Equipe de recherche DRACULA

Publications de l'équipe DRACULA

2012

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Modelling of thrombus growth and growth stop in flow by the method of dissipative particle dynamics.
Auteurs
Vitaly Volpert url; Alen Tosenberger; Fazly Ataullakhanov; N. Bessonov; Mikhail A. Panteleev; Alexey Tokarev
Détail
Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling, 2012, pp. 2012, Vol. 27, No. 5, 507-522.
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Titre
On the existence of stationary solutions for some systems of non-Fredholm integro-differential equations.
Auteurs
Vitaly Volpert url; Vitali Vougalter
Détail
Discontinuity, Nonlinearity and Complexity, 2012, pp. 1(2) (2012) 197-209.
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Titre
Continuous Mathematical Model of Platelet Thrombus Formation in Blood Flow.
Auteurs
Vitaly Volpert url; Alexey Tokarev; G. Sirakov; G. Panasenko; E. Schnol; A. Butylin; Fazly Ataullakhanov
Détail
Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling, 2012, 2012, Vol. 27, No. 2, pp.192-212.
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Titre
Solvability Conditions for a Linearized Cahn-Hilliard Equation of Sixth Order.
Auteurs
Vitaly Volpert url; Vitali Vougalter
Détail
Math. Model. Nat. Phenom., 2012, pp. 7 (2012), no. 2, 146-154.
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Titre
Mathematical modelling of erythropoiesis in vivo with multiple erythroblastic islands.
Auteurs
Vitaly Volpert url; Nikolai Bessonov; N. Eymard; Polina Kurbatova
Détail
Applied Mathematics Letters, 2012, pp. 25 (2012)1217-1221.
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Titre
Propagation of Turing patterns in a plankton model.
Auteurs
Vitaly Volpert url; N. K. Thakur
Détail
J. Biol. Dynamics, 2012, pp. 2012, 1-15.
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Titre
Existence of travelling waves for a class of integro-differential equations from population dynamics
Auteurs
Vitaly Volpert url; Narcisa Apreutesei
Détail
International Electronic Journal of Pure and Applied Mathematics, 2012, pp. Vol. 5 No. 2 2012, 53-67
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Titre
Reaction-Diffusion Model of Atherosclerosis Development.
Auteurs
Vitaly Volpert url; N. El Khatib; Stéphane Génieys; Bogdan Kazmierczak
Détail
J. Math. Biol., 2012, pp. 65 (2012), no. 2, 349-374.
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Titre
Asymptotic numerical analysis of the diffusion-discrete absorption equation.
Auteurs
Vitaly Volpert url; Polina Kurbatova; Grigory Panasenko
Détail
Math. Methods Appl. Sci., 2012, pp. 35 (2012), no. 4, 438-444
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Titre
On the solvability conditions for the diffusion equation with convection terms.
Auteurs
Vitaly Volpert url; Vitali Vougalter
Détail
Comm. Pure and Applied Analysis, 2012, pp. 11 (2012), No.1, 365-373.
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Titre
Solvability conditions for some linear and nonlinear non-Fredholm elliptic problems.
Auteurs
Vitaly Volpert url; Vitali Vougalter
Détail
Anal. Math. Phys., 2012, pp. (2012) 2:473-496.
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Titre
Mathematical model of the primary CD8 T cell immune response: stability analysis of a nonlinear age-structured system.
Auteurs
Emmanuelle Terry; Jacqueline Marvel; Christophe Arpin; Olivier Gandrillon; Fabien Crauste
Détail
Journal of Mathematical Biology, 2012, 65, pp. 263-291
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Titre
The age of olfactory bulb neurons in humans.
Auteurs
Olaf Bergmann; Jakob Liebl; Samuel Bernard; Kanar Alkass; Maggie S Y Yeung; Peter Steier; Walter Kutschera; Lars Johnson; Mikael Landén; Henrik Druid; Kirsty L Spalding; Jonas Frisén
Détail
Neuron, Cell Press, 2012, 74 (4), pp. 634-9
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Titre
Fragmentation and monomer lengthening of rod-like polymers, a relevant model for prion proliferation
Auteurs
Ionel Ciuperca; Erwan Hingant; Liviu Palade; Laurent Pujo-Menjouet
Détail
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, 2012, 17 (3), pp. 775-799
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article-corr-final.ps article-corr-final.pdf BibTex
Titre
Modeling erythroblastic islands: using a hybrid model to assess the function of central macrophage.
Auteurs
S. Fischer; P. Kurbatova; N. Bessonov; O. Gandrillon; V. Volpert; F. Crauste
Détail
Journal of Theoretical Biology, 2012, 298, pp. 92-106
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BibTex
Titre
Cardiomyocyte renewal in humans.
Auteurs
Olaf Bergmann; Sofia Zdunek; Jonas Frisén; Samuel Bernard; Henrik Druid; Stefan Jovinge
Détail
Circulation Research, American Heart Association, 2012, 110 (1), e17-8; author reply e19-21
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BibTex
Titre
Global well-posedness of a conservative relaxed cross diffusion system.
Auteurs
Thomas Lepoutre; Michel Pierre; Guillaume Rolland
Détail
SIAM Journal on Mathematical Analysis, Society for Industrial ane Applied Mathematics, 2012, 44 (3), pp. 1674-1693
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LPR_cross.pdf LPR_cross.ps BibTex

