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Il y a 7 Resultats avec le mot cle : "GenScale"

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Transfert technologique

Collaboration réussie entre Korilog et Inria

Nathalie Lacaux - 18/06/2012

La société bretonne Korilog vient d’intégrer dans sa plate-forme logicielle la technologie PLAST, fruit de sa collaboration avec l’équipe de recherche Genscale du centre Inria de Rennes. Le plus de cet outil : une recherche de similarités de séquences génomiques banque-à-banque à la fois rapide et précis.

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Bioinformatique - Logiciel

Koriplast

Jean-Michel Prima - 1/03/2012

PME bretonne de bio-informatique, Korilog édite des outils qui aident les biologistes à analyser les séquences d'ADN et de protéines. Elle débute avec l'équipe de recherche Genscale une collaboration visant à développer une solution pour gérer la pléthore d'informations issues du séquençage de nouvelle génération. Rencontre avec son fondateur, Patrick Durand.

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Technologie

Le génome de la framboise sur Raspberry Pi

Jean-Michel Prima - 1/07/2014

Des scientifiques viennent de parvenir à assembler les 400 millions de paires de bases du génome de la framboise sur un simple Raspberry Pi, un mini-ordinateur disposant seulement de 512 Mo de Ram. Objectif de cette performance : démontrer le très peu de mémoire vive nécessaire à la nouvelle génération de logiciels mis au point par Genscale, une équipe de bio-informatique au centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique. Cette nouvelle technologie est mise à disposition des biologistes dans GATB, une boîte à outils entièrement dédiée à l'assemblage génomique.

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Conférence scientifique

Conférence "Modélisation du vivant au sein de l'écosystème Inria - IRISA"

15/10/2013

Mardi 15 octobre à 11h00, quatre équipes de recherche en informatique communes au centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique et au laboratoire Irisa dont les thématiques sont centrées sur la modélisation du vivant, seront présentées.

Lieu : Salle Turing - Espace Conférences Inria - Centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique

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Jobim 2012 Rennes

Conférence - Bioinformatique

Conférence JOBIM 2012

3/07/2012 au 6/07/2012

Du 3 au 6 juillet 2012, Inria organise la 13e édition du colloque JOBIM : journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématique, le rendez-vous annuel de la communauté bio-informatique francophone, placé sous l’égide de la Société Française de Bio-Informatique (SFBI).

Lieu : Université de Rennes 1

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KLAST : une nouvelle technologie de comparaison de séquences à haute performance (vidéo)

Equipe de recherchde GENSCALE (Inria Rennes - Bretagne Atlantique) et Korilog Sarl -

Korilog et Genscale feront une présentation de KLAST, depuis les fondements algorithmiques, jusqu'à ses applications en analyse de données de séquençage de nouvelle génération.

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Dominique Lavenier et Patrick Durand, équipe Genscale Dominique Lavenier et Patrick Durand

Technologie

Un outil d'analyse génomique pour le diagnostic cancer

Jean-Michel Prima - 4/04/2017

Développée par l'équipe de recherche GenScale, au centre Inria Rennes – Bretagne Atlantique, GATB est une boîte à outils pour l'analyse des données issues des séquenceurs génomiques de nouvelle génération. Elle comprend aujourd'hui une douzaine de logiciels spécialisés dans différentes tâches de bio-informatique. Les chercheurs prévoient d'y intégrer une nouvelle application destinée à faciliter le diagnostic pour le traitement des cancers dans les hôpitaux.

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