Publications de l'équipe PARIETAL

2012

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Hyperfrontality and hypoconnectivity during refreshing in schizophrenia.

Auteurs

Marie-Laure Grillon; Catherine Oppenheim; Gaël Varoquaux; Frédérique Charbonneau; Anne-Dominique Devauchelle; Marie-Odile Krebs; Franck Bayle; Bertrand Thirion; Caroline Huron

Détail

Psychiatry Research: Neuroimaging, Elsevier, 2012, epub ahead of print

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Titre

Significant correlation between a set of genetic polymorphisms and a functional brain network revealed by feature selection and sparse Partial Least Squares

Auteurs

Edith Le Floch; Vincent Guillemot; Vincent Frouin; Philippe Pinel; Christophe Lalanne; Laura Trinchera; Arthur Tenenhaus; Antonio Moreno; Monica Zilbovicius; Thomas Bourgeron; Stanislas Dehaene; Bertrand Thirion; Jean-Baptiste Poline; Edouard Duchesnay

Détail

NeuroImage, 2012, 63 (1), pp. 11-24

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Titre

Multi-scale Mining of fMRI data with Hierarchical Structured Sparsity

Auteurs

Rodolphe Jenatton; Alexandre Gramfort; Vincent Michel; Guillaume Obozinski; Evelyn Eger; Francis Bach; Bertrand Thirion

Détail

SIAM Journal on Imaging Sciences, SIAM, 2012, 5 (3), pp. 835-856

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Titre

An empirical comparison of surface-based and volume-based group studies in neuroimaging

Auteurs

Alan Tucholka; Virgile Fritsch; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

NeuroImage, 2012, pp. na

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Titre

Detecting Outliers in High-Dimensional Neuroimaging Datasets with Robust Covariance Estimators

Auteurs

Virgile Fritsch ; Gaël Varoquaux; Benjamin Thyreau; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16, pp. 1359-1370

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Titre

A-Brain: Using the Cloud to Understand the Impact of Genetic Variability on the Brain

Auteurs

Gabriel Antoniu ; Alexandru Costan; Benoit Da Mota; Bertrand Thirion; Radu Tudoran

Détail

ERCIM News, ERCIM EEIG, 2012, pp. 21-22

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Titre

Mixed-norm estimates for the M/EEG inverse problem using accelerated gradient methods

Auteurs

Alexandre Gramfort ; Matthieu Kowalski; Matti Hämäläinen

Détail

Physics in Medicine and Biology, IOP Science, 2012, 57 (7), pp. 1937-1961

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Titre

Automatic fiber bundle segmentation in massive tractography datasets using a multi-subject bundle atlas.

Auteurs

P. Guevara; D. Duclap; C. Poupon; L. Marrakchi-Kacem; P. Fillard; D. Lebihan; M. Leboyer; J. Houenou; J.-F. Mangin

Détail

NeuroImage, Elsevier, 2012, epub ahead of print

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Titre

Markov models for fMRI correlation structure: is brain functional connectivity small world, or decomposable into networks?

Auteurs

Gaël Varoquaux ; Alexandre Gramfort; Jean Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Journal of Physiology - Paris, Elsevier, 2012, 106, pp. 212-221

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Titre

In Situ Synchrotron Microtomography Reveals Multiple Reaction Pathways During Soda-Lime Glass Synthesis

Auteurs

Emmanuelle Gouillart; Michael-J. Toplis; Julien Grynberg; Marie-Hélène Chopinet; Elin Sondergard; Luc Salvo; Michel Suéry; Marco Di Michiel; Gaël Varoquaux

Détail

Journal of the American Ceramic Society, 2012, 95 (5), pp. 1504-1507

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Communications avec actes

Titre

A Novel Sparse Graphical Approach for Multimodal Brain Connectivity Inference

Auteurs

Bernard Ng; Gaël Varoquaux; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France.

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Titre

Joint T1 and Brain Fiber Log-Demons Registration Using Currents to Model Geometry

Auteurs

Viviana Siless; Joan Glaunès; Pamela Guevara; Jean-François Mangin; Cyril Poupon; Denis Le Bihan; Bertrand Thirion; Pierre Fillard

Détail

MICCAI, Oct 2012, Nice, France, France.