Communications avec actes

Titre
Finding Collections of k-Clique Percolated Components in Attributed Graphs
Auteurs
Pierre-Nicolas Mougel; Christophe Rigotti url; Olivier Gandrillon
Détail
Pacific-Asia Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (PAKDD), 2012, Kuala Lumpur, Malaysia. 7302, pp. 181-192, LNCS
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BibTex
Titre
Finding Collections of Protein Modules in Protein-Protein Interaction Networks
Auteurs
Pierre-Nicolas Mougel; Christophe Rigotti url; Olivier Gandrillon
Détail
Bioinformatics and Computational Biology (BICoB), 2012, Las Vegas, United States. pp. 216-222
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Thèses

Titre
Modélisation probabiliste en biologie moléculaire et cellulaire
Auteurs
Romain Yvinec url
Détail
mathématiques appliquées; modélisation des systèmes vivants. Université Claude Bernard - Lyon I, Oct. 2012. French
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masterv3.pdf BibTex
Titre
Contributions à la théorie des modèles positive.
Auteurs
Mohammed Belkasmi
Détail
mathématiques. Université Claude Bernard - Lyon I, Mar. 2012. French
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Contributions_A_la_thA_orie_des_modA_les_positive_.pdf BibTex

Documents sans référence de publication

Titre
First passage times in homogeneous nucleation and self-assembly
Auteurs
Romain Yvinec; Maria R. D'Orsogna; Tom Chou
Détail
Nov. 2012. 18 pages, 9 Figures
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BibTex
Titre
The role of platelets in blood coagulation during thrombus formation in flow
Auteurs
Alen Tosenberger; Fazly Ataullakhanov; Nikolai Bessonov; Mikhail A. Panteleev; Alexey Tokarev; Vitaly Volpert
Détail
Aug. 2012
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hal_20120910.pdf BibTex
Titre
Estimating relevant parameters of the CD8 immune response from a systems biology approach
Auteurs
Emmanuelle Terry; Isabelle Le Mercier; Julien Mafille; Sophia Djebali; Thibault Andrieu; Blandine Mercier; Christophe Arpin; Fabien Crauste url; Jacqueline Marvel; Olivier Gandrillon
Détail
Jun. 2012
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Terry-etal-06-06-2012.pdf BibTex
Titre
Adiabatic reduction of a piecewise deterministic markov model of stochastic gene expression with bursting transcription
Auteurs
Jinzhi Lei; Michael C. Mackey; Romain Yvinec; Changjing Zhuge
Détail
Feb. 2012. 39 pages
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2011

