Publications de l'équipe SERPICO

2012

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Confinement induces actin flow in a meiotic cytoplasm.

Auteurs

Mathieu Pinot; Villier Steiner; Benoit Dehapiot; Byung-Kuk Yoo; Franck Chesnel; Laurent Blanchoin; Charles Kervrann; Zoher Gueroui

Détail

Proceedings- National Academy of Sciences Usa, 2012, epub ahead of print

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Communications avec actes

Titre

Tracking Growing Axons by Particle Filtering in 3D+t Fluorescent Two-Photon Microscopy Images

Auteurs

Huei-Fang Yang; Xavier Descombes; Charles Kervrann; Caroline Medioni; Florence Besse

Détail

Asian Conference on Computer Vision, Nov 2012, Daejeon, Korea, Republic Of.

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2011

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Simultaneous motion detection and background reconstruction with a conditional mixed-state markov random field

Auteurs

Tomas Crivelli; Patrick Bouthemy; Bruno Cernuschi-Frias; Jian-Feng Yao

Détail

International Journal of Computer Vision, Kluwer Academic Publishers, 2011, 94 (3), pp. 295-316

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Titre

Cryo-Electron Tomography of microtubules assembled in vitro from purified components.

Auteurs

Frédéric Coquelle; Sophie Blestel; Claire Heichette; Isabelle Arnal; Charles Kervrann ; Denis Chrétien

Détail

Methods in Molecular Biology -Clifton then Totowa-, Clifton, N.J. : Humana Press, 2011, Microtubule Dynamics: Methods and Protocols, 777, pp. 193-208

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Titre

Advanced microcopy to study tracking and spatiotemporal organization of intracellular membranes

Auteurs

Bertrand Cinquin; Alexandre Gidon; Anatole Chessel; Thierry Pecot; Jérôme Boulanger; Charles Gueudry; Charles Kervrann; Jean Salamero

Détail

Bio-Medical Materials and Engineering, IOS Press, 2011

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Communications sans actes

Titre

How does GTP-hydrolysis destabilize the microtubule lattice ?

Auteurs

Audrey Guesdon; Sophie Blestel; Charles Kervrann ; Denis Chrétien

Détail

12th Congres of the French Society for Microscopy, Jun 2011, Strasbourg, France.

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Titre

Interaction of +TIPs with microtubule ends

Auteurs

Frédéric Coquelle; Audrey Guesdon; Morgane Angevin; Thomas Chenuel; Morgane Chrétien; Claire Heichette; Sophie Blestel; Charles Kervrann ; Isabelle Arnal; Denis Chrétien

Détail

12th Congres of the French Society for Microscopy, Jun 2011, Strasbourg, France.

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Titre

Cryo-electron tomography of macromolecular assemblies: from quantum dots to 3D crystals of proteins

Auteurs

Audrey Guesdon; Frédéric Coquelle; Sophie Blestel; Emeline Pollet; Benjamin Vitre; Morgane Angevin; Claire Heichette; Isabelle Arnal; Charles Kervrann ; Denis Chrétien

Détail

12th Congres of the French Society for Microscopy, Jun 2011, Strasbourg, France.

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Titre

Structure of Paramecium trichocysts

Auteurs

Emeline Pollet; Cathy Fisch; Audrey Guesdon; Claire Heichette; Pascale Dupuis-Williams; Charles Kervrann ; Amelie Leforestier; Denis Chrétien

Détail

12th Congres of the French Society for Microscopy, Jun 2011, Strasbourg, France.

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Conférences invitées

Titre

Change detection methods in fluorescence live cell imaging for sub-cellular trafficking analysis

Auteurs

Charles Kervrann ; Jérôme Boulanger; Anatole Chessel; Bertrand Cinquin; Jean Salamero

Détail

BioImage Informatics II, Sep 2011, Ashburn VA, United States.

