Equipe de recherche ASCLEPIOS

Publications de l'équipe ASCLEPIOS

2012

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Voxel-based quantitative analysis of brain images from F-18 Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography with a Block-Matching algorithm for spatial normalization
Auteurs: Christophe Person; Valérie Louis-Dorr; Sylvain Poussier; Olivier Commowick; Grégoire Malandain; Louis Maillard; Didier Wolf; Nicolas Gilet; Véronique Roch; Gilles Karcher; Pierre-Yves Marie
Détail: Clinical Nuclear Medicine, 2012, 37 (3), pp. 268-273
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Titre: Using spatial prior knowledge in the spectral fitting of MRS images
Auteurs: B. Michael Kelm; Frederik O. Kaster; A. Henning; Marc-André Weber; P. Bachert; P. Boesiger; Fred A. Hamprecht; Bjoern H. Menze
Détail: NMR in Biomedicine, Wiley, 2012, 25 (1), pp. 1-13
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Communications avec actes

Titre: Current-based 4D shape analysis for the mechanical personalization of heart models
Auteurs: Loic Le Folgoc; Hervé Delingette; Antonio Criminisi; Nicholas Ayache
Détail: Menze, Bjoern and Langs, Georg and Montillo, Albert and Tu, Zhuowen and Criminisi, Antonio. MCV - MICCAI Workshop on Medical Computer Vision - 2012, Oct 2012, Nice, France. Springer
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Titre: Towards Real-Time Computation of Cardiac Electrophysiology for Training Simulator
Auteurs: Hugo Talbot ; Christian Duriez; Hadrien Courtecuisse ; Jatin Relan; Maxime Sermesant; Stéphane Cotin ; Hervé Delingette
Détail: Statistical Atlases and Computational Models of the Heart - STACOM 2012 in the 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France. Springer, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Simulated breath-hold reconstruction in micro-SPECT: application to peritoneal metastases expressing NIS as reporter gene
Auteurs: Marine Breuilly; Grégoire Malandain; Nicholas Ayache; Jacques Darcourt; Thierry Pourcher; Philippe Franken
Détail: 2012 SNM Annual Meeting, Jun 2012, Miami Beach, United States.
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Titre: PRISE EN COMPTE DU MOUVEMENT RESPIRATOIRE DU PETIT ANIMAL POUR LA RECONSTRUCTION 3D TEMP SYNCHRONISEE: APPLICATION AUX METASTASES PERITONEALES
Auteurs: Marine Breuilly; Grégoire Malandain; Jacques Darcourt; Thierry Pourcher; Philippe Franken
Détail: 50ème Colloque de Médecine Nucléaire de Langue Française, Apr 2012, Montpellier, France.
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Titre: Sparsity and Scale: Compact Representations of Deformation for Diffeomorphic Registration
Auteurs: Stefan Sommer; Mads Nielsen; Xavier Pennec
Détail: IEEE Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis (MMBIA 2012), Jan 2012, Breckenridge, Colorado, United States.
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Communications sans actes

Titre: Interactive Electromechanical Model of the Heart for Patient-Specific Therapy Planning and Training using SOFA
Auteurs: Hugo Talbot ; Stéphanie Marchesseau; Christian Duriez; Hadrien Courtecuisse ; Jatin Relan; Maxime Sermesant; Stéphane Cotin ; Hervé Delingette
Détail: VPH 2012, Sep 2012, Londres, United Kingdom.
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Titre: Simulated breath-hold reconstruction in micro-SPECT: application to peritoneal metastases expressing NIS as reporter gene
Auteurs: Marine Breuilly; Grégoire Malandain; Nicholas Ayache; Jacques Darcourt; Thierry Pourcher; Philippe Franken
Détail: MIBO - second Molecular Imaging in Biology and Oncology (MIBO) workshop - 2012, Jan 2012, Nice, France.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: SOFA: A Multi-Model Framework for Interactive Physical Simulation
Auteurs: François Faure ; Christian Duriez ; Hervé Delingette ; Jérémie Allard ; Benjamin Gilles; Stéphanie Marchesseau; Hugo Talbot ; Hadrien Courtecuisse ; Guillaume Bousquet; Igor Peterlik ; Stéphane Cotin
Détail: Yohan Payan. Soft Tissue Biomechanical Modeling for Computer Assisted Surgery, Springer, Jun. 2012, 978-3-642-29013-8
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Titre: Exponential Barycenters of the Canonical Cartan Connection and Invariant Means on Lie Groups
Auteurs: Xavier Pennec ; Vincent Arsigny
Détail: Frederic Barbaresco and Amit Mishra and Frank Nielsen. Matrix Information Geometry, Springer, May. 2012, 978-3-642-30231-2
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Ouvrages scientifiques

Titre: Biomedical Image Analysis: Methodologies And Applications
Auteurs: Nikolaos Paragios; James Duncan; Nicholas Ayache
Détail: Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Springer, 2012, 978-0-387-09748-0
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2011

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Evaluation of registration methods on thoracic CT: the EMPIRE10 challenge.
Auteurs: Keelin Murphy; Bram Van Ginneken; Joseph Reinhardt; Sven Kabus; Kai Ding; Xiang Deng; Kunlin Cao; Kaifang Du; Gary Christensen; Vincent Garcia; Tom Vercauteren; Nicholas Ayache; Olivier Commowick; Grégoire Malandain; Ben Glocker; Nikolaos Paragios; Nassir Navab; Vladlena Gorbunova; Jon Sporring; Marleen De Bruijne; Xiao Han; Mattias Heinrich; Julia Schnabel; Mark Jenkinson; Cristian Lorenz; Marc Modat; Jamie Mcclelland; Sébastien Ourselin; Sacha Muenzing; Max Viergever; Dante De Nigris; Louis Collins; Tal Arbel; Marta Peroni; Rui Li; Gregory Sharp; Alexander Schmidt-Richberg; Jan Ehrhardt; René Werner; Dirk Smeets; Dirk Loeckx; Gang Song; Nicholas Tustison; Brian Avants; James Gee; Marius Staring; Stefan Klein; Berend Stoel; Martin Urschler; Manuel Werlberger; Jef Vandemeulebroucke; Simon Rit; David Sarrut; Josien Pluim
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30 (11), pp. 1901-20
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Titre: Registration, Atlas Estimation and Variability Analysis of White Matter Fiber Bundles Modeled as Currents
Auteurs: Stanley Durrleman; Pierre Fillard; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache
Détail: NeuroImage, elsevier, 2011, 55 (3), pp. 1073-1090
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Titre: Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
Auteurs: Pierre Fillard; Xavier Pennec; Paul Thompson; Nicholas Ayache
Détail: NeuroImage, undefined or unknown publisher, 2011
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Titre: A Multi-Front Eikonal Model of Cardiac Electrophysiology for Interactive Simulation of Radio-Frequency Ablation
Auteurs: Erik Pernod; Maxime Sermesant; Ender Konukoglu; Jatin Relan; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Computers and Graphics, undefined or unknown publisher, 2011, 35, pp. 431-440
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Titre: Modeling and Registration for Electrophysiology Procedures Based on Three-Dimensional Imaging
Auteurs: Kawal Rhode; Maxime Sermesant
Détail: Current Cardiovascular Imaging Reports, undefined or unknown publisher, 2011, 4, pp. 116-126
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Titre: Personalization of Cardiac Motion and Contractility from Images using Variational Data Assimilation
Auteurs: Hervé Delingette; Florence Billet; Ken C.L. Wong; Maxime Sermesant; Kawal Rhode; Matt Ginks; C.A. Rinaldi; Reza Razavi; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, undefined or unknown publisher, 2011
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Titre: Personalisation of a Cardiac Electrophysiology Model using Optical Mapping and MRI for Prediction of Changes with Pacing
Auteurs: Jatin Relan; Mihaela Pop; Hervé Delingette; Graham Wright; Nicholas Ayache; Maxime Sermesant
Détail: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, undefined or unknown publisher, 2011
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Titre: A Statistical Model for Quantification and Prediction of Cardiac Remodelling: Application to Tetralogy of Fallot
Auteurs: Tommaso Mansi; Ingmar Voigt; Benedetta Leonardi; Xavier Pennec; Stanley Durrleman; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Andrew Taylor; Younes Boudjemline; Giacomo Pongiglione; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Images, undefined or unknown publisher, 2011
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Titre: DENTALMAPS: Automatic Dental Delineation for Radiotherapy Planning in Head and Neck Cancer
Auteurs: Juliette Thariat; Liliane Ramus; Philippe Maingon; Guillaume Odin; Vincent Grégoire; Vincent Darcourt; Pierre-Yves Marcy; Nicolas Guevara; Marie-Helene Orlanducci; Serge Marcie; Gilles Poissonnet; Alex Bozec; Olivier Dassonville; François Demard; Laurent Castillo; José Santini; Grégoire Malandain
Détail: International Journal of Radiation Oncology*Biology*Physics / International Journal of Radiation Oncology Biology Physics; International Journal of Radiation Oncology Biology & Physics, undefined or unknown publisher, 2011
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Titre: iLogDemons: A Demons-Based Registration Algorithm for Tracking Incompressible Elastic Biological Tissues
Auteurs: Tommaso Mansi; Xavier Pennec; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: International Journal of Computer Vision, Springer, 2011, 92 (1), pp. 92-111
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Titre: Coupled Personalization of Cardiac Electrophysiology Models for Prediction of Ischaemic Ventricular Tachycardia
Auteurs: Jatin Relan; Phani Chinchapatnam; Maxime Sermesant; Kawal Rhode; Matt Ginks; Hervé Delingette; Aldo C. Rinaldi; Reza Razavi; Nicholas Ayache
Détail: Journal of the Royal Society Interface Focus, Royal Society publishing, 2011, 1 (3), pp. 396-407
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Titre: euHeart: Personalized and integrated cardiac care using patient-specific cardiovascular modelling
Auteurs: Nic Smith; A. De Vecchi; M. McCormick; D. Nordsletten; Oscar Camara; Alejandro Frangi; Hervé Delingette; Maxime Sermesant; Jatin Relan; Nicholas Ayache; M.W. Krueger; W. Schulze; Rod Hose; I. Valverde; P. Beerbaum; C. Staicu; M. Siebes; J. Spaan; Peter Hunter; J. Weese; H. Lehmann; Dominique Chapelle; Reza Razavi
Détail: Journal of the Royal Society Interface Focus, Royal Society Publishing, 2011, 1 (3), pp. 349-364
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Titre: A Smart Atlas for Endomicroscopy using Automated Video Retrieval
Auteurs: Barbara André; Tom Vercauteren; Anna M. Buchner; Michael B. Wallace; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2011, 15 (4), pp. 460-476
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Titre: Patient-Specific Electromechanical Models of the Heart for Prediction of the Acute Effects of Pacing in CRT: a First Validation
Auteurs: Maxime Sermesant; Radomir Chabiniok; Phani Chinchapatnam; Tommaso Mansi; Florence Billet; Philippe Moireau; Jean-Marc Peyrat; Ken C.L. Wong; Jatin Relan; Kawal Rhode; Matt Ginks; Pier Lambiase; Hervé Delingette; Michel Sorine; C.A. Rinaldi; Dominique Chapelle; Reza Razavi; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Analysis, Elsevier, 2011
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Titre: Vers un patient numérique personnalisé pour le diagnostic et la thérapie guidés par l'image
Auteurs: Nicholas Ayache; Olivier Clatz; Hervé Delingette; Grégoire Malandain; Xavier Pennec; Maxime Sermesant
Détail: Médecine / Sciences, EDK France, 2011, 27, pp. 208-213
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Titre: Spatial Decision Forests for MS Lesion Segmentation in Multi-Channel Magnetic Resonance Images
Auteurs: Ezequiel Geremia; Olivier Clatz; Bjoern H. Menze; Ender Konukoglu; Antonio Criminisi; Nicholas Ayache
Détail: NeuroImage, Elsevier, 2011
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Titre: Detecting stable distributed patterns of brain activation using Gini contrast
Auteurs: Georg Langs; Bjoern H. Menze; Danial Lashkari; Polina Golland
Détail: NeuroImage, Elsevier, 2011, 56, pp. 497-507
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Titre: A New Metric for Detecting Change in Slowly Evolving Brain Tumors: Validation in Meningioma Patients
Auteurs: Kilian M. Pohl; Ender Konukoglu; Sébastien Novellas; Nicholas Ayache; Andriy Fedorov; Ion-Florin Talos; Alexandra Golby; William M. Wells; Ron Kikinis; Peter Black
Détail: Neurosurgery, Lippincott, Williams & Wilkins, 2011, 68(1 Suppl Operative), pp. 225-33
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Titre: Inter-Model Consistency and Complementarity: Learning from ex-vivo Imaging and Electrophysiological Data towards an Integrated Understanding of Cardiac Physiology
Auteurs: Oscar Camara; Maxime Sermesant; P. Lamata; L. Wang; Mihaela Pop; Jatin Relan; M. De Craene; Hervé Delingette; H. Liu; S. Niederer; A. Pashaei; G. Plank; D. Romero; R. Sebastian; Ken C.L. Wong; H. Zhang; Nicholas Ayache; Alejandro Frangi; P. Shi; Nic Smith; Graham Wright
Détail: Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2011, Experimental and Computational Model Interactions in Bio-Research: State of the Art, 107 (1), pp. 122-133
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Titre: Efficient Probabilistic Model Personalization Integrating Uncertainty on Data and Parameters: Application to Eikonal-Diffusion Models in Cardiac Electrophysiology
Auteurs: Ender Konukoglu; Jatin Relan; U. Cilingir; Bjoern H. Menze; Phani Chinchapatnam; A.S. Jadidi; H. Cochet; M. Hocini; Hervé Delingette; P. JaÏs; M. Haïssaguerre; Nicholas Ayache; Maxime Sermesant
Détail: Progress in Biophysics and Molecular Biology, Elsevier, 2011, 107 (1), pp. 134-146
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Titre: Comparison of statistical models performance in case of segmentation using a small amount of training datasets
Auteurs: François Chung; Jérôme Schmid; Nadia Magnenat-Thalmann; Hervé Delingette
Détail: Visual Computer, undefined or unknown publisher, 2011, 27 (2), pp. 141-151
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Titre: Subject-specific knee joint model: Design of an experiment to validate a multi-body finite element model
Auteurs: C. Öhman; D.M. Espino; Tobias Heimann; M. Baleani; Hervé Delingette; Marco Viceconti
Détail: Visual Computer, springer, 2011, 27, pp. 153-159
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Communications avec actes

