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Inria Channel
- Présentation
- Publications HAL
- Rapports d'activité
Equipe de recherche ABS
Publications de l'équipe ABS
2012
Communications avec actes
- Titre
- Calibration of a Fully-Constrained Parallel Cable-Driven Robot
- Auteurs
- Dit Sandretto Julien Alexandre; David Daney; Marc Gouttefarde
- Détail
- ROMANSY'2012: 19th CISM-IFToMM Symposium on Robot Design, Dynamics, and Control, Paris, France. pp. 1-8, 2012
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-
Rapports
- Titre
- PALSE: Python Analysis of Large Scale (Computer) Experiments
- Auteurs
- Frederic Cazals ; Tom Dreyfus; Noël Malod-Dognin; Alix Lhéritier
- Détail
- [Research Report], 2012, pp. 16. RR-8165
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-
- Titre
- Probing a Continuum of Macro-molecular Assembly Models with Graph Templates of Complexes
- Auteurs
- Tom Dreyfus; Valérie Doye; Frederic Cazals
- Détail
- [Research Report], 2012, pp. 20. RR-8118
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-
- Titre
- Stoichiometry Determination for Mass-spectrometry Data: the Interval Case
- Auteurs
- Deepesh Agarwal; Frederic Cazals ; Noël Malod-Dognin
- Détail
- [Research Report], 2012, pp. 31. RR-8101
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- Titre
- CSA: Comprehensive comparison of pairwise protein structure alignments
- Auteurs
- Inken Wohlers; Noël Malod-Dognin; Rumen Andonov; Gunnar W. Klau
- Détail
- [Research Report], 2012, pp. 12. RR-7874
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-
Thèses
- Titre
- Approximation et représentation des fonctions sur la sphère. Applications à la géodésie et à l'imagerie médicale.
- Auteurs
- Ana-Maria Nicu
- Détail
- Université de Nice Sophia-Antipolis, Feb. 2012. English
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-
2011
Communications avec actes
- Titre
- Using Dominances for Solving the Protein Family Identification Problem
- Auteurs
- Noël Malod-Dognin; Mathilde Le Boudic-Jamin; Pritish Kamath; Rumen Andonov
- Détail
- Przytycka, Teresa and Sagot, Marie-France. 11th Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2011), Sep 2011, Saarbrücken, Germany. Springer Berlin / Heidelberg, Algorithms in Bioinformatics, 6833, pp. 201-212, Lecture Notes in Computer Science
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-
- Titre
- Shape Matching by Localized Calculations of Quasi-isometric Subsets, with Applications to the Comparison of Protein Binding Patches
- Auteurs
- Frederic Cazals; Noël Malod-Dognin
- Détail
- Loog, Marco and Wessels, Lodewyk and Reinders, Marcel and de Ridder, Dick. The 6th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB), Nov 2011, Delft, Netherlands. Springer Berlin / Heidelberg, Pattern Recognition in Bioinformatics, 7036, pp. 272-283, Lecture Notes in Computer Science
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-
- Titre
- Identification rapide de familles protéiques par dominance
- Auteurs
- Mathilde Le Boudic-Jamin; Noël Malod-Dognin; Alexandre Cornu; Jacques Nicolas; Rumen Andonov
- Détail
- 12th Annual Congress of the French National Society of Operations Research and Decision Science (ROADEF), Mar 2011, Saint-Étienne, France. 2, pp. 791-792
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-
Rapports
- Titre
- Characterizing the Morphology of Protein Binding Patches
- Auteurs
- Noël Malod-Dognin; Achin Bansal; Frederic Cazals
- Détail
- [Research Report], 2011, pp. 49. RR-7743
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-
- Titre
- Assessing the Reconstruction of Macro-molecular Assemblies: the Example of the Nuclear Pore Complex
- Auteurs
- Frederic Cazals; Tom Dreyfus
- Détail
- [Research Report], 2011. RR-7513
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- Titre
- Assessing the Reconstruction of Macro-molecular Assemblies with Toleranced Models
- Auteurs
- Tom Dreyfus; Valérie Doye; Frederic Cazals
- Détail
- [Research Report], 2011. RR-7768
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-
Thèses
- Titre
- Modélisation Multi-échelle et Analyse d'Assemblages Macro-moléculaires Ambigus, avec Applications au Complexe du Pore Nucléaire
- Auteurs
- Tom Dreyfus
- Détail
- informatique. Université de Nice Sophia-Antipolis, Dec. 2011. French
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-
2010
Articles dans des revues avec comité de lecture
- Titre
- ESBTL: efficient PDB parser and data structure for the structural and geometric analysis of biological macromolecules.
- Auteurs
- Sébastien Loriot; Frederic Cazals; Julie Bernauer
- Détail
- Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2010, 26 (8), pp. 1127-8
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-
- Titre
- MULTI-RESOLUTION MODELING OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES - Session Introduction.