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Particle Dynamics Methods of Blood Flow Simulations,
Auteurs
Alen Tosenberger; Vsevolod Salnikov; Nikolai Bessonov; Evgeniya Babushkina; Vitaly Volpert url
Détail
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2011, 6 (5), pp. 320-332
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mmnp-tosenberger.pdf BibTex
Titre
On the existence of stationary solutions for some non-Fredholm integro-differential equations
Auteurs
Vitali Vougalter; Vitaly Volpert url
Détail
Documenta Mathematica, 2011, 16, pp. 561-580
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nfnl-revised.pdf BibTex
Titre
Computational Algorithm for Some Problems with Variable Geometrical Structure
Auteurs
Nikolai Bessonov; Vitaly Volpert url
Détail
Lecture notes in computer science, 2011, 6260/2011, pp. 87-102
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algorithm.pdf BibTex
Titre
Spectrum of some integro-differential operators and stability of travelling waves
Auteurs
Arnaud Ducrot; Martine Marion; Vitaly Volpert url
Détail
Nonlinear Analysis: Theory, Methods and Applications, 2011, 74 (13), pp. 4455-4473
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int-spectrum15.pdf BibTex
Titre
Properness and Topological Degree for Nonlocal Reaction-Diffusion Operators
Auteurs
Narcisa Apreutesei; Vitaly Volpert url
Détail
Abstract and Applied Analysis, 2011, pp. ID 629692
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int-dif-prop_3_revised.pdf BibTex
Titre
Solvability conditions for some non-Fredholm operators
Auteurs
Vitali Vougalter; Vitaly Volpert url
Détail
Proceedings of the Edinburgh Mathematical Society, 2011, 54 (1), pp. 249-271
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fredholm.pdf BibTex
Titre
Dynamics of human adipose lipid turnover in health and metabolic disease.
Auteurs
Peter Arner; Samuel Bernard; Mehran Salehpour; Göran Possnert; Jakob Liebl; Peter Steier; Bruce A Buchholz; Mats Eriksson; Erik Arner; Hans Hauner; Thomas Skurk; Mikael Rydén; Keith N Frayn; Kirsty L Spalding
Détail
Nature, 2011, 478 (7367), pp. 110-3
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Titre
Cholesterol synthesis-related enzyme oxidosqualene cyclase is required to maintain self-renewal in primary erythroid progenitors.
Auteurs
C. Mejia-Pous; F. Damiola; O. Gandrillon
Détail
Cell Proliferation, 2011, 44 (5), pp. 441-52
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Titre
Dynamics of polymerization shed light on the mechanisms that lead to multiple amyloid structures of the prion protein.
Auteurs
Maria-Teresa Alvarez-Martinez; Pascaline Fontes; Viviana Zomosa-Signoret; Jacques-Damien Arnaud; Erwan Hingant; Laurent Pujo-Menjouet; Jean-Pierre Liautard
Détail
BBA - Biochimica et Biophysica Acta, 2011, 1814 (10), pp. 1305-17
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BibTex
Titre
Regulation of mammalian cell cycle progression in the regenerating liver.
Auteurs
Anuradha Chauhan; Stephan Lorenzen; Hanspeter Herzel; Samuel Bernard
Détail
Journal of Theoretical Biology, 2011, 283 (1), pp. 103-12
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BibTex
Titre
A review on local asymptotic stability analysis for mathematical models of hematopoiesis with delay and delay-dependent coefficients
Auteurs
Fabien Crauste url
Détail
Annals of the Tiberiu Popoviciu Seminar of functional equations, approximation and convexity, 2011, 9, pp. 121-143
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ATPS-2011-Crauste-Fabien.pdf BibTex
Titre
Les complexités : point de vue d'un institut des systèmes complexes
Auteurs
Eric Bertin; Guillaume Beslon; Olivier Gandrillon; Sébastian Grauwin; Pablo Jensen; Nicolas Schabanel
Détail
Hermes, 2011, 60, pp. 145-150
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BibTex
Titre
Identification of cardiomyocyte nuclei and assessment of ploidy for the analysis of cell turnover.
Auteurs
Olaf Bergmann; Sofia Zdunek; Kanar Alkass; Henrik Druid; Samuel Bernard; Jonas Frisén
Détail
Experimental Cell Research, 2011, 317 (2), pp. 188-94
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Titre
HYBRID MODEL OF ERYTHROPOIESIS AND LEUKEMIA TREATMENT WITH CYTOSINE ARABINOSIDE
Auteurs
Polina Kurbatova; Samuel Bernard; Nikolai Bessonov; Fabien Crauste; Ivan Demin; Charles Dumontet; Stephan Fischer; Vitaly Volpert
Détail
SIAM Journal on Applied Mathematics, 2011, 71 (6), pp. 2246-2268
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FinalVersion.pdf BibTex
Titre
Application of Hybrid Models to Blood Cell Production in the Bone Marrow
Auteurs
Nikolai Bessonov; Fabien Crauste url; Stephan Fisher; Polina Kurbatova; Vitaly Volpert
Détail
Math. Model. Nat. Phenom., 2011, 6 (7), pp. 2-12
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BibTex
Titre
Modelling of Plant Growth with Apical or Basal Meristem
Auteurs
Nikolai Bessonov; Fabien Crauste url; Vitaly Volpert
Détail
Math. Model. Nat. Phenom., 2011, 6 (2), pp. 107-132
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BibTex
Titre
Extrapolation Spaces and Partial Neutral Functional Differential Equations with infinite delay
Auteurs
Mostafa Adimy; Khalil Ezzinbi; Mohamed Alia
Détail
Differential and integral equations, Khayyam Publishing, 2011
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Communications avec actes

