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KisSplice : Assemblage local de transcriptomes (vidéo)

Equipe de recherche BAMBOO (Inria Grenoble - Rhône-Alpes) -

KisSplice est un logiciel qui permet d'analyser des données RNAseq avec ou sans génome de référence. C'est un assembleur local de transcriptome. Il permet d'identifier des SNPs, des indels et des évènements d'épissage alternatif. Il permet de traiter plusieurs conditions expérimentales, et ainsi quantifier chaque variant dans chaque condition. Il a de très bonnes performances mémoire (5Go pour 100M lectures).

Mots-clés :

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