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Titre

Sparse DSI: Learning DSI structure for denoising and fast imaging

Auteurs

Alexandre Gramfort ; Poupon Cyril; Maxime Descoteaux

Détail

MICCAI, Oct 2012, Nice, France. Springer

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Titre

A MapReduce Approach for Ridge Regression in Neuroimaging-Genetic Studies

Auteurs

Benoit Da Mota; Michael Eickenberg; Soizic Laguitton; Vincent Frouin; Gaël Varoquaux ; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

DCICTIA-MICCAI - Data- and Compute-Intensive Clinical and Translational Imaging Applications in conjonction with the 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2012, Oct 2012, Nice, France.

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Titre

Improving accuracy and power with transfer learning using a meta-analytic database

Auteurs

Yannick Schwartz; Gaël Varoquaux; Christophe Pallier; Philippe Pinel; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

MICCAI, Oct 2012, Nice, France. pp. 1-8

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Titre

Non-parametric Density Modeling and Outlier Detection in Medical Imaging Datasets

Auteurs

Virgile Fritsch ; Gaël Varoquaux ; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Fei Wang and Dinggang Shen and Pingkun Yan and Kenji Suzuki. Machine Learning in Medical Imaging - Miccai 2012 workshop, Oct 2012, Nice, France. pp. 207-214

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Titre

Learning to rank from medical imaging data

Auteurs

Fabian Pedregosa ; Alexandre Gramfort ; Gaël Varoquaux ; Elodie Cauvet; Christophe Pallier; Bertrand Thirion

Détail

MLMI 2012 - 3rd International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging, Oct 2012, Nice, France.

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Titre

Improved brain pattern recovery through ranking approaches

Auteurs

Fabian Pedregosa ; Alexandre Gramfort ; Gaël Varoquaux ; Bertrand Thirion; Christophe Pallier; Elodie Cauvet

Détail

PRNI 2012 : 2nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom.

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Titre

On spatial selectivity and prediction across conditions with fMRI

Auteurs

Yannick Schwartz; Gaël Varoquaux; Bertrand Thirion

Détail

PRNI 2012 : 2nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom. pp. 53-56

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Titre

Connectivity-informed Sparse Classifiers for fMRI Brain Decoding

Auteurs

Bernard Ng; Viviana Siless; Gaël Varoquaux; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion; Rafeef Abugharbieh

Détail

Pattern Recognition in Neuroimaging, Jul 2012, London, United Kingdom.

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Titre

Multilayer Scattering Image Analysis Fits fMRI Activity in Visual Areas

Auteurs

Michael Eickenberg; Alexandre Gramfort; Bertrand Thirion

Détail

International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom.

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Titre

Decoding Visual Percepts Induced by Word Reading with fMRI

Auteurs

Alexandre Gramfort ; Christophe Pallier; Gaël Varoquaux; Bertrand Thirion

Détail

Pattern Recognition in NeuroImaging (PRNI), 2012 International Workshop on, Jul 2012, Londres, United Kingdom. pp. 13-16

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Titre

Small-sample brain mapping: sparse recovery on spatially correlated designs with randomization and clustering

Auteurs

Gaël Varoquaux ; Alexandre Gramfort; Bertrand Thirion

Détail

John, Langford and Joelle, Pineau. International Conference on Machine Learning, Jun 2012, Edimbourg, United Kingdom.

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Titre

Template-Based Tractography for Clinical Neonatal Diffusion Imaging Data

Auteurs

Natasha Lepore ; Fernando Yepes ; Yi Lao; Ashok Panigraphy; Rafael Cheschin; Subhashree Ravichandran; Marvin D. Nelson; Pierre Fillard

Détail

Template-Based Tractography for Clinical Neonatal Diffusion Imaging Data, Feb 2012, San Francisco CA, United States.

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Titre

A fast computational framework for genome-wide association studies with neuroimaging data

Auteurs

Benoit Da Mota; Vincent Frouin; Edouard Duchesnay; Soizic Laguitton; Gaël Varoquaux; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

20th International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT 2012), Aug 2012, Limassol, Cyprus.

