00873631/file/MFCA2013_Proceedings.pdf BibTex

Theses

titre
Segmentation automatique des anomalies de la substance blanche du sujet âgé
auteur
Thomas Samaille
article
Neurosciences. Paris 6, 2013. Français
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2012

Journal articles

titre
Is radiological evaluation as good as computer-based volumetry to assess hippocampal atrophy in Alzheimer's disease?
auteur
Claire Boutet, Marie Chupin, Olivier Colliot, Marie Sarazin, Gurkan Mutlu, Aurélie Drier, Audrey Pellot, Didier Dormont, Stéphane Lehéricy
article
Neuroradiology, Springer Verlag, 2012, 54 (12), pp.1321-1330. ⟨10.1007/s00234-012-1058-0⟩
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BibTex
titre
Distinct patterns of antiamyloid-β antibodies in typical and atypical Alzheimer disease
auteur
Guillaume Dorothée, Michel Bottlaender, Edmond Moukari, Leonardo C de Souza, Renaud Maroy, Fabian Corlier, Olivier Colliot, Marie Chupin, Foudil Lamari, Stephane Lehéricy, Bruno Dubois, Marie Sarazin, Pierre Aucouturier
article
Archives of Neurology -Chigago-, American Medical Association, 2012, 69 (9), pp.1181-1185. ⟨10.1001/archneurol.2012.604⟩
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BibTex
titre
Gadolinium-staining reveals amyloid plaques in the brain of Alzheimer's transgenic mice
auteur
Alexandra Petiet, Mathieu Santin, Anne Bertrand, Christopher Wiggins, Fanny Petit, Diane Houitte, Philippe Hantraye, Jesus Benavides, Thomas Debeir, Thomas Rooney, Marc Dhenain
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2012, 33 (8), pp.1533-1544. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2011.03.009⟩
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BibTex
titre
Community structure in large-scale cortical networks during motor acts.
auteur
F. de Vico Fallani, A. Chessa, M. Valencia, Mario Chavez, L. Astolfi, F. Cincotti, D. Mattia, F. Babiloni
article
Chaos, Solitons and Fractals, Elsevier, 2012, Chaos and dynamics in biological networks, 45 (5), pp.603-610. ⟨10.1016/j.chaos.2012.02.006⟩
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BibTex
titre
Automatic hippocampal segmentation in temporal lobe epilepsy: impact of developmental abnormalities
auteur
Hosung Kim, Marie Chupin, Olivier Colliot, Boris C Bernhardt, Neda Bernasconi, Andrea Bernasconi
article
NeuroImage, Elsevier, 2012, 59 (4), pp.3178-3186. ⟨10.1016/j.neuroimage.2011.11.040⟩
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BibTex
titre
Contrast-based fully automatic segmentation of white matter hyperintensities: method and validation
auteur
Thomas Samaille, Ludovic Fillon, Rémi Cuingnet, Eric Jouvent, Hugues Chabriat, Didier Dormont, Olivier Colliot, Marie Chupin
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2012, 7 (11), pp.e48953. ⟨10.1371/journal.pone.0048953⟩
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https://hal.inria.fr/hal-00789657/file/journal.pone.0048953.PDF BibTex

Conference papers

titre
Segmentation of white matter hyperintensities: a comparison of automatic methods on multicentre data
auteur
Ludovic Fillon, Thomas Samaille, Eric Jouvent, Hugues Chabriat, Didier Dormont, Olivier Colliot, Marie Chupin
article
OHBM 2012 - 18th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2012, Beijing, China
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titre
Modelling morphological variability of the hippocampus using manifold learning and large deformations
auteur
Claire Cury, Joan Glaunès, Emilie Gerardin, Marie Chupin, Olivier Colliot
article
OHBM 2012 - 18th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2012, Pekin, China
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https://hal.inria.fr/hal-00816100/file/HBM_2012_abstract_4.pdf BibTex
titre
Dynamic Patient-specific Modeling of Ischemic Stroke Lesion Evolution: From Presentation to Final Damage using Diffusion, Perfusion and T2 MR imaging
auteur
Islem Rekik, Stéphanie Allassonniere, Carpenter Trevor, Joanna Wardlaw, Stanley Durrleman
article
XXI European Stroke Conference, May 2012, Lisbon, Portugal
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titre
Automatic segmentation of white matter hyperintensities robust to multicentre acquisition and pathological variability
auteur
Thomas Samaille, Olivier Colliot, Rémi Cuingnet, Eric Jouvent, Hugues Chabriat, Didier Dormont, Marie Chupin
article
SPIE 2012 - Symposium on Medical Imaging, Feb 2012, San Diego, United States. pp.1-9, ⟨10.1117/12.910268⟩
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Directions of work or proceedings

titre
Proceedings of Second International Workshop on Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data
auteur
Stanley Durrleman, Fletcher Tom, Guido Gerig, Marc Niethammer
article
S. Durrleman and T. Fletcher and G. Gerig and M. Niethammer. France. 7570, Springer, pp.163, 2012, Lecture Notes in Computer Science (LNCS), 978-3-642-33554-9. ⟨10.1007/978-3-642-33555-6⟩
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2004

Conference papers

titre
Integration of fuzzy structural information in deformable models
auteur
Olivier Colliot, Oscar Camara-Rey, Isabelle Bloch
article
Information Processing and Management of Uncertainty IPMU 2004, 2004, Perugia, Italy
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01930357/file/ipmu2004.pdf BibTex

2003

Conference papers

titre
3D nonlinear PET-CT image registration algorithm with constrained Free-Form Deformations
auteur
Oscar Camara, O. Colliot, Gaspar Delso, Isabelle Bloch
article
3rd IASTED International Conference on Visualization, Imaging, and Image Processing (VIIP 2003), 2003, Benalmadena, Spain
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01930355/file/article_viip.pdf BibTex

2002

Conference papers

titre
Brain symmetry plane computation in MR images using inertia axes and optimization
auteur
Alexander Tuzikov, Olivier Colliot, Isabelle Bloch
article
16th International Conference on Pattern Recognition, Aug 2002, Québec, Canada. ⟨10.1109/ICPR.2002.1044783⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01930349/file/icpr02.pdf BibTex
titre
Characterization of approximate plane symmetries for 3D fuzzy objects
auteur
Olivier Colliot, Isabelle Bloch, Alexander Tuzikov
article
9th International Conference on Information Processing and Management of Uncertainty IPMU 2002), Jul 2002, Annecy, France. pp.1749-1756
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01930352/file/ipmu2002.pdf BibTex

1999

Journal articles

titre
Evaluation of Gonadal Function in 107 Intersex Patients by Means of Serum Antimüllerian Hormone Measurement.
auteur
Rodolfo Rey, Corinne Belville, Claire Nihoul-Fékété, L Michel-Calemard, M Forest, Najiba Lahlou, Francis Jaubert, I Mowszowicz, Michel David, Nurcin Saka, Claire Bouvattier, Anne Bertrand, Claudine Lecointre, Sylvie Soskin, Sylvie Cabrol, Hélène Crosnier, Juliane Leger, Stéphen Lortat-Jacob, Marc Nicolino, Wolfgang Rabl, S Toledo, Firdevs Baş, Anne Gompel, Paul Czernichow, Nathalie Josso
article
Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, Endocrine Society, 1999, 84 (2), pp.627 - 631. ⟨10.1210/jcem.84.2.5507⟩
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