Titre: Geodesics, Parallel Transport & One-parameter Subgroups for Diffeomorphic Image Registration
Auteurs: Marco Lorenzi; Xavier Pennec
Détail: Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads. Third International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability, Sep 2011, Toronto, Canada. pp. 64-74
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Titre: Kernel Bundle EPDiff: Evolution Equations for Multi-Scale Diffeomorphic Image Registration
Auteurs: Stefan Sommer; François Lauze; Mads Nielsen; Xavier Pennec
Détail: Bruckstein, A.M. and ter Haar Romeny, B. and Bronstein, A.M. and Bronstein, M.M.. Scale Space and Variational Methods in Computer Vision, May 2011, Ein-Gedi, Israel. Springer, Scale Space and Variational Methods in Computer Vision Scale Space and Variational Methods in Computer Vision - Third International Conference, SSVM 2011, 6667, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: A federated system for sharing and reuse of images and image processing tools in neuroimaging
Auteurs: Bernard Gibaud; Farooq Ahmad; Christian Barillot; Franck Michel; Bacem Wali; Bénédicte Batrancourt; Michel Dojat; Pascal Girard; Alban Gaignard; Diane Lingrand; Johan Montagnat; Javier Rojas Balderrama; Grégoire Malandain; Xavier Pennec; David Godard; Gilles Kassel; Mélanie Pélégrini-Issac
Détail: in Proceedings of the Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS'11), Jun 2011, Berlin, Germany. pp. 0-0
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Titre: De l'imagerie médicale à la modélisation numérique personnalisée du corps humain
Auteurs: Hervé Delingette
Détail: 10e colloque national en calcul des structures, May 2011, Giens, France. pp. Clé USB
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Titre: Layered spatio-temporal forests for left ventricle segmentation from 4D cardiac MRI data
Auteurs: Jan Margeta; Ezequiel Geremia; Antonio Criminisi; Nicholas Ayache
Détail: STACOM Workshop at MICCAI 2011, 2011, Toronto, Canada. Springer
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Titre: Retrieval evaluation and distance learning from perceived similarity between endomicroscopy videos
Auteurs: Barbara André; Tom Vercauteren; Anna Buchner; Michael Wallace; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2011, 2011, Toronto, Canada.
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Titre: Monitoring the brain's longitudinal changes in clinical trials for Alzheimers disease: a robust and reliable non-rigid registration framework
Auteurs: Marco Lorenzi; Xavier Pennec; Giovanni Frisoni
Détail: Alzheimer's Association 2011 International Conference on Alzheimer's Disease (AAICAD), 2011, Paris, France.
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Titre: Which parallel transport for the statistical analysis of longitudinal deformations?
Auteurs: Xavier Pennec; Marco Lorenzi
Détail: Colloque GRETSI '11, 2011, Bordeaux, France.
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Titre: A 3D MRI-Based Cardiac Computer Model to Study Arrhythmia and Its In-vivo Experimental Validation
Auteurs: Mihaela Pop; Maxime Sermesant; Jean-Marc Peyrat; Eugene Crystal; Sudip Ghate; Tommaso Mansi; Ilan Lashevsky; Beiping Qiang; Elliot Mcveigh; Nicholas Ayache; Graham Wright
Détail: Dimitris N. Metaxas and Leon Axel. FIMH 2011- Sixth International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart., May 2011, New-York, United States. springer, Functional Imaging and Modeling of the Heart 6th International Conference, FIMH 2011, New York City, NY, USA, May 25-27, 2011. Proceedings, 6666, pp. 195-205, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Ventricular Scar At Cardiac CT Correlates To Critical Isthmuses Of Ventricular Tachycardia Circuits And Sites Of Slow Conduction During Sinus Rhythm - Evidence For Clinical Use Of CT Integration Into 3D Mapping Systems
Auteurs: Hubert Cochet; Amir S. Jadidi; Frédéric Sacher; Nicolas Derval; Maxime Sermesant; Jatin Relan; Steven J. Kim; Pierre Bordachar; Philippe Ritter; Meleze Hocini; Michel Montaudon; François Laurent; Nicholas Ayache; Michel Haïssaguerre; Pierre Jais
Détail: Heart Rhythm Society '11, May 2011, San Francisco, CA, United States.
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Titre: Ventricular Scar imaging at MRI Correlates to Critical Isthmuses of Ventricular Tachycardia Circuits and Sites of Slow Conduction during Sinus Rhythm - Utility of integrating MR-data into 3D Mapping Systems
Auteurs: Amir S. Jadidi; Hubert Cochet; Frédéric Sacher; Steven J. Kim; Maxime Sermesant; Jatin Relan; Nicolas Derval; Shinsuke Miyazaki; Ashok Shah; Daniel Scherr; Steven B. Wilton; Patrizio Pascale; Laurent Roten; Michala Pederson; Sebastien Knecht; Pierre Bordachar; Philippe Ritter; Meleze Hocini; Michel Montaudon; François Laurent; Nicholas Ayache; Michel Haïssaguerre; Pierre Jais
Détail: Heart Rhythm Society '11, May 2011, San Francisco, CA, United States.
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Titre: Statistical Analysis of the Human Cardiac Fiber Architecture from DT-MRI
Auteurs: Hervé Lombaert; Jean-Marc Peyrat; Pierre Croisille; Stanislas Rapacchi; Laurent Fanton; Patrick Clarysse; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Axel, Leon and Metaxas, Dimitris. FIMH - Sixth International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart - 2011, May 2011, New York City, NY, United States. Springer, Functional Imaging and Modeling of the Heart, 6666, pp. 171-179, Lecture Notes in Computer Science - LNCS
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Titre: A Multi-scale Kernel Bundle for LDDMM: Towards Sparse Deformation Description Across Space and Scales
Auteurs: Stefan Sommer; François Lauze; Mads Nielsen; Xavier Pennec
Détail: Szekely, Gabor and Hahn, Horst. IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. Springer, Information Processing in Medical Imaging, 6801, pp. 624-635, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Schilds Ladder for the parallel transport of deformations in time series of images
Auteurs: Marco Lorenzi; Nicholas Ayache; Xavier Pennec
Détail: Szekely, G. and Hahn, H.. IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. Springer, Information Processing in Medical Imaging, 6801, pp. 463-474, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: A Generative Approach for Image-Based Modeling of Tumor Growth
Auteurs: Bjoern H. Menze; Koen Van Leemput; Antti Honkela; Ender Konukoglu; Marc-André Weber; Nicholas Ayache; Polina Golland
Détail: Szekely, G. and Hahn, H.. IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. Springer, Information Processing in Medical Imaging, 6801, pp. 735-747, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Human Statistical Atlas of Cardiac Fiber Architecture from DT-MRI
Auteurs: Hervé Lombaert; Jean-Marc Peyrat; Stanislas Rapacchi; Laurent Fanton; Hervé Delingette; Nicholas Ayache; Pierre Croisille
Détail: Proceedings of International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM) 2011, May 2011, Montréal, Québec, Canada. 19, pp. 280
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Titre: Mapping the effects of Ab142 levels on the longitudinal changes in healthy aging: hierarchical modeling based on stationary velocity filds.
Auteurs: Marco Lorenzi; Nicholas Ayache; Giovanni Frisoni; Xavier Pennec
Détail: Fichtinger, Gabor and Martel, Anne and Peters, Terry. Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2011, Toronto, Canada. Springer, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2011, 6892, pp. 663-670, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Synthetic Echocardiographic Image Sequences for Cardiac Inverse Electro-Kinematic Learning
Auteurs: Adityo Prakosa; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Eric Saloux; Pascal Allain; Pascal Cathier; Patrick Etyngier; Nicolas Villain; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), 2011, Toronto, Canada, Canada. Springer, Heidelberg, 8p, LNCS
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Titre: Geometry-Aware Multiscale Image Registration Via OBBTree-Based Polyaffine Log-Demons
Auteurs: Christof Seiler; Xavier Pennec; Mauricio Reyes Aguirre
Détail: Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2011 (MICCAI), 2011, no address, Canada. Springer, Heidelberg, LNCS
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Titre: Femur Specific Polyaffine Model to Regularize the Log-Domain Demons Registration
Auteurs: Christof Seiler; Xavier Pennec; Lucas Ritacco; Mauricio Reyes Aguirre
Détail: Dawant, Benoit M. and Haynor, David R.. Proceedings of SPIE Medical Imaging '11, 2011, Lake Buena Vista, Floride, United States. SPIE Publishing, Medical Imaging 2011: Image Processing, 7962, Paper 7962-15
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Model-based segmentation
Auteurs: Tobias Heimann; Hervé Delingette
Détail: Deserno, Thomas Martin. Biomedical Image Processing, Springer, pp. 279-303, 2011, 978-3-642-15815-5
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Titre: Statistical Computing On Non-Linear Spaces For Computational Anatomy
Auteurs: Xavier Pennec; Pierre Fillard
Détail: Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Biomedical Image Analysis: Methodologies And Applications, Springer, 2011
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Titre: Joint T1 and Brain Fiber Diffeomorphic Registration Using the Demons
Auteurs: Viviana Siless; Pamela Guevara; Xavier Pennec; Pierre Fillard
Détail: Liu, Tianming and Shen, Dinggang and Ibanez, Luis and Tao, Xiaodong. Multimodal Brain Image Analysis, 7012, Springer Berlin / Heidelberg, pp. 10-18, 2011, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-642-24445-2
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Rapports

Titre: Learning Semantic and Visual Similarity for Endomicroscopy Video Retrieval
Auteurs: Barbara André; Tom Vercauteren; Anna Buchner; Michael Wallace; Nicholas Ayache
Détail: [Research Report], 2011. RR-7722
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Thèses

Titre: Atlas intelligent pour guider le diagnostic en endomicroscopie : une application clinique de la reconnaissance d'images par le contenu
Auteurs: Barbara André
Détail: Informatique temps réel, robotique et automatique. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, Oct. 2011. English
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Titre: Modélisation de l'apparence de régions pour la segmentation d'images basée modèle
Auteurs: François Chung
Détail: Informatique temps - réel, robotique, automatique. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, Jan. 2011. English
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2010

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Imaging plant growth in 4D : robust tissue reconstruction and lineaging at cell resolution.
Auteurs: R. Fernandez; Pradeep Das; V. Mirabet; E. Moscardi; Jan Traas; J.-L. Verdeil; Grégoire Malandain; Christophe Godin
Détail: Nature Methods, 2010, 7, pp. 547-553
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Titre: Multiplicative Jacobian energy decomposition method for fast porous visco-hyperelastic soft tissue model
Auteurs: Stéphanie Marchesseau; T. Heimann; S. Chatelin; R. Willinger; Hervé Delingette
Détail: Lecture notes in computer science, 2010, 6361 (1), pp. 235-242
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Titre: Fast porous visco-hyperelastic soft tissue model for surgery simulation: Application to liver surgery
Auteurs: Stéphanie Marchesseau; T. Heimann; S. Chatelin; R. Willinger; Hervé Delingette
Détail: Progress in Biophysics and Molecular Biology / Progress in Biophysics & Molecular Biology, 2010, 103 (2-3), pp. 185-196
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Titre: Le coeur numérique
Auteurs: Hervé Delingette; Maxime Sermesant
Détail: Doc Sciences, undefined or unknown publisher, 2010, 13, pp. 26-33
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Titre: Combined diffusion imaging and MR Spectroscopy in Human Prion Diseases
Auteurs: Damien Galanaud; Stéphane Haïk; Marius George Linguraru; Jean-Philippe Ranjeva; Baptiste Faucheux; Elsa Kaphan; Nicholas Ayache; Jacques Chiras; Patrick Cozzone; Didier Dormont; Jean-Philippe Brandel
Détail: American Journal of Neuroradiology, undefined or unknown publisher, 2010, 31 (7), pp. 1311-8
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Titre: Outils de contourage, utilisation et construction d'atlas anatomiques : exemples des cancers de la tete et du cou
Auteurs: Liliane Ramus; Juliette Thariat; Pierre-Yves Marcy; Yoann Pointreau; Guillaume Bera; Olivier Commowick; Grégoire Malandain
Détail: Cancer/Radiothérapie, undefined or unknown publisher, 2010, 14 (3), pp. 206-12
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Titre: A Non-Conservative Lagrangian Framework for Statistical Fluid Registration: SAFIRA
Auteurs: Caroline Brun; Natasha Leporé; Xavier Pennec; Yi-Yu Chou; Agatha Lee; Greig De Zubicaray; Katie Mcmahon; Margaret Wright; James C. Gee; Paul Thompson
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2010
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Titre: Image Guided Personalization of Reaction-Diffusion Type Tumor Growth Models Using Modified Anisotropic Eikonal Equations
Auteurs: Ender Konukoglu; Olivier Clatz; Bjoern H. Menze; Marc-André Weber; Bram Stieltjes; Emmanuel Mandonnet; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2010, 29 (1), pp. 77-95
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Titre: Registration of 4D Cardiac CT Sequences Under Trajectory Constraints With Multichannel Diffeomorphic Demons
Auteurs: Jean-Marc Peyrat; Hervé Delingette; Maxime Sermesant; Chenyang Xu; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2010, 29 (7), pp. 1351-1368
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Titre: Spherical Demons: Fast Diffeomorphic Landmark-Free Surface Registration
Auteurs: Boon Thye Thomas Yeo; Mert Sabuncu; Tom Vercauteren; Nicholas Ayache; Bruce Fischl; Polina Golland
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2010, 29 (3), pp. 650-668
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Titre: Distribution and Fibre Field Similarity Mapping of the Human Anterior Commissure Fibres by Diffusion Tensor Imaging
Auteurs: Markand D. Patel; Nicolas Toussaint; Geoffrey D. Charles-Edwards; Jean-Pierre Lin; Philip G. Batchelor
Détail: Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medecine (MAGMA), undefined or unknown publisher, 2010
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Titre: Extrapolating Glioma Invasion Margin in Brain Magnetic Resonance Images: Suggesting New Irradiation Margins
Auteurs: Ender Konukoglu; Olivier Clatz; Pierre-Yves Bondiau; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2010, 14 (2), pp. 111-125
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Titre: Sharing and reusing cardiovascular anatomical models over the Web: a step towards the implementation of the virtual physiological human project
Auteurs: D. Gianni; S. Mckeever; T. Yu; R. Britten; Hervé Delingette; Alejandro Frangi; Peter Hunter; Nic Smith
Détail: Philos Transact of the Royal Society A Mathematical Physical Engineering Sciences, undefined or unknown publisher, 2010, 368, pp. 3039-3056
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Titre: Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.
Auteurs: Franck Michel; Alban Gaignard; Farooq Ahmad; Christian Barillot; Bénédicte Batrancourt; Michel Dojat; Bernard Gibaud; Pascal Girard; David Godard; Gilles Kassel; Diane Lingrand; Grégoire Malandain; Johan Montagnat; Mélanie Pélégrini-Issac; Xavier Pennec; Javier Rojas Balderrama; Bacem Wali
Détail: Studies in health technology and informatics, 2010, 159, pp. 112-23
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Communications avec actes

