Equipe de recherche BIGS

Publications de l'équipe BIGS

2012

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
System biology approach for in vivo photodynamic therapy optimization of ruthenium-porphyrin compounds
Auteurs
Marlène Pernot; Thierry Bastogne; Nicolas P. E. Barry; Bruno Therrien; Gunda Koellensperger; Stephan Hann; Vadzim Reshetov; Muriel Barberi-Heyob
Détail
Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2012, 117, pp. 80-89
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Titre
Real-Time Monitoring of Photocytotoxicity in Nanoparticles-based Photodynamic Therapy: A Model-based Approach
Auteurs
Hamanou Benachour; Thierry Bastogne; Magali Toussaint; Yosra Chemli; Aymeric Sève; Céline Frochot; François Lux; Olivier Tillement; Régis Vanderesse; Muriel Barberi-Heyob
Détail
PLoS ONE, 2012, 7 (11), pp. e48617
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Titre
Tumor vascular responses to antivascular and antiangiogenic strategies: looking for suitable models
Auteurs
Jihane Mriouah; Cédric Boura; Magalie Thomassin; Thierry Bastogne; Dominique Dumas; Béatrice Faivre; Muriel Barberi-Heyob
Détail
Trends in Biotechnology, 2012, 30 (12), pp. 649-658
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Titre
Limits of variance-based sensitivity analysis for non- identifiability testing in high dimensional dynamic models
Auteurs
Simona Dobre; Thierry Bastogne url; Christophe Profeta; Muriel Barberi-Heyob; Alain Richard
Détail
Automatica, 2012, 48 (1), pp. 2740-2749
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Automatica_SD_VF.pdf BibTex
Titre
Tumor growth modeling based on cell and tumor lifespans
Auteurs
Roukaya Keinj; Thierry Bastogne url; Pierre Vallois url
Détail
Journal of Theoretical Biology, 2012, 312, pp. 76-86
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JTB_2012_HAL.pdf BibTex
Titre
Convergence of stochastic gene networks to hybrid piecewise deterministic processes
Auteurs
Alina Crudu; Arnaud Debussche; Aurélie Muller; Ovidiu Radulescu
Détail
Annals of Applied Probability, 2012, 22 (5), pp. 1822-1859
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convergence-PDP.pdf convergence-PDP.ps BibTex
Titre
Multifunctional peptide-conjugated hybrid silica nanoparticles for photodynamic therapy and MRI
Auteurs
Hamanou Benachour; Aymeric Sève; Thierry Bastogne; Céline Frochot; Régis Vanderesse; Jordane Jasniewski; Imen Miladi; Claire Billotey; Olivier Tillement; François Lux; Muriel Barberi-Heyob
Détail
Theranostics, 2012, 2 (9), pp. 889-904
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Communications avec actes

