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- Présentation
- Publications HAL
Equipe de recherche DYLISS
Publications de l'équipe DYLISS
2012
Articles dans des revues avec comité de lecture
- Titre
- Antagonistic interactions between heterotrophic bacteria as a potential regulator of community structure of hypersaline microbial mats.
- Auteurs
- Richard A Long; Damien Eveillard; Shelli L M Franco; Eric Reeves; James L Pinckney
- Détail
- FEMS Microbiology Ecology, 2012, epub ahead of print
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- Titre
- Dynamic Regulation of Tgf-B Signaling by Tif1γ: A Computational Approach
- Auteurs
- Geoffroy Andrieux; Nathalie Theret; Michel Le Borgne; Laurent Fattet; Ruth Rimokh
- Détail
- PLoS ONE, Public Library of Science, 2012
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- Titre
- Environmental factors determining ammonia-oxidizing organism distribution and diversity in marine environments.
- Auteurs
- Nicholas J Bouskill; Damien Eveillard; Diana Chien; Amal Jayakumar; Bess B Ward
- Détail
- Environmental Microbiology, 2012, 14 (3), pp. 714-29
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- Titre
- Substitutive Arnoux-rauzy sequences have pure discrete spectrum
- Auteurs
- Valérie Berthé; Timo Jolivet; Anne Siegel
- Détail
- Uniform Distribution Theory, Mathematical Institute of the Slovak Academy of Sciences, 2012, 7 (1), pp. 173-197
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Communications avec actes
- Titre
- Local Substitutability for Sequence Generalization
- Auteurs
- François Coste; Gaelle Garet; Jacques Nicolas
- Détail
- Jeffrey Heinz and Colin de la Higuera and Tim Oates. ICGI 2012, Sep 2012, Washington, United States. MIT Press, Proceedings of the Eleventh International Conference on Grammatical Inference, 21, pp. 97-111, JMLR Workshop and Conference Proceedings
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- Titre
- Expressive Pattern Matching with Logol. Application to the Modelling of -1 Ribosomal Frameshift events
- Auteurs
- Catherine Belleannée; Olivier Sallou; Jacques Nicolas
- Détail
- JOBIM 2012- 13e Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2012, Rennes, France. pp. 5-14
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- Titre
- Using Mutual Information and Answer Set Programming to refine PWM based transcription regulation network
- Auteurs
- Andres Aravena; Carito Guziolowski; Anne Siegel; Alejandro Maass
- Détail
- Jobim 2012, Jul 2012, Rennes, France. pp. 171
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- Titre
- Revisiting the Training of Logic Models of Protein Signaling Networks with a Formal Approach based on Answer Set Programming
- Auteurs
- Santiago Videla; Carito Guziolowski; Federica Eduati; Sven Thiele; Niels Grabe; Julio Saez-Rodriguez; Anne Siegel
- Détail
- D. Gilbert and M. Heiner. CMSB - 10th Computational Methods in Systems Biology 2012, Oct 2012, London, United Kingdom. Springer, CMSB 2012, LNCS, 7605, pp. 342-361
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- Titre
- Using large scale knowledge database about reactions and regulations to find key regulators of sets of genes
- Auteurs
- Pierre Blavy; Florence Gondret; Sandrine Lagarrigue; Jaap Van Milgen; Anne Siegel
- Détail
- F. Coste et D. Tagu. JOBIM 2012, 2012, Rennes, France. Inria Rennes Bretagne Atlantique, JOBIM 2012. 13eme journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques, pp. 123-132
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Communications sans actes
- Titre
- Modeling cell signaling pathways with discrete dynamical systems : Application to the Transforming Growth Factor β (TGFβ) dependent Epithelial-Mesenchymal Transition
- Auteurs
- Geoffroy Andrieux; Michel Le Borgne; Nathalie Theret
- Détail
- ISMB 2012, Jul 2012, Long Beach, United States.
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- Titre
- Modeling cell signaling pathways with discrete dynamical systems : Application to Transforming Growth Factor β (TGFβ) signaling
- Auteurs
- Geoffroy Andrieux; Michel Le Borgne; Nathalie Theret
- Détail
- Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Jul 2012, Rennes, France.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques
- Titre
- To detect and analyze sequence repeats whatever be their origin
- Auteurs
- Jacques Nicolas
- Détail
- Yves Bigot. Mobile genetic elements : protocols and genomic applications, 859, Springer, pp. 69-90, Feb. 2012, Springer Protocols, 978-1-61779-602-9
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Rapports
- Titre
- Recherche d'éléments structurés dans les génomes par modèles logiques
- Auteurs
- Antoine Rocheteau; Catherine Belleannée
- Détail
- [Research Report], 2012, pp. 30. PI-1994
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