Titre: Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project
Auteurs: Franck Michel ; Alban Gaignard ; Farooq Ahmad; Christian Barillot; Bénédicte Batrancourt; Michel Dojat; Bernard Gibaud; Pascal Girard; David Godard; Gilles Kassel; Diane Lingrand ; Grégoire Malandain; Johan Montagnat ; Mélanie Pélégrini-Issac; Xavier Pennec; Javier Rojas Balderrama ; Bacem Wali
Détail: HealthGrid'10, Jun 2010, Paris, France. pp. 112-123
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Titre: Atlas-Based Reduced Models of Blood Flows for Fast Patient-Specific Simulations
Auteurs: Kristin Mcleod; Alfonso Caiazzo; Miguel Angel Fernandez; Tommaso Mansi; Irene Vignon-Clementel; Maxime Sermesant; Xavier Pennec; Younes Boudjemline; Jean-Frédéric Gerbeau
Détail: STACOM, Sep 2010, Beijin, China. Springer, Statistical Atlases and Computational Models of the Heart, 6364, pp. 95-104, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Measuring the inter-species variability of endocast growth using shape regression and spatiotemporal registration
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache; José Braga
Détail: Abstracts of the 79-th annual meeting of the American Assoc. of Physical Anthropologists (AAPA), April 2010, Albuquerque, 2010, no address, United States. pp. 78-79
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Titre: Three-dimensional Prolate Spheroidal Extrapolation for Sparse DTI of the In-vivo Heart
Auteurs: Nicolas Toussaint; Christian T. Stoeck; Maxime Sermesant; Sebastian Kozerke; Philip G. Batchelor
Détail: Book of Abstracts, International Society in Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM'10), 2010, Stockholm, United Kingdom.
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Titre: Modèles numériques pour la simulation et la prédiction de la fonction cardiaque
Auteurs: Tommaso Mansi; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Xavier Pennec; Nicholas Ayache; Younes Boudjemline
Détail: Congrès de la Société Francaise de Pédiatrie et de l'Association des Pédiatres de Langue Française (APLF), 2010, no address, France.
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Titre: A Robust and Efficient Block Matching Framework for Non Linear Registration of Thoracic CT Images
Auteurs: Vincent Garcia; Olivier Commowick; Grégoire Malandain
Détail: Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China.
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Titre: Diffeomorphic demons and the EMPIRE10 challenge
Auteurs: Vincent Garcia; Tom Vercauteren; Grégoire Malandain; Nicholas Ayache
Détail: Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China.
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Titre: Multi-atlas based segmentation: Application to the head and neck region for radiotherapy planning
Auteurs: Liliane Ramus; Grégoire Malandain
Détail: MICCAI Workshop Medical Image Analysis for the Clinic - A Grand Challenge, 2010, Beijing, China, China.
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Titre: Personalisation of a 3D Cardiac Electrophysiology Model for Ventricular Myocardium using Optical Mapping and MRI
Auteurs: Jatin Relan; Mihaela Pop; Hervé Delingette; Graham Wright; Nicholas Ayache; Maxime Sermesant
Détail: MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function (STACOM) and a Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge (CESC'10), 2010, no address, Canada. Springer, 6364, LNCS
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Titre: Cardiac motion estimation using a proactive deformable model: evaluation and sensitivity analysis
Auteurs: Ken C.L. Wong; Florence Billet; Tommaso Mansi; Radomir Chabiniok; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function (STACOM) and a Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge (CESC'10), 2010, no address, China. Springer, 6364, pp. 154-163, LNCS
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Titre: An image retrieval approach to setup difficulty levels in training systems for endomicroscopy diagnosis
Auteurs: Barbara André; Tom Vercauteren; Anna M. Buchner; Muhammad Waseem Shahid; Michael B. Wallace; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'10), 2010, Beijing, China, United States. Springer, pp. 480-487, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Comparison of the endocast growth of chimpanzees and bonobos via temporal regression and spatiotemporal registration
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache; José Braga
Détail: Miccai Workshop on Spatio-Temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, 2010, Beijing, China, China.
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Titre: 4D registration of serial brain MR's images: a robust measure of changes applied to Alzheimer's disease
Auteurs: Marco Lorenzi; Nicholas Ayache; Giovanni Frisoni; Xavier Pennec
Détail: Miccai Workshop on Spatio-Temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, 2010, Beijing, China, Italy.
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Titre: Atlas to Image-with-Tumor Registration based on Demons and Deformation Inpainting
Auteurs: Hans Lamecker; Xavier Pennec
Détail: Proc. MICCAI Workshop on Computational Imaging Biomarkers for Tumors - From Qualitative to Quantitative (CIBT'2010), 2010, Beijing, China.
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Titre: Non-Invasive Activation Times Estimation using 3D Echocardiography
Auteurs: Adityo Prakosa; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Eric Saloux; Pascal Allain; Pascal Cathier; Patrick Etyngier; Nicolas Villain; Nicholas Ayache
Détail: Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function + a Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge (STACOM+CESC'10), 2010, Beijing, China. Springer, 6364, LNCS
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Titre: Coupled Personalisation of Electrophysiology Models for Simulation of Induced Ischemic Ventricular Tachycardia
Auteurs: Jatin Relan; Phani Chinchapatnam; Maxime Sermesant; Kawal Rhode; Hervé Delingette; Reza Razavi; Nicholas Ayache
Détail: Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'10), 2010, Beijing, China, United Kingdom. LNCS
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Titre: In-vivo Human 3D Cardiac Fibre Architecture: Reconstruction Using Curvilinear Interpolation of Diffusion Tensor Images
Auteurs: Nicolas Toussaint; Christian T. Stoeck; Sebastian Kozerke; Maxime Sermesant; Philip G. Batchelor
Détail: Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'10), 2010, Beijing, China, United Kingdom. Springer, LNCS
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Titre: Interactive real time simulation of cardiac radio-frequency ablation
Auteurs: Erik Pernod; Maxime Sermesant; Jatin Relan; Hervé Delingette
Détail: Proc. of Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine (2010) (VCBM'2010), 2010, Leipzig, Germany.
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Titre: A Log-Euclidean Statistical Analysis of DTI Brain Deformations
Auteurs: Andrew Sweet; Xavier Pennec
Détail: Proc. of MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI 2010, 2010, Beijing, China, China.
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Titre: LogDemons Revisited: Consistent Regularisation and Incompressibility Constraint for Soft Tissue Tracking in Medical Images
Auteurs: Tommaso Mansi; Xavier Pennec; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Proc. of Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'10), part II, 2010, Beijing, China, China. 6362, pp. 652-659, LNCS
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Titre: Log-Domain Diffeomorphic Registration of Diffusion Tensor Images
Auteurs: Andrew Sweet; Xavier Pennec
Détail: Proc. of Workshop on Biomedical Image Registration 2010, 2010, Lübeck, Germany, Germany. Springer, 6204, pp. 198-209, LNCS
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Titre: Endomicroscopic video retrieval using mosaicing and visual words
Auteurs: Barbara André; Tom Vercauteren; Michael B. Wallace; Anna M. Buchner; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, no address, United States. IEEE, pp. 1419-1422
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Titre: Statistically assisted fluid image registration algorithm - SAFIRA
Auteurs: Caroline Brun; Natasha Leporé; Xavier Pennec; Yi-Yu Chou; Agatha Lee; Marina Barysheva; Greig De Zubicaray; Katie Mcmahon; Margaret Wright; Paul Thompson
Détail: Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, no address, United States. IEEE, pp. 364-367
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Titre: Lung CT registration combining intensity, curves and surfaces
Auteurs: V. Gorbunova; Stanley Durrleman; Pechin Lo; Xavier Pennec; M. De Bruijne
Détail: Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, no address, Denmark. IEEE, pp. 340-343
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Titre: Assessing Selection Methods in the Context of Multi-atlas Based Segmentation
Auteurs: Liliane Ramus; Grégoire Malandain
Détail: Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, The Netherlands, Netherlands. IEEE
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Titre: Parametric regression of 3D medical images through the exploration of non-parametric regression models
Auteurs: Christof Seiler; Xavier Pennec; Mauricio Reyes Aguirre
Détail: Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, no address, Spain. IEEE, pp. 452-455
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Titre: A 3D Statistical Fluid Registration Algorithm
Auteurs: Caroline Brun; Natasha Leporé; Yi-Yu Chou; Xavier Pennec; Greig De Zubicaray; Katie Mcmahon; Margaret Wright; James C. Gee; Paul Thompson
Détail: Workshop on Machine Learning in Medical Imaging (MLMI'2010), 2010, Beijing, China.
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Titre: Construction of patient specific atlases from locally most similar anatomical pieces.
Auteurs: Liliane Ramus; Olivier Commowick; Grégoire Malandain
Détail: Med Image Comput Comput Assist Interv (MICCAI), Sep 2010, China. 6363 (LNCS), pp. 155-162
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Personalization of Reaction-Diffusion Tumor Growth Models in MR Images: Application to Brain Gliomas Characterization and Radiotherapy Planning
Auteurs: Ender Konukoglu; Olivier Clatz; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Deisboeck, Thomas S. and Stamatakos, Georgios. Multiscale Cancer Modeling, CRC Press, 2010, Chapman & Hall/CRC Mathematical & Computational Biology
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Titre: Personalized Computational Models of the Heart for Cardiac Resynchronization Therapy
Auteurs: Maxime Sermesant; Reza Razavi
Détail: Kerckhoffs, Roy C.P.. Patient-Specific Modeling of the Cardiovascular System, Springer New York, pp. 167-182, 2010, 978-1-4419-6691-9
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Directions d'ouvrages

Titre: Statistical Atlases and Computational Models of the Heart, First International Workshop, STACOM 2010, and Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge, CESC 2010
Auteurs: Oscar Camara; Mihaela Pop; Kawal Rhode; Maxime Sermesant; Nic Smith; Alistair A. Young
Détail: Camara, Oscar and Pop, Mihaela and Rhode, Kawal and Sermesant, Maxime and Smith, Nic and Young, Alistair A.. 6364, Springer, pp. 292, 2010, LNCS, 978-3-642-15834-6
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Thèses

Titre: Modèles physiologiques et statistiques du cœur guidés par imagerie médicale : application à la tétralogie de Fallot
Auteurs: Tommaso Mansi
Détail: Informatique temps réel, Robotique et Automatique. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, Sep. 2010. English
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Titre: Assimilation de données images pour la personnalisation d'un modèle électromécanique du coeur
Auteurs: Florence Billet
Détail: informatique. Université de Nice Sophia-Antipolis, Jul. 2010. French
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Titre: Modèles statistiques de courants pour mesurer la variabilité anatomique de courbes, de surfaces et de leur évolution
Auteurs: Stanley Durrleman
Détail: Automatique, traitement du signal et des images. Université de Nice Sophia-Antipolis, Mar. 2010. English
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2009

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: DT-REFinD: diffusion tensor registration with exact finite-strain differential.
Auteurs: B T Thomas Yeo; Tom Vercauteren; Pierre Fillard; Jean-Marc Peyrat; Xavier Pennec; Polina Golland; Nicholas Ayache; Olivier Clatz
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE, 2009, 28 (12), pp. 1914-28
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Titre: Evaluation of 14 nonlinear deformation algorithms applied to human brain MRI registration.
Auteurs: Arno Klein; Jesper Andersson; Babak Ardekani; John Ashburner; Brian Avants; Ming-Chang Chiang; Gary Christensen; D. Louis Collins; Pierre Hellier; Joo Hyun Song; Mark Jenkinson; Claude Lepage; Daniel Rueckert; Paul Thompson; Tom Vercauteren; Roger Woods; John Mann; Ramin Parsey
Détail: NeuroImage, 2009, 46 (3), pp. 786-802
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Titre: A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Linear Registration
Auteurs: Vincent Arsigny; Olivier Commowick; Nicholas Ayache; Xavier Pennec
Détail: J. of Math. Imaging and Vision (JMIV), undefined or unknown publisher, 2009, 33 (2), pp. 222-238
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Titre: A three-dimensional histological atlas of the human basal ganglia. II. Atlas deformation strategy and evaluation in deep brain stimulation for Parkinson disease.
Auteurs: Eric Bardinet; Manik Bhattacharjee; Didier Dormont; Bernard Pidoux; Grégoire Malandain; Michael Schupbach; Nicholas Ayache; Philippe Cornu; Yves Agid; Jérôme Yelnik
Détail: Journal of neurosurgery, undefined or unknown publisher, 2009, 110 (2), pp. 208-19
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Titre: Statistical Models on Sets of Curves and Surfaces based on Currents
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2009, 13 (5), pp. 793-808
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Titre: Fusion of optical imaging and MRI for the evaluation and adjustment of macroscopic models of cardiac electrophysiology: A feasibility study
Auteurs: Mihaela Pop; Maxime Sermesant; Damien Lepiller; M.V. Truong; Elliot Mcveigh; Eugene Crystal; Alexander Dick; Hervé Delingette; Nicholas Ayache; Graham Wright
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2009, 13 (2), pp. 370-80
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Titre: Computation of a Probabilistic Statistical Shape Model in a Maximum-a-posteriori Framework
Auteurs: Heike Hufnagel; Jan Ehrhardt; Xavier Pennec; Nicholas Ayache; Heinz Handels
Détail: Methods of information in medicine, undefined or unknown publisher, 2009, 48 (4), pp. 314-319
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Titre: Mapping the Regional Influence of Genetics on Brain Structure Variability - A Tensor-Based Morphometry Study
Auteurs: Caroline Brun; Natasha Leporé; Xavier Pennec; Agatha Lee; Marina Barysheva; Sarah Madsen; Christina Avedissian; Yi-Yu Chou; Greig De Zubicaray; Katie Mcmahon; Margaret Wright; Arthur Toga; Paul Thompson
Détail: NeuroImage, undefined or unknown publisher, 2009, 48 (1), pp. 37-49
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Titre: A pre-clinical assessment of an atlas-based automatic segmentation tool for the head and neck
Auteurs: R. Sims; Aurélie Isambert; Vincent Grégoire; F. Bidault; L. Fresco; J. Sage; J. Mills; Jean Bourhis; Dimitri Lefkopoulos; Olivier Commowick; M. Benkebil; Grégoire Malandain
Détail: Radiother Oncol, undefined or unknown publisher, 2009, 93 (3), pp. 474-8
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Titre: Revue des approches de segmentation des lésions de sclérose en plaques dans les séquences conventionnelles IRM
Auteurs: Jean-Christophe Souplet; Christine Lebrun; Stéphane Chanalet; Nicholas Ayache; Grégoire Malandain
Détail: Revue neurologique, undefined or unknown publisher, 2009, 165 (1), pp. 7-14
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Titre: Editorial: Special Issue on Medical Robotics
Auteurs: Jaydev Desai; Nicholas Ayache
Détail: International Journal of Robotics Research, undefined or unknown publisher, 2009, 28 (9), pp. 1099-1100
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Titre: An Augmented Reality System for Liver Thermal Ablation: Design and Evaluation on Clinical Cases
Auteurs: Stéphane Nicolau; Xavier Pennec; Luc Soler; X. Buy; A. Gangi; Nicholas Ayache; Jacques Marescaux
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2009, 13 (3), pp. 494-506
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Communications avec actes

