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Equipe de recherche MODEMIC
Modélisation et Optimisation des Dynamiques des Ecosystèmes MICrobiens
- Responsable : Alain Rapaport
- Type : Équipe-projet
- Centre(s) de recherche : Sophia
- Domaine : STIC pour les sciences de la vie et de l'environnement
- Thème : Observation, modélisation et commande pour le vivant
- INRA, Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (UMR)
Présentation de l'équipe
Les activités de recherche de l'équipe MODEMIC portent sur la modélisation et la simulation d'écosystèmes microbiens, naturels ou reconstitués, présentant plusieurs échelles temporelles, spatiales ou taxomomiques. Ses objectifs sont- une meilleure compréhension de l'écologie microbienne, notamment sur les plans de la diversité, des fonctions (dégradation, fermentation, séquestration) et des enjeux pour la préservation de l'environnement (qualité des ressources en eau, fertilités des sols,...)
- l'aide à la décision pour la conduite et l'amélioration des bio-procédés (dépollution, chimie verte,...)
Axes de recherche
- approche macroscopique
- approche microscopique
- mariage des deux approches
- détermination des structures des communautés
- caractérisation des interactions
- observation des structures spatiales
- identification, capteurs logiciels et filtrage
- stabilisation de bioprocédés
- commande optimale de bioréacteurs
- conception optimale
Logiciels
Relations industrielles et internationales
- UMR Centro de Modelamiento Matematico, Santiago, Chili
- Departamento de Ingeniera Matematica, Universidad de Chile, Santiago, Chili
- Departamento de Matematica, Universidad Tecnica Federico Santa Maria, Valparaiso, Chili
- Departamento de Ingenieria Informatica, Universidad de Santiago, Chili
- Instituto de Matematica y Ciencias Afines, Universidad Nacional de Ingenieria - Lima, Pérou
- Centre for systems engineering and applied mechanics, Université catholique de Louvain-la-Neuve, Belgique
- Automatic Control Laboratory, Université de Mons, Belgique
- Departamento de Matematica Aplicada, Universidad Complutense de Madrid, Espagne
- NRC Biotechnology Research Institute, Montréal, Canada
- Probability and Statistics Group, School of Mathematics, University of Manchester, Royaume-Uni
- Community and Conservation Ecology group, University of Groningen, Pays-Bas
- Department of Biology, McGill University, Montréal, Canada
- School of Biology, Georgia Institute of Technology, Atlanta, USA
- Laboratoire de Modélisation Mathématique et Numérique dans les Sciences de l'Ingénieur, Ecole Nationale d'Ingénieurs de Tunis, Université Tunis El-Manar, Tunisie
- Laboratoire d'Automatique, Université de Tlemcen, Algérie
- Laboratorio di Ingegneria Ambientale, Politecnico de Milano, Italie
- Centre de Biotechnologie de Sfax, Tunisie
- Grupo de Ingenieria Ambiental y Bioprocesos, Universidade de Santiago de Compostela, Espagne
- Escuela de Ingenieria Bioquimica, Pontifica Universidad Catholica de Valparaiso, Chili
- BANG - Analyse numérique de modèles non linéaires pour la Bio et Géophysique
- BIGS - Biologie, génétique et statistiques
- BIOCORE - Biological control of artificial ecosystems
- CARMEN - Modélisation et calculs pour l'électrophysiologie cardiaque
- DRACULA - Modélisation multi-échelle des dynamiques cellulaires : application à l'hématopoïese
- MACS - Modélisation, analyse et contrôle pour le calcul des structures
- MASAIE - Outils et modèles de théorie du contrôle non-linéaire pour l'épidémiologie et l'immunologie
- NUMED - Modélisation numérique en médecine
- REO - Simulation numérique d'écoulements biologiques
- SISYPHE - SIgnaux et systèmes en PHysiologie et ingénieriE
- VIRTUAL PLANTS - Modélisation de la morphogénèse des plantes à différentes échelles, des gènes aux phénotypes
Mots-clés : Modélisation Écologie microbienne Diversité Structuration spatiale Préservation de l'environnement Systèmes dynamiques Automatique Optimisation Modèles individus-centrés Dynamiques spatio-tem
Equipes de recherche du même thème :
Contact
Responsable de l'équipe
Alain Rapaport
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Tél: +33 4 99 61 26 52
Secrétariat
Tél: +33 4 92 38 75 56
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