Titre
Extraction sous Contraintes d'Ensembles de Cliques Homogènes
Auteurs
Pierre-Nicolas Mougel; Marc Plantevit; Christophe Rigotti url; Olivier Gandrillon; Jean-Francois Boulicaut
Détail
11eme Conference Francophone sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances (EGC'11), 2011, France. pp. 1-12
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Ouvrages scientifiques

Titre
Elliptic Partial Differential Equations. Volume I. Fredholm theory of elliptic problems in unbounded domains
Auteurs
Vitaly Volpert url
Détail
birkhauser, pp. 655, Dec. 2011
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Documents sans référence de publication

Titre
On the bursting of gene products
Auteurs
Romain Yvinec; Alexandre F. Ramos
Détail
Dec. 2011. 13 pages
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RY-13-12-11.pdf RY-13-12-11.ps BibTex
Titre
Positive model theory and amalgamations
Auteurs
Mohammed Belkasmi
Détail
Dec. 2011, Notre Dame Journal of Formal Logic. This article has been accepted at Notre Dame Journal of Formal Logic.
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article3ndjfl.pdf BibTex
Titre
Synchronisation and control of proliferation in cycling cell population models with age structure
Auteurs
Frédérique Billy url; Jean Clairambault; Olivier Fercoq; Stéphane Gaubert; Thomas Lepoutre; Thomas Ouillon; Shoko Saito
Détail
Dec. 2011. 46 pages
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BiCFerGLOuS.pdf BibTex
Titre
Modelling Erythroblastic Islands: Using a Hybrid Model to Assess the Function of Central Macrophage
Auteurs
Stephan Fischer; Polina Kurbatova; Nikolai Bessonov; Olivier Gandrillon; Vitaly Volpert; Fabien Crauste
Détail
May. 2011, UMR5208
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manuscript.pdf manuscript.ps BibTex
Titre
A numerical scheme for rod-like polymers with fragmentation and monomers lengthening
Auteurs
Erwan Hingant
Détail
2011
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article.pdf article.ps BibTex

2010

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Novel genes differentially expressed between posterior and median silk gland identified by SAGE-aided transcriptome analysis.
Auteurs
Corinne Royer; Jérôme Briolay; Annie Garel; Patrick Brouilly; Shun-Ichi Sasanuma; Motoe Sasanuma; Michihiko Shimomura; Céline Keime; Olivier Gandrillon; Yongping Huang; Gérard Chavancy; Kazuei Mita; Pierre Couble
Détail
Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2010, epub ahead of print
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Titre
Identification of human, rat and chicken ribosomal proteins by a combination of two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis and mass spectrometry.
Auteurs
Anh Thu Nguyen-Lefebvre; Sandrine Gonin-Giraud; Alexander Scherl; Patrizia Arboit; Laure Granger; Jean-Charles Sanchez; Jean-Jacques Diaz; Olivier Gandrillon; Jean-Jacques Madjar
Détail
Journal of proteomics, 2010, epub ahead of print
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Titre
Spatial structures and generalized travelling waves for an integro-differential equation
Auteurs
Vitaly Volpert; Narcisa Apreutesei; Nikolai Bessonov; Vitali Vougalter
Détail
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, 2010, 13 (3), pp. 537-557
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Titre
Existence of Waves for a Nonlocal Reaction-Diffusion Equation.
Auteurs
Vitaly Volpert; I. Demin
Détail
Math. Model. Nat. Phenom., 2010, pp. 5 (2010), No. 5, 80-101.
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Titre
Linear stability analysis of reaction front propagation in liquids with vibrations
Auteurs
Vitaly Volpert; K. Allali; F. Bikany; A. Taik
Détail
international electronic journal of pure and applied mathematics (IEJPAM), 2010, 1 (2), pp. 196-215
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BibTex
Titre
On the solvability conditions for some non-Fredholm operators
Auteurs
Vitaly Volpert; Vitali Vougalter
Détail
International Journal of Pure and Applied Mathematics (IJPAM), 2010, 60 (2), pp. 169-191
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BibTex
Titre
Mathematical study of feedback control roles and relevance in stress erythropoiesis.
Auteurs
Fabien Crauste; Ivan Demin; Olivier Gandrillon; Vitaly Volpert
Détail
Journal of Theoretical Biology, 2010, 263 (3), pp. 303-16
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BibTex
Titre
Adipocyte turnover: relevance to human adipose tissue morphology.
Auteurs
Erik Arner; Pål O Westermark; Kirsty L Spalding; Tom Britton; Mikael Rydén; Jonas Frisén; Samuel Bernard; Peter Arner
Détail
Diabetes, 2010, 59 (1), pp. 105-9
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BibTex
Titre
Tumor growth rate determines the timing of optimal chronomodulated treatment schedules
Auteurs
Samuel Bernard; Branka Cajavec Bernard; Francis Lévi; Hanspeter Herzel
Détail
PLoS Computational Biology, 2010, 6 (3), pp. e1000712
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bernard2010PLoSComputBiol.pdf BibTex
Titre
Boundedness and Lyapunov Function for a Nonlinear System of Hematopoietic Stem Cell Dynamics
Auteurs
Fabien Crauste; Mostafa Adimy; Abderrahim El Abdllaoui
Détail
Comptes Rendus Mathematique, 2010, 348 (7-8), pp. 373-377
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BibTex
Titre
Asymptotic behavior and stability switch for a mature-immature model of cell differentiation
Auteurs
Mostafa Adimy; Fabien Crauste; Catherine Marquet
Détail
Nonlinear Analysis: Real World Applications, 2010, 11 (4), pp. 2913-2929
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BibTex
Titre
Stability and Hopf bifurcation for a cell population model with state-dependent delay
Auteurs
Fabien Crauste; Mostafa Adimy; Hassan Hbid; Redouane Qesmi
Détail
SIAM Journal on Applied Mathematics, 2010, 70 (5), pp. 1611-1633
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BibTex
Titre
A multi-scale model of erythropoiesis
Auteurs
Ivan Demin; Fabien Crauste; Olivier Gandrillon; Vitaly Volpert
Détail
Journal of Biological Dynamics, 2010, 4 (1), pp. 59-70
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BibTex
Titre
A mathematical model for the interpretation of nuclear bomb test derived 14C incorporation in biological systems
Auteurs
Samuel Bernard; Jonas Frisén; Kirsty Spalding
Détail
Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms, 2010, 268 (7-8), pp. 1295-1298
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bernardNIMB.pdf BibTex

Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre
Stability and Hopf bifurcation for a first-order linear delay differential equation with distributed delay
Auteurs
Fabien Crauste
Détail
Complex Time Delay Systems (Ed. F. Atay), Springer, pp. 320, 2010
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Documents sans référence de publication

Titre
Molecular Distributions in Gene Regulatory Dynamics
Auteurs
Michael C. Mackey; Marta Tyran-Kamińska; Romain Yvinec
Détail
Sep. 2010. 14 pages, 12 figures. Conferences: "2010 Annual Meeting of The Society of Mathematical Biology", Rio de Janeiro (Brazil), 24-29/07/2010. "First International workshop on Differential and Integral Equations with Applications in Biology and Medicine", Aegean University, Karlovassi, Samos island (Greece), 6-10/09/2010
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2009

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Mathematical model of hematopoiesis dynamics with growth factor-dependent apoptosis and proliferation regulation
Auteurs
Fabien Crauste; Mostafa Adimy
Détail
Mathematical and Computer Modelling, 2009, 49, pp. 2128-2137
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2008

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Discrete maturity-structured model of cell differentiation with applications to acute myelogenous leukemia
Auteurs
Mostafa Adimy; Fabien Crauste url; Abderrahim El Abdllaoui
Détail
Journal of Biological Systems, World Scientific Publishing, 2008, 16 (3), pp. 395-424
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BibTex
Titre
Modélisation de la dynamique de l'hématopoïèse normale et pathologique
Auteurs
Mostafa Adimy; Samuel Bernard; Jean Clairambault; Fabien Crauste url; Stéphane Génieys; Laurent Pujo-Menjouet
Détail
Hématologie, 2008, 14 (5), pp. 339-350
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Titre
Numerical integration of a mathematical model of hematopoietic stem cell dynamics
Auteurs
Mostafa Adimy; Oscar Angulo; Fabien Crauste url; Juan Carlos Lopez-Marcos
Détail
Computer and mathematics with applications, Elsevier, 2008, 56, pp. 594-606
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2006

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Asymptotic Behavior of a Discrete Maturity Structured System of Hematopoietic Stem Cells Dynamics with Several Delays
Auteurs
Mostafa Adimy; Fabien Crauste url; Abderrahim El Abdllaoui
Détail
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2006, 1 (2), pp. 1-22
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