Titre: Reconstruction 3D des structures anatomiques des membres inférieurs
Auteurs: François Chung; Jérôme Schmid; Olivier Clatz; Nadia Magnenat-Talmann; Hervé Delingette
Détail: ORASIS'09 - Congrès des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, 2009, Trégastel, France, France.
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Titre: Adaptive Tetrahedral Meshing for Personalized Cardiac Simulations
Auteurs: Hans Lamecker; Tommaso Mansi; Jatin Relan; Florence Billet; Maxime Sermesant; Nicholas Ayache; Hervé Delingette
Détail: CI2BM09 - MICCAI Workshop on Cardiovascular Interventional Imaging and Biophysical Modelling, Sep 2009, London, United Kingdom. pp. 149-158
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Titre: Volumetric Prediction of Cardiac Electrophysiology using a Heart Model Personalised to Surface Data
Auteurs: Jatin Relan; Maxime Sermesant; Mihaela Pop; Hervé Delingette; Michel Sorine; Graham Wright; Nicholas Ayache
Détail: CI2BM09 - MICCAI Workshop on Cardiovascular Interventional Imaging and Biophysical Modelling, Sep 2009, London, United Kingdom. 9 p.
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Titre: A statistical model of white matter fiber bundles based on currents.
Auteurs: Stanley Durrleman; Pierre Fillard; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache
Détail: Jerry L. Prince and Dzung L. Pham and Kyle J. Meyers. International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2009, Williamsburg, Va, United States. Springer-Verlag, Proceedings of Information Processing in Medical Imaging (IPMI'09), 5636, pp. 114-25, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Spatiotemporal Atlas Estimation for Developmental Delay Detection in Longitudinal Datasets
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Guido Gerig; Nicholas Ayache
Détail: Yang, Guang-Zhong and Hawkes, David and Rueckert, Daniel and Noble, Alison and Taylor, Chris. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part I, 2009, London, UK, United States. Springer, 5761, pp. 297-304, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Subject-Specific Ligament Models: Towards Real-Time Simulation of the Knee Joint
Auteurs: Tobias Heimann; François Chung; Hans Lamecker; Hervé Delingette
Détail: Computational Biomechanics for Medicine IV Workshop 2009, 2009, no address, United States.
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Titre: Quantitative comparison of two cardiac electrophysiology models using personalisation to optical and MR data
Auteurs: Jatin Relan; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Mihaela Pop; Graham Wright; Nicholas Ayache
Détail: IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'09), 2009, Boston, MA, Canada. pp. 1027-1030
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Titre: Asymmetric Image-Template Registration
Auteurs: Mert Sabuncu; Boon Thye Thomas Yeo; Tom Vercauteren; Koen Van Leemput; Polina Golland
Détail: Yang, Guang-Zhong and Hawkes, David and Rueckert, Daniel and Noble, Alison and Taylor, Chris. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part I, 2009, London, UK, United States. Springer, 5761, pp. 565-573, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Multimodal Prior Appearance Models based on Regional Clustering of Intensity Profiles
Auteurs: François Chung; Hervé Delingette
Détail: Yang, Guang-Zhong and Hawkes, David and Rueckert, Daniel and Noble, Alison and Taylor, Chris. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part II, 2009, London, UK, United Kingdom. Springer, 5762, pp. 1051-1058, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Using Frankenstein's Creature Paradigm to Build a Patient Specific Atlas
Auteurs: Olivier Commowick; Simon Warfield; Grégoire Malandain
Détail: Yang, Guang-Zhong and Hawkes, David and Rueckert, Daniel and Noble, Alison and Taylor, Chris. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part II, 2009, London, UK, United States. Springer, 5762, pp. 993-1000, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Automatic Extraction of Mandibular Nerve and Bone from Cone-Beam CT Data
Auteurs: D. Kainmüller; Hans Lamecker; H. Seim; M. Zinser; S. Zachow
Détail: Yang, Guang-Zhong and Hawkes, David and Rueckert, Daniel and Noble, Alison and Taylor, Chris. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2009, no address, Germany. Springer, 5762, pp. 76-83, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Level Set Segmentation Using a Point-Based Statistical Shape Model Relying on Correspondence Probabilities
Auteurs: Heike Hufnagel; Jan Ehrhardt; Xavier Pennec; Alexander Schmidt-Richberg; Heinz Handels
Détail: Proc. of MICCAI Workshop Probabilistic Model for Medical Image Analysis (PMMIA'09), 2009, no address, Germany.
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Titre: Curve- and surface-based registration of lung CT images via currents
Auteurs: V. Gorbunova; Stanley Durrleman; Pechin Lo; Xavier Pennec; M. De Bruijne
Détail: Brown, M. and de Bruijne, M. and van Ginneken, B. and Kiraly, A. and Kuhnigk, J.M. and Lorenz, C. and McClelland, J.R. and Mori, K. and Reeves, A.P. and Reinhardt, J.. Proc. of Second International Workshop on Pulmonary Image Analysis, 2009, London United Kingdom, Denmark. pp. 15-25
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Titre: Cardiac Motion Recovery and Boundary Conditions Estimation by Coupling an Electromechanical Model and Cine-MRI Data
Auteurs: Florence Billet; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2009 (FIMH'09), 2009, no address, France. 5528, pp. 376-385, LNCS
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Titre: Physically-Constrained Diffeomorphic Demons for the Estimation of 3D Myocardium Strain from Cine-MRI
Auteurs: Tommaso Mansi; Jean-Marc Peyrat; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Julie Blanc; Younes Boudjemline; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2009 (FIMH'09), 2009, no address, France. 5528, pp. 201-210, LNCS
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Titre: Introducing space and time in local feature-based endomicroscopic image retrieval
Auteurs: Barbara André; Tom Vercauteren; Aymeric Perchant; Michael B. Wallace; Anna M. Buchner; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of the MICCAI Workshop - Medical Content-based Retrieval for Clinical Decision (MCBR-CDS'09), 2009, no address, United States. Springer, 5853, pp. 18-30, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Endomicroscopic image retrieval and classification using invariant visual features
Auteurs: Barbara André; Tom Vercauteren; Aymeric Perchant; Michael B. Wallace; Anna M. Buchner; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, Boston, MA, United States. IEEE, pp. 346-349
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Titre: A Lagrangian formulation for statistical fluid registration
Auteurs: Caroline Brun; Natasha Leporé; Xavier Pennec; Yi-Yu Chou; Agatha Lee; Marina Barysheva; Greig De Zubicaray; Katie Mcmahon; Margaret Wright; Arthur Toga; Paul Thompson
Détail: Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, no address, United States. IEEE, pp. 975-978
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Titre: Using consensus measures for atlas construction
Auteurs: Liliane Ramus; Grégoire Malandain
Détail: Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, Boston, MA, United States.
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Titre: Parameter Estimation of a 3D Cardiac Electrophysiology Model Including the Restitution Curve Using Optical and MR Data
Auteurs: Jatin Relan; Maxime Sermesant; Mihaela Pop; Hervé Delingette; Michel Sorine; Graham Wright; Nicholas Ayache
Détail: Dössel, Olaf and Schlegel, Wolfgang C.. World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, 2009, Munich, Germany, Canada. Springer, 25/IV, pp. 1716-1719, IFMBE Proceedings
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Titre: Application of a Probabilistic Statistical Shape Model to Automatic Segmentation
Auteurs: Heike Hufnagel; Jan Ehrhardt; Xavier Pennec; Heinz Handels
Détail: World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, WC 2009, München, 2009, no address, Germany. Springer, 25/4, pp. 2181-2184, IFMBE Proceedings
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Titre: Error Assessment on myocardial fiber orientations from DTI measurements
Auteurs: Nicolas Toussaint; Stanley Durrleman; Maxime Sermesant; Sebastian Kozerke; Philip G. Batchelor
Détail: Book of Abstracts, European Society of Magnetic Resonance in Medicine (ESMRMB) 26th Annual Scientific Meeting, 2009, Antalya, Turkey, Turkey. 22, pp. 59
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Titre: Joint segmentation via patient-specific latent anatomy model
Auteurs: Tammy Riklin-Raviv; Bjoern H. Menze; Koen Van Leemput; Bram Stieltjes; Marc-André Weber; Nicholas Ayache; William M. Wells; Polina Golland
Détail: MICCAI Workshop on Probabilistic Methods in Medical Image Analysis (PMMIA'09)), 2009, London, UK, United Kingdom.
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Titre: A Statistical Model of Right Ventricle in Tetralogy of Fallot for Prediction of Remodelling and Therapy Planning
Auteurs: Tommaso Mansi; Stanley Durrleman; Boris Bernhardt; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Ingmar Voigt; Philipp Lurz; Andrew Taylor; Julie Blanc; Younes Boudjemline; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'09), 2009, London, UK, United Kingdom. Springer, 5761, pp. 214-221, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Characterization of Post-infarct Scars in a Porcine Model - a Combined Experimental and Theoretical Study
Auteurs: Mihaela Pop; Maxime Sermesant; Tommaso Mansi; Eugene Crystal; Jay Detsky; Yuesong Yang; Paul Fefer; Elliot Mcveigh; Alexander Dick; Nicholas Ayache; Graham Wright
Détail: Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2009 (FIMH'09), 2009, no address, France. 5528, pp. 1-10, LNCS
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Titre: Personalised Electromechanical Model of the Heart for the Prediction of the Acute Effects of Cardiac Resynchronisation Therapy
Auteurs: Maxime Sermesant; Florence Billet; Radomir Chabiniok; Tommaso Mansi; Phani Chinchapatnam; Philippe Moireau; Jean-Marc Peyrat; Kawal Rhode; Matt Ginks; Pier Lambiase; Simon Arridge; Hervé Delingette; Michel Sorine; C.A. Rinaldi; Dominique Chapelle; Reza Razavi; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2009 (FIMH'09), 2009, no address, France. 5528, pp. 239-248, LNCS
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Grid Analysis of Radiological Data
Auteurs: Cecile Germain-Renaud; Vincent BRETON; Patrick Clarysse; Bertrand Delhay; Yann Gaudeau; Tristan Glatard ; Emmanuel Jeannot; Yannick Legre; Johan Montagnat ; Jean-Marie Moureaux; Angel Osorio; Xavier Pennec; Joel Schaerer; Romain Texier
Détail: Mario Cannataro (Ed.). Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine and Healthcare, IGI, pp. 363-391, May. 2009, chapter 19
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Titre: Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine, and Healthcare
Auteurs: C. Germain-Renaud; V. Breton; Patrick Clarysse; B. Delhay; Y. Gaudeau; Tristan Glatard; E. Jannot; Y. Legré; Johan Montagnat; J.-M. Moureau; A. Osorio; Xavier Pennec; J. Schaerer; R. Texier
Détail: Cannataro, Mario. undefined or unknown booktitle, IGI Global, pp. 363-391, 2009, 9781605663746
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Titre: Asclepios: a Research Project-Team at INRIA for the Analysis and Simulation of Biomedical Images
Auteurs: Nicholas Ayache; Olivier Clatz; Hervé Delingette; Grégoire Malandain; Xavier Pennec; Maxime Sermesant
Détail: Bertot, Y. and Huet, G. and Lévy, J.-J. and Plotkin, G.. From semantics to computer science: essays in honor of Gilles Kahn, Cambridge University Press, pp. 415-436, 2009
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Titre: Virtual Pulmonary Valve Replacement Interventions with a Personalised Cardiac Electromechanical Model
Auteurs: Tommaso Mansi; Barbara André; Michael Lynch; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Younes Boudjemline; Nicholas Ayache
Détail: Magnenat-Thalmann, Nadia and Zhang, Jian J. and Feng, David D.. Recent Advances in the 3D Physiological Human, Springer, pp. 201-210, 2009, 978-1-84882-564-2
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Titre: Musculoskeletal simulation model generation from MRI datasets and motion capture data
Auteurs: Jérôme Schmid; Anders Sandholm; François Chung; Daniel Thalmann; Hervé Delingette; Nadia Magnenat-Thalmann
Détail: Magnenat-Thalmann, Nadia and Zhang, Jian J. and Feng, David D.. Recent Advances in the 3D Physiological Human, Springer, pp. 3-19, 2009, 978-1-84882-564-2
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Directions d'ouvrages

Titre: Functional Imaging and Modeling of the Heart - FIMH 2009
Auteurs: Nicholas Ayache; Hervé Delingette; Maxime Sermesant
Détail: Ayache, Nicholas and Delingette, Hervé and Sermesant, Maxime. 5528, Springer, 2009, LNCS
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Rapports

Titre: Spatiotemporal Atlas Estimation for Developmental Delay Detection in Longitudinal Datasets
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Guido Gerig; Alain Trouvé; Nicholas Ayache
Détail: [Research Report], 2009, 17 p.. RR-6952
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Thèses

Titre: Comparaison de l'Anatomie et de la Fonction Cardiaque : Statistiques sur l'Architecture des Fibres et Recalage d'Images 4D CT
Auteurs: Jean-Marc Peyrat
Détail: AUTOMATIQUE, TRAITEMENT DU SIGNAL ET DES IMAGES. Université de Nice Sophia-Antipolis, Nov. 2009. English
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Titre: Comparaison de l'Anatomie et de la Fonction Cardiaque: Statistiques sur l'Architecture des Fibres et Recalage d'Images 4D CT
Auteurs: Jean-Marc Peyrat
Détail: AUTOMATIQUE, TRAITEMENT DU SIGNAL ET DES IMAGES. Université de Nice Sophia-Antipolis, Nov. 2009. English
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Titre: Modélisation de la croissance des gliomes et personnalisation des modéles de croissance à l'aide d'images médicales
Auteurs: Ender Konukoglu
Détail: informatique. Université de Nice Sophia-Antipolis, Feb. 2009. English
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Titre: Évaluation de l'atrophie et de la charge lésionnelle sur des séquences IRM de patients atteints de sclérose en plaques
Auteurs: Jean-Christophe Souplet
Détail: Automatique Traitement du Signal et des Images. Université de Nice Sophia-Antipolis, Jan. 2009. French
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2008

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Workflow-based data parallel applications on the EGEE production grid infrastructure
Auteurs: Johan Montagnat ; Tristan Glatard ; Isabel Campos Plasencia; Francisco Castejon; Xavier Pennec; Giuliano Taffoni; Vladimir Voznesensky; Claudio Vuerli
Détail: Journal of Grid Computing, 2008, 6 (8), pp. 369-383
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Titre: Diffeomorphic demons: Efficient non-parametric image registration.
Auteurs: Tom Vercauteren; Xavier Pennec; Aymeric Perchant; Nicholas Ayache
Détail: NeuroImage, 2008, 45 (1), Supplement 1, March 2009, Pages S61-S72
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Titre: Diffusion tensor imaging characteristics of the corpus callosum in mild, moderate, and severe traumatic brain injury.
Auteurs: D. R. Rutgers; P. Fillard; G. Paradot; M. Tadié; P. Lasjaunias; D. Ducreux
Détail: AJNR. American journal of neuroradiology., American Society of Neuroradiology, 2008, 29 (9), pp. 1730-5
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Titre: Flexible and efficient workflow deployement of data-intensive applications on grids with MOTEUR
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Diane Lingrand; Xavier Pennec
Détail: International Journal of High Performance Computing Applications, 2008, 22 (3), pp. 347-360
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Titre: A Service-Oriented Architecture enabling dynamic services grouping for optimizing distributed workflows execution
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; David Emsellem; Diane Lingrand
Détail: Future Generation Computer Systems, 2008, 24 (7), pp. 720-730
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Titre: White matter abnormalities in mild traumatic brain injury: a diffusion tensor imaging study.
Auteurs: D. R. Rutgers; F. Toulgoat; J. Cazejust; P. Fillard; P. Lasjaunias; D. Ducreux
Détail: AJNR. American journal of neuroradiology., American Society of Neuroradiology, 2008, 29 (3), pp. 514-9
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Titre: In Vivo Detection of Thalamic Gliosis: A Pathoradiologic Demonstration in Familial Fatal Insomnia
Auteurs: Stéphane Haïk; Damien Galanaud; Marius George Linguraru; K. Peoc'H; N. Privat; Baptiste Faucheux; Nicholas Ayache; J.J. Hauw; Didier Dormont; Jean-Philippe Brandel
Détail: Archives of Neurology, undefined or unknown publisher, 2008, 65 (4), pp. 545-549
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Titre: A phantom study of the accuracy of CT, MR and PET image registrations with a block matching-based algorithm
Auteurs: Aurélie Isambert; Guillaume Bonniaud; F. Lavielle; Grégoire Malandain; Dimitri Lefkopoulos
Détail: Cancer/Radiothérapie, undefined or unknown publisher, 2008, 12 (8), pp. 800-8
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Titre: Principal Deformations Modes of Articulated Models for the Analysis of 3D Spine Deformities
Auteurs: Jonathan Boisvert; Farida Cheriet; Xavier Pennec; Hubert Labelle; Nicholas Ayache
Détail: Electronic Letters on Computer Vision and Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2008, 7 (4), pp. 13-31
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Titre: Toward patient-specific myocardial models of the heart
Auteurs: Maxime Sermesant; J. M. Peyrat; Phani Chinchapatnam; Florence Billet; Tommaso Mansi; Kawal Rhode; Hervé Delingette; Reza Razavi; Nicholas Ayache
Détail: Heart Failure Clinics, undefined or unknown publisher, 2008, 4 (3), pp. 289-301
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Titre: Articulated Spine Models for 3D Reconstruction from Partial Radiographic Data
Auteurs: Jonathan Boisvert; Farida Cheriet; Xavier Pennec; Hubert Labelle; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, undefined or unknown publisher, 2008, 55 (11), pp. 2565-2574
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Titre: Geometric Variability of the Scoliotic Spine using Statistics on Articulated Shape Models
Auteurs: Jonathan Boisvert; Farida Cheriet; Xavier Pennec; Hubert Labelle; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2008, 27 (4), pp. 557-568
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Titre: Model-Based Imaging of Cardiac Apparent Conductivity and Local Conduction Velocity for Diagnosis and Planning of Therapy
Auteurs: Phani Chinchapatnam; Kawal Rhode; Matt Ginks; C.A. Rinaldi; Pier Lambiase; Reza Razavi; Simon Arridge; Maxime Sermesant
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2008, 27 (11), pp. 1631-1642
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Titre: Triangular Springs for Modeling Nonlinear Membranes
Auteurs: Hervé Delingette
Détail: IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, undefined or unknown publisher, 2008, 14 (2)
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Titre: Generation of a Statistical Shape Model with Probabilistic Point Correspondences and EM-ICP
Auteurs: Heike Hufnagel; Xavier Pennec; Jan Ehrhardt; Nicholas Ayache; Heinz Handels
Détail: International Journal for Computer Assisted Radiology and Surgery (IJCARS), undefined or unknown publisher, 2008, 2 (5), pp. 265-273
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Titre: An efficient locally affine framework for the smooth registration of anatomical structures
Auteurs: Olivier Commowick; Vincent Arsigny; Aurélie Isambert; Jimena Costa; Frédéric Dhermain; F. Bidault; Pierre-Yves Bondiau; Nicholas Ayache; Grégoire Malandain
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2008, 12 (4), pp. 427-41
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Titre: Inferring brain variability from diffeomorphic deformations of currents: an integrative approach
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Paul Thompson; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2008, 12 (5), pp. 626-637
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Titre: Compensation of geometric distortion effects on intraoperative magnetic resonance imaging for enhanced visualization in image-guided neurosurgery
Auteurs: Neculai Archip; Olivier Clatz; Stephen Whalen; Simon Dimaio; Peter Black; Alexandra Golby; Ferenc Jolesz; Simon Warfield
Détail: Neurosurgery, undefined or unknown publisher, 2008, 62 (3 supl. 1), pp. 209-15
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Titre: Computational Modelling of the WHO Grade II Glioma Dynamics: Principles and Applications to Surgical Strategy
Auteurs: Emmanuel Mandonnet; Johan Pallud; Olivier Clatz; Hugues Duffau; Laurent Capelle
Détail: Neurosurgical Review, undefined or unknown publisher, 2008, 31 (3), pp. 263-9
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Titre: Biocomputing: numerical simulation of glioblastoma growth using diffusion tensor imaging
Auteurs: Pierre-Yves Bondiau; Olivier Clatz; Maxime Sermesant; Pierre-Yves Marcy; Hervé Delingette; Marc Frenay; Nicholas Ayache
Détail: Physics in Medicine and Biology, undefined or unknown publisher, 2008, 53 (4), pp. 879-93
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Titre: Evaluation of an atlas-based automatic segmentation software for the delineation of brain organs at risk in a radiation therapy clinical context
Auteurs: Aurélie Isambert; Frédéric Dhermain; F. Bidault; Olivier Commowick; Pierre-Yves Bondiau; Grégoire Malandain; Dimitri Lefkopoulos
Détail: Radiother Oncol, undefined or unknown publisher, 2008, 87 (1), pp. 93-9
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Titre: Atlas-Based Delineation of Lymph Node Levels in Head and Neck Computed Tomography Images
Auteurs: Olivier Commowick; Vincent Grégoire; Grégoire Malandain
Détail: Radiotherapy Oncology, undefined or unknown publisher, 2008, 87 (2), pp. 281-289
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Titre: Flexible and efficient workflow deployment of data-intensive applications on GRIDS with MOTEUR
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Diane Lingrand; Xavier Pennec
Détail: International Journal of High Performance Computing Applications, undefined or unknown publisher, 2008, 3 (22), pp. 347-360
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Articles de vulgarisation scientifique

Titre: Simulation : Le coeur numérique par Hervé Delingette et Miguel Fernandez. De l'ordinateur à la clinique, entretien avec Jérôme Garot, propos recueillis par Dominique Chouchan. Améliorer les performances des implants cardiaques par Alain Ripart
Auteurs: Hervé Delingette; Miguel A. Fernandez; Jérôme Garot; Alain Ripart
Détail: La Recherche Les Cahiers de l'Inria, Société d' éditions scientifiques, 2008, Newton les alchimistes et la science, 416 février 2008
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Communications avec actes

