Equipe de recherche ORPAILLEUR

Publications de l'équipe ORPAILLEUR

2012

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Fast Protein Structure Alignment using Gaussian Overlap Scoring of Backbone Peptide Fragment Similarity
Auteurs: David Ritchie ; Anisah Ghoorah; Lazaros Mavridis; Vishwesh Venkatraman
Détail: Bioinformatics, Oxford Journals, 2012
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Titre: Predicting Multi-component Protein Assemblies Using an Ant Colony Approach
Auteurs: Vishwesh Venkatraman; David Ritchie
Détail: International Journal of Swarm Intelligence Research, IGI Global, 2012, 3, pp. 19-31
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Titre: Recent Trends and Applications in 3D Virtual Screening
Auteurs: Leo Ghemtio; Violeta Pérez-Nueno; Vincent Leroux; Yasmine Asses; Michel Souchet; Lazaros Mavridis; Bernard Maigret; David Ritchie
Détail: Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening, Bentham Science Publishers, 2012, 15 (9), pp. 749-769
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Titre: Detecting Drug Promiscuity Using Gaussian Ensemble Screening
Auteurs: Violeta Pérez-Nueno; Vishwesh Venkatraman; Lazaros Mavridis; David Ritchie
Détail: Journal of Chemical Information and Modeling, ACS Publications, 2012, 52 (8), pp. 1948-1961
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Titre: Flexible protein docking refinement using pose-dependent normal mode analysis
Auteurs: Vishwesh Venkatraman; David Ritchie
Détail: Proteins, Wiley Periodicals Inc., 2012, 80 (9), pp. 2262-2274
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Titre: Using ontology-based annotation to profile disease research
Auteurs: Yi Liu; Adrien Coulet; Paea LePendu; Nigam H Shah
Détail: Journal of the American Medical Informatics Association, BMJ Publishing Group, 2012, 19 (e1), pp. e177-e186
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Titre: Combining farmers' decision rules and landscape stochastic regularities for landscape modelling
Auteurs: Noémie Schaller; El Ghali Lazrak; Philippe Martin; Jean-Francois Mari ; Christine Aubry; Marc Benoît
Détail: Landscape Ecology, Springer, 2012, 27 (3), pp. 433-446
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Titre: Exploring c-Met kinase flexibility by sampling and clustering its conformational space
Auteurs: Asses Yasmine; Vishwesh Venkatraman; Vincent Leroux; David Ritchie ; Bernard Maigret
Détail: Proteins, Wiley Periodicals Inc., 2012, 80 (4), pp. 1227-1238
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Titre: Seasonal Changes of Macroinvertebrate Communities in a Stormwater Wetland Collecting Pesticide Runoff From a Vineyard Catchment (Alsace, France)
Auteurs: Sylvain Martin; Aurélie Bertaux; Florence Le Ber; Elodie Maillard; Gwenaël Imfeld
Détail: Archives of Environmental Contamination and Toxicology, 2012, 62 (1), pp. 29-41
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Titre: Comparison of statistical algorithms for detecting homogeneous river reaches along a longitudinal continuum
Auteurs: Thierry Leviandier; Adrien Alber; Florence Le Ber; Hervé Piégay
Détail: Geomorphology, 2012, 138 (1), pp. 130-144
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Titre: L'insertion territoriale des cultures biomasses pérennes. Etude de cas sur le miscanthus en Côte d'Or (bourgogne, France)
Auteurs: Laura Martin; Julie Wohlfahrt; Florence Le Ber; Marc Benoît
Détail: L'Espace Géographique, 2012, 2, pp. 138-153
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Titre: Functional classification of genes using semantic distance and fuzzy clustering approach: Evaluation with reference sets and overlap analysis
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Benabderrahmane Sidahmed; Malika Smail-Tabbone ; Napoli Amedeo; Poch Olivier
Détail: international Journal of Computational Biology and Drug Design. Special Issue on: "Systems Biology Approaches in Biological and Biomedical Research", Inderscience publishers, 2012, 5 (3/4), pp. 245-260
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Articles dans des revues sans comité de lecture

Titre: Guest Editorial: The state of the art in text mining and natural language processing for pharmacogenomics
Auteurs: Adrien Coulet ; Kevin Bretonnel Cohen; Russ B. Altman
Détail: Journal of Biomedical Informatics, Elsevier, 2012, 45 (5), pp. 825-826
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Communications avec actes

Titre: Fast Computation of Orthogonal Polar Harmonic Transforms
Auteurs: Thai V. Hoang ; Salvatore Tabbone
Détail: The 21st International Conference on Pattern Recognition - ICPR 2012, Nov 2012, Tsukuba Science City, Japan.
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Titre: Analyse des structures des haies et des linéaires pérennes dans deux paysages agricoles contrastés
Auteurs: Sébastien Da Silva; Claire Lavigne; Florence Le Ber
Détail: SAGEO - International Conference on Spatial Analysis and GEOmatics, 2012, Liège, Belgium. pp. 16
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Titre: Including spatial relations and scales within sequential pattern extraction
Auteurs: Maguelonne Teisseire ; Sandra Bringay; Mickaël Fabrègue; Florence Le Ber; Agnès Braud
Détail: DS'2012: 15th International Conference on Discovery Science, Oct 2012, Lyon, France. http://eric.univ-lyon2.fr/ds-2012/, LNCS / LNAI
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Titre: Hermes: an efficient algorithm for building Galois sub-hierarchies
Auteurs: Anne Berry; Marianne Huchard ; Amedeo Napoli; Alain Sigayret
Détail: Laszlo Szathmary, Uta Priss. CLA'2012: 9th International Conference on Concept Lattices and Applications, Oct 2012, Fuengirola (Málaga), Spain. Universidad de Malaga, pp. 21-32
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Titre: Adapting Spatial and Temporal Cases
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Florence Le Ber; Jean Lieber; Laura Martin
Détail: Ian Watson, Belen Diaz Agudo. International Conference for Case-Based Reasoning, Sep 2012, Lyon, France. Springer, Case-Based Reasoning Research and Development, 7466, pp. 77-91, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: A Semantic Wiki for Editing and Sharing Decision Guidelines in Oncology
Auteurs: Thomas Meilender; Jean Lieber; Gilles Herengt; Fabien Palomares; Nicolas Jay
Détail: John Mantas. The 24th European Medical Informatics Conference - MIE 2012, Aug 2012, Pise, Italy.
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Titre: Characterizing Modular Ontologies
Auteurs: Sarra Ben Abbès ; Andreas Scheuermann; Thomas Meilender; Mathieu D'Aquin
Détail: 7th International Conference on Formal Ontologies in Information Systems - FOIS 2012, Jul 2012, Graz, Austria. pp. 13-25
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Titre: Modelling farmers' choice of miscanthus allocation in farmland: a case-based reasoning model
Auteurs: Laura Martin; Florence Le Ber; Julie Wohlfahrt; Géraldine Bocquého; Marc Benoît
Détail: R. Seppelt, A.A. Voinov, S. Lange, D. Bankamp. 2012 International Congress on Environmental Modelling and Software, Managing Resources of a Limited Planet, Sixth Biennial Meeting, Jul 2012, Leipzig, Germany. International Environmental Modelling and Software Society (iEMSs), pp. 8
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Titre: From Web 1.0 to Social Semantic Web: Lessons Learnt from a Migration to a Medical Semantic Wiki
Auteurs: Thomas Meilender; Jean Lieber; Fabien Palomares; Nicolas Jay
Détail: 9th Extended Semantic Web Conference - ESWC 2012, May 2012, Heraklion, Greece.
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Titre: Extraction de motifs spatio-temporels à différentes échelles avec gestion de relations spatiales qualitatives.
Auteurs: Mickaël Fabrègue; Agnès Braud; Sandra Bringay; Florence Le Ber; Maguelonne Teisseire
Détail: 30ème édition, Inforsid 2012, May 2012, France. pp. 123-138
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Titre: Extension du formalisme des flux opérationnels par une algèbre temporelle
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Florence Le Ber; Jean Lieber
Détail: Sixièmes Journées de l'Intelligence Artificielle Fondamentale (JIAF), May 2012, Toulouse, France. Sixièmes Journées de l'Intelligence Artificielle Fondamentale, pp. 133-142
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Titre: Watch me playing, I am a professional: a first study on video game live streaming
Auteurs: Mehdi Kaytoue ; Arlei Silva ; Loïc Cerf ; Wagner Meira; Chedy Raïssi
Détail: Hakim Hacid and Shengbo Guo and Julien Velcin. MSND@WWW - International Workshop on Mining Social Network Dynamics - 2012 (in conjunction with WWW - World Wild Web - 2012), May 2012, Lyon, France. ACM, WWW '12 Companion - Proceedings of the 21st international conference companion on World Wide Web, pp. 1181-1188
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Titre: Man-Machine Collaboration to Acquire Cooking Adaptation Knowledge for the TAAABLE Case-Based Reasoning System
Auteurs: Amélie Cordier; Emmanuelle Gaillard; Emmanuel Nauer
Détail: SWCS Semantic Web Collaborative Spaces, Apr 2012, Lyon, France. ACM, pp. 1113-1120
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Titre: Structure analysis of hedgerows and other perennial landscape lines in two French agricultural landscapes
Auteurs: Florence Le Ber; Claire Lavigne; Sébastien Da Silva
Détail: AGILE 2012, Apr 2012, Avignon, France. pp. 6
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Titre: NRPS toolbox for the discovery of new nonribosomal peptides and synthetases
Auteurs: Maude Pupin; Malika Smail-Tabbone ; Philippe Jacques; Marie-Dominique Devignes; Valérie Leclère
Détail: François Coste et Denis Tagu. Journées Ouvertes en Biologie, l'Informatique et les Mathématiques - JOBIM 2012, Jul 2012, Rennes, France. pp. 89-93
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Titre: Formal Concept Analysis for the Interpretation of Relational Learning applied on 3D Protein-Binding Sites
Auteurs: Emmanuel Bresso; Renaud Grisoni; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smail-Tabbone
Détail: Ana Fred. 4th international conference on Knowledge Discovery and Information Retrieval - KDIR 2012, Oct 2012, Barcelona, Spain. 12 p.
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Titre: Healtcare Trajectory Mining by Combining Multi-dimensional Component and Itemsets
Auteurs: Elias Egho; Dino Ienco; Nicolas Jay; Amedeo Napoli; Pascal Poncelet ; Catherine Quantin; Chedy Raïssi; Maguelonne Teisseire
Détail: NFMCP'2012: New Frontiers in Mining Complex Patterns, Workshop in conjunction with European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases (ECML PKDD 2012), Sep 2012, United Kingdom. Springer, pp. 12, LNCS
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Communications sans actes

Titre: Extracting Generic Cooking Adaptation Knowledge for the TAAABLE Case-Based Reasoning System
Auteurs: Emmanuelle Gaillard; Emmanuel Nauer ; Marie Lefevre; Amélie Cordier
Détail: Cooking with Computers workshop @ ECAI 2012, Aug 2012, Montpellier, France.
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Titre: Semi-automatic annotation process for procedural texts: An application on cooking recipes
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Florence Le Ber; Jean Lieber; Thomas Meilender; Emmanuel Nauer
Détail: Amélie Cordier, Emmanuel Nauer. Cooking with Computers workshop - ECAI 2012, Aug 2012, Montpellier, France.
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Titre: Adaptation de cas spatiaux et temporels
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Florence Le Ber; Jean Lieber; Laura Martin
Détail: 20ème atelier Français de Raisonnement à Partir de Cas, Jun 2012, Paris, France.
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Titre: Semantic decision trees editing for decision support with KcatoS - Application in oncology
Auteurs: Thomas Meilender; Jean Lieber; Fabien Palomares; Nicolas Jay
Détail: SIMI 2012: Semantic Interoperability in Medical Informatics, May 2012, Heraklion, Greece.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Modéliser " l'entre deux " dans l'organisation spatiale des exploitations agricoles -- Mise en évidence de quelques problématiques
Auteurs: Florence Le Ber; Christian Brassac
Détail: S. Lardon. Géoagronomie, paysage et projets de territoire, QUAE, pp. 63-72, Oct. 2012, Indisciplines, 978-2-7592-1856-1
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Titre: GenExp-LandSiTes: a 2D Agricultural Generating Piece of Software
Auteurs: Florence Le Ber; Jean-Francois Mari
Détail: Benedicte Bucher and Florence Le Ber. Innovative Software Development in GIS, ISTE WILEY, pp. 189 - 214, Jul. 2012, GIS, 978-1-84821-364-7
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Titre: GenExp-LandSiTes : un logiciel générateur de paysages agricoles 2D
Auteurs: Florence Le Ber; Jean-Francois Mari
Détail: Bénédicte Bucher et Florence Le Ber. Développements logiciels en géomatique, HERMES Lavoisier, pp. 181 - 202, Jul. 2012, Information Géographique et Aménagement du Territoire, 978-2-7462-2437-2
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Titre: Modeling Protein-Protein Interactions by Rigid-Body Docking
Auteurs: David Ritchie
Détail: Timothy Clark and Lee Banting. Drug Design Strategies: Computational Techniques and Applications, RSC Publishing, pp. 56-86, 2012, RSC Drug Discovery Series, 978-1-84973-167-6
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Titre: Introduction
Auteurs: Bénédicte Bucher; Florence Le Ber
Détail: B. Bucher et F. Le Ber. Développements logiciels en géomatique -- innovations et mutualisation, Hermes Lavoisier, pp. 17-34, 2012, IGAT
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Titre: Analyse des spécificités des développements logiciels en géomatique
Auteurs: Florence Le Ber; Bénédicte Bucher
Détail: B. Bucher et F. Le Ber. Développements logiciels en géomatique -- innovations et mutualisation, Hermes Lavoisier, pp. 264-269, 2012, IGAT
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Titre: Défis et propositions pour la mutualisation de développements logiciels en géomatique
Auteurs: Bénédicte Bucher; Julien Gaffuri; Florence Le Ber; Thérèse Libourel
Détail: B. Bucher et F. Le Ber. Développements logiciels en géomatique -- innovations et mutualisation, Hermes Lavoisier, pp. 271-290, 2012, IGAT
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Titre: Introduction
Auteurs: Bénédicte Bucher; Florence Le Ber
Détail: B. Bucher et F. Le Ber. Innovative Software Development in GIS, ISTE - WILEY, pp. 1-21, 2012, GIS Series
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Titre: Analysis of the specificities of Software Development in Geomatics Research
Auteurs: Florence Le Ber; Bénédicte Bucher
Détail: B. Bucher et F. Le Ber. Innovative Software Development in GIS, ISTE - WILEY, pp. 285-292, 2012, GIS Series
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Titre: Challenges and Proposals for Software Development Pooling in Geomatics
Auteurs: Bénédicte Bucher; Julien Gaffuri; Florence Le Ber; Thérèse Libourel
Détail: B. Bucher et F. Le Ber. Innovative Software Development in GIS, ISTE - WILEY, pp. 293-316, 2012, GIS Series
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Directions d'ouvrages

Titre: Innovative Software Development in GIS
Auteurs: Bénédicte Bucher; Florence Le Ber
Détail: ISTE - WILEY, pp. 331, 2012
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Titre: Développements logiciels en géomatique
Auteurs: Bénédicte Bucher; Florence Le Ber
Détail: Hermes Lavoisier, pp. 297, 2012
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Rapports

Titre: On Measuring Similarity for Sequences of Itemsets
Auteurs: Elias Egho; Chedy Raïssi; Toon Calders; Thomas Bourquard; Nicolas Jay; Amedeo Napoli
Détail: [Research Report], 2012, pp. 19. RR-8086
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Titre: Semantic Indexing and Retrieval based on Formal Concept Analysis
Auteurs: Victor Codocedo; Ioanna Lykourentzou; Amedeo Napoli
Détail: [Report], 2012
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2011

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Representing and comparing protein folds and fold families using 3D shape-density representations
Auteurs: Lazaros Mavridis; Anisah Ghoorah; Vishwesh Venkatraman; David Ritchie
Détail: Proteins, Wiley-Blackwell, 2011, 80 (2), pp. 530-545
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Titre: Identifying and characterizing promiscuous targets: Implications for virtual screening
Auteurs: Violeta Pérez-Nueno; David Ritchie
Détail: Expert Opinion on Drug Discovery, Informa Plc, 2011
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Titre: GPU-powered tools boost molecular visualization.
Auteurs: Matthieu Chavent; Bruno Lévy; Michael Krone; Katrin Bidmon; Jean-Philippe Nominé; Thomas Ertl; Marc Baaden
Détail: Briefings in Bioinformatics, 2011, 12 (6), pp. 689-701
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Titre: GPU-accelerated atom and dynamic bond visualization using hyperballs: a unified algorithm for balls, sticks, and hyperboloids.
Auteurs: Matthieu Chavent; Antoine Vanel; Alex Tek; Bruno Levy; Sophie Robert; Bruno Raffin; Marc Baaden
Détail: Journal of Computational Chemistry, 2011, 32 (13), pp. 2924-35
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Titre: Community-Wide Assessment of Protein-Interface Modeling Suggests Improvements to Design Methodology.
Auteurs: Sarel J Fleishman; Timothy A Whitehead; Eva-Maria Strauch; Jacob E Corn; Sanbo Qin; Huan-Xiang Zhou; Julie C Mitchell; Omar N A Demerdash; Mayuko Takeda-Shitaka; Genki Terashi; Iain H Moal; Xiaofan Li; Paul A Bates; Martin Zacharias; Hahnbeom Park; Jun-Su Ko; Hasup Lee; Chaok Seok; Thomas Bourquard; Julie Bernauer; Anne Poupon; Jérôme Azé; Seren Soner; Sefik Kerem Ovalı; Pemra Ozbek; Nir Ben Tal; Türkan Haliloglu; Howook Hwang; Thom Vreven; Brian G Pierce; Zhiping Weng; Laura Pérez-Cano; Carles Pons; Juan Fernández-Recio; Fan Jiang; Feng Yang; Xinqi Gong; Libin Cao; Xianjin Xu; Bin Liu; Panwen Wang; Chunhua Li; Cunxin Wang; Charles H Robert; Mainak Guharoy; Shiyong Liu; Yangyu Huang; Lin Li; Dachuan Guo; Ying Chen; Yi Xiao; Nir London; Zohar Itzhaki; Ora Schueler-Furman; Yuval Inbar; Vladimir Patapov; Mati Cohen; Gideon Schreiber; Yuko Tsuchiya; Eiji Kanamori; Daron M Standley; Haruki Nakamura; Kengo Kinoshita; Camden M Driggers; Robert G Hall; Jessica L Morgan; Victor L Hsu; Jian Zhan; Yuedong Yang; Yaoqi Zhou; Panagiotis L Kastritis; Alexandre M J J Bonvin; Weiyi Zhang; Carlos J Camacho; Krishna P Kilambi; Aroop Sircar; Jeffrey J Gray; Masahito Ohue; Nobuyuki Uchikoga; Yuri Matsuzaki; Takashi Ishida; Yutaka Akiyama; Raed Khashan; Stephen Bush; Denis Fouches; Alexander Tropsha; Juan Esquivel-Rodríguez; Daisuke Kihara; P Benjamin Stranges; Ron Jacak; Brian Kuhlman; Sheng-You Huang; Xiaoqin Zou; Shoshana J Wodak; Joel Janin; David Baker
Détail: Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2011, in press
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Titre: NCBO Resource Index: Ontology-Based Search and Mining of Biomedical Resources
Auteurs: Clement Jonquet; Paea LePendu; Sean Falconer; Adrien Coulet; Natalya F. Noy; Mark A. Musen; Nigam H. Shah
Détail: Journal of Journal of Web Semantics, Elsevier, 2011, 9 (3), pp. 316-324
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Titre: Spatial clustering of protein binding sites for template based protein docking
Auteurs: Anisah Ghoorah; Marie-Dominique Devignes; Malika Smaïl-Tabbone; David Ritchie
Détail: Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2011, 27 (20), pp. 2820-2827
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Titre: Using Consensus-Shape Clustering To Identify Promiscuous Ligands and Protein Targets and To Choose the Right Query for Shape-Based Virtual Screening
Auteurs: Violeta Pérez-Nueno; David Ritchie
Détail: Journal of Chemical Information and Modeling, ACS Publications, 2011, 51 (6), pp. 1233-1248
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Titre: Integration and publication of heterogeneous text-mined relationships on the Semantic Web
Auteurs: Adrien Coulet; Yael Garten; Michel Dumontier; Russ B Altman; Mark Musen; Nigam H Shah
Détail: Journal of Biomedical Semantics, 2011, 2 (S2), pp. S10
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Titre: Comparative genomics allowed the identification of drug targets against human fungal pathogens.
Auteurs: Ana Karina R. Abadio; Erika S. Kioshima; Marcus M. Teixeira; Natalia F. Martins; Bernard Maigret; Maria Sueli S. Felipe
Détail: BMC Genomics, BioMed Central Ltd, 2011, 12, pp. 75
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Titre: In silico prediction of horizontal gene transfer in Streptococcus thermophilus
Auteurs: Catherine Eng; Annabelle Thibessard; Morten Danielsen; Thomas Bovbjerg Rasmussen; Jean-Francois Mari; Pierre Leblond
Détail: Archives of Microbiology, Springer, 2011, 193 (4), pp. 287-297
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Titre: Mining gene expression data with pattern structures in formal concept analysis
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli; Sébastien Duplessis
Détail: Information Sciences, 2011, 181 (10), pp. 1989-2001
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Titre: Capitalisation d'expériences pour la mise en place d'observatoires de pratiques agricoles
Auteurs: Florence Le Ber; Sandra Nogry; Christian Brassac; Marc Benoît
Détail: Revue internationale de Géomatique, 2011, 21, pp. 99-118
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Titre: Un système d'information pour le suivi et l'évaluation de la qualité des cours d'eau -- Application à l'hydro-écorégion de la plaine d'Alsace
Auteurs: Corinne Grac; Agnès Braud; Florence Le Ber; Michèle Trémolières
Détail: RSTI - Ingénierie des Systèmes d'Information, 2011, 16, pp. 9-30
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Titre: HIV-PDI: A Protein-Drug Interaction Resource for Structural Analyses of HIV Drug Resistance: 1. Concepts and Associated Database
Auteurs: Leo Ghemtio; Malika Smaïl-Tabbone; Appolinaire Djikeng; Marie-Dominique Devignes; Lionel Keminse; Patricia Kelbert; Joseph Fokam; Bernard Maigret; Odile Ouwe-Missi-Oukem-Boyer
Détail: Journal of Health & Medical Informatics, 2011, 2 (1), pp. 1000104
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Titre: HIV-PDI: A Protein Drug Interaction Resource for Structural Analyses of HIV Drug Resistance: 2. Examples of Use and Proof-of-Concept
Auteurs: Leo Ghemtio; Michel Souchet; Appolinaire Djikeng; Lionel Keminse; Patricia Kelbert; David Ritchie; Bernard Maigret; Odile Ouwe-Missi-Oukem-Boyer
Détail: Journal of Health & Medical Informatics, 2011, 2 (1), pp. 1000105
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Titre: A collaborative filtering approach for protein-protein docking scoring functions.
Auteurs: Thomas Bourquard; Julie Bernauer; Jérôme Azé; Anne Poupon
Détail: PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (4), pp. e18541
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Communications avec actes