- Auteurs
- Samuel Flores; Julie Bernauer; Xuhui Huang; Ruhong Zhou; Seokmin Shin
- Détail
- Pacific Symposium on Biocomputing, World Scientific, 2010, 15, pp. 201-204
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-
Communications avec actes
- Titre
- Maximum Cliques in Protein Structure Comparison
- Auteurs
- Noël Malod-Dognin; Rumen Andonov; Nicola Yanev
- Détail
- Paola Festa. SEA 2010 9th International Symposium on Experimental Algorithms, May 2010, Naples, Italy. Springer, Experimental Algorithms, 6049, pp. 106-117, LNCS
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-
Rapports
- Titre
- Comparing Protein 3D Structures Using A_purva
- Auteurs
- Noël Malod-Dognin; Nicola Yanev; Rumen Andonov
- Détail
- [Research Report], 2010, pp. 9. RR-7464
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- Titre
- Multi-scale Geometric Modeling of Ambiguous Shapes with Toleranced Balls and Compoundly Weighted alpha-shapes
- Auteurs
- Frederic Cazals; Tom Dreyfus
- Détail
- [Research Report], 2010, pp. 32. RR-7306
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-
2009
Articles dans des revues avec comité de lecture
- Titre
- Design of the CGAL Spherical Kernel and application to arrangements of circles on a sphere
- Auteurs
- Pedro De Castro; Frederic Cazals; Sebastien Loriot; Monique Teillaud
- Détail
- Computational Geometry, Elsevier, 2009
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-
- Titre
- Computing the Arrangement of Circles on a Sphere, with Applications in Structural Biology
- Auteurs
- Frederic Cazals; Sebastien Loriot
- Détail
- Computational Geometry, Elsevier, 2009
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Communications avec actes
- Titre
- A geometric knowledge-based coarse-grained scoring potential for structure prediction evaluation
- Auteurs
- Sebastien Loriot; Frederic Cazals; Michael Levitt; Julie Bernauer
- Détail
- Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Jul 2009, Nantes, France.
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-
- Titre
- Comparing Voronoi and Laguerre tessellations in the protein-protein docking context
- Auteurs
- Thomas Bourquard; Julie Bernauer; Jérôme Azé; Anne Poupon
- Détail
- Sixth annual International Symposium on Voronoi Diagrams, Jun 2009, Copenhagen, Denmark.
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-
Rapports
- Titre
- On the Characterization and Selection of Diverse Conformational Ensembles, with Applications to Flexible Docking
- Auteurs
- Sebastien Loriot; Sushant Sachdeva; Karine Bastard; Chantal Prevost; Frederic Cazals
- Détail
- [Research Report], 2009. RR-6503
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- Titre
- Reconstruction d'ensembles compacts 3D
- Auteurs
- Frederic Cazals; David Cohen-Steiner
- Détail
- [Research Report], 2009, pp. 20. RR-6868
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- Titre
- Robust and Efficient Delaunay triangulations of points on or close to a sphere
- Auteurs
- Manuel Caroli; Pedro M. M. De Castro; Sebastien Loriot; Olivier Rouiller; Monique Teillaud; Camille Wormser
- Détail
- [Research Report], 2009. RR-7004
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- Titre
- Computing the Volume of a Union of Balls: a Certified Algorithm
- Auteurs
- Frederic Cazals; Kanhere Harshad; Sebastien Loriot
- Détail
- [Research Report], 2009, pp. 25. RR-7013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- Titre
- Modeling Macro-Molecular Interfaces with Intervor
- Auteurs
- Frederic Cazals; Sebastien Loriot
- Détail
- [Research Report], 2009, pp. 15. RR-7069
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2008
Articles dans des revues avec comité de lecture
- Titre
- Jet fitting 3: A Generic C++ Package for Estimating the Differential Properties on Sampled Surfaces via Polynomial Fitting
- Auteurs
- Frederic Cazals; Marc Pouget
- Détail
- ACM ACM Transactions on Mathematical Software, ACM, 2008, 35 (3)
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-
Chapitres d'ouvrages scientifiques
- Titre
- Ridges and Umbilics of Polynomial Parametric Surfaces
- Auteurs
- Frederic Cazals; Jean-Charles Faugère; Marc Pouget; Fabrice Rouillier
- Détail
- B. Juttler and R. Piene. Geometric Modeling and Algebraic Geometry, Springer, pp. 141-159, 2008, 978-3-540-72184-0
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Rapports
- Titre
- Shelling the Voronoi interface of protein-protein complexes predicts residue activity and conservation
- Auteurs
- Benjamin Bouvier; Raik Gruenberg; Michael Nilges; Frederic Cazals
- Détail
- [Research Report], 2008. RR-6415
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Thèses
- Titre
- Arrangements de cercles sur une sphère: Algorithmes et Applications aux modèles moléculaires representés par une union de boules
- Auteurs
- Sebastien Loriot
- Détail
- mathématiques. Université de Bourgogne, Dec. 2008. English
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2007
Articles dans des revues avec comité de lecture
- Titre
- Expression Reduction Systems with Patterns
- Auteurs
- Julien Forest; Delia Kesner
- Détail
- Journal of Automated Reasoning, 2007, 39 (4), pp. 513-541
- Accès au bibtex
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Chapitres d'ouvrages scientifiques
- Titre
- Approximation of Ridges and Umbilics on Triangulated Surface Meshes
- Auteurs
- Frederic Cazals; Marc Pouget
- Détail
- CGAL Editorial Board. CGAL User and Reference Manual 3.3 edition, CGAL Editorial Board, 2007
- Accès au bibtex
-
- Titre
- Estimation of Local Differential Properties
- Auteurs
- Frederic Cazals; Marc Pouget
- Détail
- CGAL Editorial Board. CGAL User and Reference Manual 3.3 edition, CGAL Editorial Board, 2007
- Accès au bibtex
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