Titre: Comparing algorithms for diffeomorphic registration: Stationary LDDMM and Diffeomorphic Demons
Auteurs: Monica Hernandez; Salvador Olmos; Xavier Pennec
Détail: Xavier Pennec. 2nd MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2008, New-York, United States. pp. 24-35
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Titre: A Forward Model to Build Unbiased Atlases from Curves and Surfaces
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache
Détail: Xavier Pennec. 2nd MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2008, New-York, United States. pp. 68-79
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Titre: A framework for evaluating the impact of compression on registration algorithms without gold standard
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat ; Xavier Pennec
Détail: International Conference on Image Processing, Oct 2008, San Diego, California, United States. IEEE, pp. 2912-2915
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Titre: Multiple Sclerosis Brain MRI Segmentation Workflow deployment on the EGEE Grid
Auteurs: Erik Pernod; Jean-Christophe Souplet; Javier Rojas Balderrama; Diane Lingrand; Xavier Pennec
Détail: MICCAI, Sep 2008, New York, United States. pp. 55-64
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Titre: Implementation of Turing machines with the Scufl data-flow language
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat
Détail: Workshop on Workflow Systems in e-Science, May 2008, Lyon, France. pp. 1-10
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Titre: DTI Registration with Exact Finite-Strain Differential
Auteurs: B.T. Thomas Yeo; Tom Vercauteren; Pierre Fillard; Xavier Pennec; Polina Golland; Nicholas Ayache; Olivier Clatz
Détail: IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), May 2008, Paris, France. IEEE, pp. 700-703
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Titre: Symmetric Log-Domain Diffeomorphic Registration: A Demons-based Approach
Auteurs: Tom Vercauteren; Xavier Pennec; Aymeric Perchant; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States.
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Titre: Spherical Demons: Fast Surface Registration
Auteurs: B.T. Thomas Yeo; Mert Sabuncu; Tom Vercauteren; Nicholas Ayache; Bruce Fischl; Polina Golland
Détail: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. Springer-Verlag
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Titre: Detection of DTI white matter abnormalities in multiple sclerosis patients.
Auteurs: Olivier Commowick; Pierre Fillard; Olivier Clatz; Simon K Warfield
Détail: Dimitris Metaxas and Leon Axel and Gabor Fichtinger and Gábor Székely. International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York City, United States. Springer-Verlag, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2008, 5241, pp. 975-82, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: A Global Criterion for the Computation of Statistical Shape Model Parameters Based on Correspondence Probabilities
Auteurs: Heike Hufnagel; Xavier Pennec; Jan Ehrhardt; Nicholas Ayache; Heinz Handels
Détail: Springer,. Bildverarbeitung für die Medizin 2008, 2008, no address, Germany. 14, pp. 277-282, Informatik aktuell
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Titre: Versatile design of changing mesh topologies for surgery simulation
Auteurs: Barbara André; Hervé Delingette
Détail: Fourth International Symposium on BioMedical Simulation (ISBMS'08), 2008, London, UK, United Kingdom. Springer, 5104, pp. 147-156, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Biquadratic and Quadratic Springs for Modeling St Venant Kirchhoff Materials
Auteurs: Hervé Delingette
Détail: Fourth International Symposium on BioMedical Simulation (ISBMS'08), 2008, London, UK, United Kingdom. Springer, 5104, pp. 40-48, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Monitoring Slowly Evolving Tumors
Auteurs: Ender Konukoglu; William M. Wells; Sébastien Novellas; Nicholas Ayache; Ron Kikinis; Peter Black; K.M. Pohl
Détail: In Proceedings of the IEEE Internation Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), 2008, Paris, France, France.
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Titre: A framework for evaluating the impact of compression on registration algorithms without gold standard
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Xavier Pennec
Détail: International Conference on Image Processing, 2008, no address, United States. pp. 2912-2915
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Titre: An Automatic Segmentation of T2-FLAIR Multiple Sclerosis Lesions
Auteurs: Jean-Christophe Souplet; Christine Lebrun; Nicholas Ayache; Grégoire Malandain
Détail: MICCAI-Multiple Sclerosis Lesion Segmentation Challenge Workshop, 2008, New York, NY, USA, United States.
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Titre: An Integrated Platform for Dynamic Cardiac Simulation and Image Processing: Application to Personalised Tetralogy of Fallot Simulation
Auteurs: Nicolas Toussaint; Tommaso Mansi; Hervé Delingette; Nicholas Ayache; Maxime Sermesant
Détail: Proc. Eurographics Workshop on Visual Computing for Biomedicine (VCBM), 2008, Delft, The Netherlands, Netherlands.
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Titre: Cardiac Electrophysiology Model Adjustment Using the Fusion of MR and Optical Imaging
Auteurs: Damien Lepiller; Maxime Sermesant; Mihaela Pop; Hervé Delingette; Graham Wright; Nicholas Ayache
Détail: Metaxas, Dimitris N. and Axel, Leon and Fichtinger, Gabor and Székely, Gábor. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, no address, United States. Springer, 5241, pp. 678-685, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Registration of 4D Time-Series of Cardiac Images with Multichannel Diffeomorphic Demons
Auteurs: Jean-Marc Peyrat; Hervé Delingette; Maxime Sermesant; Xavier Pennec; Chenyang Xu; Nicholas Ayache
Détail: Metaxas, Dimitris and Axel, Leon and Fichtinger, Gabor and Székely, Gábor. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, New York, USA, United States. Springer, 5242, pp. 972-979, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Real Time Autonomous Video Image Registration for Endomicroscopy: Fighting The Compromises
Auteurs: Tom Vercauteren; Alexander Meining; François Lacombe; Aymeric Perchant
Détail: Conchello, Jose-Angel and Cogswell, Carol J. and Wilson, Tony. Proc. SPIE BIOS - Three-Dimensional and Multidimensional Microscopy: Image Acquisition and Processing XV, 2008, San Jose, CA, USA, United States. SPIE, 6861, pp. 68610C
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Titre: Comparison of Statistical Shape Models Built on Correspondence Probabilities and One-to-One Correspondences
Auteurs: Heike Hufnagel; Xavier Pennec; Jan Ehrhardt; Nicholas Ayache; Heinz Handels
Détail: Proc. SPIE Symposium on Medical Imaging '08, 2008, San Diego, USA, Germany. 6914, SPIE Conference Series
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Titre: Comparing algorithms for diffeomorphic registration: Stationary LDDMM and Diffeomorphic Demons
Auteurs: Monica Hernandez; Salvador Olmos; Xavier Pennec
Détail: Pennec, Xavier and Joshi, S.. Proc. of the International Workshop on the Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA-2008), 2008, no address, Spain.
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Titre: Cardiac Motion Recovery by Coupling an Electromechanical Model and Cine-MRI Data: First Steps
Auteurs: Florence Billet; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Miller, K. and Nielsen, P.M.F.. Proc. of the Workshop on Computational Biomechanics for Medicine III. (Workshop MICCAI-2008), 2008, no address, United States.
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Titre: A New Evaluation Of The Brain Parenchymal Fraction: Application In Multiple Sclerosis Longitudinal Studies
Auteurs: Jean-Christophe Souplet; Christine Lebrun; Nicholas Ayache; Grégoire Malandain
Détail: Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), 2008, Paris, France, France. IEEE, pp. 65-68
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Titre: A tensor-based morphometry study of genetic influences on brain structure using a new fluid registration method
Auteurs: Caroline Brun; Natasha Leporé; Xavier Pennec; Yi-Yu Chou; Agatha Lee; Marina Barysheva; Greig De Zubicaray; Matthew Meredith; Katie Mcmahon; Margaret Wright; Arthur Toga; Paul Thompson
Détail: Metaxas, Dimitris and Axel, Leon. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, New York, USA, United States. Springer, 5242, pp. 914-921, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: A new registration method based on Log-Euclidean Tensor metrics and its application to genetic studies
Auteurs: Caroline Brun; Natasha Leporé; Xavier Pennec; Yi-Yu Chou; Agatha Lee; Greig De Zubicaray; Katie Mcmahon; Margaret Wright; Marina Barysheva; Arthur Toga; Paul Thompson
Détail: Proc. of the 2008 IEEE Int. Symp. on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), Paris, France, May 14-17, 2008, no address, France. pp. 1115-1118
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Titre: Best individual template selection from deformation tensor minimization
Auteurs: Natasha Leporé; Caroline Brun; Yi-Yu Chou; Agatha Lee; Marina Barysheva; Xavier Pennec; Katie Mcmahon; Matthew Meredith; Greig De Zubicaray; Margaret Wright; Arthur Toga; Paul Thompson
Détail: Proc. of the 2008 IEEE Int. Symp. on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), Paris, France, May 14-17, 2008, no address, France. pp. 460-463
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Communications sans actes

Titre: NeuroLOG: Neuroscience Application Workflows Execution on the EGEE Grid
Auteurs: Javier Rojas Balderrama; Diane Lingrand; Erik Pernod; Jean-Christophe Souplet; Xavier Pennec; Johan Montagnat
Détail: EGEE conference, Sep 2008, Istanbul, Turkey.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Tumor Growth Modeling in Oncological Image Analysis
Auteurs: Ender Konukoglu; Xavier Pennec; Olivier Clatz; Nicholas Ayache
Détail: Bankman, I.. Handbook of Medical Image Processing and Analysis - New edition, Academic Press, pp. 297-307, 2008, 13: 978-0-12-373904-9
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Titre: Landmark-based registration using features identified through differential geometry
Auteurs: Xavier Pennec; Nicholas Ayache; Jean-Philippe Thirion
Détail: Bankman, I.. Handbook of Medical Image Processing and Analysis - New edition, Academic Press, pp. 565-578, 2008, 13: 978-0-12-373904-9
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Titre: Processing of In Vivo Fibered Confocal Microscopy Video Sequences
Auteurs: Tom Vercauteren; Nicholas Ayache; Nicolas Savoire; Grégoire Malandain; Aymeric Perchant
Détail: Rittscher, Jens and Machiraju, Raghu and Wong, Stephen T.C.. Microscopic Image Analysis for Life Science Applications, Artech House, pp. 441-463, 2008
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Titre: Statistical computing on manifolds: from Riemannian geometry to computational anatomy
Auteurs: Xavier Pennec
Détail: Nielsen, Frank. Emerging Trends in Visual Computing, 5416, Springer, pp. 347-386, 2008, LNCS, 978-3-642-00825-2
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Directions d'ouvrages

Titre: Proceedings of the Second International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
Auteurs: Xavier Pennec; Sarang Joshi
Détail: Pennec, Xavier and Joshi, Sarang. undefined or unknown publisher, 2008
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Rapports

Titre: Sparse Approximation of Currents for Statistics on Curves and Surfaces
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache
Détail: [Research Report], 2008, pp. 15. RR-6571
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Thèses

Titre: Modèles de la variabilité géométrique du rachis scoliotique
Auteurs: Jonathan Boisvert
Détail: Automatique, traitement du signal et des images. Université de Nice Sophia-Antipolis, Mar. 2008. French
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Titre: Segmentation de structures anatomiques du bas abdomen à l'aide de surfaces déformables 3D
Auteurs: Maria Jimena Costa
Détail: Informatique temps réel, robotique et automatique. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, Mar. 2008. English
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Titre: Traitement riemannien des tenseurs pour l'IRM de diffusion et l'anatomie algorithmique du cerveau.
Auteurs: Pierre Fillard
Détail: Automatique, traitement du signal et des images. Université de Nice Sophia-Antipolis, Feb. 2008. English
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Titre: Recalage et mosaïques d'images pour la microscopie confocale fibrée dynamique in vivo
Auteurs: Tom Vercauteren
Détail: Informatique temps réel, robotique et automatique. École Nationale Supérieure des Mines de Paris, Jan. 2008. English
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Titre: Recalage et Mosaïques d'Images pour la Microscopie Confocale Fibrée Dynamique In Vivo
Auteurs: Tom Vercauteren
Détail: Informatique temps réel, robotique et automatique. Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, Jan. 2008. English
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Documents sans référence de publication

Titre: A probabilistic model to analyse workflow performance on production grids
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Xavier Pennec
Détail: May. 2008
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2007

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Clinical DT-MRI estimation, smoothing, and fiber tracking with log-Euclidean metrics.
Auteurs: Pierre Fillard; Xavier Pennec; Vincent Arsigny; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE, 2007, 26 (11), pp. 1472-82
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Titre: MR diffusion tensor imaging and fiber tracking in spinal cord arteriovenous malformations: a preliminary study.
Auteurs: A. Ozanne; T. Krings; D. Facon; P. Fillard; J. L. Dumas; H. Alvarez; D. Ducreux; P. Lasjaunias
Détail: AJNR. American journal of neuroradiology., American Society of Neuroradiology, 2007, 28 (7), pp. 1271-9
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Titre: Diffusion tensor magnetic resonance imaging and fiber tracking in spinal cord lesions: current and future indications.
Auteurs: Denis Ducreux; Pierre Fillard; David Facon; Augustin Ozanne; Jean-François Lepeintre; Jerome Renoux; Marc Tadié; Pierre Lasjaunias
Détail: Neuroimaging Clinics of North America, Elsevier, 2007, 17 (1), pp. 137-47
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Titre: Measuring brain variability by extrapolating sparse tensor fields measured on sulcal lines.
Auteurs: Pierre Fillard; Vincent Arsigny; Xavier Pennec; Kiralee M Hayashi; Paul M Thompson; Nicholas Ayache
Détail: NeuroImage, Elsevier, 2007, 34 (2), pp. 639-50
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Titre: Dynamic Model of Communicating Hydrocephalus for Surgery Simulation
Auteurs: Olivier Clatz; Stéphane Litrico; Hervé Delingette; Philippe Paquis; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, undefined or unknown publisher, 2007, 54 (4), pp. 755-758
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Titre: Segmentation Propagation from Deformable Atlases for Brain Mapping and Analysis
Auteurs: Marius George Linguraru; Tom Vercauteren; Mauricio Reyes Aguirre; Miguel Ángel González Ballester; Nicholas Ayache
Détail: Brain Researchearch Journal, Nova Science Publishers, 2007, 1 (4), pp. 269-287
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Titre: Glioma Dynamics and Computational Models: A Review of Segmentation, Registration, and In Silico Growth Algorithms and their Clinical Applications
Auteurs: Elsa Angelini; Olivier Clatz; Emmanuel Mandonnet; Ender Konukoglu; Laurent Capelle; Hugues Duffau
Détail: Current Medical Imaging Reviews, undefined or unknown publisher, 2007, 3 (4), pp. 262-176
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Titre: High Resolution Miniprobe-based Confocal Microscopy in Combination with Video-mosaicing
Auteurs: Valentin Becker; Tom Vercauteren; Claus Hann Von Weyern; Christian Prinz; Roland Schmid; Alexander Meining
Détail: Gastrointestinal Endoscopy, undefined or unknown publisher, 2007, 66 (5), pp. 1001-1007
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Titre: A Computational Framework for the Statistical Analysis of Cardiac Diffusion Tensors: Application to a Small Database of Canine Hearts
Auteurs: Jean-Marc Peyrat; Maxime Sermesant; Xavier Pennec; Hervé Delingette; Chenyang Xu; Elliot Mcveigh; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2007, 26 (11), pp. 1500-1514
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Titre: Learning Shape Correspondence for n-D curves
Auteurs: Alain Pitiot; Hervé Delingette; Paul Thompson
Détail: International Journal of Computer Vision, undefined or unknown publisher, 2007, 71 (1), pp. 71-88
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Titre: Deformable Atlases for the Segmentation of Internal Brain Nuclei in Magnetic Resonance Imaging
Auteurs: Marius George Linguraru; Miguel Ángel González Ballester; Nicholas Ayache
Détail: International Journal of Computers, Communication and Control, undefined or unknown publisher, 2007, 2 (1), pp. 26-36
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Titre: A topologically faithful, tissue-guided, spatially varying meshing strategy for computing patient-specific head models for endoscopic pituitary surgery simulation
Auteurs: Michel Audette; Hervé Delingette; A. Fuchs; O. Burgert; K. Chinzei
Détail: Journal of Computer Aided Surgery, undefined or unknown publisher, 2007, 12 (1), pp. 43-52
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Titre: Three-dimensional reconstruction of stained histological slices and 3D non-linear registration with in-vivo MRI for whole baboon brain
Auteurs: Julien Dauguet; Thierry Delzescaux; Françoise Condé; Jean-François Mangin; Nicholas Ayache; Philippe Hantraye; Vincent Frouin
Détail: Journal of Neuroscience Methods, undefined or unknown publisher, 2007, 164 (1), pp. 191-204
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Titre: Non-rigid alignment of preoperative MRI, fMRI, and DT-MRI with intra-operative MRI for enhanced visualization and navigation in image-guided neurosurgery
Auteurs: Neculai Archip; Olivier Clatz; Stephen Whalen; Dan Kacher; Andriy Fedorov; Andriy Kot; Nikos Chrisochoides; Ferenc Jolesz; Alexandra Golby; Peter Black; Simon Warfield
Détail: NeuroImage, undefined or unknown publisher, 2007, 35 (2), pp. 609-24
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Titre: A three-dimensional, histological and deformable atlas of the human basal ganglia. I. Atlas construction based on immunohistochemical and MRI data
Auteurs: Jérôme Yelnik; Eric Bardinet; Didier Dormont; Grégoire Malandain; Sébastien Ourselin; Dominique Tandé; Carine Karachi; Nicholas Ayache; Philippe Cornu; Yves Agid
Détail: NeuroImage, undefined or unknown publisher, 2007, 34 (2), pp. 618-38
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Titre: Model-based respiratory motion compensation for emission tomography image reconstruction
Auteurs: Mauricio Reyes Aguirre; Grégoire Malandain; Pierre Malick Koulibaly; Miguel Ángel González Ballester; Jacques Darcourt
Détail: Phys Med Biol, undefined or unknown publisher, 2007, 52 (12), pp. 3579-600
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Titre: Geometric Means in a Novel Vector Space Structure on Symmetric Positive-Definite Matrices
Auteurs: Vincent Arsigny; Pierre Fillard; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, undefined or unknown publisher, 2007, 29 (1), pp. 328-347
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Communications avec actes