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Titre

Statistical Learning for Resting-State fMRI: Successes and Challenges

Auteurs

Gaël Varoquaux ; Bertrand Thirion

Détail

Gearg Langs, Irina Rish, Moritz Grosse-Wentrup, Brain Murphy. Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging, NIPS workshop, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain. Springer, pp. 172-177, 2012

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Titre

A Comparative Study of Algorithms for Intra- and Inter-subjects fMRI Decoding

Auteurs

Vincent Michel; Alexandre Gramfort; Evelyn Eger; Gaël Varoquaux ; Bertrand Thirion

Détail

Georg Langs, Irina Rish, Moritz Grosse-Wentrup, Brain Murphy. MLINI - Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging - 2011, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain. Springer, Lecture Notes in Computer Science, pp. 1-8, 2012

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2011

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Scikit-learn: Machine Learning in Python

Auteurs

Fabian Pedregosa; Gaël Varoquaux; Alexandre Gramfort; Vincent Michel; Bertrand Thirion; Olivier Grisel; Mathieu Blondel; Peter Prettenhofer; Ron Weiss; Vincent Dubourg; Jake Vanderplas; Alexandre Passos; David Cournapeau; Matthieu Brucher; Matthieu Perrot; Édouard Duchesnay

Détail

Journal of Machine Learning Research, MIT Press, 2011

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Titre

Quantitative evaluation of 10 tractography algorithms on a realistic diffusion MR phantom.

Auteurs

Pierre Fillard; Maxime Descoteaux; Alvina Goh; Sylvain Gouttard; Ben Jeurissen; James Malcolm; Alonso Ramirez-Manzanares; Marco Reisert; Ken Sakaie; Fatima Tensaouti; Ting Yo; Jean-François Mangin; Cyril Poupon

Détail

NeuroImage, Elsevier, 2011, 56 (1), pp. 220-34

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Titre

A supervised clustering approach for fMRI-based inference of brain states

Auteurs

Vincent Michel; Alexandre Gramfort; Gaël Varoquaux; Evelyn Eger; Christine Keribin; Bertrand Thirion

Détail

Pattern Recognition, elsevier, 2011, epub ahead of print

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Titre

Multiclass Sparse Bayesian Regression for fMRI-Based Prediction

Auteurs

Vincent Michel; Evelyn Eger; Christine Keribin; Bertrand Thirion

Détail

International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi, 2011, 2011, epub

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Titre

Registration, Atlas Estimation and Variability Analysis of White Matter Fiber Bundles Modeled as Currents

Auteurs

Stanley Durrleman; Pierre Fillard; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache

Détail

NeuroImage, elsevier, 2011, 55 (3), pp. 1073-1090

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Titre

The NumPy array: a structure for efficient numerical computation

Auteurs

Stefan Van Der Walt; S. Chris Colbert; Gaël Varoquaux

Détail

Computing in Science and Engineering, IEEE, 2011, 13 (2), pp. 22-30

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Titre

Total variation regularization for fMRI-based prediction of behaviour.

Auteurs

Vincent Michel; Alexandre Gramfort; Gaël Varoquaux; Evelyn Eger; Bertrand Thirion

Détail

IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE, 2011, 30 (7), pp. 1328 - 1340

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Titre

Mayavi: 3D visualization of scientific data

Auteurs

Prabhu Ramachandran; Gaël Varoquaux

Détail

Computing in Science & Engineering, IEEE, 2011, 13 (2), pp. 40-51

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Titre

DTI registration in atlas based fiber analysis of infantile Krabbe disease.

Auteurs

Yi Wang; Aditya Gupta; Zhexing Liu; Hui Zhang; Maria L Escolar; John H Gilmore; Sylvain Gouttard; Pierre Fillard; Eric Maltbie; Guido Gerig; Martin Styner

Détail

NeuroImage, Elsevier, 2011, epub ahead of print

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Titre

Voxelwise multivariate statistics and brain-wide machine learning using the full diffusion tensor.

Auteurs

Anne-Laure Fouque; Pierre Fillard; Anne Bargiacchi; Arnaud Cachia; Monica Zilbovicius; Benjamin Thyreau; Edith Le Floch; Philippe CIUCIU; Edouard Duchesnay

Détail

Med Image Comput Comput Assist Interv, Springer, 2011, 14 (Pt 2), pp. 9-16

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Titre

Forward Field Computation with OpenMEEG.

