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Rencontre Inria Industrie

Programme de la journée du 11 février 2014

Au programme de cette journée sur la bio-informatique et les outils numériques pour la santé : participation de professionnels du domaine, d'intervenants de renom et présentation de nombreuses technologies et d'applications innovantes.

Programme de la journée du 11 février 2014

9h00

Accueil des participants autour d’un petit-déjeuner

9h30

Discours d'introduction

par     Michel Cosnard , Président-directeur général d' Inria

9h45

Matinée conférence

  • Médecine systémique des maladies respiratoires : une vraie rupture

par le  Professeur Christophe Pison CHU de Grenoble,  MD, PhD, Chef de la Clinique Universitaire Pneumologie, Institut du Thorax 

Après avoir exposé le poids des maladies respiratoires et les succès limités dans la guérison de celles-ci, le professeur Pison présentera les projets de recherche européens en cours dans ce domaine ainsi que les défis à relever en bio-informatique pour être plus efficient.

  • Modèles et Outils Bio-Informatiques pour la Biologie et la Santé

  par Alain Viari, Directeur Scientifique Adjoint pour les Sciences de la Vie et l'Environnement, Inria

Cet exposé vise à donner un aperçu des activités de modélisation, d'analyse et simulation actuellement menées chez Inria dans le domaine de la biologie moléculaire et cellulaire. Il s’appuiera sur les démonstrateurs proposés dans le cadre de ces rencontres.

Nous illustrerons plusieurs aspects concernant :

  • la biologie structurale et l'analyse de structures 3D de complexes protéiques;
  • le traitement des données "omiques", notamment les données "Next Generation Sequencing" pour l'étude des génomes et transcriptomes;
  • l'analyse et d'exploitation de grands volumes de données hétérogènes;
  • la simulation en biologie systémique aux échelles moléculaires (réseaux de régulation génique, réseaux de signalisation, évolution in silico) et cellulaires (régénération tissulaire);
  • le suivi et le contrôle temps-réel de processus cellulaires, par imagerie cellulaire et dispositifs micro-fluidiques
Pause café
  • bioMérieux & diagnostic in-vitro : besoins et enjeux en bioinformatique

par  Jean-Baptiste Veyrieras , bioMérieux,  Responsable du laboratoire Données et Connaissance, Département de Recherche Technologique

La bio-informatique (lato sensu ) est désormais une discipline et une compétence pivot pour la réussite de nombreux projets de R&D chez bioMérieux. La recherche de bio-marqueurs et l’évaluation de nouvelles technologies nécessitent en effet la mise en œuvre d’approches d’inférence et d’apprentissage à partir d’ensembles de données de plus en plus vastes et complexes. Nous présenterons l’état actuel de ces besoins ainsi que quelques perspectives importantes pour les applications de demain.

  •   BIOASTER : approches multi-omiques pour de nouvelles solutions dans le domaine des maladies infectieuses

par  Christophe d'Enfert, BIOASTER,  Directeur Scientifique et Chef de l’Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques, Institut Pasteur, Paris

L’Institut de Recherche Technologique BIOASTER a été créé en mai 2012 dans le cadre des Investissements d’Avenir. Il s’agit du seul IRT dans le domaine de la santé, focalisé sur les maladies infectieuses et la microbiologie. BIOASTER se situe à l’interface de la recherche académique et du développement industriel avec deux ambitions :

  • Développer des technologies innovantes permettant de résoudre les verrous rencontrés par les industriels et PMEs du secteur des maladies infectieuses et de la microbiologie ;
  • Soutenir le développement de nouveaux produits dans les domaines du diagnostic, du médicament, et du vaccin à l’aide de ses différents plateaux techniques.

Les plateaux techniques que BIOASTER a mis en place depuis sa création ou auxquels il a accès par son réseau de partenaires permettent de développer des approches multi-omiques qui doivent accélérer l’identification de solutions diagnostiques, préventives ou thérapeutiques. L’enjeu est sans aucun doute dans la synergie qui pourra être faite de la combinaison de ces données de natures diverses (génomique, métagénomique, transcriptomique, métabolomique, immunomique). C’est pour cela que BIOASTER a comme priorité la mise en place d’un plateau permettant à ses partenaires académiques, PMEs et industriels d’accéder à des capacités de stockage, de calcul et d’analyse des données au plus haut niveau.

12h30

Discours de clôture

par  François Sillion , Directeur, Inria Grenoble - Rhône-Alpes

13h00

Ouverture du showroom de technologies innovantes et déjeuner buffet

 

25 démonstrations de technologies innovantes seront présentées (programme des démonstrations) par les équipes Inria, des PME partenaires, le pôle Lyonbiopôle et l'Agence pour les mathématiques en interaction avec l'entreprise et la société.

14h30 - 16h30

Présentations "flash" d’innovations technologiques

Présentations "flash" (8 mn) en parallèle du showroom organisées par le pôle Lyonbiopôle.

  • Analyse de Données Intégrative
    AltraBio - Pierre-Emmanuel Jouve
  • La Fédération Lyonnaise de Modélisation et Sciences Numériques
    FLMSN - Violaine Louvet
  • Highly sensitive and efficient RNAi screening for accelerate your drug development
    GENEL - Céline Paillier, Gaëlle Saint Auret
  • Concevoir et développer les outils de diagnostic clinique de demain, fondés sur l’utilisation des technologies de séquençage génomique et métagénomique à très haut débit
    Genostar  - François Rechenmann
  • Traitement, Modélisation et Visualisation d’images médicales
    Kitware - Julien Jomier
  • Carpaccio : Programme pour l'analyse des muscles
    SATT Lyon Saint-Etienne / Lyon Science Transfert - Brian Rudkin
  • Elexir : une puissante plate-forme intégrée pour l'analyse du transcriptome
    SATT Lyon Saint-Etienne / Lyon Science Transfert - Didier Auboeuf
  • Solution d'accès et d'exploitation d'applications de bio-informatique sur les Cloud hybrides
    Sysfera - David Loureiro
  • Des données à la simulation et au contrôle des procédés biologiques
    The Cosmo Company - Thierry de Lumley

17h30

Clôture

Un espace de rencontres d'affaires sera mis à disposition des participants.

Localisation

Mots-clés : Rencontre Inria Industrie Santé Innovation Centre de recherche Grenoble Rhône-Alpes Bio-informatique

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