Titre: Merging overlapping orchestrations: an application to the Bronze Standard medical application
Auteurs: Clémentine Nemo; Tristan Glatard ; Mireille Blay-Fornarino; Johan Montagnat
Détail: Services Computing Conference, Jul 2007, Salt Lake City, Utah, United States. pp. 364-371
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Titre: Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat ; Xavier Pennec
Détail: Cluster Computing and the Grid, May 2007, Rio de Janeiro, Brazil. pp. 100-107
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Titre: Region Tracking Algorithms on Laser Scanning Devices Applied to Cell Traffic Analysis
Auteurs: Aymeric Perchant; Tom Vercauteren; Fabien Oberrietter; Nicolas Savoire; Nicholas Ayache
Détail: Jeffrey A. Fessler. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'07), Apr 2007, Arlington, United States. Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2007. ISBI 2007. 4th International Symposium on
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Titre: Insight Into Efficient Image Registration Techniques and the Demons Algorithm
Auteurs: Tom Vercauteren; Xavier Pennec; Ezio Malis; Aymeric Perchant; Nicholas Ayache
Détail: Nico Karssemeijer and Boudewijn Lelieveldt. Information Processing in Medical Imaging, Jul 2007, Kerkrade, Netherlands. 20th International Conference, IPMI 2007, Kerkrade, The Netherlands, July 2-6, 2007. Proceedings, 4584/2007, pp. 495-506, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Non-parametric Diffeomorphic Image Registration with the Demons Algorithm
Auteurs: Tom Vercauteren; Xavier Pennec; Aymeric Perchant; Nicholas Ayache
Détail: Nicholas Ayache and Sébastien Ourselin and Anthony Maeder. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Oct 2007, Brisbane, Australia. 4792/2007, pp. 319-326, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: SOFA: A modular yet efficient simulation framework
Auteurs: François Faure; Jérémie Allard; Stéphane Cotin; Paul Neumann; Pierre-Jean Bensoussan; Christian Duriez; Hervé Delingette; Laurent Grisoni
Détail: Surgetica 2007: Computer-Aided Medical Interventions: tools and applications, 2007, Chambery, France.
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Titre: SOFA - an Open Source Framework for Medical Simulation
Auteurs: Jérémie Allard; Stéphane Cotin; François Faure; Pierre-Jean Bensoussan; François Poyer; Christian Duriez; Hervé Delingette; Laurent Grisoni
Détail: Medicine Meets Virtual Reality, MMVR 15, Feb 2007, palm beach, United States.
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Titre: Measuring brain variability via sulcal lines registration: a diffeomorphic approach.
Auteurs: Stanley Durrleman; Xavier Pennec; Alain Trouvé; Nicholas Ayache
Détail: Nicholas Ayache and Sébastien Ourselin and Anthony Maeder. International Conference on Medical Imaging and Computer Assisted Intervention, Oct 2007, Brisbane, Australia. Springer-Verlag, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2007, 4791, pp. 675-82, Lecture notes in computer science
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Titre: Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
Auteurs: Pierre Fillard; Xavier Pennec; Paul Thompson; Nicholas Ayache
Détail: Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, Australia.
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Titre: Point-Based Statistical Shape Models with Probabilistic Correspondences and Affine EM-ICP
Auteurs: Heike Hufnagel; Xavier Pennec; Jan Ehrhardt; Heinz Handels; Nicholas Ayache
Détail: Springer,. Bildverarbeitung fuer die Medizin 2007, 2007, no address, Germany. Springer, pp. 434-438, Informatik aktuell
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Titre: Diffeomorphic Demons Using ITK's Finite Difference Solver Hierarchy
Auteurs: Tom Vercauteren; Xavier Pennec; Aymeric Perchant; Nicholas Ayache
Détail: Insight Journal -- ISC/NA-MIC Workshop on Open Science at MICCAI 2007, 2007, no address, Australia.
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Titre: Merging overlapping orchestrations: an application to the Bronze Standard medical application
Auteurs: Clémentine Nemo; Tristan Glatard; Mireille Blay-Fornarino; Johan Montagnat
Détail: International Conference on Services Computing (SCC 2007), 2007, Salt Lake City, Utah, USA, United States. pp. 364-371
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Titre: Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Xavier Pennec
Détail: International Symposium on Cluster Computing and the Grid (CCGrid), 2007, Rio de Janeiro, Brazil. IEEE, pp. 100-107
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Titre: A 3D Videoconferencing System with 2D Backwards Compatibility
Auteurs: J.L. Landabaso; Tommaso Mansi; C. Molina; K. Zangelin; P. Enfedaque; J. Canadas; L. Lizcano
Détail: IEEE,. Proc. 3DTV Conference 2007, 2007, no address, United States. pp. 1-4
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Titre: Grid-Enabled Software Environment for Enhanced Dynamic Data-Driven Visualization and Navigation During Image-Guided Neurosurgery
Auteurs: Nikos Chrisochoides; Andriy Fedorov; Andriy Kot; Neculai Archip; Daniel Goldberg-Zimring; Dan Kacher; Stephen Whalen; Ron Kikinis; Ferenc Jolesz; Olivier Clatz; Simon Warfield; Peter Black; Alexandra Golby
Détail: Proc. 7th International Conference on Computational Science (ICCS), 2007, Beijing, China, China. Springer, 4487, pp. 980-987, LNCS
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Titre: Anisotropic Wave Propagation and Apparent Conductivity Estimation in a Fast Electrophysiological Model: Application to XMR Interventional Imaging
Auteurs: Phani Chinchapatnam; Kawal Rhode; A. King; G. Gao; Y. Ma; T. Schaeffter; David Hawkes; Reza Razavi; Derek Hill; Simon Arridge; Maxime Sermesant
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4791, pp. 575-583, LNCS
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Titre: Automatic Segmentation of Bladder and Prostate Using Coupled 3D Deformable Models
Auteurs: Jimena Costa; Hervé Delingette; Sébastien Novellas; Nicholas Ayache
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4791, pp. 252-260, LNCS
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Titre: Shape Analysis Using a Point-Based Statistical Shape Model Built on Correspondence Probabilities
Auteurs: Heike Hufnagel; Xavier Pennec; Jan Ehrhardt; Heinz Handels; Nicholas Ayache
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4791, pp. 959-967, LNCS
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Titre: Mean Template for Tensor-Based Morphometry using Deformation Tensors
Auteurs: Natasha Leporé; Caroline Brun; Xavier Pennec; Yi-Yu Chou; Oscar Lopez; Howard Aizenstein; James Becker; Arthur Toga; Paul Thompson
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4792, pp. 826-833, LNCS
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Titre: Clinical Evaluation of a Respiratory Gated Guidance System for Liver Punctures
Auteurs: Stéphane Nicolau; Xavier Pennec; Luc Soler; Nicholas Ayache
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony J.. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4792, pp. 77-85, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Efficient Selection of the Most Similar Image in a Database for Critical Structures Segmentation
Auteurs: Olivier Commowick; Grégoire Malandain
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Part II, 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp. 203-210, LNCS
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Titre: Towards an Identification of Tumor Growth Parameters from Time Series of Images
Auteurs: Ender Konukoglu; Olivier Clatz; Pierre-Yves Bondiau; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4791, pp. 549-556, LNCS
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Titre: MedINRIA: Medical Image Navigation and Research Tool by INRIA
Auteurs: Nicolas Toussaint; Jean-Christophe Souplet; Pierre Fillard
Détail: Proc. of MICCAI'07 Workshop on Interaction in medical image analysis and visualization, 2007, Brisbane, Australia, Australia.
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Titre: vtkINRIA3D: A VTK Extension for Spatiotemporal Data Synchronization, Visualization and Management
Auteurs: Nicolas Toussaint; Maxime Sermesant; Pierre Fillard
Détail: Proc. of Workshop on Open Source and Open Data for MICCAI, 2007, Brisbane, Australia, Australia.
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Titre: Statistical Comparison of Cardiac Fibre Architectures
Auteurs: Jean-Marc Peyrat; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Xavier Pennec; Chenyang Xu; Elliot Mcveigh; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2007 (FIMH'07), 2007, no address, United States. 4466, pp. 413-423, LNCS
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Titre: An experimental framework to validate 3D models of cardiac electrophysiology via optical imaging and MRI
Auteurs: Mihaela Pop; Maxime Sermesant; Desmond Chung; G. Liu; Elliot Mcveigh; Eugene Crystal; Graham Wright
Détail: Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2007 (FIMH'07), 2007, no address, United States. 4466, pp. 100-109, LNCS
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Titre: An anisotropic multi-front fast marching method for real-time simulation of cardiac electrophysiology
Auteurs: Maxime Sermesant; Ender Konukoglu; Hervé Delingette; Yves Coudière; Phani Chinchapatnam; Kawal Rhode; Reza Razavi; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2007 (FIMH'07), 2007, no address, United States. 4466, pp. 160-169, LNCS
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Titre: CardioSense3D: Patient-Specific Cardiac Simulation
Auteurs: Hervé Delingette; Maxime Sermesant; Jean-Marc Peyrat; Nicholas Ayache; Kawal Rhode; Reza Razavi; Elliot Mcveigh; Dominique Chapelle; Jacques Sainte-Marie; Philippe Moireau; Miguel Fernandez; Jean-Frédéric Gerbeau; K. Djabella; Q. Zhang; Michel Sorine
Détail: Proceedings of IEEE International Conference on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'07), 2007, Metro Washington DC, USA, United States. pp. 628-631
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Titre: Statistical Shape Analysis via Principal Factor Analysis
Auteurs: Mauricio Reyes Aguirre; Marius George Linguraru; K. Marias; Nicholas Ayache; L.P. Nolte; Miguel Ángel González Ballester
Détail: Proceedings of IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2007, Metro Washington DC, USA, United States. pp. 1216-1219
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Titre: Evaluation Of Brain Image Nonrigid Registration Algorithms Based on Log-Euclidean MR-DTI Consistency Measures
Auteurs: Franciso Javier Sanchez Castro; Olivier Clatz; Julien Dauguet; Neculai Archip; Jean-Philippe Thiran; Simon Warfield
Détail: Proceedings of IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'07), 2007, Metro Washington DC, USA, United States. pp. 45-48
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Titre: Automatic Segmentation of the Bladder Using Deformable Models
Auteurs: Jimena Costa; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'07), 2007, Metro Washington DC, USA, United States. pp. 904-907
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Titre: A Recursive Anisotropic Fast Marching Approach to Reaction Diffusion Equation: Application to Tumor Growth Modeling
Auteurs: Ender Konukoglu; Maxime Sermesant; Olivier Clatz; Jean-Marc Peyrat; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of the 20th International Conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI'07), 2007, no address, Netherlands. 4584, pp. 686-699, LNCS
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Titre: Comparison of Standard and Riemannian Fluid Registration for Tensor-Based Morphometry in HIV/AIDS
Auteurs: Caroline Brun; Natasha Leporé; Xavier Pennec; Yi-Yu Chou; Oscar Lopez; Howard Aizenstein; James Becker; Arthur Toga; Paul Thompson
Détail: Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, United States.
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Applications de la géométrie discrète en imagerie médicale
Auteurs: Grégoire Malandain
Détail: Coeurjolly, David and Montanvert, Annick and Chassery, Jean-Marc. Géométrie discrète et images numériques, Hermès, pp. 371-379, 2007, Traités IC2
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Directions d'ouvrages

Titre: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2007 - Part I
Auteurs: Nicholas Ayache; Sébastien Ourselin; Anthony Maeder
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. 4791, Springer, 2007, LNCS
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Titre: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2007 - Part II
Auteurs: Nicholas Ayache; Sébastien Ourselin; Anthony Maeder
Détail: Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. 4792, Springer, 2007, LNCS
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Rapports

Titre: Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
Auteurs: Pierre Fillard; Xavier Pennec; Paul Thompson; Nicholas Ayache
Détail: [Research Report], 2007, pp. 12. RR-6241
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Titre: Notes on Convex Sets, Polytopes, Polyhedra Combinatorial Topology, Voronoi Diagrams and Delaunay Triangulations
Auteurs: Jean Gallier
Détail: [Research Report], 2007, pp. 191. RR-6379
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Thèses

Titre: Création et utilisation d'atlas anatomiques numériques pour la radiothérapie
Auteurs: Olivier Commowick
Détail: informatique. Université de Nice Sophia-Antipolis, Feb. 2007. French
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2006

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Functional MRI in brain tumours
Auteurs: D. Ducreux; F. Dhermain; Pierre Fillard
Détail: Cancer/Radiothérapie, Elsevier, 2006, 10 (6-7), pp. 330-3
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Titre: Blockwise processing applied to brain microvascular network study
Auteurs: Céline Fouard; Grégoire Malandain; Steffen Prohaska; Malte Westerhoff
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2006, 25 (10), pp. 1319 - 1328
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Titre: MR diffusion tensor imaging and fiber tracking in inflammatory diseases of the spinal cord.
Auteurs: J. Renoux; D. Facon; P. Fillard; I. Huynh; P. Lasjaunias; D. Ducreux
Détail: AJNR. American journal of neuroradiology., The American Society of Neuroradiology, 2006, 27 (9), pp. 1947-51
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Titre: Log-Euclidean metrics for fast and simple calculus on diffusion tensors.
Auteurs: Vincent Arsigny; Pierre Fillard; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Magnetic Resonance in Medicine, John Wiley & Sons, 2006, 56 (2), pp. 411-21
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Titre: Diffusion tensor imaging and tractography of central pontine myelinolysis
Auteurs: M. Liberatore; C. Denier; P. Fillard; M. C. Petit-Lacour; F. Benoudiba; P. Lasjaunias; D. Ducreux
Détail: Journal of neuroradiology. Journal de neuroradiologie., Elsevier, 2006, 33 (3), pp. 189-93
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Titre: A Novel Three-Dimensional Computer-Assisted Method for a Quantitative Study of Microvascular Networks of the Human Cerebral Cortex
Auteurs: Francis Cassot; Frédéric Lauwers; Céline Fouard; Steffen Prohaska; Valérie Lawers-Cances
Détail: Microcirculation, 2006, 13 (1), pp. 1-18
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Titre: MR diffusion tensor imaging and fiber tracking in 5 spinal cord astrocytomas.
Auteurs: D. Ducreux; J.-F. Lepeintre; P. Fillard; C. Loureiro; M. Tadié; P. Lasjaunias
Détail: AJNR. American journal of neuroradiology., NCBI, 2006, 27 (1), pp. 214-6
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Titre: Realistic numerical modelling of human head tissues exposure to electromagnetic waves from cellular phones
Auteurs: Serge Piperno; Gilles Scarella; Olivier Clatz; Stéphane Lanteri; G. Beaume; S. Oudot; J.-P. Pons; P. Joly; J. Wiart
Détail: Comptes Rendus de l Académie des Sciences - Series IV - Physics, 2006, 7 (5), pp. 501-508
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Titre: Robust Mosaicing with Correction of Motion Distortions and Tissue Deformation for In Vivo Fibered Microscopy
Auteurs: Tom Vercauteren; Aymeric Perchant; Grégoire Malandain; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Analysis, Elsevier, 2006, The Eighth International Conference on Medical Imaging and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2005, 10 (5), pp. 673-692
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Titre: A Riemannian Framework for Tensor Computing
Auteurs: Xavier Pennec; Pierre Fillard; Nicholas Ayache
Détail: International Journal of Computer Vision, undefined or unknown publisher, 2006, 66 (1), pp. 41-66
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Titre: An Electromechanical Model of the Heart for Image Analysis and Simulation
Auteurs: Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE, 2006, 25 (5), pp. 612-625
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Titre: Building Maps of Local Apparent Conductivity of the Epicardium with a 2D Electrophysiological Model of the Heart
Auteurs: Valérie Moreau-Villéger; Hervé Delingette; Maxime Sermesant; Hiroshi Ashikaga; Elliot Mcveigh; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, IEEE, 2006, 53 (8), pp. 1457-1466
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Titre: Reconstruction of Coronary Arteries from a Single Rotational X-Ray Projection Sequence
Auteurs: Christophe BLONDEL; Grégoire Malandain; Régis Vaillant; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2006, 25 (5), pp. 653-663
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Titre: Intrinsic Statistics on Riemannian Manifolds: Basic Tools for Geometric Measurements
Auteurs: Xavier Pennec
Détail: Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer, 2006, 25 (1), pp. 127-154
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Titre: Cardiac function estimation from MRI using a heart model and data assimilation: Advances and difficulties
Auteurs: Maxime Sermesant; Philippe Moireau; Oscar Camara; Jacques Sainte-Marie; Rado Andriantsimiavona; Robert Cimrman; Derek Hill; Dominique Chapelle; Reza Razavi
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2006, 10 (4), pp. 642-656
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Titre: Segmentation of focal cortical dysplasia lesions on MRI using level set evolution
Auteurs: Olivier Colliot; Tommaso Mansi; N. Bernasconi; V. Naessens; D. Klironomos; A. Bernasconi
Détail: NeuroImage, undefined or unknown publisher, 2006, 32 (4), pp. 1621-1630
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Titre: Computational Models for Image Guided, Robot-Assisted and Simulated Medical Interventions
Auteurs: Hervé Delingette; Xavier Pennec; Luc Soler; Jacques Marescaux; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of the IEEE, IEEE, 2006, 94 (9), pp. 1678- 1688
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Titre: Early detection of cognitive impairment in relapsing-remitting multiple sclerosis: functional-anatomical correlations and longitudinal follow-up
Auteurs: Caroline Bensa; Christelle Bertogliati; Stéphane Chanalet; Grégoire Malandain; P. Bedoucha; Christine Lebrun
Détail: Revue neurologique, undefined or unknown publisher, 2006, 162 (12), pp. 1221
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Articles de vulgarisation scientifique