Auteurs

Alexandre Gramfort; Théodore Papadopoulo; Emmanuel Olivi; Maureen Clerc

Détail

Comput Intell Neurosci, Hindawi Publishing Corporation, 2011, 2011, pp. 923703

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Titre

Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines

Auteurs

Pierre Fillard; Xavier Pennec; Paul Thompson; Nicholas Ayache

Détail

NeuroImage, undefined or unknown publisher, 2011

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Communications avec actes

Titre

Apport des dictionnaires temps-fréquence, de la parcimonie et des structures pour l'imagerie cérébrale fonctionnelle M/EEG

Auteurs

Alexandre Gramfort; Daniel Strohmeier; Jens Haueisen; Matti Hämäläinen; Matthieu Kowalski

Détail

GRETSI 2011, Sep 2011, Bordeaux, France. pp. ID45

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Titre

Multi-subject dictionary learning to segment an atlas of brain spontaneous activity

Auteurs

Gaël Varoquaux; Alexandre Gramfort; Fabian Pedregosa; Vincent Michel; Bertrand Thirion

Détail

Information Processing in Medical Imaging, Jul 2011, Kaufbeuren, Germany. Springer, Information Processing in Medical Imaging, 6801, pp. 562-573, Lecture Notes in Computer Science

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Titre

Functional brain imaging with M/EEG using structured sparsity in time-frequency dictionaries

Auteurs

Alexandre Gramfort; Daniel Strohmeier; Jens Haueisen; Matti Hamalainen; Matthieu Kowalski

Détail

International Conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI '11), Jul 2011, Irsee, Germany. Springer, Information Processing in Medical Imaging, 6801, pp. 600-611

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Titre

A probabilistic framework to infer brain functional connectivity from anatomical connections

Auteurs

Fani Deligianni; Gaël Varoquaux; Bertrand Thirion; Emma Robinson; David Sharp; David Edwards; Daniel Rueckert

Détail

Information Processing in Medical Imaging, Jul 2011, Kaufbeuren, Germany. Springer, Information Processing in Medical Imaging, 6801, pp. 296-307

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Titre

M/EEG source reconstruction based on Gabor thresholding in the source space

Auteurs

Daniel Strohmeier; Alexandre Gramfort; Jens Haueisen; Matti Hämäläinen; Matthieu Kowalski

Détail

NFSI 2011, May 2011, Banff, Canada. pp. ??

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Titre

MULTIFRACTAL ANALYSIS OF RESTING STATE NETWORKS IN FUNCTIONAL MRI

Auteurs

Philippe Ciuciu; Gaël Varoquaux; Patrice Abry; Moty Almog

Détail

IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2011, Chicago, United States. paper ID 1544

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Titre

Multi-scale Mining of fMRI Data with Hierarchical Structured Sparsity

Auteurs

Rodolphe Jenatton; Alexandre Gramfort; Vincent Michel; Guillaume Obozinski; Francis Bach; Bertrand Thirion

Détail

PRNI 2011 - IEEE International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, May 2011, Seoul, Korea, Republic Of. IEEE

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Titre

Detecting Outlying Subjects in High-Dimensional Neuroimaging Datasets with Regularized Minimum Covariance Determinant

Auteurs

Virgile Fritsch; Gaël Varoquaux; Thyreau Benjamin; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. Springer-Verlag, 14th International Conference, Toronto, Canada, September 18-22, 2011, Part III, pp. 264-271

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Titre

Connectivity-informed fMRI Activation Detection

Auteurs

Bernard Ng; Abugharbieh Rafeef; Gaël Varoquaux; Jean Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Gabor Fichtinger and Anne Martel and Terry Peters. Medical Image Computing and Computed Aided Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. Springer-Verlag, 14th International Conference, Toronto, Canada, September 18-22, 2011, 6892, pp. 285-292, 2011

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Communications sans actes

Titre

Accelerating ISTA with an active set strategy

Auteurs

Matthieu Kowalski ; Pierre Weiss ; Alexandre Gramfort; Sandrine Anthoine

Détail

OPT 2011: 4th International Workshop on Optimization for Machine Learning, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain.