Titre
Markovian modelling of phenotypic state transitions in glioblastoma cancer cells.
Auteurs
Thierry Bastogne url; Anna Golebiewska; Francisco Azuaje; Simone Niclou
Détail
EMBO Conference Series: From Functional Genomics to Systems Biology, Nov 2012, Heidelberg, Germany. pp. 122
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Titre
Analyse canonique généralisée d'un flux de données d'espérance variable dans le temps
Auteurs
Jean-Marie Monnez
Détail
XIXèmes Rencontres de la Société Francophone de Classification - SFC 2012, Oct 2012, Marseille, France.
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soumission.pdf BibTex
Titre
Pharmacokinetic modeling of nanoparticles-based PS vectors into glioblastoma from MRI imaging in PDT
Auteurs
Jean-Baptiste Tylcz; Denise Bechet; Thierry Bastogne url; Hugues Garnier; Muriel Barberi-Heyob
Détail
9th International Symposium on Photodynamic Therapy and Photodiagnosis in Clinical Practice, Oct 2012, Brixen, Italy. pp. CDROM
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Titre
Optimization of illumination in interstitial photodynamic therapy for high-grade brain tumors
Auteurs
Magali Toussaint; Magalie Thomassin; Marine Amouroux; Ernest Galbrun; Walter Blondel; Thierry Bastogne url; Muriel Barberi-Heyob
Détail
9th International Symposium on Photodynamic Therapy and Photodiagnosis in Clinical Practice, Oct 2012, Brixen, Italy. pp. CDROM
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Titre
System identification of the intrabrain tumoral uptake of multifunctional nanoparticles
Auteurs
Jean-Baptiste Tylcz; Denise Bechet; Thierry Bastogne url; Hugues Garnier; Muriel Barberi-Heyob
Détail
8th IFAC Symposium on Biological and Medical Systems, IFAC BMS 2012, Aug 2012, Budapest, Hungary. pp. CDROM
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BMS_2012_JBT_nanoMRI_TB.pdf BibTex
Titre
Global sensitivity analysis and estimation of photophysical parameters from in vivo data in photodynamic therapy
Auteurs
Simona Dobre; Jean-Baptiste Tylcz; Thierry Bastogne; Muriel Barberi-Heyob
Détail
Michel Kinnaert. 16th IFAC Symposium on System Identification, SYSID'2012, Jul 2012, Bruxelles, Belgium. IFAC, pp. 1731-1736
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BibTex
Titre
Méthodologie de Création d'un Indice de Défaveur Contextuelle - Un Outil Permettant l'Analyse des Inégalités Sociales de Santé
Auteurs
Benoît Lalloué; Jean-Marie Monnez; Cindy Padilla; Denis Zmirou-Navier; Séverine Deguen
Détail
SFDS - 44èmes journées de Statistique - 2012, May 2012, Bruxelles, Belgium. pp. Submission_44
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submission_44.pdf BibTex
Titre
Analyse canonique généralisée de données séquentielles d'espérance fixe ou variable dans le temps
Auteurs
Romain Bar; Jean-Marie Monnez
Détail
SFDS - 44èmes journées de Statistique - 2012, May 2012, Bruxelles, Belgium.
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submission163_2_.pdf BibTex

Autres publications

Titre
Persistent random walks, variable length Markov chains and piecewise deterministic Markov processes
Auteurs
Peggy Cenac; Brigitte Chauvin; Samuel Herrmann; Pierre Vallois
Détail
Jul. 2012. Submitted for publication
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cchv.pdf BibTex

Rapports

Titre
Smoothness of the density for solutions to Gaussian Rough Differential Equations
Auteurs
Thomas Cass; Martin Hairer; Christian Litterer; Samy Tindel url
Détail
[Report], 2012
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Hoermander13.pdf Hoermander13.ps BibTex

Documents sans référence de publication

Titre
Approximation of stationary solutions to SDEs driven by multiplicative fractional noise
Auteurs
Serge Cohen; Fabien Panloup; Samy Tindel url
Détail
Nov. 2012
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cohen_panloup_tindel.ps cohen_panloup_tindel.pdf BibTex
Titre
Analyse Canonique Généralisée de données séquentielles
Auteurs
Romain Bar; Jean-Marie Monnez
Détail
May. 2012
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sfds_2012_resume.pdf BibTex

2011

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Multinomial model-based formulations of TCP and NTCP for radiotherapy treatment planning
Auteurs
Roukaya Keinj; Thierry Bastogne; Pierre Vallois
Détail
Journal of Theoretical Biology, 2011, 279 (1), pp. 55-62
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JTB-2010.pdf BibTex
Titre
The rough path associated to the multidimensional analytic fbm with any Hurst parameter
Auteurs
Samy Tindel; Jérémie Unterberger
Détail
Collectanea Mathematica, 2011, 62 (2), pp. 197-223
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analytic-fbm2.pdf analytic-fbm2.ps BibTex
Titre
A construction of the rough path above fractional Brownian motion using Volterra's representation
Auteurs
David Nualart; Samy Tindel
Détail
Annals of Probability, 2011, 39 (3), pp. 1061-1096
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volumes8.pdf volumes8.ps BibTex
Titre
Multi-operator Scaling Random Fields
Auteurs
Hermine Biermé; Céline Lacaux; Hans-Peter Scheffler
Détail
Stochastic Processes and their Applications, 2011, 121 (11), pp. 2642-2677
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MultiOSpreprint.pdf BibTex
Titre
Discriminant analyses of peanut allergy severity scores
Auteurs
Olivier Collignon; Jean-Marie Monnez; Pierre Vallois; F. Codreanu; J.-M. Renaudin; Gisèle Kanny; Marie Brulliard; Bernard Bihain; Sandrine Jacquenet; Denise-Anne Moneret-Vautrin
Détail
Journal of Applied Statistics, 2011, 38 (9), pp. 1783-1799
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ARTICLE.ARACHIDE.prA_publi_IECN.10.pdf BibTex
Titre
A novel immunoassay using recombinant allergens simplifies peanut allergy diagnosis
Auteurs
Pierre Vallois; Jean-Marie Monnez
Détail
International Archives of Allergy and Immunology, 2011, 154, pp. 216-226
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BibTex
Titre
A characterization of Kummer, gamma and beta distributions via Matsumoto-Yor property
Auteurs
Pierre Vallois
Détail
Electronic Journal of Probability, 2011, -
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BibTex