Titre: Modèles Biomathématiques de Croissance Des Gliomes : Recherche en Informatique et Perspectives en Neuro-oncologie
Auteurs: Olivier Clatz; Emmanuel Mandonnet; Stéphane Chanalet; Christine Lebrun; Ender Konukoglu; Hervé Delingette; Nicholas Ayache; Pierre-Yves Bondiau
Détail: Neurologies, Expressions Santé, 2006, 9 (93), pp. 665-667
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Titre: La simulation de Chirurgie Hépatique
Auteurs: Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Pour la Science, Pour la Science, 2006, 52 (52), pp. 106-109
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Communications avec actes

Titre: Left-Invariant Riemannian Elasticity: a distance on shape diffeomorphisms ?
Auteurs: Xavier Pennec
Détail: Xavier Pennec and Sarang Joshi. 1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp. 1-13
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Titre: Performance evaluation of grid-enabled registration algorithms using bronze-standards
Auteurs: Tristan Glatard ; Xavier Pennec; Johan Montagnat
Détail: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. Springer, Part II, pp. 152-160
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Titre: Medical image registration algorithms assessment: Bronze Standard application enactment on grids using the MOTEUR workflow engine
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat ; Xavier Pennec
Détail: HealthGrid, Jun 2006, Valencia, Spain. pp. 93-103
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Titre: An experimental comparison of Grid5000 clusters and the EGEE grid
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat ; Xavier Pennec
Détail: Experimental Grid testbeds for the assessment of large-scale distributed applications and tools, Jun 2006, Paris, France. pp. 1-10
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Titre: Efficient services composition for grid-enabled data-intensive applications
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat ; Xavier Pennec
Détail: High Performance and Distributed Computing, Jun 2006, Paris, France. pp. 333-334
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Titre: Probabilistic and dynamic optimization of job partitioning on a grid infrastructure
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat ; Xavier Pennec
Détail: Parallel, Distributed and network-based Processing, Feb 2006, Montbéliard-Sochaux, France. pp. 231-238
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Titre: Clinical DT-MRI estimation, smoothing and fiber tracking with log-Euclidean metrics
Auteurs: Pierre Fillard; Vincent Arsigny; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp. 786-789
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Titre: Probabilistic and dynamic optimization of job partitioning on a grid infrastructure
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Xavier Pennec
Détail: 14th euromicro conference on Parallel, Distributed and network-based Processing (PDP06), 2006, Montbéliard-Sochaux, France. IEEE, pp. 231-238
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Titre: Aid of Computer Modelling to Identify Ventricular Reentries due to Infarct Scars
Auteurs: Mihaela Pop; Maxime Sermesant; Alexander Dick; John Graham; Yves Coudière; Graham Wright
Détail: 15th World Congress in Cardiac Electrophysiology and Cardiac Techniques (Cardiostim'06), 2006, no address, French Southern Territories.
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Titre: Assessment of Radio-frequency Ablation of Ventricular Arrhythmias Via Magnetic Resonance Imaging and Computer Modelling
Auteurs: Mihaela Pop; Maxime Sermesant; Alexander Dick; John Graham; Yves Coudière; Graham Wright
Détail: 15th World Congress in Cardiac Electrophysiology and Cardiac Techniques (Cardiostim'06), 2006, no address, French Southern Territories.
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Titre: A theoretical model of ventricular reentry and its radiofrequency ablation therapy
Auteurs: Mihaela Pop; Maxime Sermesant; Yves Coudière; J. Graham; M. Bronskill; Alexander Dick; Graham Wright
Détail: 3rd IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: Macro to Nano (ISBI'06), 2006, no address, United States. pp. 33-36
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Titre: Improved segmentation of focal cortical dysplasia lesions on MRI using expansion towards cortical boundaries
Auteurs: Olivier Colliot; Tommaso Mansi; P. Besson; N. Bernasconi; A. Bernasconi
Détail: 3rd IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: Nano to Macro (ISBI), 2006, Arlington, VA, USA, United States. pp. 323-326
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Titre: Unstructured mesh solvers for the simulation of electromagnetic wave propagation and induced temperature elevation in living tissues
Auteurs: Olivier Clatz; Stéphane Lanteri; Serge Piperno
Détail: 7th International Symposium on Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 2006, no address, French Southern Territories.
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Titre: Generic web service wrapper for efficient embedding of legacy codes in service-based workflows
Auteurs: Tristan Glatard; David Emsellem; Johan Montagnat
Détail: Grid-Enabling Legacy Applications and Supporting End Users Workshop (GELA'06), Paris, France, June 19-23, 2006, no address, French Southern Territories.
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Titre: Stereo Reconstruction of the Epicardium for Optical Fluorescence Imaging
Auteurs: Desmond Chung; Mihaela Pop; Maxime Sermesant; Graham Wright
Détail: MICCAI Workshop on Biophotonics Imaging for Diagnostics and Treatment, 2006, no address, French Southern Territories. pp. 33-40
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Titre: Processing and Mosaicing of Fibered Confocal Images
Auteurs: Nicholas Ayache; Tom Vercauteren; Grégoire Malandain; Fabien Oberrietter; Nicolas Savoire; Aymeric Perchant
Détail: MICCAI Workshop on Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB'06), 2006, no address, Denmark.
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Titre: Health-e-Child: An Integrated Biomedical Platform for Grid-Based Pediatrics
Auteurs: J. Freund; D. Comaniciu; Y. Ioannis; P. Liu; Richard Mcclatchey; E. Moley-Fletcher; Xavier Pennec; Giacomo Pongiglione; X.S. Zhou
Détail: Proc of Health-Grid 2006, 2006, Valancia, Spain, Spain. 120, pp. 259-270, Studies in Health Technology and Informatics
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Titre: Principal Spine Shape Deformation Modes Using Riemannian Geometry and Articulated Models
Auteurs: Jonathan Boisvert; Xavier Pennec; Hubert Labelle; Farida Cheriet; Nicholas Ayache
Détail: Proc of the IV Conference on Articulated Motion and Deformable Objects, Andratx, Mallorca, Spain, 11-14 July, 2006, no address, Spain. Springer, 4069, pp. 346-355, LNCS
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Titre: An experimental comparison of Grid5000 clusters and the EGEE grid
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Xavier Pennec
Détail: Proc of the Workshop on Experimental Grid testbeds for the assessment of large-scale distributed applications and tools (EXPGRID'06), Paris, France, June 19-23, 2006, no address, France.
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Titre: A Log-Euclidean Framework for Statistics on Diffeomorphisms
Auteurs: Vincent Arsigny; Olivier Commowick; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, no address, Denmark. pp. 924-931, LNCS
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Titre: Extrapolating Tumor Invasion Margins for Physiologically Determined Radiotherapy Regions
Auteurs: Ender Konukoglu; Olivier Clatz; Pierre-Yves Bondiau; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, no address, Denmark. pp. 338-346, LNCS
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Titre: Towards a Statistical Atlas of Cardiac Fiber Structure
Auteurs: Jean-Marc Peyrat; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Xavier Pennec; Chenyang Xu; Elliot Mcveigh; Nicholas Ayache
Détail: Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, no address, Denmark. Springer, 4190, pp. 297-304, LNCS
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Titre: Performance evaluation of grid-enabled registration algorithms using bronze-standards
Auteurs: Tristan Glatard; Xavier Pennec; Johan Montagnat
Détail: Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part II, 2006, no address, Denmark. Springer, 4191, pp. 152-160, LNCS
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Titre: Medical image registration algorithms assessment: Bronze Standard application enactment on grids using the MOTEUR workflow engine
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Xavier Pennec
Détail: Proc. of the HealthGrid conference (HealthGrid'06), Valencia, Spain, June 7-9, 2006, no address, Spain. 120, pp. 93-103, Studies in Health Technology and Informatics
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Titre: Statistics on Diffeomorphisms in A Log-Euclidean Framework
Auteurs: Vincent Arsigny; Olivier Commowick; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Pennec, Xavier and Joshi, S.. Proc. of the International Workshop on the Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA-2006), 2006, no address, Denmark. pp. 16-17
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Titre: Left-Invariant Riemannian Elasticity: a distance on Shape Diffeomorphisms?
Auteurs: Xavier Pennec
Détail: Pennec, Xavier and Joshi, S.. Proc. of the International Workshop on the Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA-2006), 2006, no address, Denmark. pp. 1-13
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Titre: An interactive Intensity- and Feature-Based Non-Rigid Registration Framework for 3D Medical Images
Auteurs: Antoine Azar; Chenyang Xu; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp. 824-827
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Titre: 3D Anatomic Variability Assesment of the Scoliotic Spine Using Statistics on Lie Groups
Auteurs: Jonathan Boisvert; Xavier Pennec; Nicholas Ayache; Hubert Labelle; Farida Cheriet
Détail: Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. IEEE, pp. 750-753
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Titre: Efficient services composition for grid-enabled data-intensive applications
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Xavier Pennec
Détail: IEEE,. Proceedings of the IEEE International Symposium on High Performance Distributed Computing (HPDC'06), Paris, France, June 19, 2006, no address, France. pp. 333-334
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Titre: Evaluation of Atlas Construction Strategies in the Context of Radiotherapy Planning
Auteurs: Olivier Commowick; Grégoire Malandain
Détail: Proceedings of the SA2PM Workshop (From Statistical Atlases to Personalized Models), 2006, Copenhagen, Denmark.
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Titre: An Efficient Locally Affine Framework for the Registration of Anatomical Structures
Auteurs: Olivier Commowick; Vincent Arsigny; Jimena Costa; Nicholas Ayache; Grégoire Malandain
Détail: Proceedings of the Third IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp. 478-481
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Titre: A Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Rigid or Affine Registration
Auteurs: Vincent Arsigny; Olivier Commowick; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Pluim, J.P.W. and Likar, B. and Gerritsen, F.A.. Proceedings of the Third International Workshop on Biomedical Image Registration (WBIR'06), 2006, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. Springer, 4057, pp. 120-127, LNCS
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Titre: A Novel Framework for the 3D Analysis of Spine Deformation Modes
Auteurs: Jonathan Boisvert; Farida Cheriet; Xavier Pennec; Nicholas Ayache; Hubert Labelle
Détail: Research into Spinal Deformities, 2006, no address, United States. 123, pp. 176-182, Studies in Health Technology and Informatics
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Titre: Assessment of Brace Local Action on Vertebrae Relative Poses
Auteurs: Jonathan Boisvert; Farida Cheriet; Xavier Pennec; Nicholas Ayache; Hubert Labelle
Détail: Research into Spinal Deformities, 2006, no address, United States. 123, pp. 372-378, Studies in Health Technology and Informatics
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Titre: A topologically faithful, tissue-guided, spatially varying meshing strategy for computing patient-specific head models for endoscopic pituitary surgery simulation
Auteurs: Michel Audette; Hervé Delingette; A. Fuchs; O. Burgert; K. Chinzei
Détail: Studies in health technology and informatics, Medicine Meets Virtual Reality (MMVR), 2006, no address, United States. pp. 22-27
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Titre: Toward Real-Time, Image Guided Neurosurgery Using Distributed and Grid Computing
Auteurs: Nikos Chrisochoides; Andriy Fedorov; Andriy Kot; Neculai Archip; Peter Black; Olivier Clatz; Alexandra Golby; Ron Kikinis; Simon Warfield
Détail: SuperComputing06, 2006, Tampa, Florida, USA, United States.
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Titre: Data composition patterns in service-based workflows
Auteurs: Johan Montagnat; Tristan Glatard; Diane Lingrand
Détail: Workshop on Workflows in Support of Large-Scale Science (WORKS'06), 2006, Paris, France, France.
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Directions d'ouvrages

Titre: Proceedings of the MICCAI Workshop - From Statistical Atlases to Personalized Models: Understanding Complex Diseases in Populations and Individuals
Auteurs: Hervé Delingette; Alejandro Frangi
Détail: Delingette, Hervé and Frangi, Alejandro. undefined or unknown publisher, 2006
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Titre: Proceedings of the First International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
Auteurs: Xavier Pennec; Sarang Joshi
Détail: Pennec, Xavier and Joshi, Sarang. MICCAI - Inria, pp. 187, 2006
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HDR

Titre: Statistical Computing on Manifolds for Computational Anatomy
Auteurs: Xavier Pennec
Détail: Université de Nice Sophia-Antipolis, Dec. 2006. English
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Autres publications

Titre: Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat ; Xavier Pennec
Détail: Nov. 2006. I3S laboratory Research Report (I3S/RR-2006-35-FR), Sophia Antipolis, France
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Rapports

Titre: A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Affine Registration
Auteurs: Vincent Arsigny; Olivier Commowick; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: [Research Report], 2006, pp. 46. RR-5865
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Titre: Towards a Statistical Atlas of Cardiac Fiber Architecture
Auteurs: Jean-Marc Peyrat; Maxime Sermesant; Hervé Delingette; Xavier Pennec; Chenyang Xu; Elliot Mcveigh; Nicholas Ayache
Détail: [Research Report], 2006. RR-5906
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Titre: Measuring Brain Variability by Extrapolating Sparse Tensor Fields Measured on Sulcal Lines
Auteurs: Vincent Arsigny; Xavier Pennec; Kiralee M. Hayashi; Paul M. Thompson; Nicholas Ayache; Pierre Fillard
Détail: [Research Report], 2006. RR-5887
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Titre: Dynamic Model of Communicating Hydrocephalus for Surgery Simulation
Auteurs: Olivier Clatz; Stéphane Litrico; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: [Research Report], 2006, pp. 20. RR-5934
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Thèses

Titre: Traitement de données dans les groupes de Lie : une approche algébrique. Application au recalage non-linéaire et à l'imagerie du tenseur de diffusion
Auteurs: Vincent Arsigny
Détail: mathématiques et informatique. Ecole Polytechnique X, Nov. 2006. English
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2005