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Titre

Beyond brain reading: randomized sparsity and clustering to simultaneously predict and identify

Auteurs

Alexandre Gramfort ; Gaël Varoquaux; Bertrand Thirion

Détail

Springer. NIPS 2011 MLINI Workshop, Dec 2011, Granada, Spain. Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging, pp. 9-16

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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre

Statistical Computing On Non-Linear Spaces For Computational Anatomy

Auteurs

Xavier Pennec; Pierre Fillard

Détail

Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Biomedical Image Analysis: Methodologies And Applications, Springer, 2011

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Titre

Joint T1 and Brain Fiber Diffeomorphic Registration Using the Demons

Auteurs

Viviana Siless; Pamela Guevara; Xavier Pennec; Pierre Fillard

Détail

Liu, Tianming and Shen, Dinggang and Ibanez, Luis and Tao, Xiaodong. Multimodal Brain Image Analysis, 7012, Springer Berlin / Heidelberg, pp. 10-18, 2011, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-642-24445-2

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Documents associés à des manifestations scientifiques (Tutoriel, poster/prés./préface, papier court, digest de conférence, …)

Titre

Adjoint method for lead-fields computation in MEEG.

Auteurs

Emmanuel Olivi; Alexandre Gramfort; Théodore Papadopoulo; Maureen Clerc

Détail

[Poster]. HBM'2011, Jun 2011, Québec City, Canada

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2010

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Phase delays within visual cortex shape the response to steady-state visual stimulation.

Auteurs

Benoit Cottereau; Jean Lorenceau; Alexandre Gramfort; Maureen Clerc; Bertrand Thirion; Sylvain Baillet

Détail

NeuroImage, Elsevier, 2010, epub ahead of print

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Titre

Tracking cortical activity from M/EEG using graph-cuts with spatiotemporal constraints.

Auteurs

Alexandre Gramfort; Théodore Papadopoulo; Sylvain Baillet; Maureen Clerc

Détail

NeuroImage, Elsevier, 2010, epub ahead of print

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Titre

OpenMEEG: opensource software for quasistatic bioelectromagnetics.

Auteurs

Alexandre Gramfort; Theodore Papadopoulo; Emmanuel Olivi; Maureen Clerc

Détail

BioMedical Engineering OnLine, BioMed Central, 2010, 9 (1), pp. 45

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Titre

A priori par normes mixtes pour les problèmes inverses: Application à la localisation de sources en M/EEG

Auteurs

Matthieu Kowalski; Alexandre Gramfort

Détail

Traitement du Signal, 2010, 27 (1), pp. 51-76

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Titre

A group model for stable multi-subject ICA on fMRI datasets.

Auteurs

Gaël Varoquaux; Sepideh Sadaghiani; Philippe Pinel; Andreas Kleinschmidt; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

NeuroImage, 2010, 51 (1), pp. 288-99

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Titre

Graph-Based Variability Estimation in Single-Trial Event-Related Neural Responses.

Auteurs

Alexandre Gramfort; R. Keriven; Maureen Clerc

Détail

IEEE Trans Biomed Eng, IEEE, 2010, epub ahead of print

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Titre

Inference of a HARDI fiber bundle atlas using a two-level clustering strategy.

Auteurs

Pamela Guevara; Cyril Poupon; Denis Rivière; Yann Cointepas; Linda Marrakchi; Maxime Descoteaux; Pierre Fillard; Bertrand Thirion; Jean-François Mangin

Détail

Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, springer, 2010, 13 (Pt 1), pp. 550-7

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Communications avec actes

Titre

Brain covariance selection: better individual functional connectivity models using population prior

Auteurs

Gaël Varoquaux; Alexandre Gramfort; Jean Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Richard Zemel and John Shawe-Taylor. Advances in Neural Information Processing Systems, Dec 2010, Vancouver, Canada. Advances in Neural Information Processing Systems

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Titre

Multi-Class Sparse Bayesian Regression for Neuroimaging data analysis

Auteurs

Vincent Michel; Evelyn Eger; Christine Keribin; Bertrand Thirion

Détail

International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging (MLMI) In conjunction with MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. 6357, pp. 50-58, LNCS