Communications avec actes

Titre
A stochastic model of the cell and tumor lifespans in radiotherapy
Auteurs
Thierry Bastogne url; Roukaya Keinj; Pierre Vallois
Détail
18th IFAC World Congress, IFAC WC'2011, Aug 2011, Milan, Italy. pp. CDROM
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ifacWC_2011_TB2_HAL.pdf BibTex
Titre
Contributions of experiment designs in photodynamic therapy: photosensitizer design, treatment analysis and optimization.
Auteurs
Thierry Bastogne; Loraine Tirand; Julien Gravier; Denise Bechet; Vincent Morosini; Marlène Pernot; Céline Frochot; Alain Richard; François Guillemin; Muriel Barberi-Heyob
Détail
13th World Congress of the International Photodynamic Association, IPA 2011, May 2011, Innsbruck, Austria. pp. CDROM
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IPA_WC_2011_v5.pdf BibTex

Rapports

Titre
A least square-type procedure for parameter estimation in stochastic differential equations with additive fractional noise
Auteurs
Andreas Neuenkirch; Samy Tindel
Détail
[Report], 2011
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zero-squares-nt.ps zero-squares-nt.pdf BibTex
Titre
Upper bounds for the density of solutions of stochastic differential equations driven by fractional Brownian motions
Auteurs
Fabrice Baudoin; Cheng Ouyang; Samy Tindel
Détail
[Report], 2011
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Gauss-bounds-fbm9.ps Gauss-bounds-fbm9.pdf BibTex
Titre
LAN property for some fractional type Brownian motion
Auteurs
Serge Cohen; Fabrice Gamboa; Céline Lacaux; Jean-Michel Loubes
Détail
[Report], 2011
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LAN_Final_2011.pdf BibTex
Titre
Smooth density for some nilpotent rough differential equations
Auteurs
Yaozhong Hu; Samy Tindel
Détail
[Report], 2011
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h-t-norris8.ps h-t-norris8.pdf BibTex
Titre
On inference for fractional differential equations
Auteurs
Alexandra Chronopoulou; Samy Tindel
Détail
[Report], 2011
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estim-fbm11-hal.ps estim-fbm11-hal.pdf BibTex

Thèses

Titre
Modélisation de la croissance d'une tumeur après traitement par radiothérapie
Auteurs
Roukaya Keinj
Détail
Université Henri Poincaré - Nancy I, Dec. 2011. French
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phd-RK.pdf BibTex