Titre: Mining Dominant Patterns in the Sky
Auteurs: Arnaud Soulet; Chedy Raïssi; Marc Plantevit; Bruno Crémilleux
Détail: IEEE. The 11th IEEE International Conference on Data Mining - ICDM 2011, Dec 2011, Vancouver, B.C, Canada.
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Titre: A FCA-based analysis of sequential care trajectories
Auteurs: Elias Egho; Nicolas Jay; Chedy Raïssi; Amedeo Napoli
Détail: Amedeo Napoli and Vilem Vychodil. The Eighth International Conference on Concept Lattices and their Applications - CLA 2011, Oct 2011, Nancy, France.
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Titre: Fast Mining of Iceberg Lattices: A Modular Approach Using Generators
Auteurs: Laszlo Szathmary; Petko Valtchev; Amedeo Napoli; Robert Godin; Alix Boc; Vladimir Makarenkov
Détail: Amedeo Napoli and Vilem Vychodil. The Eighth International Conference on Concept Lattices and their Applications - CLA 2011, Oct 2011, Nancy, France.
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Titre: Numerical information fusion: Lattice of answers with supporting arguments
Auteurs: Zainab Assaghir; Amedeo Napoli; Mehdi Kaytoue; Didier Dubois; Henri Prade
Détail: 23rd IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence - ICTAI 2011, Nov 2011, Boca-Raton, United States. pp. 621-628
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Titre: Adaptation knowledge discovery for cooking using closed itemset extraction
Auteurs: Emmanuelle Gaillard; Jean Lieber; Emmanuel Nauer
Détail: The Eighth International Conference on Concept Lattices and their Applications - CLA 2011, Oct 2011, Nancy, France.
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Titre: Utility-Driven Anonymization in Data Publishing
Auteurs: Mingqiang Xue; Panagiotis Karras; Chedy Raïssi; Hung Keng Pung
Détail: 20th ACM Conference on Information and Knowledge Management - CIKM 2011, Oct 2011, Glasgow, United Kingdom. ACM
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Titre: Knowledge extraction for improving case retrieval and recipe adaptation
Auteurs: Julien Cojan; Valmi Dufour-Lussier; Emmanuelle Gaillard; Jean Lieber; Emmanuel Nauer ; Yannick Toussaint
Détail: Computer Cooking Contest Workshop, Sep 2011, London, United Kingdom.
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Titre: Towards Bounding Sequential Patterns
Auteurs: Chedy Raïssi; Jian Pei
Détail: Chid Apté and Joydeep Ghosh and Padhraic Smyth. 17th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining - KDD-2011, Aug 2011, San Diego, United States. ACM
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Titre: Protein-protein docking based on shape complementarity and Voronoi fingerprint
Auteurs: Thomas Bourquard; Jérôme Azé; Anne Poupon; David Ritchie
Détail: Emmanuel BARILLOT, Christine F ROIDEVAUX, Eduardo PC ROCHA. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jun 2011, Paris, France. Institut Pasteur, JOBIM 2011, pp. 9-16
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Titre: An Algorithm for Adapting Cases Represented in ALC
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: 22nd International Joint Conference on Artificial Intelligence - IJCAI 2011, Jul 2011, Barcelone, Spain.
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Titre: Document Analysis Research in the Year 2021
Auteurs: Daniel Lopresti; Bart Lamiroy
Détail: Kishan G. Mehrotra and Chilukuri K. Mohan and Jae C. Oh and Pramod K. Varshney and Moonis Ali. Twenty-fourth International Conference on Industrial, Engineering and Other Applications of Applied Intelligent Systems - IEA/AIE 2011, Jun 2011, Syracuse, NY, United States. Springer, Modern Approaches in Applied Intelligence, 6703, pp. 264-274, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Predicting Multicomponent Protein Assemblies Using an Ant Colony Approach
Auteurs: Vishwesh Venkatraman; David Ritchie
Détail: International Conference on Swarm Intelligence, Jun 2011, Cergy, France.
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Titre: Édition sémantique d'arbres de décision pour l'oncologie avec KcatoS
Auteurs: Thomas Meilender; Nicolas Jay; Jean Lieber; Fabien Palomares
Détail: 1ère édition du Symposium sur l'Ingénierie de l'Information Médicale - SIIM 2011, Jun 2011, Toulouse, France.
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Titre: Adaptation par révision et adaptation différentielle : comparaison de deux approches de l'adaptation
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: 19ème atelier Français de Raisonnement à Partir de Cas - Rapc2011, May 2011, Chambéry, France.
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Titre: Quels formalismes temporels pour représenter des connaissances extraites de textes de recettes de cuisine ?
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier ; Florence Le Ber; Jean Lieber
Détail: Sébastien Laborie and Florence Le Ber. Représentation et raisonnement sur le temps et l'espace, May 2011, Chambéry, France.
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Titre: How Carefully Designed Open Resource Sharing Can Help and Expand Document Analysis Research
Auteurs: Bart Lamiroy; Daniel Lopresti; Hank Korth; Jeff Heflin
Détail: Gady Agam, Christian Viard-Gaudin. Document Recognition and Retrieval XVIII - DRR 2011, Jan 2011, San Francisco, United States. SPIE, Document Recognition and Retrieval XVIII, Part of the IS\&T/SPIE 23rd Annual Symposium on Electronic Imaging, 7874
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Titre: Motifs séquentiels δ-libres
Auteurs: Marc Plantevit; Chedy Raïssi ; Crémilleux Bruno
Détail: Extraction et gestion des connaissances (EGC'2011), Jan 2011, Brest, France. Hermann-Éditions
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Titre: Benchmarking a new semantic similarity measure using fuzzy clustering and reference sets: Application to cancer expression data
Auteurs: Sidahmed Benabderrahmane; Marie-Dominique Devignes; Malika Smail-Tabbone; Olivier Poch; Amedeo Napoli; Wolfgang Raffelsberger; Dominique Guenot; Nguyen Hoan; Eric Guerin
Détail: 11ème Conférence Internationale Francophone sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances - EGC 2011, Jan 2011, Brest, France.
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Titre: Les moteurs de wikis sémantiques : un état de l'art
Auteurs: Thomas Meilender; Nicolas Jay; Jean Lieber; Fabien Palomares
Détail: Extraction et gestion des connaissances (EGC'2011), Jan 2011, Brest, France. pp. 575-580
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Titre: Analyse de la structure des haies dans les vergers pour la définition de paysages mieux adaptés contre les bioagresseurs
Auteurs: Sébastien Da Silva; Claire Lavigne; Florence Le Ber
Détail: SAGEO 2011 - International Conference on Spatial Analysis and GEOmatics Conférence internationale de Géomatique et d'Analyse Spatiale Au sein de la 25e Conférence Internationale de Cartographie, Jul 2011, Paris, France. pp. 1-4
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Titre: Symbolic Galois Lattices with Pattern Structures
Auteurs: Prakhar Agarwal; Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli; Géraldine Polaillon
Détail: Sergei O. Kuznetsov and Dominik Slezak and Daryl H. Hepting and Boris G. Mirkin. Thirteenth International Conference on Rough Sets, Fuzzy Sets and Granular Computing - RSFDGrC-2011, Jun 2011, Moscou, Russian Federation. Springer-Verlag, 6743, pp. 191-198, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Parsing Coordination Extragrammatically
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Bruno Guillaume; Guy Perrier
Détail: 5th Language & Technology Conference - LTC'11, Nov 2011, Poznan, Poland.
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Titre: A lattice-based query system for assessing the quality of hydro-ecosystems
Auteurs: Agnès Braud; Cristina Nica; Corinne Grac; Florence Le Ber
Détail: A Napoli, V. Vychodil. CLA 2011, Oct 2011, Nancy, France. INRIA NGE et LORIA, pp. 265-277
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Titre: Mining Biclusters of Similar Values with Triadic Concept Analysis
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Juraj Macko; Wagner Meira; Amedeo Napoli
Détail: Amedeo Napoli and Vilem Vychodil. The Eighth International Conference on Concept Lattices and their Applications - CLA 2011, Oct 2011, Nancy, France.
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Titre: Extracting Decision Trees from Interval Pattern Concept Lattices
Auteurs: Zainab Assaghir; Mehdi Kaytoue; Wagner Meira; Jean Villerd
Détail: Amedeo Napoli and Vilem Vychodil. The Eighth International Conference on Concept Lattices and their Applications - CLA 2011, Oct 2011, Nancy, France.
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Titre: Use of domain knowledge for dimension reduction: application to mining of drug side effects
Auteurs: Emmanuel Bresso; Sidahmed Benabderrahmane; Malika Smaïl-Tabbone; Gino Marchetti; Arnaud Sinan Karaboga; Michel Souchet; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: Ana Fred. International Conference on Knowledge Discovery and Information Retrieval - KDIR 2011, Oct 2011, Paris, France. INSTICC, SciTePress Digital Library, pp. 8
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Titre: Ontology-based functional classification of genes: evaluation with reference sets and overlap analysis
Auteurs: Sidahmed Benabderrahmane; Marie-Dominique Devignes; Malika Smaïl-Tabbone; Amedeo Napoli; Olivier Poch
Détail: Zhongming Zhao. The second workshop on Integrative Data in Systems Biology held in conjunction with the IEEE BIBM 2011 conference, Nov 2011, Atlanta, United States. IEEE Computer Society
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Titre: Mining for Reengineering: an Application to Semantic Wikis using Formal and Relational Concept Analysis
Auteurs: Lian Shi; Yannick Toussaint; Amedeo Napoli; Alexandre Blansché
Détail: Grigoris Antoniou and Marko Grobelnik and Elena Simperl and Bijan Parsia and Dimitris Plexousakis and Jeff Pan and Pieter De Leenhee. The Semanic Web: Research and Applications - 8th Extended Semantic Web Conference, ESWC 2011, May 2011, Heraklion, Crete, Greece. Springer, 6644, pp. 421-435, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Symbolic Data Analysis and Formal Concept Analysis
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli; Géraldine Polaillon
Détail: Richard Emilion - Guillaume Cleuziou. XVIIIeme Rencontres de la Société Francophone de Classification - SFC 2011, Sep 2011, Orléans, France.
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Titre: Cheating to achieve Formal Concept Analysis over a large formal context
Auteurs: Victor Codocedo; Carla Taramasco; Hernan Astudillo
Détail: The Eighth International Conference on Concept Lattices and their Applications - CLA 2011, Oct 2011, Nancy, France. pp. 349-362
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Titre: Revisiting Numerical Pattern Mining with Formal Concept Analysis
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli
Détail: Twenty second International Joint Conference on Artificial Intelligence - IJCAI 2011, Jul 2011, Barcelona, Spain.
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Titre: Biclustering Numerical Data in Formal Concept Analysis
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli
Détail: Petko Valtchev and Robert Jäschke. 9th International Conference on Formal Concept Analysis - ICFCA 2011, May 2011, Nicosia, Cyprus. Springer, Formal Concept Analysis - 9th International Conference. Proceedings., 6628, pp. 135-150, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Revisiting Numerical Pattern Mining with Formal Concept Analysis
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli
Détail: Journées Nationales de l'Intelligence Artificielle Fondamentale, Jun 2011, Lyon, France.
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Titre: Distributed Privacy Preserving Data Collection
Auteurs: Mingqiang Xue; Panagiotis Papadimitriou; Chedy Raïssi; Panagiotis Kalnis; Hung Keng Pung
Détail: Jeffrey Xu Yu and Myoung Ho Kim and Rainer Unland. 16th International Conference on Database Systems for Advanced Applications - DASFAA 2011, Apr 2011, Hong Kong, China. springer, 6587, pp. 93-107, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Improving case retrieval by enrichment of the domain ontology
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Jean Lieber; Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: 19th International Conference on Case Based Reasoning - ICCBR'2011, Sep 2011, London, United Kingdom.
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Titre: Using Kendall-Tau Meta-Bagging to Improve Protein-Protein Docking Predictions
Auteurs: Jérôme Azé; Thomas Bourquard; Sylvie Hamel; Anne Poupon; David Ritchie
Détail: M. Loog et al.. PRIB 2011, Nov 2011, DELFT, Netherlands. pp. 284-295
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Titre: Querying Relational Concept Lattices
Auteurs: Zeina Azmeh ; Marianne Huchard ; Amedeo Napoli; Mohamed Rouane Hacene; Petko Valtchev
Détail: CLA'11: The 8th International Conference on Concept Lattices and their Applications, Oct 2011, France. pp. 377-392
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Communications sans actes

Titre: Extraction de connaissances agronomiques par fouille des voisinages entre occupations du sol
Auteurs: El Ghali Lazrak; Noémie Schaller; Jean-Francois Mari
Détail: Atelier en marge d'EGC 2011, Jan 2011, Brest, France.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Using Markov Models to Mine Temporal and Spatial Data
Auteurs: Jean-Francois Mari; Florence Le Ber; El-Ghali Lazrak; Marc Benoît; Catherine Eng; Annabelle Thibessard; Pierre Leblond
Détail: Kimito Funatsu and Kiyoshi Hasegawa. New Fundamental Technologies in Data Mining, Intech, pp. 561-584, 2011, 978-953-307-547-1
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Titre: Ontology-based knowledge discovery in pharmacogenomics.
Auteurs: Adrien Coulet; Malika Smaïl-Tabbone; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: Hamid R. Arabnia and Quoc-Nam Tran. Software Tools and Algorithms for Biological Systems, 696, Springer, pp. 357-66, 2011, Advances in Experimental Medicine and Biology, 978-1-4419-7046-6
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Titre: Toward the Discovery of Itemsets with Significant Variations in Gene Expression Matrices
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sébastien Duplessis; Amedeo Napoli
Détail: Fichet, Bernard and Piccolo, Domenico and Verde, Rosanna and Vichi, Maurizio. Classification and Multivariate Analysis for Complex Data Structures, Springer Berlin Heidelberg, pp. 463-471, 2011, Studies in Classification, Data Analysis, and Knowledge Organization, 978-3-642-13312-1
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Directions d'ouvrages

Titre: The 8th International Conference on Concept Lattices and Their Applications CLA 2011
Auteurs: Amedeo Napoli; Vilem Vychodil
Détail: Amedeo Napoli and Vilem Vychodil. INRIA Nancy-Grand-Est and LORIA, pp. 416, 2011, 978-2-905267-78-8
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HDR

Titre: Algorithmes Haute-Performance pour la Reconnaissance de Formes Moléculaires
Auteurs: David Ritchie
Détail: Université Henri Poincaré - Nancy I, Apr. 2011. French
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Autres publications

Titre: A gentle introduction to Relational Concept Analysis, Tutorial ICFCA 2011
Auteurs: Marianne Huchard; Amedeo Napoli; Mohamed Rouane-Hacene; Petko Valtchev
Détail: May. 2011
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Documents associés à des manifestations scientifiques (Tutoriel, poster/prés./préface, papier court, digest de conférence, …)

Titre: SIXIÈME ATELIER : Représentation et raisonnement sur le temps et l'espace (RTE 2011)
Auteurs: Sébastien Laborie; Florence Le Ber
Détail: [Conference digest]. Atelier Représentation et raisonnement sur le temps et l'espace (RTE 2011), 2011, Chambéry, France
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Rapports

Titre: Les systèmes informatiques fondés sur la confiance : un état de l'art.
Auteurs: Emmanuelle Gaillard
Détail: [Research Report], 2011, pp. 23
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Titre: Embedding Tolerance Relations in Concept Lattices - An application in Information Fusion
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Zainab Assaghir; Amedeo Napoli
Détail: [Research Report], 2011, pp. 23. RR-7353
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Thèses

Titre: Prise en compte des connaissances du domaine dans l'analyse transcriptomique : Similarité sémantique, classification fonctionnelle et profils flous. Application au cancer colorectal.
Auteurs: Sidahmed Benabderrahmane
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Dec. 2011. French
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Titre: Application de la théorie de la révision des connaissances au raisonnement à partir de cas
Auteurs: Julien Cojan
Détail: Université Henri Poincaré - Nancy I, Oct. 2011. French
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Titre: Conception par modélisation et criblage in silico d'inhibiteurs du récepteur c-Met
Auteurs: Yasmine Asses
Détail: Chimie et physique moléculaires. Université Henri Poincaré - Nancy I, Oct. 2011. French
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Titre: Traitement de données numériques par analyse formelle de concepts et structures de patrons
Auteurs: Mehdi Kaytoue
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Apr. 2011. English
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2010

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Using spherical harmonic surface property representations for ligand-based virtual screening
Auteurs: Violeta Pérez-Nueno; Vishwesh Venkatraman; Lazaros Mavridis; Tim Clark; David Ritchie
Détail: Molecular Informatics, Wiley-VCH, 2010, 30 (2-3), pp. 151-159
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Titre: Applying in silico Tools to the Discovery of Novel CXCR4 Inhibitors
Auteurs: Violeta Pérez-Nueno; David Ritchie
Détail: Drug Development Research, Wiley-Liss Inc., 2010
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Titre: IntelliGO: a new vector-based semantic similarity measure including annotation origin
Auteurs: Sidahmed Benabderrahmane; Malika Smaïl-Tabbone; Olivier Poch; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: BMC Bioinformatics, PubMedID 21122125, 2010, 11, 11 (1), pp. 588
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Titre: Using text to build semantic networks for pharmacogenomics
Auteurs: Adrien Coulet; Nigam H Shah; Yael Garten; Mark Musen; Russ B Altman
Détail: Journal of Biomedical Informatics, elsevier, 2010, 43 (6), pp. 1009-19
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Titre: A Comprehensive Comparison of Ligand-Based Virtual Screening Tools Against the DUD Data set Reveals Limitations of Current 3D Methods
Auteurs: Vishwesh Venkatraman; Violeta Pérez-Nueno; Lazaros Mavridis; David Ritchie
Détail: Journal of chemical information and modeling, ACS, 2010, 50 (12), pp. 2079-2093
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Titre: By interacting with the C-terminal Phe of apelin, Phe255 and Trp259 in helix VI of the apelin receptor are critical for internalization.
Auteurs: Xavier Iturrioz; Romain Gerbier; Vincent Leroux; Rodrigo Alvear-Perez; Bernard Maigret; Catherine Llorens-Cortes
Détail: The Journal of Biological Chemistry, 2010, 285 (42), pp. 32627-32637
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Titre: Computing Closed Skycubes
Auteurs: Chedy Raïssi; Jian Pei; Thomas Kister
Détail: Proceedings of the VLDB Endowment, VLDB endowment, 2010, 3 (1), pp. 838-847
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Titre: ρ-uncertainty: Inference-Proof Transaction Anonymization
Auteurs: Jianneng Cao; Panagiotis Karras; Chedy Raïssi; Kian-Lee Tan
Détail: Proceedings of the VLDB Endowment, VLDB Endowment, 2010, 3 (1), pp. 1033-1044
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Titre: Ultra-fast FFT protein docking on graphics processors
Auteurs: David Ritchie; Vishwesh Venkatraman
Détail: Bioinformatics, Oxford University Press, 2010, 26 (19), pp. 2398-2405
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Titre: Identification and pharmacological properties of E339-3D6, the first nonpeptidic apelin receptor agonist
Auteurs: Xavier Iturrioz; Rodrigo Alvear-Perez; Nadia De Mota; Christel Franchet; Fabrice Guillier; Vincent Leroux; Hubert Dabire; Melissande Le Jouan; Hadjila Chabane; Romain Gerbier; Dominique Bonnet; Alain Berdeaux; Bernard Maigret; Jean-Luc Galzi; Marcel Hibert; Catherine Llorens-Cortes
Détail: The FASEB Journal, 2010, 24 (5), pp. 1506-1517
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Titre: Comparison of three preprocessing filters efficiency in virtual screening: identification of new putative LXRbeta regulators as a test case
Auteurs: Leo Ghemtio; Marie-Dominique Devignes; Malika Smaïl-Tabbone; Michel Souchet; Vincent Leroux; Bernard Maigret
Détail: Journal of chemical information and modeling, 2010, 50 (5), pp. 701-715
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Titre: Efficiency of a hierarchical protocol for highthroughput structure-based virtual screening on Grid5000 cluster grid
Auteurs: Leo Ghemtio; Emmanuel Jeannot; Bernard Maigret
Détail: Open Access Bioinformatics, 2010, 2, pp. 41-53
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Titre: HexServer: an FFT-based protein docking server powered by graphics processors
Auteurs: Gary Macindoe; Lazaros Mavridis; Vishwesh Venkatraman; Marie-Dominique Devignes; David Ritchie
Détail: Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2010, 38, pp. W445-W449
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Titre: L'analyse Formelle de Concepts au service de la construction et l'enrichissement d'une ontologie
Auteurs: Rokia Bendaoud; Yannick Toussaint; Amedeo Napoli
Détail: Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, Cepadues, 2010, Fouille de données complexes : avancées récentes, E-18, pp. 133-164
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Titre: Graph-Mining Algorithm for the Evaluation of Bond Formability
Auteurs: Frédéric Pennerath; Gilles Niel; Philippe Vismara; Philippe Jauffret; Claude Lauren; Amedeo Napoli
Détail: Journal of chemical information and modeling, 2010, 50 (2), pp. 221-239
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Titre: Mining Complex Hydrobiological Data with Galois Lattices
Auteurs: Aurélie Bertaux; Florence Le Ber; Agnès Braud; Michèle Trémolières
Détail: International Journal of Computing & Information Sciences, 2010, 7 (2), pp. 63-77
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Titre: BioRegistry: Automatic extraction of metadata for biological database retrieval and discovery
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Philippe Franiatte; Nizar Messai; Emmanuel Bresso; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: International Journal of Metadata Semantics and Ontologies, Inderscience Enterprises Ltd., 2010, 5 (3), pp. 184-193
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Titre: Crechaindo : un système itératif et interactif de classification par treillis de concepts, pour la recherche d'information sur le web
Auteurs: Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: Document numérique, Lavoisier, 2010, Recherche d'information représentation, organisation et accès personnalisés, 13 (1), pp. 41-62
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Titre: Generating Rare Association Rules Using the Minimal Rare Itemsets Family
Auteurs: Laszlo Szathmary; Petko Valtchev; Amedeo Napoli
Détail: International Journal of Software and Informatics, Chinese Academy of Sciences, 2010, 4 (3), pp. 219-238
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Titre: Fusion de données imparfaites en utilisant l'analyse formelle de concepts
Auteurs: Zainab Assaghir; Mehdi Kaytoue; Henri Prade; Amedeo Napoli
Détail: Numéro spécial de la Revue des Nouvelles Technologies de l'Information (RNTI), Cépadès, 2010, Fouille de données complexes - Complexité liée aux données multiples
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Communications avec actes

