Sites Inria

Il y a 8 Résultats avec le mot clé : "Genscale"

© Image Clipart

Transfert technologique

Collaboration réussie entre Korilog et Inria

Nathalie Lacaux - 18/06/2012

La société bretonne Korilog vient d’intégrer dans sa plate-forme logicielle la technologie PLAST, fruit de sa collaboration avec l’équipe de recherche Genscale du centre Inria de Rennes. Le plus de cet outil : une recherche de similarités de séquences génomiques banque-à-banque à la fois rapide et précis.

Mots-clés :

Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Collaboration réussie entre Korilog et Inria

Lire la suite

Bioinformatique - Logiciel

Koriplast

Jean-Michel Prima - 1/03/2012

PME bretonne de bio-informatique, Korilog édite des outils qui aident les biologistes à analyser les séquences d'ADN et de protéines. Elle débute avec l'équipe de recherche Genscale une collaboration visant à développer une solution pour gérer la pléthore d'informations issues du séquençage de nouvelle génération. Rencontre avec son fondateur, Patrick Durand.

Mots-clés :

Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Koriplast

Lire la suite

Technologie

Le génome de la framboise sur Raspberry Pi

Jean-Michel Prima - 1/07/2014

Des scientifiques viennent de parvenir à assembler les 400 millions de paires de bases du génome de la framboise sur un simple Raspberry Pi, un mini-ordinateur disposant seulement de 512 Mo de Ram. Objectif de cette performance : démontrer le très peu de mémoire vive nécessaire à la nouvelle génération de logiciels mis au point par Genscale, une équipe de bio-informatique au centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique. Cette nouvelle technologie est mise à disposition des biologistes dans GATB, une boîte à outils entièrement dédiée à l'assemblage génomique.

Mots-clés :

Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Le génome de la framboise sur Raspberry Pi

Lire la suite

Conférence scientifique

Conférence "Modélisation du vivant au sein de l'écosystème Inria - IRISA"

15/10/2013

Mardi 15 octobre à 11h00, quatre équipes de recherche en informatique communes au centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique et au laboratoire Irisa dont les thématiques sont centrées sur la modélisation du vivant, seront présentées.

Lieu : Salle Turing - Espace Conférences Inria - Centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique

Mots-clés :

Accueil > Centre > Rennes > Agenda > Conférence "Modélisation du vivant au sein de l'écosystème Inria - IRISA"

lire la suite

Jobim 2012 Rennes

Conférence - Bioinformatique

Conférence JOBIM 2012

3/07/2012 au 6/07/2012

Du 3 au 6 juillet 2012, Inria organise la 13e édition du colloque JOBIM : journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématique, le rendez-vous annuel de la communauté bio-informatique francophone, placé sous l’égide de la Société Française de Bio-Informatique (SFBI).

Lieu : Université de Rennes 1

Mots-clés :

Accueil > Centre > Rennes > Agenda > Conférence JOBIM 2012

lire la suite

KLAST : une nouvelle technologie de comparaison de séquences à haute performance (vidéo)

Equipe de recherchde GENSCALE (Inria Rennes - Bretagne Atlantique) et Korilog Sarl -

Korilog et Genscale feront une présentation de KLAST, depuis les fondements algorithmiques, jusqu'à ses applications en analyse de données de séquençage de nouvelle génération.

Mots-clés :

Accueil > Centre > Grenoble > Innovation > RII bio-informatique > Démos > Démo Korilog & Genscale

Lire la suite

Dominique Lavenier et Patrick Durand, équipe Genscale Dominique Lavenier et Patrick Durand

Technologie

Un outil d'analyse génomique pour le diagnostic cancer

Jean-Michel Prima - 4/04/2017

Développée par l'équipe de recherche GenScale, au centre Inria Rennes – Bretagne Atlantique, GATB est une boîte à outils pour l'analyse des données issues des séquenceurs génomiques de nouvelle génération. Elle comprend aujourd'hui une douzaine de logiciels spécialisés dans différentes tâches de bio-informatique. Les chercheurs prévoient d'y intégrer une nouvelle application destinée à faciliter le diagnostic pour le traitement des cancers dans les hôpitaux.

Mots-clés :

Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Un outil d'analyse génomique pour le diagnostic cancer

Lire la suite

Expédition Tara Océan ©S.Bollet / Fondation Tara Expeditions

Interdisciplinarité

Des outils innovants pour la metagénomique comparative

Jean-Michel Prima (*) - 6/02/2019

En analysant la distribution génomique du plancton dans des échantillons d'eau de mer, on pourrait à la fois mieux connaître cette biomasse et déterminer l'impact que le changement climatique aura sur elle.
Mais un problème se pose : dans ces échantillons, la flore microbienne est séquencée sans que l'on puisse séparer les individus. C'est comme si les morceaux de multiples puzzles avaient été mélangés dans une seule boîte. La comparaison de toutes ces pièces les unes avec les autres se heurte à la complexité des données et au manque de logiciels capables de les traiter. Financé par l'Agence nationale de la recherche et coordonné par l'équipe de recherche Inria GenScale, le projet HydroGen vient de donner naissance à deux outils pour aider les  biologistes à faire parler les données.

Mots-clés :

Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Des outils innovants pour la metagénomique comparative

Lire la suite

Haut de page

Suivez Inria