Documents sans référence de publication

Titre
A stochastic model for bacteriophage therapies
Auteurs
Xavier Bardina; David Bascompte; Carles Rovira; Samy Tindel
Détail
Sep. 2011. 17 pages, 2 figures.
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fags8.ps fags8.pdf BibTex
Titre
Uniform law of the logarithm for the conditional distribution function and application to certainty bands
Auteurs
Sandie Ferrigno; Myriam Maumy-Bertrand; Aurélie Muller
Détail
Jul. 2011
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MMS1.pdf BibTex
Titre
An Omnibus Test of Goodness-of-fit for Conditional Distribution Functions with Applications to Regression Models
Auteurs
Gilles Ducharme; Sandie Ferrigno
Détail
Feb. 2011
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Omnibus_Gofit_H10.pdf BibTex
Titre
On locally self-similar fractional random fields indexed by a manifold
Auteurs
Jacques Istas; Céline Lacaux
Détail
2011
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IL-LASS.pdf BibTex
Titre
On Stratonovich and Skorohod stochastic calculus for Gaussian processes
Auteurs
Yaozhong Hu; Maria Jolis; Samy Tindel
Détail
2011. 43 pages
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sko-rough14.pdf sko-rough14.ps BibTex
Titre
From invariance principles to a class of multifractional fields related to fractional sheets
Auteurs
Céline Lacaux; Renaud Marty
Détail
2011, MAP5 2011-08
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Lacaux-Marty-2011.pdf BibTex
Titre
Malliavin calculus for fractional heat equation
Auteurs
Aurélien Deya; Samy Tindel
Détail
2011. Dedicated to David Nualart on occasion of his 60th birthday
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RHE-regu-submitted.pdf RHE-regu-submitted.ps BibTex
Titre
A fast and recursive algorithm for clustering large datasets with k-medians
Auteurs
Hervé Cardot; Peggy Cénac; Jean-Marie Monnez
Détail
2011
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ARTICLE.SEQUENTIAL.K-MEDIANSk.V3.2011.pdf BibTex

2010

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Uniform law of the logarithm for the local linear estimator of the conditional distribution function
Auteurs
Sandie FERRIGNO; Myriam Maumy-Bertrand; Aurélie Muller
Détail
Comptes Rendus de l Académie des Sciences - Series I - Mathematics, 2010, 348 (17-18), pp. 1015-1019
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CRAS-revision1.pdf BibTex
Titre
Weak approximation of a fractional SDE
Auteurs
Xavier Bardina; Ivan Nourdin; Carles Rovira; Samy Tindel
Détail
Stochastic Processes and their Applications, 2010, 120 (1), pp. 39-65
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weak.pdf weak.ps BibTex
Titre
From persistent random walks to the telegraph noise
Auteurs
Samuel Herrmann; Pierre Vallois
Détail
Stochastics and Dynamics, 2010, 10 (2), pp. 161-196
Accès au texte intégral et bibtex
persist3f.pdf persist3f.ps BibTex
Titre
Discretizing the fractional Levy area
Auteurs
Andreas Neuenkirch; Samy Tindel; Jérémie Unterberger
Détail
Stochastic Processes and their Applications, 2010, 120, pp. 223-254
Accès au texte intégral et bibtex
fla-euler12.pdf fla-euler12.ps BibTex
Titre
Rough evolution equations
Auteurs
Massimiliano Gubinelli; Samy Tindel
Détail
Annals of Probability, 2010, 38, pp. 1-75
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BibTex
Titre
Phenomenological modeling of tumor diameter growth based on a mixed effects model
Auteurs
Thierry Bastogne; Adeline Samson; Pierre Vallois; Sophie Mézières-Wantz; Sophie Pinel; Denise Bechet; Muriel Barberi-Heyob
Détail
Journal of Theoretical Biology, 2010, 262 (3), pp. 544-552
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JTB_09_v27.pdf BibTex
Titre
Stationary measures for self-stabilizing processes: asymptotic analysis in the small noise limit
Auteurs
Samuel Herrmann; Julian Tugaut
Détail
Electronic Journal of Probability, 2010, 15, pp. 2087-2116
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Convergence-final.pdf BibTex