Titre: A Platform for Storing, Visualizing, and Interpreting Collections of Noisy Documents
Auteurs: Bart Lamiroy; Daniel Lopresti
Détail: Fourth Workshop on Analytics for Noisy Unstructured Text Data - AND'10, Oct 2010, Toronto, Canada. ACM, ACM International Conference Proceeding Series
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Titre: Using Formal Concept Analysis for Discovering Knowledge Patterns
Auteurs: Mohamed Rouane-Hacene; Marianne Huchard; Amedeo Napoli; Petko Valtchev
Détail: Marzena Kryszkiewicz, Sergei Obiedkov. CLA'10: 7th International Conference on Concept Lattices and Their Applications, Oct 2010, Sevilla, Spain. University of Sevilla, pp. 223-234, CEUR
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Titre: Adverse Drug Reaction Mining in Pharmacovigilance data using Formal Concept Analysis
Auteurs: Jean Villerd; Yannick Toussaint; Agnès Lillo Le-Louët
Détail: Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases (PKDD), Sep 2010, Barcelona, Spain. MACHINE LEARNING AND KNOWLEDGE DISCOVERY IN DATABASES, 6323/2010, pp. 386-401, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Modelling regional Land Use: articulating the farm and the landscape levels by combining farmers' decision rules and landscape stochastic regularities
Auteurs: Noémie Schaller; El-Ghali Lazrak; Philippe Martin; Jean-Francois Mari; Christine Aubry; Marc Benoît
Détail: Ed. ; I. Shili-Touzi, Ed. ; A. Perrin, Ed. ; European society for agronomy. Proceedings of Agro2010: the XIth ESA Congress, Aug 2010, Montpellier, France. pp. 917-918
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Titre: Text adaptation using formal concept analysis
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Jean Lieber; Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: Isabelle Bichindaritz and Stefania Montani. 18th International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR 2010, Jul 2010, Alessandria, Italy. Springer-Verlag, 6176, pp. 96-110, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: An Algorithm for Adapting Cases Represented in an Expressive Description Logic
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: Isabelle Bichindaritz and Stefania Montani. 18th International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR 2010, Jul 2010, Alessandria, Italy. Springer Berlin, Case-Based Reasoning Research and Development, 6176, pp. 51-65, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Un algorithme d'adaptation avec des cas exprimés dans la logique de descriptions ALC
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: Florence Le Ber et Jean Renaud. 18ème Atelier « Raisonnement à Partir de Cas » RàPC 2010, Jun 2010, Strasbourg, France. pp. 37-48
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Titre: Adapter des cas en utilisant un opérateur de révision ou des règles
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: Laurence Cholvy, Sébastien Konieczny. Journée Intelligence Artificielle Fondamentale, Jun 2010, Strasbourg, France.
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Titre: A Simple, Yet Effective and Efficient, Sliding Window Sampling Algorithm
Auteurs: Xuesong Lu; Tok Wee Hyong; Chedy Raïssi; Stéphane Bressan
Détail: Hiroyuki Kitagawa and Yoshiharu Ishikawa and Qing Li and ChiemiWatanabe. 15th International Conference on Database Systems for Advanced Applications - DASFAA 2010, Apr 2010, Tsukuba, Japan. Springer, 5981, pp. 337-351, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Une étude sur la mise en forme de patrons de conception pour les ontologies avec l'analyse formelle de concepts
Auteurs: Béatrice Fuchs; Marianne Huchard; Amedeo Napoli
Détail: Jean-Claude Royer. LMO 2010 : Langages et Modèles à Objets, Mar 2010, Pau, France. Université de Pau, pp. 83-98
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Titre: Time-Space Dependencies in Land-Use Successions at Agricultural Landscape Scales
Auteurs: El-Ghali Lazrak; Marc Benoît; Jean-Francois Mari
Détail: www.symposcience.org. International Conference on Integrative Landscape Modelling, Feb 2010, Montpellier, France.
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Titre: Fouille de paysages agricoles: analyse des voisinages des successions d'occupation du sol
Auteurs: Jean-Francois Mari; El Ghali Lazrak; Marc Benoît
Détail: Maroua Bouzid, Florence Le Ber, Gérard Ligozat et Odile Papini. Colloque RTE (Raisonnement sur le Temps et l'Espace) en marge de RFIA 2010, Jan 2010, Caen, France. RTE 2010
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Titre: 3D-blast: 3D protein structure alignment, comparison, and classification using spherical polar Fourier correlations
Auteurs: Lazaros Mavridis; David Ritchie
Détail: Pacific Symposium on Biocomputing 2010, Jan 2010, Hawaii, United States. World Scientific Publishing, pp. 281-292
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Titre: Représentation temporelle qualitative de recettes de cuisine
Auteurs: Florence Le Ber; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: RTE 2010 - atelier associé à la conférence RFIA 2010, Jan 2010, France. pp. 25-28
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Titre: Neutral modelling of agricultural landscapes by tessellation methods: the GenExP-LandSiTes software - Application to the simulation of gene flow
Auteurs: Florence Le Ber; Claire Lavigne; Katarzyna Adamczyk; Frédérique Angevin; Nathalie Colbach; Jean-François Mari; Hervé Monod
Détail: International Conference on Integrative Landscape Modelling, Feb 2010, Montpellier, France. pp. 1-9
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Titre: Connaissances de domaine et treillis de concepts pour l'exploration progressive de données complexes
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Sylvie DESPRES. 21es Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances - IC 2010, Jun 2010, Nîmes, France. Ecole des Mines d'Alès, pp. 233 - 244
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Titre: Cas socio-spatiaux pour le diagnostic prospectif de territoires
Auteurs: Sylvie Lardon; Florence Le Ber
Détail: 18ème Atelier Raisonnement à Partir de Cas - RàPC 2010, 2010, Strasbourg, France. pp. 83-90
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Titre: Un système d'information pour le suivi et l'évaluation de la qualité des cours d'eau
Auteurs: Corinne Grac; Agnès Braud; Florence Le Ber; Michèle Trémolières
Détail: Actes du 3ème atelier " Systèmes d'Information et de Décision pour l'Environnement" - SIDE 2010 - Congrès Inforsid, 2010, Marseille, France. pp. 12-21
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Titre: Human-machine Collaboration for Enriching Semantic Wikis using Formal Concept Analysis
Auteurs: Alexandre Blansché; Hala Skaf-Molli; Pascal Molli; Amedeo Napoli
Détail: 5th Workshop on Semantic Wikis Linking Data and People - SemWiki2010, May 2010, Heraklion, Greece.
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Titre: A Survey of Hybrid Representation of Concept Lattices in Conceptual Knowledge Processing
Auteurs: Peter Eklund; Jean Villerd
Détail: Léonard Kwuida and Baris Sertkaya. I8th International Conference on Formal Concept Analysis - ICFCA 2010, Mar 2010, Agadir, Morocco. Springer Berlin / Heidelberg, Formal concept analysis, 5986, pp. 296-311, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Complémentarité des méthodes numériques et symboliques en pharmacovigilance
Auteurs: Jean Villerd; Yannick Toussaint; Agnès Lillo-Le Louet
Détail: Sylvie Desprès. 21èmes Journées Francophones d'Ingénierie des Connaissances, Jun 2010, Nîmes, France. Ecole des Mines d'Alès, Actes des 21èmes Journées Francophones d'Ingénierie des Connaissances, pp. 221-232
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Titre: Using Spatial Relations for Graphical Symbol Description
Auteurs: Santosh K.C.; Laurent Wendling; Bart Lamiroy
Détail: 20th International Conference on Pattern Recognition - ICPR 2010, Aug 2010, Istanbul, Turkey. IEEE, ICPR 2010 - 20th International Conference on Pattern Recognition, pp. 2041 - 2044
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Titre: Spatial Similarity based Stroke Number and Order Free Clustering
Auteurs: Santosh K.C.; Cholwich Nattee; Bart Lamiroy
Détail: International Conference on Frontiers in Handwriting Recognition, Nov 2010, Kolkata, India.
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Titre: Améliorer la remémoration par enrichissement de l'ontologie du domaine
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Jean Lieber; Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: 18ème atelier de Raisonnement à Partir de Cas - RàPC2010, Jun 2010, Strasbourg, France.
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Titre: Enrichir une ontologie pour améliorer la recherche d'information approximative
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier; Jean Lieber; Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: Atelier "Evolution d'ontologies" lors de la conférence Ingénierie des Connaissances (IC) 2010, Jun 2010, Nîmes, France.
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Titre: TAAABLE 3: Adaptation of ingredient quantities and of textual preparations
Auteurs: Alexandre Blansché; Julien Cojan; Valmi Dufour-Lussier; Jean Lieber; Pascal Molli; Emmanuel Nauer; Hala Skaf-Molli; Yannick Toussaint
Détail: 18h International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR 2010, "Computer Cooking Contest" Workshop Proceedings, Jul 2010, Alessandria, Italy.
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Titre: SHREC'10 Track: Protein Models
Auteurs: Lazaros Mavridis; Vishwesh Venkatraman; David Ritchie; H. Morikawa; Rumen Andonov; Alexandre Cornu; Noël Malod-Dognin; Jacques Nicolas; M. Temerinac-Ott; M. Reisert; H. Burkhardt; A. Axenopoulos; P. Daras
Détail: Eurographics Workshop on 3D Object Retrieval - 3DOR 2010, May 2010, Norrköping, Sweden.
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Titre: Using Graphics Processors to Accelerate Protein Docking Calculations
Auteurs: David Ritchie; Vishwesh Venkatraman; Lazaros Mavridis
Détail: HealthGrid 2010, 2010, Paris, France.
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Titre: Using Domain Knowledge to Guide Lattice-based Complex Data Exploration
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Helder Coelho, Rudi Studer and Michael Wooldridge. 19th European Conference on Artificial Intelligence - ECAI 2010, Aug 2010, Lisbon, Portugal. IOS press, 215, pp. 847-852, Frontiers in Artificial Intelligence and Applications
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Titre: Finding Minimal Rare Itemsets and Rare Association Rules
Auteurs: Laszlo Szathmary; Petko Valtchev; Amedeo Napoli
Détail: Proceedings of the 4th International Conference on Knowledge Science, Engineering and Management (KSEM 2010), 2010, Belfast, Northern Ireland, UK, United Kingdom. Springer, Knowledge Science, Engineering and Management, 6291, pp. 16-27, LNAI
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Titre: Embedding tolerance relations in formal concept analysis: an application in information fusion
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Zainab Assaghir; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli
Détail: Jimmy Huang and Nick Koudas and Gareth J. F. Jones and Xindong Wu and Kevyn Collins-Thompson and Aijun An. ACM Conference on Information and Knowledge Management, Oct 2010, Toronto, Canada. ACM, Proceedings of the 19th ACM Conference on Information and Knowledge Management, CIKM 2010, pp. 1689-1692
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Titre: A Possibility Theory-Oriented Discussion of Conceptual Pattern Structures
Auteurs: Zainab Assaghir; Mehdi Kaytoue; Henri Prade
Détail: Amol Deshpande and Anthony Hunter. Scalable Uncertainty Management, Sep 2010, Toulouse, France. Springer, Scalable Uncertainty Management - 4th International Conference. Proceedings., 6379, pp. 70-83, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Two Complementary Classification Methods for Designing a Concept Lattice from Interval Data.
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Zainab Assaghir; Nizar Messai; Amedeo Napoli
Détail: Sebastian Link and Henri Prade. Foundations of Information and Knowledge Systems, 6th International Symposium, Feb 2010, Sofia, Bulgaria. Springer, Foundations of Information and Knowledge Systems, 6th International Symposium. Proceedings., 5956, pp. 345-362, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Managing Information Fusion with Formal Concept Analysis
Auteurs: Zainab Assaghir; Mehdi Kaytoue; Amedeo Napoli; Henri Prade
Détail: Vicenç Torra and Yasuo Narukawa and Marc Daumas. Modeling Decisions for Artificial Intelligence - 7th International Conference, Oct 2010, Perpignan, France. Springer, Modeling Decisions for Artificial Intelligence - 7th International Conference. Proceedings., 6408, pp. 104-115, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Complémentarité de deux méthodes de classification pour la construction de treillis de concepts à partir de données numériques
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Zainab Assaghir; Nizar Messai; Amedeo Napoli
Détail: 17ème conférence en Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle, 2010, Caen, France.
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Titre: Organisation de la fusion d'information avec l'analyse formelle de concepts
Auteurs: Zainab Assaghir; Mehdi Kaytoue; Amedeo Napoli; Henri Prade
Détail: Journées Nationales de l'Intelligence Artificielle Fondamentale, Jun 2010, Strasbourg, France.
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Titre: Classification de données numériques par treillis de concepts basée sur une similarité symbolique/numérique
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Zainab Assaghir; Nizar Messai; Amedeo Napoli
Détail: Société Francophone de Classification - SFC 2010, 2010, Saint-Denis de la Réunion, France. pp. 99-102
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Titre: Coron : Plate-forme d'extraction de connaissances dans les bases de données
Auteurs: Baptiste Ducatel; Mehdi Kaytoue; Florent Marcuola; Amedeo Napoli; Laszlo Szathmary
Détail: 17ème conférence en Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle - RFIA 2010, Jan 2010, Caen, France. Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle - RFIA 2010, pp. 883-884
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Titre: The Coron System
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Florent Marcuola; Amedeo Napoli; Laszlo Szathmary; Jean Villerd
Détail: L. Boumedjout and P. Valtchev and L. Kwuida and B. Sertkaya. 8th International Conference on Formal Concept Analsis - ICFCA 2010, Mar 2010, Agadir, Morocco. 8th International Conference on Formal Concept Analsis (ICFCA) - Supplementary Proceedings, pp. 55-58
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Titre: Organisation de la fusion d'information avec l'analyse formelle de concepts
Auteurs: Zainab Assaghir; Mehdi Kaytoue; Amedeo Napoli; Henri Prade
Détail: Rencontres francophones sur la Logique Floue et ses Applications - LFA 2010, Nov 2010, Lannion, France.
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Conférences invitées

Titre: Why and How Knowledge Discovery Can Be Useful for Solving Problems with CBR
Auteurs: Amedeo Napoli
Détail: Isabelle Bichindaritz and Stefania Montani. Case-Based Reasoning. Research and Development, 18th International Conference on Case-Based Reasoning, ICCBR 2010, Alessandria, Italy, July 19-22, 2010. Proceedings, 2010, Alessandria (Italie), France. Springer, pp. 12-19, Lecture Notes in Computer Science 6176
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Robust and Precise Circular Arc Detection
Auteurs: Bart Lamiroy; Yassine Guebbas
Détail: Jean-Marc Ogier, Wenyin Liu, Josep Lladós. Graphics Recognition. Achievements, Challenges, and Evolution, 6020, Springer-Verlag, pp. 49-60, 2010, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Unified Pairwise Spatial Relations: An Application to Graphical Symbol Retrieval
Auteurs: Santosh K.C.; Laurent Wendling; Bart Lamiroy
Détail: Jean-Marc Ogier, Wenyin Liu and Josep Lladós. Graphics Recognition. Achievements, Challenges, and Evolution, 6020, Springer Berlin / Heidelberg, pp. 163-174, 2010, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-642-13728-0
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Directions d'ouvrages

Titre: Informations géographiques -- Connaissances et enjeux environnementaux
Auteurs: Florence Le Ber; Thérèse Libourel
Détail: Hermès - Lavoisier, pp. 141-271, 2010
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Titre: 18ème Atelier "Raisonnement à Partir de Cas" RàPC 2010
Auteurs: Florence Le Ber; Jean Renaud
Détail: Florence Le Ber et Jean Renaud. ., pp. 100, 2010
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Titre: Actes du 5ème atelier "Représentation et raisonnement sur le Temps et l'Espace" RTE 2010
Auteurs: Maroua Bouzid; Florence Le Ber; Gérard Ligozat; Odile Papini
Détail: Maroua Bouzid et Florence Le Ber et Gérard Ligozat et odile Papini. ., pp. 45, 2010
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Mémoires

Titre: Parsing Punctuation and Coordination Extragrammatically
Auteurs: Valmi Dufour-Lussier
Détail: [Master thesis 2], 2010, Université Nancy 2
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Rapports

Titre: Pattern Mining in Numerical Data: Extracting Closed Patterns and their Generators
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli
Détail: [Research Report], 2010, pp. 25. RR-7416
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Thèses

Titre: Analyse formelle de concepts et fusion d'informations : application à l'estimation et au contrôle d'incertitude des indicateurs agri-environnementaux
Auteurs: Zainab Assaghir
Détail: informatique. Institut National Polytechnique de Lorraine - INPL, Nov. 2010. French
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Titre: Simulation numérique et approche orientée connaissance pour la découverte de nouvelles molécules thérapeutiques
Auteurs: Leo Ghemtio
Détail: chimie physique moléculaire et structurale. Université Henri Poincaré - Nancy I, May. 2010. French
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Documents sans référence de publication

Titre: Les moteurs de wikis sémantiques : un état de l'art
Auteurs: Thomas Meilender; Nicolas Jay; Jean Lieber; Fabien Palomares
Détail: 2010
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2009

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Visualizing Social Photos on a Hasse Diagram for Eliciting Relations and Indexing New Photos
Auteurs: Michel Crampes; Jeremy Oliveira-Kumar; Sylvie Ranwez; Jean Villerd
Détail: IEEE Computer Graphics and Applications, IEEE, 2009, 15 (6), pp. 985-992
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Titre: Identification and characterisation of a novel immune-type receptor (NITR) gene cluster in the European sea bass, Dicentrarchus labrax, reveals recurrent gene expansion and diversification by positive selection
Auteurs: Serena Ferraresso; Heiner Kuhl; Massimo Milan; David Ritchie; Christopher Secombes; Richard Reinhardt; Lucao Bargelloni
Détail: Immunogenetics, Springer, 2009, 61 (11-12), pp. 773-788
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Titre: A new data mining approach for the detection of bacterial promoters combining stochastic and combinatorial methods
Auteurs: Catherine Eng; Charu Asthana; Bertrand Aigle; Sébastien Hergalant; Jean-Francois Mari; Pierre Leblond
Détail: Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2009, 16 (9), pp. 1211-1225
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Titre: Landscape regularity modelling for environmental challenges in agriculture
Auteurs: El Ghali Lazrak; Jean-Francois Mari; Benoît Marc
Détail: Landscape Ecology, Springer, 2009, Landscape Ecology, 25 (2), pp. 169-183
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Titre: Biological Profiling of Anti-HIV Agents and Insight into CCR5 Antagonist Binding Using in silico Techniques
Auteurs: Antonio Carrieri; Violeta Pérez-Nueno; Alessandra Fano; Carlo Pistone; David Ritchie; Jordi Teixidó
Détail: ChemMedChem, John Wiley & Sons, 2009, 4 (7), pp. 1153-1163
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Titre: Identification of threonine 348 as a residue involved in aminopeptidase A substrate specificity.
Auteurs: Cédric Claperon; Inmaculada Banegas-Font; Xavier Iturrioz; Raphael Rozenfeld; Bernard Maigret; Catherine Llorens-Cortes
Détail: The Journal of Biological Chemistry, 2009, 284 (16), pp. 10618-26
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Titre: Discovery of Novel HIV Entry Inhibitors for the CXCR4 Receptor by Prospective Virtual Screening
Auteurs: Violeta Perez-Nueno; Sofia Pettersson; David Ritchie; Jose Borrell; Jordi Teixido
Détail: Journal of chemical information and modeling, American Chemical Society, 2009, 49 (4), pp. 810-823
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Titre: Collective motions in glucosamine-6-phosphate synthase: influence of ligand binding and role in ammonia channelling and opening of the fructose-6-phosphate binding site.
Auteurs: Nicolas Floquet; Philippe Durand; Bernard Maigret; Bernard Badet; Marie-Ange Badet-Denisot; David Perahia
Détail: Journal of Molecular Biology, 2009, 385 (2), pp. 653-64
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Titre: Neutral modelling of agricultural landscapes by tessellation methods—Application for gene flow simulation.
Auteurs: Florence Le Ber; Claire Lavigne; Katarzyna Adamczyk; Frédérique Angevin; Nathalie Colbach; Jean-François Mari; Hervé Monod
Détail: Ecological Modelling, 2009, 220, pp. 3536-3545
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Titre: Does the availability of positron emission tomography modify diagnostic strategies for solitary pulmonary nodules? An observational study in France.
Auteurs: Irawati Lemonnier; Cédric Baumann; Nicolas Jay; Kazem Alzahouri; Patrick Arveux; Damien Jolly; Catherine Lejeune; Michel Velten; Fabien Vitry; Marie-Christine Woronoff-Lemsi; Francis Guillemin
Détail: BMC Cancer, 2009, 9, pp. 139
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Titre: CreChainDo: an iterative and interactive Web information retrieval system based on lattices
Auteurs: Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: International Journal of General Systems, Informa UK (Taylor & Francis), 2009, 38 (4), pp. 363-378
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Titre: Biochemical studies and Molecular Dynamics Simulations of Smad3-Erbin interaction identify a non-classical Erbin PDZ binding
Auteurs: Nadine Déliot; Matthieu Chavent; Claire Nourry; P. LÉcine; C. Arnaud; A. Hermant; Bernard Maigret; Jp Borg
Détail: Biochemical and Biophysical Research Communications / Biochemistry and Biophysics Research Communications, Elsevier, 2009, 378 (3), pp. 360-365
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Titre: Gene-Disease Relationship Discovery based on Model-driven Data Integration and Database View Definition
Auteurs: Saliha Yilmaz; Philippe Jonveaux; Cedric Bicep; Laurent Pierron; Malika Smail-Tabbone; Marie-Dominique Devignes
Détail: Bioinformatics, Oxford University Press, 2009, 25 (2), pp. 230 - 236
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Titre: A molecular modelling study to rationalize the regioselectivity in acylation of flavonoïd glycosides catalysed by Candida antartica lipase B
Auteurs: Eduardo De Oliveira; Catherine Humeau; Latifa Chebil; Elaine Maia; François Dehez; Bernard Maigret; Mohamed Ghoul; Jean-Marc Engasser
Détail: Journal of Molecular Catalysis B Enzymatic, Elsevier, 2009, 59 (1-3), pp. 96-105
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Titre: Analysis of c-Met Kinase Domain Complexes: A New Specific Catalytic Site Receptor Model for Defining Binding Modes of ATP-Competitive Ligands
Auteurs: Yasmine Asses; Vincent Leroux; Safia Tairi-Kellou; Rosanna Dono; Flavio Maina; Bernard Maigret
Détail: Chemical Biology & Drug Design, The Royal Society of Chemistry, 2009, 74 (6), pp. 560-570
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Titre: Self assembly of peptides near or within membranes using coarse grained MD simulations
Auteurs: A. Khalfa; W. Treptow; Bernard Maigret; M. Tarek
Détail: Chemical Physics, Elsevier, 2009, 358 (1-2), pp. 161-170
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Communications avec actes

Titre: Une approche de l'adaptation en raisonnement à partir de cas fondée sur l'optimisation sous contraintes
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: Cholvy, Laurence and Konieczny, Sébastien. Journées d'Intelligence Artificielle Fondamentale, Oct 2009, Marseille, France.
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Titre: The Model of Most Informative Patterns and Its Application to Knowledge Extraction from Graph Databases
Auteurs: Frédéric Pennerath; Amedeo Napoli
Détail: Wray L. Buntine and Marko Grobelnik and Dunja Mladenic and John Shawe-Taylor. European Conference, ECML PKDD 2009, Sep 2009, Bled, Slovenia. Springer Berlin / Heidelberg, 5782, pp. 205-220, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Knowledge acquisition and discovery for the textual case-based cooking system WIKITAAABLE
Auteurs: Fadi Badra; Julien Cojan; Amélie Cordier; Jean Lieber; Thomas Meilender; Alain Mille; Pascal Molli; Emmanuel Nauer; Amedeo Napoli; Hala Skaf-Molli; Yannick Toussaint
Détail: Sarah Jane Delany. 8th International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR 2009, Workshop Proceedings, Jul 2009, Seattle, United States. pp. 249-258
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Titre: Opportunistic Adaptation Knowledge Discovery
Auteurs: Fadi Badra; Amélie Cordier; Jean Lieber
Détail: Lorraine McGinty and David C. Wilson. 8th International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR 2009, Jul 2009, Seattle, United States. Springer, Case-Based Reasoning Research and Development, 5650, pp. 60-74, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Fuzzy Logic Approach to Represent and Propagate Imprecision in Agri-Environmental Indicator Assessment.
Auteurs: Zainab Assaghir; Philippe Girardin; Amedeo Napoli
Détail: Joao Paulo Carvalho and Didier Dubois and Uzay Kaymak and Jo{ã}o Miguel da Costa Sousa. Proceedings of the Joint 2009 International Fuzzy Systems Association World Congress and 2009 European Society of Fuzzy Logic and Technology Conference, Jul 2009, Lisbonne, Portugal. pp. 707-712
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Titre: Belief Merging-based Case Combination
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: David C. Wilson and Lorraine McGinty. 8th International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR 2009, Jul 2009, Seattle, United States. Springer Berlin, Case-Based Reasoning Research and Development, 5650, pp. 105-119, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Mining Safety Signals in Spontaneous Report Database using Concept Analysis
Auteurs: Mohamed Rouane Hacene; Yannick Toussaint; Petko Valtchev
Détail: Carlo Combi, Yuval Shahar and Ameen Abu-Hanna. 12th Conference on Artificial Intelligence in Medicine - AIME 2009, Jul 2009, Verona, Italy. Springer Berlin / Heidelberg, Artificial Intelligence in Medicine, 5651, pp. 285-294, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Découverte opportuniste de connaissances d'adaptation
Auteurs: Fadi Badra; Amélie Cordier; Jean Lieber
Détail: Béatrice Fuchs and Amedeo Napoli. 17ème atelier sur le raisonnement à partir de cas - RàPC-09, Jun 2009, Paris, France. pp. 23-34
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Titre: Le moteur de raisonnement à partir de cas de WikiTaaable
Auteurs: Jean Lieber
Détail: Béatrice Fuchs and Amedeo Napoli. 17ème atelier sur le raisonnement à partir de cas - RàPC-09, Jun 2009, Paris, France.
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Titre: WikiTaaable, un wiki sémantique utilisé comme un tableau noir dans un système de raisonnement à partir de cas textuel
Auteurs: Amélie Cordier; Jean Lieber; Pascal Molli; Emmanuel Nauer; Hala Skaf-Molli; Yannick Toussaint
Détail: Béatrice Fuchs and Amedeo Napoli. 17ème atelier de Raisonnement à Partir de Cas - RàPC 2009, Jun 2009, Paris, France.
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Titre: WIKITAAABLE: A semantic wiki as a blackboard for a textual case-based reasoning system
Auteurs: Amélie Cordier; Jean Lieber; Pascal Molli; Emmanuel Nauer; Hala Skaf-Molli; Yannick Toussaint
Détail: SemWiki 2009 - 4rd Semantic Wiki Workshop at the 6th European Semantic Web Conference - ESWC 2009, Jun 2009, Heraklion, Greece.
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Titre: WICRI : construire des réseaux de la recherche et de l'innovation dans l'UPM
Auteurs: Jacques Ducloy; Alice Hermann; Patrick Mussot; Valérie Warth; Jean-Pierre Thomesse
Détail: Espace Numérique Ouvert Pour la Méditerranée, Mar 2009, Agadir, Morocco.
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Titre: Correspondances de Galois pour la manipulation de contextes flous multi-valués
Auteurs: Aurélie Bertaux; Florence Le Ber; Agnès Braud
Détail: Extraction et Gestion de Connaissances, Jan 2009, Strasbourg, France. Cépaduès, pp. 193-198, RNTI
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Titre: Identifying ecological traits: a concrete FCA-based approach
Auteurs: Aurélie Bertaux; Florence Le Ber; Agnès Braud; Michèle Trémolières
Détail: S. Ferré, S. Rudolph. 7th International Conference on Formal Concept Analysis - ICFCA 2009, May 2009, Darmstadt, Germany. Springer, 5548, pp. 224-236, LNAI
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Titre: Une démarche fondée sur les treillis de Galois pour l'aide à la qualification de l'état des milieux aquatiques
Auteurs: Agnès Braud; Corinne Grac; Silvia Pristavu; Emilie Dor; Florence Le Ber
Détail: SIDE 2009, 2009, Toulouse, France. pp. 95-104
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Titre: Utilisation d'une algèbre temporelle pour la représentation et l'adaptation de recettes de cuisine
Auteurs: Florence Le Ber; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: 17ème Séminaire Raisonnement à partir de Cas, Jun 2009, Paris, France. pp. 141-149
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Titre: Combiner treillis de Galois et analyse factorielle multiple pour l'analyse de traits biologiques
Auteurs: Aurélie Bertaux; Florence Le Ber; Pulu Li; Michèle Trémolières
Détail: XVIème Recontres de la Société Francophone de Classification - SFC 2009, Sep 2009, Grenoble, France. pp. 117-120
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Titre: Relative impacts of closest fields and background pollen on GM adventitious presence rates in non-GM harvests
Auteurs: Frédérique Angevin; Etienne K. Klein; Jean-François Mari; Florence Le Ber; Katarzyna Adamczyk; Hervé Monod; Claire Lavigne
Détail: Genetically Modified Crops Coexistence Conference, 2009, Melbourne, Australia. pp. 1-7
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Titre: Éléments de réflexion sur les composants d'ontologies et leur manipulation par RàPC
Auteurs: Béatrice Fuchs; Amedeo Napoli
Détail: Béatrice Fuchs et Amedeo Napoli. 17ième séminaire sur le raisonnement à partir de Cas, Paris, 2009, France. LORIA, pp. 107-113
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Titre: Segmentation of Continuous Document Flow by a modified Backward- Forward algorithm
Auteurs: Thomas Meilender; Abdel Belaïd
Détail: SPIE - Electronic Imaging, 2009, Los Angeles, United States.
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Titre: Analyse de données transcriptomiques: Modélisation floue de profils d'expression différentielle et analyse fonctionnelle.
Auteurs: Sidahmed Benabderrahmane; Marie-Dominique Devignes; Malika Smaïl-Tabbone; O. Poch; Amedeo Napoli; N. Nguyen N.-H; W. Raffelsberger
Détail: Actes du XXVIIième congrès Informatique des Organisations et Systèmes d'information et de décision - INFORSID 2009, May 2009, Toulouse, France. pp. 413-428
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Titre: A KDD Approach for Designing Filtering Strategies to Improve Virtual Screening
Auteurs: Léo Ghemtio; Malika Smail-Tabbone; Marie-Dominique Devignes; Michel Souchet; Bernard Maigret
Détail: Ana Fred. KDIR - International Conference on Knowledge Discovery and Information Retrieval, Oct 2009, Madeira, Portugal. INSTIC
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Titre: From data to knowledge through collaboration: bridging Wikis and Knowledge Systems
Auteurs: Hernan Astudillo; Gérôme Canals; Alicia Diaz; Amedeo Napoli; Maria-Graça Pimentel
Détail: COLIBRI, Jul 2009, Bento Gonçalves, Brazil.
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Titre: Taaable : système de recherche et de création, par adaptation, de recettes de cuisine
Auteurs: Amélie Cordier; Jean Lieber; Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: Extraction et gestion des connaissances – EGC'2009, 2009, Strasbourg, France. pp. 479-481
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Titre: Two FCA-Based Methods for Mining Gene Expression Data
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sébastien Duplessis; Sergei O. Kuznetsov; Amedeo Napoli
Détail: Sébastien Ferré and Sebastian Rudolph. Formal Concept Analysis, 7th International Conference, ICFCA 2009, Apr 2009, Darmstadt, Germany. Springer, Formal Concept Analysis, 7th International Conference, 5548, pp. 251-266, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: L'analyse formelle de concepts pour l'extraction de connaissances dans les données d'expression de gènes
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sébastien Duplessis; Amedeo Napoli
Détail: Extraction et gestion des connaissances, Jan 2009, Strasbourg, France. Extraction et gestion des connaissances (EGC'2009), Actes., RNTI-E-15, pp. 439-440, Revue des Nouvelles Technologies de l'Information
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Titre: Classification de données numériques par treillis de concepts et structures de patrons
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Amedeo Napoli
Détail: Journées Nationales de l'Intelligence Artificielle Fondamentale, Oct 2009, Marseille, France.
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Titre: On the mining of numerical data with Formal Concept Analysis and similarity
Auteurs: Zainab Assaghir; Mehdi Kaytoue; Nizar Messai; Amedeo Napoli
Détail: Société Francophone de Classification, 2009, Grenoble, France.
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Titre: Efficient Vertical Mining of Frequent Closures and Generators
Auteurs: Laszlo Szathmary; Petko Valtchev; Amedeo Napoli; Robert Godin
Détail: Niall M. Adams and Céline Robardet and Arno Siebes and Jean-François Boulicaut. 8th International Symposium on Intelligent Data Analysis - IDA 2009, Aug 2009, Lyon, France. Springer, 5772, pp. 393-404, Lecture Notes in Computer Science
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Communications sans actes