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Titre

Detection of brain functional-connectivity difference in post-stroke patients using group-level covariance modeling

Auteurs

Gaël Varoquaux; Flore Baronnet; Andreas Kleinschmidt; Pierre Fillard; Bertrand Thirion

Détail

Dinggang Shen and Alejandro Frangi and Gabor Szekely. Medical Image Computing and Computer Added Intervention, Sep 2010, Beijing, China. Springer, Lecture Notes in Computer Science

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Titre

Parcellation Schemes and Statistical Tests to Detect Active Regions on the Cortical Surface

Auteurs

Bertrand Thirion; Alan Tucholka; Jean-Baptiste Poline

Détail

Lechevallier, Yves and Saporta, Gilbert. 19th International Conference on Computational Statistics, Aug 2010, Paris, France. Spinger Verlag, Proceedings of COMPSTAT'2010, pp. 565-572

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Titre

Accurate Definition of Brain Regions Position Through the Functional Landmark Approach

Auteurs

Bertrand Thirion; Gaël Varoquaux; Jean-Baptiste Poline

Détail

13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2010, Beijing, China.

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Titre

Imaging genetics: bio-informatics and bio-statistics challenges

Auteurs

Jean-Baptiste Poline; Christophe Lalanne; Arthur Tenenhaus; Edouard Duchesnay; Bertrand Thirion; Vincent Frouin

Détail

Lechevallier, Yves and Saporta, Gilbert. 19th International Conference on Computational Statistics, Aug 2010, Paris, France. Proceedings of COMPSTAT'2010

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Titre

Total Variation regularization enhances regression-based brain activity prediction

Auteurs

Vincent Michel; Alexandre Gramfort; Gaël Varoquaux; Bertrand Thirion

Détail

1st ICPR Workshop on Brain Decoding - Pattern recognition challenges in neuroimaging - 20th International Conference on Pattern Recognition, Aug 2010, Istanbul, Turkey. IEEE Computer Society, 0, pp. 9-12

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Titre

A supervised clustering approach for extracting predictive information from brain activation images

Auteurs

Vincent Michel; Evelyn Eger; Christine Keribin; Jean-Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis - IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2010, San Francisco, United States. pp. 08

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Titre

ICA-based sparse feature recovery from fMRI datasets

Auteurs

Gaël Varoquaux; Merlin Keller; Jean Baptiste Poline; Philippe Ciuciu; Bertrand Thirion

Détail

Biomedical Imaging, IEEE International Symposium on, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. IEEE, pp. 1177

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Titre

Multi-condition M/EEG inverse modeling with sparsity assumptions: how to estimate what is common and what is specific in multiple experimental conditions

Auteurs

Alexandre Gramfort

Détail

Biomag: International Conference on Biomagnetism, Mar 2010, Dubrovnik, Croatia.

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Titre

The symmetric BEM: bringing in more variables for better accuracy

Auteurs

Maureen Clerc; Alexandre Gramfort; Emmanuel Olivi; Théodore Papadopoulo

Détail

Supek, Selma and Susac, Ana. Biomag 2010, May 2010, Dubrovnik, Croatia. Springer, Advances in Biomagnetism, 28, pp. 109-112, IFMBE Proceedings

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Documents associés à des manifestations scientifiques (Tutoriel, poster/prés./préface, papier court, digest de conférence, …)

Titre

OpenMEEG for M/EEG forward modeling: a comparison study

Auteurs

Alexandre Gramfort; Theodore Papadopoulo; Emmanuel Olivi; Maureen Clerc

Détail

[Poster]. Human Brain Mapping, Jun 2010, Barcelone, Spain

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Rapports

Titre

OpenMEEG: opensource software for quasistatic bioelectromagnetics

Auteurs

Alexandre Gramfort; Théodore Papadopoulo; Emmanuel Olivi; Maureen Clerc

Détail

[Research Report], 2010

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Thèses

Titre

Améliorer la compréhension du cortex visuel à l'aide de techniques de classification

Auteurs

Vincent Michel

Détail

Imagerie et Apprentissage. Université Paris Sud - Paris XI, Dec. 2010. English

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2009

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

An automatic valuation system in the human brain: evidence from functional neuroimaging.