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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre

Mixed-state Markov models in image motion analysis

Auteurs

Tomas Crivelli; Bruno Cernuschi-Frias; Patrick Bouthemy; Jian-Feng Yao

Détail

Springer. Machine Learning for Vision-Based Motion Analysis, 1st Edition., 2011, XIV, 372 pages, SpringerLink, Part 2, 77-115, 2011, Theory and Techniques Series: Advances in Pattern Recognition / Wang, L.; Zhao, G.; Cheng, L.; Pietikäinen, M. (Eds.), 978-0-85729-056-4

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2010

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Assessment of standard coil positioning in transcranial magnetic stimulation in depression

Auteurs

Cecilia Nauczyciel; Pierre Hellier; Xavier Morandi; Sophie Blestel; Dominique Drapier; Jean-Christophe Ferre; Christian Barillot; Bruno Millet

Détail

Psychiatry Research, elsevier, 2010

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Titre

A Patch-Based Method for Repetitive and Transient Event Detection in Fluorescence Imaging

Auteurs

Jérôme Boulanger; Alexandre Gidon; Charles Kervrann; Jean Salamero

Détail

PLoS ONE, PLoS, 2010, 5 (10), pp. e13190

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Titre

Condensed Mitotic Chromosome Structure at Nanometer Resolution Using PALM and EGFP- Histones

Auteurs

Atsushi Matsuda; Lin Shao; Jérôme Boulanger; Charles Kervrann; Peter M. Carlton; Peter Kner; David Agard; John W. Sedat

Détail

PLoS ONE, PLoS, 2010, 5 (9), pp. e12768

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Titre

Real time ultrasound image denoising

Auteurs

Fernanda Palhano Xavier De Fontes; Guillermo Andrade Barroso; Pierrick Coupé; Pierre Hellier

Détail

Journal of Real-Time Image Processing, Springer, 2010

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Titre

An automatic geometrical and statistical method to detect acoustic shadows in intraoperative ultrasound brain images

Auteurs

Pierre Hellier; Pierrick Coupé; Xavier Morandi; D. Louis Collins

Détail

Medical Image Analysis, elsevier, 2010, 14 (2), pp. 195-204

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Titre

Patch-Based Nonlocal Functional for Denoising Fluorescence Microscopy Image Sequences

Auteurs

Jérôme Boulanger; Charles Kervrann; Patrick Bouthemy; Peter Elbau; Jean-Baptiste Sibarita; Jean Salamero

Détail

IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE, 2010, 29 (2), pp. 442-453

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Articles de vulgarisation scientifique

Titre

Informatique et médecine

Auteurs

Pierre Hellier

Détail

Doc Sciences, CRDP Versailles, 2010

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Communications avec actes

Titre

An Anthropomorphic Polyvinyl Alcohol Triple-Modality Brain Phantom based on Colin27

Auteurs

Sean Jy-Shyang Chen; Pierre Hellier; Jean-Yves Gauvrit; Maud Marchal; Xavier Morandi; D. Louis Collins

Détail

springer. MEDICAL IMAGE COMPUTING AND COMPUTER-ASSISTED INTERVENTION – MICCAI 2010, Sep 2010, Pekin, China. 6362, pp. 92-100, LNCS

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Titre

Electron cryo-tomography of microtubule assemblies: automatic segmentation of tomograms with CryoSeg.

Auteurs

Sophie Blestel; C. Fish; Claire Heichette; P. Dupuys-Williams; Denis Chrétien; Charles Kervrann

Détail

EMBO Conference Series on Microtubules - Structure, Regulation and Functions, Jun 2010, Heidelberg, Germany. pp. 72

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Titre

Three dimensional reconstruction of 14 protofilaments GMPCPP-microtubules using TubuleJ.

Auteurs

Audrey Guesdon; Sophie Blestel; Claire Heichette; Charles Kervrann; Denis Chrétien

Détail

EMBO Conference Series on Microtubules - Structure, Regulation and Functions, Jun 2010, Heidelberg, Germany. pp. 127

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Titre

Effects of XMAP215 on microtubule dynamics and structure and its visualization by electron cryo-tomography.