Titre: Response of biological indices to pressures in the running waters of the Alsace floodplain (eastern France). Towards a proposal of a new tool for assessing ecological status of waterbodies
Auteurs: Corinne Grac; Florence Le Ber; Photis Nobelis; Michel Lafont; Michèle Trémolières
Détail: 6th symposium for European Freshwater Sciences - SEFS 6, Aug 2009, Sinaia, Romania.
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Titre: Comment évaluer la qualité des données de bases régionales ou nationales des RSA en vue d'une utilisation épidémiologique à partir de l'analyse formelle de concept et des treillis de Galois
Auteurs: Nicolas Jay; François Kohler
Détail: XXIIe journées EMOIS, Mar 2009, Nancy, France.
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Titre: Fouille de données à l'aide de modèles stochastiques : segmentation temporo-spatiale des successsions de cultures d'un territoire agricole à l'aide de HMM2
Auteurs: El-Ghali Lazrak; Marc Benoît; Jean-Francois Mari
Détail: STIC 2009 Environnement, Jun 2009, Calais, France.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Maîtriser les ressources numériques : biologie "in silico"
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Magali Roux. Biologie L'ère numérique, CNRS Editions, pp. 189-222, Jun. 2009, 9782271067791
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Titre: Combining knowledge discovery, ontologies, annotations, and semantic wikis
Auteurs: Hernan Astudillo; Victor Codocedo; Gérôme Canals; Diego Torres; Alicia Diaz; Amedeo Napoli; Alan Gomes; Maria-Graça Pimentel
Détail: Mário Meireles Teixeira. Webmedia Minicourse Book, SBC, 2009
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Titre: A Conformity Measure using Background Knowledge for Association Rules: Application to Text Mining
Auteurs: Hacène Cherfi; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: Yanchang Zhao and Chengqi Zhang and Longbing Cao. Post-Mining of Association Rules: Techniques for Effective Knowledge Extraction, IGI Global, 2009, 978-1605664040
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Ouvrages scientifiques

Titre: Actes du 17ième séminaire sur le raisonnement à partir de Cas, Paris (29--30 juin)
Auteurs: Béatrice Fuchs; Amedeo Napoli
Détail: Béatrice Fuchs et Amedeo Napoli. LORIA, 200 p., 2009
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Rapports

Titre: Efficient Vertical Mining of Frequent Closed Itemsets and Generators
Auteurs: Laszlo Szathmary; Petko Valtchev; Amedeo Napoli
Détail: [Research Report], 2009, pp. 16
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Thèses

Titre: Extraction de connaissances d'adaptation en raisonnement à partir de cas
Auteurs: Fadi Badra
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Nov. 2009. French
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Titre: Analyses formelle et relationnelle de concepts pour la construction d'ontologies de domaines à partir de ressources textuelles hétérogènes
Auteurs: Rokia Bendaoud
Détail: Université Henri Poincaré - Nancy I, Jul. 2009. French
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Titre: Méthodes d'extraction de connaissances à partir de données modélisables par des graphes. Application à des problèmes de synthèse organique.
Auteurs: Frédéric Pennerath
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Jul. 2009. French
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Titre: Analyse de concepts formels guidée par des connaissances de domaine : Application à la découverte de ressources génomiques sur le Web
Auteurs: Nizar Messai
Détail: information cognition et apprentissages. Université Henri Poincaré - Nancy I, Mar. 2009. French
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Titre: Vers une nouvelle stratégie pour l'assemblage interactif de macromolécules
Auteurs: Matthieu Chavent
Détail: chimie organique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Jan. 2009. French
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2008

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Asp218 participates with Asp213 to bind a Ca2+ atom into the S1 subsite of aminopeptidase A: a key element for substrate specificity.
Auteurs: Cédric Claperon; Raphael Rozenfeld; Xavier Iturrioz; Nicolas Inguimbert; Mayumi Okada; Bernard Roques; Bernard Maigret; Catherine Llorens-Cortes
Détail: Biochemical Journal, 2008, 416 (1), pp. 37-46
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Titre: How do genetically modified (GM) crops contribute to background levels of GM pollen in an agricultural landscape?
Auteurs: Claire Lavigne; Etienne K. Klein; Jean-François Mari; Florence Le Ber; Katarzyna Adamczyk; Hervé Monod; Frédérique Angevin
Détail: Journal of Applied Ecology, 2008, 45 (4), pp. 1104-1113
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Titre: Étude longitudinale d'une procédure de modélisation de connaissances en matière de gestion du territoire agricole
Auteurs: Florence Le Ber; Christian Brassac
Détail: Revue d'Anthropologie des Connaissances, 2008, 2 (2), pp. 151-168
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Titre: Raisonnement à partir de cas et agronomie des territoires - Constructions croisées
Auteurs: Pierre-Louis Osty; Florence Le Ber; Jean Lieber
Détail: Revue d'Anthropologie des Connaissances, 2008, 2 (2), pp. 169-193
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Titre: Mining for adverse drug events with formal concept analysis.
Auteurs: Alexander Estacio-Moreno; Yannick Toussaint; Cédric Bousquet
Détail: Studies in health technology and informatics, 2008, 136, pp. 803-808
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Titre: La famille des motifs les plus informatifs. Application à l'extraction de graphes en chimie organique
Auteurs: Frédéric Pennerath; Amedeo Napoli
Détail: Information - Interaction - Intelligence, 2008, 8 (2), pp. 153-179
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Titre: Analyse de l'émergence de connaissances au cours d'un processus collectif. Re-catégorisations, reformulations, stabilisations
Auteurs: Christian Brassac; Sylvie Lardon; Florence Le Ber; Lorenza Mondada; Pierre-Louis Osty
Détail: Revue d'Anthropologie des Connaissances, 2008, Vol. 2 (2), pp. 267-286
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Titre: Insights into the binding and activation sites of the receptors for cholecystokinin and gastrin
Auteurs: Magali Foucaud; Elodie Archer-Lahlou; Esther Marco; Irina G. Tikhonova; Bernard Maigret; Chantal Escrieut; Ingrid Langer; Daniel Fourmy
Détail: Regulatory Peptides, Elsevier, 2008, 145 (1-3), pp. 17-23
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Titre: Analyse formelle de données relationnelles pour la réingénierie des modèles UML
Auteurs: Mohamed Rouane-Hacene; Michel Dao; Marianne Huchard; Petko Valtchev
Détail: Ingénierie des Systèmes d'Information - Revue des sciences et technologies de l'information (ISI-RSTI), Hermes, 2008
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Titre: Ontology-guided data preparation for discovering genotype-phenotype relationships
Auteurs: Adrien Coulet; Malika Smail-Tabbone; Pascale Benlian; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: BMC Bioinformatics, BioMed Central Ltd, 2008, 9 (Suppl 4), pp. S3
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Titre: Cluster Induced fit in liver X receptor beta: a molecular dynamics-based investigation
Auteurs: Alexandre Beautrait; Arnaud S. Karaboga; Michel Souchet; Bernard Maigret
Détail: Proteins Structure Function and Bioinformatics, Wiley Interscience, 2008, 72 (3), pp. 873-882
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Titre: Multiple-step virtual screening using VSM-G: overview and validation of fast geometrical matching enrichment.
Auteurs: Alexandre Beautrait; Vincent Leroux; Matthieu Chavent; Léo Ghemtio; Marie-Dominique Devignes; Malika Smail-Tabbone; Wensheng Cai; Xuegang Shao; Gilles Moreau; Peter Bladon; Jianhua Yao; Bernard Maigret
Détail: Journal of Molecular Modeling, Springer-Verlag, 2008, 14 (2), pp. 135-148
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Titre: SHEF: a vHTS geometrical filter using coefficients of spherical harmonic molecular surfaces
Auteurs: Wensheng Cai; Jiawei Xu; Xueguang Shao; Vincent Leroux; Alexandre Beautrait; Bernard Maigret
Détail: Journal of Molecular Modeling, Springer-Verlag, 2008, 14 (5), pp. 393-401
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Titre: MetaMol: High-quality visualization of molecular skin surface
Auteurs: Matthieu Chavent; Bruno Lévy; Bernard Maigret
Détail: Journal of Molecular Graphics and Modelling, Elsevier, 2008, 27 (2), pp. 209-216
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Titre: Exploring the binding pocket for pyridopyrimidine ligands at the CCK1 receptor by molecular docking.
Auteurs: Amel Toumi-Maouche; Boubekeur Maouche; Safia Tairi-Kellou; Salima El-Aoufi; Mercedes Martin-Martinez; Rosario Gonzalez-Muniz; Daniel Fourmy; Bernard Maigret
Détail: Journal of Molecular Modeling, Springer-Verlag, 2008, 14 (4), pp. 303-314
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Titre: A new Met inhibitory-scaffold identified by a focused forward chemical biological screen.
Auteurs: Salvatore Patané; Nicolas Pietrancosta; Hessameh Hassani; Vincent Leroux; Bernard Maigret; Jean-Louis Kraus; Rosanna Dono; Flavio Maina
Détail: Biochemical and Biophysical Research Communications / Biochemistry and Biophysics Research Communications, Elsevier, 2008, 375 (2), pp. 184-189
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Titre: Contribution of molecular modeling and site-directed mutagenesis to the identification of threonine 348 as a residue involved in aminopeptidase a substrate specificity.
Auteurs: Cédric Claperon; Raphael Rozenfeld; Xavier Iturrioz; Nicolas Inguimbert; Mayumi Okada; Bernard Roques; Bernard Maigret; Catherine Llorens-Cortes
Détail: The Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2008
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Titre: Modeling adaptation of breast cancer treatment decision protocols in the Kasimir project
Auteurs: Jean Lieber; Mathieu D'Aquin; Fadi Badra; Amedeo Napoli
Détail: Applied Intelligence, Springer, 2008, 28 (3), pp. 261-274
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Communications avec actes

Titre: Mining Intervals of Graphs to Extract Characteristic Reaction Patterns
Auteurs: Frédéric Pennerath; Géraldine Polaillon; Amedeo Napoli
Détail: DS 2008, Oct 2008, Budapest, Hungary. Springer Berlin / Heidelberg, 5255, pp. 210-221, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: A Method for Classifying Vertices of Labeled Graphs Applied to Knowledge Discovery from Molecules
Auteurs: Frédéric Pennerath; Géraldine Polaillon; Amedeo Napoli
Détail: ECAI'2008, Jul 2008, Patras, Greece. 178, pp. 147-151
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Titre: Arpentage: Analyse de Régularités Paysagères pour l'Environnement dans les territoires Agricoles
Auteurs: El-Ghali Lazrak; Jean-Francois Mari; Marc Benoît
Détail: Symposium "Spatial landscape modelling: from dynamic approaches to functional evaluation", Jun 2008, Toulouse, France.
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Titre: Familles génératrices de règles d'adaptation pour assister leur acquisition semi-automatique.
Auteurs: Matthieu Tixier; Fadi Badra; Jean Lieber
Détail: 19es Journées Francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC 2008), Jun 2008, Nancy, France. pp. 225-236
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Titre: Prétraitement des bases de données de réactions chimiques pour la fouille de schémas de réactions
Auteurs: Frédéric Pennerath; Géraldine Polaillon; Amedeo Napoli
Détail: 8èmes journées Extraction et Gestion des Connaissances, Feb 2008, Sophia-Antipolis, France. 2, pp. 547-558, Revue des Nouvelles Technologies de l'Information
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Titre: Le problème de l'extraction des graphes informatifs. Application à l'extraction de connaissance à partir de bases de réactions chimiques
Auteurs: Frédéric Pennerath; Amedeo Napoli
Détail: 16e congrès francophone AFRIF-AFIA Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle - RFIA 2008, Jan 2008, Amiens, France. pp. 133-142
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Titre: Opportunistic Acquisition of Adaptation Knowledge and Cases - The IakA Approach
Auteurs: Amélie Cordier; Béatrice Fuchs; Léonardo Lana De Carvalho; Jean Lieber; Alain Mille
Détail: European Conference on Case-Based Reasoning, Sep 2008, Trier, Germany. Springer, pp. 150-164
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Titre: First Elements on Knowledge Discovery guided by Domain Knowledge (KDDK)
Auteurs: Jean Lieber; Amedeo Napoli; Laszlo Szathmary; Yannick Toussaint
Détail: Saddok Ben Yahia, Engelbert Mephu Nguifo and Radim Belohlavek. Fourth International Conference on Concept Lattices and Applications - CLA 2006, Oct 2006, Hammamet, Tunisia. Springer, 4923, pp. 22-41, 2008, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Analysis of social communities with iceberg and stability-based concept lattices
Auteurs: Nicolas Jay; François Kohler; Amedeo Napoli
Détail: Raoul Medina and Sergei Obiedkov. 6th International Conference on Formal Concept Analysis - ICFCA 2008, Feb 2008, Montréal, Canada. Springer, 4933, pp. 258-272, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Utilisation de la théorie de possibilités pour calculer un indicateur agri-environnemental
Auteurs: Zainab Assaghir; Philippe Girardin; Amedeo Napoli
Détail: Actes de la conférence : Rencontres francophones sur la Logique Floue et ses Applications - LFA 2008, Oct 2008, Lens, France. pp. 390-397
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Titre: Using Formal Concept Analysis for mining and interpreting patient flows within a healthcare network
Auteurs: Nicolas Jay; François Kohler; Amedeo Napoli
Détail: Fourth International Conference on Concept Lattices and Their Applications - CLA 2006, Oct 2006, Hammamet, Tunisia. 2008
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Titre: Classification dynamique par treillis de concepts pour la recherche d'information sur le web.
Auteurs: Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: 5ème Conférence de recherche en information et applications - CORIA 2008, Mar 2008, Trégastel, France. pp. 71-86
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Titre: PACTOLE: A methodology and a system for semi-automatically enriching an ontology from a collection of texts
Auteurs: Rokia Bendaoud; Yannick Toussaint; Amedeo Napoli
Détail: 16th International Conference on Conceptual Structures ICCS'08, Jul 2008, Toulouse, France. Conceptual Structures: Knowledge Visualization and Reasoning, 5113, pp. 203-216
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Titre: Refactorings of Design Defects using Relational Concept Analysis
Auteurs: Naouel Moha; Mohamed Rouane-Hacene; Yann-Gael Gueheneuc; Petko Valtchev
Détail: Medina, Raoul and Obiedkov, Sergei. 6th International Conference on Formal Concept Analysis - ICFCA 2008, Feb 2008, Montréal, Canada. Springer, 4933, pp. 289-304, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Ontology Learning from Text using Relational Concept Analysis
Auteurs: Mohamed Rouane-Hacene; Amedeo Napoli; Petko Valtchev; Yannick Toussaint; Rokia Bendaoud
Détail: International MCETECH Conference on e-Technologies - MCETECH 2008, Jan 2008, Montréal, Canada.
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Titre: Extraction de connaissances à partir de données relationnelles avec l'analyse formelle de concepts
Auteurs: Mohamed Rouane-Hacene; Marianne Huchard; Amedeo Napoli; Petko Valtchev
Détail: 16e congrès francophone AFRIF-AFIA Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle - RFIA'08, Jan 2008, Amiens, France.
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Titre: Constructing Iceberg Lattices from Frequent Closures Using Generators
Auteurs: Laszlo Szathmary; Petko Valtchev; Amedeo Napoli; Robert Godin
Détail: J.-F. Boulicaut and M. R. Berthold and T. Horvath. 11th International Conference on Discovery Science - DS '08, Oct 2008, Budapest, Hungary. Springer Berlin / Heidelberg, Discovery Science, 5255, pp. 136-147, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: An Efficient Hybrid Algorithm for Mining Frequent Closures and Generators
Auteurs: Laszlo Szathmary; Petko Valtchev; Amedeo Napoli; Robert Godin
Détail: Radim Belohlavek and Sergei O. Kuznetsov. 6th International Conference on Concept Lattices and Their Applications (CLA '08), Oct 2008, Olomouc, Czech Republic. pp. 47-58
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Titre: Formalisation de l'adaptation conservatrice dans les espaces métriques
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: De Loor, Pierre and Bénard Romain. 16ème atelier de Raisonnement à Partir de Cas - RàPC 2008, Apr 2008, Nancy, France.
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Titre: Conservative Adaptation in Metric Spaces
Auteurs: Julien Cojan; Jean Lieber
Détail: Althoff, Klaus-Dieter and Bergmann, Ralph and Minor, Mirjam and Hanft, Alexandre. 9th European Conference on Case-Based Reasoning - ECCBR 2008, Sep 2008, Trier, Germany. Springer-Verlag, Advances in Case-Based Reasoning, 5239, pp. 135-149, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Edhibou: a Customizable Interface for Decision Support in a Semantic Portal
Auteurs: Fadi Badra; Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Thomas Meilender
Détail: Christian Bizer and Anupam Joshi. 7th International Semantic Web Conference - ISWC 2008, Oct 2008, Karlsruhe, Germany. CEUR-WS.org
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Titre: Representing Case Variations for Learning General and Specific Adaptation Rules
Auteurs: Fadi Badra; Jean Lieber
Détail: Amedeo Cesta and Nikos Fakotakis. Fourth Starting AI Researcher's Symposium (STAIRS 2008), Jul 2008, Patras, Greece. IOS Press, pp. 1-11
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Titre: TAAABLE: Text Mining, Ontology Engineering, and Hierarchical Classification for Textual Case-Based Cooking
Auteurs: Fadi Badra; Rokia Bendaoud; Rim Bentebibel; Pierre-Antoine Champin; Julien Cojan; Amélie Cordier; Sylvie Després; Stéphanie Jean-Daubias; Jean Lieber; Thomas Meilender; Alain Mille; Emmanuel Nauer; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: Martin Schaaf. 9th European Conference on Case-Based Reasoning - ECCBR 2008, Workshop Proceedings, Sep 2008, Trier, Germany. pp. 219-228
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Titre: Many-Valued Concept Lattices for Conceptual Clustering and Information Retrieval
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Malik Ghallab. 18th European Conference in Artificial Intelligence - ECAI 2008, Jul 2008, Patras, Greece. IOS Press, pp. 127-131
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Titre: BioRegistry: Automatic Extraction of Metadata for Biological Database Retrieval and Discovery
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Philippe Franiatte; Nizar Messai; Amedeo Napoli; Malika Smail-Tabbone
Détail: 1st international workshop on Ressource Discovery (RED), Joint to iiWAS 2008, Nov 2008, Linz, Austria.
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Titre: Ontology Refinement through Role Assertion Analysis: Example in Pharmacogenomics
Auteurs: Adrien Coulet; Malika Smail-Tabbone; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: Franz Baader and Carsten Lutz and Boris Motik. 21st International Workshop on Description Logics - DL2008, May 2008, Dresden, Germany.
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Titre: Extending Attribute Dependencies for Lattice-Based Querying and Navigation
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smail-Tabbone
Détail: Peter W. Eklund and Ollivier Haemmerlé. 16th International Conference on Conceptual Structures - ICCS 2008, Jul 2008, Toulouse, France. Springer, Conceptual Structures: Knowledge Visualization and Reasoning, 5113, pp. 189-202, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: A Proposal for an Interactive Ontology Design Process based on Formal Concept Analysis
Auteurs: Rokia Bendaoud; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: Carole Eschenbach and Michael Grüninger. 5th international conference on Formal Ontology in Information Systems - FOIS 2008, Oct 2008, Saarbrücken, Germany. IOS Press, 183, pp. 311-323, Frontiers in Artificial Intelligence and Applications
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Titre: Formal Concept Analysis: A unified framework for building and refining ontologies
Auteurs: Rokia Bendaoud; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: Aldo Gangemi and Jérôme Euzenat. 16th International Conference on Knowledge Engineering and Knowledge Management - EKAW 2008, Sep 2008, Acitrezza, Catania, Italy. Springer Berlin / Heidelberg, Knowledge Engineering: Practice and Patterns, 5268, pp. 156-171, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Using Formal Concept Analysis for the Extraction of Groups of Co-expressed Genes
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sébastien Duplessis; Amedeo Napoli
Détail: Le Thi Hoai An and Pascal Bouvry and Pham Dinh Tao. Modelling, Computation and Optimization in Information Systems and Management Sciences, Sep 2008, Metz, France. Springer, Modelling, Computation and Optimization in Information Systems and Management Sciences, Second International Conference. Proceedings., 14, pp. 439-449, Communications in Computer and Information Science
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Titre: Toward the discovery of itemsets with significant variations in gene expression matrices
Auteurs: Mehdi Kaytoue; Sébastien Duplessis; Amedeo Napoli
Détail: First joint meeting of the Société Francophone de Classification and the Classification and Data Analysis Group of the Italian Statistical Society - SFC - CLADAG 2008, Jun 2008, Caserta, Italy.
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Communications sans actes