Auteurs

Maël Lebreton; Soledad Jorge; Vincent Michel; Bertrand Thirion; Mathias Pessiglione

Détail

Neuron, 2009, 64 (3), pp. 431-9

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Titre

Deciphering cortical number coding from human brain activity patterns.

Auteurs

Evelyn Eger; Vincent Michel; Bertrand Thirion; Alexis Amadon; Stanislas Dehaene; Andreas Kleinschmidt

Détail

Curr Biol, 2009, 19 (19), pp. 1608-15

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Titre

Recruitment of an area involved in eye movements during mental arithmetic.

Auteurs

André Knops; Bertrand Thirion; Edward M Hubbard; Vincent Michel; Stanislas Dehaene

Détail

Science, 2009, 324 (5934), pp. 1583-5

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Communications avec actes

Titre

Proceedings of the 8th Python in Science conference

Auteurs

Gaël Varoquaux; Stefan Van Der Walt; Jarrod Millman

Détail

Gaël Varoquaux; Stefan van der Walt ; Jarrod Millman. SciPy 2009: 8th Python in Science Conference, Aug 2009, Pasadena, United States. 1, pp. 1-78

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Titre

CanICA: Model-based extraction of reproducible group-level ICA patterns from fMRI time series

Auteurs

Gaël Varoquaux; Sepideh Sadaghiani; Jean Baptiste Poline; Bertrand Thirion

Détail

Medical Image Computing and Computer Aided Intervention, Sep 2009, London, United Kingdom. pp. 1

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Titre

Adaptive multi-class Bayesian sparse regression - An application to brain activity classification

Auteurs

Vincent Michel; Evelyn Eger; Christine Keribin; Bertrand Thirion

Détail

MICCAI 2009: fMRI data analysis workshop - Medical Image Computing and Computer Aided Intervention, Sep 2009, London, United Kingdom. pp. 1

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HDR

Titre

Méthodes structurales et probabilistes pour l'analyse de groupe en neuroimagerie fonctionnelle

Auteurs

Bertrand Thirion

Détail

École normale supérieure de Cachan - ENS Cachan, Jul. 2009. English

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2008

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

A fully Bayesian approach to the parcel-based detection-estimation of brain activity in fMRI.

Auteurs

Salima Makni; Jérôme Idier; Thomas Vincent; Bertrand Thirion; Ghislaine Dehaene-Lambertz; Philippe Ciuciu

Détail

NeuroImage, 2008, 41 (3), pp. 941-69

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Titre

A fully Bayesian approach to the parcel-based detection-estimation of brain activity in fMRI.

Auteurs

Salima Makni; Jérôme Idier; Thomas Vincent; Bertrand Thirion; Ghislaine Dehaene-Lambertz; Philippe Ciuciu

Détail

NeuroImage, 2008, 41 (3), pp. 941-69

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Titre

Agile Computer Control of a Complex Experiment

Auteurs

Gaël Varoquaux

Détail

Computing in Science and Engineering, 2008, 10 (2), pp. 55-59

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Titre

Connectivity-Based Parcellation of the Cortical Mantle Using q-Ball Diffusion Imaging

Auteurs

Muriel Perrin; Yann Cointepas; Arnaud Cachia; Cyril Poupon; Bertrand Thirion; Denis Rivière; Pascal Cathier; Vincent El Kouby; André Constantinesco; Denis Le Bihan; Jean-François Mangin

Détail

International Journal of Biomedical Imaging, 2008, 2008, pp. 368406

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Titre

Probabilistic anatomo-functional parcellation of the cortex: how many regions?

