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Il y a 52 Résultats avec le mot clé : "Rencontre Inria Industrie"

© INRIA Sophie Auvin - M comme Multimédia

Génomique comparée, exploration et analyse (vidéo)

Equipe de recherche MAGNOME (Inria Bordeaux - Sud-Ouest) -

Les génomes d'organismes apparentés sont séquencés et comparés en routine pour des applications en biotechnologies et en santé. Magus est un système intégré pour gérer l'annotation, la comparaison et l'analyse de génomes similaires. Sa base de connaissances est reliée à des outils d'exploration et à des environnements d'analyse interactive comme Galaxy. Magus propose une API et un système de plug-ins pour l’intégration de développements à façon.

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Modélisation de réseaux, signatures de protéines et motifs à partir de données et connaissances incomplètes (vidéo)

Equipe de recherche DYLISS (Inria Rennes - Bretagne Atlantique) -

Nous présentons différents outils pour exhiber des modèles robustes synthétisant données et connaissances incomplètes (par exemple, venant d'espèces non modèles).  BioASP permet la confrontation efficace de connaissances et données "omiques". caspo est dédié à la reconstruction exhaustive de réseaux de signalisation. Protomata learner vise l'apprentissage de signature de familles de protéines. Logol est un couteau suisse très expressif pour l'identification de motifs.

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Simuler l'organisation des tissus sur des échelles histologiques (vidéo)

Equipe de recherche MAMBA (Inria Paris - Rocquencourt) -

Certain processus d’organisation tissulaire et de régénération sont simulés par un modèle à base d’agents dans lequel chaque cellule est présentée comme un individu. Ces modèles rendent compte de l’architecture spatiale à des échelles histologiques, et peuvent être directement exécutés à partir de reconstructions d’images 3D. Ainsi, ils permettent de lier l’architecture des tissus à leur fonction, et de représenter la variabilité intercellulaire. Les simulations peuvent être utilisées pour raffiner les modèles PKPD et PBPK.

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© INRIA Sophie Auvin - A comme Algorithme

CloudPower : service Cloud de calcul intensif pour les PME/PMI

Equipe de recherche AVALON (Inria Grenoble - Rhône-Alpes) -

Notre projet met en oeuvre une technologie issue de la recherche (CNRS, Inria) afin de proposer aux PMI/PME un accès facile et à la demande, aux ressources de calcul dont elles ont besoin. Cette technologie s'appuie sur le logiciel XtremWeb-HEP et permet de collecter les ressources informatiques sous-exploitées sur Internet pour construire une offre de supercalculateur virtuel permettant de fournir des services de calcul haute performance à la demande.

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DIYABC : méthodes bayésiennes approchées pour la génétique de populations

Institut de Mathématiques et Modélisation de Montpellier - I3M - Université Montpellier 2 -

DIYABC est un logiciel pour une analyse globale de l'histoire démographique des populations à partir de données de polymorphisme génétique. L'utilisateur peut étudier ou comparer différents scénarios d'évolution combinant des événements de divergences, rencontre (admixtures) ou changement de taille de populations. La dernière version (Cornuet et al. 2014) permet d'exploiter des données de type microsatellites, portion de séquence ADN ou SNP (single nucleotide polymorphism). Ce logiciel équipé d'une interface graphique conviviale a été conjointement développé avec le Centre de biologie pour la gestion des populations (INRA), fonctionne sur de nombreux systèmes d'exploitation et facilite le déplacement de la partie calculatoire sur un cluster de calcul.

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analyse de données intégrative pour les sciences de la vie

Société ALTRABIO -

L’intégration de connaissances et données hétérogènes est l’un des challenges clefs des problématiques complexes rencontrées dans la recherche académique et industrielle en sciences de la vie. Afin de relever ce challenge, AltraBio a développé une approche originale basée sur son expertise multidisciplinaire croisant médecine, biologie, statistique, data-mining et informatique. Nous aborderons les outils, compétences et expertises clefs d’AltraBio en nous concentrant plus particulièrement sur deux points :

1 - l’analyse de données d’expression génique et son application dans le cadre de la stratification de population en pharmaco-génomique et recherche de bio-marqueur (cf. application web WikiBioPath (WBP) qui est une plateforme intégrant base de connaissances et outils spécifiques afin de permettre l’interprétation contextuelle de données expérimentales d’expression génique.

2 - l’analyse de données de cytométrie de flux.

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Solution d'accès et d'exploitation d'applications de bio-informatique sur les Cloud hybrides (vidéo)

Société SYSFERA -

L'outil informatique (simulation, Big Data, etc.) est au cœur de la plupart des avancées de la recherche actuelle. Nous verrons comment l'utilisation de différents types de ressources (traditionnelles HPC et cloud) permettent d'accélérer la recherche en biologie, en santé et en écologie-environnement, grâce à SysFera-DS, la solution de pointe de SysFera. SysFera-DS est un portail web permettant aux utilisateurs métier d'accéder à des applications, graphiques ou en ligne de commande, d'une manière comparable au SaaS, sans nécessiter de connaissances avancées en informatique. Les chercheurs peuvent ainsi se concentrer sur leur cœur de métier tout en exploitant au mieux les moyens informatiques complexes mis à leur disposition.

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Modélisation de systèmes complexes en biologie

Société THE COSMO COMPAGNY -

Société lyonnaise, spin off de l’Ecole normale supérieure, qui a mis au point une plateforme logicielle très innovante permettant de comprendre, prédire et manager des systèmes extrêmement complexes. La plateforme créée à l’origine pour des applications en biologie systémique s’applique aussi à de nombreux autres domaines : la planification urbaine, la logistique, la sécurité des systèmes critiques…
La démonstration présentera plusieurs applications de la modélisation des systèmes complexes dans des applications industrielles en biologie : bioprocédés,  management de pandémie.

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SAMSON : Software for Adaptive Modeling and Simulation Of Nanosystems (vidéo)

Equipe de recherche NANO-D (Inria Grenoble - Rhône-Alpes) -

SAMSON est une plateforme logicielle générique pour la conception et l’étude de nanosystèmes. Les applications à la biologie, en particulier la biologie structurale, sont nombreuses, et nous présenterons par exemple la modification interactive de la structure de protéines, les possibilités d’alignement dans les cartes de densité, les algorithmes permettant la prédiction d’appariement de protéines.

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