Titre: Traitement d'imperfections des indicateurs agri-environnentaux
Auteurs: Zainab Assaghir; Philippe Girardin; Amedeo Napoli
Détail: Manifestation des Jeunes Chercheurs en Sciences et Technologies de l'Information et de la Communication - MajecSTIC 2008, Oct 2008, Marseille, France.
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Titre: GenExP, a software for simulating random field-patterns
Auteurs: Florence Le Ber; Katarzyna Adamczyk; Claire Lavigne; Jean-François Mari
Détail: Spatial Landscape Modelling Symposium, Jun 2008, Toulouse, France.
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Titre: Modéliser l'entre deux dans l'organisation spatiale des exploitations agricoles
Auteurs: Florence Le Ber; Christian Brassac
Détail: Journées Jean-Pierre Deffontaines, Apr 2008, Versailles, France.
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Titre: Model-driven data integration for mining protein-ligand and protein-protein interactions in a drug design context.
Auteurs: Leo Ghemtio; Emmanuel Bresso; Michel Souchet; Bernard Maigret; Malika Smaïl-Tabbone; Marie-Dominique Devignes
Détail: Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM 2008, Jun 2008, Lille, France.
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Directions d'ouvrages

Titre: Actes du colloque international "Spatial Analysis and GEOmatics", SAGEO'08 - 25-27 juin 2008
Auteurs: Florence Le Ber; Thérèse Libourel
Détail: SIGMA, pp. actes sur CD, 2008
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Titre: Actes du 4ème atelier Représentation et raisonnement sur le temps et l'espace (RTE 2008), SAGEO'08, Montpellier
Auteurs: Maroua Bouzid; Florence Le Ber; Gérard Ligozat; Odile Papini
Détail: SIGMA, pp. 68, 2008
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HDR

Titre: Contributions à la conception de systèmes de raisonnement à partir de cas
Auteurs: Jean Lieber
Détail: Université Henri Poincaré - Nancy I, Jan. 2008. French
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Autres publications

Titre: Introduction au dossier "De la bergerie au centre de calcul : élaboration collective de connaissances spatiales"
Auteurs: Florence Le Ber
Détail: 2008. Introduction à un ensemble d'articles de la revue d'anthropologie des connaissances (volume 2, numéro 2)
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Rapports

Titre: Dynamiques des systèmes de culture du bassin de la Seine : mise en évidence d'une intensification des pratiques culturales au cours des trois dernières décennies
Auteurs: Céline Schott; Marc Benoît; Catherine Mignolet; Jean-François Mari
Détail: [Research Report], 2008
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Titre: Efficient Mining of Frequent Closures with Precedence Links and Associated Generators
Auteurs: Laszlo Szathmary; Petko Valtchev; Amedeo Napoli
Détail: [Research Report], 2008, pp. 58. RR-6657
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Thèses

Titre: Construction et utilisation d'une base de connaissances pharmacogénomique pour l'intégration de données et la découverte de connaissances
Auteurs: Adrien Coulet
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Oct. 2008. French
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Titre: Découverte et représentation des trajectoires de soins par analyse formelle de concepts
Auteurs: Nicolas Jay
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Oct. 2008. French
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Titre: Développement et validation de la plateforme de criblage virtuel VSM-G et étude du domaine FAT de la kinase d'adhérence focale FAK
Auteurs: Alexandre Beautrait
Détail: Bioinformatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Jan. 2008. French
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Documents sans référence de publication

Titre: Decision support systems in oncology: Are we there yet?
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: 2008
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2007

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Aspects de la réingénierie des modèles UML par analyse de données relationnelles
Auteurs: Mohamed Hacene Rouane; Michel Dao; Marianne Huchard; Petko Valtchev
Détail: Ingénierie des Systèmes d'information (RSTI série) - Modèles et espace technologique des systèmes d'information, Hermès-Lavoisier, 2007, 12 (5), pp. 39-68
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Titre: Functional dissociation between apelin receptor signaling and endocytosis: implications for the effects of apelin on arterial blood pressure
Auteurs: Xavier Iturrioz; Said El Messari; N. De Mota; C. Fassot; Rodrigo Alvear-Perez; Bernard Maigret; Catherine Llorens-Cortes
Détail: Archives des maladies du coeur et des vaisseaux, 2007, 100 (8), pp. 704-8
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Titre: Relational Concept Discovery in Structured Datasets
Auteurs: Marianne Huchard; Mohamed Hacene Rouane; Cyril Roume; Petko Valtchev
Détail: Annals of Mathematics and Artificial Intelligence, Springer Netherlands, 2007, 49 (1/4), pp. 39-76
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Titre: The Galois lattice as a hierarchical structure for topological relations
Auteurs: Amedeo Napoli; Florence Le Ber
Détail: Annals of Mathematics and Artificial Intelligence, 2007, pp. 1-20
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Titre: GenExP, un logiciel simulateur de paysages agricoles pour l'étude de la diffusion de transgènes
Auteurs: Katarzyna Adamczyk; Frédérique Angevin; Nathalie Colbach; Claire Lavigne; Florence Le Ber; Jean-François Mari
Détail: Revue internationale de Géomatique, 2007, 17 (3-4), pp. 469-487
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Titre: Correction et complétude d'un algorithme de recherche d'information par treillis de concepts
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Revue des Nouvelles Technologies de l'Information RNTI, Cépaduès Editions, 2007
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Titre: PGY Repeats and N-Glycans Govern the Trafficking of Paranodin and Its Selective Association with Contactin and Neurofascin-155
Auteurs: Carine Bonnon; Christophe Bel; Laurence Goutebroze; Bernard Maigret; Jean-Antoine Girault; Catherine Faivre-Sarrailh
Détail: Molecular Biology of the Cell, American Society for Cell Biology, 2007, 18 (1), pp. 229-241
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Titre: Role of water molecules for binding inhibitors in the SH2 domain of Grb2: a molecular dynamics study
Auteurs: Vincent Leroux; Nohad Gresh; Wang-Qing Liu; Christiane Garbay; Bernard Maigret
Détail: Journal of Molecular Structure THEOCHEM, Elsevier, 2007, 806 (1-3), pp. 51-66
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Titre: Validated ligand binding sites in CCK receptors. Next step: computer-aided design of novel CCK ligands
Auteurs: Irina G. Tikhonova; Esther Marco; Elodie Lahlou-Archer; Ingrid Langer; Magali Foucaud; Bernard Maigret; Daniel Fourmy
Détail: Current Topics in Medicinal Chemistry, Bentham Science Publishers, 2007, 7 (12), pp. 1243-1247
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Titre: Ammonia channeling in bacterial glucosamine-6-phosphate synthase (Glms): molecular dynamics simulations and kinetic studies of protein mutants
Auteurs: Nicolas Floquet; Stéphane Mouilleron; Rasha Daher; Bernard Maigret; Bernard Badet; Marie-Ange Badet-Denisot
Détail: FEBS Letters / FEBS-Letters; FEBS Microbiol Lett, Elsevier, 2007, 581 (16), pp. 2981-2987
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Titre: Discovering new inhibitors of bacterial glucosamine-6P synthase (GlmS) by docking simulations
Auteurs: Nicolas Floquet; Céline Richez; Philippe Durand; Bernard Maigret; Bernard Badet; Marie-Ange Badet-Denisot
Détail: Bioorganic & Medicinal Chemistry letters / Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters (Bioorg Med Chem Lett), Elsevier, 2007, 17 (7), pp. 1966-1970
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Titre: Should structure-based virtual screening techniques be used more extensively in modern drug discovery ?
Auteurs: Vincent Leroux; Bernard Maigret
Détail: Computers and Applied Chemistry, Peking Publishing House of Electronics Industry, 2007, 27, pp. 1-10
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Titre: La représentation de points de vue dans le système d'aide à la décision en cancérologie KASIMIR
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: L'Objet, Hermès/Lavoisier, 2007, 13 (2-3), pp. 143-175
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Communications avec actes

Titre: Construction d'une ontologie à partir d'un corpus de textes avec l'ACF
Auteurs: Rokia Bendaoud; Mohamed Rouane Hacene; Yannick Toussaint; Bertrand Delecroix; Amedeo Napoli
Détail: IC 2007, Jul 2007, Grenoble, France.
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Titre: Text-based ontology construction using relational concept analysis
Auteurs: Rokia Bendaoud; Mohamed Rouane Hacene; Yannick Toussaint; Bertrand Delecroix; Amedeo Napoli
Détail: International Workshop on Ontology Dynamics - IWOD 2007, Jun 2007, Innsbruck, Austria.
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Titre: Analyse formelle de données relationnelles pour la réingénierie des modèles UML
Auteurs: Mohamed Hacene Rouane; Michel Dao; Marianne Huchard; Petko Valtchev
Détail: Isabelle Borne, Xavier Crégut, Sophie Ebersold, Frédéric Migeon. LMO'07 : Langages et Modèles à Objets, Mar 2007, Toulouse, France, France. Hermès Lavoisier, pp. 151-166
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Titre: A Proposal for Combining Formal Concept Analysis and Description Logics for Mining Relational Data
Auteurs: Mohamed Hacene Rouane; Marianne Huchard; Amedeo Napoli; Petko Valtchev
Détail: Kuznetsov, Sergei O.; Schmidt, Stefan. ICFCA'07: 5th International Conference Formal Concept Analysis, Feb 2007, Clermont-Ferrand, France, France. Springer, 4390, pp. 51-65, LNAI (Lecture Notes on Artificial Intelligence)
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Titre: Construction d'ontologie à partir de corpus de textes
Auteurs: Rokia Bendaoud; Yannick Toussaint; Amedeo Napoli
Détail: Septièmes journées Extraction et Gestion des Connaissances - EGC 2007, Jan 2007, Namur, Belgium.
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Titre: Case Base Mining for Adaptation Knowledge Acquisition
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Fadi Badra; Sandrine Lafrogne; Jean Lieber; Amedeo Napoli; Laszlo Szathmary
Détail: Morgan Kaufmann, Inc.. Twentieth International Joint Conference on Artificial Intelligence - IJCAI'07, Jan 2007, Hyderabad, India. pp. 750-755
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Titre: Suivi et analyse d'un processus collaboratif de modélisation de connaissances spatiales
Auteurs: Florence Le Ber; Sylvie Lardon; Christian Brassac
Détail: Batton-Hubert, M. ; Joliveau, T. ; Lardon, S.. Conférence Québéco-Française de Développement de la Géomatique (CQFD-Géo 2007), 2007, Clermont-Ferrand, France. GDR Sigma, pp. 1-8
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Titre: Modélisation d'épisodes de conception d'observatoires à partir de corpus narratifs
Auteurs: Sandra Nogry; Florence Le Ber; Christian Brassac
Détail: A. Cordier, B. Fuchs. Actes du 15ème atelier de raisonnement à partir de cas - RàPC2007, 2007, Grenoble, France. AFIA, pp. 103-110
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Titre: Modélisation d'épisodes de conception d'observatoires à partir de corpus narratifs
Auteurs: Sandra Nogry; Florence Le Ber; Christian Brassac
Détail: F. Trichet. Actes des 18es Journées Francophones d'Ingénierie des Connaissances - IC 2007, 2007, Grenoble, France. Cépaduès, pp. 327-328
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Titre: Mining Complex Hydrobiological Data with Galois Lattices
Auteurs: Aurélie Bertaux; Agnès Braud; Florence Le Ber
Détail: A.M.Tjoa and R.R. Wagner. International Workshop on Advances in Conceptual Knowledge Engineering (ACKE'07), 2007, Regensburg, Germany. pp. 519-523
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Titre: Traitement d'attributs inter-dépendants pour la recherche d'information par treillis
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: 18es Journées Francophones d'Ingénierie des Connaissances - IC 2007, Jul 2007, Grenoble, France. Cépaduès éditions, pp. 109-120
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Titre: Extraction de connaissances d'adaptation par analyse de la base de cas
Auteurs: Fadi Badra; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Cépaduès. 7èmes Journées francophones "Extraction et Gestion des Connaissances" - EGC'2007, Jan 2007, Namur/Belgique. 2, pp. 751-760, RNTI
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Titre: Dynamical modification of context for an iterative and interactive information retrieval process on the web
Auteurs: Emmanuel Nauer; Yannick Toussaint
Détail: Fifth International Conference on Concept Lattices and Their Applications - CLA 2007, 2007, Montpellier, France.
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Titre: IntoWeb : une plate forme hypertexte d'extraction de connaissances et de recherche d'information
Auteurs: Emmanuel Nauer
Détail: Cinquième colloque VSST (Veille Stratégique Scientifique & Technologique), 2007, Marrakech, Morocco.
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Titre: Ontology-guided Data Preparation for Discovering Genotype-Phenotype Relationships
Auteurs: Adrien Coulet; Malika Smaïl-Tabbone; Pascale Benlian; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: Network Tools and Applications in Biology: A Semantic Web for Bioinformatics - NETTAB 2007, Jun 2007, Pisa, Italy.
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Titre: ZART: A Multifunctional Itemset Mining Algorithm
Auteurs: Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli; Sergei O. Kuznetsov
Détail: 5th International Conference on Concept Lattices and Their Applications (CLA '07), Oct 2007, Montpellier, France. pp. 26-37
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Titre: Towards Rare Itemset Mining
Auteurs: Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli; Petko Valtchev
Détail: 19th IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI '07), Oct 2007, Patras, Greece. 1, pp. 305-312
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Titre: Acquisition de connaissances du domaine d'un système de RàPC : une approche fondée sur l'analyse interactive des échecs d'adaptation --- le système FrakaS
Auteurs: Amélie Cordier; Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille
Détail: Amélie Cordier. 15ème atelier sur le raisonnement à partir de cas - RàPC-07, Jul 2007, Grenoble, France. pp. 57-70
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Titre: Acquisition interactive des connaissances d'adaptation intégrée aux sessions de raisonnement à partir de cas --- Principes, architecture IakA et prototype KayaK
Auteurs: Amélie Cordier; Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille
Détail: Amélie Cordier. 15ème atelier sur le raisonnement à partir de cas - RàPC-07, Jul 2007, Grenoble, France. pp. 71-84
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Titre: Application de la révision et de la fusion des connaissances à l'adaptation et à la combinaison de cas
Auteurs: Jean Lieber
Détail: Amélie Cordier. 15ème atelier sur le raisonnement à partir de cas - RàPC-07, Jul 2007, Grenoble, France. pp. 119-129
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Titre: Une approche pour représenter les variations entre cas --- Vers une application à l'extraction de connaissances d'adaptation
Auteurs: Fadi Badra; Jean Lieber
Détail: Amélie Cordier. 15ème atelier sur le raisonnement à partir de cas - RàPC-07, Jul 2007, Grenoble, France. pp. 47-56
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Titre: Application de la théorie de la révision à l'adaptation en raisonnement à partir de cas : l'adaptation conservatrice
Auteurs: Jean Lieber
Détail: J. Lang and Y. Lespérance and D. Sadek. 4èmes journées francophones sur les modèles formels de l'interaction - MFI'07, 2007, Paris, France. pp. 201-213
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Titre: Application of the Revision Theory to Adaptation in Case-Based Reasoning: the Conservative Adaptation
Auteurs: Jean Lieber
Détail: Rosina O. Weber and Michael M. Richter. 7th International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR'07, Aug 2007, Belfast, United Kingdom. Springer Berlin / Heidelberg, Case-Based Reasoning Research and Development 7th International Conference on Case-Based Reasoning, ICCBR 2007 Belfast, Northern Ireland, UK, August 13-16, 2007 Proceedings, 4626, pp. 239-253, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Faillure Analysis for Domain Knowledge Acquisition in a Knowledge-Intensive CBR System
Auteurs: Amélie Cordier; Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille
Détail: Rosina O. Weber and Michael M. Richter. 7th International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR-07, Aug 2007, Belfast, United Kingdom. Springer Berlin / Heidelberg, Case-Based Reasoning Research and Development 7th International Conference on Case-Based Reasoning, ICCBR 2007 Belfast, Northern Ireland, UK, August 13-16, 2007 Proceedings, 4626, pp. 463-477, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: On-Line Domain Knowledge Management for Case-Based Medical Recommendation
Auteurs: Amélie Cordier; Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille
Détail: I. Bichindaritz and S. Montani. 5th workshop on CBR in the Health Sciences, a workshop of the seventh International Conference on Case-Based Reasoning (ICCBR-07), D. C. Wilson and D. Khemani (volume editors), Aug 2007, Belfast, United Kingdom. pp. 285-294
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Titre: Interactive Knowledge Acquisition in Case Based Reasoning
Auteurs: Amélie Cordier; Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille
Détail: D. Wilson and D. Khemani. Workshop on Knowledge Discovery and Similarity, a workshop of the seventh International Conference on Case-Based Reasoning (ICCBR-07), D. C. Wilson and D. Khemani (volume editors), Aug 2007, Belfast, United Kingdom.
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Titre: Annotation sémantique par classification
Auteurs: Yannick Toussaint; Sylvain Tenier
Détail: Francky Trichet. Ingénierie des Connaissances, Jul 2007, Grenoble, France. Cépadues éditions, Ingénierie des Connaissances - 18èmes journées francophones, 2, pp. 85-96
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Titre: Classes d'annotation pour l'annotation sémantique
Auteurs: Sylvain Tenier; Yannick Toussaint
Détail: Laublet, Patrick et Aussenac-Gille, Nathalie. Atelier "Ontologies et Textes" Ontotexte 2007, Oct 2007, Sophia Antipolis, France. Actes de l'atelier "Ontologies et Textes" Ontotexte 2007, pp. 49 - 58
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Titre: Distance sémantique entre concepts définis en ALE
Auteurs: Mohamed Zied Maala; Alexandre Delteil; Amedeo Napoli
Détail: I. Borne and X. Crégut and S. Ebersold and F. Migeon. Conférence Francophone Langages et modèles à objets - LMO 07, 2007, Toulouse, France. Hermès/lavoisier, pp. 117-130
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Titre: Workshop PC Chairs' Message. Web Data Integration for Mining in the Life Sciences (WebDIM4LS)
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Malika Smail-Tabbone
Détail: Mathias Weske and Mohand-Said Hacid and Claude Godart. International Workshops on Web Information Systems Engineering – WISE 2007 Workshops, Dec 2007, Nancy, France. Springer, Web Information Systems Engineering – WISE 2007 Workshops, 4832, pp. 3-4, Lecture Notes in Computer Science
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Communications sans actes

Titre: Mining Frequent Most Informative Subgraphs
Auteurs: Frédéric Pennerath; Amedeo Napoli
Détail: Mining And Learning With Graphs (MLG), Aug 2007, Florence, Italy.
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Titre: Response of biological indices to pressures in the running waters of the Alsace floodplain (Eastern France). Towards a proposal of a new tool to assess ecological status of waterbodies
Auteurs: Corinne Grac; Michel Lafont; Florence Le Ber; Photis Nobelis; Michèle Trémolières
Détail: Symposium for European Freshwater Science, 2007, Italy.
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Titre: Mettre à jour des épisodes pour contribuer à la conception d'observatoires de pratiques
Auteurs: Sandra Nogry; Christian Brassac; Florence Le Ber
Détail: 4èmes Journées d'Étude en Psychologie Ergonomique - EPIQUE 2007, 2007, Nantes, France.
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Titre: Landscape as designed by farming systems: a challenge for landscape agronomists in Europe
Auteurs: Marc Benoît; Catherine Mignolet; S. Herrmann; Davide Rizzo; Anna-Camilla Moonen; P. Bàrberi; Mariassunta Galli; E. Bonari; N. Silvestri; Claudine Thenail; Sylvie Lardon; H. Rapey; E. Marraccini; Florence Le Ber
Détail: Farming Systems Design 2007, International symposium on Methodologies for Integrated Analysis of Farm Production Systems, 2007, Catania, Italy.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Mining Description Logics Concepts With Relational Concept Analysis
Auteurs: Marianne Huchard; Amedeo Napoli; Mohamed Hacene Rouane; Petko Valtchev
Détail: Paula Brito, Guy Cucumel, Patrice Bertrand and Francisco de Carvalho. Selected Contributions in Data Analysis and Classification, Springer Berlin Heidelberg, pp. 259-270, Aug. 2007, Studies in Classification, Data Analysis, and Knowledge Organization, 978-3-540-73558-8 (Print) 978-3-540-73560-1 (Online)
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Titre: Modèles graphiques pour le raisonnement temporel et spatial
Auteurs: Jean-Francois Mari; Christine Largouët
Détail: F. Le Ber, G. Ligozat, O. Papini. Raisonnement sur l'espace et le temps, Edition Lavoisier, HERMES, pp. 249 - 271, Jan. 2007, ISBN : 2-7462-1455-5
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Titre: Fouille de données spatio-temporelles à l'aide de modèles de Markov cachés
Auteurs: Jean-Francois Mari
Détail: F. Le Ber, G. Ligozat, O. Papini. Raisonnement sur l'espace et le temps, Editions Lavoisier, HERMES, pp. 305 - 316, Jan. 2007, ISBN : 2-7462-1455-5
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Titre: Treillis pour le raisonnement spatial
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: F. Le Ber, G. Ligozat et O. Papini. Raisonnements sur l'espace et le temps : des modèles aux applications, Hermès - Lavoisier, pp. 225-248, 2007, Traité IGAT
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Titre: Reconnaissance de paysages agricoles à l'aide de treillis de relations
Auteurs: Florence Le Ber
Détail: F. Le Ber, G. Ligozat et O. Papini. Raisonnements sur l'espace et le temps : des modèles aux applications, Hermès - Lavoisier, pp. 291-304, 2007, Traité IGAT
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Directions d'ouvrages

Titre: Raisonnements sur l'espace et le temps : des modèles aux applications
Auteurs: Florence Le Ber; Gérard Ligozat; Odile Papini
Détail: Lavoisier, pp. 419, 2007
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Titre: Actes du 3ème atelier Représentation et raisonnement sur le temps et l'espace (RTE 2007)
Auteurs: Maroua Bouzid; Florence Le Ber; Gérard Ligozat; Odile Papini
Détail: AFIA, pp. 72, 2007
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Titre: Raisonnement à partir de cas 1. Conception et Configuration de produits.
Auteurs: Jean Renaud; Brigitte Chebel-Morello; Béatrice Fuchs; Jean Lieber
Détail: Lavoisier, 286 p., 2007
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Titre: Raisonnement à partir de cas 2. Surveillance, diagnostic et maintenance.
Auteurs: Jean Renaud; Brigitte Chebel-Morello; Béatrice Fuchs; Jean Lieber
Détail: Lavoisier, 264 p., 2007
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Autres publications

Titre: Extraction de concepts et de relations en analyse relationnelle de concepts (ARC)
Auteurs: Mohamed Hacene Rouane; Marianne Huchard; Amedeo Napoli; Petko Valtchev
Détail: 2007
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Documents sans référence de publication

Titre: Sémantique et composition des règles d'adaptation d'un système de raisonnement à partir de cas - Vers la construction d'une base de règles d'adaptation
Auteurs: Matthieu Tixier
Détail: Jun. 2007
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2006

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Conception collaborative d'objets géo-graphiques. Application aux jeux de territoire.
Auteurs: Sylvie Lardon; Florence Le Ber; Christian Brassac; Patrick Caron; Michel Mainguenaud; Jean-Michel Préau
Détail: Revue internationale de Géomatique, 2006, 16 (2), pp. 269-284
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Titre: Temporal and Spatial Data Mining with Second-Order Hidden Markov Models
Auteurs: Jean-François Mari; Florence Le Ber
Détail: Soft Computing, Springer-Verlag, 2006, 10 (5), pp. 406 - 414
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Titre: Studying crop sequences with CarrotAge, a HMM-based data mining software
Auteurs: Florence Le Ber; Marc Benoît; Céline Schott; Jean-François Mari; Catherine Mignolet
Détail: Ecological Modelling, 2006, 191, pp. 170-185
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Titre: Comparaison d'organisations spatiales agricoles - Le système ROSA
Auteurs: Jean-Luc Metzger; Sylvie Lardon; Florence Le Ber
Détail: Revue internationale de Géomatique, 2006, 16 (2), pp. 195-210
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Titre: Towards a Text Mining Methodology Using Association Rules Extraction
Auteurs: Hacène Cherfi; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: Soft Computing, Springer-Verlag, 2006, A Fusion of Foundations, Methodologies and Applications, 10 (5), pp. 431-441
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Titre: Treillis de concepts et ontologies pour interroger l'annuaire de sources de données biologiques BioRegistry
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Ingénierie des Systèmes d'Information (ISI), Lavoisier, 2006, Systèmes d'information spécialisés, 11 (1), pp. 39-60
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Titre: Immunoselection and characterization of a human genomic PPAR binding fragment located within POTE genes
Auteurs: Hossam Murad; Philippe Collet; Emilie Brunner; Hervé Schohn; Philippe Becuwe; Marie-Dominique Devignes; Michel Dauça; Lionel Domenjoud
Détail: Biochimie, Elsevier, 2006
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Titre: A transgenic mouse model engineered to investigate human brain-derived neurotrophic factor in vivo
Auteurs: Fabrice Guillemot; Italina Cerutti; Charles Auffray; Marie-Dominique Devignes
Détail: Transgenic research., SpringerLink, 2006
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Titre: Effects of PPAR and RXR ligands in semaphorin 6B gene expression of human MCF-7 breast cancer cells.
Auteurs: Hossam Murad; Philippe Collet; Cecile Huin-Schohn; Nehmann Al-Makdissy; Geraldine Kerjan; Alain Chedotal; Mireille Donner; Marie-Dominique Devignes; Philippe Becuwe; Hervé Schohn; Lionel Domenjoud; Michel Dauça
Détail: International journal of oncology., Athens : Editorial Academy of the International Journal of Oncology, 2006, 28, pp. 977-984
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Titre: Adaptation Knowledge Acquisition: a Case Study for Case-Based Decision Support in Oncology
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Computational Intelligence, Blackwell synergy, 2006, 22 (3/4), pp. 161-176
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Communications avec actes