Articles dans des revues avec comité de lecture

Titre: Brain MR diffusion tensor imaging and fibre tracking to differentiate between two diffuse axonal injuries.
Auteurs: D. Ducreux; I. Huynh; P. Fillard; J. Renoux; M. C. Petit-Lacour; K. Marsot-Dupuch; P. Lasjaunias
Détail: Neuroradiology, Springer-Verlag, 2005, 47 (8), pp. 604-8
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Titre: Medical image analysis on grids
Auteurs: Cécile Germain-Renaud; Vincent Breton; Patrick Clarysse; Yann Gaudeau; Tristan Glatard; Emmanuel Jeannot; Yannick Legré; Charles Loomis; Isabelle Magnin; Johan Montagnat; Jean-Marie Moureaux; Angel Osorio; Xavier Pennec; Romain Texier
Détail: International Journal of Clinical Monitoring and Computing, Kluwer, 2005, 19 (4-5), pp. 339-349
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Titre: MR diffusion tensor imaging and fiber tracking in spinal cord compression.
Auteurs: David Facon; Augustin Ozanne; Pierre Fillard; Jean-François Lepeintre; Caroline Tournoux-Facon; Denis Ducreux
Détail: AJNR. American journal of neuroradiology., NCBI, 2005, 26 (6), pp. 1587-94
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Titre: Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.
Auteurs: Olivier Commowick; Radu Stefanescu; Pierre Fillard; Vincent Arsigny; Nicholas Ayache; Xavier Pennec; Grégoire Malandain
Détail: Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Springer-Verlag, 2005, Information processing in medical imaging, 8 (Pt 2), pp. 927-34
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Titre: Measurement of total pulmonary arterial compliance using invasive pressure monitoring and MR flow quantification during MR-guided cardiac catheterization
Auteurs: V. Muthurangu; D. Atkinson; Maxime Sermesant; M.E. Miquel; S. Hegde; R. Johnson; Rado Andriantsimiavona; Andrew Taylor; E. Baker; R. Tulloh; Derek Hill; Reza Razavi
Détail: Am J Physiol Heart Circ Physiol, undefined or unknown publisher, 2005, 289 (3), pp. 1301-1306
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Titre: Hepatic Surgery Simulation
Auteurs: Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Communications- ACM, undefined or unknown publisher, 2005, 48 (2), pp. 31-36
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Titre: An augmented reality system to guide radio-frequency tumor ablation
Auteurs: Stéphane Nicolau; Alain Garcia; Xavier Pennec; Luc Soler; Nicholas Ayache
Détail: Computer Animation and Virtual World (previously the Journal of Visualization & Computer Animation), Wiley, 2005, 16 (1), pp. 1-10
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Titre: Robust Non-Rigid Registration to Capture Brain Shift from Intra-Operative MRI
Auteurs: Olivier Clatz; Hervé Delingette; Ion-Florin Talos; Alexandra Golby; Ron Kikinis; Ferenc Jolesz; Nicholas Ayache; Simon Warfield
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2005, 24 (11), pp. 1417-1427
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Titre: Realistic Simulation of the 3D Growth of Brain Tumors in MR Images Coupling Diffusion with Mass Effect
Auteurs: Olivier Clatz; Maxime Sermesant; Pierre-Yves Bondiau; Hervé Delingette; Simon Warfield; Grégoire Malandain; Nicholas Ayache
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2005, 24 (10), pp. 1334-1346
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Titre: A system for real-time XMR guided cardiovascular intervention
Auteurs: Kawal Rhode; Maxime Sermesant; D. Brogan; S. Hegde; J. Hipwell; Pier Lambiase; E. Rosenthal; C. Bucknall; S. Qureshi; J. Gill; Reza Razavi; Derek Hill
Détail: IEEE Transactions on Medical Imaging, undefined or unknown publisher, 2005, 24 (11), pp. 1428-1440
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Titre: Atlas-based automatic segmentation of MR images: validation study on the brainstem in radiotherapy context
Auteurs: Pierre-Yves Bondiau; Grégoire Malandain; Stéphane Chanalet; Pierre-Yves Marcy; Jean-Louis Habrand; François Fauchon; Philippe Paquis; Adel Courdi; Olivier Commowick; Isabelle Rutten; Nicholas Ayache
Détail: International Journal of Radiation Oncology*Biology*Physics / International Journal of Radiation Oncology Biology Physics; International Journal of Radiation Oncology Biology & Physics, undefined or unknown publisher, 2005, 61 (1), pp. 289-98
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Titre: Polyrigid and Polyaffine Transformations: a Novel Geometrical Tool to Deal with Non-Rigid Deformations - Application to the registration of histological slices
Auteurs: Vincent Arsigny; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2005, 9 (6), pp. 507-523
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Titre: Removing Tetrahedra from manifold tetrahedralisation : application to real-time surgical simulation
Auteurs: Clément Forest; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2005, 9 (2), pp. 113-122
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Titre: Simulation of Cardiac Pathologies using an Electromechanical Biventricular Model and XMR Interventional Imaging
Auteurs: Maxime Sermesant; Kawal Rhode; G. Sanchez-Ortiz; Oscar Camara; Rado Andriantsimiavona; S. Hegde; Daniel Rueckert; Pier Lambiase; C. Bucknall; E. Rosenthal; Hervé Delingette; Derek Hill; Nicholas Ayache; Reza Razavi
Détail: Medical Image Analysis, undefined or unknown publisher, 2005, 9 (5), pp. 467-480
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Titre: A Grid Service for the Interactive Use of a Parallel Non-Rigid Registration Algorithm of Medical Images
Auteurs: Radu Stefanescu; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Methods of information in medicine, undefined or unknown publisher, 2005, 44 (2)
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Titre: La tomographie en mouvement
Auteurs: Grégoire Malandain; Mauricio Reyes Aguirre
Détail: Pour la Science, undefined or unknown publisher, 2005, 338, pp. 132-137
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Titre: Recaler pour mieux soigner
Auteurs: Xavier Pennec
Détail: Pour la Science, undefined or unknown publisher, 2005, pp. 126-131
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Communications avec actes

Titre: Mosaicing of Confocal Microscopic In Vivo Soft Tissue Video Sequences
Auteurs: Tom Vercauteren; Aymeric Perchant; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: Jim Duncan and Guido Gerig. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, United States. Proceedings of the 8th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, pp. 753-760, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: Fast and simple calculus on tensors in the log-Euclidean framework.
Auteurs: Vincent Arsigny; Pierre Fillard; Xavier Pennec; Nicholas Ayache
Détail: J. Duncan and G. Gerig. International Conference on Medical Image computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. Springer-Verlag, Medical image computing and computer-assisted intervention. Part I, 3749, pp. 115-22, Lecture notes in computer science
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Titre: Riemannian elasticity: a statistical regularization framework for non-linear registration.
Auteurs: Xavier Pennec; R. Stefanescu; V. Arsigny; Pierre Fillard; Nicholas Ayache
Détail: J. Duncan and G. Gerig. International Conference on Medical Image computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. Springer-Verlag, Medical image computing and computer-assisted intervention. Part II, 3750, pp. 943-50, Lecture notes in computer science
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Titre: Extrapolation of sparse tensor fields: application to the modeling of brain variability.
Auteurs: Pierre Fillard; Vincent Arsigny; Xavier Pennec; Paul M. Thompson; Nicholas Ayache
Détail: Gary E. Christensen and Milan Sonka. International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2005, Glenwood Springs, CO, United States. Springer-Verlag, Information processing in medical imaging, 3565, pp. 27-38, Lecture notes in computer science
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Titre: Non-Linear 2D and 3D Registration Using Block-Matching and B-Splines
Auteurs: Heike Hufnagel; Xavier Pennec; Grégoire Malandain; Hans Handels; Nicholas Ayache
Détail: Bildverarbeitung fuer die Medizin 2005, 2005, Heidelberg, Germany, Germany. Springer, pp. 325-329, Informatik aktuell
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Titre: A topologically faithful, tissue-guided, spatially varying meshing strategy for computing patient-specific head models for endoscopic pituitary surgery simulation
Auteurs: Michel Audette; Hervé Delingette; A. Fuchs; O. Burgert; K. Chinzei
Détail: Computer Vision for Biomedical Image Applications (CVBIA), 2005, Beijing, China, China. pp. 178-188, LNCS
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Titre: Modélisation macroscopique de la croissance des tumeurs cérébrales
Auteurs: Olivier Clatz; Pierre-Yves Bondiau; Hervé Delingette; Nicholas Ayache
Détail: Congrès Français de Mécanique (CFM), 2005, Troyes, France.
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Titre: A Riemannian Framework for the Processing of Tensor-Valued Images
Auteurs: Pierre Fillard; Vincent Arsigny; Nicholas Ayache; Xavier Pennec
Détail: Olsen, Ole Fogh and Florak, Luc and Kuijper, Arjan. Deep Structure, Singularities, and Computer Vision (DSSCV), 2005, no address, Netherlands. Springer, pp. 112-123, LNCS
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Titre: Respiratory Motion Correction in Emission Tomography Imaging
Auteurs: Mauricio Reyes Aguirre; Grégoire Malandain; Jacques Darcourt; Pierre Malick Koulibaly
Détail: Fully Three-Dimensional Image Reconstruction Meeting in Radiology and Nuclear Medicine, 2005, Salt Lake City, Utah, USA, United States.
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Titre: Tree Matching Applied to Vascular System
Auteurs: Arnaud Charnoz; Vincent Agnus; Grégoire Malandain; Luc Soler; Mohamed Tajine
Détail: Brun, Luc and Vento, Mario. Graph-Based Representations in Pattern Recognition, 2005, no address, France. Springer, 3434, pp. 183-192, LNCS
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Titre: Early diagnosis of human TSE by multimodality MRI: Spectroscopic detection of thalamic gliosis in a patient with FFI and normal FLAIR and diffusion-weighted imaging
Auteurs: Stéphane Haïk; Damien Galanaud; Baptiste Faucheux; N. Privat; Marius George Linguraru; Nicholas Ayache; J.J. Hauw; Didier Dormont; Jean-Philippe Brandel
Détail: II International Symposium on The New Prion Biology: Basic Science, Diagnosis and Therapy, 2005, Venice, Italy, Italy.
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Titre: Integrating Tactile and Force Feedback with Finite Element Models
Auteurs: Christopher Wagner; Olivier Clatz; Ross Feller; Douglas Perrin; Hervé Delingette; Nicholas Ayache; Robert Howe
Détail: International Conference on Robotics and Automation (ICRA'05), 2005, Barcelona, Spain.
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Titre: Grid-enabled workflows for data intensive applications
Auteurs: Tristan Glatard; Johan Montagnat; Xavier Pennec
Détail: Proc. 18th IEEE Symp. on Computer Based Medical Systems (CBMS'05), Dublin, Ireland, June 23-24, 2005, Dublin, Ireland, Ireland. IEEE, pp. 537-542
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Titre: Estimating Local Apparent Conductivity with a 2-D Electrophysiological Model of the Heart
Auteurs: Valérie Moreau-Villéger; Hervé Delingette; Maxime Sermesant; Hiroshi Ashikaga; Owen Faris; Elliot Mcveigh; Nicholas Ayache
Détail: Proc. of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2005 (FIMH'O5), 2005, no address, Spain. Springer, 3504, pp. 256-266, LNCS
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Titre: Retrospective cross-evaluation of an histological and deformable 3D atlas of the basal ganglia on series of Parkinsonian patients treated by deep brain stimulation (DBS)
Auteurs: Eric Bardinet; Didier Dormont; Grégoire Malandain; Manik Bhattacharjee; Bernard Pidoux; Christian Saleh; Philippe Cornu; Nicholas Ayache; Yves Agid; Jérôme Yelnik
Détail: Duncan, Jim and Gerig, Guido. Proceedings of MICCAI'05, 2005, Palm Springs, California, United States. Springer, 3750, pp. 385-393, LNCS
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Titre: Liver registration for the follow-up of hepatic tumors
Auteurs: Arnaud Charnoz; Vincent Agnus; Grégoire Malandain; Clément Forest; Mohamed Tajine; Luc Soler
Détail: Duncan, Jim and Gerig, Guido. Proceedings of MICCAI'05, 2005, Palm Springs, California, United States. Springer, 3750, pp. 155-162, LNCS
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Titre: Hybrid Formulation of the Model-Based Non-Rigid Registration Problem to Improve Accuracy and Robustness
Auteurs: Olivier Clatz; Hervé Delingette; Ion-Florin Talos; Alexandra Golby; Nicholas Ayache; Ron Kikinis; Ferenc Jolesz; Simon Warfield
Détail: Duncan, Jim and Gerig, Guido. Proceedings of MICCAI'05, 2005, no address, United States. Springer, 3750, pp. 295-302, LNCS
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Titre: A Fast-Marching Approach to Cardiac Electrophysiology Simulation for XMR Interventional Imaging
Auteurs: Maxime Sermesant; Yves Coudière; Valérie Moreau-Villéger; Kawal Rhode; Derek Hill; Reza Razavi
Détail: Proceedings of MICCAI'05, 2005, Palm Springs, California, United States. Springer, 3750, pp. 607-615, LNCS
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Titre: Respiratory Motion Correction in Emission Tomography Image Reconstruction
Auteurs: Mauricio Reyes Aguirre; Grégoire Malandain; Pierre Malick Koulibaly; Miguel Ángel González Ballester; Jacques Darcourt
Détail: Duncan, Jim and Gerig, Guido. Proceedings of MICCAI'05, Part II, 2005, Palm Springs, California, United States. Springer, 3750, pp. 369-376, LNCS
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Titre: Early diagnosis of human TSE by multimodality MRI: Spectroscopic detection of thalamic gliosis in a patient with FFI and normal FLAIR and diffusion-weighted imaging
Auteurs: Stéphane Haïk; Damien Galanaud; Baptiste Faucheux; N. Privat; I. Laffont-Proust; Marius George Linguraru; Nicholas Ayache; J.J. Hauw; Didier Dormont; Jean-Philippe Brandel
Détail: Proceedings of Prions 2005: Between Fundamentals and Society's Needs, 2005, no address, France. pp. 176
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Titre: A complete Augmented Reality Guidance System for Liver Punctures: First Clinical Evaluation
Auteurs: Stéphane Nicolau; Xavier Pennec; Luc Soler; Nicholas Ayache
Détail: Duncan, Jim and Gerig, Guido. Proceedings of the 8th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Part I, 2005, Palm Springs, CA, USA, October 26-29, United States. Springer, 3749, pp. 539-547, LNCS
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Titre: On the Adequacy of Principal Factor Analysis for the Study of Shape Variability
Auteurs: Miguel Ángel González Ballester; Marius George Linguraru; Mauricio Reyes Aguirre; Nicholas Ayache
Détail: Fitzpatrick, J.M. and Reinhardt, J.M.. SPIE Medical Imaging '05, 2005, no address, United States. SPIE Publishing, 5747, pp. 1392-1399
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Titre: Realistic numerical modeling of human head tissues exposure to electromagnetic waves from mobiles phones
Auteurs: Gilles Scarella; Olivier Clatz; Stéphane Lanteri; Grégory Beaume; Steve Oudot; Jean-Philippe Pons; Serge Piperno; Patrick Joly; Joe Wiart
Détail: Seventh International Conference on Mathematical and Numerical Aspects of Wave Propagation, 2005, Brown University, Rhode Island, United States.
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Titre: Computer-Assisted Interventions on liver: Feasibility of the anchor needle technique for real-time targeting of lesions with respiratory motion
Auteurs: Ivan Bricault; Simon Dimaio; Olivier Clatz; Sonia Pujol; Kirby Vosburgh; Ron Kikinis
Détail: Surgetica, 2005, Chambéry, France.
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Titre: Segmentation of Focal Cortical Dysplasia Lesions Using a Feature-Based Level Set
Auteurs: Olivier Colliot; Tommaso Mansi; N. Bernasconi; V. Naessens; D. Klironomos; A. Bernasconi
Détail: Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'05), 2005, Palm Springs (CA), USA, United States. Springer, 3749, pp. 375-382, Lecture Notes in Computer Science
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Titre: A level set driven by MR features of focal cortical dysplasia for lesion segmentation
Auteurs: Olivier Colliot; Tommaso Mansi; N. Bernasconi; V. Naessens; D. Klironomos; A. Bernasconi
Détail: Medical Image Understanding and Analysis (MIUA), 2005, no address, United States. pp. 239-242
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Chapitres d'ouvrages scientifiques

Titre: Automated Image Segmentation: Issues and Applications
Auteurs: Alain Pitiot; Hervé Delingette; Paul Thompson
Détail: Leondes, Cornelius T.. Medical Imaging Systems Technology, 3, World Scientific, 2005
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Titre: Non-Rigid MR/US Registration for Tracking Brain Deformations
Auteurs: Xavier Pennec; Alexis Roche; Pascal Cathier; Nicholas Ayache
Détail: Blum, R.S. and Liu, Zh.. Multi-Sensor Image Fusion and Its Applications, 26, CRC Press - Taylor and Francis, pp. 107-143, 2005, Signal Processing and Communications
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Autres publications

Titre: An optimized workflow enactor for data-intensive grid applications
Auteurs: Tristan Glatard ; Johan Montagnat ; Xavier Pennec
Détail: Oct. 2005. I3S laboratory Research Report (I3S/RR-2005-32-FR), Sophia Antipolis, France
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Thèses

Titre: Méthodes variationnelles et séquentielles pour l'étude de la contraction cardiaque
Auteurs: Valérie Moreau-Villéger
Détail: informatique. Université de Nice Sophia-Antipolis, Dec. 2005. French
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