Auteurs

Frédéric Coquelle; Sophie Blestel; K. Kinoshita; Benjamin Vitre; Claire Heichette; Charles Kervrann; Isabelle Arnal; Denis Chrétien

Détail

EMBO Conference Series on Microtubules - Structure, Regulation and Functions, Jun 2010, Heidelberg, Germany. pp. 97

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Titre

A detection-based framework for the analysis of recycling in TIRF microscopy

Auteurs

Anatole Chessel; Bertrand Cinquin; Sabine Bardin; Jérôme Boulanger; Jean Salamero; Charles Kervrann

Détail

IEEE. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI 2010), Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp. 1281-1284

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Communications sans actes

Titre

Une plateforme logicielle de neurochirurgie assistée par l'image

Auteurs

Alexandre Abadie; Romain Carpentier; Pierre Hellier; Pierre Jannin; Jean-Yves Gauvrit; Sylma Diabara; Pierre-Louis Henaux; Laurent Riffaud; Claire Haegelen; Abderrahmane Hamlat; Gilles Brassier; Xavier Morandi

Détail

Congrès de la Société de Neurochirurgie de Langue Française, Dec 2010, Paris, France.

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Titre

Structural basis of the interaction between microtubules and +TIPs

Auteurs

Isabelle Arnal; Frédéric Coquelle; Sophie Blestel; Benjamin Vitre; Claire Heichette; Charles Kervrann; Denis Chrétien

Détail

EMBO Conference Series on Microtubules - Structure, Regulation and Functions (2010), Jun 2010, Heidelberg, Germany.

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Titre

Electron cryo-tomography of microtubule assemblies: automatic segmentation of tomograms with CryoSeg

Auteurs

Sophie Blestel; C. Fish; Claire Heichette; P. Dupuys-Williams; Denis Chrétien; C. Kervrann

Détail

EMBO Conference Series on Microtubules - Structure, Regulation and Functions., Jun 2010, Heidelberg, Germany.

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Titre

Three dimensional reconstruction of 14 protofilaments GMPCPP-microtubules using TubuleJ

Auteurs

Audrey Guesdon; Sophie Blestel; Claire Heichette; C. Kervrann; Denis Chrétien

Détail

EMBO Conference Series on Microtubules - Structure, Regulation and Functions., Jun 2010, Heidelberg, Germany.

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Titre

Non-local means filter and novel bayesian approximations for non-local image regularization

Auteurs

Charles Kervrann

Détail

SIAM Imaging Science 2010, Apr 2010, Chicago, United States.

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Titre

A detection based framework for systematic analysis of dual color TIRF microscopy

Auteurs

Anatole Chessel; Bertrand Cinquin; François Waharte; Charles Kervrann; Jean Salamero

Détail

Focus on Microscopy (FOM'10), Mar 2010, Shangai, China.

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HDR

Titre

Image processing methods for 3D intraoperative ultrasound

Auteurs

Pierre Hellier

Détail

Université Rennes 1, Jun. 2010. English

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Titre

Modèles statistiques pour l'analyse d'images, algorithmes et applications en imagerie bio-cellulaire et moléculaire

Auteurs

Charles Kervrann

Détail

Université Rennes 1, Jun. 2010. French

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Documents sans référence de publication

Titre

Multiscale neighborhood-wise decision fusion for redundancy detection in image pairs

Auteurs

Charles Kervrann; Jérôme Boulanger; Thierry Pecot; Patrick Perez; Jean Salamero

Détail

Apr. 2010. SIAM Journal Multiscale Modeling & Simulation (in revision)

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2009

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Comparison of piece-wise linear, linear, and nonlinear atlas-to-patient warping techniques: Analysis of the labeling of subcortical nuclei for functional neurosurgical applications