Titre: GENEXP, un logiciel pour simuler des paysages agricoles
Auteurs: Florence Le Ber; Claire Lavigne; Jean-François Mari; Katarzyna Adamczyk; Frédérique Angevin
Détail: Colloque International de Géomatique et d'Analyse Spatiale, Recherches et Développements - SAGEO-2006, Sep 2006, Strasbourg/France, France. pp. 1 - 12
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Titre: OntoBib: an Ontology-Based System for the Management of a bibliography
Auteurs: Sahar Al-Sudani; Rim Al Hulou; Amedeo Napoli; Emmanuel Nauer
Détail: Workshop on Knowledge Management and Organizational Memories - ECAI'2006, Aug 2006, Riva del Garda, Italy. Workshop on Knowledge Management and Organizational Memories - ECAI'2006, 7 p.
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Titre: SNP-Converter: an Ontology-Based solution to Reconcile Heterogeneous SNP Descriptions for Pharmacogenomic Studies
Auteurs: Adrien Coulet; Malika Smaïl-Tabbone; Pascale Benlian; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: 3rd International Workshop on Data Integration in the Life Sciences 2006 - DILS'06, Jul 2006, European Bioinformatics Institute (EBI), Hinxton/UK.
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Titre: Ontology-driven Data Integration for Pharmacogenomics: Application to Genome Variations
Auteurs: Adrien Coulet; Malika Smaïl-Tabbone; Pascale Benlian; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: Journées Ouvertes : Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM'06, Jul 2006, Bordeaux/France.
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Titre: Extraction de données pharmacogénomiques à partir d'études cliniques : problématique
Auteurs: Adrien Coulet; Marie-Dominique Devignes; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Deuxième atelier sur la "Fouille de données complexes dans un processus d'extraction des connaissances", Jan 2005, Paris/France.
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Titre: SNP-Ontology for semantic integration of genomic variation data
Auteurs: Adrien Coulet; Malika Smaïl-Tabbone; Pascale Benlian; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: 14th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology - ISMB'06, Aug 2006, Fortaleza/Brésil.
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Titre: A proposal for annotation, semantic similarity and classification of textual documents
Auteurs: Emmanuel Nauer; Amedeo Napoli
Détail: The 12th International Conference on Artificial Intelligence: Methodology, Systems, Applications - AIMSA 2006. AI, people and the web, 2006, Varna, Bulgaria. Springer Berlin / Heidelberg, 4183, pp. 201-212, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Mining a database on Alsatian rivers
Auteurs: Corinne Grac; Agnès Herrmann; Florence Le Ber; Michèle Trémolières; Agnès Braud; Adamou Handja; Nicolas Lachiche
Détail: 7th International Conference on Hydroinformatics, 2006, France. Research Publishing, pp. 2263-2270
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Titre: Adaptation Knowledge Discovery from a Case Base
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Fadi Badra; Sandrine Lafrogne; Jean Lieber; Amedeo Napoli; Laszlo Szathmary
Détail: 2006. G. Brewka, pp. 795-796
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Titre: Vers l'extraction de motifs rares
Auteurs: Laszlo Szathmary; Sandy Maumus; Petronin Pierre; Yannick Toussaint; Amedeo Napoli
Détail: Gilbert Ritschard, Chabane Djeraba. Extraction et gestion des connaissances, Jan 2006, Lille, France. Cépaduès-éditions, Extraction et gestion des connaissances - EGC 2006, 2/RNTI-E-6, pp. 499-510, RNTI
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Titre: Raisonnement à partir de cas décentralisé pour le Web sémantique
Auteurs: Mathieu D'Aquin
Détail: 14e Atelier de Raisonnement à Partir de Cas, Mar 2006, Besançon, France.
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Titre: Annotation sémantique de pages web
Auteurs: Sylvain Tenier; Amedeo Napoli; Xavier Polanco; Yannick Toussaint
Détail: Gilbert Ritschard, Chabane Djeraba. 6èmes journées francophones "Extraction et Gestion de Connaissances" - EGC 2006, Jan 2006, ENIC Telecom - USTL - Lille 1, France. Cépaduès-éditions, Extraction et gestion des connaissances - EGC 2006, 1/RNTI-E-6, pp. 305-310, RNTI
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Titre: Construction d'une ontologie de descripteurs UCD en astronomie
Auteurs: Emmanuel Nauer; Alexandre Richard; Sébastien Derriere; Françoise Genova; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: 17e journées francophones d'Ingénierie des connaissances - IC 2006, 2006, Nantes, France.
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Titre: Suggested Ontology for Pharmacogenomics (SO-Pharm): Modular Construction and Preliminary Testing
Auteurs: Adrien Coulet; Malika Smaïl-Tabbone; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: Proceedings of International Workshop on Knowledge Systems in Bioinformatics - KSinBIT'06, Oct 2006, Montpellier, France.
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Titre: La fouille de graphes dans les bases de données réactionnelles au service de la synthèse en chimie organique
Auteurs: Frédéric Pennerath; Amedeo Napoli
Détail: Gilbert Ritschard, Chabane Djeraba. 6èmes Journées Francophones "Extraction et gestion des connaissances" - EGC 2006, Jan 2006, Lille, France. Cépaduès-éditions, Extraction et gestion des connaissances - EGC 2006, 2/RNTI-E-6, pp. 517-528, RNTI
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Titre: BR-Explorer: An FCA-based algorithm for Information Retrieval
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Fourth International Conference On Concept Lattices and Their Applications - CLA 2006, Oct 2006, Hammamet/Tunisia.
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Titre: BR-Explorer: A sound and complete FCA-based retrieval algorithm (Poster)
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: 4th International Conference on Formal Concept Analysis - ICFCA 2006, Feb 2006, Dresden/Germany.
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Titre: Cancer patient flows discovery in DRG databases
Auteurs: Nicolas Jay; Amedeo Napoli; François Kohler
Détail: MIE 2006, Aug 2006, Maastricht/Pays-bas.
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Titre: Mise en évidence de filières de soins dans le traitement du cancer A l'aide des motifs fréquents et treillis de Galois.
Auteurs: Nicolas Jay; Amedeo Napoli; François Kohler
Détail: XIX Journnées EMOIS, Mar 2006, Nancy/France.
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Titre: Instantiation of relations for semantic annotation
Auteurs: Sylvain Tenier; Yannick Toussaint; Amedeo Napoli; Xavier Polanco
Détail: Web Intelligence Consortium. The 2006 IEEE/WIC/ACM International Conference on Web Intelligence - WI 2006, Dec 2006, Hong Kong Convention and Exhibition Centre/Chine. IEEE Computer Society Press, Web Intelligence, pp. 463-472
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Titre: Construction et enrichissement d'une ontologie à partir d'un corpus de textes
Auteurs: Rokia Bendaoud
Détail: RJCRI'06, Mar 2006, Lyon/France. ARIA, pp. 353-358, HERMES
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Titre: Vers l'implantation d'un moteur d'inférences pour une logique de descriptions avec domaine concret flou
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Julien Cojan; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Didier Dubois et Henri Prade. Rencontres francophones sur la Logique Floue et ses Applications - LFA-06, Oct 2006, Toulouse, France. CEPADUES
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Titre: Une première formalisation de la phase d'élaboration du raisonnement à partir de cas
Auteurs: Jean Lieber; Béatrice Fuchs; Alain Mille; Amedeo Napoli
Détail: Brigitte Chebel-Morello. 14ème atelier francophone de raisonnement à partir de cas, Mar 2006, Besançon, France.
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Titre: Case-Based Reasoning Within Semantic Web Technologies
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Jérôme Euzenat and John Domingue. The Twelfth International Conference on Artificial Intelligence: Methodology, Systems and Applications - AIMSA'2006, Sep 2006, Varna/Bulgarie. Springer, 4183, pp. 190-200, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Réflexions sur la place du RàPC dans trois domaines de recherche actuels
Auteurs: Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille; Amedeo Napoli
Détail: B. Morello-Chebel. 14ième Atelier de Raisonnement à Partir de Cas - RàPC'06, 2006, Besançon, France. pp. 3-13
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Titre: Réflexions sur l'extraction de motifs rares
Auteurs: Sandy Maumus; Amedeo Napoli; Laszlo Szathmary; Yannick Toussaint
Détail: M. Nadif and F.-X. Jollois. 13ièmes rencontres de la Société Francophone de Classification - SFC-06, 2006, Metz, France. pp. 157-162
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Why and how design monitoring processes of farmer practices in European landscape?
Auteurs: Marc Benoît; Michel Passouant; Claudine Thenail; Laurence Hubert-Moy; Pierre Dupraz; Christian Brassac; Florence Le Ber; Jean-François Mari; Christian Bockstaller; Olivier Barrière; Dominique King; Christine Le Bas; Pierre Ruelle
Détail: Langeveld, H. ; Röling, N.. Changing European farming systems for a better future. New visions for rural areas, Wageningen Academic Publisher, Wageningen (NLD), pp. 461-462, 2006
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Titre: Towards a Semantic Portal for Oncology using a Description Logic with Fuzzy Concrete Domains
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Elie Sanchez. Fuzzy Logic and the Semantic Web, 1, Elsevier, 2006, Capturing intelligence, 0-444-51948-3
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Titre: Des outils informatiques pour accéder au contenu des textes : l'apport des outils de traitement de la langue et de fouille de textes
Auteurs: Yannick Toussaint
Détail: Lisette Calderan, Bernard Hidoine et Jacques Millet. Pérenniser le document numérique, ADBS Éditions, pp. 83 - 100, 2006, 2-84365-087-9
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Titre: Les systèmes à base de connaissances
Auteurs: Florence Le Ber; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: J. Akoka and I. Comyn-Wattiau. Encyclopédie de l'informatique et des systèmes d'information, Vuibert, pp. 1197-1208, 2006, 978-2-7117-4846-4
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Rapports

Titre: OntoBib: an Ontology-Based System for the Management of a bibliography
Auteurs: Sahar Al-Sudani; Rim Alhulou; Amedeo Napoli; Emmanuel Nauer
Détail: [Research Report], 2006, pp. 12
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Titre: ZART: A Multifunctional Itemset Mining Algorithm
Auteurs: Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli; Sergei O. Kuznetsov
Détail: [Research Report], 2006, pp. 19
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Titre: Mining Rare Association Rules
Auteurs: Laszlo Szathmary; Sandy Maumus; Amedeo Napoli
Détail: [Research Report], 2006, pp. 19
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Titre: A Definition and a Formalization of Conservative Adaptation for Knowledge-Intensive Case-Based Reasoning Application to Decision Support in Oncology (A Preliminary Report)
Auteurs: Jean Lieber
Détail: [Research Report], 2006, pp. 27
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Thèses

Titre: Méthodes symboliques de fouille de données avec la plate-forme Coron
Auteurs: Laszlo Szathmary
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Nov. 2006. English
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2005

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Anticiper l'assolement pour mieux gérer les ressources en eau : comment valoriser les données d'occupation du sol ?
Auteurs: Delphine Leenhardt; Flavie Cernesson; Jean-François Mari; Delphine Mesmin
Détail: Ingénieries eau-agriculture-territoires, Lavoisier, 2005, 42, pp. 13 - 22
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Titre: Une démarche et un outil pour modéliser et comparer l'organisation spatiale d'exploitations agricoles (An approach and a tool to modelize and compare the spatial organization of farms)
Auteurs: Sylvie Lardon; Florence Le Ber; Jean-Luc Metzger; Pierre-Louis Osty
Détail: Revue internationale de Géomatique, 2005, 15(3), pp. 263 - 280
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Titre: Anticiper l'assolement pour mieux gérer les ressources en eau : comment valoriser des données d'occupation du sol ?
Auteurs: Delphine Leenhardt; Flavie Cernesson; Jean-François Mari; Delphine Mesmin
Détail: Ingénierie - E A T, 2005, 42, pp. 13-22
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Titre: Inscription spatiale d'une activité cognitive collective de représentation de l'espace
Auteurs: Christian Brassac; Florence Le Ber
Détail: Intellectica, 2005, 41-42, pp. 181-200
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Titre: Knowledge Editing and Maintenance Tools for a Semantic Portal in Oncology
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Christophe Bouthier; Sébastien Brachais; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: International Journal on Human-Computer Studies, Elsevier, 2005, 62, pp. 619-638
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Titre: Hiérarchisation des règles d'association en fouille de textes
Auteurs: Rokia Bendaoud; Yannick Toussaint; Amedeo Napoli
Détail: Revue des Sciences et Technologies de l'Information (Série Ingénierie des Systèmes d'Information), Vincent, C. and Pinson, S., 2005, Extraction et gestion des connaissances (EGC'2005), 1, pp. 263-274
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Titre: Deux méthodologies de classification de règles d'association pour la fouille de textes
Auteurs: Hacène Cherfi; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: REVUE DES NOUVELLES TECHNOLOGIES DE L'INFORMATION, Cépaduès Editions, 2005, Fouilles de données complexes., E-4, pp. 211-234
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Titre: Classification et interrogation de sources de données biologiques
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: REVUE DES NOUVELLES TECHNOLOGIES DE L'INFORMATION, Cépaduès-Editions, 2005, Extraction des connaissances : Etat et perspectives, pp. 43-47
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Communications avec actes

Titre: Knowledge extraction from webpages
Auteurs: Sylvain Tenier; Amedeo Napoli; Xavier Polanco; Yannick Toussaint
Détail: 5th International Workshop on Knowledge Markup and Semantic Annotation - SemAnnot 2005, Nov 2005, Galway/Ireland.
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Titre: User-designed web services to support heterogeneous biological data retrieval
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Hervé De Palma; Laurent Pierron; Lionel Domenjoud; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Angelo Facchiano and Paolo Romano. First International Workshop on workflows management: new abilities for the biological information overflow - NETTAB 2005, Oct 2005, Naples, Italy. pp. 27-34
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Titre: BioRegistry : a structured metadata repository for bioinformatic databases
Auteurs: Malika Smaïl-Tabbone; Shazia Osman; Nizar Messai; Amedeo Napoli; Marie-Dominique Devignes
Détail: M.R. Berthold, R. Glen, K. Diederichs, O. Kohlbacher, I. Fisher. First International Symposium on Computational Life Science - CompLife 2005, Sep 2005, Konstanz, Germany. Springer, 3695, pp. 46-56, Lecture Notes in Bioinformatics
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Titre: Data Mining Using Hidden Markov Models (HMM2) to Detect Heterogeneities into Bacteria Genomes
Auteurs: Catherine Eng; Annabelle Thibessard; Sébastien Hergalant; Jean-François Mari; Pierre Leblond
Détail: Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM 2005, Jul 2005, Lyon/France.
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Titre: Querying a Bioinformatic Data Sources Registry with Concept Lattices
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: Frithjof Dau, Marie-Laure Mugnier and Gerd Stumme. 3th International Conference on Conceptual Structures - ICCS 2005, Jun 2005, Kassel, Germany. Springer Berlin / Heidelberg, Conceptual Structures: Common Semantics for Sharing Knowledge, 3596, pp. 323-336, LNAI
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Titre: Deux méthodes de classification de règles d'association en fouille de textes
Auteurs: Hacène Cherfi; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: V. Makarenkov; G. Cucumel; F.-J. Lapointe. 12èmes journées de la Société Francophone de Classification - SFC-05, Apr 2005, Montréal/Canada. Presses Universitaires de Montréal, pp. 104-107
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Titre: Relations, structures et objets : quelques variations
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: M. Huchard, S. Ducasse et O. Nierstrasz. 2005. Hermès Lavoisier, pp. 177—190, RSTI L'Objet, volume 11, numéro 1—2
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Titre: Construction collaborative d'objets géo-graphiques
Auteurs: Florence Le Ber; Sylvie Lardon; Christian Brassac; Michel Mainguenaud; Jean-Michel Préau
Détail: D. Josselin and T. Libourel. 2005. pp. 1-13, Actes sur CD
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Titre: Vers une utilisation du critère pessimiste de Wald pour aider à la décision à partir de cas
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: 13ème Atelier Raisonnement à partir de cas, May 2005, Nice.
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Titre: Decentralized Case-Based Reasoning for the Semantic Web
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Yolanda Gil, Enrico Motta, V. Richard Benjamins, Mark A. Musen. 4th International Semantic Web Conference - ISWC 2005, Nov 2005, Galway/Irelande. Springer Verlag, 3729, pp. 142-155, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Une nouvelle approche pour la modélisation du profil de l'utilisateur dans les systèmes de filtrage d'information : le modèle de filtre détecteur de nouveauté
Auteurs: Randa Kassab; Jean-Charles Lamirel; Emmanuel Nauer
Détail: 2ème COnférence en Recherche d'Infomations et Applications - CORIA'2005, Mar 2005, Grenoble/France, France. pp. 185-200
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Titre: Novelty Detection for Modeling User's Profile
Auteurs: Randa Kassab; Jean-Charles Lamirel; Emmanuel Nauer
Détail: The 18th International FLAIRS Conference, May 2005, Clearwater Beach/USA, United States. pp. 830-831
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Titre: CORON: A Framework for Levelwise Itemset Mining Algorithms
Auteurs: Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli
Détail: Ganter, Bernhard and Godin, Robert and Mephu Nguifo, Engelbert. Third International Conference on Formal Concept Analysis - ICFCA '05, Feb 2005, Lens/France. pp. 110-113
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Titre: Fouille de données du génome à l'aide de modèles de Markov cachés
Auteurs: Sébastien Hergalant; Bertrand Aigle; Pierre Leblond; Jean-François Mari
Détail: Extraction et Gestion de Connaissances - EGC 2005, Jan 2005, Paris/France. pp. 141 - 148
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Titre: Exploitation des données de la cohorte STANISLAS par des techniques de fouille de données numériques et symboliques utilisées seules ou en combinaison
Auteurs: Sandy Maumus; Amedeo Napoli; Laszlo Szathmary; Sophie Visvikis-Siest
Détail: Atelier Fouille de Données Complexes dans un Processus d'Extraction des Connaissances - EGC 2005, Feb 2005, Paris/France. pp. 73-76
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Communications sans actes

Titre: Fouille de données biomédicales complexes : extraction de règles et de profils génétiques dans le cadre de l'étude du syndrome métabolique
Auteurs: Sandy Maumus; Amedeo Napoli; Laszlo Szathmary; Sophie Visvikis-Siest
Détail: G. Perrière, A. Guénoche, C. Gourgeon. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM 2005, 2005, Lyon, France. pp. 169-173
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Titre: Modélisation, comparaison et interprétation d'organisations spatiales agricoles
Auteurs: Florence Le Ber; Marc Benoît; Mathieu Capitaine; Sylvie Lardon; Pierre-Louis Osty; Christian Brassac; Jean-Michel Préau; Lorenza Mondada; Jean-Luc Metzger; Amedeo Napoli
Détail: Actes du colloque "Société de l'information", 2005, Lyon, France. pp. 194-198
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Conférences invitées

Titre: Treillis de concepts et ontologies pour l'interrogation d'un annuaire de sources de données biologiques (BioRegistry)
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Malika Smaïl-Tabbone; Amedeo Napoli
Détail: Actes du XXIIIème congrès Informatique des Organisations et Systèmes d'information et de décision - INFORSID 2005, May 2005, Grenoble/France.
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Titre: Méthode sémantique pour la classification et l'interrogation de sources de données biologiques
Auteurs: Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: EGC 2005 - Atelier Modélisation des Connaissances, Jan 2005, Paris.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Méthodes de représentation des règles d'organisation du territoire agricole
Auteurs: Marc Benoît; Mathieu Capitaine; Florence Le Ber
Détail: C. Laurent et P. Thinon. Agricultures et territoires, Hermès Lavoisier, pp. 191 - 206, 2005, Traité IGAT
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Directions d'ouvrages

Titre: Représentation et raisonnement sur le temps et l'espace -- Actes de l'atelier AFIA, Nice, 30 mai 2005
Auteurs: Florence Le Ber; Gérard Ligozat
Détail: AFIA, pp. 52, 2005
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Rapports

Titre: FouDanGA : Fouille de données pour l'annotation de génomes d'actinomycètes
Auteurs: Jean-François Mari; Fabrice Touzain; Sébastien Hergalant; Isabelle Debled-Rennesson
Détail: [Research Report], 2005
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Titre: Towards a global methodology for mining cohorts with biological and genetic data
Auteurs: Sandy Maumus; Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli; Eliane Albuisson; Sophie Visvikis-Siest
Détail: [Research Report], 2005, pp. 28
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Titre: Construction d'une ontologie de descripteurs UCD en astronomie
Auteurs: Emmanuel Nauer; Alexandre Richard; Sébastien Derriere; Françoise Genova; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: [Research Report], 2005, pp. 15
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Titre: A smooth introduction to symbolic methods for knowledge discovery
Auteurs: Amedeo Napoli
Détail: [Interne], 2005, pp. 27
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Thèses

Titre: Un portail sémantique pour la gestion des connaissances en cancérologie
Auteurs: Mathieu D'Aquin
Détail: Université Henri Poincaré - Nancy I, Dec. 2005. French
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Titre: Contribution à l'élaboration d'un modèle de Raisonnement à Partir de Cas pour l'aide à l'interprétation d'organisations spatiales agricoles
Auteurs: Jean-Luc Metzger
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Apr. 2005. French
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2004

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: An experiment on knowledge discovery in chemical databases
Auteurs: Sandra Berasaluce; Claude Laurenço; Amedeo Napoli; Gilles Niel
Détail: Lecture Notes in Artificial Intelligence, 2004, 3202, pp. 39–51
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Titre: Objets et représentation, un couple en devenir
Auteurs: Amedeo Napoli; Bernard Carré; Roland Ducournau; Jérôme Euzenat; François Rechenmann
Détail: L'Objet, logiciel, base de données, réseaux (RSTI série), 2004, 10 (4), pp. 61-81
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Titre: Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-length cDNA clones.
Auteurs: Tadashi Imanishi; Marie-Dominique Devignes; Sumio Sugano
Détail: PLoS Biology, 2004, 2 (6), pp. 856-875
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Titre: A Data Cleaning Solution by Perl Scripts for the KDD Cup 2003 Task 2
Auteurs: Martine Cadot; Joseph Di Martino
Détail: SIGKDD Explorations, ACM, 2004, 5 (2), pp. 158-159
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Titre: The human Semaphorin 6B gene is down regulated by PPARs
Auteurs: Philippe Collet; Lionel Domenjoud; Marie-Dominique Devignes; Hossam Murad; Hervé Schohn; Michel Dauça
Détail: Genomics, 2004, 83 (6), pp. 1141-1150
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Titre: Alternative usage of 5' exons in the chicken nerve growth factor gene: refined characterization of a weakly expressed gene
Auteurs: Odile Bertaux; Esther Toselli-Mollereau; Charles Auffray; Marie-Dominique Devignes
Détail: Gene, Elsevier, 2004, 334, pp. 83-97
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Titre: Extraction de connaissances à partir de textes structurés
Auteurs: Yannick Toussaint
Détail: Document numérique, 2004, 8 (3), pp. 11-34
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Titre: Objets et représentation, un couple en devenir
Auteurs: Amedeo Napoli; Bernard Carré; Roland Ducournau; Jérôme Euzenat; François Rechenmann
Détail: L'Objet, 2004, 10 (4), pp. 61-81
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Titre: Une mesure de similarité sémantique pour la classification de documents par le contenu
Auteurs: Rim Al Hulou; Amedeo Napoli; Emmanuel Nauer
Détail: Revue des Sciences et Technologies de l'Information (Série Ingénierie des Systèmes d'Information), Hermès, 2004, Langages et modèles à Objets - LMO'04, 10 (2--3), pp. 217-230
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Communications avec actes