Communications avec actes

Titre
Identifiability and sensitivity analysis of a Photodynamic Therapy model
Auteurs
Simona Dobre; Thierry Bastogne; Muriel Barberi-Heyob; Alain Richard
Détail
6th International Conference on Sensitivity Analysis of Model Output, SAMO 2010, Jul 2010, Milan, Italy. pp. CDROM
Accès au texte intégral et bibtex
SAMO2010VF_HAL.pdf BibTex
Titre
A multinomial model of tumor growth treated by radiotherapy
Auteurs
Roukaya Keinj; Thierry Bastogne; Pierre Vallois
Détail
11th IFAC Symposium on Computer Applications in Biotechnology, CAB 2010, Jul 2010, Leuven, Belgium. FrPostersT3.7
Accès au texte intégral et bibtex
cab2010_v25.pdf BibTex
Titre
ACP projetée de données séquentielles
Auteurs
Jean-Marie Monnez
Détail
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France.
Accès au texte intégral et bibtex
p55.pdf BibTex
Titre
Tests multiples pour la comparaison des probabilités de survenue d'une infidélité de transcription dans des ARNm sains et cancéreux
Auteurs
Olivier Collignon; Marie Brulliard; Jean-Marie Monnez; Pierre Vallois; Benoit Thouvenot; Sandrine Jacquenet; Virginie Ogier; Olivier Roitel
Détail
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France.
Accès au texte intégral et bibtex
p74.pdf BibTex

Documents sans référence de publication

Titre
A Milstein-type scheme without Levy area terms for SDEs driven by fractional Brownian motion
Auteurs
Aurélien Deya; Andreas Neuenkirch; Samy Tindel
Détail
2010
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approx-scheme-10.pdf approx-scheme-10.ps BibTex
Titre
Pathwise definition of second order SDEs
Auteurs
Lluis Quer-Sardanyons; Samy Tindel
Détail
2010
Accès au texte intégral et bibtex
elliptic15.pdf elliptic15.ps BibTex
Titre
Independence properties of the Matsumoto-Yor type
Auteurs
Angelo Efoévi Koudou; Pierre Vallois
Détail
2010, Prépublication IECN 2010/25. 27 pages
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2010-25.pdf BibTex

2009

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Uncertainties of extreme rainfall quantiles estimated by a stochastic rainfall model and by a Generalized Pareto Distribution
Auteurs
Aurélie Muller; Patrick Arnaud; Michel Lang; Jacques Lavabre
Détail
Hydrological Sciences Journal, 2009, 54 (3), pp. 417-429
Accès au bibtex
BibTex
Titre
Penalisations of multidimensional Brownian motion, VI
Auteurs
Bernard Roynette; Pierre Vallois; Marc Yor
Détail
ESAIM: Probability and Statistics, 2009, 13, pp. 152-180
Accès au texte intégral et bibtex
penal-multi-VI-dec07.pdf BibTex

Communications avec actes

Titre
System identification of tumor growth described by a mixed effects model
Auteurs
Thierry Bastogne; Adeline Samson; Sophie Mézières-Wantz; Pierre Vallois; Sophie Pinel; Muriel Barberi-Heyob
Détail
15th IFAC Symposium on System Identification, SYSID 2009, Jul 2009, Saint-Malo, France. pp. CDROM
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sysid09_tumorgrowth_v22_HAL.pdf BibTex

Documents sans référence de publication

Titre
Convergence and performances of the peeling wavelet denoising algorithm
Auteurs
Céline Lacaux; Aurélie Muller; Radu Ranta; Samy Tindel
Détail
Nov. 2009. 20 pages
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LMRT-Peeling-Denoising09.pdf LMRT-Peeling-Denoising09.ps BibTex

2008

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre
Bayesian comparison of different rainfall depth-duration-frequency relationships
Auteurs
Aurélie Muller; Jean-Noël Bacro; Michel Lang
Détail
Stochastic Environmental Research and Risk Assessment, 2008, 22 (1), pp. 33-46
Accès au texte intégral et bibtex
articleMullerBacroLang.pdf BibTex
Titre
Volatility Estimators and the Inverse Range Process in a Random Volatility Random Walk and Wiener Processes
Auteurs
Pierre Vallois; Charles Tapiero
Détail
Physica A: Statistical Mechanics and its Applications, 2008, 387 (11), pp. 2565-2574
Accès au texte intégral et bibtex
Final_Range_Volatility_Rev_nov07.pdf BibTex

Documents sans référence de publication

Titre
Modélisation de réactions chimiques dans les réseaux de gènes. Problème de convergence de processus markoviens vers un processus déterministe par morceaux.
Auteurs
Aurélie Muller
Détail
Jan. 2008
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ActesBiostat.pdf BibTex