Auteurs

Alan Tucholka; Bertrand Thirion; Matthieu Perrot; Philippe Pinel; Jean-François Mangin; Jean-Baptiste Poline

Détail

Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Springer, 2008, 11 (Pt 2), pp. 399-406

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Communications avec actes

Titre

Mayavi: Making 3D Data Visualization Reusable

Auteurs

Gaël Varoquaux; Prabhu Ramachandran

Détail

Gaël Varoquaux; Travis Vaught ; Jarrod Millman. SciPy 2008: 7th Python in Science Conference, Aug 2008, Pasadena, United States. 1, pp. 51

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Titre

Proceedings of the 7th Python in Science conference

Auteurs

Gaël Varoquaux; Travis Vaught; Jarrod Millman

Détail

Gaël Varoquaux; Travis Vaught ; Jarrod Millman. SciPy 2008: 7th Python in Science Conference, Aug 2008, Pasadena, United States. 1, pp. 1-78

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Titre

Mutual information-based feature selection enhances fMRI brain activity classification

Auteurs

Vincent Michel; Cécilia Damon; Bertrand Thirion

Détail

2008 5th IEEE international symposium on biomedical imaging: From nano to macro, May 2008, Paris, France. pp. 592 - 595

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2007

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Analysis of a large fMRI cohort: Statistical and methodological issues for group analyses.

Auteurs

Bertrand Thirion; Philippe Pinel; Sébastien Mériaux; Alexis Roche; Stanislas Dehaene; Jean-Baptiste Poline

Détail

NeuroImage, 2007, 35 (1), pp. 105-20

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Titre

Fast reproducible identification and large-scale databasing of individual functional cognitive networks.

Auteurs

Philippe Pinel; Bertrand Thirion; Sébastien Meriaux; Antoinette Jobert; Julien Serres; Denis Le Bihan; Jean-Baptiste Poline; Stanislas Dehaene

Détail

BMC Neuroscience, 2007, 8, pp. 91

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Titre

Challenging the estimation of cortical activity from MEG with simulated fMRI-constrained retinotopic maps.

Auteurs

Alexandre Gramfort; Benoit Cottereau; Maureen Clerc; Bertrand Thirion; Sylvain Baillet

Détail

Conference proceedings : Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society., IEEE, 2007, 2007, pp. 4945-8

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Titre

Geometric Means in a Novel Vector Space Structure on Symmetric Positive-Definite Matrices

Auteurs

Vincent Arsigny; Pierre Fillard; Xavier Pennec; Nicholas Ayache

Détail

SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, undefined or unknown publisher, 2007, 29 (1), pp. 328-347

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Communications avec actes

Titre

Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines

Auteurs

Pierre Fillard; Xavier Pennec; Paul Thompson; Nicholas Ayache

Détail

Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, Australia.

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Titre

MedINRIA: Medical Image Navigation and Research Tool by INRIA

Auteurs

Nicolas Toussaint; Jean-Christophe Souplet; Pierre Fillard

Détail

Proc. of MICCAI'07 Workshop on Interaction in medical image analysis and visualization, 2007, Brisbane, Australia, Australia.

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Titre

vtkINRIA3D: A VTK Extension for Spatiotemporal Data Synchronization, Visualization and Management

Auteurs

Nicolas Toussaint; Maxime Sermesant; Pierre Fillard

Détail

Proc. of Workshop on Open Source and Open Data for MICCAI, 2007, Brisbane, Australia, Australia.

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2006

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre

Inverse retinotopy: inferring the visual content of images from brain activation patterns.

Auteurs

Bertrand Thirion; Edouard Duchesnay; Edward Hubbard; Jessica Dubois; Jean-Baptiste Poline; Denis Le Bihan; Stanislas Dehaene

Détail

NeuroImage, 2006, 33 (4), pp. 1104-16

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Titre

A Riemannian Framework for Tensor Computing

Auteurs

Xavier Pennec; Pierre Fillard; Nicholas Ayache

Détail

International Journal of Computer Vision, undefined or unknown publisher, 2006, 66 (1), pp. 41-66

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Communications avec actes

Titre

Clinical DT-MRI estimation, smoothing and fiber tracking with log-Euclidean metrics

Auteurs

Pierre Fillard; Vincent Arsigny; Xavier Pennec; Nicholas Ayache

Détail

Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp. 786-789

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2005

Communications avec actes

Titre

A Riemannian Framework for the Processing of Tensor-Valued Images

Auteurs

Pierre Fillard; Vincent Arsigny; Nicholas Ayache; Xavier Pennec

Détail

Olsen, Ole Fogh and Florak, Luc and Kuijper, Arjan. Deep Structure, Singularities, and Computer Vision (DSSCV), 2005, no address, Netherlands. Springer, pp. 112-123, LNCS

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