Titre: Kasimir : gestion de connaissances décisionnelles en cancérologie
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Sébastien Brachais; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Emmanuel Caillaud, Muriel Lombard, Jean Renaud. Modélisation et pilotage des systèmes de Connaissances et de Compétences dans les Entreprises Industrielles - C2EI'04, 2004, Nancy, France. 6 p
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Titre: Étude de quelques logiques de descriptions floues et de formalismes apparentés
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Jacky Montmain. Rencontres francophones sur la logique floue et ses applications - LFA'04, 2004, Nantes, France. Cépadues-Editions, pp. 255-262
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Titre: Intelligent access to genomic sources on the web
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Nizar Messai; Amedeo Napoli; Shazia Osman; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: W3C Workshop on Semantic Web for Life Sciences, Oct 2004, Cambridge, Massachusetts USA.
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Titre: CarrotAge, a software for mining land-use data
Auteurs: Florence Le Ber; Jean-François Mari; Marc Benoît; Catherine Mignolet; Céline Schott
Détail: Fourth International Workshop on Environmental Applications of Machine Learning - EAML'2004, 2004, Bled, Slovenia. 2 p
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Titre: Knowledge-based Selection of Association Rules for Text Mining
Auteurs: Dietmar Janetzko; Hacène Cherfi; Roman Kennke; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: R. Lopez de Màntaras and L. Saitta. 16h European Conference on Artificial Intelligence - ECAI'04, 2004, Valencia, Spain. IOS Press, pp. 485-489
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Titre: Knowledge organisation and information retrieval using Galois lattices
Auteurs: Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli
Détail: Rose Dieng-Kuntz and Nada Matta. Workshop on Knowledge Management and Organizational Memories - ECAI 2004 (16th European Conference on Artificial Intelligence), 2004, Valencia, Spain. pp. 73-78
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Titre: An Experiment on Mining Chemical Reaction Databases
Auteurs: Sandra Berasaluce; Claude Laurenço; Amedeo Napoli; Gilles Niel
Détail: Le Thi Hoai An and Pham Dinh Tao. Modelling, Computation and Optimization in Information Systems and Management Sciences - MCO'04, 2004, Metz, France. Hermes Science Publishing, London, pp. 535-542
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Titre: Sélection de règles d'association par un modèle de connaissances pour la fouille de textes
Auteurs: Hacène Cherfi; Dietmar Janetzko; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: M. Liquière et M. Sebban. Conférence d'Apprentissage - CAp 2004, 2004, Montpellier, France. Presses Universitaires de Grenoble, pp. 191-206
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Titre: Classification non supervisée par HMM de sites de fixation de facteurs de transcription chez les bactéries
Auteurs: Sébastien Hergalant; Bertrand Aigle; Bernard Decaris; Jean-François Mari; Pierre Leblond
Détail: 5èmes Journées Ouvertes : Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM'04, 2004, Montréal, Canada. 1 p
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Titre: Decision Support and Knowledge Management in Oncology using Hierarchical Classification
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Sébastien Brachais; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Katherina Kaiser and Silvia Miksch and Samson W. Tu. Proceedings of the Symposium on Computerized Guidelines and Protocols - CGP-2004, 2004, Prague, Czech Republic. IOS Press, 101, pp. 16-30, Studies in Health Technology and Informatics
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Titre: Vers une acquisition automatique de connaissances d'adaptation par examen de la base de cas --- une approche fondée sur des techniques d'extraction de connaissances dans des bases de données
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Sébastien Brachais; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Rushed Kanawati and Sylvie Salotti and Farida Zehraoui. 12ème Atelier de Raisonnement à Partir de Cas - RàPC'04, 2004, Université Paris Nord, Villetaneuse, France. pp. 41-52
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Titre: Utilisation de connaissances pour l'aide à la recherche documentaire fondée sur le contenu
Auteurs: Rim Al Hulou; Amedeo Napoli
Détail: G. Hébrail and L. Lebart and J.-M. Petit. 4èmes Journées d'Extraction et de Gestion des Connaissances - EGC'2004, 2004, Clermont Ferrand, France. RNTI - Cépaduès Editions Toulouse, pp. 503
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Titre: Réduction d'un jeu de règles d'association par des méta-règles issues de la logique de "sens commun"
Auteurs: Martine Cadot; Joseph Di Martino; Amedeo Napoli
Détail: G. Hébrail and L. Lebart and J.-M. Petit. 4èmes journées d'Extraction et de Gestion des Connaissances - EGC'2004, 2004, Clermont-Ferrand, France. RNTI, Cépaduès Éditions Toulouse, pp. 353
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Titre: Knowledge organisation and information retrieval with Galois lattices
Auteurs: Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli
Détail: Motta, E. and Shadbolt, N. and Stutt, A. and Gibbins, N.. 14th International Conference on Engineering Knowledge in the Age of the Semantic Web (EKAW 2004), 2004, Whittlebury Hall, UK. Springer, 3257, pp. 511-512, Lecture notes in Computer Science
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Titre: Les treillis de Galois pour l'organisation et la gestion des connaissances
Auteurs: Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli
Détail: Chavent, M. et Langlais, M.. 11èmes Rencontres de la Société Francophone de Classification - SFC '04, 2004, Bordeaux, France. Cépaduès Editions, C/1, pp. 153-164, Revue des Nouvelles Technologies de l'Information (RNTI)
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Titre: A new approach to detect Interactions Involving Lipid Genes by Combining Data Mining and Statistics in the STANISLAS Cohort
Auteurs: Sandy Maumus; Amedeo Napoli; Catherine Sass; Eliane Albuisson; Sophie Visvikis
Détail: Biologie Prospective - Santorini Conference, 2004, Santorini, Greece. 1 p
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Titre: Kasimir : portail sémantique pour la gestion des connaissances en cancérologie
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Sébastien Brachais; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Second séminaire francophone du Web Sémantique Médical - WSM 2004, 2004, Rouen, France. 2 p
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Titre: Représentation de points de vue pour le raisonnement à partir de cas
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Langages et Modèles à Objets - LMO'04, 2004, Lille, France. 10/2-3, pp. 245-258, Revue des Sciences et Technologies de l'Information, RSTI - série L'Objet
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Titre: An Experiment on Knowledge Discovery in Chemical Databases
Auteurs: Sandra Berasaluce; Claude Laurenço; Amedeo Napoli; Gilles Niel
Détail: J.-F Boulicaut and F. Esposito and F. Giannotti and D. Pedreschi. 8th European Conference on Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases - PKDD 2004, Sep 2004, Pisa, Italia. Springer Verlag, 3202, pp. 39-51, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Integration of biological data from web resources : management of multiple answers through metadata retrieval
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Malika Smaïl-Tabbone
Détail: 12th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology - 3rd European Conference on Computational Biology - ISMB-ECCB 2004, 2004, Glasgow, Scotland, United Kingdom. pp. 3
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Titre: Knowledge organisation and information retrieval based on Galois lattices
Auteurs: Laszlo Szathmary; Amedeo Napoli
Détail: Le Thi Hoai An and Pham Dinh Tao. Modelling, Computation and Optimization in Information Systems and Management Sciences - MCO '04, 2004, Metz, France. Hermes Science Publishing, pp. 611-618
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Analyse des paysages agricoles : définition d'indicateurs pour la reconnaissance de structures spatiales sur images satellitaires
Auteurs: Jean Bachacou; Florence Le Ber; Ludmila Mangelinck
Détail: P. Monestiez and S. Lardon and B. Seguin. Organisation spatiale des activités agricoles et processus environnementaux, INRA Éditions, pp. 279-302, 2004, Science Update
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Titre: De la confiserie sur le Causse, ou comment concilier chorèmes et graphes
Auteurs: Florence Le Ber; Christian Brassac; Jean-Michel Préau; Jean-Luc Metzger
Détail: C. Blanc-Pamard and J.-P. Deffontaines and S. Lardon and C. Raichon and S. Zasser-Bedoya. Agro-tribulations, INRA éditions, pp. 117-129, 2004
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Rapports

Titre: Réalisation d'un annuaire de sources de données génomiques en vue de la collecte et de l'intégration de données sur le Web
Auteurs: Shazia Osman
Détail: [Stage], 2004, 77 p. A04-R-545 || osman04a
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Titre: Fouille de données textuelles complexes
Auteurs: Rokia Bendaoud
Détail: [Stage], 2004, 36 p. A04-R-568 || bendaoud04a
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Titre: Treillis de Galois et ontologies de domaine pour la classification et la recherche de sources de données génomiques
Auteurs: Nizar Messai
Détail: [Stage], 2004, 30 p. A04-R-541 || messai04a
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Titre: Data mining in reaction databases: extraction of knowledge on chemical functionality transformations
Auteurs: Sandra Berasaluce; Gilles Niel; Amedeo Napoli; Claude Laurenço
Détail: [Interne], 2004, 28 p. A04-R-049 || berasaluce04a
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Titre: A semantic similarity measure for content-based classification of documents
Auteurs: Rim Al Hulou; Amedeo Napoli; Emmanuel Nauer
Détail: [Interne], 2004, 15 p. A04-R-518 || al_hulou04c
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Thèses

Titre: Etude et réalisation d'un système d'extraction de connaissances à partir de textes
Auteurs: Hacène Cherfi
Détail: informatique. Université Henri Poincaré - Nancy I, Nov. 2004. French
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Documents sans référence de publication

Titre: Learning to automatically detect features for mobile robots using second-order Hidden Markov Models
Auteurs: Olivier Aycard; Jean-François Mari; Richard Washington
Détail: 2004
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2003

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Modeling and Comparing Farm Maps using Graphs and Case-based Reasoning
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli; Jean-Luc Metzger; Sylvie Lardon
Détail: Journal of Universal Computer Science, 2003, 9 (9), pp. 1073-1095
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Titre: Une optimisation de l'extraction d'un jeu de règles s'appuyant sur les caractéristiques statistiques des données
Auteurs: Martine Cadot; Amedeo Napoli
Détail: Extraction des connaissances et apprentissage - Méthodes d'optimisation pour l'ECA, RSTI série RIA-ECA, 2003, 16 (6), pp. 631-656
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Titre: XML et les objets (objectif XML)
Auteurs: Jérôme Euzenat; Amedeo Napoli; Jean-François Baget
Détail: L'Objet, 2003, 9 (3), pp. 11-37
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Titre: Perfectionnisme : effets du sexe et de l'échec
Auteurs: André Masson; Martine Cadot; M. Ansseau
Détail: L'Encéphale, 2003, XXIX (2), pp. 125-135
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Titre: Design and comparison of lattices of topological relations for spatial representation and reasoning
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: Journal of Experimental and Theoretical Artificial Intelligence, 2003, 15 (3), pp. 331-371
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Communications avec actes

Titre: Une mesure de similarité sémantique pour raisonner sur des documents
Auteurs: Rim Al Hulou; Amedeo Napoli; Emmanuel Nauer
Détail: 3èmes Journées Nationales sur les Modèles de Raisonnement - JNMR'03, 2003, Paris, France. 13 p
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Titre: Acquisition of Adaptation Knowledge for Breast Cancer Treatment Decision Support
Auteurs: Jean Lieber; Mathieu D'Aquin; Pierre Bey; Amedeo Napoli; Maria Rios; Catherine Sauvagnac
Détail: 9th Conference on Artificial Intelligence in Medicine in Europe2003 - AIME 2003, 2003, Protaras, Chypre. 10 p
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Titre: Towards a Text Mining Methodology Using Frequent Itemsets and Association Rule Extraction
Auteurs: Hacène Cherfi; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: M. Nadif, A. Napoli, E. SanJuan, A. Sigayret. Journées d'informatique Messine - JIM'03, Sep 2003, Metz, France. INRIA Lorraine, pp. 285-294
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Titre: Learning to automatically detect features for mobile robots using second-order Hidden Markov Models
Auteurs: Olivier Aycard; Jean-François Mari; Richard Washington
Détail: proceedings of the IJCAI'03 - Workshop on Reasoning with Uncertainty in Robotics - IJCAI-RUR'03, Aug 2003, Acapulco, Mexico, France. 8 p
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Titre: Un modèle de connaissances en RDF(S) pour raisonner à partir de cas sur le Web sémantique
Auteurs: Mathieu D'Aquin
Détail: Atelier raisonnement à partir de cas - Plate-forme AFIA, Jul 2003, Laval. 9 p
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Titre: Vers une méthodologie de fouille de textes s'appuyant sur l'extraction de motifs fréquents et de règles d'association
Auteurs: Hacène Cherfi; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: Rémi Gilleron. Conférence d'Apprentissage (CAp'03), dans le cadre de la plate-forme (AFIA'03), Jul 2003, Laval, France. Presses universitaires de Grenoble, pp. 61-76
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Titre: Raisonnement à partir de cas pour expliquer des organisations spatiales
Auteurs: Jean-Luc Metzger
Détail: 11ème Atelier Raisonnement à partir de cas - Plate-forme AFIA, Jul 2003, Laval, France. 10 p
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Titre: A Hybrid Classification Method for Database Contents Analysis
Auteurs: Jean-Charles Lamirel; Yannick Toussaint; Shadi Al Shehabi
Détail: The 16th International FLAIRS Conference - FLAIRS 2003, 2003, St. Augustine, Florida.
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Titre: Vers un Web sémantique en cancérologie
Auteurs: Sébastien Brachais; Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Première journée Web sémantique médical - WSM'2003, Mar 2003, Rennes, France. 2 p
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Titre: Méthodologie de sélection et de lecture de règles d'association pour la fouille de textes
Auteurs: Hacène Cherfi; Yannick Toussaint
Détail: Atelier de fouille de textes en Génomique, dans le cadre de la conférence Extraction et de Gestion des Connaissances - EGC'03, Jan 2003, Lyon, France. pp. 1-2
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Titre: Three Galois lattices of topological relations: design, comparison and use
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: M. Nadif, A. Napoli, E. San Juan, A. Sigayret. Journées de l'informatique Messine - JIM'2003, Sep 2003, Metz, France. INRIA Lorraine, pp. 55-66
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Titre: HMM, an Efficient Way to Detect Transcriptional Promoters in Bacterial Genomes?
Auteurs: Sébastien Hergalant; Bertrand Aigle; Bernard Decaris; Jean-François Mari; Pierre Leblond
Détail: European Conference on Computational Biology - ECCB'2003, Sep 2003, Paris, France. pp. 417-419
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Titre: Temporal and Spatial Data Mining with Second-Order Hidden Markov Models
Auteurs: Jean-François Mari; Florence Le Ber
Détail: Mohamed Nadif, Amedeo Napoli, Eric San Juan, Alain Sigayret. Fourth International Conference on Knowledge Discovery and Discrete Mathematics - Journées de l'informatique Messine - JIM'2003, Sep 2003, Metz, France. INRIA, pp. 247-254
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Titre: Modeling and representing structures for analyzing spatial organization in agronomy
Auteurs: Jean-Luc Metzger; Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: 11th International Conference on Conceptual Structures - ICCS 2003, Jul 2003, Dresden, Germany. Springer, 2746, pp. 215-228, Lecture notes in Artificial Intelligence
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Titre: A first experiment on the STANISLAS cohort using closed frequent pattern search
Auteurs: Sandy Maumus; Amedeo Napoli; Sophie Visvikis
Détail: European Conference on Computational Biology - ECCB'2003, Sep 2003, Paris, France. 2 p
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Titre: Règles d'association et interaction entre variables binaires
Auteurs: Martine Cadot; Amedeo Napoli
Détail: Yadolah Dodge et Giuseppe Melfi. 10èmes Rencontres de la Société Francophone de Classification - SFC'03, 2003, Neuchatel, Suisse. PAN, Méthodes et perspectives en classification
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Titre: Data mining in reaction databases. Extraction of knowledge on topology-based and functionality-based transformations
Auteurs: Sandra Berasaluce; Gilles Niel; Amedeo Napoli; Claude Laurenço
Détail: First Lilly Distinguished Lectureship, Nov 2003, Namur, Belgium.
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Titre: Éléments pour la modélisation et la représentation de structures spatiales agricoles
Auteurs: Jean-Luc Metzger; Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: Langages et Modèles à Objets - LMO'2003, 2003, Vannes, France. 9/2003, pp. 197-210, RSTI - L'objet
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Titre: CarrotAge, un logiciel pour la fouille de données agricoles
Auteurs: Marc Benoît; Florence Le Ber; Jean-François Mari; Catherine Mignolet; Céline Schott
Détail: Colloque STIC et Environnement SE'2003, Jun 2003, Rouen, France. 4 p
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Titre: A Generic Solution for Automated Collecting and Integration of Biological Data from Web Sources
Auteurs: Marie-Dominique Devignes; Yvan Norsa; Malika Smaïl-Tabbone; Philippe Collet; Lionel Domenjoud; Michel Dauça
Détail: European Conference on Computational Biology - ECCB'03, Sep 2003, Paris, France. pp. 2
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Conférences invitées

Titre: Fouille de données dans des bases de données de réactions : extraction de connaissances sur les méthodes de synthèse
Auteurs: Claude Laurenço; Sandra Berasaluce; Philippe Jauffret; Amedeo Napoli; Gilles Niel
Détail: Chimiométrie 2003, Dec 2003, Paris, France. 4 p
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Rapports

Titre: Typologies des successions de cultures et des techniques culturales dans le bassin de la Seine
Auteurs: Catherine Mignolet; Céline Schott; Jean-François Mari; Marc Benoît
Détail: [Contrat], 2003, 21 p. A03-R-235 || mignolet03a
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Titre: Adaptation Knowledge Acquisition, a Study for Breast Cancer Treatment
Auteurs: Jean Lieber; Mathieu D'Aquin; Pierre Bey; Amedeo Napoli; Maria Rios; Catherine Sauvagnac
Détail: [Interne], 2003, 14 p. A03-R-027 || lieber03a
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Titre: Comparaison de deux techniques d'extraction automatique de règles dans les bases de données. Illustration sur des données issues d'un questionnaire sur les peurs.
Auteurs: Martine Cadot; Amedeo Napoli; Viviane Nahama-Fourguette
Détail: [Interne], 2003, 28 p. A03-R-052 || cadot03a
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Titre: Knowledge Edition and Maintenance Tools for a Semantic Portal in Oncology
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Christophe Bouthier; Sébastien Brachais; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: [Interne], 2003, 24 p. A03-R-162 || daquin03b
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Titre: Règles d'association et "Paradoxe de Simpson"
Auteurs: Martine Cadot; Amedeo Napoli
Détail: [Interne], 2003, 8 p. A03-R-172 || cadot03b
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2002

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Computing iceberg concept lattices with Titanic
Auteurs: Gerd Stumme; Rafik Taouil; Yves Bastide; Nicolas Pasquier; Lotfi Lakhal
Détail: Data and Knowledge Engineering, 2002, 42 (2), pp. 189-222
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Titre: The design of an object-based system for representing and classifying spatial structures and relations
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: Journal of Universal Computer Science, 2002, 8 (8), pp. 751-773
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Titre: Segmentation temporelle et spatiale de données agricoles
Auteurs: Jean-François Mari; Florence Le Ber; Marc Benoît
Détail: Revue internationale de Géomatique, 2002, 12 (4), pp. 439-460
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Titre: Combining XML and Description Logics for Describing and Querying Documents
Auteurs: Rim Al Hulou; Amedeo Napoli
Détail: ERCIM News, 2002, 51, pp. 32-33
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Communications avec actes

Titre: Object-based Representation and Classification of Spatial Structures and Relations
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: International Conference on Tools with Artificial Intelligence - ICTAI'2002, Nov 2002, Washington DC, Etats-Unis d'Amerique. IEEE, 8 p
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Titre: Fouille de textes par combinaison de règles d'association et d'indices statistiques
Auteurs: Hacène Cherfi; Yannick Toussaint
Détail: 1er Colloque International sur la Fouille de Textes - CIFT'2002, Sep 2002, Hammamet, Tunisie. pp. 67-80
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Titre: Segmentation temporelle et spatiale de données agricoles
Auteurs: Jean-François Mari; Florence Le Ber; Marc Benoît
Détail: Actes des 6èmes Journées Cassini 2002, Sep 2002, Presqu'Île de Crozon, France. pp. 251-272
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Titre: A proposition for a multi-dimensional classification-based system for corporate knowledge management
Auteurs: Laszlo Szathmary
Détail: The 2nd EKMF Management Summer School - KMSS'2002, Sep 2002, Sophia Antipolis, France. pp. 129-134
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Titre: Modelling and comparing maps with graphs
Auteurs: Florence Le Ber; Jean-Luc Metzger; Amedeo Napoli
Détail: ECAI Workshop on Spatial and Temporal Reasoning, Jul 2002, Lyon, France. 4 p
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Titre: Strong, Fuzzy and Smooth Hierarchical Classification for Case-Based Problem Solving
Auteurs: Jean Lieber
Détail: F. van Harmelen. 15th European Conference on Artificial Intelligence - ECAI'02, Jul 2002, Lyon, France. IOS Press, Amsterdam, pp. 81-85
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Titre: A Galois lattice for qualitative spatial reasoning and representation
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: M. Liquière. ECAI Workshop on Advances in Formal Concept Analysis for Knowledge Discovery in Databases - FCAKDD'2002, Jul 2002, Lyon, France. 12 p
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Titre: Extraction de connaissances à partir de bases de données de réactions en chimie organique
Auteurs: Sandra Berasaluce; Claude Laurenço; Amedeo Napoli
Détail: Bruno Bachimont. Treizième journées francophones d'ingénierie des connaissances - IC'2002, Jun 2002, Rouen, France. pp. 151-162
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Titre: The Kasimir Project: Knowledge Management in Cancerology
Auteurs: Jean Lieber; Mathieu D'Aquin; Pierre Bey; Benoît Bresson; Olivier Croissant; Pierre Falzon; Anne Lesur; Julien Lévêque; Vanina Mollo; Amedeo Napoli; Maria Rios; Catherine Sauvagnac
Détail: 4th International Workshop on Enterprise Networking and Computing in Health Care Industry - HealthCom 2002, 2002, Nancy, France. pp. 125-127
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Titre: Analyse de l'interaction experts -- informaticiens lors de la modélisation de connaissances spatiales
Auteurs: Florence Le Ber; Christian Brassac; Jean-Luc Metzger
Détail: 13èmes Journées francophones sur l'ingénierie des Connaissances - IC'2002, 2002, Rouen, France. 10 p
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Titre: Représentation multi-points de vue des connaissances pour l'adaptation
Auteurs: Mathieu D'Aquin; Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Marie-Christine Jaulent and Christel Le Bozec and Eric Zapletal. 10ème séminaire français de raisonnement à partir de cas - RàPC'2002, May 2002, Paris, France. pp. 23-31
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Titre: Recopier c'est déjà adapter : six types d'adaptation par copie
Auteurs: Jean Lieber
Détail: Marie-Christine Jaulent and Christel Le Bozec and Eric Zapletal. 10ème séminaire français de raisonnement à partir de cas - RàPC'2002, May 2002, Paris, France. pp. 11-21
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Titre: Combining XML and DL for describing and querying documents
Auteurs: Rim Al Hulou; Amedeo Napoli
Détail: International Workshop on Description Logics - DL'2002, 2002, Toulouse, France. 8 p
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Titre: Using DL for a Case-Based Explanation System
Auteurs: Jean-Luc Metzger; Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: Ian Horrocks and Sergio Tessaris. International Workshop on Description Logics - DL'2002, 2002, Toulouse, France. pp. 203-210
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Titre: Adéquation d'indices statistiques à l'interprétation de règles d'association
Auteurs: Hacène Cherfi; Yannick Toussaint
Détail: A. Morin, P. Sébillot. 6èmes Journées internationales d'Analyse statistique des Données Textuelles - JADT 2002, 2002, Saint-Malo, France. pp. 233-244
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Titre: Interprétation des règles d'association extraites par un processus de fouille de textes
Auteurs: Hacène Cherfi; Yannick Toussaint
Détail: 13ème Congrès francophone AFRIF-AFIA de Reconnaissance des Formes et d'intelligence Artificielle - RFIA'02, 2002, Angers, France. 3, pp. 975-983
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Titre: Complémentarité entre fouille de données et recherche d'information dans le cadre d'analyses bibliométriques
Auteurs: Emmanuel Nauer
Détail: 13ème Congrès francophone AFRIF-AFIA de Reconnaissances des Formes et d'intelligence Artificielle, Jan 2002, Angers, France. 3, pp. 965-974
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Titre: Une plate-forme XML pour représenter des documents et leur contenu pour la mise en oeuvre du Web sémantique
Auteurs: Rim Al Hulou; Olivier Corby; Rose Dieng-Kuntz; Jérôme Euzenat; Carolina Medina Ramirez; Amedeo Napoli; Raphael Troncy
Détail: Jean Charlet and Philippe Laublet and Chantal Reynaud. Journées scientifiques Web sémantique, Oct 2002, Ivry, France. 7 p
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Titre: Association de méthodes symboliques et numériques pour l'analyse du contenu de bases de données
Auteurs: Jean-Charles Lamirel; Yannick Toussaint
Détail: 13ème Congrès Francophone AFRIF-AFIA de Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle - RFIA'2002, Jan 2002, Angers, France.
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Titre: Design and comparison of lattices of topological relations based on Galois lattice theory
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: D. Fensel, F. Giunchiglia, D. McGuinness, M.-A. Williams. Eight International Conference on Principles of Knowledge Representation and Reasoning - KR'2002, Apr 2002, Toulouse, France. Morgan Kaufmann Publishers, pp. 37-46
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Titre: Fouille de données à l'aide de HMM : Application à la détection de réitérations intragénomiques
Auteurs: Sébastien Hergalant; Bertrand Aigle; Bernard Decaris; Pierre Leblond; Jean-François Mari
Détail: Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM'02, 2002, Saint Malo, France. pp. 269-273
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Titre: How Far Association Rules and Statistical Indices help Structure Terminology?
Auteurs: Hacène Cherfi; Yannick Toussaint
Détail: N. Aussenac-Gilles, A. Maedche. Workshop of ECAI2002: Natural Language Processing and Machine Learning for Ontology Engineering OLT'02, Jul 2002, Lyon, France. pp. 5-9
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Titre: Intragenomic reiterations detection using hidden Markov models
Auteurs: Sébastien Hergalant; Bertrand Aigle; Bernard Decaris; Pierre Leblond; Jean-François Mari
Détail: 10th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology - ISMB 2002, Aug 2002, Edmonton, Canada. 1 p
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Titre: Utilisation des logiques de descriptions pour la représentation des structures spatiales
Auteurs: Jean-Luc Metzger; Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: Journées CASSINI 2002, Sep 2002, Presqu'île de Crozon, France. 5 p
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Titre: Description et comparaison de deux techniques d'extraction automatique de règles dans une base de données
Auteurs: Martine Cadot; Amedeo Napoli
Détail: 9ièmes Rencontres de la Société Francophone de Classification, Sep 2002, Toulouse, France. 4 p
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Titre: A first study of the central role of the analyst in the knowledge discovery process in biology
Auteurs: Sandy Maumus; Amedeo Napoli; Rafik Taouil; Sophie Visvikis
Détail: Poster session at the 10th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology - ISMB'02, Aug 2002, Edmonton, Canada. 1 p
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Titre: DefineCrawler : un crawler paramétrable pour la recherche d'information intelligente sur le Web
Auteurs: Emmanuel Nauer
Détail: Journées scientifiques Web sémantique, Oct 2002, Paris, France. 6 p
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Titre: Three knowledge representation formalisms for content-based manipulation of documents
Auteurs: Rim Al Hulou; Olivier Corby; Rose Dieng-Kuntz; Jérôme Euzenat; Carolina Ramirez; Amedeo Napoli; Raphael Troncy
Détail: Matteo Cristani. Workshop on Semantic Web - SemWeb@KR2002, Apr 2002, Toulouse, France. 8 p
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Rapports