Auteurs

M. Chakravarty; Abbas F. Sadikot; Jürgen Germann; Pierre Hellier; Gilles Bertrand; D. Louis Collins

Détail

Human Brain Mapping, Wiley, 2009, 30 (11), pp. 3574–3595

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Communications sans actes

Titre

Evaluation de la précision d'une méthode de recalage automatique échographie 3D intra-opératoire – IRM pré-opératoire en neurochirurgie

Auteurs

Pierre-Louis Henaux; Pierre Hellier; Pierre Jannin; Pierrick Coupé; Claire Haegelen; Sylma Diabara; Xavier Morandi

Détail

Congrès de la Société de Neurochirurgie de Langue Française, Dec 2009, paris, France.

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2008

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

TMS and neuronavigation in treatment of depression: a view into the future

Auteurs

Cecilia Nauczyciel; Laure Guibert; Pierre Hellier; Dominique Drapier; Nathalie Le Garzic; Xavier Morandi; Bruno Millet

Détail

L'Encéphale, elsevier, 2008, 34 (6), pp. 625-8

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2005

Directions d'ouvrages

Titre

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (Editorial)

Auteurs

Pierre Hellier; David Haynor; Christian Barillot

Détail

P. Hellier, D.R. Haynor, C. Barillot. 10, Wiley, pp. 197, Jun. 2005

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2004

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

A hierarchical parametric algorithm for deformable multimodal image registration

Auteurs

Pierre Hellier; Christian Barillot

Détail

Computer Methods and Programs in Biomedicine, Elsevier, 2004, 75 (2), pp. 107-115

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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre

Inter-subject non-rigid registration: an overview with classification and the Romeo algorithm

Auteurs

Pierre Hellier

Détail

J. Suri, D. Wilson, S. Laxminarayan. Handbook of medical image analysis, volume III: segmentation and registration methods, Kluwer, pp. 273-338, Nov. 2004

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Ouvrages scientifiques

Titre

Proceedings of Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2004

Auteurs

Barillot Christian; David R. Haynor; Pierre Hellier

Détail

Springer, pp. 2044, Sep. 2004

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2003

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Robust multiscale deformable registration of 3D ultrasound images

Auteurs

I. Pratikakis; Christian Barillot; Pierre Hellier; Etienne Memin

Détail

International Journal of Image and Graphics, World Scientific Publishing Company, 2003, 3 (4), pp. 547-566

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Titre

Retrospective evaluation of intersubject brain registration

Auteurs

Pierre Hellier; Christian Barillot; Isabelle Corouge; Bernard Gibaud; G. Le Goualher; D. Louis Collins; Allan Evans; Grégoire Malandain; Nicholas Ayache; G. E. Christensen; H.J. Johnson

Détail

IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE, 2003, 22 (9), pp. 1120 - 1130

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Titre

Interindividual functional mapping: a nonlinear local approach

Auteurs

Isabelle Corouge; Pierre Hellier; Bernard Gibaud; Christian Barillot

Détail

NeuroImage, Elsevier, 2003, 19 (4), pp. 1337-1348

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Titre

Coupling dense and landmark-based approaches for non rigid registration

Auteurs

Pierre Hellier; Christian Barillot

Détail

IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE, 2003, 22 (2), pp. 217 - 227

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2001

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Segmentation of brain 3D MR images using level sets and dense registration

Auteurs

Caroline Baillard; Pierre Hellier; Christian Barillot

Détail

Medical Image Analysis, elsevier, 2001, 5 (3), pp. 185-194

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Titre

Hierarchical estimation of a dense deformation field for 3-D robust registration

Auteurs

Pierre Hellier; Christian Barillot; Etienne Memin; Patrick Pérez

Détail

IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE, 2001, 20 (5), pp. 388 - 402

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2000

Thèses

Titre

Recalage non rigide en imagerie cérébrale : méthodes et validation

Auteurs

Pierre Hellier

Détail

Université Rennes 1, Dec. 2000. French

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