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Equipe de recherche BONSAI
Bioinformatics and Sequence Analysis
- Responsable : Hélène Touzet
- Type : Équipe-projet
- Centre(s) de recherche : Lille
- Domaine : STIC pour les sciences de la vie et de l'environnement
- Thème : Biologie numérique et bioinformatique
- Université des sciences et technologies de Lille (Lille 1), CNRS, Laboratoire d'informatique fondamentale de Lille (LIFL) (UMR8022)
Présentation de l'équipe
La bio-informatique a connu un développement important ces vingt dernières années pour devenir un domaine de recherche riche et fécond. Cette evolution s'est accompagnée d'innovations en biologie moléculaire concernant les technologies de séquençage, le transcriptome, la protéomique, qui permettent d'accéder à une mine d'informations. Ces données constituent une opportunité inédite d'élucider le fonctionnement du génome et de la cellule. L'objectif principal de BONSAI est de développer des outils pour l'analyse des génomes et des séquences à grande échelle. Cela inclut la définition de modèles combinatoires et d'algorithmes efficaces, la mise en oeuvre dans des logiciels robustes et diffusés, la validation sur des données biologiques. La plupart de nos projets de recherche sont menés en collaboration avec des équipes de recherche de biologie.Axes de recherche
High-throughput sequence analysis Noncoding RNAs Nonribosomal peptides Genome rearrangementsMots-clés : Bioinformatique
Equipes de recherche du même thème :
- ABS - Algorithmes et Biologie Structurale
- AMIB - Algorithmes et modèles pour la Biologie Intégrative
- BAMBOO - Un regard algorithmique sur les génomes, les cellules et l'environnement
- BEAGLE - Artificial Evolution and Computational Biology
- DYLISS - Dynamics, Logics and Inference for biological Systems and Sequences
- GENSCALE - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics
- IBIS - Modélisation, simulation, analyse expérimentale et contrôle de réseaux de régulation bactériens
- MAGNOME - Models and Algorithms for the Genome
- MORPHEME - Morphologie et Images
- SERPICO - Modélisation spatio-temporelle, imagerie et dynamiques cellulaires des complexes moléculaires
Contact
Responsable de l'équipe
Hélène Touzet
(Voir toutes les équipes)
Tél: +33 3 59 57 79 16
Secrétariat
Tél: +33 3 59 57 78 37
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