Titre: Learning to automatically detect features for mobile robots using second-order Hidden Markov Models
Auteurs: Olivier Aycard; Jean-François Mari; Richard Washington
Détail: [Research Report], 2002, pp. 32. RR-4659
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Titre: Une optimisation de l'extraction d'un jeu de règles s'appuyant sur les caractéristiques statistiques des données
Auteurs: Martine Cadot; Amedeo Napoli
Détail: [Interne], 2002. A02-R-162 || cadot02a
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2001

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Recherche des successions de cultures et de leurs évolutions : analyse par HMM des données Ter-Uti en Lorraine
Auteurs: Marc Benoît; Florence Le Ber; Jean-François Mari
Détail: Agreste Vision - La statistique agricole, 2001, 31, pp. 23-30
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Titre: Étude de treillis de relations topologiques pour l'interprétation d'images satellitaires
Auteurs: Florence Le Ber; Ludmila Mangelinck; Amedeo Napoli
Détail: Revue internationale de Géomatique, 2001, 11 (2), pp. 215-219
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Titre: Version francophone du TASTE (Test for Ability to Study and Evaluation)
Auteurs: Andre-Marie Masson; Martine Cadot; A.M. Peirera; E. Depreeuw; M. Ansseau
Détail: L`Encéphale, 2001, 27, pp. 527-538
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Communications avec actes

Titre: Acquisition et modélisation de connaissances d'adaptation, une étude pour le traitement du cancer du sein
Auteurs: Jean Lieber; Pierre Bey; Florian Boisson; Benoît Bresson; Pierre Falzon; Anne Lesur; Amedeo Napoli; Maria Rios; Catherine Sauvagnac
Détail: Jean Charlet. journées ingénierie des connaissances - IC'2001, 2001, Grenoble, France. Presses Universitaires de Grenoble, pp. 409-426
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Titre: Des règles, des cas, des généralités, des spécificités, des applications, des adaptations, des chaînes, des combinaisons et des tartes
Auteurs: Jean Lieber
Détail: Béatrice Fuchs et Alain Mille. Atelier raisonnement à partir de cas RàPC 2001, 2001, Grenoble, France. pp. 49-58
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Titre: Un algorithme pour la phase d'adaptation du raisonnement à partir de cas
Auteurs: Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille; Amedeo Napoli
Détail: Andreas Herzig. Journées nationales sur les modèles de raisonnement - JNMR'01, 2001, Arras, France. 14 p
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Titre: Chorèmes et graphes pour modéliser les interactions entre organisation spatiale et fonctionnement des exploitations agricoles
Auteurs: Mathieu Capitaine; Sylvie Lardon; Florence Le Ber; Jean-Luc Metzger
Détail: Journées CASSINI 2001, 2001, Montpellier, France. 15 p
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Titre: XML et les systèmes de représentation de connaissances par objets pour la gestion de données semi-structurées
Auteurs: Rim Al Hulou; Emmanuel Nauer; Amedeo Napoli
Détail: Journées Francophones d'Extraction et de Gestion des Connaissances - EGC 2001, 2001, Nantes, France. 1 p
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Titre: Sentence Analysis by Case-Based Reasoning
Auteurs: Fairouz Chakkour; Yannick Toussaint
Détail: Moonis Ali. The Fourteenth International Conférence on Industrial and Engineering Applications of Artificial Intelligence and Expert SystemsIEA/AIE, 2001, Budapest, Hungary. Springer Verlag, 2070, pp. 546-551, Lecture notes in artificial intelligence
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Titre: Combining Symbolic and Numeric Techniques for Database Content Analysis
Auteurs: Yannick Toussaint; Jean-Charles Lamirel; Mathieu D'Aquin
Détail: AI/IEA01, 2001.
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Titre: Réseaux neuronaux avancés pour la cartographie de la science et de la technologie : Application à l'analyse des brevets
Auteurs: Jean-Charles Lamirel; Yannick Toussaint; Jacques Ducloy; Catherine Czysz; Claire François
Détail: Veille Stratégique Scientifique et Technologique - VSST'2001, Oct 2001, Barcelone, Espagne. pp. 215-229
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Titre: Réhabilitons les doublons !
Auteurs: Emmanuel Nauer
Détail: FPC/UPC - SFBA - IRIT. Veille Stratégique Scientifique et Technique - VSST 2001, 2001, Barcelona, Spain. 1, pp. 35-48
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Titre: Extraire des structures prédicatives à partir des textes, vers une indexation conceptuelle des textes
Auteurs: Fairouz Chakkour; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: Béatrice Fuchs, Alain Mille. Plate-forme AFIA / Atelier raisonnement partir de cas, 2001, Grenoble, France. 7 p
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Titre: Computing Proper Implications
Auteurs: Rafik Taouil; Yves Bastide
Détail: 9th International Conference on Conceptual Structures: Broadening the Base - ICCS'2001, Jul 2001, Stanford, CA US. 13 p
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Titre: Intelligent Structuring and Reducing of Association Rules with Formal Concept Analysis
Auteurs: Gerd Stumme; Rafik Taouil; Yves Bastide; Nicolas Pasquier; Lotfi Lakhal
Détail: 24th German / 9th Austrian Conference on Artificial Intelligence - KI 2001, Sep 2001, Vienna, Austria. 15 p
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Titre: Évolution d'une hiérarchie de classes par interclassement
Auteurs: Pascal Rapicault; Amedeo Napoli
Détail: R. Godin and I. Borne. Langages et Modèles à Objets, LMO'01, 2001, Le Croisic, France. Hermès, 7/1/2, pp. 215-230, l'Objet
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Titre: Extraction et interprétation de règles d'association pour la fouille de textes
Auteurs: Hacène Cherfi; Yannick Toussaint
Détail: A3CTE - Plate-forme AFIA, 2001, Grenoble, France. Presses Universitaires de Grenoble, pp. 15-16
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Ouvrages scientifiques

Titre: Probabilistic and Statistical Methods in Computer Science
Auteurs: Jean-François Mari; René Schott
Détail: Kluwer Academic Publishers, 236 p, 2001
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Rapports

Titre: Design and Comparison of Lattices of Topological Relations for Spatial Representation and Reasoning
Auteurs: Florence Le Ber; Ludmila Mangelinck; Amedeo Napoli
Détail: [Research Report], 2001, pp. 57. RR-4321
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Titre: Segmentation du génome de Streptomyces coelicolor par chaînes de Markov pour la recherche de réitérations
Auteurs: Sébastien Hergalant
Détail: [Stage], 2001, 50 p. A01-R-392 || hergalant01a
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2000

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Adaptation des normes et formats documentaires à la gestion informatisée de corpus bibliographiques
Auteurs: Samuel Jolibois; Emmanuel Nauer; Dominique Chouanière; Jacques Ducloy; Françoise Grandjean; Marc Mouzé-Amady
Détail: Bulletin des Bibliothèques de France, 2000, 45 (1), 11 p
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Titre: Les représentations des connaissances par objets
Auteurs: Amedeo Napoli; Jérôme Euzenat; Roland Ducournau
Détail: Revue Technique et Science Informatiques - TSI, 2000, 19 (1-2-3), pp. 387-394
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Communications avec actes

Titre: Combining symbolic and numeric techniques for DL contents classification and analysis
Auteurs: Jean-Charles Lamirel; Yannick Toussaint
Détail: First DELOS Workshop on Information seeking, searching and querying in Digital Librairies, Dec 2000.
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Titre: Levelwise search of frequent patterns with counting inference
Auteurs: Yves Bastide; Rafik Taouil; Nicolas Pasquier; Gerd Stumme; Lotfi Lakhal
Détail: Bases de Données Avancées - BDA'00, Oct 2000, Blois. 16 p
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Titre: Representation of spatial relations and structures in object-based knowledge representation systems
Auteurs: Florence Le Ber; Amedeo Napoli
Détail: ECAI Workshop on Current Issues in Spatio-Temporal Reasoning, 2000, Berlin, Germany.
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Titre: An Algorithm for Adaptation in Case-based Reasoning
Auteurs: Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille; Amedeo Napoli
Détail: Werner Horn. 14th European Conference on Artificial Intelligence - ECAI'2000, 2000, Berlin, Germany. IOS Press, pp. 45-49
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Titre: A Note on Classification-Based Reasoning and Semi-Structured Objects
Auteurs: Amedeo Napoli
Détail: Henk Kiers & Jean-Paul Rasson. 7th Conference of the International Federation of Classification Societies, 2000, Namur, Belgique. pp. 146
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Titre: Fouille de données agricoles par Modèles de Markov cachés
Auteurs: Jean-François Mari; Florence Le Ber; Marc Benoît
Détail: Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances - IC'2000, 2000, Toulouse, France. pp. 197-205
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Titre: Le raisonnement à partir de cas pour l'identification de rôles sémantiques dans des énoncés en langue naturelle
Auteurs: Fairouz Chakkour; Amedeo Napoli; Yannick Toussaint
Détail: séminaire RàPC-2000, May 2000.
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Titre: Une méthode d'étiquetage morpho-syntaxique pour la reconnaissance de tables de matières
Auteurs: Abdel Belaïd; Yannick Toussaint
Détail: Colloque International Francophone sur l'Ecrit et le Document - CIFEd'00, Jul 2000, Lyon, France. 10 p
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Titre: Objets graphiques et cognition située et distribuée. Un exemple en acquisition de connaissances
Auteurs: Florence Le Ber; Christian Brassac
Détail: Représentations graphiques dans les systèmes complexes naturels et artificiels. Journées de Rochebrune, Jan 2000. ENST, 14 p
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Titre: What can XML do for information retrieval on the WEB?
Auteurs: Emmanuel Nauer; Rim Al Hulou; Amedeo Napoli
Détail: Proceedings of the 7th International Workshop on Knowledge Representation meets Databases - KRDB'2000, 2000, Berlin/Germany. pp. 101-114
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Titre: Case-Based Reasoning for Breast Cancer Treatment Decision Helping
Auteurs: Jean Lieber; Benoît Bresson
Détail: E. Blanzieri & L. Portinale. fifth European Workshop on Case-Based Reasoning - EWCBR'2000, 2000, Trento, Italie. Springer, 1898, pp. 173-185, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: XML : un formalisme de représentation intermédiaire entre données semi-structurées et représentations par objets
Auteurs: Rim Al Hulou; Amedeo Napoli; Emmanuel Nauer
Détail: C. Dony & H.A. Sahraoui. Langages et Modèles à Objets - LMO'00, 2000, Montréal, Canada. Hermès, pp. 75-90
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Titre: Raisonnement à partir de cas pour l'aide au traitement du cancer du sein
Auteurs: Benoît Bresson; Jean Lieber
Détail: journées ingénierie des connaissances, 2000, Toulouse, France. pp. 189-196
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Titre: Composition et décomposition de l'adaptation dans le cadre du raisonnement à partir de cas
Auteurs: Jean Lieber
Détail: F. Le Ber et J. Lieber. Journée sur l'adaptation, INRA de Champenoux, 15 mai, 2000, INRA de Champenoux. pp. 31-36
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Titre: Objects and Classification: A Natural Convergence
Auteurs: Marianne Huchard; Robert Godin; Amedeo Napoli
Détail: J. Malenfant & S. Moisan & A. Moreina. Object-Oriented Technology --- ECOOP 2000 Workshop Reader, Jun 2000, Sophia Antipolis et Cannes, France. Springer-Verlag, 1964, pp. 123-137, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Fast computation of concept lattices using data mining techniques
Auteurs: Gerd Stumme; Rafik Taouil; Yves Bastide; Nicolas Pasquier; Lotfi Lakhal
Détail: 7th International Workshop on Knowledge Representation meets Databases - KRDB'2000, Aug 2000, Berlin, Germany. 9 p
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Titre: Un système de reconnaissance d'organisations spatiales agricoles sur images satellitaires
Auteurs: Florence Le Ber; Ludmila Mangelinck; Amedeo Napoli
Détail: Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle - RFIA'2000, 2000, Paris, France. I, pp. 119-128
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Titre: Building and interpreting term dependencies using association rules extracted from Galois Lattices
Auteurs: Yannick Toussaint; Arnaud Simon
Détail: Recherche d'Informations Assistée par Ordinateur - Content-Based Multimedia Information Access - RIAO'2000, 2000, Paris, France. 7 p
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Titre: Une proposition pour la représentation de structures dans un système de représentation de connaissances par objets
Auteurs: Amedeo Napoli; Florence Le Ber; Katalin Bognar
Détail: P. Tchounikine. Ingénierie des Connaissances - Ic-2000, 2000, Toulouse, France. AFIA - IRIT, Toulouse, pp. 145-152
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Titre: Apport de la fouille de données textuelles pour l'analyse de l'information
Auteurs: Yannick Toussaint; Arnaud Simon; Hacène Cherfi
Détail: Ingénierie des connaissances - IC'2000, May 2000, Toulouse, France. 10 p
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Titre: Le raisonnement à partir de cas pour l'analyse conceptuelle des énoncés en langue naturelle
Auteurs: Fairouz Chakkour
Détail: Rencontres Jeunes Chercheurs en Intelligence Artificielle, 2000, Lyon, France. 16 p
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: MAUD : Un prototype de machine à dicter vocale
Auteurs: Dominique Fohr; Jean-Paul Haton; Jean-François Mari; Kamel Smaïli; Imed Zitouni
Détail: none. Ressources et évaluation en ingénierie des langues, De Boeck, pp. 315-328, 2000, universités francophones
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Titre: Un algorithme de fouille dans une représentation des données par objets : une application au domaine médical
Auteurs: Arnaud Simon; Amedeo Napoli
Détail: J. Charlet & M. Zacklad & G. Kassel & D. Bourigaul. Ingénierie des Connaissances, évolutions récentes et nouveaux défis, Eyrolles, 11 p, 2000
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Titre: Interprétation de classes de termes par généralisation de structures prédicat-arguments
Auteurs: Nicolas Capponi; Yannick Toussaint
Détail: J. Charlet, M.Zacklad, G. Kassel et D. Bourigault. Ingénierie des connaissances, évolutions récentes et nouveaux défis, Eyrolles, pp. 337-357, 2000
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Titre: Planification à partir de cas et classification
Auteurs: Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Jean Charlet, Manuel Zacklad, Gilles Kassel, Didier Bourigault. Ingénierie des connaissances -- Évolutions récentes et nouveaux défis, Eyrolles, pp. 357-369, 2000, collection technique et scientifique des télécommunications
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Rapports

Titre: Treillis de relations topologiques et reconnaissance de structures spatiales sur images satellitaires
Auteurs: Florence Le Ber; Ludmila Mangelinck; Amedeo Napoli
Détail: [Interne], 2000, 74 p. A00-R-419 || le_ber00g
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Titre: Acquisition, modélisation et représentation de connaissances pour le raisonnement à partir de cas. Application à l'étude d'organisations spatiales agricoles
Auteurs: Jean-Luc Metzger
Détail: [Stage], 2000, 36 p. A00-R-121 || metzger00a
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Titre: Design and comparison of lattices of topological relations: Application to satellite image understanding
Auteurs: Florence Le Ber; Ludmila Mangelinck; Amedeo Napoli
Détail: [Interne], 2000, 39 p. A00-R-214 || le_ber00c
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Titre: Actes de la journée sur l'adaptation
Auteurs: Florence Le Ber; Jean Lieber
Détail: [Interne], 2000, 50 p. A00-R-331 || le_ber00e
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1999

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Représentation de relations et classification de structures spatiales
Auteurs: Florence Le Ber; Ludmila Mangelinck; Amedeo Napoli
Détail: Revue d'Intelligence Artificielle, 1999, 13 (2), pp. 441-467
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Titre: Raisonnement à partir de cas et résolution de problèmes dans une représentation par objets
Auteurs: Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: Revue d'Intelligence Artificielle, 1999, 13, pp. 9-35
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Communications avec actes

Titre: Building Viewpoints in an Object-Based Representation System for Knowledge Discovery in Databases
Auteurs: Arnaud Simon; Amedeo Napoli
Détail: S. Rubin. International Conference on Information Reuse & Integration - IRI'99, 1999, Atlanta, USA. The International Society for Computers and Their Applications, ISCA, pp. 104-108
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Titre: Objets semi-structurés, classes polythétiques et classification
Auteurs: Rim Al Hulou; Amedeo Napoli; Emmanuel Nauer
Détail: Florence Le ber, Jean-Francois Mari, Amedeo Napoli, Arnaud Simon. Septièmes journées de la Société Francophone de Classification - SFC'99, 1999, Nancy, France. Unité de recherche INRIA Lorraine, pp. 299-306
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Titre: Aspects classificatoires des systèmes à objets
Auteurs: Roland Ducournau; Marianne Huchard; Therese Libourel; Amedeo Napoli
Détail: F. Le Ber & J.F. Mari & A. Napoli & A. Simon. Septièmes Rencontres de la Société Francophone de Classification, 1999, Nancy, France. LORIA, pp. 45-52
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Titre: Variable-Length Sequence Language Model for Large Vocabulary Continuous Dictation Machine
Auteurs: Imed Zitouni; Jean-François Mari; Kamel Smaïli; Jean-Paul Haton
Détail: 6th European Conference on Speech Communication and Technology - EUROSPEECH'99, 1999, Budapest, Hungary.
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Titre: Relations et treillis de Galois
Auteurs: Arnaud Simon
Détail: Florence Le ber, Jean-Francois Mari, Amedeo Napoli, Arnaud Simon. Septième journées de la Société Francophone de Classification - SFC'99, 1999, Nancy, France. Unité de recherche INRIA Lorraine, pp. 299-306
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Titre: Reformulations and Adaptation Decomposition
Auteurs: Jean Lieber
Détail: Lieber, Jean et Melis, Erica et Mille, Alain et Napoli, Amedeo. International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR'99, 1999, Munich, Germany. LSA, University of Kaiserslautern, 7 p
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Titre: Classification problems in object-based representation systems
Auteurs: Amedeo Napoli
Détail: P. Lambrix & A. Borgida & M. Lenzerini & R. Moeller & P. Patel-Schneider. International Workshop on Description Logics - Dl'99, 1999, Linkoepings Universitet, Sweden. Linkoepings Universitet, Sweden, pp. 169-171
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Titre: Vers une théorie unifiée de l'adaptation en raisonnement à partir de cas
Auteurs: Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille; Amedeo Napoli
Détail: Journées Ingénierie des Connaissances - IC'99, 1999, Palaiseau, France.
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Titre: La méthode d'Euler vue comme une application du raisonnement à partir de cas
Auteurs: Jean Lieber
Détail: A. Mille et B. Trousse. Actes du 7ème séminaire français de raisonnement à partir de cas, 1999, Palaiseau, France. 5 p
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Titre: Classification pour l'aide au traitement du cancer du sein
Auteurs: Benoît Bresson; Jean Lieber
Détail: Florence Le ber, Jean-Francois Mari, Amedeo Napoli, Arnaud Simon. Septième journées de la Société Francophone de Classification - SFC'99, 1999, Nancy, France. Unité de recherche INRIA Lorraine, 7 p
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Titre: Classification de successions culturales par modèles de Markov
Auteurs: Jean-François Mari; Florence Le Ber; Marc Benoît
Détail: Florence Le ber, Jean-Francois Mari, Amedeo Napoli, Arnaud Simon. Septième journées de la Société Francophone de Classification - SFC'99, 1999, Nancy, France. Unité de recherche INRIA Lorraine, pp. 177 - 184
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Titre: Towards a Unified Theory of Adaptation in Case-Based Reasoning
Auteurs: Béatrice Fuchs; Jean Lieber; Alain Mille; Amedeo Napoli
Détail: K.D. Althoff, R. Bergmann, L.K. Branting. Third International Conference on Case-Based Reasoning - ICCBR'99, 1999, Seeon Monastery, Germany. Springer, 1650, pp. 104-117, Lecture Notes in Artificial Intelligence
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Titre: Les problèmes de variations terminologiques dans l'indexation de références bibliographiques
Auteurs: Emmanuel Nauer
Détail: Journées Internationales de Linguistique Appliquée - JILA'99, 1999, Nice, France. 3 p.
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Titre: De l'importance de la normalisation en bibliométrie
Auteurs: Emmanuel Nauer
Détail: Société Française de Bibliométrie Appliquée. Les systèmes d'information élaborée, 1999, Ile Rousse, France.
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Directions d'ouvrages

Titre: Workshop on Formalisation of Adaptation in Case-Based Reasoning
Auteurs: Jean Lieber; Erica Melis; Alain Mille; Amedeo Napoli
Détail: 1999
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1998

Communications avec actes

Titre: Distributed Component Technology: How Could it Help the Biological Data Analysis Task?
Auteurs: Fabien Campagne; Amedeo Napoli; Bernard Maigret
Détail: A.J. Robinson. Objects in Bioinformatics (OIB-98), 1998, Cambridge, UK. EMBL - EBI, 2-4 (Poster abstract)
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Titre: Représentation par objets et classification pour le raisonnement à partir de cas
Auteurs: Jean Lieber; Amedeo Napoli
Détail: M. Chein et F. Schmitt. Conférence AFCET - RFIA, 1998, Clermont-Ferrand, France. AFCET - AFIA - Université de Clermont-Ferrand, pp. 345-354 (tome III)
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Titre: Aspects de la classification dans un système de représentation des connaissances par objets
Auteurs: Arnaud Simon; Amedeo Napoli; Jean Lieber; Alain Ketterlin
Détail: Olivier Gascuel et Gilles Caraux. Sixièmes rencontres de la société francophone de classification, 1998, Montpellier, France. Société francophone de classification -- INRA Montpellier, pp. 205-209
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Titre: Using Case-Based Reasoning to Build Intelligent Systems
Auteurs: Amedeo Napoli
Détail: D. Plemenos. Third International Conference on Computer Graphics and Artificial Intelligence - ICCGAI'98, 1998, Limoges, France. AFIG -- LMSI Limoges, pp. 109-111
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Titre: A note on the representation and the manipulation of structures
Auteurs: Amedeo Napoli
Détail: E. Franconi, G. De Giacomo, R.M. MacGregor, W. Nutt and C.A. Welty. International Workshop on Description Logics - Dl'98, 1998, Trento, Italy. CEUR-WS.org, pp. 157-159, CEUR Workshop Proceedings
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Ouvrages scientifiques

Titre: Langages et modèles à objets -- Etat des recherches et perspectives
Auteurs: Roland Ducournau; Jérôme Euzenat; Gérald Masini; Amedeo Napoli
Détail: INRIA Rocquencourt, 528 p, 1998, Didactique
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Thèses

Titre: Représentation et classification de structures spatiales -- Application à la reconnaissance de paysages agricoles
Auteurs: Ludmila Mangelinck
Détail: Université Henri Poincaré - Nancy I, Oct. 1998. French
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1995

Autres publications

Titre: Classification et objets: programmation ou représentation?
Auteurs: Bernard Carré; Roland Ducournau; Jérôme Euzenat; Amedeo Napoli; François Rechenmann
Détail: 1995. Actes des 5ièmes Journées Nationales PRC-GDR Intelligence artificielle, Nancy, 1995
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