Il y a 8 Résultats avec le mot clé : "Genscale"
© Image Clipart
Transfert technologique
Collaboration réussie entre Korilog et Inria
La société bretonne Korilog vient d’intégrer dans sa plate-forme logicielle la technologie PLAST, fruit de sa collaboration avec l’équipe de recherche Genscale du centre Inria de Rennes. Le plus de cet outil : une recherche de similarités de séquences génomiques banque-à-banque à la fois rapide et précis.
Mots-clés :
- Korilog
- KLAST
- BLAST
- Génome
- INRIA Rennes - Bretagne Atlantique
- GenScale
- Patrick Durand
- Dominique Lavenier
- Séquençage
Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Collaboration réussie entre Korilog et Inria
Bioinformatique - Logiciel
Koriplast
PME bretonne de bio-informatique, Korilog édite des outils qui aident les biologistes à analyser les séquences d'ADN et de protéines. Elle débute avec l'équipe de recherche Genscale une collaboration visant à développer une solution pour gérer la pléthore d'informations issues du séquençage de nouvelle génération. Rencontre avec son fondateur, Patrick Durand.
Mots-clés :
Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Koriplast
Technologie
Le génome de la framboise sur Raspberry Pi
Des scientifiques viennent de parvenir à assembler les 400 millions de paires de bases du génome de la framboise sur un simple Raspberry Pi, un mini-ordinateur disposant seulement de 512 Mo de Ram. Objectif de cette performance : démontrer le très peu de mémoire vive nécessaire à la nouvelle génération de logiciels mis au point par Genscale, une équipe de bio-informatique au centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique. Cette nouvelle technologie est mise à disposition des biologistes dans GATB, une boîte à outils entièrement dédiée à l'assemblage génomique.
Mots-clés :
Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Le génome de la framboise sur Raspberry Pi
Conférence scientifique
Conférence "Modélisation du vivant au sein de l'écosystème Inria - IRISA"
Mardi 15 octobre à 11h00, quatre équipes de recherche en informatique communes au centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique et au laboratoire Irisa dont les thématiques sont centrées sur la modélisation du vivant, seront présentées.
Lieu : Salle Turing - Espace Conférences Inria - Centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique
Mots-clés :
- Biogenouest
- Modélisation du vivant
- DYLISS
- GenScale
- Visages
- Serpico
- INRIA Rennes - Bretagne Atlantique
Accueil > Centre > Rennes > Agenda > Conférence "Modélisation du vivant au sein de l'écosystème Inria - IRISA"
Conférence - Bioinformatique
Conférence JOBIM 2012
Du 3 au 6 juillet 2012, Inria organise la 13e édition du colloque JOBIM : journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématique, le rendez-vous annuel de la communauté bio-informatique francophone, placé sous l’égide de la Société Française de Bio-Informatique (SFBI).
Lieu : Université de Rennes 1
Mots-clés :
- Genscale
- Dyliss
- Bioinformatique
- JOBIM
- INRIA Rennes - Bretagne Atlantique
- Biologie
- Informatique
- Mathématiques
KLAST : une nouvelle technologie de comparaison de séquences à haute performance (vidéo)
Korilog et Genscale feront une présentation de KLAST, depuis les fondements algorithmiques, jusqu'à ses applications en analyse de données de séquençage de nouvelle génération.
Mots-clés :
Accueil > Centre > Grenoble > Innovation > RII bio-informatique > Démos > Démo Korilog & Genscale
Dominique Lavenier et Patrick Durand
Technologie
Un outil d'analyse génomique pour le diagnostic cancer
Développée par l'équipe de recherche GenScale, au centre Inria Rennes – Bretagne Atlantique, GATB est une boîte à outils pour l'analyse des données issues des séquenceurs génomiques de nouvelle génération. Elle comprend aujourd'hui une douzaine de logiciels spécialisés dans différentes tâches de bio-informatique. Les chercheurs prévoient d'y intégrer une nouvelle application destinée à faciliter le diagnostic pour le traitement des cancers dans les hôpitaux.
Mots-clés :
Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Un outil d'analyse génomique pour le diagnostic cancer
©S.Bollet / Fondation Tara Expeditions
Interdisciplinarité
Des outils innovants pour la metagénomique comparative
En analysant la distribution génomique du plancton dans des échantillons d'eau de mer, on pourrait à la fois mieux connaître cette biomasse et déterminer l'impact que le changement climatique aura sur elle.
Mais un problème se pose : dans ces échantillons, la flore microbienne est séquencée sans que l'on puisse séparer les individus. C'est comme si les morceaux de multiples puzzles avaient été mélangés dans une seule boîte. La comparaison de toutes ces pièces les unes avec les autres se heurte à la complexité des données et au manque de logiciels capables de les traiter. Financé par l'Agence nationale de la recherche et coordonné par l'équipe de recherche Inria GenScale, le projet HydroGen
vient de donner naissance à deux outils pour aider les biologistes à faire parler les données.
Mots-clés :
- ADN
- Génome
- Séquençage
- Genscale
- INRIA Rennes - Bretagne Atlantique
- DiscoSnp
- Simka
- Tara Océan
- Pierre Peterlongo
Accueil > Centre > Rennes > Actualités > Des outils innovants pour la metagénomique comparative
Centres de recherche Inria
